4WEPA

Apo yehz from escerichia coli
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
ASPVKVGSKIDTEGALLGNIILQVLESHGVPTVNKVQLGTTPVVRGAITSGELDIYPEYTGNGAFFFKDENDAAWKNAQQGYEKVKKLDSEHNKLIWLTPAPANNTWTIAVRQDVAEKNKLTSLADLSRYLQEGGTFKLAASAEFIERADALPAFEKAYGFKLGQDQLLSLAGGDTAVTIKAAAQQTSGVNAAMAYGTDGPVAALGLQTLSDPQGVQPIYAPAPVVRESVLREYPQMAQWLQPVFASLDAKTLQQLNASIAVEGLDAKKVAADYLKQKGWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title YehZYXW of Escherichia coli Is a Low-Affinity, Non-Osmoregulatory Betaine-Specific ABC Transporter.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative osmoprotectant uptake system substrate-binding prot
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli str. k-12 substr. mg1655
total genus 105
structure length 281
sequence length 281
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4wepA01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 4wepA02
4IGTA 4Z7EA 3TTKA 1VFDA 3QK6A 5H8NB 4QFLA 2XX9A 1XVYA 5AA2B 1SDXA 3QYTA 4ZEDA 3R7XA 1LCTA 3OO6A 3VXBA 5CC2A 3A3CA 1N84A 1A7LA 1ATGA 4U1ZA 4ONYA 3O9PA 2E0SA 3B6WA 4C1UA 4O3BA 1OVTA 1DMBA 2DXYA 3ZKLA 1UTHB 1B3EA 4EQ9A 5I58B 3GXAA 1R6ZA 3VV5A 4XKRA 2I48A 4RPNA 1YTVA 1MY2A 3TUSA 3A3UA 2VD2A 3M3KA 4KQPA 2OWSA 4PFUA 4R6HA 2D3IA 4XIGQ 3L6HA 3DLNA 5JEIA 2V25A 5DVIA 1JVYA 3LSLA 2HCAA 3KGCA 1IITA 3CG1A 4ELPA 4JB7A 3HHFA 3PPQA 3RPWA 2P1SA 2GRVA 2Z8EA 5H8NA 3TTNA 4OESA 4HCWA 1P1NA 3HO7A 2ZYMA 3OO8A 3UGWA 1EU8A 3C31A 3RT8A 1UTBB 3PMXA 1FTLA 3RGYA 3KFMA 5I2NA 3BFTA 4DXBA 2F78A 3PPNA 2ZXTA 1ZU0A 5KDTB 1UTHA 1TWYA 2ZMBA 5I58A 1MDQA 3MZBA 1SW1A 3PPOA 2RC7A 3O29A 5H8QA 3THIA 2Z8FA 4I8CA 4ELOA 2PBWA 5IAIA 4TLLB 1IEJA 3TTRA 3T9XB 1IQ7A 1JEVA 3G3GA 2RC8A 1B5HA 3O2AA 4F31B 3IX1A 3SEVA 3JZJA 3IO6A 4DE8A 3U8QA 4OFOA 4KI0E 5EHMA 1R1NA 5K2XA 4RA1A 4F3GA 