4UYEA

Bromodomain of human brpf1 with n-1,3-dimethyl-2-oxo-6-(piperidin-1- yl)-2,3-dihydro-1h-1,3-benzodiazol-5-yl-2-methoxybenzamide
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
QLTPFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPVPLSEVPDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYRAAVRLREQGGAVLRQARRQAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords PEREGRIN
publication title 1,3-Dimethyl Benzimidazolones are Potent, Selective Inhibitors of the Brpf1 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-08-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4uyeA00
3JVJA 4NR5A 3HMFA 3P1FA 5KTUA 5FH6A 5KTXA 4O74A 5FB0A 4IOOA 5C8GA 4A9EA 4UYFB 4CFKA 4HBWA 2H60A 5A5PA 4FLPA 2D82A 4O70A 5ENCA 5C7NA 3O33A 4QYDA 5CRMA 2YEKA 4YC9A 2RI7A 4O7EA 5D3PA 3QZTA 2RNXA 5EV9A 4Q0NA 4YYKA 5IGMA 4QSQA 4UYEA 2L84A 5DYAA 4O78A 5EICA 5ACYA 5LVRA 4QEVA 5EPBA 3G0JA 4QYLA 1F68A 4O7CA 5EPSA 3QZSA 4CFLA 4QR3A 4MEQA 5E9IA 5ENGA 3QZVA 2YYNA 4XY9A 5EK9A 4NYVA 4BHWA 5F36A 5BT4A 2DVSA 5HRXA 5CQ4A 2FSAA 5LJ2A 4CLBA 4F3IA 4QR5A 5H85A 2F6JA 3UVWA 5L99A 4J0SA 5TCMA 1JM4B 1WUGA 5L96A 5CQ3A 5EWVA 4XUAA 5IGNA 3AQAA 4NXJA 2WP1A 5K29A 4Q0OA 5DKCA 4QUTA 5HELA 5E9LA 3O35A 5CY9A 5EISA 5DKHA 5EI4A 3P1CA 5A7CA 4J3IA 5HRVA 4CURA 2RFJA 4KCXA 5EWDA 3UV2A 4YYMA 3U5NA 5H1UA 5HEMA 5D7XA 4UYFA 5FH7A 5ENHA 2R10A 5CP5A 4YYHA 4BW2A 5FE9A 4N4IA 4Y03A 4N3WA 5F1HA 3SVGA 4NYWA 3SVFA 5LKTA 5FBXA 4QC3A 3P1DA 5CUGA 1N72A 5DW2A 4E96A 2DWWA 1JSPB 5D25A 4NR9A 5EVAA 5ENEA 5G4SA 4MR5A 5CPEA 4YBTA 5CUCA 4O72A 5A83A 2YW5A 3ONIA 4LDFA 5IGKA 3IU5A 5DLZA 4YYGA 4WHWA 5ETBA 4PTBA 3S91A 4Z6IA 2DATA 5D3JA 3LXJA 3U5KA 2L85A 4XY8A 2DVQA 2RS9B 4XUBA 5E9KA 5ENBA 3MB4A 5D3HA 4NUEA 5II2A 4RVRA 4YYNA 2D9EA 4YAXA 4IR5A 5E73A 5F3AA 4ZQLA 4IOQA 4Z6HA 2YDWA 5CQTA 5I1QA 4NS5A 5CZGA 4Z1SA 4HXMA 4HXRA 5FB1A 4CUTA 5E3GA 4NRBA 4UIYA 2KTBB 4O76A 3S92A 4O7FA 5D3RA 5E9MA 4TT6A 4CUSA 4TT4A 4A9OA 5I7XA 4N4FA 4ZC9A 5C85A 5FH8A 5IBNA 3K2JA 3P5OA 5DKDA 4NRAA 4QR4A 