4WEYA

Crystal structure of e.coli dsba in complex with compound 17
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Application of Fragment-Based Screening to the Design of Inhibitors of Escherichia coli DsbA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
total genus 67
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2014-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4weyA00
4IKHA 5CAXA 2L59A 3ZREA 2H19A 3I69A 2VD1A 1YKCA 4KX4A 2I3YA 1EWXA 4J56E 5COHA 1XWBA 4POLA 1E2YA 4HZ4A 1PN9A 1K0OA 2AUVA 1XOAA 2PBJA 2PN8A 4KH7A 20GSA 1XBSA 1XWKA 2VCXA 1QGVA 2IMIA 2CZ3A 1KTEA 2VL3A 4MJCA 1GH2A 4PQIA 1F3BA 4RI7A 5A4UA 3TRPA 2PVQA 3W6GA 1CQHA 4K9ZA 2AHEA 1TU7A 5FWGA 3G7YA 4XRDA 3APOA 4EL1A 2G2QA 4IVFA 1Z7RA 6GSWA 2FGXA 3KXOA 2ON7A 1HNCA 1OAZA 2FA4A 4K7OA 2H72A 4GTUA 2OBIA 4L0WA 4I8BA 4YQUA 5B7CA 4KDUA 4XS1A 2V1MA 4TXOA 4KDXA 1G7EA 1F2EA 5F05A 5CP1A 4P3YB 2MBTA 2CX4A 3ZTLA 1T1VA 4MP4A 1BG5A 4TKYA 1SJIA 5C00A 2JZSA 2H1DA 2C4JA 2YV9A 3GH6A 1TJDA 3US3A 1WMJA 1FO5A 3FK8A 3VPTA 1VF4A 2VCTA 1GSFA 1VF3A 1QMVA 1SYXA 3D4TA 1GSUA 1SK1A 2AV4A 1FAAA 4PUFC 3U6VA 3E9JB 3HVVA 1CQGA 3BOAA 3D5JA 2CA8A 2E7PA 1OC3A 4XCSA 1I9DA 2XPDA 5IMAA 3H79A 1Z3EA 4MJAA 1OE8A 3BD2A 5IMVA 5JWQB 4NV5A 1HNAA 4IHUA 4E8EA 2FWEA 2QKEA 3IHQA 3TCOA 5LNKe 3U5RE 3DEXA 2R5GA 1HD2A 3CSIA 1AC1A 5C04A 2H70A 5ELGA 4OFMA 4PQHA 3C71A 1HNBA 3IK7A 4G9HA 3FYGA 1OC9A 1XPVA 1EOGA 1A2MA 3KM6A 2H1GA 1XWGA 2IFQA 3GTUB 1GP1A 3J7Yb 4ZB6A 3EMXA 1GUKA 5D96A 1T4YA 10GSA 2A4VA 2LV3A 4NAXA 5AISA 2L57A 3F4SA 4HJ2A 1ZYQB 5DQSA 1A0FA 2VAFA 4BVYA 1BQ7A 3Q19A 1C72A 2MMZA 4O5RA 1A2JA 5JWRB 2AAWA 1B9YC 2JSZA 3D4MA 3NIVA 3ZRDA 3KMNA 5CO3A 4DSSA 3EURA 4F9ZA 2ZCTA 3AY8A 1OC9B 5HR2A 3ERFA 4CDOA 1UA5A 3IDVA 3A3TA 1B9XC 1Z7PA 3TB2A 1ERVA 2IFQB 5ECOB 3GIXA 2DMLA 1JFUA 4ECCA 2LTKA 4KUNA 5CRGA 3CYNA 5ENUA 2K8SA 5HQPA 3P8WA 2C3NA 3TKQA 1S3DA 16GSA 4HDEA 2WGRA 1K0BA 1AQVA 4KAEA 1XVQA 4IELA 1SU9A 4MH2A 4WR4A 2H8LA 4KSOA 1W4VA 3TJBA 1NHYA 