4W89A

Crystal structure of xeg5a, a gh5 xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase from metagenomic library, in complex with cellotriose
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
339
structure length
339
Chain Sequence
DRSRVFDILSNINIGWNLGNTLDATGGGNSVNAETSWGNPKTTQEIVDTVNDRGFNAIRIPVTFANHLGPAPEYTISADWLARVKEVVDYAVNDGMYIILDTHHETNYWLKTDPNNEAALCEELAAIWKQLAEAFKDYDEKLMFEGMNEPRMAGSAKEWSGGTPAERKLINAMNKAFIDAVRATGGNNADRVLIICTYGHNSDEPTLKDLEIPSDPNIAVALHTYTPYFFTYVADGSYSVWNGSKKNDITWQYNNIKKYLIDKGIPVVITETGAQFKENTEDIVRWIGDYVGTLDQDGVKCFIWDNNIYHGNGEKFGLLNRSLLKWYNDDIVDAYVNHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase
publication title Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family.
pubmed doi rcsb
source organism Uncultured bacterium
total genus 143
structure length 339
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.151: Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase.
pdb deposition date 2014-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4w89A00
4IISA 1FP9A 1E56A 1KWKA 1E4NA 3ARYA 1VIWA 5GNYA 4D6JA 4GPNA 6CGTA 1KCKA 3ZIZA 2HVMA 1LL4A 4UR9A 2AMGA 1QNQA 3AIWA 1NH6A 1V0LA 3HMCA 3OGRA 2B31A 3IK2A 1JZ2A 3WD2A 1JYXA 1VEOA 1GQJA 2WC7A 3MV11 2UY2A 1OGGA 1Q4NX 4RE4A 1S46A 1I1XA 2VUYA 1J01A 3ZSSA 1DWFM 2OLHA 2VMFA 1YQ2A 1NARA 4TX6A 3NSNA 3SEPA 4CD4A 1KWGA 3VTRA 1W91A 1MYRA 3QOMA 2J7DA 2WHMA 1BTCA 4GZEA 3OBAA 3ZT7A 1H11A 4AZBA 1DWIM 7A3HA 1CGUA 2QHAA 2OWCA 4DWSB 4W87A 4WKHA 4MAVA 2VZTA 2BY1A 3SCOA 1ISYA 3WUGA 1VBRA 4Z2LA 5ECUA 1JD9A 3ARXA 2XSBA 3I3BA 4PMRA 2CXGA 5JBFA 3W27A 2FHFA 3WDJA 3CLWA 1UYQA 3T08A 2J8GA 2WMIB 4HMCA 5CPTA 1X1NA 1ODZA 1K9EA 4MJ4A 1FA2A 1U33A 2YJQA 4P7OA 3WH5A 3WMBA 2VT0A 1VENA 2V3FA 2ZUSA 3VINA 2E9MA 2GJPA 1V6VA 3WBEA 1GUVA 3RM9A 4KGJA 4S3JA 4UFMA 4FLQA 4LX4A 5D9NA 1JZ7A 4CCCA 3CMJA 2QV4A 2X0YA 2J8FA 1CGYA 3SIMA 1M7XA 4PYSA 1ZJBA 4GI9A 