4W51A

T4 lysozyme l99a with no ligand bound
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endolysin
publication title Homologous ligands accommodated by discrete conformations of a buried cavity.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4w51A00
1JTMA 4AQNA 1ZYTA 186LA 1L16A 2RBQA 1C6AA 1CVKA 1QT5A 3L2XA 3C83A 1C6IA 212LA 128LA 3K2RA 1QUOA 131LA 1L67A 1L61A 1C67A 2OTYX 3DMZA 1OV5A 166LA 109LA 4I7NA 246LA 1L21A 1CV0A 182LA 1TLAA 3GUKA 4LDLA 1CX7A 1QTDA 4I7KA 1G06A 4EKQA 142LA 195LA 1C6KA 236LA 152LA 201LA 222LA 4W54A 185LA 4I7RA 3SBAA 4DKLA 4LZMA 180LA 4W57A 3L64A 2RBPA 1G1WA 1OV7A 245LA 1SX2A 4DJHA 4EKRA 4ARQB 1PQIA 1L24A 1L10A 1LYIA 1L18A 127LA 158LA 1QTHA 1L59A 1LI6A 2OE9X 1C65A 1L25A 1CU3A 3CDQA 231LA 261LA 126LA 157LA 3OE0A 1DYGA 4ARPA 3DN4A 1L06A 3DKEX 3NY9A 1L28A 1L41A 1LYJA 221LA 1QT4A 3HH4A 1L04A 3DNAA 3HUKA 4ARMB 1CU0A 224LA 2F32A 1SSWA 3HUAA 4EPIA 1L00A 1CU2A 244LA 111LA 1D2WA 1QT7A 1T97A 3CDRA 1P46A 1CUPA 5LZMA 1L02A 259LA 2B73A 1L45A 1L73A 226LA 216LA 1L29A 2B75A 2RBNA 3GUOA 4GBRB 147LA 3DN0A 4LDEA 189LA 3HT6A 1SWZA 3C8QA 1D3JA 1JQUA 1LWGA 249LA 1L85A 160LA 1C6PA 3FA0A 1SSYA 3C7ZA 198LA 3G3XA 238LA 1SWYA 1KY1A 1L96A 257LA 3C80A 1L68A 3PBLA 3DMVA 2Q9EA 161LA 3SB6A 262LA 1L72A 1T8FA 1QTCA 1EPYA 1L27A 4I7LA 1LI2A 192LA 1G0KA 1L34A 1T6HA 1LLHA 2OU9A 229LA 1L05A 3DN8A 3CDOA 1CU5A 1D3NA 1WTHA 2OU8A 3HTDA 1C6DA 1L37A 3SB8A 140LA 1L52A 1QUDA 1L32A 1L03A 2B6WA 230LA 2RH1A 4W51A 3D4SA 1C6BA 3SB5A 1L62A 1DYAA 1K28A 2B6TA 1L23A 1L47A 1T8AA 1KY0A 2A4TA 2B7XA 1LYFA 1G0PA 6LZMA 102LA 1L20A 4YXCA 181LA 1KS3A 199LA 1L35A 1L89A 3HTFA 1C6EA 1L65A 4ZPUA 1CV3A 3G3VA 2OTZX 251LA 1T8GA 1G0JA 174LA 1LGWA 1QS5A 187LA 1L70A 1B6IA 120LA 151LA 4W56A 118LA 1C6FA 3HDEA 1CTWA 206LA 3OE8A 3C7YA 3FI5A 209LA 3G3WA 3GUJA 1SX7A 248LA 3C8RA 1C6CA 1L84A 4I7SA 1OWZA 173LA 3HU9A 7LZMA 1L79A 256LA 1C6NA 2OE4X 1QSQA 2RBOA 2F2QA 1L40A 1XEPA 114LA 3UONA 4EXMA 1OWYA 1C6HA 1L38A 1P3NA 3HH5A 1C63A 1L94A 1L56A 162LA 1C6TA 4I7QA 3SB9A 2RBSA 1DYEA 144LA 1QUGA 253LA 1P37A 1L30A 241LA 3ODUA 1QTVA 4PJZA 1P2LA 1P2RA 