1WRYA 1U6TA 2VUPA 4KNDA 1M9AA 3IOSA 1TRSA 3GA4A 2AYTA 2VCVA 4ZXGA 4JZQA 4XS4A 2M72A 4O92A 2FA8A 2XPEA 3F4RA 2HZFA 2GZPA 2RUEA 4JU5A 5HR3A 4K1FA 2VOCA 5EL8A 4DSSB 2K18A 2LNSA 4WR5A 4YAVA 3QFBC 2IWTA 1J08A 4OFTA 1DE1A 4HQSA 1WOUA 4JBBA 4TR3A 2H71A 3SWLA 1WPIA 4PQ1A 2X64A 4GSSA 2B7JA 1V2AA 4DEJA 3RDWA 3DVXA 4XRAA 1M2AA 2REMA 5H5SA 3D22A 3G7JA 1J0FA 3DYRA 1SD9A 1SKSB 3QAVA 1BJXA 3M1GA 4L5LA 3DIEA 1T00A 2MMOA 4HI7A 1UVZA 1SKRB 3I6AA 3ZZXA 1T7PB 4JEDA 1TP9A 4XS4B 3O76A 3UEMA 3FW2A 4IQ1A 4KW6A 3QFAC 2KOKA 1J9BA 3CTFA 4AJ6A 3QAGA 3QMXA 2YOIA 2XBIA 3KGKA 1V9WA 1TU8A 2H74A 5D8IA 5HR0A 2GQLA 2LQQA 5H5RA 4EVMA 1O85A 2EIRA 1HYUA 5IO0A 1AQXA 3TKPA 3KD0A 4KB3A 1KNGA 4V2MA 3DWVA 2XC2A 1GUHA 1GTIA 4IJ3A 3I9V2 4I2UA 2MZCA 4EF0A 3GL3A 2KUCA 1K3OA 1S3AA 2BTOT 5AIXA 1T3BA 2GZZA 4IP6A 3GSTA 2RUFA 2K8VA 3EWLA 5ID2A 1OVNA 3ZMLA 2I4AA 1EGOA 3ZL5A 1ZMAA 4ECBA 3C73A 2JSYA 1X5CA 1G6YA 4GWRA 2OE0A 3VI5A 4ML1A 5CYYA 2GVPA 1U3AA 1EOHA 1OC8A 3Q74A 4EUYA 4GQFA 1O73A 1AW9A 4O32A 4BL7A 3DMLA 1PKZA 3HDCA 3M0FA 6GSSA 4K0GA 2EIQA 4Q5NA 5KN0A 2ZUPA 1MDKA 2H6YA 2RIIA 1R4WA 3TRQA 4TN8A 2E2MA 2X8CA 2A2RA 1YZXA 3KP8A 1H75A 2HLSA 4G2EA 2F9SA 2IMEA 2DJ3A 2WB9A 3DGQA 5ID2B 2B1KA 2VL2C 4X1UA 3WGEA 2PGTA 2GS3A 2ES7A 1SYRA 4EXJA 1BAYA 2K6VA 3QPMA 3A2VA 4F2IA 1DSBA 1A8YA 1GSDA 1XWAA 3W8JA 4EO3A 4I2TA 5G31A 1GWCA 4JR6A 3QAWA 1K0NA 2BMXA 3TJGA 4MF6A 3HA9A 3FZAA 2NTOA 5EY6A 3WYWA 2VLUA 3F8UA 4IS0A 5L71A 2VO4A 1IYHA 2MMNA 2B5YA 2B6MA 4BA7A 5A5KA 1U87A 3KMOA 3TGZA 5G1KA 1V58A 1LJRA 5D9TA 4GCIA 3CRUA 3VI7A 3BCIA 5CRDA 1TKDB 3ZMKA 3EINA 8GSSA 4IGJA 5D9WA 17GSA 3KTBA 2P5QA 2RM6A 3GSSA 3F9UA 5AGYA 4ZL9A 2DMMA 2MYGA 3TKSE 4MA9A 4MPFA 4JE1A 1MD3A 4KE3A 2GT6A 3H8QA 4IQAA 2LRNA 1K0AA 3UVTA 2NBSA 4HOJA 3FY7A 4K2DA 4IBPA 4MZCA 2NVLA 2YP6A 3KIJA 3DVWA 1EP7A 2I9HA 3FRCA 4HJMA 4F82A 2WRTA 3MDKA 5HFGA 2IMKA 2CQ9A 5ECSA 5IIZA 2YNXA 3KH9A 3MSZA 2GSSA 2CVBA 1YEXA 3P2AA 1A2LA 1PA3A 1QXHA 5A4WA 3GKNA 5ECLB 3KTLA 4ZB9A 3TKSA 3LQ7A 