4WEPA

Apo yehz from escerichia coli
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
ASPVKVGSKIDTEGALLGNIILQVLESHGVPTVNKVQLGTTPVVRGAITSGELDIYPEYTGNGAFFFKDENDAAWKNAQQGYEKVKKLDSEHNKLIWLTPAPANNTWTIAVRQDVAEKNKLTSLADLSRYLQEGGTFKLAASAEFIERADALPAFEKAYGFKLGQDQLLSLAGGDTAVTIKAAAQQTSGVNAAMAYGTDGPVAALGLQTLSDPQGVQPIYAPAPVVRESVLREYPQMAQWLQPVFASLDAKTLQQLNASIAVEGLDAKKVAADYLKQKGWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Putative osmoprotectant uptake system substrate-binding prot
publication title YehZYXW of Escherichia coli Is a Low-Affinity, Non-Osmoregulatory Betaine-Specific ABC Transporter.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli str. k-12 substr. mg1655
molecule tags Transport protein
total genus 105
structure length 281
sequence length 281
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4wepA01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 4wepA02
3IL1B 5I56B 2XXHA 1QUIA 1P1UA 4TQUQ 1OMPA 4F3GA 3UP9A 1UIVA 4R6KA 1H43A 1XVYA 3E9XA 4H5FA 1USYH 4PFTA 1A8EA 1Z7NE 2VP1A 1MY3A 3HN0A 3SEUA 1B9JA 5I57A 4OFJA 3MVZA 2H4IA 4MFIA 2NWJA 3KSJA 1DSNA 4F22A 1LAFE 4YKPA 1LFIA 2O1MA 2X7PA 1Y3NA 3MVWA 1B3GA 2ALUA 3T66A 1Y3PA 4F3PA 3IK6B 3TAJA 3O66A 1RYXA 2V93A 4R6YA 3IB1A 2P0SA 4EDPA 2HEUA 1MY4A 3FJMA 2Z23A 3IJOB 1BP5A 3V5AA 4NF6B 3MPLA 1EZ9A 4LP2B 4KD5A 1B5JA 3LSFB 4ZZAA 1D4NA 1JEUA 4IY5A 4JXIA 1OIBA 3LR1A 3EN3A 3V83A 2RCAA 1IIWA 4OFLA 1UTHA 3C32A 2DWIA 1B40A 2E0SA 3SEYA 3G3KA 4ZEDA 3VVEA 4DLDA 4P0IA 1ZTYA 2OCUA 1SDXA 1LB9A 3UN6A 1NNTA 1YTVA 2F6PA 4MBPA 4ZDMA 4G77A 1B3HA 2V3UA 1H45A 1PB9A 1GR2A 3LSWA 4U23A 3HHGA 3L6GA 1MH3A 4PFWA 1B4ZA 3HHFA 2O51A 1PBPA 2G29A 4QRZA 3N6TA 4JSDA 2I49A 4X9TA 4EF2A 1S7YA 3KBRA 2I0CA 4QFPA 5L9OA 2BJJX 5TP9B 2F97A 3DP8A 5AA1A 3V89B 2UYFA 1TT1A 4Z0IA 3TQLA 3QXMA 1L5TA 3R6UA 5TU0A 1FQFA 3HCQA 2OJTA 2XXQA 1JETA 3OSQA 2FYIA 3MZ1A 2KLFA 1QVSA 3ILUB 3H7MA 2X26A 4O3AA 1ZKBA 3PPQA 2Q89A 5L9MA 1N0TA 1YPNA 1B58A 1LAHE 3CG1A 3DLNA 2VOZA 3MQ9A 4ZE8A 4YU0A 2Y7WA 4ELRA 3MW0A 3O28A 2VHAA 