4WLXA

High pressure protein crystallography of hen egg white lysozyme at 280 mpa
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title High-pressure protein crystallography of hen egg-white lysozyme
pubmed doi rcsb
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4wlxA00
1B7MA 1JKBA 2MEAA 1QQYA 1J1OY 1NDGC 4HTKA 4A7DA 3TXBA 3F6ZA 1GF3A 4H9EA 5FHWA 1A4VA 1TBYA 2W1MA 4DD3A 3WL2A 4DD0A 2DQIY 2RSCA 2LYMA 1BB5A 3A67Y 1UIHA 4H91A 1IOTA 1YILA 1GXXA 4ETEA 4CGEA 3AB6A 1HFYA 2WARA 2DQFC 4I8SA 5I4WA 1C46A 5KXXA 1QUSA 1G7LC 2MEBA 4G4BA 1GAYA 2XJWA 3CB7A 4XN6A 4CJ2A 5F9XA 3EBAB 1EQ4A 4OWHA 5JENB 4LYOA 4ANRA 4KXIA 4NHPA 3LYMA 4XADA 2HEAA 2I25L 1E8LA 1JKCA 4H90A 3A6BY 1UIEA 1YAOA 4LT1A 4B0DA 1LZ9A 4GN3A 1GE1A 2CWIA 3CT5A 4LT2A 1UC0A 4NG8A 4RW2A 1OQMA 2CJLA 1LMOA 4PRQA 4H8XA 1ZVYB 4ETDA 1IORA 1LMTA 2YBJA 4GLAA 4GLVA 5C6IA 2XBSA 4WG7A 1GB7A 1JWRA 3A93A 4NWHA 1DI5A 1LZEA 1A2YC 2HUBA 4DDCA 1GFEA 4NSHA 1IWTA 3A6CY 1JJ3A 1AKIA 4H94A 5LVJA 5M1YA 4HP0A 2DQHY 1FLQA 3P66A 1AM7A 4NSGA 1B7NA 4WLXA 5KXRA 4ETCA 1LSAA 1N4FA 3TXIA 3CT0A 1B5XA 4NGKA 1UUZC 1IC4Y 5F9UA 5C6LA 1INUA 1LHIA 5FDJA 3W6DA 4NEBA 1GXV2 3MGWA 2ZYCA 1IR7A 4DD7A 2Q0MX 4N9RA 5F81A 5KKJA 4H92A 3WUMA 3P4ZA 4LGKA 1ZV5L 2BQGA 2Z38A 2N5ZA 4Z41A 4NFVA 5B07A 4XJIA 2H5ZA 1LYZA 4GN4A 5LIOA 1HMLA 3T36A 4GCDA 1REZA 1B5ZA 3A94A 1QDTA 4HJZA 3TXKA 1MELL 3AGGG 5KXNA 4QGZA 4M6DA 4W96A 1JEFA 3B0IA 1GF0A 1VEDA 4HPIA 1YKZX 4MCKA 1ZMYL 3W6EA 1XFPL 3WPKA 5LA5A 3GXRA 2Z18A 3AGIA 4NHTA 5LINA 1OUDA 1HSWA 2ZQ4A 4WO9A 5AMYA 4UWVA 2H9JA 1RCMA 2DKVA 4QEQA 4NGJA 2Z2FA 1GFGA 2D4JA 1IX0A 3TXFA 1GE3A 2Z12A 2A7DA 3A96A 4ETAA 1LMNA 1XEJA 4OWCA 1T3PA 1IWVA 1HC0A 3OJPA 1LKRA 4XJHA 1OUJA 1JKDA 4DDBA 2BPUA 4NGWA 1LCNA 1LSPA 154LA 4B1AA 153LA 1LJGA 1JITA 1JTTL 1IOSA 5HLLA 1LZ4A 4H9FA 4WLDA 5HNLA 1LZYA 1IP7A 1YAQA 2I6ZA 3AZ6A 4BAPA 1HERA 1GE4A 1DPXA 1KIPC 4NGOA 3WVXA 2EIZC 4RW1A 2CDSA 3A3RX 2W1LA 3HBDA 2YBHA 2EKSC 1IWWA 1LZDA 2YBLA 1BWHA 1GFUA 3W6FA 2YBMA 1LJIA 1GF5A 1GFHA 2A7FA 2F4AA 3AYQA 3LYZA 4B4JA 1EQEA 2EQLA 1F6RA 