3MUAA 3WUBA 4UCFA 4ZEPA 3LPFA 2X1IA 3VUPA 4D6IA 2TAAA 1SYTA 1C8QA 3W25A 2ZXDA 4GO9A 1UD6A 3L4WA 1UWTA 1CZ1A 2RGMA 2VZVA 1ESWA 3T0DA 5I24A 2J7EA 4BZYA 2VZOA 4DWSA 1JIBA 4U2ZA 1Q6FA 1RH9A 4MNMA 2J7BA 3VGFA 3SCUA 4MJ2A 4GQQA 1E5JA 2V3DA 5GNZA 4D1IA 3PZQA 4UFLA 1M04A 3VM5A 2A3HA 5EFDA 2GSJA 4M80A 2E3ZA 1W3LA 1G9HA 3N1AA 2VCCA 3ZSTA 1GCYA 3U57A 4PMYA 2D22A 3PN8A 2OYLA 3W82A 3AYRA 1UG6A 5E09A 2ZUMA 1JG9A 1B9ZA 1HP4A 2GFTA 3NUKA 1EOKA 3PZOA 1V3JA 1UR2A 2A3AA 5D9PA 1CGXA 2VO5A 4C7FA 1EGZA 5FOOA 8CGTA 3N15A 1LF1A 2OSXA 5CLWA 3UG4A 1DWHM 1Q6GA 3VDAA 2WVUA 3AMGA 4CN4A 4UQAA 3AROA 3EBVA 1VFMA 1KQYA 4HP5A 4AIUA 5A94A 1KXVA 2E8YA 3WEMA 2BXZA 2PF0A 3HJEA 1HJVA 1FH8A 5CXPA 3TONA 1GOMA 3VMPA 1UH3A 4BCEA 3W37A 4ACYA 2VI0A 2WMHA 2ZIDA 2FGLA 3WDPP 2D0FA 4AD1A 3UCQA 4PEEA 3L4XA 1W3KA 2J74A 1V03A 3WD3A 4LPCA 2ESCA 1DP0A 1X6LA 3BCFA 4EK7A 3N12A 1HL9A 4AIOA 4KRTA 4M81A 1BG9A 4RE3A 4UZUA 2PWEA 2A3EA 1CIUA 3WDIA 4WSJA 4K68A 4WKAA 3SCVA 5CGTA 2D1ZA 1PX4A 1HF6A 1MW2A 1E0VA 3M07A 3FY1A 4D71A 1ZBVA 3GXMA 2BHZA 2GJXA 2C0HA 4Z2HA 3F5KA 4WJXA 5AC4A 1WDQA 4CU7A 2YA1A 2WM0A 1I1WA 3VILA 3ZOAA 1HJSA 3AS1A 4AZGA 2YL9A 2YA2A 3SCRA 1R7AA 1XRVA 3II1A 3O9NA 2FHBA 3CUFA 4FF5A 3WUFA 1BFNA 1UH4A 2VZUA 3AS3A 1XCXA 5D8ZA 1GNXA 1HT6A 4MDPA 1QI0A 1WO2A 4W8BA 4E8DA 5BXRA 3WUEA 1EDTA 1KCLA 4AC1X 4MADA 4MTVA 3MV01 4QLJA 1SMAA 1CLXA 4C7DA 4W7UA 4WF7A 5LA0A 4CD8A 2GK1B 1J12A 4PMUA 4AZ7A 2EPOA 3DECA 1FH9A 2VRKA 2YOCA 3VU2A 1MVYA 2FGZA 5JUVA 3SCSA 1EQCA 3MANA 1E71M 5BRQA 4E4PA 4H04A 4F9DA 3CUJA 4PMOA 3VGEA 2QF8A 4ATWA 1MW3A 2PWGA 2FHCA 4B3LA 5I2UA 2UY3A 2WVVB 1ZU8A 3L4VA 3MS8A 3BLPX 3L4TA 3ARQA 3RM4A 3GNOA 1J10A 4TX8A 2WKLA 4QLKA 1EOMA 1TE1A 2EPLX 4D72A 5CG0A 2WZIA 3WDHA 1L0PA 4NF7A 2XSAA 3WFZA 2XHYA 1ZS2A 1OWQA 2WHLA 3G6LA 1CEOA 1BGGA 5C71A 1MFUA 1B3XA 1C91A 4QDMA 4D6HA 3CHCA 2QMJA 5A8PA 1H0GA 3DYOA 1B31A 5FIPA 1F4HA 3AXHA 3U5UA 3CZEA 5FCZA 3AYSA 4U3AA 