4WOAA

Lysozyme multiple crystals after surface acoustic wave alignment
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
publication title Precise Manipulation and Patterning of Protein Crystals for Macromolecular Crystallography Using Surface Acoustic Waves.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4woaA00
1IC5Y 2F4AA 2XTHA 1LMQA 2BQGA 1CJ9A 4I0CA 5APCA 2W1LA 4TSCA 3TXIA 1I1ZA 1B5XA 4H9HA 4XJFA 1BB5A 1LYYA 2YSSC 1BQLY 4PHIA 4UWVA 1LHIA 1TEWA 1JTOL 4CJ2A 1LJKA 5KXTA 1UC0A 3MGWA 2YBIA 1B7NA 5IDDA 4X3BA 1IOTA 4N1CC 1GHLA 1GXXA 3SP3A 3WUNA 4W94A 2PC2A 1LZGA 1IOCA 1J1XY 208LA 4PJ2C 4ZFPA 1N4FA 1IP1A 3FE0A 2LYMA 3GXRA 4OOOA 1C46A 1GFUA 1OQMA 4LT0A 1IP7A 1C08C 1YKXX 3AGGG 4NSGA 1LMAA 3TXJA 2CJLA 2DQCY 1FLUA 3P65A 5KXYA 1WVVA 5LYTA 1JTPL 3P66A 1DI3A 1LAAA 1GFRA 1NBYC 3B0OA 5B1GA 2MEEA 1B5VA 1D0LA 1WTNA 2IFFY 4NGVA 5I4XA 2DQAA 1NWGA 1AKIA 4TWSA 1XGTC 3ATOA 4H91A 1LKSA 4KXIA 1XFPL 1GB2A 1ALCA 1VDTA 4WM1A 3OJPA 1BB6A 4H9FA 1IP4A 4DD7A 1IWUA 1V7SA 1LZYA 4G49A 1FLYA 3AZ5A 5FSTA 4DDAA 4G4HA 1GBOA 2D6BA 3B72A 2EKSC 1RE2A 1A4VA 1I56A 1RFPA 1AT5A 133LA 1FN5A 1BWIA 4DDBA 4LGKA 1IP6A 1B5WA 4B4EA 5KXPA 1CJ7A 1CNSA 1VEDA 3TXHA 1C43A 1HFZA 4LYCA 4Z41A 5KJ9A 1GF3A 4J7VA 4DD1A 1PZYA 3BKVA 1JPOA 2DQHY 3WW6A 1D6QA 4J1AA 4LT2A 4XYYA 1IORA 1UCOA 1LSYA 4WG7A 1IVMA 1HSXA 3CB7A 1OUEA 1GDWA 4H8XA 4E3UA 4J0LA 4GCBA 1GBZA 1HC0A 1CKFA 5DM9A 1GFTA 4WLYA 2C8OA 4NGYA 1HFYA 1UA6Y 2FBDA 4HJZA 5C6IA 1UIGA 4IASA 5FELA 3W6DA 1IC4Y 3ULRA 2ZIJA 1W08A 5APDA 4M4OA 4LYOA 5IELA 1GB8A 1GFVA 4YEMA 1DI5A 5HNCA 3WUAA 4WG1A 1GB7A 1XGPC 4H94A 4HPIA 1XEJA 2H9JA 5E9RA 1JTTL 3A6BY 4NHIA 2LYOA 1LMPA 1LJNA 1D6PA 2DKVA 2CGIA 3LYMA 3LYZA 1T6VL 2BQIA 5LAGA 4H90A 3TXBA 4WM6A 2LZTA 1QIOA 1OUFA 4XJGA 4MCKA 1GF4A 5HMJA 1JEFA 4YF2A 4ZEEA 4GN5C 1CKHA 5KXZA 1JIYA 2MEFA 1LMTA 4QDNA 4Z98A 4GCFA 3ZVQA 1NQIA 1GEZA 1FLQA 1LZ5A 1F6SA 1GBXA 2A7FA 2FYCA 2XJWA 1UIBA 3IWRA 3A94A 1LZRA 2Q0MX 3W6CA 3WMKA 1VAUA 1BHZA 1B7MA 1LYOA 1LJIA 5AMYA 1P2CC 3P64A 1REZA 1IWZA 1G7HC 4PPOA 4QEQA 4AGAA 3A3QA 2MEBA 