4WETA

Crystal structure of e.coli dsba in complex with compound 16
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
QYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
publication title Application of Fragment-Based Screening to the Design of Inhibitors of Escherichia coli DsbA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
total genus 63
structure length 187
sequence length 187
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2014-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4wetA00
4ECJA 2XHFA 4EVMA 2L6CA 1EZKA 5CP1A 2DJ0A 5CRWA 2KOKA 4BA7A 2A4VA 2YCDA 3OR5A 4ECIA 2KP2A 1EGRA 1TJDA 2A2RA 3CXGA 1F9MA 1MDKA 2FWEA 2TRCP 3APSA 4G19A 2V2GA 4TKYA 4ZL9A 2LJAA 3DKSA 1SK0A 5IO0A 3EC3A 4BVYA 3WT2A 1Z3EA 3I43A 1XWCA 1FO5A 4BPYA 4GRFA 1XBSA 3MAKA 3L9SA 2K6VA 1ACVA 4CHSA 3RPPA 3CTGA 4RUVA 4NV2A 1OVNA 2VAFA 2WZ9A 5B6MA 3FY7A 4LL1B 1FHEA 2YPMA 3ZIJA 4HUAA 3H1NA 4JEDA 1THXA 1O7UA 4MZWA 5EY6A 5G1KA 2GZPA 5J41A 3EE2A 1GNWA 3TB2A 1A0RP 4V1Ap 2VL3A 4EC0A 2MMAA 1UC7A 1K3OA 1PQNA 4KCEA 1DE1A 1ERUA 4K7IA 3N9JA 4LLRA 11GSA 4GCIA 3D5JA 2CX4A 1RK4A 2QC7A 3FW2A 2CAIA 5D9XA 3QMXA 2WB9A 5L71A 4XIHA 4NV5A 2VL2A 2WULA 16GSA 1R5AA 3CRUA 5GAND 5ID2B 4AJ6A 3NOFA 2BTOT 4HU9A 3DXBA 4ISDA 5IMAA 4ML1A 2H0IA 1IYHA 1YJ6A 1FG4A 5KN2A 4OWYA 2I1UA 2L4CA 2R6KA 4N11A 5CYYA 1OYJA 1ERTA 1M99A 4L0WA 3CMIA 4HDEA 1K0NA 1PX6A 1HNAA 3WT1A 4L0UA 5B6NA 5DJLA 1M7TA 4GLTA 3UVHA 3GH6A 2EIOA 5J5NA 2YZUA 3DVWA 4KUNA 4ML6A 4NPBA 2H1GA 3GRXA 3GHAA 1YDKA 3C1RA 3M9JA 3QR6A 1E6BA 2ZCTA 5FT3A 5HQPA 3VLNA 1OE7A 1GSDA 1GUMA 1V2AA 4KAEA 1GULA 4DSRA 3TKPA 4YQMA 2YZHA 2YV9A 5COHA 5D8IA 1J08A 1K0OA 2B3SA 2D2ZA 2DJ2A 1YQ1A 4WEYA 1X0RA 1TKDB 3HDCA 4KCAA 2YNXA 1E2YA 3FR3A 3ME8A 2PMTA 2IMFA 3C1SA 4MCUA 1PL1A 2H75A 5IIZA 1ON4A 4K9ZA 1TP9A 2FCHA 2G2QA 2NBSA 3HVXA 2DJJA 3HZ8A 2JADA 3LXZA 2Z9SA 4HOJA 3TUEA 3GN3A 1YZXA 2HNLA 2RM6A 4Q5RA 1X5CA 3E0UA 2E2GA 2WJUA 2EC4A 8GSSA 3ZIVA 3EYTA 3HHVA 1M2DA 1M2AA 2FUG2 3IA1A 4HI7A 1MDIA 1I9DA 