2QMKA 1UR8A 3CZ8A 3VO0A 4PSRA 1ISZA 5D8WA 2XVGA 2ZUTA 1W1YA 1XV8A 2JEPA 2EXOA 1E0XA 3PZ9A 4M29A 4P7QA 4KH2A 4M1RA 2AAAA 2GDVA 5BXTA 1PIFA 4A4AA 5A1AA 1EDQA 3WF3A 5I5RA 1CDGA 3OLIA 1CXKA 3M46A 1V02A 3WELA 3NDYA 4Z2JA 2PWDA 5M17A 1E72M 5A69A 2UWFA 5CPSA 3NJ3A 3N11A 2JEQA 1E43A 3WH9A 2VNCA 1B0IA 2WVVA 2WMFA 1UD4A 1ZJAA 3UG5A 3B8SA 2J4GA 3MMDA 4A3YA 3BAYA 4DUVA 4ZXOA 4YHGA 1E5NA 1WZKA 2IXUA 3THDA 1H41A 1B3WA 4J3SA 1UWRA 3AIQA 2ZXAA 1NOFA 5I78A 1VFFA 3AICA 2ZE0A 2VRQA 4GINA 1D3CA 1V08A 5HXMA 4U5KA 1V6XA 1ITXA 3CZJA 5BXSA 1GOKA 1VJSA 3J7HA 3EMCA 4R27A 1ZBCA 5A6BA 2W91A 3O2LA 5C70A 4AD4A 3WQ5A 4UQ9A 2NW0A 1E3ZA 1K9TA 3I3DA 3K4AA 2X2YA 5JIWA 1LLOA 5D4YA 4HU0A 1LQ0A 3VIMA 1GPFA 5I23A 2DT2A 4M56A 4AY1A 3MSGA 1ZL1A 4WSKA 4H8VA 1HVQA 3KWXA 1B90A 2WMJA 3BC9A 1UHVA 2WYSA 1QI5A 3PHAA 4QLLA 4TVDA 2DSZA 1JDDA 1JZ4A 4NRSA 4W7WA 3WNLA 3K8LA 1E4LA 4HTYA 1AQ0A 3T2PA 1AMYA 2Y24A 4X9YA 3B9AA 4ACZB 2CEQA 1JZ8A 1MWOA 4P8UA 3QGVA 1CENA 3FN9A 3IAQA 1XSIA 4J3UA 1O6IA 1W1PA 3W6MA 3EMQA 3POHA 4KWUA 3BH4A 6A3HA 5A3HA 4ATDA 1R86A 1CXEA 3U5YA 4CCDA 3WIJA 1ISXA 1W9VA 3GBEA 3TP4A 4GZJA 1A47A 1HIZA 1HKKA 3CUIA 4QAWA 1VEPA 1EIBA 3MMUA 1UWSA 3LMYA 4JIEA 3VGDA 1U30A 2UY5A 4PSPA 3FW6A 3TOPA 3SUTA 1WPCA 4TUFA 4PRWA 4DWSD 1J0KA 2CITA 5D9OA 3EDKA 1C7TA 1E55A 4JKLA 4MB3A 1OD0A 1R85A 1XH2A 3ZR5A 1KBBA 1XGZA 3IJ7A 2Y8KA 2WBKA 1ISWA 3LPOA 1KFWA 3EDFA 5I0DA 1JL8A 4CD5A 3ARSA 4D6FA 4LYPA 2G3JA 1GZJA 4JL1A 4UFIA 3NIYA 3OIHA 4EE9A 1W9PA 4F79A 3GTNA 2WSKA 4P8WA 2CBUA 2J7FA 2GVYA 3AIBA 3MO4A 2DH3A 4ACZA 3SURA 3ZT5A 1TCMA 4Z2IA 1MQQA 3ZR6A 1DWGM 1B1YA 2QPUA 3W81A 4HOWA 1PX8A 4HOXA 3CO4A 2G8ZA 4UFJA 4FLRA 1TA3B 1WDSA 3RILA 4OBSA 2WZHA 3AHYA 3JUGA 3K8MA 4B3KA 5I3DA 2YA0A 2XJ7A 3SCTA 1VF8A 3OLDA 1Q6CA 4MNJA 1YHTA 1M03A 4JHZA 4V28A 3VDHA 2YDSA 3WH8A 1F4AA 3T0BA 3WD1A 4UQCA 1OT1A 3WDRA 2QPSA 1UD8A 3OG2A 4GZIA 3A3HA 3UESA 3ARUA 2Z1KA 4PTVA 3RO8A 4U31A 4CKQA 