4X9TA 3ZSFA 2CZLA 1B2HA 3PD8A 4OMBA 4TQUQ 3ECRA 1LBBA 1DOTA 3OEKA 3S9MC 2DSFA 3QUJA 3LSXA 5KCJA 1OIBA 5F7VA 3ZS6A 1BP5A 2OLBA 1GV8A 3UP9A 1BKAA 3VLWA 4ELRA 1D9YA 5KDTA 4JWYA 4N07A 5ICQA 1FTOA 1M5BA 2IEEA 2O84X 1ZJLA 1MS7A 3EN3A 1MH3A 4LUBA 3OELA 1B52A 1HSLA 3MVXA 4OTEA 2ALUA 2NVUB 4H5GA 1MPBA 3PD9A 5DYHA 1MQJA 4UACA 3OEMA 4PFWA 1JEUA 5ITPA 4F1UA 1IXIA 4DCXA 3KEIA 2H99A 4EF2A 2RC9A 1GR2A 2Q2AA 4R6KA 4RK2A 5ISUA 3OENA 4GD5A 1LLSA 4ZDMA 2QPQA 1DSNA 3MP6A 3H3GA 3VE1B 2YLNA 1OQHA 2ZYNA 1DTZA 3T9HB 4POWA 1IUDA 3E4RA 3MAMA 4HW8A 1ZBMA 3EHUA 3W9VA 2VOZA 4U22A 3CR9A 4G8NA 5I56B 3CG3A 3H6TA 4QFPA 4JSOA 4GOTA 5J1DA 4NF8B 2R9JA 3LSWA 1SI0A 2ZNSA 1FQEA 4KCCA 3K4UA 2VD3A 2XXYA 3IR1A 4LA9A 4PFYA 4TOZA 4DLDA 1PEBA 1XS5A 4IO5A 4YKKA 4U23A 1B6HA 4LZ7A 4E0XA 3HN0A 3FIRA 4R6YA 2RKMA 5CMMA 1MY4A 3MJNA 1B9JA 4ZS9A 1O7TA 1Y3NA 4OVJA 4F1YA 5AA4B 4YKPA 4H67A 2I0BA 2O1LA 3PGFA 1IZ1A 4GF8A 2DOJA 5I56A 2HAUA 3T96B 3TQWA 4FIMA 4NF8A 4QFKA 3WAEA 1NH7A 4NF6B 2DE3A 2A5TA 4QSEA 1Y20A 2XXRA 1AOVA 5L9OA 4R75A 2HQ0A 2Y7KA 2Z22A 2W7YA 4IY6A 2O7IA 2F36A 3T93B 1XT8A 4AQ4A 3M8UA 1Y4TA 3U93A 2O1MA 1I6QA 4MH5A 1SW5A 3SESA 1BLFA 1NNKA 4OERA 3T9UA 1EZ9A 5AA4A 2HAVA 1L5TA 1PB7A 1NMUA 4OHNA 4EXLA 1VE4A 3DELB 3LUYA 2CMOA 3TAJA 3K6WA 1MPDA 5BWJA 2O68A 1MG1A 3PMWA 4YKIA 1MXYA 4F18A 4GL0A 2X7QA 1NKXA 3CIJA 3FVKA 1OLCA 3N5LA 1USYE 2O51A 2Z8DA 4NF6A 3N94A 5AA2D 5H8SA 1H44A 4FJPA 5CBRA 4TLMB 1H3DA 2OK2A 4EXKA 3VVDA 1QUJA 4JWOA 2FA7A 1LAHE 4JXIA 2OCUA 4RY1A 1FQBA 4IO7A 1XOCA 4X1BA 3MWBA 3C9HA 3PPRA 4QHQA 2I58A 3FVNA 3IOUA 1B4HA 3CFZA 2V84A 2O69A 1MXZA 3CFLA 1QKBA 2DVCA 3CI8A 1FTKA 3FXRA 3HV1A 2XX8A 2QRYA 2Y7WA 2DVZA 1H76A 3KG2A 3SEYA 2NOOA 4YAHX 1URDA 3JYRA 2PYYA 2DQVA 1N7XA 5L8DA 3OD7A 3VXCA 1Q35A 1ZIUA 1SBPA 3OSQA 1ZKBA 5CM6A 1Y4CA 4LZ5A 3U94A 5CMKA 4DXUA 3TCGA 