The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
50
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sequence length |
140
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structure length |
140
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Chain Sequence |
DCSILELLKVKNQWREAFGEGHHRVQFGLELWKRFFDTHPEVKGLFKGVNGDNIYSPEFAAHAERVLSGLDMTIGLLDDTNAFKAQVTHLHSQHVERSINPEFYEHFLGALLHVLPKYLGTKLDQDAWTKCFHTIADGIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
Isolated Chain D of Gigant Hemoglobin from Glossoscolex Paul
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| publication title |
The structure of the giant haemoglobin from Glossoscolex paulistus.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
50
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| structure length |
140
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| sequence length |
140
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-09-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| D | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3NL7 A; 3EU1 A; 2VRY A; 1O1I B; 1JF4 A; 5AZQ A; 4KN3 A; 3M39 A; 1FN3 B; 3WCW B; 4DWT A; 4F6B A; 3K9Z A; 1OUT A; 2ZLW B; 1S61 A; 3ZJS A; 3MBA A; 1BVC A; 1HBH B; 2ZSS A; 1XZU B; 1MLU A; 1Y31 A; 3FS4 B; 1JDO A; 1YVT B; 1PBX B; 1IRC A; 2AV0 A; 3E5I A; 3KMF C; 4M4B B; 1J3Z A; 1YIE B; 1XZ5 B; 3RJN B; 2QSP B; 1YGF A; 1J40 A; 2V1H A; 1XY0 A; 1Y4B A; 1HJT A; 2LH3 A; 1JPB A; 1UX8 A; 2GRZ A; 3IC2 B; 3WCW C; 2QSS A; 1MCY A; 2HZ1 A; 1YHE B; 3TM9 A; 2BMM A; 3D7O A; 2NX0 A; 1DO7 A; 1YMA A; 1Y7Z B; 3M3B A; 4OF9 A; 1N9I A; 1MLR A; 4G51 A; 4B4Y A; 1LH3 A; 1Y0D B; 3PI9 A; 5JGG A; 2V1F A; 1MNK A; 1Y7D A; 1QXD A; 1I3D A; 1NGK A; 1J41 A; 3FH9 B; 2ZS1 A; 2DN1 B; 2O5T X; 3UHV A; 4IRO A; 1HBR A; 2MGE A; 4MQJ A; 1O1L A; 1GVH A; 2GNV A; 2SPO A; 1CH7 A; 2WY4 A; 3OO5 B; 4HSX A; 1DXV A; 1O1J B; 3MJP B; 1NEJ A; 2D2N B; 5E29 B; 1O1N B; 1MLQ A; 4O4T A; 2LH2 A; 2R4W A; 4U8U C; 104M A; 3G4Q A; 2ZT1 A; 5IKS A; 4G1V A; 1GBU A; 5EE4 D; 1DTI A; 3OGB A; 4X0L A; 1THB A; 5E6E A; 1NAZ A; 1HV4 B; 1S5X B; 1YEN A; 3P5Q A; 1J7W A; 2W6X A; 4ROM B; 4JAC A; 2HHD A; 5HY8 B; 1RQ4 B; 2D2N C; 1VRE A; 3HC9 A; 1WMU B; 2HHE B; 1HGB B; 2EF2 A; 3G4W A; 2G14 A; 3NG6 A; 1J7S B; 4XDI A; 1GDJ A; 3BOM A; 1VXC A; 1HBI A; 2LH1 A; 5HLX A; 1NWN A; 1SDL A; 4FWZ A; 2O5O