6LYTA 1LZ5A 1HEPA 1JIYA 1HMKA 2DQAA 4GCEA 1B7QA 4TWSA 3WUNA 2BQBA 1REXA 1OUBA 1FDLY 4H9BA 5F16A 3J4GA 1LSEA 1VDSA 3ZVQA 4J1BA 1GFAA 5B1FA 1LHKA 1CJ9A 1QDRA 1LJ3A 1VAUA 4NIJA 4PGJB 4YENA 2BQDA 2DQCY 4NG1A 5DM9A 1CJ8A 1QTEA 5F14A 3ZVQB 3LN2A 1LYSA 1HNLA 1REMA 3W6AA 5I4YA 2D6BA 1NWGA 1TAYA 5C6JA 1UCOA 1IC5Y 2BQJA 4J7VA 4WLYA 4HTQA 5FELA 3RZ4A 3EXDA 1B7SA 5I4XA 1UACY 1AZFA 1GE0A 4WM5A 4NGYA 2EPEA 1GFTA 3TXEA 1LJJA 1JHLA 2MEHA 3W6BA 1LSZA 4IJ4A 3WU7A 1YKXX 1W08A 4N1CC 1LZ1A 2AUBA 5B05A 1B7LA 5FEKA 4WG1A 1JPOA 1UIBA 5KXSA 4XJDA 4CFPA 1LMQA 4MR1A 3FI7A 2YSSC 4R0FA 1GF9A 1C7PA 1YAMA 2W1YA 1OUGA 4EMNA 1CKCA 1AT5A 1UIFA 1B7PA 3LYOA 1IIZA 1GHLA 1LYYA 4OOOA 3WW6A 1IP5A 5II3A 1LAAA 5EBHA 3TMXA 1NKHA 1GB6A 3WVYA 2HEBA 3WPLA 4DD9A 2BQAA 5IELA 3W6CA 4HJVA 4WM4A 1CJ6A 1G7IC 4IATA 4YEOA 3G3BB 1KXWA 2W1XA 4WM2A 1GBSA 3E3DA 4YF2A 4NHIA 5LYTA 4LT3A 1OUCA 1BB6A 3LZTA 4FDYA 4WM1A 5LXWA 1WQQA 1LZCA 1YL1X 1YL0X 1WTNA 1LZTA 1GBYA 3TXHA 5KKIA 4DWXA 1FKQA 3N9EA 1KXXA 2HU3A 1JKAA 1V7SA 4HTNA 3RU5A 1GD6A 5L3IA 1LSDA 1LZ8A 2C8PA 2DQGY 3B0OA 5HNCA 1B5YA 2ZILA 1IP4A 1JUGA 1IY4A 1O23A 2BLXA 5KXZA 1WVUA 5ILCA 4WL6A 1LJNA 4XJGA 4I0CA 3W3EA 2MEEA 1GEVA 3WMKA 1XGRC 1GB0A 2B5ZA 5KXKA 5KXOA 2YBNA 1RJCB 1DXJA 1H6MA 1H87A 1QSAA 1G7JC 1LMAA 4ML7A 1VDPA 1GAZA 4QY9A 5I53A 5LVHA 1LMCA 2DBTA 1LZRA 5KXTA 1LZGA 2YBIA 4TX7A 1GBXA 1JTPL 1CJ7A 3BKVA 3D3DA 3OK0A 1LJEA 4NHQA 134LA 4J1AA 4O34A 1BWJA 1LSYA 2FBBA 4H9HA 4LYBA 4LYTA 4GCFA 4NWEA 4XJBA 8LYZA 4HPEA 4P2EA 1GFKA 4CHXA 4C3WA 5IHGA 1REYA 1NQIA 5KJ9A 4N5RA 1GF6A 1HSXA 1SQ2L 4KL7A 4LYCA 3TMVA 4DD2A 1F10A 1UIGA 5B06A 1LHMA 7LYZA 4TSCA 1IR9A 1LOZA 1YIKA 4L41A 5HQ1A 1D6QA 2HEDA 4YOPA 4TTDA 4IASA 1GB2A 1D0KA 3WW5A 5DLAA 3B6LA 1YKYX 5KXYA 3EMSA 3M18B 4G9SA 1FLYA 4TSBA 2D91A 1ZVHL 2ZNWY 1Z55A 1HENA 4PHIA 1WQOA 1GB3A 1XGQC 1SLYA 2F30A 1IC7Y 1IWYA 2BAAA 2HEEA 2IFFY 3KAMA 4RDSA 4DT3A 1C08C 1XGTC 2HTXA 1NBZC 1TCYA 4H8YA 4RLMA 1I20A 1LTMA 2DQEY 1OUIA 3P68A 4LT0A 1CKHA 1GPQC 1TEWA 2LZTA 5APCA 3RT5X 1V7TA 2YVBA 1BGIA 1BB7A 1OUAA 3HFMY 4LFXA 