1EU8A 2DS9A 3TFLA 3S4UA 2OK2A 1SI0A 5HBCA 1NNFA 4U1ZA 3TEPA 3KN3A 4TLMB 4JWYA 2IA4A 2HQ0A 5H8HA 4QFLA 1LBCA 1ZLQA 3TCGA 1Y20A 4WKMA 2HFBA 4LQ2A 3N94A 1M5DA 5BUUA 2F6GA 4RPNA 3ZS6A 1NH7A 5DYHA 3PUWE 3JYRA 4C0RA 4GWOA 5AA3A 3U94A 2ESNA 1A8FA 3MPKA 5AA4B 4U4SA 2RINA 2OZZA 4QSDA 3C31A 4LONB 1BLFA 3IX1A 1MXXA 3TCHA 4F29A 1O63A 4H1XA 5ISUA 4QFOA 2ZMBA 2RC8A 4I62A 3GBAA 3FASA 1EZOA 1NH8A 4EQBA 3FATA 3OO6A 1PEBA 4LUBA 3KJTA 5I2KA 3CRBA 2F34A 1B2HA 1MY0A 5JK4A 1URGA 1A99A 1ZIUA 4BDOA 1MY1A 2DE2A 3FV2A 4EXLA 3PUYE 2XXWA 3UK4A 4PETA 4MF3A 1ZJLA 2HZKA 1RYOA 3W9WA 2D21A 2V84A 4ZS9A 3U8QA 3H6WA 3PPPA 5I59B 3LSLA 3HO7A 1EZPA 1US5A 2LAOA 5FHOA 3EHSA 4TOZA 1FTJA 3RPWA 1XT8A 2DWJA 1IEJA 4F19A 2AYSA 1B5IA 3PPRA 3CFZA 4LATA 5AA2B 3K02A 3M8UA 3K2DA 4FJPA 1B0HA 1XS5A 1JEVA 3FUZA 1ATGA 1VFDA 3D4GA 4NF6A 3SEWA 1MQJA 4QSCA 3OO8A 4O3CA 2Y7KA 3N6UA 4WEDA 3W15C 3K4UA 4GL0A 3USDA 5DEXB 4KI0E 3PUZE 1XOCA 4N13A 4Z7EA 3TODA 4EUOA 1FTMA 4F18A 1OLAA 4H6DA 3K01A 1MXVA 1MXYA 1B1HA 1MS7A 1VE4A 4HCWA 4DCYA 4LZ5A 3OO9A 2A5TA 1M5CA 1TFAA 4ESWA 1RKMA 4NMYA 4QHQA 5B70A 4K3FA 5EHMA 3FVGA 1PB8A 1SW2A 1FQDA 3F11A 4HW8A 3K6VA 1I6AA 1T0KA 4OENA 4F2QA 3CFXA 2Z8EA 3C35A 3S9EA 2DWAA 3VXBA 5KZTA 4JWOA 1MM7A 5ICQA 4FEBA 3K0VA 3VVDA 2XXRA 4NWDA 2OBGA 3HV1A 2CZLA 1KWHA 4LQ5A 5TP9A 5EYFA 3PV0E 3OEMA 1B52A 2DWHA 1SW5A 4DXCA 5IKBA 4FECA 4FORA 3RLFE 1Q35A 3PUXE 3BFUA 1II5A 3K6UA 2XHDA 1QUKA 3UGWA 2CMOA 2PYYA 4ZECA 4RK9A 2Y7IA 4FEDA 3VFJA 5FTIA 4YB5A 1VR5A 4F2OA 5I58B 1Y4CA 1BKAA 5K2XA 4JBZA 4R9FA 4YAHX 3MP8A 1BIYA 2QRYA 1SD3A 4UA8A 2XX8A 4KR5A 3SKPA 2XD3A 1WDNA 2H9BA 4LZ7A 2DE3A 4Q5TA 3A3CA 1P1WA 1MPBA 5CBSA 1N04A 1Y9UA 3ZKKA 4DIGA 5JEIA 4DXBA 3SEVA 5ITOA 3LC8A 5I2KB 2PMSA 2B3FA 2DOJA 2THIA 1PB7A 1QW0A 3Q29A 2I6EA 2Z22A 3LBSA 3SETA 4MLVA 5AA4A 2ONSA 2O7UA 2Z8FA 2B65A 3PU5A 3MJNA 1NKXA 1ZBMA 2XXYA 3O9PA 3FJ7A 5CM6A 2PT2A 3AXFA 3U1OA 2UVHA 1POY1 4IY6A 1P99A 1AOVA 1FQAA 3TQWA 2HAUA 2V25A 2Q2AA 1ANFA 4OVJA 2QPQA 1B7HA 3B6TA 1YCJA 3EHTA 4QSEA 5EHSA 3RGYA 3RT6B 1JW1A 3O2AA 