4ILFA 2H76A 1A2LA 2X8HA 5D9TA 4Z7XA 3GUSA 4QL9A 2GSRA 5F07A 3GX8A 2HLSA 1J0FA 1MEKA 4F03A 1FB0A 2RUEA 3PR8A 1TTZA 1ILOA 19GSA 3RAZA 6GSXA 3VURA 3VWVA 1YKAA 4KNDA 1JZDA 1C72A 2C0DA 3IV4A 3A3TA 4MJAA 4AJ8A 2VM2A 3CSIA 3FYGA 1ZGNA 1T4ZA 3MNGA 4I2UA 2YWNA 4EO3A 1AAZA 5DBQA 2F8FA 2XPEA 3WD6A 3J7Yk 4PURA 1O85A 2R4VA 4PNGA 1M0UA 3KZQA 3KD0A 3F4SA 5ECSA 1GLQA 2VCTA 3E3EA 4MJBA 1JZWA 4G10A 2MBTA 5IQYA 2ES7A 1XZOA 2B6MA 2REMA 4G9HA 2V6KA 4TXOA 5HR3A 3LORA 2OADA 4KA0A 1S3CA 2YN1A 5E4WA 5G2ZA 5JWQB 3FZ4A 1EV9A 1GH2A 3WYWA 2YP6A 4MZBA 1AW9A 13GSA 2HZEA 1ABAA 3ZFLA 1OC9A 1S3DA 5DCGA 2I81A 3LEFA 1AIUA 4O7HA 5ECRB 3TJJA 3V1WA 3IK9A 1OAZA 2CVDA 3KH9A 2B7JA 4V2NA 3G7IA 2KUCA 3M0FA 4ACSA 1M2BA 3ERWA 2P0GA 2RLIA 3G9BA 3VPQA 4BWSA 1IYIA 4KDYA 1TU7A 3HJMA 12GSA 3N5OA 3WGDA 3TRPA 2J23A 3A5WA 3IE3A 1QMVA 4TXOB 2CV4A 1A0FA 5J4UA 3LSZA 3IHQA 4YAPA 3TRXA 2RM5A 1A8YA 2H74A 1R5PA 2FWFA 1BX9A 3J7Yb 1G0TA 4XTSA 2HZEB 2IMDA 3DWVA 1F6MC 3KMOA 3F4RA 4F9ZA 2IJYA 2TIRA 1BYEA 5DDLA 4IS0A 3APQA 2HZFA 3CSJA 3TRQA 3DD3A 1W89A 3ZVJD 1GSSA 3E9JB 4NAXA 1ST9A 2IL3A 3F8UA 2GT6A 3GL3A 3QDNA 4MLYA 2VOCA 1SL2B 2K8SA 4NHWA 2G0FA 5ECPB 5IMCA 1A8LA 4OO5A 1XWKA 3CSHA 4DSSA 3HJOA 1GUKA 2H30A 2CT6A 4YAVA 1UA5A 3F4TA 2AHEA 2H6XA 4I6XA 4XCSA 4ZB6A 4GSNA 4OD7A 3KP8A 1U87A 2GLRA 3GSTA 3L4NA 1GSUA 4KE3A 2BMXA 2IN3A 1ML6A 4KDUA 2HSHA 2FD3A 3NIVA 3KTBA 1ZOFA 2CA8A 5D93A 3KIJA 3L9UA 4WR4A 5JWRB 3I69A 3EU4A 1NSWA 1N2AA 5G5FA 2O7KA 3FZ9A 1XW9A 1R7HA 3GIXA 4JR4A 1SKRB 1URMA 3LGCA 4WF5A 4EE0A 3BD2A 1EEJA 4PUAA 2IPAA 2LUSA 2V32A 3IAS2 1U88A 3TJGA 2ON5A 3PINA 4QL7A 1K0AA 2VCWA 4DEJA 1PMTA 2H6YA 4G2EA 4JBBA 4KX4A 5ELAA 3TJFA 4DSSB 3FEUA 4H86A 5DALA 4ZB8A 3GKXA 4EXJA 4F2IA 2AYTA 2VIMA 5A4VA 5KN0A 1SJ6A 2N5BA 4X0XA 2HSYA 2PPTA 1BJXA 2JZSA 3F6FA 3VFIA 2C8UA 2FHEA 3ZRDA 4RI6A 1SYXA 2AJQB 3ZZXA 4ID0A 2LRNA 3GKKA 1B48A 1XVWA 2IMIA 3A2WA 5F05A 2WS2A 2O87A 3L0HA 1TW9A 1SJIA 2LRCA 5ID2A 1Q4JA 1BAYA 3HD5A 3DGQA 2F3MA 4WR5A 4ZXGA 4PXOA 5DALB 3LYPA 3QPMA 3BBYA 3AY8A 