4PRQA 1DKJA 5HLLA 4BADA 5KXNA 2ZQ4A 3ATNA 4RW1A 1NKHA 2HECA 4N9RA 1IR8A 1EQ4A 3RNXA 1H6MA 4OW1A 1IO5A 4LYBA 4NGJA 1LHHA 1O23A 4B0DA 4YOPA 2BAAA 4NWEA 1JJ0A 1DI4A 1FDLY 4NSJA 3HBEX 4DDCA 2MEAA 4NGKA 1OUGA 1DXJA 3VWOA 2F2NA 2BQAA 4FDYA 1Z55A 1VATA 5C6LA 1B5UA 1FBIX 1PS5A 2I25L 5FDJA 4ETBA 1GBWA 1LZTA 1JKDA 1MELL 4GN4A 4TX7A 4ANRA 5JENB 2BLXA 1DPWA 5HMVA 5KXKA 2ZYCA 1GF9A 1HNLA 3TMXA 4LFPA 4NGLA 1HF4A 4OWEA 3FI7A 4NG1A 1OUDA 1TAYA 1GD6A 5LA8A 5KKIA 2YBNA 1QSAA 2A7DA 2DQJY 4GLVA 1UACY 1A2YC 1GF5A 3AGHA 4MR1A 1IP3A 4HSFA 4ET8A 3TXEA 2ZILA 5B1FA 1GE0A 1XEKA 1LHLA 1WQNA 3TMUA 1QUTA 1B7SA 4Z3MA 1B7QA 2F4GA 3IJVA 1QDRA 1UBZA 2Z12A 4NEBA 4WM4A 3WYHA 1JKAA 3KAMA 2HTXA 1YILA 1LCNA 4GLAA 1HMLA 2C8PA 1HERA 5M1YA 3LHMA 3W3EA 1V7TA 3E3DA 1UIFA 1IEEA 2FBBA 5KXSA 3A91A 1BB7A 1B7RA 3AYQA 3W6FA 1GF7A 3P68A 1JKBA 2MEGA 4N8ZA 1GEVA 1GAZA 4BAFA 3WU7A 5L9JA 1ZVHL 1NBZC 3AGIA 3AZ7A 1FKQA 2ZNXY 4I8SA 3WPKA 3LYOA 3TXKA 2H9KA 1IOQA 1KIPC 1I20A 2ZYPA 3EXDA 5F14A 1VFBC 4G4CA 2BQDA 2ZNWY 1OUJA 4N1EI 4UWUA 1XGQC 1LHJA 2H5ZA 1LZSA 4GN3A 3CT0A 1C45A 4ET9A 1B9OA 1WQRA 3WVYA 4HV1A 1B2KA 1CKCA 1REMA 3TMVA 3WXTA 1BGIA 2AUBA 2HEEA 6LYZA 4NY5A 3A90A 3EMSA 4LYZA 1TDYA 4H92A 1DPXA 1GF8A 1REXA 4DD3A 1QTEA 3RT5X 5I54A 2BQJA 3GXKA 4RDSA 4CFOA 3B0IA 207LA 2ZIKA 1D0KA 4WM2A 3AZ6A 2BQCA 2NWDX 3P4ZA 1UICA 2CWIA 5F16A 4MSTA 4WLXA 1G7IC 3OK0A 1BWHA 1YL0X 4QGZA 4W96A 1IWXA 1NDMC 4H9EA 4NGOA 1LJEA 5KKJA 1LZ1A 2Z38A 4N5RA 2WARA 1LJ3A 3A95A 2Z37A 1OUIA 4BS7A 1LMNA 5DL9A 2LHMA 3CSQA 1OUHA 1CKGA 3CQLA 3T6UA 3WVXA 3N9EA 5LXWA 1HFXA 1LSAA 2BQFA 1E8LA 1NMMA 1REYA 4LYTA 1GB6A 2EIZC 2I6ZA 2YDGA 4B49A 4Z46A 5E4PA 1B0DA 2N5ZA 2YBLA 4CHXA 4HJVA 3ZEKA 5A3ZA 4R0FA 3HBHA 3F6ZA 1JWRA 1IWYA 5D5CA 1GB9A 4XJIA 1IP2A 1GFHA 1LZ6A 3B6LA 1GE1A 4U3XB 5KXXA 2BQBA 2DQDY 1TCYA 4NWHA 5LAFA 3TXGA 4HPEA 4DD0A 4KL7A 3WU8A 4DWXA 5C6JA 1LZAA 2BQNA 1LSEA 1LJHA 4B4IA 5B06A 2ZWBA 3WPJA 1HEOA 2G4NA 2XBSA 2X0AA 1C10A 3M18B 3N9AA 5APEA 4DC4A 5KXOA 1OP9B 2MEHA 5LYMA 4ETEA 4KPMA 1NF5A 1HHLA 3WPLA 1GFKA 1GFAA 4WL6A 1LSDA 4DYGA 5KXMA 