X; 1Z8U B; 3UHQ A; 3B75 A; 3VRG A; 5CNB A; 4QAU A; 1S6A A; 1FHJ A; 2ZS1 D; 1GCW A; 1M9P A; 1LHS A; 3H57 A; 1A3O B; 1Y5F B; 1YEQ B; 3BJ1 A; 3GQR A; 3MJU A; 3WFX A; 3D17 A; 1KFR A; 2PGH A; 1W92 A; 103M A; 2GRH A; 4MQK A; 3WCU B; 107M A; 3LB4 A; 1J3F A; 4F6I A; 1Y4V B; 2MYB A; 2ZLU A; 3ZJQ A; 1O1K A; 7HBI A; 4HRT A; 3IC0 B; 1F63 A; 1XZ4 A; 1HDB A; 2ZWJ A; 2EVK A; 1EW6 A; 3ZOL A; 3WFU A; 1Y5K B; 4YU3 A; 1XZ7 B; 5CMV A; 3MKB B; 1MNI A; 3UBV A; 1NQP A; 1JW8 A; 4MQG B; 5MBA A; 1LFT A; 2ZLV B; 5HAV A; 2IN4 A; 1BIJ B; 3G4R A; 1MNH A; 2MGI A; 1LFY A; 1G09 B; 1DXT B; 3NFE B; 4H0B A; 2HZ2 A; 1CH5 A; 106M A; 3ONZ B; 1CO8 A; 2QRW A; 3AT6 B; 3WCU C; 1BZ1 A; 1CLS B; 1WLA A; 5C6Y A; 3GDJ B; 1G0B B; 3DUT B; 4ZVB A; 3V2V A; 1CQX A; 1O1O B; 3NMM A; 2ZT0 A; 1Y7G B; 2BKM A; 1HDA A; 1CH3 A; 4FWX A; 1HGA B; 1JEB B; 2ZSR A; 1B86 A; 1RPS A; 5EYJ A; 1Y8K A; 1CH4 A; 5KER B; 1K1K A; 2W72 B; 3UHH A; 1YH9 B; 1JY7 A; 1FDH G; 2QU0 B; 3QJC A; 1TES A; 1J52 A; 3D1K B; 1DXU B; 1O1P A; 1MLF A; 3A2G A; 2BLJ M; 1Y45 A; 1LFZ A; 4XS0 B; 2VM0 A; 3R5I B; 1Y09 A; 3OO4 A; 2MB5 A; 1HDS B; 4DC7 A; 1A6K A; 1MYF A; 1BZP A; 5EET A; 1A00 A; 2D60 B; 1DUO A; 1Y4P B; 1YE2 A; 1GLI B; 2HBG A; 1Y35 B; 2EVP A; 1C7D B; 2FAL A; 3ODQ A; 3HRW A; 2W72 C; 3IXF A; 1CPW A; 1A4F B; 1Y7C A; 3HHB A; 3ECZ A; 3S66 A; 2LH5 A; 3MVC A; 3GQP A; 1BZR A; 1NXF A; 4MQC B; 1Y0A B; 1YMB A; 1SDK B; 110M A; 1G9V B; 3A5G A; 3ZJI A; 2V1J A; 1Y0C A; 1A0Z B; 1YHU B; 1K0Y A; 1XZV A; 1LH1 A; 1QPW B; 3VRE B; 4UUR A; 2GKM A; 4NS2 A; 3QJE B; 1MKO A; 3OZV A; 2ZLX B; 2QFN A; 2ZS0 B; 1A6G A; 2Z6N B; 3LR7 A; 1NZ4 A; 1LFV A; 1O1M A; 1IBE A; 3PI8 B; 2HBF B; 4MBA A; 1VXF A; 1XQ5 A; 3GK9 A; 4MU5 A; 1MBA A; 1NIH A; 5ILE A; 1MLJ A; 2DN2 A; 1C40 B; 1V75 B; 1Y0T B; 1MOH A; 1OBM A; 6HBW B; 1LFQ A; 3GKV A; 3OJ1 A; 1COH A; 2W31 A; 1SPG A; 3WR1 A; 1NS9 B; 2XYK A; 5ILP A; 1ABY A; 3ZJJ A; 1CH9 A; 3OK5 A; 1DXD A; 2ZLT A; 1HGC B; 1GCV B; 1UFJ A; 2HCO A; 3HF4 A; 1HBA A; 4H07 A; 1KD2 B; 2ZFO D; 2ZS0 C; 1YG5 B; 3PIA A; 1Y4R B; 4O2G A; 1YCA A; 2VLZ A; 3QMA A; 1FCS A; 2AA1 B; 2D5Z B; 3BA2 A; 1S0H A; 1OUU B; 1YEU B; 3BJ3 B; 2HBE A; 1VWT B; 1RTE A; 1XCH A; 2GTL A; 1G08 A; 3CY5 A; 1VXG A; 5CNC A; 3LB1 A; 1EBT A; 3VHB A; 1MOA A; 1CH1 A; 3A5B A; 1GJN A; 1UC3 A; 3QQR A; 1IOP A; 5SW7 B; 3EDA A; 1H1X A; 1JZK A; 3QZX A; 3QM6 A; 1Y46 A; 4F6D A; 1Y8H B; 1VHB A; 