4WBJA

Crystal structure of bradyrhizobium japonicum scoi in the oxidized state
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
157
structure length
157
Chain Sequence
b'AIGGPFQLTDQNGKAVTDKSLKGKPTLIFFGYTHCPDVCPTSLFEISEVLRAMGKDADKVNAIFISVDPERDTPATMKNYLSSFDPHLEGLSGDPAEIAKVITSYRVYAKKVPTKDGDYTMDHTALIYLMDRDGRFVSPFNLKRTPEEAAADLKRYL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Bradyrhizobium japonicum ScoI in the oxidized state
rcsb
molecule keywords Blr1131 protein
source organism Bradyrhizobium diazoefficiens
molecule tags Chaperone
total genus 51
structure length 157
sequence length 157
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4wbjA00
3IC4A 1ERTA 1K0MA 1SK2A 3CTGA 1XPVA 3VK9A 4OD7A 3IHQA 1BAYA 2OA7A 3A2WA 5B8AA 1OAZA 3TKSC 5GAPD 3E9JB 4PUFC 4ML1A 5G2ZA 1DUGA 3S9FA 1UVZA 4NV2A 1AUCA 22GSA 4HZ2A 2WRTA 4J2FA 3E3EA 3MSZA 1HNBA 1ERWA 3RHCA 5IMAA 4KSMA 4KX4A 5DALA 4HU7A 4L0UA 3FYGA 5ABRA 2I4AA 3P8WA 1GLQA 4MZCA 18GSA 3APOA 2H6YA 4PNFA 5IMCA 3KP9A 1OE7A 1O7UA 5G1KA 4IKHA 4I2UA 3HY2A 2PERA 1USBA 10GSA 2H1GA 3P7XA 4E8EA 1X5CA 2H74A 1TP9A 2A2RA 2BJXA 3GFKA 2E2GA 3FHKA 3UIWA 1GRXA 2GQMA 3C1SA 3NIVA 4GSNA 2GSTA 2C0GA 4TR1B 2L5LA 3HXSA 5ID2A 2YNXA 5D9WA 4ZBBA 4K0NA 4EO3A 2MMNA 2RIIA 2DIYA 3WGEA 4WR4A 4POKA 3RDWA 2FUG2 5AN1A 1PKZA 1ACVA 4ID0A 4XHMA 2LRCA 5A4UA 3UAPA 5FHIA 3A2XA 3UBKA 3FR9A 3H8QA 1M2AA 5G31A 1U6TA 1SKRB 1ZMAA 1MTCA 1XOBA 1SD9A 4O5RA 3HZ4A 5CRHA 1VF2A 1GLPA 2X99A 1ABAA 4YAPA 5CYYA 5DJLA 2CQ9A 3TRPA 3CRTA 5B7CA 1BEDA 13GSA 3GA4A 3QD9A 2GZPA 1FVKA 3GKKA 2H30A 1ZYQB 2ON5A 4OWYA 3GURA 2VOCA 2IL3A 5FT3A 2XBIA 3WGXA 3DKSA 3FRCA 1MD4A 3L78A 1X9MB 3H4KA 3O3TA 4Q5QA 1VF3A 