17GSA 2B1KA 3ERFA 4GXZA 1JZRA 4WXTA 1XFLA 1SENA 2K18A 1RQMA 2IFQA 2HXKA 2MMZA 4OO4A 3ZMKA 5IOXA 2E2MA 4POMA 1X5DA 3F3QA 2GDRA 5ECQB 1GTUA 3ZMLA 5F0GA 3GH9A 2L57A 3HA9A 4K0NA 2C3NA 3IK7A 5CREA 2PBJA 4IGJA 4LMWA 3DRNA 2OACA 1W4VA 2DMLA 4PUFC 2FNOA 4KDXA 1A24A 1B4QA 5KEJA 2DMMA 1DSBA 2H1BA 3CTFA 1K0CA 3PGTA 3BJ5A 1GNEA 2NVLA 3R2QA 1JLVA 1FVKA 1Y6EA 1PL2A 1TK8B 3TJKA 2HE3A 3EURA 3ZITA 5JCGA 1R4WA 2YJHA 3EWLA 4JZQA 4K7NA 2O85A 2I9HA 1GSYA 4BVXA 2CQ9A 1YF1A 2H0HA 1XOAA 1WIKA 3D22A 2IFQB 2LEGA 2ZUPA 3D6IA 1B9XC 2KLXA 3W8SA 4BL7A 1TRWA 4NMUA 3KJYA 5CRHA 4I8BA 2H66A 5LD0A 2EIRA 4ZL8A 1HNBA 4HS1A 2A2SA 3W6GA 5ECMB 2AB6A 2WGRA 3IAM2 1PX7A 2YJ7A 1PSQA 5IPGA 3KH7A 2VCXA 4GSTA 1V40A 1CQGA 5HFKA 1ZYQB 5C00A 1TOFA 1SD9A 3VWUA 3MDKA 4MH2A 3A2XA 3KGKA 3FZ5A 1EEMA 2P5QA 2F9SA 3C71A 2OBKA 5ECLB 5ENUA 2H70A 2GS3A 3VI5A 4POLA 4HQSA 3RHCA 4OFMA 1AXDA 5HFGA 1XWBA 3UBKA 5JCWA 4MZCA 3C7MA 5ABRA 5G1LA 4MABA 1Z7PA 6GSWA 2CX3A 2DIYA 1QQ2A 1FVJA 3EU3A 5G31A 4ZILA 1WE0A 1WMJA 1OC8A 4DVCA 3F9UA 3DVXA 1ZZYA 1OC3A 3ZTLA 1PKWA 3RPNA 3SBCA 1EOGA 4TOPA 2CVKA 4IP6A 1TRVA 4XS4A 2MMNA 2R5GA 4ZL7A 3RHBA 3HXSA 4OCFA 3C8EA 1Z9HA 1YEPA 1F37A 1TI3A 4NXIA 1ZCPA 6GSVA 4N30A 4MF5A 4MH3A 5D73A 3Q74A 2LQQA 4FIWA 2H19A 5H5SA 4HZ4A 1H75A 4IW9A 3F0IA 3QOUA 4KSOA 2JZTA 1F2EA 2FY6A 3ERGA 2KHPA 4F0BA 1T8EB 1TRUA 4PNFA 1SU9A 4YH2A 2L5LA 2JU5A 5CAXA 3Q6OA 1OE8A 4L8EA 2VM1A 3HCZA 3GTUB 5EL8A 5IMFA 5J9CA 5DCHA 4L5OA 2GSTA 4XS4B 2N5FA 2VCQA 4RQXA 1SL1B 3TGZA 5EVOA 3H4KA 1MD3A 4ZIJA 4JR6A 1YY7A 5DAKB 2VO4A 3FZAA 1JFUA 4IJ3A 5A4WA 3KM6A 1AQWA 1VF1A 2TRXA 3LQ7A 5A5KA 4V2MA 2C1YA 1OKDA 4FH8A 2OBIA 5LNKe 4MP4A 2GZZA 5IMDA 2JZRA 1O81A 5CRGA 4TR0A 2OA7A 3UMAA 1X5EA 5HR2A 3IPZA 3QFAC 4F82A 4XS1A 1TK0B 3ZLPA 3UOMA 1BEDA 4ULXA 3UJ1A 2K8VA 3UL3A 2IWTA 3CRTA 4WETA 4HEA2 1NM3A 3MWHA 2F51A 5AGYA 3P2AA 2CVBA 3WGXA 2B5EA 2MBSA 3L9VA 1K0MA 3D4TA 1XIYA 3UARA 3GKNA 4YQVA 5FWGA 4IJIA 3P7XA 2LSTA 1QXHA 3DYRA 1HQOA 1UN2A 1T7PB 5AIXA 1SYRA 1JLWA 2VL9A 3FRCA 2LTKA 