2LZMA 4PK0A 184LA 168LA 1CUQA 2HUKA 1C60A 1CV5A 1QT3A 148LE 2LCBA 4W58A 2B70A 1L31A 1L64A 3C81A 123LA 1L07A 1L90A 2RB0X 1CX6A 2CUUA 1L19A 1LYEA 2NTGA 1LYDA 1L92A 1L54A 1L63A 1DYBA 1LYHA 4K5YA 2NTHA 2QARC 1L08A 237LA 3DN3A 129LA 252LA 1G0MA 170LA 1C66A 3HH3A 1D3FA 2RB1X 1L71A 1LGUA 145LA 217LA 3NY8A 3FADA 1P6YA 2RAYX 200LA 2HUMA 3DMXA 3HH6A 3DN6A 1I6SA 1L01A 139LA 215LA 177LA 1L75A 3VW7A 1PQKA 2OEAX 1G0QA 3RUNA 1LWKA 1L0KA 3GULA 3LZMA 2RAZX 2B6ZA 4EPFA 196LA 1C6LA 4I7OA 1P5CA 1P64A 103LA 1CV4A 1L60A 240LA 172LA 150LA 1L77A 2O4WA 3EMLA 1L50A 1L69A 1L53A 167LA 4ARJA 1DYCA 1L13A 235LA 3OE9A 1L15A 3C8SA 1L57A 1G1VA 149LA 1L14A 1L17A 1QTBA 1L51A 3OE6A 1C6QA 225LA 1XJTA 1L74A 112LA 254LA 4W52A 1CV6A 214LA 3F9LA 1L81A 1C69A 1L36A 4ARQA 138LA 163LA 191LA 1LPYA 242LA 2Z6BA 175LA 1XJUA 1L80A 122LA 1L86A 4I7MA 211LA 1C64A 3HDFA 4OO9A 1L44A 1D2YA 1ZWNA 1PQJA 220LA 250LA 178LA 3F8VA 146LA 1L42A 190LA 3SN6R 3PDSA 143LA 4LDOA 2L78A 188LA 2QB0B 2OE7X 1PQDA 1CV1A 3CDTA 1C68A 3V2YA 108LA 1L33A 4ARMA 5I14A 258LA 1L93A 255LA 2B74A 164LA 233LA 2B72A 2B6XA 2F47A 234LA 1KW5A 104LA 239LA 1QT8A 4S0WA 4YXAC 3GUIA 247LA 4I7TA 1ZURA 1G0LA 1L26A 1QUHA 1L0JA 1C6GA 113LA 171LA 2HULA 1C6MA 1L22A 3GUNA 3GUPA 159LA 1L95A 2ANXA 1L58A 4IAPA 1L99A 3SB7A 137LA 1OVJA 2O79A 1L97A 183LA 4EKSA 176LA 2O7AA 3HT9A 4I7JA 1L11A 227LA 4DAJA 3JR6A 169LA 243LA 1NHBA 228LA 130LA 1L66A 1OVKA 2LC9A 260LA 119LA 1P36A 1P7SA 3C7WA 1CU6A 165LA 1QT6A 4GRVA 1L83A 1LW9A 218LA 4W59A 2B6YA 213LA 2RB2X 1L76A 1DYDA 2IGCA 3HU8A 4YX7C 4EJ4A 125LA 1L55A 1KW7A 1L09A 197LA 156LA 1OYUA 1KNIA 1QTZA 1JTNA 1L12A 3GUMA 205LA 2ANVA 1L98A 1PQMA 1G07A 1LI3A 1L88A 2OU0X 4I7PA 3NYAA 1OVHA 3RZEA 4W53A 1L39A 1PQOA 1D3MA 4W55A 107LA 110LA 210LA 1D9WA 3HTGA 4ARLA 1DYFA 4E97A 115LA 1C62A 1C61A 155LA 4EKPA 1G0GA 3DN1A 1L48A 1QS9A 2RBRA 3CDVA 3HUQA 1C6JA 1L49A 2Q9DA 1L43A 1P56A 3SBBC 3V2WA 3HT7A 3HT8A 1QSBA 1LGXA 1L82A 223LA 1L87A 1L91A 3HWLA 141LA 3HTBA 1LYGA 219LA 3C82A 232LA 3QAKA 3DN2A 1L46A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AQNA 5L3HA 3B72A 3L2XA 1B7PA 212LA 