1DE2A 2XPEA 2O7KA 3QDNA 1W89A 4WEYA 3G7JA 1A2JA 2LKUA 3EMXA 4KCAA 4DSQA 2R37A 3GRXA 5B6MA 2QSIA 1A0FA 3F4RA 1A2MA 2CAQA 2LRTA 3C8EA 1AQXA 1JFUA 4K1FA 4TRXA 1OC8A 2H0IA 4GSSA 1X5DA 1EWXA 3KTLA 2LNSA 4HQSA 11GSA 1ZCPA 3HJOA 3FW2A 2F8AA 2HRFA 2LTKA 2VCTA 4Q5RA 2D2ZA 2H1DA 3R2QA 3QMXA 3AY8A 1ERVA 2GDRA 3GX0A 3QR6A 5HR3A 2B7JA 4N0VA 2KLXA 1VF4A 4IVFA 5AIXA 4XS4B 2WGRA 1Z5YE 4HJMA 1EZKA 3TB2A 1EGOA 2OE1A 4ACSA 2VL3A 2CX3A 4EUYA 5JWQB 4V1Ap 2JZSA 1S3CA 1TK0B 2DJKA 3GMFA 2LJRA 3ZRDA 3P90A 1G7EA 2I9HA 1V57A 3F8UA 4MPGA 1TRUA 2V6OA 3TKQA 3G7YA 3J7Yk 5HFIA 2FY6A 1UA5A 1SENA 1SKWB 5IMDA 3DXBA 5CRWA 1TI1A 5G1LA 3F3RA 2JZRA 3VPTA 1SYRA 3TCOA 1SK0A 2K8SA 6GSUA 1OVNA 4O7HA 4GLTA 1ON4A 1YDKA 3KMNA 2H6XA 1QXHA 1HD2A 5AISA 1T4ZA 2HZEB 1MDJA 1BG5A 3CSIA 1V9WA 2R5GA 1EP8A 5G5EA 4KDUA 3DRNA 1C72A 1YKAA 2AB6A 1SL2B 4XS1A 1NHYA 3NZNA 1PRXA 1TW9A 2WULA 14GSA 2C3TA 4Z7XA 2GVPA 3L9UA 4ZL8A 2VM2A 1B9XC 3UJ1A 2ZCTA 2VD1A 2F9SA 1Z7PA 3VWXA 3HVSA 3E0UA 2HSYA 2B5XA 1YQ1A 3KH7A 5LCZA 1A24A 1NSWA 3DVWA 2M80A 2JSYA 1J0FA 3IA1A 3ZMLA 1BQ7A 5B8BA 1GULA 1GTBA 2I81A 2WDUA 2L4QA 5JWRB 1XW9A 2RM6A 4EXJA 4MJEA 2YV7A 4PURA 1O81A 2KHPA 1KBNA 2GT6A 3DEXA 4L5OA 4KW6A 1Q4JA 1ZYEA 3IK9A 4YAVA 2HXKA 2N5AA 3CSJA 3GIXA 1XVWA 2C80A 2GGTA 3DMLA 3TKSA 3ERFA 1F2EA 2GQLA 5ECKB 2DSAA 5AIVA 3TKRA 3KIJA 1VGLA 4G9HA 4TR4A 3TOTA 1JLVA 3GSTA 1AC1A 2VAFA 4KE3A 3DWVA 2PVOC 3D5JA 3Q6OA 2IMFA 2H76A 1GNEA 1GUKA 1M7TA 2YPMA 3TJGA 1MDIA 1TKDB 1TK8B 4JRRA 3DGQA 4TXOB 3EC3A 1URMA 2WZ9A 2N5BA 3ED3A 3QFBC 4G19A 1XW5A 3HVXA 5GSTA 1Z3EA 2MMZA 3LXZA 3D6IA 1GSDA 3MAKA 2YOIA 2R6KA 2KOKA 4KH7A 1SL1B 2P0GA 3H1NA 2N5FA 3D22A 3P2AA 5D73A 5ECPB 2YANA 2GQKA 2H66A 3VWWA 