4NGVA 2Y8PA 3WPJA 4U3XB 208LA 1LKSA 3A91A 5FSTA 4RLNA 5E9RA 3TXDA 2NWDX 3BKHA 3TXGA 3WH1A 4Z98A 2XTHA 3AW6A 3N9AA 193LA 1YAPA 4MSTA 4OW1A 1GWDA 4OWEA 2LYOA 3VWOA 3A3QA 1HEWA 3TMUA 1NBYC 3HBHA 1WQNA 1WVVA 2ZIJA 3P65A 4ET8A 5KXLA 1B5WA 1GF8A 1WQRA 1XGPC 2ZWBA 1ALCA 4B49A 1B9OA 4PPOA 5LAFA 2MEFA 1T6VL 2BQEA 5LYZA 5HMVA 1B5UA 4W94A 2G4PA 2ZQ3A 1VFBC 5D5CA 1B2KA 1F0WA 1FKVA 1LZNA 3G3AB 2H9KA 3TMWA 2HECA 4YM8A 4H9CA 2X0AA 1HFZA 1PS5A 4UWUA 2GV0A 2F2NA 1LSNA 3M3UA 4DC4A 1CNSA 1B7RA 3ULRA 4N8ZA 3A90A 1KIRC 1GBZA 4AGAA 1C45A 1AT6A 3ATOA 3QNGA 1DQJC 4H8ZA 4B4IA 4GCCA 5E4PA 3AZ4A 1DI3A 1NDMC 3B0KA 3EO5A 1D0MA 1EQ5A 1LJHA 1IP6A 4NSJA 4XJFA 4EOFA 2LZ2A 4WO6A 3AZ5A 1F6SA 4XYYA 5A3ZA 2BQIA 4WLTA 4WOAA 1BWIA 4OWAA 1BVXA 4ZEEA 2ZNXY 1VDQA 1FLWA 4LZTA 4Z3MA 4H93A 1IVMA 4DD1A 2C8OA 1VDTA 4ET9A 1LSCA 2G4QA 5FCPA 3WU8A 4NSIA 1GDWA 5L3HA 2MEGA 1KXYA 1QIOA 1HFXA 5L9JA 1OUFA 1LJ4A 2F4GA 4N1EI 2VB1A 4BAFA 3CSQA 1DKKA 1NMMA 1IY3A 4H9AA 4NGLA 1IR8A 5LVGA 1CKGA 4LYMA 1LSFA 1OUEA 1D6PA 1CKDA 1LZAA 135LA 3AGHA 5LYMA 1PZYA 1HF4A 1GB5A 3ZEKA 1IEEA 2IHLA 1IWXA 5APEA 1LJKA 1UA6Y 3GXKA 1LSMA 1CKFA 3ATNA 1GFVA 1G7HC 6LYZA 2DQDY 1HHLA 2BQNA 2I26L 1BB4A 1LPIA 1P2CC 2BQKA 3N9CA 1GEZA 1GFJA 4GN5C 5HMJA 1OP9B 2G4NA 4TUNA 5ILFA 4LFPA 2FBDA 3WUAA 5K7OA 4WMGA 5I5QA 5B1GA 4YEMA 4M4OA 4R6CA 1D9UA 3QY4A 1HEOA 2BQMA 1BVKC 2MEIA 3SP3A 1C10A 4J0LA 4E3UA 1YANA 1LMPA 2FYDA 1FBIX 1LSBA 1RE2A 2HU1A 1QUTA 4HJYA 1MLCE 2Z37A 1BQLY 3AJNA 1I56A 3A92A 5LVIA 3RNXA 4D9ZA 4ZIXA 4G4CA 1HELA 1J1XY 3A8ZA 3TXJA 1LZ6A 3IJVA 4OOTA 4C5FA 1I1ZA 1LHHA 3B72A 1IWUA 5B59A 1EL1A 1IP1A 1NHEA 2Z39A 2LYZA 5J7CA 3A34A 1BB3A 4LYZA 1IOQA 2Z19A 2D4KA 4BADA 1JSEA 4XENA 9LYZA 1FLUA 1QTKA 3WU9A 3J6KA 5IDDA 3CSZA 4II8A 3T6UA 4KPMA 4BS7A 1GBOA 1XGUC 2MECA 5APDA 1J1PY 207LA 1IP2A 3LYTA 3A95A 1GB9A 4WL7A 133LA 4N0JA 1W6ZA 3RW8A 1WQMA 3FE0A 1UIAA 3K3TA 5KXPA 1C43A 4ETBA 2D4IA 2BQCA 3LHMA 4PJ2C 2HEFA 2PC2A 2BQFA 1JSFA 4H1PA 4ZFPA 2BLYA 1G7MC 2BQLA 1LJFA 2LHMA 4FJRA 3QE8A 4X3BA 1GBWA 1GFRA 4DDAA 1JJ0A 4WM3A 4HV2A 5LA8A 