3K2RA 131LA 1L67A 3AYQA 1L21A 3A8ZA 4WO6A 1W6ZA 4LDLA 2BQAA 1CX7A 3W6FA 1C6KA 1JIYA 222LA 3SBAA 1WQMA 3FE0A 4W57A 1FLYA 2BPUA 2RBPA 3RT5X 1LOZA 245LA 4DJHA 2IHLA 4EKRA 1L10A 1LYIA 4LYCA 1L18A 1QTHA 1LI6A 2G4PA 3B6LA 5KXWA 5LVJA 2OE9X 4J7VA 1JHLA 1GFVA 5FCPA 4QEQA 1LJGA 5KXKA 1DYGA 4ARPA 1J1PY 1IC5Y 1L06A 4QDNA 1KIRC 4DYGA 2D4KA 3HH4A 1B9OA 1BWHA 1GF3A 4ARMB 1GE3A 2BQFA 4BAPA 1QDRA 1L00A 5HQ1A 3D9AC 1CU2A 4IATA 1LZDA 5A3ZA 1D2WA 3CDRA 1CUPA 5LZMA 2B73A 4LYMA 2MEGA 4H9CA 4OWEA 3GUOA 1VDTA 2WARA 1AKIA 4GN5C 1UUZC 2MEIA 1SWZA 1GF8A 1IP3A 1IR7A 1XGQC 1L85A 1C6PA 5LVGA 3C7ZA 4NSGA 1L96A 257LA 1DKKA 4ETEA 1L68A 3DMVA 2Q9EA 4HTQA 1JSFA 1LPIA 4H8XA 4DD0A 1OUCA 4EOFA 2A7FA 3SB6A 1QTCA 1LI2A 2HECA 1LJEA 1L34A 3WVXA 1FLUA 3DN8A 1WTHA 1XFPL 4YEMA 5B59A 1L37A 4MCKA 2B6WA 1AT5A 4W51A 3SB5A 1C6BA 2I25L 2HU1A 1L47A 4CGEA 2MECA 1HEWA 2A4TA 1UIGA 102LA 4YF2A 2EQLA 4ZPUA 1CV3A 1VAUA 2OTZX 1F0WA 1G0JA 3WH1A 1HF4A 134LA 1ALCA 1GHLA 4RW2A 4XN6A 151LA 4Z3MA 4ANRA 1H6MA 4XJIA 5L9JA 2BQGA 3CSQA 2BLXA 1LSEA 1UICA 1RE2A 2ZILA 5I54A 1LTMA 1SX7A 2YBJA 3HU9A 7LZMA 1L79A 2Z2EA 2RBOA 2BQKA 3LZ2A 1OWYA 1L38A 1L94A 1LSBA 1C6TA 1REZA 1DYEA 4ETAA 144LA 1P37A 3ODUA 4G9SA 4XJFA 1YANA 3WPJA 4PJZA 1P2RA 1CUQA 1QT3A 2B70A 4WLYA 123LA 1L07A 1CX6A 1L19A 193LA 1QTEA 1D0LA 1DYBA 1UIEA 2QARC 4LT3A 237LA 1JSEA 1AM7A 3WUMA 1IC4Y 3GXKA 1HNLA 1L71A 3FADA 1UBZA 3TMWA 3G3AB 2RAYX 3HH6A 4LYBA 1L01A 139LA 3E3DA 2BQEA 5C6IA 1LHLA 5FHWA 1LZ9A 4LT0A 3RUNA 1LWKA 1L0KA 5T3FA 196LA 1C6LA 4I7OA 1P5CA 2H5ZA 1EQEA 1TEWA 3W3EA 5KKJA 1NWGA 1CV4A 4LYOA 1DI3A 4PRUA 1IWYA 3OE9A 1HEMA 3C8SA 154LA 1GFRA 1L17A 2YDGA 1OUAA 1L74A 1VFBC 254LA 3TXJA 1CNSA 214LA 3F9LA 4G4HA 1C69A 2Q0MX 4LYZA 1ZVHL 163LA 1GB8A 2Z6BA 5IHGA 4H94A 1L86A 2Z39A 4I7MA 3HDFA 1LMNA 1PQJA 4WLDA 3RZ4A 3F8VA 1C46A 5B1FA 1LSAA 143LA 2A7DA 4CFOA 1LJFA 1YROA 4OWCA 1CV1A 3CDTA 1C68A 5F16A 1KIQC 1VDQA 4J1AA 4ARMA 1GFUA 164LA 1HEPA 233LA 1YAOA 4IJ4A 4NGKA 1XEJA 4HV1A 5L3IA 1HMKA 1B7QA 1JPOA 1LJ3A 2ZIJA 3SP3A 4I7TA 1IO5A 1QUHA 1BHZA 4HPIA 1YL0X 1LAAA 2HULA 1LZBA 4DQ5A 5A3EA 2RSCA 1LZGA 137LA 1OVJA 4NGIA 3TMXA 