3O6TA 4Z7XA 2V41A 2LNTA 3BJ5A 3GURA 2HYXA 3ZIVA 4WF5A 3M9KA 2GSRA 3TKSC 4J2FA 1GNWA 4PUAA 3RPNA 2HZEB 4N0ZA 1U3IA 3VLNA 4H86A 1GSQA 2AB6A 2DLXA 4LLRA 3ZLPA 5B8AA 3FZ9A 2PUKC 2DIYA 1SL1B 3VWXA 3GTUA 1AXDA 2DSAA 2L6DA 1MTCA 2ALBA 2I1UA 5AN1A 1EGRA 1BYEA 1ABAA 1SK2A 3GV1A 5D73A 3G7IA 5IMCA 4HZ2A 2GLRA 2PERA 2VCQA 2WZ9A 3E3EA 1ZZYA 5DVBA 1QK8A 5J3RA 1A8LA 1SL2B 3HZ8A 4TXVA 1T8EB 5B6MA 3JCML 1M9BA 5DQYA 4G10A 4GSNA 1RK4A 3A2WA 1O81A 6GSVA 1WJKA 3UAPA 1TRWA 1V40A 2VL9A 5G2ZA 3IK9A 1R7HA 1TDIA 2TRCP 3EC3A 3GH9A 1GSYA 4L8EA 2N5BA 3W8SA 2A2SA 1MEKA 3VWVA 2YWNA 3QOUA 3F63A 4QL9A 1JLVA 1JLWA 4XHMA 1GSSA 2EC4A 1OYJA 3GKXA 3UL3A 1K3LA 3UJ1A 1R26A 1A0RP 3F4TA 2H0HA 5CRHA 2L6CA 2X99A 3IRAA 3F6FA 3IE3A 3IR4A 4ML6A 1G7OA 2HXKA 4K0NA 2J23A 3S9FA 4XTSA 1PX7A 2WCIA 4N30A 3TRXA 9GSSA 1TW9A 4AF2A 1M0UA 2GQMA 5F07A 2CVKA 4K8MA 1GLPA 2P31A 3ZFBA 3VWWA 5D93A 4PGTA 2ZNMA 1O6JA 1A23A 4MJEA 5DCHA 4NV2A 2DJ2A 3QCPA 5E59A 2P0GA 5CRWA 3TUEA 3IA1A 2OA7A 12GSA 3CXGA 3CRTA 3CSJA 4ECJA 5F8BA 1PRXA 2B5EA 5ECNB 3GYKA 4WBJA 3C8EA 4NMUA 2FHEA 2PPTA 1M2DA 2LEGA 2HRNA 2WS2A 1MDJA 3LWAA 3ME8A 3DRNA 4ISDA 4ZIJA 1X9SB 1O8WA 4GXZA 1GSEA 1ZGNA 3KCMA 2LJKA 1FVJA 2FY6A 4Q5FA 5J41A 5ECPB 4TR1B 2YWIA 2RM5A 3PGTA 1DUGA 2E0QA 1X9WB 5GSSA 4EDZA 2WDUA 4KA0A 1WE0A 1XW6A 5CNWA 3KJYA 5DJLA 3L9VA 1AAZA 3GFKA 2HFDA 3RHBA 3CSHA 3APSA 3APQA 2DC5A 2H30A 2KHPA 3RBTA 3J7Yk 1VF1A 2VD0A 5DALA 3TKRA 1NHOA 1YF0A 1O8XA 2N5FA 1Z6MA 2VM2A 2MBSA 1B4QA 2H01A 3RHCA 3ZYWA 3O3TA 1TRUA 3ZVJD 1FB6A 2YCDA 5KEJA 1PX6A 3C1RA 4ZBBA 3FZ4A 1B4PA 2R6KA 2H6ZA 1LBKA 3IV4A 3IAM2 2M46A 1YKAA 3GN3A 1R5AA 3CMIA 5D9XA 1AIUA 2E2GA 2MMAA 2IPAA 5FHIA 3Q6OA 1VRSD 5E4WA 4ZB8A 3NOFA 3EVIA 4BPYA 4X43A 3UARA 4PX1A 5F06A 2LQOA 5KN1A 3I43A 4MDCA 2IJYA 2B3SA 1GLQA 4I97A 2JACA 5DALB 1XOBA 4MF7A 1ZOFA 2F8AA 5HFIA 3H93A 4LL1B 1YQ1A 2LJRA 4L0UA 14GSA 3UMAA 5IOWA 4I5QA 2O87A 4N0VA 2YZUA 3LG6A 3ME7A 3ERGA 3GNJA 4OWYA 2FUG2 3HVXA 3L9UA 4MJBA 4TR4A 5IO2A 1M7TA 4ZL7A 1A24A 