5J7CA 3A3RX 5K7OA 1VDSA 4TTDA 1FLWA 1W6ZA 1RJCB 4HV2A 1GBYA 1WQMA 3J4GA 1H87A 1IR9A 4XJDA 4NGZA 2HU1A 4WOAA 4NHSA 2Z19A 2BLYA 1IWWA 3RZ4A 4P2EA 5F9UA 5ILFA 2DQEY 3G3AB 5B59A 4LZTA 1IY4A 1LJ4A 1D0MA 1IR7A 3A67Y 1GE3A 1LOZA 4OOTA 4XADA 4YEOA 1JHLA 2DQFC 2HU3A 1GB0A 2HEBA 135LA 4XJBA 4IJ4A 3TMWA 2YVBA 3AJNA 4QY9A 2DQIY 4WM3A 4NHPA 1DKKA 1GWDA 1HEWA 1HSWA 1RI8B 2FYDA 2D4IA 1DQJC 1BB4A 4RLMA 3T36A 2Z18A 1LSPA 3BKHA 4WLDA 3AZ4A 1IOSA 1HELA 1LKRA 4D9ZA 4IATA 1JSFA 4OWBA 3HBDA 1QQYA 5DN5A 4C5FA 1ZMYL 2MEIA 1AM7A 1GDXA 1HENA 1LZ9A 4WO9A 3RW8A 4DT3A 1WQPA 4DD9A 4HTNA 2BQKA 1YL1X 3K3TA 4NSIA 4PGJB 1G7JC 1JSEA 2D4JA 4H9CA 5F9XA 193LA 3B0KA 1GB5A 4KT3A 3A92A 4H93A 4NSHA 1JITA 1B7LA 5T3FA 4J1BA 5I53A 4B1AA 2Z2EA 3D3DA 4PRUA 4WLTA 3ZVQB 5FHWA 1LSCA 1OUCA 4NIJA 5KXLA 1YROA 5L3IA 1LJFA 1LSZA 3W6AA 1YKZX 2B5ZA 1VDQA 1LMCA 4H8YA 1YIKA 4EOFA 1XSFA 1D9UA 4H9IA 5FEKA 3W6BA 1GPQC 1JUGA 2W1MA 1IP5A 1B5ZA 2YBJA 4M6DA 1SQ2L 2CDSA 4XJHA 1F6RA 3AW7A 4CFPA 4R6CA 3QNGA 2F30A 1KXWA 1WQOA 1TBYA 2ZQ3A 7LYZA 1AT6A 1GF6A 1YANA 2XBRA 154LA 4H1PA 5ILCA 5I4WA 1JKCA 1QUSA 5LVJA 1KXYA 4O34A 153LA 1BVXA 2BQHA 3LN2A 4N0JA 4NG8A 5LYZA 5HQ1A 1IWTA 1BVKC 1J1PY 1QTKA 4HP0A 4XN6A 5KXRA 4YENA 3QE8A 4ZIXA 4ETDA 4NGIA 1NHEA 1ZV5L 1UUZC 2D91A 1WVUA 1YAOA 4LT3A 194LA 5DN4A 3LYTA 1BB3A 2Z2FA 4L41A 1VDPA 5LVGA 2DBTA 4GCCA 4OWCA 1B5YA 1GFGA 2HEAA 3CT5A 1GFJA 1GBSA 4LT1A 4ETAA 2EQLA 2G4PA 3W6EA 2BQMA 2VB1A 1LSBA 3A96A 1UIAA 1G7MC 2HUBA 4OWAA 1YAMA 1JJ3A 1GE2A 5HNLA 4UWNA 1F0WA 1LZCA 2HEDA 2W1YA 1B7PA 5A3EA 3A8ZA 3WL2A 4HTQA 4BAPA 1XEIA 5I5QA 4ML7A 4TUNA 5D5FA 1KIQC 1GXV2 3HFMY 1IX0A 4OWHA 4H9BA 1GF0A 1LZ8A 1IWVA 1QSWA 2LZ2A 3N9CA 1BWJA 4LYMA 2BQEA 4RLNA 5L3HA 1OUAA 4LFXA 2BQLA 2G4QA 1LYSA 4WMGA 1LZ4A 1LTMA 132LA 4YM8A 5LVIA 1GAYA 1INUA 4WL7A 1UIDA 3CSRA 4G4BA 3WU9A 3WXUA 8LYZA 3LZTA 3IJUA 4II8A 3J6KA 1B7OA 1IY3A 5KXWA 1DZBX 4H9AA 2DQGY 5B07A 4TSBA 4C3WA 1GFEA 1GE4A 1LJJA 3A93A 5DLAA 4DD2A 1J1OY 4WO6A 1CJ8A 3M3UA 3WULA 5LA5A 4NGWA 1G7LC 4A7DA 2W1XA 2GV0A 3LZ2A 5F81A 5IHGA 5FCPA 3EO5A 1LHMA 4NHTA 