4WEYA

Crystal structure of e.coli dsba in complex with compound 17
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Application of Fragment-Based Screening to the Design of Inhibitors of Escherichia coli DsbA.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
total genus 67
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2014-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4weyA00
3KM6A 2R5GA 4XS4B 2FNOA 2RIIA 5HFIA 3W6GA 1GUMA 1FB6A 3RHBA 3G7JA 2EIQA 16GSA 2I81A 3P90A 4KH7A 1C72A 5ELGA 3F6FA 4EC0A 3EE2A 2YJHA 6GSVA 2GZPA 2HSYA 2WRTA 3RPPA 4JEDA 5G30A 3E9JB 5AISA 4NAXA 1A24A 3VI7A 2QGVA 3TJGA 2GT6A 1JLVA 2HRFA 2RUEA 2N5BA 1RQMA 3GSTA 1JFUA 3VK9A 4ZL8A 4JRRA 2E0QA 4K0GA 1WOUA 4J56E 3RAZA 4OFNA 5F07A 3ISOA 1PQNA 4YQMA 5CRGA 2HZEB 2AYTA 3M1GA 4MLYA 2H0HA 4F9ZA 2YN1A 1JZWA 2IMFA 1Z6NA 2HYXA 3QOUA 5D9WA 2VOCA 2GT5A 4OWYA 3FR3A 2HXKA 3SWLA 2VL2C 3UL3A 1SKWB 1XBSA 2ON5A 1Z5YE 4F0BA 3IPZA 5D73A 1X9SB 2YWNA 5D9TA 3ZVJA 2AV4A 1EP8A 1PX7A 3DGQA 5IMAA 3IK7A 4NV2A 3DVWA 5JCUA 4OO5A 2H30A 3F0IA 3JCML 1K3LA 2GSQA 1HNAA 4MA9A 2H73A 3GX0A 3CYNA 1TK5B 2E2MA 11GSA 1QUWA 4LA1A 4KGIA 1G6YA 2HZFA 1Y25A 2MYGA 5J3RA 2H8LA 2DMMA 3A2VA 2DJ1A 3DVXA 1R5PA 4ISDA 4TKYA 1F37A 2LJKA 3QMXA 2L5OA 5IPHA 5DBQA 5J9BA 4K9ZA 5D96A 1GLQA 2K18A 3CBUA 3H93A 1V40A 4IP6A 1USBA 2NVLA 4O7HA 4WETA 1EP7A 3UVTA 4F0CA 1XXUA 3CRUA 3TRPA 3IXRA 5IMFA 2L6DA 2V6KA 2IJYA 5HR2A 1VGLA 2FUG2 4HZ4A 3ZIJA 3TKSE 5IPGA 3DEXA 4MP4A 1QGVA 2VCTA 1PL2A 3CRTA 2GQLA 3HDCA 1IYIA 4ID0A 1MEKA 3TB2A 6GSWA 3GH6A 1U3IA 1KNGA 5ECNB 3ME8A 2LS5A 3CTGA 1O6JA 1N8JA 4V2LA 5B6MA 5B8AA 1Z3EA 2HNLA 5E4WA 4MABA 3KJYA 4EF0A 1SD8A 1SENA 3CTFA 3G7IA 4OFMA 1JZRA 3WD6A 1AQWA 1BJXA 1EOGA 3N5OA 1SK2A 4YAVA 4XS6A 3FY7A 1O7UA 4OMVA 2YOIA 3LORA 3APSA 1X5DA 3H8QA 2H76A 1GTIA 3J7Yb 1XW9A 3Q19A 1BYEA 1AQVA 4L0WA 6GSSA 1XW5A 3QAGA 1N2AA 5ECHB 5IQYA 3UAPA 2FWHA 4KX4A 3H4KA 4IELA 5F8BA 1LBKA 4RUVA 5D9XA 3GUSA 4IBPA 1YQ1A 4TR4A 3KMOA 3WYWA 1U6TA 