4W89 | Genus

Total Genus 143

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	143
sequence length	339
structure length	339
Chain Sequence	DRSRVFDILSNINIGWNLGNTLDATGGGNSVNAETSWGNPKTTQEIVDTVNDRGFNAIRIPVTFANHLGPAPEYTISADWLARVKEVVDYAVNDGMYIILDTHHETNYWLKTDPNNEAALCEELAAIWKQLAEAFKDYDEKLMFEGMNEPRMAGSAKEWSGGTPAERKLINAMNKAFIDAVRATGGNNADRVLIICTYGHNSDEPTLKDLEIPSDPNIAVALHTYTPYFFTYVADGSYSVWNGSKKNDITWQYNNIKKYLIDKGIPVVITETGAQFKENTEDIVRWIGDYVGTLDQDGVKCFIWDNNIYHGNGEKFGLLNRSLLKWYNDDIVDAYVNHA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Uncultured bacterium
publication title	Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase
total genus	143
structure length	339
sequence length	339
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.151: Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase.
pdb deposition date	2014-08-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4w89A00

1UD2A 2ESCA 7TAAA 1RD6A 4GZIA 1XC6A 2QV4A 5BXTA 2UY3A 1PIFA 2J25A 4V27A 1J18A 3GXDA 2CESA 3BAXA 2X05A 4HOXA 3U7BA 3EYPA 4GQQA 1HJWA 1F4HA 1HKIA 4TVUA 2BY2A 3VGEA 2XVLA 1BQCA 4JHOA 4XUYA 5A6MA 4QCEA 1ISVA 2A3EA 4OIFA 1DP0A 3L4XA 1S46A 2ZXAA 2CHOA 3IAPA 1W2PA 4H2CA 4ATWA 2ZUWA 1HT6A 2D24A 3W24A 4E4PA 5A8PA 5I23A 1H09A 5M5DA 1LG2A 3WSUA 4LPCA 4OOZA 3WEOA 4UFMA 2FGLA 1BG9A 3AMLA 5C71A 3AMCA 3N15A 3VX1A 2XFFA 4QAWA 4AZBA 1JZ8A 4AZHA 1LJYA 1NOFA 1XSJA 4TTUA 4DWSB 3RIKA 4PMUA 1GORA 4EKJA 4Z2HA 5I77A 1JIBA 2J7EA 1UWSA 1R7AA 1HJXA 1CPUA 1BTCA 4TX6A 3WDPP 1ESWA 4N0RA 1GHRA 1HKMA 2V5CA 1AVAA 3MV11 2BVYA 4OOUA 2YJQA 1MYRA 3VU2A 1XGZA 1VBUA 3W53A 1GW1A 4D1JA 2WMIB 4PCSA 1MW3A 4NI3A 3RJXA 3L4TA 1EOMA 2WWDA 3BSHA 1MW0A 5LA1A 3UETA 4U2YA 3WH8A 1UZ4A 1H3GA 2GJXB 2C8NA 1ZBVA 2W5FA 3BAWA 3WD2A 1V6WA 4M56A 2BVDA 4HU8A 2J7CA 3E1F1 3VIGA 3U5UA 4BQ4A 4IPNB 5ABFA 2VVSA 4AIEA 2XGIA 1JNDA 3W29A 5EFFA 3SCQA 1GOKA 2VQTA 1XSIA 2NT0A 5HPOA 2PF0A 1MQPA 1JFHA 3HU7A 3AS2A 5A1AA 2YLAA 3GBEA 1DEDA 3IK2A 3U5YA 5A69A 3AICA 4ACYA 4RE2A 3VDBA 2OWCA 4HOWA 2NSXA 2HVMA 4CD7A 5E6YA 4GI8A 4IISA 3RM9A 1D7FA 3GYCA 1MQRA 4DM2A 4FLQA 1R87A 4P8WA 