1X0RA 3HVVA 2OADA 4GRFA 2RUEA 4MK3A 5D9XA 4N0ZA 3ZZXA 3QFAC 4MLYA 4PUAA 2FWHA 2WJUA 2PVQA 3G9BA 3DD3A 4V2LA 1X9SB 4F2IA 1ZL9A 3IAM2 4FYBA 4OMVA 5C00A 4AJ6A 2NBSA 2P5RA 4LL4B 5C04A 4XS4A 1GSSA 4BVXA 4MZWA 1ERUA 1GUMA 5ECHB 4MZBA 5IO0A 4ZXGA 5CP1A 4F82A 5HFKA 4ECJA 2C0EA 1A23A 5F07A 4K6XA 1V40A 1YF0A 1O8WA 2KUCA 3H93A 1PD21 4MH3A 1ZZYA 1WPIA 2C3QA 2HRNA 3ZVJD 4XTSA 3RBTA 3WD6A 1A8LA 1R7HA 6GSYA 5J9CA 4HEA2 1GSUA 2DJ0A 5J3RA 2BMXA 3TKPA 5CO3A 7GSSA 3I43A 1AQVA 3WGDA 2HZEA 5ECMB 3M1GA 1M2BA 2AV4A 2CZ3A 4LMVA 2VL2C 1ST9A 2AAWA 2VCQA 4MF7A 1J08A 5D9VA 2VLVA 1M99A 2PBJA 2LS5A 4XRAA 1QK8A 5IO2A 1PKWA 1B48A 4MJBA 3I69A 1A0RP 5F06A 2CVBA 4TKYA 1G7OA 3HJPA 3UVHA 2B1LA 3EINA 4KCEA 2E7PA 2CVDA 1O85A 2GTUA 2MBSA 3ZYWA 2M72A 2X8CA 3MDKA 4ZL7A 4RI7A 4HI7A 1F3BA 5ECSA 3CSHA 20GSA 2CAIA 4G10A 4YQMA 1GSQA 3ERWA 1T8EB 3VI5A 2EC4A 1YZXA 5D96A 3RHBA 1VF1A 5ECRB 3CXGA 3I6AA 4ILFA 2DJ1A 1GSEA 1EV9A 2B6MA 1XIYA 1LBKA 4EVMA 4JBBA 4CDOA 1EOHA 4K7OA 3ZREA 4KNDA 1MEKA 1IYIA 3UL3A 1WMJA 3K8NA 2O87A 2RM5A 5EL8A 2VUPA 2JZTA 3M3MA 3KP8A 4GXZA 5HQPA 2XHFA 2FWEA 4F9ZA 4ISDA 4BVYA 1PSQA 3UEMA 1OC9A 2DJ2A 3VLNA 4I8BA 3D4MA 4MJAA 4LL1B 2IFQB 5G30A 2K8VA 1FHEA 3TKSE 4GCIA 5D8IA 1SJZA 4IQ1A 4KUNA 5DDLA 4K7IA 4KDYA 5E4WA 2IJYA 3APSA 3D21A 1O8XA 3QAVA 3ZMKA 1R4WA 3F6DA 4KDXA 4MP4A 1QGVA 1R26A 3TRQA 2G0FA 2H6ZA 3HYPA 5HR2A 3D0ZA 5JCWA 4ECIA 3A2VA 4GSTA 4FO5A 1TDIA 3FZAA 2F8FA 1JLWA 3QAGA 4PQHA 2RUFA 2YP6A 5GSSA 3N9JA 3ZFLA 3WT1A 5DQYA 1YY7A 4NWYA 1LJRA 3EE2A 4QL7A 3IXRA 3HA9A 1TU7A 1WJKA 2O8VB 1G6YA 1ZGNA 3EMPA 1TU8A 9GSSA 2TRXA 5EPFA 2NPBA 3GTUB 1B4QA 4NMUA 2DMMA 4FYUA 2OE0A 4F0CA 2FCHA 2V41A 5DQSA 1KNGA 4Q5NA 2L5OA 1M2DA 2HLSA 