3ERWA 2L59A 2MMZA 1K0BA 5ECOB 1XPVA 1HQOA 3DMLA 3D4MA 4BVYA 1SU9A 1WE0A 1FW1A 2GZYA 4HU7A 9GSSA 5IMVA 2O87A 5IMZA 3IRAA 4BWSA 1J9BA 5AN1A 5ECMB 1T1VA 1TRVA 4KNDA 3FR9A 2R37A 3N9JA 2C4JA 4PQIA 1YDKA 1GSDA 5DALB 5AIVA 3IOSA 5G1LA 1ON4A 5DQYA 5KEJA 4F82A 1WPIA 5GSSA 1IYHA 5D9VA 2B5XA 2VO4A 5CNWA 5E59A 4Q5FA 2H0GA 4FIWA 2IMKA 3FYGA 2DIYA 6GSXA 2CVBA 1F9MA 4WEYA 1T00A 4FYBA 2PUKC 4HI7A 1Z6MA 1XVQA 1TRSA 3I9V2 4WR4A 1TU7A 3WGDA 4POLA 3CSIA 1PMTA 4YH2A 2LV3A 3R2QA 4KCEA 4ZB8A 4ZB9A 2OBIA 4DVCA 3C71A 4I8BA 3QD9A 2P0GA 3HCZA 2MMNA 3NIVA 1VF4A 3GX8A 3LYKA 3M9JA 3F4SA 3C7MA 3D5JA 4P3YB 3TGZA 1XZOA 4XRDA 4NMUA 2RUFA 4TXOB 3ZLPA 2GZZA 3GKMA 4FYCA 4AF2A 3F3QA 1Z7PA 3F9UA 1NM3A 2RM5A 2B6MA 1FVKA 2TRXA 4MH3A 4K7IA 3ZL5A 3LG6A 5J41A 2M46A 3US3A 5ELAA 3PH9A 3GRXA 1I5GA 1V58A 1UVZA 3EINA 2DJ2A 1OAZA 3HJMA 3F3RA 5GSTA 3FZAA 3KP8A 4JR4A 4NHWA 2GS3A 2X8GA 5CO3A 4NV5A 5A4WA 3C1SA 4HUAA 1PKWA 4TR1A 4O5RA 3EMPA 5ENUA 2HRNA 3E0UA 3LJRA 4AJ7A 3BBYA 2LEGA 4POBA 4DSSB 2JADA 2R4VA 3KZQA 4MZBA 2H1BA 4MDCA 4LMWA 4ECIA 4V1Ag 1AAZA 5G2ZA 1QMVA 1M2AA 4MF6A 4HEA2 3EWLA 1G6WA 2PMTA 1TU8A 4HU9A 5FHIA 3ZIVA 3H79A 3UOMA 2HLSA 2LJRA 2GQMA 3PR8A 3IE3A 2XBIA 3CXGA 1DE2A 4XRAA 1ACVA 4MH2A 4QL7A 1MDIA 3ZFLA 1ZGNA 4V1Ap 5B7CA 1GRXA 1QFNA 2B7JA 1BEDA 3LXZA 1AXDA 3O6TA 2IN3A 3D22A 4ILFA 2K8VA 4DSQA 5IOXA 2H75A 2O7KA 4ZXGA 2V2GA 3WT1A 3QFBC 4N0VA 4HJ2A 4HZ2A 3P2AA 3VPQA 5F06A 3VPTA 2TIRA 3GL5A 1ZCPA 2NDOA 3QDNA 1O73A 5L71A 5CAXA 4E8EA 1O81A 1OE8A 3UBLA 3WGXA 1TK0B 1KEBA 4KDYA 5D93A 3F8UA 4D73A 4K7OA 4ML1A 4EDYA 1Q98A 1B4QA 1S3AA 3KEBA 2PERA 3EVIA 1F2EA 3LYPA 2C1YA 2FA4A 4PQ1A 3MDKA 1ZOFA 1M2BA 3HZ8A 3EYTA 1W89A 2AAWA 1A2JA 2A2SA 2OKAA 2C80A 4Z7XA 1FB0A 3FRCA 4GRFA 2Z9SA 5IOWA 2CVKA 5ECSA 1K0MA 5ID2A 3QAWA 2OE1A 3HD5A 3ZRDA 3MSZA 2PVOC 1THOA 2N5FA 3GYKA 2CAIA 5DQSA 5IM9A 2WGRA 2YANA 4AGSA 4AJ8A 3IAS2 2OBKA 6GSYA 5INYA 2H71A 3U5RE 3DXBA 4XS4A 2REMA 4FH8A 1X9WB 2WJUA 3HJOA 4OCEA 3NOFA 3FW2A 4HS1A 2FWFA 2OJLA 