4RW2A 3A6CY 2EPEA 2IHLA 3WW5A 1SLYA 4GCDA 1UIEA 3TXFA 1LJGA 1YAQA 5B05A 1LYZA 1LMOA 1GB3A 2LYZA 2D4KA 3TXDA 3AW6A 2HEFA 1C7PA 1KXXA 1QDTA 2Z39A 3WH1A 1YKYX 1MLCE 4WM5A 4HJYA 134LA 3CSZA 1WQQA 1LSNA 3G3BB 3WUMA 5APFA 1WTMA 1YQVY 4FJRA 3D9AC 1HEMA 2YBHA 2YBMA 3AB6A 1LSFA 6LYTA 4CGEA 1RCMA 4ETCA 2RSCA 1IC7Y 3RU5A 4XENA 1CJ6A 4EMNA 1IIZA 4H8ZA 4NFVA 3EBAB 3QY4A 5EBHA 1ZVYB 2MEDA 1YAPA 1F10A 1LZEA 5LVKA 2I26L 1JJ1A 5II3A 2BPUA 1HEPA 1CKDA 2Y8PA 1HEQA 5KY1A 1NDGC 1XGUC 1AZFA 1OUBA 1LZDA 1LHKA 3CT1A 4AXTA 1XGRC 2BQOA 1LZNA 2MECA 1T3PA 4B4JA 5I4YA 1LSMA 1UIHA 4GCEA 4HTKA 1EL1A 1KIRC 5LIOA 5LINA 1LPIA 1LSGA 4NHQA 1FKVA 4G9SA 3A34A 1EQ5A 9LYZA 5LVHA 1LZBA 1HMKA 1EQEA 1JISA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OE4X 1IC5Y 2XTHA 4I0CA 1C6QA 2W1LA 1B5XA 2YSSC 4UWVA 4CJ2A 4ARMB 3HUKA 2B6ZA 1B7NA 1L11A 4X3BA 215LA 2B73A 3FI5A 4W94A 1L97A 1J1XY 1L42A 4PJ2C 149LA 1DYFA 4ZFPA 4LT0A 1C08C 4LDOA 4NSGA 1LMAA 2CJLA 5KXYA 4DKLA 1L60A 1NBYC 1GFRA 1L94A 3HTFA 1WTNA 3HTBA 1G0LA 1NWGA 1XGTC 1C6AA 4DD7A 4G49A 4W59A 4G4HA 1GBOA 1A4VA 1I56A 1L83A 1L05A 4DDBA 4LGKA 238LA 1VEDA 1L69A 159LA 1HFZA 1L43A 3DMVA 1EPYA 162LA 1L23A 1IVMA 1IORA 1UCOA 1LSYA 4WG7A 1D2YA 3CB7A 1JTMA 1HC0A 237LA 4NGYA 2Q9EA 3G3VA 1L12A 5C6IA 3W6DA 1W08A 217LA 3DN0A 4LYOA 5IELA 1L91A 1L41A 3V2WA 1XEJA 5E9RA 1L61A 229LA 4WM6A 1L03A 4MCKA 1KW7A 1JIYA 1C6IA 3ZVQA 1NQIA 216LA 1F6SA 1GBXA 1L72A 1L64A 5AMYA 1L80A 1QTHA 3D4SA 250LA 2MEBA 4PRQA 176LA 2ZQ4A 1EQ4A 4LYBA 3JR6A 4YOPA 4NWEA 1JJ0A 1FDLY 4NSJA 1PQDA 2MEAA 4NGKA 1DXJA 2F2NA 5C6LA 1FBIX 3EMLA 5FDJA 111LA 1LYJA 1GBWA 1LZTA 1L21A 1G1VA 1PQKA 5KXKA 1HNLA 130LA 1HF4A 1L45A 1TAYA 1GD6A 2YBNA 1L50A 1IP3A 4HSFA 1GE0A 1CV3A 1P2LA 3HH6A 4I7PA 1UBZA 2Z12A 2HTXA 1QT8A 3E3DA 1UIFA 139LA 3AYQA 3W6FA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IC5 Y;  2F4A A;  2XTH A;  1LMQ A;  2BQG A;  1CJ9 A;  4I0C A;  5APC A;  2W1L A;  4TSC A;  3TXI A;  1I1Z A;  1B5X A;  4H9H A;  4XJF A;  1BB5 A;  1LYY A;  2YSS C;  1BQL Y;  4PHI A;  4UWV A;  1LHI A;  