4MBPA 3DP4A 4H8JA 5AA3A 4KFQA 4BDOA 4U2RA 4H65A 4MF3A 1US4A 3WAFA 2OJTA 4LQ2A 5FTIA 2F34A 3OMBA 2UYFA 1LAXA 4Q0CA 1EZPA 2DYXA 1NNTA 3G7WA 3QUFA 5BUUA 1B4ZA 3R6UA 3UK4A 5I2NB 3RNNA 4LZ8A 2UVIA 3RT6B 3IB0A 1OMPA 1B0HA 4PP0A 4OEUA 5H8QB 3MPLA 3I5OA 3IOVA 4F1VA 3D4GA 2E1SA 1S50A 1D4NA 4EQ7A 1R9LA 3R26A 2R6GE 1IXHA 2I3VA 1B0LA 3GBBA 3OSRA 4P0GA 3RLFE 3PMVA 4ESXA 3RN8A 3G3JA 2I0CA 3EQ1A 4H0WA 3IJXB 2XXQA 3MPKA 4FEDA 4ZEFA 3A09A 2F35A 2QS2A 3K00A 3OO7A 4FAJA 1SYHA 3U92A 5KCJB 2GHBA 4ESWA 3TMGA 2QS4A 2X26A 2D21A 3KOTA 3MC2A 4L17A 2H5YA 4Q8RA 5CMBA 3GLBA 1OLAA 4BDMA 2I49A 3EPEA 3CRBA 4QRZA 3K1NA 1PBQA 3FJ7A 4DZ1A 2H25A 3K1PA 1USYH 4GXAA 2HEUA 4YMBA 2PVUA 4GFRA 3BBRA 4HCYA 1WVJA 3U72A 5DVJA 3PPPA 2ONSA 4LONB 2VGQA 1LB9A 4F3PA 3MQ9A 2F7BA 2XHDA 2H4IA 3SEUA 3BFUA 4KR5A 1B51A 4PE5B 2V93A 3H4ZA 1P1UA 3N26A 1B7ZA 3KN7A 2XX7A 3EHSA 4RPOA 4GWOA 4OENA 2H98A 1TFDA 1H45A 4F2QA 1S9TA 3CSBA 2UVJA 2F6GA 3IJOB 3QSLA 4JBZA 3KJTA 3FV1A 3VVFA 4QFOA 4Z0IA 1N76A 1M5CA 3L6GA 4ZEKA 4IB2A 4JSDA 2Y7IA 3S9NC 3O66A 5IKBA 1FCKA 3TZAA 4OEVA 1TXFA 3OXNA 3P7IA 4ZZAA 2F7AA 4R72A 1T0KA 1B05A 4C1TA 4GLIA 4IO6A 4R9FA 2Q9TA 1WDNA 4ZZEA 1B3LA 5TP9A 4BDNA 1D9VA 4YZZA 5LOMA 3C35A 3KN8A 4JDFA 5CBSA 3VVEA 3SDFA 1XVXA 1MY0A 2QMXA 4HS7A 5TPAA 3VFJA 3FJGA 4FE8A 5CRYA 1GGGA 4NF5B 5KZTA 3RTFB 1SD3A 2A5TB 3TCFA 1QVSA 1FQCA 2UVGA 2M8CA 4HTGA 3N6UA 4KYDA 4G2ZA 3F11A 4XTCQ 3KBRA 2I4BA 5FTHA 4ELQA 1WODA 3D4CA 3C36A 3QIMA 1KWHA 4QFNA 3B6QA 4FORA 4POXA 3FJMA 4GIZA 1MH4A 4IY5A 1N7WA 5ELVA 2OBGA 4QSCA 4N13A 3Q29A 1YAEA 1EZOA 4LVQA 1FTMA 3RY3A 3TTLA 5I59B 4KHZE 3GBAA 2XXIA 1A54A 2HZLA 3IK6B 2XXUA 4NF5A 1MXXA 3G3HA 2DS9A 4KYEA 1MM6A 3DP8A 2ESNA 2DE4A 1B1XA 1MPCA 4DCYA 1UIUA 3K01A 3M3LA 3T66A 1I6BA 2I6EA 1H43A 1Y3PA 4XKPA 5HPQA 3MP1A 3K2DA 4N6PA 1XHYA 2DE2A 1MM7A 2V3TA 3MBPA 