1RFPA 1JISA 3LZ2A 3AW7A 1B7OA 1B5VA 1LHJA 4QDNA 1FN5A 1DKJA 4NGZA 4HV1A 3D9AC 1BHZA 4KT3A 1IO5A 4NGIA 1GDXA 2ZIKA 1GE2A 1WQPA 1XEKA 4WM6A 1QSWA 3WXUA 1UICA 1YROA 3WYHA 1UIDA 2FYCA 1IWZA 1DI4A 1GF7A 3IJUA 4AXTA 1IP3A 3CT1A 2XBRA 4HSFA 2ZYPA 4OWBA 1NF5A 4UWNA 1LYOA 3P64A 1DPWA 1GF4A 1JTOL 1RI8B 3AZ7A 194LA 5LVKA 5T3FA 5DN4A 3WXTA 4CFOA 3CSRA 5KY1A 5I54A 4PRUA 5APFA 1HEQA 1LZBA 4G49A 5A3EA 1LSGA 4NHSA 5D5FA 1KIQC 1WTMA 1GB8A 1UBZA 4G4HA 1JJ1A 1LZSA 1VATA 2YDGA 1IOCA 1DZBX 3WULA 3IWRA 5KXWA 1LHLA 2BQOA 5DN5A 2MEDA 3CQLA 4H9IA 4DYGA 3HBEX 1D0LA 132LA 1TDYA 2Z2EA 2DQJY 1B0DA 4B4EA 1OUHA 4Z46A 1YQVY 2BQHA 5LAGA 5DL9A 1XEIA 4NY5A 2CGIA 4GCBA 1XSFA 1HEMA 5KXMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HUKA 1J1OY 4HTKA 1L58A 182LA 3F6ZA 4H9EA 5FHWA 1P6YA 2RSCA 3HUAA 2LYMA 1L12A 3FI5A 1C46A 1G7LC 1C62A 3CB7A 4CJ2A 1L90A 3EBAB 1EQ4A 3LYMA 3C83A 2OU8A 4H90A 4LT1A 4GN3A 2CWIA 3CT5A 4NG8A 1JQUA 2CJLA 1LMOA 3JR6A 2YBJA 1CU5A 4DJHA 4WG7A 1JWRA 1LZEA 3A6CY 1JTMA 2RBPA 5KXRA 1N4FA 2B75A 3CT0A 160LA 2ANVA 4I7NA 5C6LA 3MGWA 3C7YA 1XEPA 4H92A 2Q9DA 3OE6A 4Z41A 3T36A 1REZA 1C6JA 2OEAX 3TXKA 1C63A 4QGZA 1YKZX 3C8QA 1XFPL 156LA 2RBSA 1C6CA 4UWVA 2H9JA 123LA 3TXFA 2Z12A 3DN3A 4OWCA 1T3PA 3SB9A 1OUJA 1JKDA 2BPUA 1JTTL 3GUJA 5HNLA 1P7SA 3AZ6A 1DPXA 183LA 2W1LA 3HBDA 2YBLA 1LZDA 1L59A 1GF5A 1L91A 1HEPA 1JIYA 4GCEA 1L0JA 1B7QA 1LSEA 4NIJA 2QARC 3LN2A 1LYSA 1NWGA 1TAYA 5C6JA 1UCOA 4J7VA 5FELA 5I4XA 1C64A 1GE0A 4NGYA 2EPEA 210LA 2L78A 3W6BA 3HU8A 1LW9A 1B7LA 5FEKA 1UIBA 4XJDA 1G07A 1LMQA 4MR1A 164LA 4R0FA 2W1YA 3C7ZA 1OWZA 166LA 1UIFA 1L89A 255LA 1IP5A 1L69A 3WVYA 4DQ5A 1LYHA 1OV5A 4YEOA 1C6DA 1C60A 1OV7A 3E3DA 2LZMA 4FDYA 5LXWA 1LZCA 3FA0A 1LYDA 1LZTA 1FKQA 1KXXA 2HU3A 1LZ8A 2C8PA 2QB0B 1CVKA 1IP4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B7M A;  1JKB A;  2MEA A;  1QQY A;  1J1O Y;  1NDG C;  4HTK A;  4A7D A;  3TXB A;  3F6Z A;  1GF3 A;  4H9E A;  5FHW A;  1A4V A;  1TBY A;  2W1M A;  4DD3 A;  3WL2 A;  4DD0 A;  2DQI Y;  2RSC A;  2LYM A;  1BB5 A;  