4AD3A 5CGMA 1JAKA 2ZX5A 4PMVA 3AFBA 3AZRA 3WQWA 3VD3A 5BRPA 1H49A 2XYLA 4YHEA 3BAXA 2WBGA 2JF6A 3PZMA 4AMCA 3ZJ8A 3CZGA 2EJ1A 4CUCA 2WLZA 1FP8A 1JZ6A 3IANA 3CIVA 5JBDA 1ODUA 3DHUA 1WZLA 2CPUA 1JFHA 2CBJA 3WMSA 2JIWA 1EDGA 5DF0A 3UETA 3A4AA 3WFLA 1OCQA 1J0HA 2YKKA 2JF7A 1V0MA 1TA3A 3NSXA 1KQZA 1ITCA 2NSXA 1JYWA 4PMDA 1V0KA 1D7FA 1UWUA 1B3VA 1LG1A 4F9JA 3CUHA 1BAGA 1HJWA 1FHLA 1DEDA 3CZLA 2C8NA 2Y8VA 3AHZA 1X6NA 3VIPA 2WB5A 3OB8A 5AY7A 2ZOXA 4AW7A 3B9EA 1TVPA 2XFRA 1FFQA 2XPKA 4BA0A 1GONA 1LL7A 4CD6A 1B30A 1TMQA 3PZTA 3WF0A 1BYDA 2XFFA 1V3LA 4J3VA 3WEOA 4PUDA 4BQ5A 1TVNA 3KEHA 3AS0A 4JZ5A 2XTKA 2G3NA 2WCGA 5EBAA 1WCGA 1Z32X 4PMNA 1C8YA 4UQBA 1CGVA 3VNYA 2PC8A 4J3XA 2BV9A 4PTWA 2V5DA 4TXEA 2GJXB 1CXFA 2CYGA 6TAAA 1XD1A 3KZSA 2EQDA 4DUXA 9CGTA 2BNJA 2YL8A 4XV0A 4D1JA 1W1VA 2EO7A 3NDZA 2G41A 2O9OA 1B3ZA 3I3EA 2VRJA 1TG7A 1H4PA 3VIOA 3DYPA 1H5VA 1E6XM 1CPUA 3WF1A 3RDKA 4D6CA 1E1EA 3WF4A 1JAEA 1PBGA 1PJ9A 5EMYA 3WNMA 1O7AA 2PWHA 2WHJA 3FHAA 3VDBA 2F61A 2BXYA 2VX4A 1HNYA 7CGTA 5A6JA 1UWIA 1GOQA 1JNEA 1E6RA 4JFTA 3QHOA 1JF6A 1H0IA 4UOJA 2WAGA 1E4IA 5E70A 2IUZA 3F4VA 1V02E 1OM0A 4UFHA 3UERA 1MXDA 1PEZA 2J47A 1ZBWA 4AWEA 2DT3A 1P6WA 2ZWZA 3OGVA 3VPLA 4IUGA 2DEPA 2W61A 2BY3A 1GQIA 1KR0A 1NWUA 1VEMA 5CQ1A 4MNKA 1A3HA 4J3WA 1EA9C 2ZUVA 3VGGA 1FFRA 4CN1A 4XZWA 1BG4A 3A47A 4OJYA 3WD4A 3SCNA 3TTYA 1E73M 1XYZA 4BQ4A 2ZXQA 1B2YA 3L4YA 4U3CA 4B15A 3ARRA 2VQTA 3CHEA 3PTQA 1CBGA 2VX7A 3GH7A 4AZ6A 3RM8A 1QI3A 3F5LA 4GI8A 5DFAA 1JXJA 1G5AA 5CJ5A 2E8ZA 2VX5A 4S3KA 7TAAA 2DSKA 1WP6A 1ZBKA 4W85A 5ABEA 5GQBA 5I77A 5LA2A 2JIEA 1FOBA 2XM2A 2Y5EA 2X8RA 2YDQA 5A6BD 5A8NA 1HP5A 3AS2A 2D2OA 4UQDA 1TFVA 1UA7A 1OGSA 3VD7A 4Q7NA 1KXTA 3AOFA 1K6AA 5IDIA 3GNPA 3PBGA 3AISA 3MSDA 4U2YA 2NT0A 4YN5A 5A6LA 3G6MA 3ZQ9A 1W3HA 2CKRA 3VKKA 3WDQA 4LQ1A 1H2JA 5DEZA 3AHVA 4ZFMA 4H41A 1XD0A 1MFVA 1Q6DA 3N13A 1NWSA 1UZ4A 4HMDA 4XB3A 5A6AA 4BQ3A 2X09A 