2E2MA 1Y6EA 4EKZA 1QQ2A 3N5OA 1K0CA 3EURA 2WB9A 1TRSA 2LNTA 3C73A 1GP1A 3ZIVA 5ECLB 4GQFA 1OKDA 3FZ5A 4EL1A 3KD0A 3TJBA 1FOVA 3KM6A 4K7NA 3O6TA 4TR0A 6GSXA 1PMTA 3UMAA 5CREA 4DSSB 3HDCA 4ML6A 4I5QA 4ZB6A 4F03A 5D9TA 1TTZA 4P3YB 1MD3A 3ERGA 4AF2A 4AJ7A 4WBRD 2B5EA 4TOPA 3JCML 3QPMA 3F0IA 4WF4A 1X5EA 5F8BA 2B1KA 3KCMA 2K6VA 4FH8A 5DBQA 1QUWA 1NHOA 5EY6A 2CZ2A 16GSA 3F4SA 4FIWA 5CNWA 1WOUA 3V1WA 1FG4A 1SYXA 3LXTA 1YEPA 4NHZA 1BJXA 3F4TA 4EC0A 2VLTA 3CTFA 1EEMA 3PGTA 2OBKA 4POLA 5IMVA 3FR6A 1E6BA 1XWAA 2J23A 4HOJA 6GSVA 4J57E 3VWUA 4WF5A 2HFDA 3TUEA 5IIZA 3GSSA 1JZOA 2X8GA 1AIUA 2CVKA 4FYCA 1PQNA 3W6GA 1PN9A 2EIQA 2ALBA 2C0FA 2VM1A 3MWHA 1FO5A 1F3AA 4NXIA 2PGTA 1ZOFA 5H5RA 2H1AA 1V98A 4IQAA 3GL5A 4TR1A 3KZQA 4XRDA 2MZCA 1GTUA 3GN3A 5HR1A 4Q5FA 2GT5A 2GS3A 3A3TA 5IOWA 3HHVA 2V2GA 5DALB 1TRWA 5GZZB 4HUAA 3UOMA 1KEBA 3IAS2 1GSYA 2P31A 4RQXA 1BYEA 4OO4A 2L59A 4F0BA 6GSWA 2C1YA 2FD3A 4K2DA 1R5AA 3RPPA 2Z9SA 3Q74A 2KP1A 1TOFA 2VCWA 4J56E 1QFNA 3VI7A 4I6XA 2GSRA 2IN3A 2VL2A 4ZBDA 3OR5A 4BA7A 3TJFA 2G2QA 1CQHA 2FA8A 5E59A 3F6FA 2FGXA 4JEDA 4NV5A 4YH2A 1EEJA 5A5KA 3U6VA 4HS1A 2VIMA 2JU5A 2PPTA 2RLIA 2YZHA 4PXOA 2PN8A 5ID2B 2QC7A 3LSZA 1SK1A 1YEXA 3QCPA 2DC5A 1DE1A 1AW9A 3VWVA 1XCCA 19GSA 4MH2A 3PR8A 3GH6A 2IMEA 4MA9A 4POMA 3GTUA 2J9HA 1LU4A 1TRVA 2DMLA 1SJ6A 4IP6A 2GZYA 2LEGA 4V2NA 2I3YA 4L5LA 1T4YA 3FZ4A 1Z9HA 2JACA 5EVOA 3EU3A 4HJ2A 3KJYA 4QQ7A 3KEBA 4IBPA 5ECQB 4D73B 5IQYA 2LSTA 1GTAA 2AHEA 3M0FA 3FY7A 4HZ4A 2PUKC 2YJ7A 2VD0A 5H5SA 1OC3A 1Z6MA 2YWNA 2MMAA 4GQCA 3LYPA 2BTOT 3WYWA 4WETA 5IOXA 4HQZA 2TIRA 4POBA 5KEJA 2V1MA 1WE0A 1AXDA 3UVTA 1W4VA 1YF1A 1HNAA 5DAKB 1XWCA 5ECOB 4WBJA 1YJ6A 5DCGA 4XIHA 