3BMWA 1E6NA 1FA2A 4HA3A 1NH6A 2QMKA 1GHSA 3PZUA 4Q22A 1KXVA 4J28A 2ZUVA 3ZT7A 1WO2A 2FHFA 2BHYA 2F8QA 4AZGA 1PPIA 4HPHA 3M46A 3WQ8A 2D20A 1EDTA 1F4AA 2WHKA 1EHAA 4AMCA 4GIAA 1HJSA 4W86A 3GH7A 1BGGA 2XG9A 3DHUA 3CUHA 3GDBA 2D22A 3WENA 4AEEA 1HVXA 1C8YA 4M8UA 3B9DA 3FW6A 3ARTA 3RM8A 1GZJA 1WNOA 1QNQA 2WCAA 3LPFA 1GOQA 4ZENA 5AY7A 5E70A 2CBVA 3QHMA 4EAMA 3CZKA 4H7VA 1GOOA 1JYVA 1QNRA 4MB4A 1BYCA 2YOCA 1WDPA 3VUPA 2JEPA 4RE4A 1BF2A 5HBFA 1DWFM 4OKDA 1O6IA 5GNYA 1G9HA 1DWHM 3WUEA 4ZEPA 2PWHA 1J12A 1EDQA 1H49A 3PZ9A 1GJWA 2WZHA 5AYBA 3W4RA 4JHZA 3WQ5A 1J0ZA 3BCDA 2VCAA 2VVNA 2W63A 1PIGA 3ZO9A 3VD9A 1UR4A 4U3AA 4RL3A 3NJ3A 1H0GA 1KCLA 2PWEA 3WNLA 4UQDA 4PMYA 4WSJA 5JIPA 2WANA 4M80A 3NUKA 1VFUA 4ATDA 3EMQA 4GKLA 2BFGA 2GK1B 3SURA 1L8NA 4AXNA 2RGMA 1W1VA 1WDSA 1V03A 4P7OA 3M6DA 2E40A 1JYNA 5FOOA 3GXMA 3VKKA 3FAWA 5LA0A 2VZSA 5DMYA 4JCLA 4S3KA 1OWQA 4S3JA 4JFUA 3RM4A 3BC9A 1JD9A 2WVVB 4KRUA 4Q7NA 4BQ3A 2WSPA 4W84A 4PUDA 2E9BA 3VTRA 3DYPA 5I3DA 1CENA 1B30A 3AJ7A 2ZX5A 2BVTA 1TG7A 2TAAA 2WMKA 3WNPA 1PBGA 3AMKA 1E4IA 4ZE5A 1CXIA 1AQ0A 2PWGA 2CERA 4CD8A 4M82A 4UFHA 1CLVA 2V3DA 3A47A 1QNSA 1JG9A 1L0PA 4HMCA 3VOCA 2WKLA 1JI2A 4AD3A 3L4VA 4P8VA 3WKZA 4N42A 1B0IA 3N12A 1OBAA 4P7QA 1CTNA 2UY2A 2WLYA 3D3AA 1MFVA 1NP2A 2DGAA 3GNOA 4QLJA 1ODUA 3GBDA 4JAWA 1TUXA 2V38A 4HA1A 3GNRA 3APGA 3SCTA 4AZ6A 1K9FA 1AQMA 3GNPA 3G6LA 4DUWA 5JBFA 3BMVA 1N82A 1V3KA 1CDGA 1SMAA 1J0HA 3OZPA 3W81A 1Q4NX 4GPNA 2VZVA 1HVQA 3K8LA 2F2HA 3CBWA 3K4AA 4GO8A 4AYSA 3SUUA 2XM2A 2GDUA 4UR9A 1UR8A 1EH9A 3UG5A 1JAKA 4AC1X 2CBUA 5HDRA 3MS8A 4PYSA 2BHUA 3PTKA 3K8MA 4PSPA 4X0VA 5D9NA 3OLEA 1Q6CA 4AD4A 1VEOA 3WH5A 2WPGA 4D1IA 3OLIA 1IT0A 1KBKA 2IXVA 3ARPA 2EEXA 1V6YA 2DIJA 2Q8XA 2YDSA 4B9ZA 4CU6A 2IXUA 3VDCA 1E6QM 1B31A 4ATLA 1C3FA 2E8ZA 3ZR6A 3WD4A 3CHDA 2GFTA 2PWFA 1UHVA 1LLOA 4ZE4A 4P7NA 1OT2A 2CIPA 3AOFA 3W0KA 4H04A 1E5JA 4MNMA 3ZJKA 2VMFA 4A3YA 4MAZA 1C93A 2VX7A 3WNMA 2V3EA 1CZ1A 2X1IA 1Q6FA 3SCVA 2DSZA 1E0VA 2OLHA 2XVKA 4Z2IA 3VX0A 1EDGA 1RP8A 3WBAA 5CGTA 4UOQA 1E71M 3J7HA 8CGTA 3OB8A 1CEOA 4E8CA 2WVUA 1UKTA 2A3AA 2QLYA 4KGLA 