4PS5A 5C4QA 4TT2A 5EA1A 2NXBA 5FE8A 5FFWA 4LR6A 5CQ5A 5C89A 4A9MA 5G4RA 4KV1A 5HFQA 4UYHA 2E3KA 4YABA 4NUCA 5FDZA 5EM3A 3UV4A 4OGIA 4UIVA 5L97A 2E7OA 4QEWA 5BT3A 3MULA 5CQ6A 5A5SA 5HQ6A 3DWYA 4CUUA 5FG4A 3UW9A 5E9YA 5BT5A 4A9HA 5KU3A 3RCWA 4IR4A 3MUKA 2DKWA 3UVXA 4YBSA 5DY7A 3G0LA 5FG5A 4CL9A 5CQAA 3O34A 5CRZA 5A5OA 4UIUA 5CUEA 4BW1A 2MJVB 4ZW1A 5A5QA 5L8TA 4QY4A 4YATA 4QNSA 5D3TA 4TYLA 3D7CA 4O71A 5AD2A 5FE6A 3LQHA 4LZRA 3P1EA 4HXSA 4NRCA 4AKNA 5EQ1A 3Q2FA 2OUOA 4HXOA 3AADA 4HXKA 5D0CA 5LUUA 3TLPA 5DYXA 2L5EA 4ALHA 4LZSA 4BW4A 4HXNA 4O7AA 5CUBA 4PCEA 3GG3A 4MEPA 4OUFA 4TTEA 4UIXA 4CUPA 5D24A 2DVVA 4YH4A 4C67A 5KTWA 4LYWA 4LYSA 4QZSA 5FE4A 4NQNA 4Z1QA 4DONA 4YK0A 5IGLA 4HBXA 4CUQA 2R0YA 4N4GA 4J1PA 5E9VA 4LRGA 5ENFA 2YELA 2I8NA 5FG6A 4BJXA 5HENA 3HMEA 4HBVA 5I88A 5D3LA 3MXFA 5LJ1A 3JVLA 5FE7A 5D26A 2RNYA 4QSWA 4A9LA 5KO4A 4UIWA 5FE1A 3MB3A 4X2IA 4WIVA 5AD3A 5FE2A 4KV4A 4YADA 4OGJA 5CGPA 5A5RA 4QBMA 5A82A 4MEOA 5IG6A 5DLXA 4XYAA 4LZ2A 4YYIA 4QSVA 5DX4A 5I86A 1ZS5A 4TQNA 5ETDA 5F2PA 5LKZA 4MR4A 3UVDA 5AMFA 4NR6A 5DFDA 4A9KA 2DVRA 5L8UA 5EP7A 3JVMA 4J0RA 5EWCA 4QSSA 5DFCA 4QSPA 5L98A 4O7BA 4NYXA 3ZYUA 4YBMA 5H1TA 5F62A 5CQ7A 4ALGA 4QSTA 5AMEA 2OO1A 2I7KA 3LJWA 4A9JA 3O36A 5HRWA 3DAIA 4GPJA 3U5OA 4N4HA 5HQ7A 4UYDA 4IR3A 5DBMA 2WP2A 5E74A 5FFVA 3IU6A 5LJ0A 3UVYA 5DFBA 3SVHA 3MQMA 2E7NA 3NXBA 5A5NA 5E0RA 5CU8A 4TU4A 5I89A 2YQDA 5JWMA 3Q2EA 4TU6A 2RNWA 4QEUA 5A81A 4QSXA 5DYCA 2LSPB 2F6NA 5I29A 4YH3A 5F60A 5CUAA 2YEMA 4TZ2A 5I80A 4PCIA 5EPRA 5COIA 3U5JA 4MR6A 5F61A 4HBYA 4LC2A 5HLSA 4IR6A 4A9FA 5D3NA 4O75A 5EWWA 3UV5A 3O37A 4A9IA 4UYGA 4UITA 5E3DA 5I83A 5TB6A 2R0VA 5CFWA 4O77A 5E7DA 5F5ZA 4HXLA 1X0JA 3U5MA 5KHMA 5HM0A 1EQFA 4TZ8A 4Z93A 2RO1A 1E6IA 5H1VA 5JI8A 4NR8A 2R0SA 5ENIA 5C87A 4MR3A 5F25A 4TS8A 4PY6A 5EU1A 4YYJA 5FFYA 4YYDA 4QB3A 3HMHA 4NR4A 2G4AA 4UIZA 4QC1A 5A85A 3I3JA 4HXPA 4LYIA 4PKLA 5F63A 3U5LA 4QUUA 5LVQA 3FKMX 5HFRA 5II1A 3LQIA 4C66A 5D3SA 4YY4A 5F1LA 4MENA 4BW3A 5IIDA 5CTLA 5J0DA 4QSRA 5DYUA 