4KUNA 4NWYA 4TVEA 2CV4A 4IW9A 3EURA 1A2MA 2JZSA 3TOUA 1AIUA 1VF1A 1K0OA 5DJLA 1OC8A 3Q74A 3AY8A 4GWRA 2HE3A 1MTCA 4ZBDA 1GNEA 3BOAA 1HNBA 2I9HA 2E7PA 1SK0A 4HJMA 2H19A 4ZL7A 3ZZXA 2VIMA 5DAKA 3BCKA 4GTUA 3RHCA 4G9HA 1PKZA 2CX3A 3VWXA 2LRNA 5G5FA 4MPGA 1GTUA 2M72A 3GKKA 3LFLA 5CRDA 1QQ2A 5D8IA 1R26A 2HZEA 4IQ1A 3HVSA 3HA9A 3GNJA 1GSYA 3FR6A 4WF4A 4FO5A 4GCIA 4BPYA 1XVWA 2XPDA 3E3EA 4DSRA 2GSRA 5ECKB 4Q5RA 2VM1A 4MJEA 3IDVA 3W8SA 2PBJA 4L5LA 4AJ6A 3WGEA 1JZOA 4WF5A 3K8NA 1U88A 4EL1A 4PNFA 4MF7A 2J9HA 2FWGA 2V1MA 3QPMA 3EC3A 1XWCA 2VM2A 3GHAA 1YEXA 2IMEA 4RQRA 1URMA 3IC4A 3HJPA 5IIZA 1XWBA 1WJKA 2JSZA 2NPBA 1V57A 3IBHA 1J08A 3TRXA 7GSSA 2I1UA 2AUVA 3TOTA 2IIYA 3ZFBA 4ECCA 4HDEA 4PGTA 2C0FA 2JU5A 1K0NA 1BX9A 3IR4A 5B8BA 2PVQA 1SYRA 3TJKA 2LUSA 3QCPA 4NXIA 1YY7A 2IMIA 1XIYA 3HZ4A 1SKRB 3HVXA 1ZZYA 3UIWA 4IVFA 2H66A 2K9FA 3F4TA 2B1KA 3HXSA 1T8EB 2FLSA 3HY2A 1T3BA 1A23A 1K3YA 3KXOA 3RDWA 5DVBA 2IPAA 4MZWA 1ZL9A 5IMCA 1SL0B 2PWJA 1TK8B 2GVPA 1O8XA 1GP1A 1JLWA 1U3AA 4K1FA 2H6ZA 3EU3A 2HFDA 5ECIB 1XW6A 3MWHA 2GSTA 3L78A 1JZDA 3DYRA 4ZL9A 3ZREA 3GTUB 1V98A 4MCUA 1TI3A 1THXA 2C0DA 1YJ6A 4JE1A 4LLRA 1A2LA 2OE3A 4KAEA 5GAPD 5ABRA 2QKEA 1QXHA 1HD2A 3TDGA 2L4QA 1H4OA 1ZYQB 3ZYWA 2KLXA 3UEMA 4TR3A 4EUYA 4K0NA 1TXXA 3LWAA 5IO0A 2ZUPA 2VCXA 20GSA 3G9BA 3FZ5A 3NZNA 4WBRD 2YZHA 4OO4A 6GSUA 1B8XA 1ERVA 4XS1A 3GIXA 5ECQB 2MBTA 2LSTA 2XPEA 2H0IA 1S3DA 1BQ7A 2H1GA 2I4AA 1TOFA 3OR5A 1V9WA 2PGTA 14GSA 2EIOA 2L57A 4GQCA 1XWGA 3CSHA 1MD4A 2RM6A 2BJXA 5HFGA 3W8JA 1W4VA 3GL3A 2H70A 3KH7A 1GTBA 4L0UA 2BMXA 1XWKA 2GGTA 1R4WA 1CQGA 2KUCA 3UARA 3BJ5A 3GV1A 1RW1A 1SD9A 4TOPA 3F6DA 2HSHA 1PGTA 3FZ4A 4MF5A 5J9CA 4H86A 1M9AA 2B1LA 1DSBA 3DD3A 4I5QA 2FWEA 3ZTLA 5DALA 3IHQA 3FK8A 4Q5NA 2VD0A 1AC1A 2LKUA 1X9MB 2GDRA 4RQXA 4GSSA 1M7TA 3A2XA 2HT9A 4HOJA 4ZBAA 1EOHA 1GUKA 2CA8A 3HYPA 4K2DA 3APQA 3H1NA 1GTAA 1U87A 1G7OA 2P5QA 4NHZA 2WCIA 3P8WA 2OACA 1OC9A 4LL1B 2GLRA 4Q5QA 4PXOA 4ECJA 1MDJA 3C8EA 2WB9A 4DEJA 