1O73A 3UARA 1XXUA 4HU9A 2B5YA 3I9V2 3BD2A 1V58A 4DVCA 2CV4A 1H4OA 3IR4A 4WKWA 3FKFA 1DBYA 1Q98A 1ML6A 4V1Ag 3SBCA 1FVJA 2LUSA 2QKEA 3GH9A 4YQUA 4DSRA 3CMIA 4L0WA 4PQIA 1HQOA 2E0QA 6GSSA 5A4VA 2XC2A 4OO5A 4CHSA 3IK7A 4TVEA 1XW6A 3GKXA 2WS2A 2VCXA 1SL0B 1A8YA 4E8HA 2OE3A 3H79A 1I9DA 3ME8A 1SD8A 4BL7A 2HI7A 2GSQA 4XCSA 1B9YC 5KN3A 2P5QA 4PGTA 5KN0A 1PL1A 1DSBA 2JADA 2R2JA 8GSSA 1ILOA 2EIOA 2H71A 2H1BA 5H5QA 1NM3A 1GWCA 4IS0A 2NTOA 1X9WB 1EOGA 4IHUA 2M46A 4H86A 2FLSA 2DBCA 2DJ3A 3L4NA 2H0HA 4IP1A 4WR5A 1Z6NA 3HCZA 3ZFBA 1TJDA 1K0BA 2GZZA 3CRUA 4HDEA 4NPBA 4WXTA 1U3AA 1B4PA 2PMTA 5G5FA 3DYRA 3MNGA 1H75A 5ELAA 3L9SA 1XWBA 1AAZA 4TXVA 2H72A 1OYJA 1K3OA 2NVLA 4CW9A 1HNCA 1J9BA 1PGTA 3RPNA 4LA1A 1K0OA 4JU5A 5DCHA 1U3IA 4KGIA 3TGZA 2H01A 1T1VA 1B8XA 2KP2A 2FNOA 12GSA 4OFMA 1WRYA 1FAAA 2MBTA 4TXOA 2PWJA 1NW2A 3TJJA 1UN2A 4IJ3A 4TR3A 6GSTA 1CQGA 1JZRA 3HJMA 1OE8A 2O85A 3M8NA 3IOSA 1PX7A 5IPGA 5J9BA 3L9VA 1PX6A 4X0XA 1XFLA 3M9JA 3SWLA 3ZL5A 4O32A 4G2EA 4I97A 4KB3A 4ZIJA 5ECNB 2H73A 2YCDA 5CRGA 2CX4A 2X8HA 4O92A 3Q18A 2IIYA 2LV3A 3LWAA 1KTEA 5B6NA 2HNLA 2YV9A 1XBSA 2ES7A 5CRDA 1TI3A 1R5PA 2A4VA 3U5RE 4X1UA 4EDYA 1MDKA 4YQVA 5KN2A 4D73A 2VO4A 2C0DA 3J7Yb 2IMIA 2ZNMA 1O6JA 1XWKA 3TDGA 2B3SA 1F9MA 2DLXA 2XPDA 3US3A 3GX8A 5IPHA 2LJKA 4GF0A 2A2SA 1XZOA 3L0HA 4JR4A 2DIZA 2ON7A 4ZL9A 3LFLA 3KXOA 4OCEA 3CYNA 5DAKA 3UBLA 1EGRA 1THOA 2K9FA 4GWRA 3LQ7A 2IMKA 2AYTA 3O76A 5JCUA 4NAXA 3EWLA 1OKTA 3ZITA 2C8UA 1XWGA 3HZ8A 3LJRA 2FWFA 2AUVA 2CA8A 4BWSA 5IMFA 5F0GA 4BWQA 3W8SA 5J5NA 2FA4A 2IWTA 3F3QA 1GTIA 1WIKA 3W8JA 1SU9A 2OBIA 2TRCP 3GKMA 3QAWA 1JHBA 2PU9C 3BJ5A 3BCKA 4I2TA 1G6WA 2QGVA 3HKRA 1G0TA 1M0UA 2HSHA 4DEJA 