4YU4 A; 3GQG A; 1DXC A; 1DWS A; 4MQH B; 1EMY A; 1MYI A; 1TU9 A; 1YHR B; 3GYS B; 3TM3 A; 3D4X B; 2GRF A; 1UIW A; 3PT7 A; 3ED9 A; 3ECL A; 4L7Y B; 1YDZ A; 1HBS A; 3EU1 B; 3NL7 B; 2D2M C; 2PEG B; 2Z8A A; 2HHB A; 3DR9 A; 3PI2 A; 1X9F C; 3WCV C; 1SHR A; 2QMB B; 4KMW A; 2QLS A; 4O1T A; 1FSX A; 1OJ6 A; 1DM1 A; 5F0B A; 1XZ2 B; 3S1J A; 1OUT B; 1YEV A; 4GZG A; 1Y4G A; 1RVW A; 1RQ3 B; 3GOU B; 3PT8 A; 2W6V A; 4F6F A; 1BZZ B; 3K3U A; 2SPL A; 1LH2 A; 1MOC A; 3ARJ A; 3AT5 B; 1GZX A; 4F6J A; 1M6C A; 1HRM A; 1J40 B; 1Y2Z A; 1HAC A; 1JZM A; 3ZHW A; 2GDM A; 4H2L A; 1NS6 A; 2MGC A; 1MLH A; 1FAW A; 5MBN A; 1Y4B B; 3UHB A; 2ZT4 A; 1YOI A; 3O7N A; 3D1A A; 5B85 A; 3V2Z A; 2SPM A; 2ZST A; 2QSS B; 4LPI A; 1CP5 A; 1HCO A; 2GTL D; 2W6W A; 1Q1F A; 1YZI A; 4NI0 B; 3UHI A; 3KUO A; 4F6G A; 1YE0 A; 1MYT A; 3D7O B; 1NPG A; 4BJA A; 2MGM A; 4G51 B; 1QSI B; 3E4N A; 1HHO A; 3UH5 A; 3K8B A; 5JGG B; 1JL6 A; 1EBC A; 1Y7D B; 1MLM A; 2ZS1 B; 1V5H A; 3KMF A; 1J7Y A; 4N8T A; 4IRO B; 1HBR B; 3ARL A; 1UVX A; 5CN7 A; 2CMM A; 4MQJ B; 4ROL A; 4HHB A; 1O1L B; 1DO4 A; 1YFF B; 4HBI A; 2MYD A; 2C0K A; 5C6E A; 1ECD A; 1S69 A; 1FN3 A; 2HZ3 A; 4MPM A; 3MYM A; 3WCW A; 4MAX A; 4N7O A; 1DXV B; 2VLY A; 5JDO F; 5CN8 A; 4PQB A; 1A3N A; 3G52 A; 1NZ5 A; 2ZLW A; 1AZI A; 5CNF A; 1BAB B; 3EDB A; 3UH7 A; 3HEN A; 4N7N A; 1XZU A; 3UHZ A; 1Y8W A; 2MHB A; 1PBX A; 3HEP A; 4G1B A; 1YIE A; 2JHO A; 3W4U A; 4FC3 B; 1JP6 A; 3DHT A; 2D5X A; 4PQC A; 4X0L B; 1CH2 A; 3IC2 A; 1THB B; 2ZSO A; 3P5Q B; 1J7W B; 3ARK A; 3OZW A; 2HHD B; 1DO3 A; 1AJG A; 3ZOM A; 3WCP A; 1BVD A; 3A0G A; 1MOD A; 5JDO C; 1J3Y B; 3NG6 B; 2DHB A; 3WTG B; 1FSL A; 3BOM B; 4U8U A; 2KSC A; 4IT8 A; 2DN1 A; 1S5Y A; 1MWD A; 1UMO A; 2B7H A; 4WCH D; 5F2A A; 5ILM A; 2OHA A; 1SDL B; 1YEO A; 2VHB A; 2RI4 B; 3LQD A; 5CN9 A; 3B75 B; 1DO1 A; 2LH6 A; 1IRD A; 3UHR A; 4NI1 A; 1FHJ B; 1GCW B; 1M9P B; 3OO5 A; 3BJ1 B; 3GQR B; 3MJU B; 2DN3 A; 3LB2 A; 1HSY A; 2MGB A; 4PQ6 A; 4MQK B; 1L2K A; 3A59 B; 4C0N A; 2ZLU B; 2D2N A; 1DTM A; 4HRT B; 2MGA A; 1MBN A; 4M4A B; 1XZ4 B; 3WCW D; 1R1X B; 1SI4 A; 2ZSX A; 1Y5J B; 1RTX A; 1NQP B; 2W6Y A; 2RAO A; 1A6M A; 1LFT B; 1Y0W A; 5EU2 A; 5E83 A; 2O5S X; 1OFJ A; 1LFY B; 3UHS A; 1YGD B; 1HV4 A; 1S5X A; 3VRF A; 2R1H A; 2GLN A; 3BCQ B; 3HXN A; 1CG8 B; 4F4O A; 1RQA B; 2G12 A; 1LJW A; 2ZSN A; 2ZT3 A; 3EOK A; 1WMU A; 2FRI X; 1HGB A; 4UIQ A; 4MQI