5HJCA 5DW1A 5HCLA 5FE0A 5CQ8A 4YY6A 5HQ5A 5FE3A 5LKUA 5CUDA 5EWHA 5I40A 4NQMA 3JVKA 3U5PA 4A9NA 5CS8A 2OSSA 5FE5A 4NUDA 3LQJA 2GRCA 5ENJA 4NR7A 5EGUA 5LKXA 1WUMA 4IORA 5I7YA 2N9GA 4WHUA 4QSUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JVJA 4NR5A 3HMFA 3P1FA 5KTUA 3D1DA 5FH6A 5KTXA 4O74A 5FB0A 4IOOA 5C8GA 4A9EA 4UYFB 4CFKA 4HBWA 2H60A 5A5PA 4FLPA 2D82A 4O70A 5ENCA 5C7NA 3O33A 4QYDA 5CRMA 2YEKA 4YC9A 2RI7A 4O7EA 5D3PA 3QZTA 2RNXA 5EV9A 4Q0NA 4YYKA 5IGMA 4QSQA 4UYEA 2L84A 5DYAA 4O78A 5EICA 5ACYA 5LVRA 4QEVA 5EPBA 3G0JA 4QYLA 1F68A 4O7CA 5EPSA 3QZSA 4CFLA 4QR3A 4MEQA 5E9IA 5ENGA 3QZVA 2YYNA 4XY9A 5EK9A 4NYVA 4BHWA 5F36A 5BT4A 2DVSA 5HRXA 5CQ4A 2FSAA 5LJ2A 4CLBA 4F3IA 4QR5A 5H85A 2F6JA 3UVWA 5L99A 4J0SA 5TCMA 1JM4B 1WUGA 5L96A 5CQ3A 5EWVA 4XUAA 5IGNA 3AQAA 4NXJA 2WP1A 5K29A 4Q0OA 5DKCA 4QUTA 5HELA 5E9LA 3O35A 5CY9A 4AKIA 5EISA 5DKHA 5EI4A 3P1CA 5A7CA 3VKHA 4J3IA 5HRVA 4CURA 2RFJA 4KCXA 5EWDA 3UV2A 4YYMA 3U5NA 5H1UA 5HEMA 5D7XA 4UYFA 5FH7A 5ENHA 2R10A 5CP5A 4YYHA 4BW2A 5FE9A 4N4IA 4Y03A 4N3WA 5F1HA 3SVGA 4NYWA 3SVFA 5LKTA 5FBXA 3ERRA 5CUGA 3P1DA 4QC3A 1N72A 5DW2A 4E96A 2DWWA 1JSPB 5D25A 4NR9A 5EVAA 5ENEA 5G4SA 4MR5A 5CPEA 4YBTA 5CUCA 4O72A 5A83A 2YW5A 3ONIA 4LDFA 5IGKA 3IU5A 5DLZA 4YYGA 4WHWA 5ETBA 4PTBA 3S91A 4Z6IA 2DATA 5D3JA 3LXJA 3U5KA 2L85A 4XY8A 2DVQA 2RS9B 4XUBA 5E9KA 5ENBA 3MB4A 5D3HA 4NUEA 5II2A 4RVRA 4YYNA 2D9EA 4YAXA 4IR5A 5E73A 5F3AA 4ZQLA 4IOQA 4Z6HA 2YDWA 4AKHA 5CQTA 5I1QA 4NS5A 5CZGA 4Z1SA 4HXMA 4HXRA 5FB1A 4CUTA 5E3GA 4NRBA 4UIYA 2KTBB 4O76A 3S92A 4O7FA 5D3RA 5E9MA 4TT6A 4CUSA 4TT4A 4A9OA 5I7XA 4N4FA 4ZC9A 5C85A 5FH8A 5IBNA 3K2JA 3P5OA 3D1BA 5DKDA 4NRAA 4QR4A 4PS5A 5C4QA 4TT2A 5EA1A 2NXBA 5FE8A 5FFWA 4LR6A 5CQ5A 5C89A 4A9MA 5G4RA 4KV1A 5HFQA 1ZKRA 4UYHA 2E3KA 4YABA 4NUCA 5FDZA 5EM3A 3UV4A 4OGIA 4UIVA 5L97A 2E7OA 4QEWA 5BT3A 3MULA 5CQ6A 5A5SA 5HQ6A 3DWYA 4CUUA 5FG4A 3UW9A 5E9YA 5BT5A 4A9HA 5KU3A 3RCWA 4IR4A 3MUKA 2DKWA 3UVXA 4YBSA 5DY7A 3G0LA 5FG5A 4CL9A 5CQAA 3O34A 5CRZA 5A5OA 4UIUA 