3AIQA 3T09A 1FH9A 3W6MA 2VR5A 3ALGA 1LF1A 5TD4A 1ITXA 2WKGA 3B8SA 2XYLA 1ISYA 2NT1A 4J7RA 2WCGA 4TUFA 2CXGA 4JL2A 4B15A 5A6SA 5IFTA 2XSAA 1XRVA 1UA3A 2YL8A 1I1WA 2XWDA 3WUBA 2O9OA 2FGZA 2O9PA 4MDPA 1UWRA 4C7GA 3AHYA 3GXFA 4MADA 1BYBA 3KWXA 4K68A 3FHAA 1W9BM 2OSXA 3EDJA 5DO8A 1QI3A 1UH3A 4TOQA 4P8XA 3TTQA 1EOKA 2WHMA 1GQLA 2XVPA 4F9DA 2J75A 2CYGA 1FH8A 5A2AA 3WMSA 1J11A 2ZXDA 3N11A 2OSWA 2Y8KA 3AQUA 3WQ6A 3CHFA 4MB1A 1LL6A 1VRXA 2BY3A 4BQ5A 2X2YA 2ZX9A 3SUVA 1C91A 5A6AA 1GQJA 2QF8A 3RDKA 2Y5EA 3VIKA 1NWTA 3L4WA 4UQEA 2VI0A 3W25A 1E56A 1LQ0A 4NRSA 4U5KA 3VIFA 1Z32X 1UQZA 3VGFA 3ZM8A 2XFYA 3AHZA 1X6NA 4GI6A 1TMQA 3GM8A 3ECQA 3FHQA 3BAIA 3PZNA 2XSBA 2XVGA 1O7AA 2J8FA 4LQ1A 4PTVA 1W2VA 4KWUA 2A3HA 2XJ7A 4AW7A 1RPKA 2DT2A 1SFSA 2OWWA 1Q6EA 2XM1A 3HN3A 2UWFA 2XVNA 3ZOAA 3CO4A 1U2YA 2MANA 4PBGA 1BYAA 4UCFA 5FD0A 4AY1A 4TVDA 3AIUA 3WD1A 2DH3A 4MNKA 1NARA 3O9NA 1I75A 3IJ9A 2Y4SA 3LPOA 4M29A 4JFTA 2WC3A 5A6BA 3ARUA 3PZVA 1E3ZA 4WKAA 3MO4A 5DF0A 1WAWA 3SCNA 1W3JA 3GZAA 2OWXA 4W8BA 3UEQA 1JDDA 1LL7A 3VMPA 4ACZA 5D9OA 5F7UA 3O6AA 3NDYA 1EQCA 1UUQA 1XD0A 1W9VA 2EO7A 2D0HA 3NSXA 3K8KA 4HPGA 4PRWA 3M7SA 2O9RA 5BXPA 4A4AA 5CXPA 1G0CA 3SUTA 3WNOA 3UCQA 4P7LA 3T0BA 1W9XA 2FDMA 3W28A 3WH9A 5I79A 2E3ZA 4LGXA 1U30A 2UY5A 3ARZA 1LL4A 1C7TA 1JZ4A 3CLWA 4XZWA 3WMCA 3VGBA 3QOKA 3UERA 3ZSSA 1A3HA 1V0LA 2DSWA 2YBTA 1P6WA 4PMNA 3AIWA 2D3NA 4L4OA 4W89A 2XHYA 2YA0A 3MMDA 1GVIA 1UD5A 1UR2A 5CLTA 3WFZA 3VM7A 1UKPA 1CGVA 1HKJA 4F66A 1E72M 4AWEA 3B9AA 3BLPX 4U31A 4AZ7A 3VIPA 3BAYA 1JNEA 4PMQA 2QMJA 2E9MA 3VGGA 2XUCA 2VNCA 3OZOA 3VNYA 1QBAA 2A3BA 5LYRA 2EPMX 1ZS2A 4QDMA 1UWUA 2C7FA 4MB5A 3CHEA 3THCA 1XYZA 1XSKA 4J3TA 1NM9A 4W88A 3TA9A 2ZX8A 2E8YA 1HJUA 4HA4A 3SCUA 2DSVA 2Z1KA 1OCQA 1E73M 4V2XA 5HNNA 3WIJA 2GSJA 2YDQA 1EO5A 1KWGA 1JD7A 2WBGA 4AD0A 3IAQA 2JE8A 3AYRA 1B3ZA 2DSUA 1B3WA 1V3MA 3ARXA 4PMRA 3VILA 1DWGM 1BSIA 1E1EA 4BS0A 1SR0A 4KGJA 4BF7A 4CCCA 4U3CA 4FK9A 5CZKA 1GOWA 3I3EA 2EPKX 2WHJA 4AZ5A 5A8MA 2EPOA 2W92A 3PZMA 2VCCA 1M04A 1BG4A 1KB3A 1RP9A 4D71A 4ZFMA 1MXDA 9CGTA 2D1ZA 1JYXA 5GNZA 4NSBA 4DWSC 1J01A 1TVNA 