1HNCA 2C3TA 1WP0A 5IO2A 2MZCA 2NTOA 4JRRA 3IBHA 3UBLA 4LA1A 4IHUA 1VRSD 4E8HA 4N0VA 4GQFA 1LJRA 3KEBA 4O5RA 1U3IA 3O3TA 3ZVJA 4CDOA 3VI7A 2KP1A 1EWXA 3ZFBA 2GT5A 3P8WA 1ERWA 2YWOA 3GKMA 1XWAA 2VLVA 14GSA 22GSA 2JL4A 1PA3A 4MPGA 4N10A 4HZ2A 1XOBA 3US3A 2OE1A 3ME7A 4X43A 3CYNA 1EP7A 4FYUA 4V2LA 2H6ZA 2XC2A 5CNWA 2JSYA 4MJEA 3HVSA 1GP1A 4IP1A 2FA4A 1VGLA 2DJ3A 2NDOA 1PGTA 3K8NA 1A2MA 1XVQA 2C80A 2X99A 2M72A 1T00A 2X64A 2E7PA 4HJ2A 3D21A 4I2TA 1BG5A 1A23A 1MDJA 2GQMA 3BOAA 1K3YA 2FLSA 3HZ4A 1FOVA 4V1Ag 3TKSA 1XW6A 3GSSA 5B7CA 2LS5A 2IMEA 1XPVA 3TOUA 1HD2A 1F3BA 1MTCA 3M8NA 3QFBC 2XBQA 2B1LA 3GL5A 2GVPA 1RW1A 2C0EA 5HR1A 4FYCA 2V41A 4ECBA 4KGIA 3TKSC 3W8JA 4TN8A 3KTLA 4MK3A 4TRXA 3DMLA 2OE0A 1M9BA 2LNSA 2PN8A 4K8MA 2C4JA 4IKHA 4ECCA 2JSZA 1V58A 5IOWA 2V1MA 3CBUA 2YWIA 3IOSA 2DJKA 1G6YA 2PGTA 4ZBBA 4POBA 2P5RA 5C04A 1GSFA 1XWGA 1X9MB 2B5XA 1DBYA 4D73A 1I5GA 3LYKA 2OJLA 4Q5NA 1K0BA 3QAWA 1O6JA 2FWGA 2R37A 1GWCA 5AN1A 2C0GA 5CO3A 3GNJA 5LCZA 4K0GA 4OCEA 2V6OA 1XCCA 3UIWA 2M46A 3FK8A 1WJKA 3TKQA 5B8BA 1J9BA 3LWAA 4CW9A 3GFKA 3IDVA 4TW5A 4YQUA 5F06A 3ED3A 3G7JA 3FR9A 1T1VA 2BJXA 4ZBAA 2RIIA 1V57A 3L78A 1PN9A 4L5LA 4IBPA 3MSZA 3ZREA 5H5QA 1ZMAA 1AQVA 4K2DA 4HJMA 2PUKC 2DLXA 3D4MA 3LG6A 2R2JA 5GZZB 4TR4A 4AJ7A 1GL8A 2DBCA 4TR3A 4RI7A 3IRAA 6GSTA 1EOHA 4D73B 1AC1A 2HYXA 4EKZA 1QGVA 2VD1A 4TR1A 4J57E 3P90A 1TDIA 3M3MA 1U6TA 5KN3A 1B4PA 1VF2A 7GSSA 2H8LA 1AUCA 3F3RA 5A4UA 4OFNA 3TKSE 3RBTA 5IMZA 4MDCA 1YEXA 3SWLA 3HVVA 3QAVA 2CAQA 3UVTA 4QQ7A 4EDZA 1SKSB 4P3YB 2XPDA 3FR6A 4FO5A 3GV1A 4N0ZA 1MD4A 1LBKA 1Z6NA 4FYBA 3S9FA 2H01A 2ZNMA 3WGEA 5D96A 1ZL9A 2H0GA 3BCIA 2B5YA 2H1AA 3EMPA 4XRAA 2XBIA 2GSSA 3GURA 4OFTA 1DUGA 4TR1B 4MF6A 3VWXA 5J3RA 4HU7A 2VCZA 3TJBA 5IM9A 4O32A 4BWQA 3GA4A 3U5RE 1N8JA 2ON7A 3QAGA 2VL2C 4XRDA 2O8VB 3H79A 5JWOB 2GGTA 3IC4A 2C3QA 3RDWA 4K7OA 2JACA 4J2FA 3TCOA 1F3AA 5JCUA 2CZ2A 1S3AA 3KP9A 2VD0A 2EIQA 1XXUA 3VPTA 2GQKA 4JE1A 2FA8A 5D9VA 3F63A 4PQIA 3PH9A 1CQHA 1EGOA 2HRFA 3ZYWA 5GAPD 