5H8FB 3SETA 4DXCA 1B7HA 3H03A 4Q5TA 1AH5A 2HZKA 2Y7PA 4P0IA 3S9EA 3IB2A 3SEWA 1UQWA 2I3WA 3TCHA 2DXRA 4OWDA 3OO9A 1NH8A 1B58A 3PU5A 3T9VA 4K3FA 4EQBA 3V89B 3KSXA 5JTYB 2P0SA 2X7PA 3Q28A 4C0RA 4EDPA 3OOAA 1ZTYA 2D5WA 1Y3QA 5I59A 1VFEA 1S7YA 3G3KA 4OXVA 4WXJA 1SW2A 3Q27A 4PETA 3C32A 1BTJA 3MVZA 4ND9A 5B70A 1DPPA 2RCAA 3B7DA 3JV9A 1JVXA 5HM4B 2PT2A 1J1NA 2RINA 2G29A 2OWTA 1PC3A 1AMFA 3LR1A 4O3CA 1FTJA 2ONRA 3FD3A 1NFTA 2LAOA 3K6VA 4OYVA 5H8FA 1P1WA 1Z7NE 2QJEA 3T22A 3DM0A 4I9DA 1LBCA 1OQGA 3C4MA 2F7CA 2A5SA 1N04A 3E13X 2PMSA 5JTYA 1US5A 4OQOA 4BDLA 4G4PA 4IO2A 5HBCA 3TTMA 4BDQA 2H9BA 3UN6A 1YPNA 2XXVA 2F97A 1M5FA 4R73A 1JW5A 4YMAA 4BDRA 1B3HA 1SI1A 2Y84A 3VDFA 4YKJA 4H1XA 1P99A 3ONMA 4NEDA 2REGA 1LAGE 3IO4A 5L9SA 4PQJA 2AYSA 1DPEA 4G8MA 2ZNTA 3EF7A 1M5EA 1NL5A 2ZYOA 3TKDA 3AXFA 4XKNA 1PB9A 1MDP1 4O3AA 1AIVA 4EF1A 5H8HB 1URSA 1JNFA 3IOTA 4I62A 3SERA 3CFXA 1NNFA 3FVOA 3V5AA 3TDJA 1B32A 5FHNA 1PDAA 1I69A 2GH9A 4U4SA 4NWDA 3QAXA 1MQIA 3IORA 2XD3A 3H6UA 2Q2CA 3SKPA 4NWCA 4LATA 2THIA 4RK9A 3PUYE 4M1VA 5A5XB 1FW0A 3LC8A 3ILTB 5M2VA 2DWHA 2WKYA 3TODA 1A8EA 4U1OA 1IXGA 4P11A 3K0VA 5B7DA 3MW0A 3MZ1A 2ABHA 3QXMA 3USDA 4G68C 1B3FA 2RF1A 4ZECA 1RKMA 5I57B 1QUKA 4F39A 1ZMGA 5ITOA 2GFEA 1AL3A 3HCQA 5H8HA 3FGSA 2P2AA 5DEXB 1LSTA 2O6AA 1POY1 2B3BA 5TU0A 3I6VA 4IO4A 5CI5A 3PV0E 5AA2A 1O63A 1QW0A 3PUZE 1LFHA 2REJA 1A8FA 4M4GA 3FV2A 3EHTA 3UORA 1RYOA 4R2BA 4MLQA 2UYEA 5I2KB 3K6UA 3LSFB 4BLAA 2XXPA 1P1QA 4WEDA 2DWJA 5DTBA 3V8XB 4NMYA 5A5XA 4YB5A 1F9BA 3GZGA 1RYXA 4R9GA 1MRPA 1QULA 1SVXB 2QL3A 2QMWA 2B3FA 2RCBA 4ZEBA 4DIGA 3FASA 3E9XA 4LP2B 2HFBA 1TT1A 3HSTA 2F5XA 4KD5A 2QS3A 3CSGA 3G3FA 1GTKA 4E0WA 1NNPA 2BJJX 2AIXA 5I57A 1URGA 4U4XA 4FECA 2XXHA 1LB8A 4YICA 1D3KA 3C34A 4H8IA 5DEXA 2XXWA 1B40A 4H5FA 2Q8JA 3KZGA 2XD2A 4RXLA 3H7MA 