3PH9A 1THOA 2P5RA 2VLVA 3L0HA 4AGSA 1B48A 5D9VA 2H6XA 4HU7A 3UIWA 4BVXA 2YANA 1QUWA 4MZWA 5EPFA 2TIRA 1XW9A 2C0GA 1X5DA 4MLYA 3UOMA 11GSA 3HHVA 4N10A 1W89A 2OJLA 4PURA 3GL5A 4LMVA 3ZIJA 5EVOA 2C3QA 1SKWB 3TOTA 4V1Ag 3EU3A 1N8JA 3NZNA 2BJXA 3GX8A 3DKSA 1LU4A 4O7HA 4GF0A 5F0GA 3WGXA 1R5PA 4WEYA 3QD9A 4WXTA 1XIYA 3E0UA 1Y6EA 5LD0A 4MK3A 4MABA 1YJ6A 1FG4A 1K3YA 2V2GA 1KEBA 2L5LA 3C7MA 4DSQA 2YPMA 19GSA 3M9JA 1X5EA 1YY7A 3FR6A 1XCCA 1JZOA 5IMFA 2TRXA 5IOXA 2HNLA 3VWUA 2L4CA 2DJ1A 4K7NA 1V98A 5G30A 1BEDA 2O89A 4V2LA 2C3TA 3TDGA 2PVOC 1V57A 4HU9A 5ECRB 1ML6A 5DAKA 2XHFA 1ACVA 1EEMA 4DVCA 4EDYA 2YJHA 4ID0A 4PXOA 4HS1A 3HY2A 1JZWA 2LJAA 2CV4A 3D0ZA 4FO5A 4FYBA 4G19A 5FT3A 4BWQA 5IPGA 1TK0B 3TJKA 4D73B 13GSA 3ZVJA 2B7KA 2CX3A 1ERTA 5AIVA 5HFKA 3RAZA 1ZYEA 1H4OA 3MAKA 5J9CA 3P90A 4FYCA 2R37A 2D2ZA 1XZOA 2HZEA 4TW5A 4TVEA 1YF1A 1F9MA 2GGTA 2FWHA 4MF5A 3EYTA 3LYKA 4QL7A 1FW1A 3CTGA 4HQZA 3WGDA 1SENA 1TI3A 5DAKB 3ED3A 2IMDA 2FWGA 1PMTA 4YH2A 3BBYA 4PNGA 3EMPA 4NWYA 1JZDA 2WJUA 2C1YA 2JL4A 2IMFA 1WP0A 3ZFLA 3VFIA 2OBKA 1FHEA 3LXZA 5INYA 1WWJA 3GKKA 4XIHA 3G9BA 4IN0A 2GT5A 4DSRA 3FZ5A 4ACSA 2LS5A 1KBNA 4Q5QA 4GQCA 5GAND 1O7UA 3D6IA 1YEPA 4OCFA 2CZ2A 4V1Ap 3M8NA 4AJ7A 4FIWA 4N11A 5GSTA 4F0CA 4PNFA 5J4UA 3F3RA 1U88A 3DXBA 1B8XA 5JCWA 1K0DA 5ABRA 2H75A 5KN2A 2JU5A 4MMMA 1WIKA 2H73A 1OKDA 3MWHA 2OKAA 1K0MA 1BX9A 1GULA 1Q98A 1TK8B 1JHBA 2VCZA 1M99A 3L9SA 1PL2A 3OR5A 4ZL8A 5JCGA 3DD3A 1XVWA 1SD8A 2H1BA 2AJQB 2PU9C 3KP9A 2HRFA 3IBHA 4E8HA 2LSTA 2NDOA 1HQOA 3FR3A 2OE3A 1VF2A 1F3AA 3GUSA 2OE1A 5IM9A 3LGCA 2FD3A 3IXRA 5ECKB 3HJOA 2WULA 1I5GA 2FLSA 1Y25A 2IIYA 22GSA 4EC0A 4WETA 4TXOB 1XFLA 2QGVA 1PL1A 3QR6A 2V6OA 4ULXA 5ECMB 2F51A 4V2NA 2YZHA 6GSXA 5LCZA 2PMTA 4NHWA 1ST9A 5A4VA 4GSTA 4WF4A 2C0DA 5HR1A 1VGLA 4LA1A 1URMA 5DBQA 4ZBDA 3LEFA 4RI6A 5G1LA 1DE2A 2HE3A 3HJMA 1G0TA 3UBLA 1NSWA 4KSMA 3LFLA 3PR8A 3A2XA 4X0XA 2K9FA 2O85A 4TOPA 5IMZA 2IN3A 4TR1A 2CAIA 5CREA 1RQMA 1Z5YE 3QDNA 1IYIA 2GSQA 