2PVOC 4PGTA 4KB3A 4XS6A 2H1DA 5DVBA 2CZ3A 1XW5A 2YWMA 3KXOA 2ALBA 2I4AA 2VCVA 3EMXA 4I5QA 2LQOA 1Q98A 2M80A 3VK9A 1EV4A 2LJKA 3FKFA 1GLPA 3GTUA 1GTAA 2QSIA 3ISOA 2X8CA 3NZNA 5AIVA 4ZBDA 4AGSA 1USBA 1V98A 1HYUA 3H93A 5ECKB 2VUPA 4TVEA 1SL0B 5FHIA 5B8AA 2E0QA 5ECIB 2HT9A 4XHMA 5INYA 4PQ1A 2C0FA 1SK2A 3ZL5A 4LMVA 3KCMA 1SKWB 3Q19A 4WBJA 3QCPA 1YKCA 5G30A 5DAKA 5ECNB 2O89A 4O92A 1TK5B 5IPHA 1WPIA 5F8BA 1ERVA 3M1GA 5J9BA 1Z7RA 2DC5A 2FWHA 5E59A 6GSYA 2K9FA 1SK1A 3TOTA 1O8XA 1QFNA 4MF7A 3A2VA 1EP8A 2H73A 2P31A 4GSSA 4GTUA 3JCML 3UEMA 5H5RA 2VLTA 4RQRA 4NWYA 1K3LA 2GSQA 4JU5A 2R3XA 1NHOA 2HRNA 4WF4A 1KBNA 2QGVA 1O73A 4IVFA 3FHKA 5D9WA 1NHYA 1TI1A 1X9SB 2YOIA 3GYKA 1GUHA 5ECOB 2AAWA 4KW6A 2AV4A 2YV7A 1O8WA 1K0DA 3KMNA 2L5OA 4Q5FA 6GSSA 3DEXA 3GX0A 3EVIA 4IQ1A 4Q5QA 1GTBA 3U6VA 2MMOA 2WFCA 4HQZA 4IELA 1ZYEA 4IN0A 4OMVA 5DJMA 2N5AA 1KTEA 2L6DA 4MMMA 3TKRA 1X9WB 2MYGA 1WOUA 1VF4A 5IMVA 3BCKA 1B9YC 1JHBA 2DIZA 3VWWA 5KN1A 18GSA 2WCIA 2X8GA 3LXTA 4EF0A 1Y25A 4PQHA 2L59A 2OE3A 1TXXA 1FB6A 2LKUA 4DSQA 1H4OA 5DQSA 4X1UA 3HJPA 4LL4B 5CRDA 3I9V2 3TDGA 4MJCA 1SJZA 2B7KA 3APOA 3Q18A 4KH7A 2NPBA 5AISA 3M9KA 2LNTA 4NHZA 1WRYA 4ZB9A 3LFLA 3HY2A 1PKZA 1VF3A 1TU8A 4E8EA 1WWJA 4EDYA 4AF2A 1QK8A 1PRXA 1TRSA 1M9AA 1DE2A 3G7YA 5HR0A 1THOA 20GSA 4I97A 2H72A 1OC9B 5HFIA 2VLUA 2AUVA 1JZOA 1Z6MA 1T3BA 2WDUA 2LV3A 6GSUA 3F6DA 1A2JA 5ELGA 4IQAA 2H71A 1LU4A 4MPFA 3I6AA 4J56E 4GWRA 2YANA 2F8AA 4GF0A 1BQ7A 1FAAA 1GSQA 1GSEA 2IMKA 2OKAA 2HFDA 3IXRA 1GTIA 2GTUA 2HI7A 4PX1A 2LJRA 2RUFA 3HYPA 1V9WA 1G6WA 2GQLA 4WKWA 2LRTA 2PVQA 4GQCA 1QUWA 3GMFA 2L4QA 5G5EA 3QD9A 1PD21 2J9HA 5EPFA 2I3YA 4KSMA 1T4YA 1YF0A 3D0ZA 3DIEA 4MA9A 5GSSA 1KEBA 1U3AA 2PWJA 3HKRA 4EL1A 5DQYA 5GSTA 2IIYA 2QKEA 1Z5YE 3IR4A 1SD8A 1UVZA 4TXVA 4K6XA 5ECHB 2PERA 1NW2A 4EUYA 2GZYA 2FGXA 4K1FA 1B8XA 4POKA 4WBRD 1G7EA 3UAPA 3O6TA 2DSAA 3C73A 2PU9C 4F0CA 9GSSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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