3L4NA 1I9DA 3DWVA 1YF1A 3UVHA 5LCZA 5JWOB 3D4TA 3WT2A 1CQHA 2F9SA 3MAKA 4ML6A 4YQVA 1GL8A 3F63A 3BD2A 1XOBA 3KTLA 4KCAA 1F3BA 1NHYA 2F8AA 4RI6A 4J2FA 1NHOA 2NTOA 4TXOA 3L9VA 1GLPA 1SYXA 5HR0A 4FYUA 3I43A 2IFQB 1LJRA 3BCIA 1AW9A 4GLTA 3I69A 2EC4A 4MJAA 4WXTA 5KN0A 1A8YA 3G7YA 1MD3A 5KN2A 1ML6A 4G19A 2VL3A 2DJKA 1TDIA 2KP2A 4G2EA 2OADA 2V6OA 1NW2A 1UC7A 2WDUA 1SJ6A 3GKXA 5CYYA 3DKSA 3UMAA 3F4RA 1K3OA 2VCWA 5C00A 3ZMLA 4DSSA 1FHEA 3O76A 2H72A 1EGRA 5H5QA 3O3TA 2K8SA 4IGJA 4E8HA 4BL7A 5EPFA 1R5AA 5LNKe 2NBSA 2MBSA 3TCOA 5JCWA 4J57E 3IA1A 2DJ0A 4I2UA 3PINA 3GURA 1R7HA 5G31A 3GN3A 1G0TA 4TXVA 4OCFA 2VCZA 1GSEA 2YCDA 2B5EA 4G10A 5CRHA 2DBCA 1B48A 1PD21 4X43A 4KSMA 3RBTA 2FY6A 1WMJA 5ECLB 3M8NA 4NPBA 4N0ZA 2OE0A 5EVOA 3IV4A 5GAND 2FCHA 3D6IA 4WBJA 1EEJA 4PX1A 2PU9C 3TKSA 3TRQA 4GSNA 1V2AA 5CP1A 4IP1A 3IAM2 2C3QA 2A4VA 2VCQA 1AUCA 3VWVA 2WULA 1OKTA 2LQQA 5DAKB 4YAPA 4JBBA 2B5YA 2V41A 1EWXA 2JZTA 4O92A 2X99A 2R6KA 5A4VA 5FWGA 1RK4A 5DCHA 1TRUA 1DBYA 2YV7A 3DIEA 1YF0A 2JL4A 3A5WA 2DMLA 3L9SA 5IO2A 4EXJA 2VAFA 3EMXA 5H5SA 2PN8A 1HNCA 5HFKA 1YZXA 2DJ3A 4QL9A 2CAQA 3U6VA 3LEFA 13GSA 2XBQA 3A2WA 3GKNA 2L5LA 2YP6A 1LU4A 2DJJA 4K8MA 1X0RA 3FHKA 2C8UA 5COHA 3KP9A 3TJBA 1BAYA 5DDLA 5IMDA 19GSA 1FG4A 2MMAA 2YPMA 3S9FA 4KB3A 4MK3A 4JR6A 1M0UA 1TTZA 1B4PA 4PNGA 3ZITA 5J4UA 1TRWA 3TJFA 3I6AA 2TRCP 5F05A 3VWWA 2P5RA 5LD0A 1S3CA 2CZ3A 2O85A 1NSWA 1T7PB 3CSJA 3KIJA 3LQ7A 1E2YA 2VUPA 4JU5A 2GTUA 1GSQA 4RI7A 2R2JA 1F3AA 2VLUA 1VF2A 4GQFA 2X8CA 2EIRA 2O8VB 2XHFA 1PX6A 4OFTA 5HR3A 1UA5A 2L4CA 1WRYA 3TKPA 4GXZA 2QC7A 1EZKA 5CREA 3ZVJD 2H1DA 1ZYEA 3SBCA 3DRNA 2MZCA 2ES7A 2ZCTA 2IL3A 2CZ2A 4LL4B 4XHMA 4ULXA 2C3NA 1H75A 3GFKA 1G7EA 3FKFA 4EKZA 2O89A 1EGOA 3P7XA 3D0ZA 1TP9A 4KDXA 3QR6A 2CQ9A 1GSUA 5C04A 2ALBA 3KD0A 1WWJA 18GSA 4KA0A 3LXTA 3KCMA 1PL1A 4EVMA 4L8EA 1YKAA 5JWQB 3GH9A 2B3SA 3QFAC 4F2IA 1ERTA 1Q4JA 2GSSA 1FVJA 3ZMKA 1A8LA 4WR5A 2C0GA 2DLXA 4IJIA 4N30A 5JCGA 4O32A 4ZILA 3J7Yk 2G0FA 2X64A 