4N07A 2AL4A 3T96B 3E3KA 3IOVA 2XX9A 4OEVA 4ZZEA 4R2BA 3MVYA 2NXOA 1WODA 3CFLA 2RKMA 3O6IA 2ZYMA 3GZGA 1S9TA 2W7YA 3K1MA 3L6HA 4OHNA 3H6VA 1O7TA 5I59A 2DE4A 2IEEA 4OFOA 3VLWA 3E13X 2UVGA 2NUVA 4RNSA 2Q9TA 3IOTA 2F7AA 3THIA 2A5TB 3CG3A 1CE2A 3TYHA 4GIZA 5AA2A 1Q1KA 3FXUA 3N26A 4FAJA 1N76A 1QKAA 1YAEA 2GRVA 1D3KA 1MXUA 4G8NA 2Y84A 2PX1A 3S9NC 4OZ9A 4G4PA 5DEXA 2GHAA 1J1NA 4ISUA 4IO4A 3G3GA 3O97A 5BWJA 1UIUA 4R9GA 3BKIB 2QL3A 2UVJA 3JZJA 3GBBA 1H76A 4KCCA 5B7DA 1XVXA 5AE4A 1MG1A 4ZEBA 4NF8B 3K6WA 3UA8A 2WKYA 3MC2A 4RPOA 4FIMA 3FVNA 3OEKA 4WEPA 4U21A 4LA9A 5ELVA 3IB2A 4AB5A 4OMBA 3FD3A 3C4MA 3G3JA 3KG2A 5JTYA 1N7WA 2QMXA 3RTFB 3M3KA 4R6HA 2YPNA 4RA1A 1IZ1A 2RC7A 3G7WA 5AA2D 3M3FA 5FHNA 4F1UA 1NL5A 3TELA 2QSXA 3CI8A 3G3HA 5L9SA 5ICTA 3QAXA 4HS7A 3RY3A 3ECRA 2Z8DA 4GFRA 3QYTA 4BDQA 4E0WA 3OD7A 5I58A 5L8DA 1MQDA 5K2YA 1A54A 3UORA 3H4ZA 2Y7PA 1R9LA 1OQGA 3ZSFA 5J1DA 3FJGA 2VD2A 1SYIA 1M5EA 2ONKE 1MDQA 2YLNA 5IAIA 3U72A 2O7IA 2DQVA 4R75A 1DOTA 1LCTA 3IJXB 5H8NA 3MAMA 4Q30B 4QFKA 3TMGA 2A5SA 4TLLB 3RQTA 2I0BA 3O6HA 3K1NA 3BBRA 1URSA 1CB6A 2ZXTA 5DT6A 1MQHA 1FQBA 1B3EA 4GXSB 3TDJA 1B7ZA 3UIFA 5CBRA 1ZU0A 4QF9A 1ZMGA 4YKIA 1MPDA 1I6BA 5TPAB 3HPIA 3TTKA 2QS1A 1JVYA 2HXWA 3H03A 2R6GE 1H44A 4GL8A 1DPEA 4UACA 4F3SA 1MRPA 3EF7A 4GLIA 2RF1A 2XXXA 2PBWA 3H6UA 2P1SA 1JVXA 1Y4TA 4OWDA 3SDFA 2R71A 1DTZA 4ELOA 3LSXA 1LB8A 3B6QA 2XX7A 4IO7A 4ZEIA 1PBQA 2V3TA 4THIA 2PVUA 1VFEA 1US4A 3K1PA 3GLBA 4JSOA 2ZYKA 3T9VA 4NF4A 4YB7A 3RNNA 2DYXA 2Y7RA 2DVZA 4IGTA 4R73A 1OLCA 1LAXA 4ELPA 3TPAA 1LAGE 3SESA 3PMWA 4OYVA 2VGQA 5A5XB 4DZ1A 3H3GA 1UQWA 4XKNA 3OO7A 2QJEA 1B32A 1P1OA 3I5OA 1N3WA 3EPEA 3CVGA 3A09A 2F36A 1IUDA 5DVIA 1B51A 3GXAA 4EQ9A 4POXA 2GH9A 2ZYNA 1N7XA 3E4RA 2D5WA 4I1DA 2AIXA 1SW4A 4XKRA 2O1LA 3S2VA 2XXPA 5JTYB 1B4HA 3OENA 2FNCA 5KDTB 4GOTA 3D4CA 4YICA 3PMVA 4F39A 4NF8A 1B7UA 1Y3QA 1JNFA 4KPTA 1AL3A 3TTRA 2GHBA 2G93A 2YJPA 3H6TA 1HSJA 2X7QA 4RY1A 1QJMA 2DSFA 4KYSA 2F78A 4EXKA 2F35A 2DXRA 2O6AA 2XXIA 4NEDA 2I3WA 4IO5A 3Q26A 4F1YA 1POTA 4LVQA 