1YAMA 3P4ZA 2O7AA 1LKSA 4DAJA 1L66A 1IY4A 4YEOA 2MEDA 2EKSC 1ZV5L 2F4GA 1CU6A 165LA 4GRVA 1A4VA 3QY4A 1CKDA 1L83A 4NGYA 2FBBA 2IGCA 3HU8A 4YX7C 4EJ4A 2Z2FA 1L55A 1L09A 1OYUA 4DDBA 4I0CA 1KNIA 5LVHA 1JTNA 1L12A 3GUMA 3QE8A 3ZVQB 1KXYA 1PQMA 1G07A 2OU0X 1JWRA 1IP4A 1VATA 4E3UA 3RZEA 1IWVA 2G4QA 1L39A 1PQOA 3WPKA 2MEFA 5B06A 1B7RA 2FYCA 1QTKA 1LJ4A 5I4WA 4EKPA 1G0GA 2YBMA 1QS9A 4NHPA 3CDVA 1C6JA 2ZYPA 1LSFA 3LZTA 1L43A 1P56A 1QSWA 3HT7A 1QSBA 1LGXA 1G7HC 1XGPC 2B5ZA 1VDPA 2BAAA 4WOAA 4WM6A 232LA 1JTMA 2DQCY 1ZYTA 186LA 2RBQA 1B5WA 2PC2A 3WPLA 2HEFA 2LYMA 5HNLA 1D9UA 1GBXA 2F2NA 1OV5A 4G4BA 1IR9A 246LA 4ZIXA 2C8OA 2LYOA 1MELL 3ATOA 1QTDA 4I7KA 4EKQA 142LA 236LA 4NFVA 152LA 201LA 3OK0A 4NY5A 4W94A 4I7RA 3WU9A 4XJBA 180LA 2F30A 3L64A 4WG7A 1GBZA 2ZIKA 1NKHA 1LZEA 4TX7A 1SX2A 4NGOA 4ZEEA 4ARQB 5F9UA 1BB3A 1L24A 5FSTA 158LA 1L59A 4N8ZA 1L25A 1CU3A 3CDQA 231LA 1LJJA 2LZ2A 3DN4A 4H8YA 3DKEX 4HTNA 3ATNA 3AW7A 4HJZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4AQN A;  5L3H A;  3B72 A;  3L2X A;  1B7P A;  212L A;  3K2R A;  131L A;  1L67 A;  3AYQ A;  1L21 A;  3A8Z A;  4WO6 A;  1W6Z A;  4LDL A;  2BQA A;  1CX7 A;  3W6F A;  1C6K A;  1JIY A;  222L A;  3SBA A;  1WQM A;  3FE0 A;  4W57 A;  1FLY A;  2BPU A;  2RBP A;  3RT5 X;  1LOZ A;  245L A;  4DJH A;  2IHL A;  4EKR A;  1L10 A;  1LYI A;  4LYC A;  1L18 A;  1QTH A;  1LI6 A;  2G4P A;  3B6L A;  5KXW A;  5LVJ A;  2OE9 X;  4J7V A;  1JHL A;  1GFV A;  5FCP A;  4QEQ A;  1LJG A;  5KXK A;  1DYG A;  4ARP A;  1J1P Y;  1IC5 Y;  1L06 A;  4QDN A;  1KIR C;  4DYG A;  2D4K A;  3HH4 A;  1B9O A;  1BWH A;  1GF3 A;  4ARM B;  1GE3 A;  2BQF A;  4BAP A;  1QDR A;  1L00 A;  5HQ1 A;  3D9A C;  1CU2 A;  4IAT A;  1LZD A;  5A3Z A;  1D2W A;  3CDR A;  1CUP A;  5LZM A;  2B73 A;  4LYM A;  2MEG A;  4H9C A;  4OWE A;  3GUO A;  1VDT A;  2WAR A;  1AKI A;  4GN5 C;  1UUZ C;  2MEI A;  1SWZ A;  1GF8 A;  1IP3 A;  1IR7 A;  1XGQ C;  1L85 A;  1C6P A;  5LVG A;  3C7Z A;  4NSG A;  1L96 A;  257L A;  1DKK A;  4ETE A;  1L68 A;  3DMV A;  2Q9E A;  4HTQ A;  1JSF A; 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