1UN2A 3IAS2 3FHKA 2XBQA 2H1AA 1SJZA 2FNOA 3A5WA 2KP2A 4I6XA 4OO5A 4WBRD 2DBCA 2O8VB 2J9HA 5J9BA 1EV9A 1GL8A 3HD5A 3R2QA 2GDRA 4POKA 1NM3A 2LRTA 2L4QA 3MNGA 6GSYA 2JADA 5J5NA 1MDIA 2HSHA 1E6BA 1TTZA 4KGIA 1QQ2A 2DJKA 4TR0A 4L5OA 1PGTA 4JR4A 3RPPA 1AUCA 2CVDA 3KEBA 2HI7A 1S3CA 4KDYA 2YJ7A 2CT6A 1K0CA 4YAPA 7GSSA 4MPGA 2GSTA 4RQXA 4CW9A 2JZRA 1EV4A 2C80A 3VURA 2OADA 2RLIA 1GUMA 6GSTA 5IPHA 4J57E 1XW5A 5DDLA 2C0FA 4OD7A 1FOVA 2GTUA 1FVKA 3CBUA 3HZ4A 3F6DA 2H66A 3L4NA 1Q4JA 5JCUA 3TOUA 2DJJA 5ELAA 1TOFA 4NHZA 4EE0A 3C1SA 5GAPD 4K7IA 5G5FA 4EKZA 2HSYA 2VCWA 2YN1A 1JZRA 5DJMA 5B8BA 5KN3A 4TRXA 1F37A 4YQVA 3SBCA 2GZYA 5ECHB 4GRFA 1X9MB 2F8FA 3HCZA 4KCEA 4OMVA 2JZTA 1ON4A 4GLTA 2R3XA 4YQMA 1GTBA 3LJRA 2GQKA 2VLTA 4MH3A 4ILFA 4CHSA 6GSUA 2B5XA 2LKUA 3GX0A 1GNEA 2M80A 4ZILA 3TJJA 2LRCA 4ECIA 3HKRA 3H1NA 4WKWA 3IC4A 3VK9A 4IJIA 3TJFA 3HJPA 1GTUA 2R4VA 3KH7A 1TXXA 3ZITA 1N2AA 2L5OA 2WFCA 1XWCA 3FKFA 4MZBA 2Z9SA 2H0IA 2YWOA 5H5QA 2VM1A 1M2BA 1PSQA 1YDKA 3M3MA 5JWOB 3F3QA 4RUVA 1SK0A 3EE2A 1PKWA 1Z9HA 2F3MA 5ECIB 2N5AA 4FYUA 4IP1A 3H4KA 1UC7A 4LL4B 1TK5B 1FB0A 3HXSA 3HYPA 2QC7A 4POMA 4OCEA 2O7KA 4ZBAA 2X8GA 3EU4A 1PD21 2QSIA 4RQRA 2EIOA 3ISOA 1GTAA 2V6KA 3PINA 1OKTA 4LMWA 5DCGA 3V1WA 5B6NA 2B1LA 3LYPA 4F03A 1TRVA 1X0RA 3F0IA 18GSA 2FCHA 5G5EA 2C8UA 2FWFA 3UVHA 2C0EA 1GRXA 4BWSA 1ERWA 3GKMA 1SL0B 4XS6A 1EP8A 2V32A 1EZKA 4HUAA 1DBYA 1T4ZA 2NPBA 4NPBA 2ON5A 1NW2A 4D73A 3UBKA 1RW1A 4F0BA 3ERWA 1MD4A 2DIZA 4MCUA 4HEA2 1AQWA 2YV7A 1SJ6A 3IPZA 4K6XA 1TI1A 2PWJA 4JRRA 3FEUA 3L78A 4NXIA 3D21A 4OFNA 3LXTA 3N9JA 4IW9A 1OE7A 1XXUA 3N5OA 1PQNA 2R2JA 3GMFA 1QFNA 2VL2A 2KP1A 2DJ0A 2X8HA 2I81A 1ILOA 4FH8A 3GHAA 4POBA 2YWMA 2OACA 3HVSA 1ZL9A 5GZZB 1THXA 1F6MC 3Q18A 3FR9A 3WT2A 3WT1A 2HT9A 1EEJA 5IQYA 4QQ7A 3P7XA 5ECQB 2IL3A 4AJ8A 3K8NA 3GRXA 1Z6NA 3BCKA 2KLXA 3KZQA 3LSZA 4OO4A 1ERUA 2G0FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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