5FHOA 5TP9B 3UA8A 1FQDA 3O6HA 1UIVA 4XXUA 2DWAA 1UTBA 2QS1A 2Y7RA 5I2KA 1B5IA 5TPAB 4F19A 4NE4A 1SQYA 3TQLA 2R71A 3KN3A 2AL5A 1JETA 1QUIA 2XXTA 3H06B 3H6VA 1YCJA 4OFJA 4F2OA 1B3GA 4UA8A 3IAZA 1N3WA 4OFLA 2AL4A 1O64A 1EH3A 2V3QA 1P1OA 1MY3A 3SEXA 1N3XA 4YU0A 2PX1A 4G68B 4FATA 2G93A 1PBPA 5F1QA 4ZEIA 3CVGA 1Y1MA 3ODBA 1I6AA 3LBSA 1CB6A 3B6TA 4GL8A 4PFTA 1VSOA 1DTGA 3E3KA 1SW4A 4THIA 1ZLQA 1QJMA 4LQ5A 1R9QA 2VP1A 2Q88A 3HPIA 2Q89A 2HXWA 3MVYA 2F6PA 1IIWA 1POTA 3I3VA 5L9MA 4X1DA 4KCDA 1JQFA 4QSDA 3TYHA 3TFLA 1CE2A 1Y1ZA 4WKMA 4G77A 2NWJA 1HSJA 1MXUA 4G8HA 4G68A 4F29A 1MY1A 1VR5A 2FNCA 3O6IA 4I1DA 3U1OA 2UXAA 2YPNA 4RYAA 4JWXA 2PT1A 1SYIA 4AB5A 3PUVE 1LCFA 4MLVA 3K02A 4YB7A 5EHSA 2VHAA 4QF9A 4OZ9A 3ZKKA 3TPAA 2XXXA 3IL1B 1PB8A 3KSJA 4EUOA 2GHAA 3RQTA 1OVBA 1ELJA 3VLVA 3MP8A 1HSEA 4OETA 4X48A 1ANFA 3KOSA 5AA1A 4DDDA 2DP8A 2IA4A 2NUVA 1QKAA 3Q25A 3W9WA 4WEPA 2ZYKA 5I84A 1II5A 3MUQA 5DT6A 4IO3A 3Q26A 5FHMA 3S4UA 3DP6A 4RNSA 1LAFE 5CMCA 1B1HA 1B46A 3RTWB 5AE4A 1JW1A 4KYSA 4IGRA 2UVHA 3H6WA 2YJPA 4NF4B 4Q30B 3RUMA 4XKQA 4ECFA 1A55A 2B65A 1LGBC 4H6DA 4F22A 3UIFA 2O7UA 2I4CA 1MQDA 1B7UA 2ZNUA 1MXWA 1MQGA 4MFIA 1B5JA 3FATA 3K1MA 1JW4A 5ICTA 1A99A 3KJ7A 3MZ9A 3G3IA 4ISUA 1GVCA 4U21A 5EYFA 4F3SA 4R2FA 1Y9UA 2FYIA 1Z7ME 1FQAA 5K2YA 3S9LC 3FZVA 3FUZA 4GVOA 3BKIB 4GRKA 4GXSB 4KPTA 4NF4A 3IB1A 4F3BA 3O6GA 3V83A 4AB6A 4RJZA 5JK4A 1MQHA 1Q1KA 3O97A 1LFIA 3IOWA 4ZE8A 3VLUA 2DWIA 4ZE9A 4YB6A 2Z23A 2ONKE 2OZZA 3N6TA 1TFAA 1FQFA 3FXUA 1M5DA 1A40A 2QSXA 3PUXE 1IXCA 3HHGA 3TEPA 3FXQA 1BIYA 2KLFA 3K6XA 1N0TA 1XC1A 3M3FA 4R74A 4GQOA 3MVWA 3TELA 3O28A 1LFGA 2F8DA 3S2VA 3PUWE 2ANJA 3ILUB 2NXOA 5DVFA 3C33A 4NTLA 4FEBA 3W15C 3FVGA 1MXVA 2V3UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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