2F51A 1GNWA 3VURA 2O89A 2L4CA 2LQQA 2FHEA 1PA3A 17GSA 2OJLA 3LORA 5D93A 2LRNA 1FB6A 4K0GA 1E2YA 3C1RA 3ME7A 3ZTLA 1K3YA 4TN8A 3BCIA 3KH9A 4KA0A 3IDVA 3EU4A 4MF6A 3BBYA 3KMOA 2REMA 2CT6A 2VCVA 2MMOA 1HYUA 5LD0A 5AGYA 5A4WA 3LYKA 3FK8A 4TW5A 4IELA 5IMZA 4N30A 1GL8A 2HYXA 4MPFA 4GTUA 2IMDA 2LQOA 3C7MA 1BX9A 1EV4A 4IGJA 4RUVA 4EDZA 2H70A 5DJMA 3PINA 5J4UA 3PH9A 1M9BA 2HE3A 5IM9A 2HT9A 3IE3A 2H0GA 4ZB8A 1S3AA 2DJJA 3F63A 4OCFA 4ECBA 1THXA 3HD5A 1U88A 3C71A 3IPZA 1RW1A 2YWMA 1K0NA 4ULXA 3F9UA 4EE0A 3ZIJA 3ZLPA 1F6MC 5GAND 1FB0A 3D4TA 1JZWA 4JZQA 1YKCA 4PX1A 3IV4A 3IRAA 5CAXA 4IJIA 4JE1A 3LGCA 1RK4A 1GSFA 1Y25A 1WP0A 3TRXA 1T7PB 1U87A 2IFQA 3ISOA 2WCIA 2YN1A 3GHAA 5HFGA 3TOUA 1K3LA 1PL2A 1N8JA 2C4JA 3TJKA 1T00A 3FR3A 4XS6A 4L8EA 2YJHA 1JZDA 3LEFA 1WWJA 4AJ8A 2OKAA 5F05A 1FW1A 1XOAA 3VFIA 4MJCA 5ENUA 5JCGA 1SJIA 2LJAA 4MDCA 3FEUA 5HR0A 5DVBA 2F3MA 3GL3A 2YWOA 2H75A 2JSZA 1F37A 1T3BA 2VLUA 5L71A 2B7KA 4KSOA 4LMWA 2OACA 3GYKA 2K18A 2EIRA 2L57A 3GNJA 1GH2A 2IPAA 3GV1A 1AQWA 3Q19A 4V2MA 4X43A 1XVQA 3DIEA 1QMVA 1V2AA 5KN1A 2R4VA 1SKSB 1IYHA 2MYGA 4OFNA 1OC9B 4ZBAA 2VCZA 2YWIA 5JWOB 2V6KA 2VL9A 5FWGA 4MCUA 2C3NA 2FWGA 4RI6A 2V32A 5COHA 2R3XA 3M9KA 4LLRA 3EVIA 3IBHA 2XBQA 3DVXA 3CBUA 4IW9A 2I1UA 1S3DA 4KAEA 4K9ZA 3FZ9A 5J41A 2YZUA 1TXXA 3GUSA 1VRSD 4PQ1A 4QL9A 4PNGA 1RQMA 5ECIB 4DSSA 3G7IA 2L6CA 1K0AA 4K8MA 4BPYA 3LG6A 2L6DA 3VPQA 2AJQB 1M9AA 4ZB9A 5LNKe 4IN0A 1N2AA 1I5GA 1TK5B 1GUHA 2JL4A 4N11A 2WFCA 1Z7RA 3ZVJA 3APQA 4JR6A 4N10A 3QOUA 3A5WA 3KTBA 2GSSA 4NHWA 2H8LA 4MABA 4OFTA 4MMMA 4MF5A 2H19A 4ZILA 3RAZA 1A2LA 3GKNA 4AGSA 5INYA 2NDOA 5ELGA 3KGKA 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