3VIIA 1US2A 2VC9A 1UQYA 4JCLA 1JZ5A 2X05A 2VTFA 3RJYA 4UOZA 1LJYA 2FH6A 2WVTA 4U5IA 1UR1A 4FLSA 3CH9A 5DT7A 1GOOA 2GJRA 3WD0A 4AISA 1WAWA 4W5UA 3W29A 3ZJKA 1BYBA 3ARVA 3ZJ7A 3AMLA 4TOQA 3E1F1 2D3NA 1IT0A 5A2BA 2YL6A 4BF7A 2WSPA 4P7RA 1MQRA 1C3FA 1TZ7A 1UKOA 1DWJM 4HU8A 4GXPA 3GXFA 4PMXA 2O9TA 2WANA 4FLOA 1KGWA 2WK2A 1UKSA 3BMWA 4PTXA 4PMZA 3GNRA 1E15A 3EMZA 5KZ6A 2PI6A 2CESA 3PTMA 3AIUA 4QCFA 2YL5A 4HMEA 3WL0A 5A6SA 3K8KA 4TVUA 2XUCA 2BVTA 3VGBA 5AYIA 4OOUA 2D24A 3RJXA 4HZ6A 4AYSA 3IJ9A 2PB1A 1NP2A 1JFXA 4AEFA 2DIEA 4WIWA 4OUEA 4X0VA 4BS0A 1CYGA 3W53A 1GW1A 1U2YA 4V27A 4J27A 1FHDA 2DIJA 1J18A 2ZX7A 1W1TA 3N04A 5BXPA 4CU8A 3BLKA 2ZUUA 4PCTA 2DDXA 3QR3A 1OB0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4IIS A;  1FP9 A;  1E56 A;  1KWK A;  1E4N A;  3ARY A;  1VIW A;  5GNY A;  4D6J A;  4GPN A;  6CGT A;  1KCK A;  3ZIZ A;  2HVM A;  1LL4 A;  4UR9 A;  2AMG A;  1QNQ A;  3AIW A;  1NH6 A;  1V0L A;  3HMC A;  3OGR A;  2B31 A;  3IK2 A;  1JZ2 A;  3WD2 A;  1JYX A;  1VEO A;  1GQJ A;  2WC7 A;  3MV1 1;  2UY2 A;  1OGG A;  1Q4N X;  4RE4 A;  1S46 A;  1I1X A;  2VUY A;  1J01 A;  3ZSS A;  1DWF M;  2OLH A;  2VMF A;  1YQ2 A;  1NAR A;  4TX6 A;  3NSN A;  3SEP A;  4CD4 A;  1KWG A;  3VTR A;  1W91 A;  1MYR A;  3QOM A;  2J7D A;  2WHM A;  1BTC A;  4GZE A;  3OBA A;  3ZT7 A;  1H11 A;  4AZB A;  1DWI M;  7A3H A;  1CGU A;  2QHA A;  2OWC A;  4DWS B;  4W87 A;  4WKH A;  4MAV A;  2VZT A;  2BY1 A;  3SCO A;  1ISY A;  3WUG A;  1VBR A;  4Z2L A;  5ECU A;  1JD9 A;  3ARX A;  2XSB A;  3I3B A;  4PMR A;  2CXG A;  5JBF A;  3W27 A;  2FHF A;  3WDJ A;  3CLW A;  1UYQ A;  3T08 A;  2J8G A;  2WMI B;  4HMC A;  5CPT A;  1X1N A;  1ODZ A;  1K9E A;  4MJ4 A;  1FA2 A;  1U33 A;  2YJQ A;  4P7O A;  3WH5 A;  3WMB A;  2VT0 A;  1VEN A;  2V3F A;  2ZUS A;  3VIN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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