5CUEA 4BW1A 2MJVB 4ZW1A 5A5QA 5L8TA 4QY4A 4YATA 4QNSA 5D3TA 4TYLA 3D7CA 4O71A 5AD2A 5FE6A 3LQHA 4LZRA 3P1EA 4HXSA 4NRCA 4AKNA 5EQ1A 3Q2FA 2OUOA 4HXOA 3AADA 4HXKA 5D0CA 5LUUA 3TLPA 5DYXA 2L5EA 4ALHA 4LZSA 4BW4A 4HXNA 4O7AA 5CUBA 4PCEA 3GG3A 4MEPA 4OUFA 4TTEA 4UIXA 4CUPA 5D24A 2DVVA 4YH4A 4C67A 5KTWA 4LYWA 4LYSA 4QZSA 5FE4A 4NQNA 4Z1QA 4DONA 4YK0A 5IGLA 4HBXA 4CUQA 2R0YA 4N4GA 4J1PA 5E9VA 4LRGA 5ENFA 2YELA 2I8NA 5FG6A 4BJXA 5HENA 3HMEA 4HBVA 5I88A 5D3LA 3MXFA 5LJ1A 3JVLA 5FE7A 3VKGA 5D26A 2RNYA 4QSWA 4A9LA 5KO4A 4UIWA 5FE1A 3MB3A 4X2IA 4WIVA 5AD3A 5FE2A 4KV4A 4YADA 4OGJA 1PUOA 5CGPA 5A5RA 4QBMA 5A82A 4MEOA 5IG6A 5DLXA 4XYAA 4LZ2A 4YYIA 4QSVA 5DX4A 5I86A 1ZS5A 4TQNA 5ETDA 5F2PA 5LKZA 4MR4A 3UVDA 5AMFA 4NR6A 5DFDA 4A9KA 2DVRA 5L8UA 5EP7A 3JVMA 4J0RA 5EWCA 4QSSA 5DFCA 4QSPA 5L98A 4O7BA 4NYXA 3ZYUA 4YBMA 5H1TA 4AKGA 5F62A 5CQ7A 4ALGA 4QSTA 5AMEA 2OO1A 2I7KA 3LJWA 4A9JA 3O36A 5HRWA 2EJNA 3DAIA 4GPJA 3U5OA 4N4HA 5HQ7A 4UYDA 4IR3A 5DBMA 2WP2A 5E74A 5FFVA 3IU6A 5LJ0A 3UVYA 5DFBA 3SVHA 3MQMA 2E7NA 3NXBA 5A5NA 5E0RA 5CU8A 4TU4A 5I89A 2YQDA 5JWMA 3Q2EA 4TU6A 2RNWA 4QEUA 5A81A 4QSXA 5DYCA 2LSPB 2F6NA 5I29A 4YH3A 5F60A 5CUAA 2YEMA 4TZ2A 5I80A 4PCIA 5EPRA 5COIA 3U5JA 4MR6A 5F61A 4HBYA 4LC2A 5HLSA 4IR6A 4A9FA 5D3NA 4O75A 5EWWA 3UV5A 3O37A 4A9IA 4UYGA 4UITA 5E3DA 5I83A 5TB6A 2R0VA 5CFWA 4O77A 5E7DA 5F5ZA 4HXLA 1X0JA 3U5MA 5KHMA 5HM0A 1EQFA 4TZ8A 4Z93A 2RO1A 1E6IA 5H1VA 5JI8A 4NR8A 2R0SA 5ENIA 5C87A 4MR3A 5F25A 4TS8A 4PY6A 5EU1A 4YYJA 5FFYA 4YYDA 4QB3A 3HMHA 4NR4A 2G4AA 4AI6A 4UIZA 4QC1A 5A85A 3I3JA 4HXPA 4LYIA 4PKLA 5F63A 3U5LA 4QUUA 5LVQA 3FKMX 5HFRA 5II1A 3LQIA 4C66A 5D3SA 4YY4A 5F1LA 4MENA 4BW3A 5IIDA 5CTLA 5J0DA 4QSRA 5DYUA 5HJCA 5DW1A 5HCLA 5FE0A 5CQ8A 4YY6A 5HQ5A 5FE3A 5LKUA 5CUDA 5EWHA 5I40A 4NQMA 3JVKA 3U5PA 4A9NA 5CS8A 2OSSA 5FE5A 4NUDA 3LQJA 2GRCA 5ENJA 4NR7A 5EGUA 5LKXA 1WUMA 4IORA 5I7YA 2N9GA 4WHUA 4QSUA
chains in the Genus database with same CATH topology
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