3AI0A 1US2A 2CETA 4UFJA 2FH8A 3WDRA 2CBIA 1JF5A 4LXFA 3W6LA 2PB1A 5E0CA 4QLLA 3K4DA 4CGTA 2VUYA 4D6EA 1PZ3A 4FLOA 3CPUA 2WB5A 1UZ1A 4UFKA 4M81A 3ZIZA 1KBBA 1NP0A 3L2LA 4IUGA 4D6IA 4JKKA 3SEPA 5A8NA 4DWSD 1CBGA 4FLRA 3WDIA 3U7VA 5FKYA 3AZRA 2UY4A 3PN8A 2EBNA 4JFVA 5HPCA 4UQ9A 3MANA 3OGSA 5A2BA 4HMDA 4P7RA 3UG3A 2VZOA 4J3SA 1G1YA 5DT5A 2J7GA 1UD6A 5IHRA 1CYGA 3ZQ9A 2YIHA 4EE9A 4W85A 5FCZA 2BY1A 4Z2LA 3I3DA 1PX8A 1XHGA 5ABFB 3EDDA 5BXRA 3VIOA 1IV8A 3ZT6A 1FHLA 5CLWA 3THDA 2WNWA 5I24A 1JAEA 2W4XA 3L2MA 1Q6DA 3MSGA 2JIWA 4W93A 3AIVA 1V3HA 3AHTA 4KH2A 4DM1A 4YHGA 1JZ3A 4PN2A 3VPLA 1M53A 2BV9A 1ISWA 5I0DA 2Y8VA 4UZSA 1WZKA 3ARVA 1W3HA 5JBDA 1UH2A 1MXGA 1OIFA 1ZJAA 3OBAA 3BAKA 1VIWA 1J0YA 3GXIA 3ZJ8A 3WMBA 1GQKA 3NYDA 5DT7A 1C7SA 1VBRA 2DQXA 5IXEA 5CJ5A 5ABEA 4UTFA 1W1YA 3CUIA 3ZT5A 5ABGA 3MUZ1 2O9TA 4CD4A 3VGDA 3RO8A 2E0PA 3CZ8A 4TTGA 1CECA 3WEMA 2GVYA 1TCMA 4JFSA 1W3LA 2YDRA 2WZIA 4CKQA 2YA2A 4D72A 2VRQA 1WP6A 1UR1A 2CPUA 1VEMA 2AAAA 2DPEA 1BLIA 4AZCA 1VENA 6A3HA 1GNXA 1HIZA 1NWSA 1KGXA 5HOSA 4QP0A 3LPGA 4URIA 1ECEA 1KFWA 3WDJA 1EIBA 2C0HA 5EMYA 3CUFA 1BYDA 1GCYA 1UKQA 1CXEA 1ITCA 3KL0A 4KMQA 1DTUA 3HJEA 3BH4A 1TA3A 5BXSA 2VQUA 3EDKA 4MB3A 3AZSA 1BHGA 4PTMA 3MMUA 4NRRA 1WE5A 2ZX6A 5BYWA 1QNPA 2WM0A 3VD5A 1H4PA 1GUVA 2DT0A 4HP5A 3SUSA 1BPLB 1V0NA 5D9PA 2QHAA 4YPJA 2JFEX 3JUGA 1V3LA 2CEQA 1W1PA 4W87A 1QHPA 2ZUTA 4GZEA 4Y7EA 1ZBWA 3QGVA 3MV01 2YL5A 1JZ7A 3TTOA 4CVWA 4W5ZA 4PTWA 1HF6A 3ZR5A 3AMDA 1H2JA 1E5NA 3DHPA 1RH9A 4L4PA 1CGYA 3L4YA 2BS9A 3WL0A 1BVZA 1E4NA 3N04A 2GJRA 5AC4A 4F79A 2V5DA 2ZE0A 3UR7A 3WH7A 3AIBA 2G3JA 4MAVA 4ZXOA 3LMYA 2ZUUA 4RE3A 1PEZA 2D23A 4OZOA 3N13A 4HZ7A 3AYSA 1VFOA 4FMVA 2W62A 1H11A 1FFRA 8A3HA 2VOTA 2OYMA 3AHVA 1JL8A 5M3WA 5A3HA 1WZMA 4MNJA 3F4VA 3A4AA 4X9YA 5E9AA 1VF8A 1FP8A 1VJZA 2ZWYA 3CHCA 1XH0A 4EANA 1QOXA 3PHAA 3VVGA 1W9UA 1KQZA 4AZCB 2YA1A 3LPPA 4F9JA 1QBBA 3PZOA 5CGMA 3TTYA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4W89A

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Chord Diagram

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