3IK9A 2LRCA 4X1UA 4K6XA 3CMIA 1FO5A 3TJJA 2VLTA 1K0CA 1AQXA 4EE0A 2V32A 1TJDA 1OVNA 2VL2A 1OE7A 1E6BA 1M2DA 4BA7A 2QSIA 5J5NA 5G1KA 5DCGA 4MZCA 2R3XA 1TKDB 2B7KA 2CX4A 2YNXA 3VWUA 2LTKA 3TKQA 5A5KA 1GSSA 2A2RA 3Q6OA 4POMA 1XFLA 1OC3A 1QK8A 4KSOA 2HI7A 2VL9A 1FAAA 1GULA 1ERUA 3MNGA 4WKWA 1XCCA 10GSA 2DSAA 2ZNMA 3UBKA 4ZB6A 3TKRA 1O8WA 1PSQA 2VCVA 2H01A 4PUFC 4PURA 3VLNA 4TN8A 2YZUA 3V1WA 4BVXA 4X0XA 2VD1A 4JZQA 1PRXA 1XWAA 2IMDA 1UN2A 2C0EA 1B9YC 1GSFA 5A4UA 3EU4A 5AGYA 5KN3A 3UJ1A 5CRWA 3C73A 1O85A 4TW5A 12GSA 4V2MA 4ECBA 3RPNA 5G5EA 3M9KA 3PGTA 3GMFA 5HR1A 3GTUA 1DE1A 2LNTA 1FOVA 1SL2B 5B6NA 2RLIA 5EL8A 5H5RA 4CHSA 2J23A 3M3MA 1EV9A 2IWTA 1Y6EA 3VURA 2VLVA 3A3TA 4CW9A 3L0HA 2YWIA 4XTSA 1OC9B 4TR1B 1Z7RA 2CT6A 4ZIJA 2AJQB 1PN9A 4LMVA 2OA7A 2K6VA 2LQOA 2M80A 3APOA 4HQZA 2E2GA 3KMNA 5JWRB 3VI5A 4N11A 2BTOT 2WZ9A 4IKHA 2H6XA 1DUGA 1YKCA 4IS0A 4MJBA 4PUAA 3HKRA 5ECPB 1KBNA 1VF3A 2DC5A 2MMOA 1A0RP 2F51A 2G2QA 3C1RA 1JHBA 2ON7A 2LRTA 2D2ZA 1ABAA 2LNSA 4EDZA 3TKSC 4EO3A 2H6YA 2C3TA 3ERGA 2H1AA 1T4YA 4MMMA 2FA8A 1ZMAA 1YEPA 5AIXA 1SJZA 4IQAA 1GUHA 4HQSA 1VRSD 1SJIA 3L9UA 4ZBBA 2JSYA 6GSTA 2JZRA 3HVVA 4POKA 3FEUA 3KTBA 4PQHA 1SK1A 1Z9HA 5F0GA 3M0FA 2WS2A 4MJCA 2KP1A 4GSTA 2FHEA 1J0FA 3QAVA 5EY6A 3KGKA 2DIZA 3VFIA 3ED3A 1M9BA 1HYUA 1TI1A 1OKDA 2GQKA 5HQPA 1TW9A 3LSZA 2F8FA 4I6XA 1SKSB 2L6CA 2P31A 1X5EA 3FZ9A 1SL1B 3ME7A 4IN0A 3KH9A 4BWQA 2F3MA 2FD3A 4IJ3A 4D73B 4KE3A 1BG5A 2H74A 4IHUA 1WP0A 4XIHA 3Q18A 2YWOA 2AHEA 4V2NA 3D21A 5GZZB 2CVDA 5FT3A 3GSSA 2FGXA 3ERFA 4KW6A 2KHPA 2PPTA 4F03A 4K7NA 1OYJA 3LGCA 4TR0A 2I3YA 1F6MC 4I2TA 4YQUA 4CDOA 17GSA 1WIKA 2WFCA 1EEMA 1A0FA 4MPFA 3TUEA 1GNWA 1ILOA 4I97A 4N10A 1ERWA 1K0AA 2XC2A 4XCSA 5DJMA 3HHVA 3GA4A 4KDUA 1EV4A 1GH2A 8GSSA 1X5CA 1ST9A 4L5OA 5ID2B 2YV9A 2JACA 2YWMA 2LJAA 1MDKA 1PA3A 5ECRB 2AB6A 4TRXA 4GF0A 5KN1A 1GWCA 1B9XC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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