3A67 Y;  1UIH A;  4H91 A;  1IOT A;  1YIL A;  1GXX A;  4ETE A;  4CGE A;  3AB6 A;  1HFY A;  2WAR A;  2DQF C;  4I8S A;  5I4W A;  1C46 A;  5KXX A;  1QUS A;  1G7L C;  2MEB A;  4G4B A;  1GAY A;  2XJW A;  3CB7 A;  4XN6 A;  4CJ2 A;  5F9X A;  3EBA B;  1EQ4 A;  4OWH A;  5JEN B;  4LYO A;  4ANR A;  4KXI A;  4NHP A;  3LYM A;  4XAD A;  2HEA A;  2I25 L;  1E8L A;  1JKC A;  4H90 A;  3A6B Y;  1UIE A;  1YAO A;  4LT1 A;  4B0D A;  1LZ9 A;  4GN3 A;  1GE1 A;  2CWI A;  3CT5 A;  4LT2 A;  1UC0 A;  4NG8 A;  4RW2 A;  1OQM A;  2CJL A;  1LMO A;  4PRQ A;  4H8X A;  1ZVY B;  4ETD A;  1IOR A;  1LMT A;  2YBJ A;  4GLA A;  4GLV A;  5C6I A;  2XBS A;  4WG7 A;  1GB7 A;  1JWR A;  3A93 A;  4NWH A;  1DI5 A;  1LZE A;  1A2Y C;  2HUB A;  4DDC A;  1GFE A;  4NSH A;  1IWT A;  3A6C Y;  1JJ3 A;  1AKI A;  4H94 A;  5LVJ A;  5M1Y A;  4HP0 A; 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 1GB9 A;  4WL7 A;  133L A;  4N0J A;  1W6Z A;  3RW8 A;  1WQM A;  3FE0 A;  1UIA A;  3K3T A;  5KXP A;  1C43 A;  4ETB A;  2D4I A;  2BQC A;  3LHM A;  4PJ2 C;  2HEF A;  2PC2 A;  2BQF A;  1JSF A;  4H1P A;  4ZFP A;  2BLY A;  1G7M C;  2BQL A;  1LJF A;  2LHM A;  4FJR A;  3QE8 A;  4X3B A;  1GBW A;  1GFR A;  4DDA A;  1JJ0 A;  4WM3 A;  4HV2 A;  5LA8 A;  1RFP A;  1JIS A;  3LZ2 A;  3AW7 A;  1B7O A;  1B5V A;  1LHJ A;  4QDN A;  1FN5 A;  1DKJ A;  4NGZ A;  4HV1 A;  3D9A C;  1BHZ A;  4KT3 A;  1IO5 A;  4NGI A;  1GDX A;  2ZIK A;  1GE2 A;  1WQP A;  1XEK A;  4WM6 A;  1QSW A;  3WXU A;  1UIC A;  1YRO A;  3WYH A;  1UID A;  2FYC A;  1IWZ A;  1DI4 A;  1GF7 A;  3IJU A;  4AXT A;  1IP3 A;  3CT1 A;  2XBR A;  4HSF A;  2ZYP A;  4OWB A;  1NF5 A;  4UWN A;  1LYO A;  3P64 A;  1DPW A;  1GF4 A;  1JTO L;  1RI8 B;  3AZ7 A;  194L A;  5LVK A;  5T3F A;  5DN4 A;  3WXT A;  4CFO A;  3CSR A;  5KY1 A;  5I54 A;  4PRU A;  5APF A;  1HEQ A;  1LZB A;  4G49 A;  5A3E A;  1LSG A;  4NHS A;  5D5F A;  1KIQ C;  1WTM A;  1GB8 A;  1UBZ A;  4G4H A;  1JJ1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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