B; 1URV A; 2ZFB A; 1HDA B; 2HBS A; 3UH3 A; 1J7S A; 1IDR A; 4WJG 1; 1AJH A; 1Y85 A; 1B86 B; 2BNL A; 3PI4 A; 1U7S A; 1RPS B; 1VXB A; 1V4X A; 1Y8K B; 1BIN A; 3G46 A; 1V4W A; 1PMB A; 2OLP A; 1LUE A; 4U8U D; 3QJC B; 3VAU A; 1O1P B; 1HLB A; 1Y45 B; 1LFZ B; 1Y5F A; 1Y09 B; 1AJ9 A; 1MZ0 A; 3PI3 A; 3WCU A; 5CHR A; 3GLN A; 4HRR B; 1A0U A; 1A00 B; 1MTJ A; 2XKI A; 2O5L X; 1YE2 B; 1CG5 B; 1Y5K A; 4FH6 A; 2D2N D; 3MKB A; 4AVD A; 1YOH A; 1U7R A; 4MQG A; 3ODQ B; 1QI8 A; 3HRW B; 2ZLV A; 1DUK A; 5KDQ B; 1Y7C B; 2V1E A; 3HHB B; 2XKH A; 5AB8 A; 4AVE A; 1G09 A; 3HYU A; 111M A; 1UT0 A; 3NFE A; 3DHR B; 2ZFO A; 3G4U A; 1JF3 A; 2YRS A; 1Y0C B; 4ESA B; 3BJ2 A; 2BW9 M; 1O1O A; 2QFK A; 1Y7G A; 4UZV A; 5AZR A; 1Y4F B; 1MWC A; 2H8F B; 1HBB A; 1MLK A; 1HGA A; 1JEB A; 108M A; 3ORD A; 1MKO B; 3S65 B; 3UHT A; 1MOB A; 1Y8I B; 2H8D A; 2BK9 A; 5HU6 A; 4L2M A; 1CIK A; 1N9H A; 1LFV B; 1A01 A; 3UI0 A; 1O1M B; 2W72 A; 1IBE B; 3IA3 B; 1Y83 A; 4F68 A; 1UVY A; 3CIU A; 3R5I A; 3H58 A; 1LFQ B; 3GKV B; 1COH B; 1HAB B; 1MWB A; 2H35 A; 1FDH A; 3QJD A; 3WR1 B; 3WCT B; 3RGK A; 1ASH A; 2GNW A; 1DKE A; 1YMC A; 3UHC A; 3ZJM A; 5EUI A; 1Y35 A; 1HBA B; 3WCU D; 1NZ2 A; 2G0Z A; 4NZI A; 3ZH0 A; 1Y4Q B; 3PIA B; 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1OR6 A; 1Y22 A; 1O16 A; 1XYE A; 2AUO A; 1XY0 B; 2ZS0 D; 1J7Y B; 2D6C A; 3UHE A; 1UFP A; 2Z6T A; 3ZJO A; 1JP8 A; 1GBV A; 5EQM A; 1MTK A; 1MBO A; 4ROL B; 4HHB B; 1MBD A; 4L7Y A; 1JWN A; 2AUQ A; 3WFT A; 1MNO A; 2PEG A; 1T1N A; 5C6E B; 1QSH A; 2QMB A; 1A9W E; 1BBB A; 4N7O B; 1XZ2 A; 3PI9 B; 1MDN A; 5EE4 C; 2M6Z A; 1A3N B; 1QXE A; 1V9Q A; 1QXD B; 1RQ3 A; 1J41 B; 1SWM A; 2DXM A; 1ECO A; 3GOU A; 4N7N B; 1Y8W B; 5CNE A; 2MHB B; 1BZZ A; 3WHM A; 3ZJN A; 1BZ0 A; 1CO9 A; 3AT5 A; 4JYQ A; 3W4U B; 1MYJ A; 1O1I A; 3DHT B; 2D5X B; 2AUP A; 1NEJ B; 2G11 A; 3AQ8 A; 2DC3 A; 1IT2 A; 2G0R A; 3G53 A; 4NI0 A; 1HBH A; 2XKG A; 2O5Q X; 3FS4 A; 1DLY A; 2R4Y A; 3UGZ A; 1YVT A; 5CND A; 1M6M A; 3WCP B; 2ZS1 C; 3A0G B; 2D2M D; 4M4B A; 3LB3 A; 1QSI A; 1XZ5 A; 1X9F D; 3WCV D; 1VXH A; 2DHB B; 2QSP A; 1GBU B; 4U8U B; 2FRK X; 2E2Y A; 1S5Y B; 2B7H B; 1OFK A; 1YEO B; 3S48 C; 3LQD B; 1MLN A; 1HBG A; 5E6E B; 1YEN B; 1IRD B; 3UH6 A; 1YFF A; 2O5B X; 1FLP A; 4NI1 B; 1YHE A; 1Y7Z A; 2DN3 B; 1LTW A; 1Y0D A; 2EKT A; 1MYG A; 5KKK A; 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