5H8NB 5CMKA 1FQEA 4H8IA 1IQ7A 1IITA 4OEUA 1B05A 3VVFA 2QS4A 1FTKA 1FTLA 3FV1A 3KEIA 4OETA 3JV9A 1N3XA 1GV8A 1NNPA 4U1OA 5H8FB 4M1VA 5FTHA 2OLBA 3ONMA 1USYE 4DE8A 4IB2A 2RCBA 3Q25A 4YKJA 1QULA 1P1QA 3N5LA 1MY2A 5KCJB 1R9QA 3RTWB 5CRYA 4KQPA 4G68B 3FZVA 4HTGA 1URDA 1IXCA 3PD8A 3MZ9A 1Y1MA 1D9VA 1MH4A 4YB6A 1GVCA 4POWA 4NF5B 1SYHA 2XD2A 1OVTA 3OXNA 1FW0A 4N6PA 5TPAA 4XKQA 1MM6A 2ZNUA 3WAFA 1IXGA 1ELJA 2VD3A 4F1VA 4NF4B 2XXTA 4YKKA 5I2NA 4JWXA 3SERA 3MBPA 2ZNTA 1BTJA 4XIGQ 5LOMA 1Y1ZA 1LFGA 3O29A 4G68C 4R72A 1NMUA 2REGA 3SEXA 3U92A 1N84A 2HZLA 3IORA 5FHMA 1JW5A 4PFYA 1WVJA 4RK2A 5F7VA 2H25A 2H5YA 4G8MA 1MPCA 2B3BA 4BDLA 3KZGA 2I4BA 1B6HA 1EH3A 2V3QA 2F7CA 1M5BA 3IAZA 1HSEA 4PQJA 3EHUA 4KHZE 1PDAA 4ND9A 4ESXA 3MZBA 1I69A 1XC1A 3KOSA 3TTLA 4PFUA 4P0GA 1MXWA 3R7XA 3A3UA 3VE1B 1R1NA 3B6WA 4HCYA 1UTBB 5H8QA 2UXAA 3TCFA 4IO2A 1D9YA 5DVFA 3S9MC 3CIJA 4RJZA 3QSLA 3MP1A 4GD5A 2F7BA 5A5XA 4KYEA 1NFTA 3MUQA 1DPPA 3FGSA 4RYAA 5CMMA 3V8XB 4U2RA 3QK6A 4Q0CA 3ILTB 2GFEA 3W9VA 4X48A 4IGRA 3BFTA 2M8CA 1B3LA 2I3VA 2ABHA 2ZNSA 2ZYOA 2NOOA 4ONYA 4AB6A 3VLVA 3KGCA 2OWTA 3KN7A 1IXHA 1TWYA 1LFHA 4MLQA 2Q8JA 4EQ7A 3DP4A 4XKPA 5KDTA 4H0WA 1DMBA 1AMFA 5HPQA 1LSTA 1S50A 5HM4B 4X1DA 4LZ8A 1MDP1 3VDFA 1OQHA 3Q28A 5CC2A 4E0XA 4BLAA 5CMCA 2H99A 2H98A 3MVXA 4P11A 3TZAA 4PE5B 3TKDA 2O69A 3CSGA 3DELB 4GRKA 3C34A 4AQ4A 1O64A 4KFQA 3TTMA 1IXIA 3OSRA 4XXUA 1XHYA 5DVJA 1LBBA 4MH5A 1R6ZA 5F1QA 4FE8A 5I57B 4QFNA 1DTGA 3C36A 3ZKLA 1B1XA 1H3DA 2QS3A 1P1NA 4IO6A 3K00A 5ITPA 1JW4A 4YMBA 2F5XA 3KOTA 1SQYA 4FATA 4G8HA 3K6XA 1HSLA 1GGGA 1M5FA 2R9JA 3RUMA 5I56A 3ODBA 5H8FA 3P7IA 3M3LA 1PC3A 2I58A 4ZE9A 2O84X 5M2VA 3FIRA 1SVXB 4F3BA 2Q88A 4DCXA 3WAEA 3MP6A 5I2NB 3FXRA 5KCJA 2UYEA 2REJA 3KJ7A 3T93B 2DXYA 1F9BA 4OXVA 1LCFA 2OWSA 4G68A 4JDFA 2XXUA 3PPOA 1JQFA 1NNKA 4ZEFA 3IO4A 3O6GA 4DXUA 3FVKA 4C1UA 1UTHB 4DDDA 3B7DA 1B46A 2D3IA 4NF5A 3H06B 4PP0A 1QUJA 4U22A 1GTKA 1A7LA 3T9XB 3KSXA 3PPNA 2QMWA 1LGBC 4KYDA 4GQOA 1B3FA 1TXFA 4NE4A 4WXJA 1SW1A 4I9DA 3U93A 4JB7A 4GF8A 