1TEW A;  1JTO L;  4CJ2 A;  1LJK A;  5KXT A;  1UC0 A;  3MGW A;  2YBI A;  1B7N A;  5IDD A;  4X3B A;  1IOT A;  4N1C C;  1GHL A;  1GXX A;  3SP3 A;  3WUN A;  4W94 A;  2PC2 A;  1LZG A;  1IOC A;  1J1X Y;  208L A;  4PJ2 C;  4ZFP A;  1N4F A;  1IP1 A;  3FE0 A;  2LYM A;  3GXR A;  4OOO A;  1C46 A;  1GFU A;  1OQM A;  4LT0 A;  1IP7 A;  1C08 C;  1YKX X;  3AGG G;  4NSG A;  1LMA A;  3TXJ A;  2CJL A;  2DQC Y;  1FLU A;  3P65 A;  5KXY A;  1WVV A;  5LYT A;  1JTP L;  3P66 A;  1DI3 A;  1LAA A;  1GFR A;  1NBY C;  3B0O A;  5B1G A;  2MEE A;  1B5V A;  1D0L A;  1WTN A;  2IFF Y;  4NGV A;  5I4X A;  2DQA A;  1NWG A;  1AKI A;  4TWS A;  1XGT C;  3ATO A;  4H91 A;  1LKS A;  4KXI A;  1XFP L;  1GB2 A;  1ALC A;  1VDT A;  4WM1 A;  3OJP A;  1BB6 A;  4H9F A;  1IP4 A;  4DD7 A;  1IWU A;  1V7S A;  1LZY A;  4G49 A;  1FLY A;  3AZ5 A;  5FST A; 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 3IJU A;  4II8 A;  3J6K A;  1B7O A;  1IY3 A;  5KXW A;  1DZB X;  4H9A A;  2DQG Y;  5B07 A;  4TSB A;  4C3W A;  1GFE A;  1GE4 A;  1LJJ A;  3A93 A;  5DLA A;  4DD2 A;  1J1O Y;  4WO6 A;  1CJ8 A;  3M3U A;  3WUL A;  5LA5 A;  4NGW A;  1G7L C;  4A7D A;  2W1X A;  2GV0 A;  3LZ2 A;  5F81 A;  5IHG A;  5FCP A;  3EO5 A;  1LHM A;  4NHT A;  4RW2 A;  3A6C Y;  2EPE A;  2IHL A;  3WW5 A;  1SLY A;  4GCD A;  1UIE A;  3TXF A;  1LJG A;  1YAQ A;  5B05 A;  1LYZ A;  1LMO A;  1GB3 A;  2LYZ A;  2D4K A;  3TXD A;  3AW6 A;  2HEF A;  1C7P A;  1KXX A;  1QDT A;  2Z39 A;  3WH1 A;  1YKY X;  1MLC E;  4WM5 A;  4HJY A;  134L A;  3CSZ A;  1WQQ A;  1LSN A;  3G3B B;  3WUM A;  5APF A;  1WTM A;  1YQV Y;  4FJR A;  3D9A C;  1HEM A;  2YBH A;  2YBM A;  3AB6 A;  1LSF A;  6LYT A;  4CGE A;  1RCM A;  4ETC A;  2RSC A;  1IC7 Y;  3RU5 A;  4XEN A;  1CJ6 A;  4EMN A;  1IIZ A;  4H8Z A;  4NFV A;  3EBA B;  3QY4 A;  5EBH A;  1ZVY B;  2MED A;  1YAP A;  1F10 A;  1LZE A;  5LVK A;  2I26 L;  1JJ1 A;  5II3 A;  2BPU A;  1HEP A;  1CKD A;  2Y8P A;  1HEQ A;  5KY1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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