2ONRA 4OESA 4ECFA 2I48A 3PMXA 2NVUB 2P2AA 3LUYA 3CSBA 3FVOA 5H8QB 3KN8A 3TTNA 4IO3A 3VXCA 3TUSA 2XXVA 4R2FA 2DP8A 3G3FA 2ANJA 2E1SA 4BDRA 3PGFA 3DP6A 3S9LC 2HCAA 4H67A 4GVOA 4ELQA 4M4GA 3CR9A 1I6QA 4L17A 3VV5A 4OQOA 5I84A 3T9HB 3PUVE 1LLSA 1MXZA 1AH5A 4I8CA 4H65A 1Z7ME 3IR1A 1MQIA 3KFMA 3OMBA 2F8DA 1SI1A 1MQGA 1A40A 1FTOA 1B5HA 4EF1A 3IOUA 4H8JA 5H8SA 4R74A 3G3IA 1UTBA 4YMAA 2DVCA 3Q27A 3DM0A 3EQ1A 3OOAA 4X1BA 4BDNA 1SBPA 3R26A 4Q8RA 2I4CA 1TFDA 3I3VA 3FXQA 3QUJA 4KCDA 1AIVA 3PD9A 4F31B 3IO6A 4YZZA 2RC9A 4RXLA 3HSTA 3C33A 3VLUA 3QIMA 5H8HB 4OERA 1FCKA 3I6VA 4O3BA 1VSOA 3T22A 2QS2A 4G2ZA 4H5GA 3RT8A 2AL5A 3T9UA 2UVIA 5CI5A 1OVBA 2FA7A 1FQCA 3RN8A 2Q2CA 4NTLA 3C9HA 3IOWA 3MWBA 4ZEKA 3OELA 4BDMA 2O68A 4GXAA 4C1TA 1QKBA 1B0LA 3IB0A 3QUFA 2HAVA 4OTEA 5CMBA 1A55A 2PT1A 4XTCQ 4U4XA 4NWCA 5DTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N8YA 3IL1B 5I56B 2XXHA 3B50A 2P3NA 1QUIA 1P1UA 4TQUQ 1OMPA 3LUZA 4F3GA 3UP9A 1UIVA 4R6KA 1H43A 1FBCA 1XVYA 3E9XA 4H5FA 1USYH 4PFTA 4PC9A 1A8EA 1Z7NE 2VP1A 1MY3A 3HN0A 3SEUA 1B9JA 5I57A 4OFJA 1FPJA 3MVZA 2H4IA 4MFIA 2NWJA 3KSJA 1DSNA 4F22A 1LAFE 5DW8A 4YKPA 1LFIA 2O1MA 2Y5KA 2X7PA 1DK4A 1Y3NA 3MVWA 1FBFA 2P3VA 1B3GA 2ALUA 3T66A 1Y3PA 4F3PA 3IK6B 1CNQA 2QVRA 3TAJA 4PAIA 1LBYA 1FRPA 3O66A 1LBVA 1RYXA 2V93A 4R6YA 3IB1A 2P0SA 4EDPA 2HEUA 1YYZA 1IMCA 1MY4A 3FJMA 3HFUA 2Z23A 3LV0A 3IJOB 1BP5A 3V5AA 4NF6B 3MPLA 1EZ9A 4LP2B 2ZZWA 4KD5A 3IFAA 1B5JA 3LSFB 4ZZAA 1D4NA 1JEUA 4IY5A 4JXIA 1OIBA 2Q74A 2FIEA 3LR1A 3EN3A 3V83A 2RCAA 1IIWA 4OFLA 1UTHA 3C32A 4UABA 2DWIA 1B40A 2E0SA 3SEYA 3G3KA 4ZEDA 2CEXA 1IMBA 3VVEA 4DLDA 4P1LA 4P0IA 1ZTYA 5I3SA 2OCUA 1SDXA 1LB9A 3UN6A 1NNTA 1YTVA 2F6PA 4MBPA 4ZDMA 4G77A 1B3HA 2V3UA 1AWBA 1H45A 1PB9A 1GR2A 3LSWA 2KQZA 4U23A 3HHGA 3L6GA 1IMDA 1MH3A 4O7IA 4PFWA 5IZ3A 4NQ8A 1B4ZA 3HHFA 4HE0A 3B8BA 2O51A 1PBPA 2G29A 4QRZA 3N6TA 4JSDA 2I49A 1K9YA 4X9TA 4EF2A 5A5LA 1S7YA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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