4WX2A

Crystal structure of tryptophan synthase from salmonella typhimurium in complex with two f6f molecules in the alpha-site and one f6f molecule in the beta-site
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
268
structure length
253
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Visualizing the tunnel in tryptophan synthase with crystallography: Insights into a selective filter for accommodating indole and rejecting water.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Transferase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 95
structure length 253
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2014-11-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4wx2A00
1W5QA 3QH2A 3NDOA 4PTNA 2BTMA 2ZZ6A 1W3NA 3LBMA 3DFPA 4O1BA 3UWWA 2NWSA 4ADTA 4LW7A 4LRTA 1QO2A 1JCMP 4ALDA 1QNVA 1IIHA 5HWMA 2EGZA 1DQWA 4GUHA 1TQXA 3N2MA 3W7HA 5E0KA 5HMSA 1DHPA 1KFCA 3ZFHA 3MHUA 5BMXA 4GUIA 2CLIA 3NPUA 3NL3A 5HWJA 1DQXA 2XN2A 4HNUA 4JNMA 3LDVA 1K7XA 5DELA 1NFBA 4GWEA 4UFJA 3CC1A 1LOLA 1XUZA 5AC6A 2F84A 8TIMA 3HO8A 2VFIA 4Z0JA 3MI3A 1FY6A 3PUEA 4MY9A 1CW2A 3BW4A 5D2XA 1EWEA 1QPOA 1XKYA 3E49A 1HUVA 1OJXA 3HJZA 1JRCA 4UR7A 4UMCA 1SQ7A 1Z41A 3M5ZA 2VEIA 3TK7A 3PSWA 4JTHA 4Q33A 2I14A 2CLLA 4HNNA 2VELA 2JK2A 4LS1A 3MMTA 4JIQA 5AC7A 3LB0A 5D2VA 4XTIA 3PBWA 3IIXA 2OJPA 2C6QA 3PBVA 3GDMA 4LC6A 5G2HA 1JUEA 5CZ0A 4UTTC 1O95A 4UTWC 3S1VA 5AHFA 4HNVA 4DO6A 3W1PA 3N19B 4EIVA 4JGDA 1X8FA 3TUUA 2WSQA 2J9YA 1QMLA 3VE7A 4CNOA 4NZFA 3P74A 2B7QA 1ME8A 4IMDA 3TQ0A 3HQ1A 5BMWA 4KKXA 4HN4A 3GDTA 4LVGA 1UB3A 1KM5A 5K9XA 1S5WA 4K8EA 1JJKA 2DU2A 3GK0A 4DPPA 3PUDA 1Z44A 2HTMA 3OA3A 2ZA1A 3BVJA 1I2PA 2GJNA 3P82A 4E2BA 2QJHA 2WNQA 2V9DA 5DY2A 5E1QA 3LM7A 5MHBA 1EA0A 1PHQA 3P62A 1W54A 1TQJA 5D38A 4NJGA 4O0KA 3I6RA 1KTBA 1LRQA 2WSYA 4UMAA 3THAA 4YL2A 5CZTA 4Z08A 1LBLA 1YXYA 3OVQA 3IGXA 4TR9A 3V1PA 1EWDA 3FEMA 5AC8A 3TQVA 1ZY9A 4JTTA 1SW0A 1HL2A 1VHCA 4KFNA 3KX6A 3QMTA 3LBCA 3BLIA 3MW7A 4ZQMA 4MYAA 3MP4A 2VKZG 4AXKA 4ADUA 3QW3A 3A5FA 4OBTA 3R2GA 3B04A 4DO5A 2E5BA 5CGQA 1OFEA 2ZA3A 3GR8A 3NZ1A 3C4UA 3YPIA 2ZZ2A 5E93A 1YTDA 3F1QA 4N4QA 1TPB1 2C13A 2X16A 3ATYA 4MY8A 2GVGA 5D02A 4OU1A 1T99A 3N73A 1KM6A 1VLIA 1IXOA 1GPWA 1XDMA 5IBXC 1AK5A 5K9CA 4LU0A 3KRZA 3SGUA 1ZHAA 1U83A 2QCLA 4UTJA 3W88A 5AYZA 1YYAA 4UMBA 2DP3A 4UTHA 2AQWA 5LKYA 4H4IA 1YXCA 4MOZA 4WUIA 2D73A 2RH9A 4JTIA 2E6YA 3U8GA 1QDSA 5KTLA 1VYRA 1FX6A 1QOPA 3IIOA 5TIMA 3TSDA 1M6JA 4QJ1A 2VEPA 4OQVA 3BK0A 3G1YA 3LHWA 1XM3A 2UV8G 5C55A 5I3JA 1H60A 4H6KA 1OABA 4XBKA 4FX7A 1TV8A 1JCNA 1K02A 3LXCA 1GWJA 1WBHA 1GOXA 1LRNA 4JTEA 1MXSA 3FYPA 4NU7A 4DF0A 3G1XA 1H61A 1DL3A 5HNRA 3GIYA 4MFDA 1AG1O 3B03A 3W7IA 4ONVA 5I3FA 3GLCA 5G1TA 1A5AA 5EA9A 3LCLA 4OWGA 4IOTA 3W86A 3CWOX 2Y62A 1WDWA 3DKJA 1H7NA 1JQVA 3LI0A 1SR9A 1KM1A 1UASA 1UJPA 2QCDB 1QFEA 2WSRA 3MHFA 4IWWA 1LROA 2YX0A 4JTJA 5K7JA 5BRBA 3KVKA 5FI8A 3A23A 4PEKA 1C9DA 2CZ5A 1SSDA 1CX9A 3ABRA 3TSMA 5AHNA 4MUZA 1J4EA 3GXNA 3RF9A 3ZWTA 3DGRA 4UFLA 3IVSA 4AHQA 1W5MA 2KZHA 1QR7A 3W75A 1HO1A 3CU2A 3RLUA 1SZEA 4DF1A 4O15A 1KM0A 2H90A 1OYBA 3C52A 3O6DA 1A5BA 3LXAA 2VXNA 3CIXA 1TV7A 1NF7A 3GX9A 1P0NA 4QNEA 2R14A 1SSGA 1TB3A 5LNRA 2H3BA 2Z2UA 5IM51 2QF7A 3HB9A 2NX1A 4NQ1A 4R33A 3E0IA 3UD6A 3QRHA 4ZQOA 3W73A 5HR6A 5LNSA 1NVMA 4EOUA 3G1SA 3W1LA 4IUOA 5KINA 4LY8A 4Y6GA 2X1TA 2I9EA 1FBAA 1JR1A 3W7PA 3O6CA 3W6YA 1G4SA 4JXCA 3IVTA 3O15A 1TSIA 1VYSX 4O0ZA 4RCXA 5CZJA 1KLYA 2QUTA 3RLVA 1GG1A 1RVGA 4MLJA 2JGQA 1WYIA 4JTUA 5KITA 5U7SA 4MPQA 4AAJA 2ZRZA 1FCVA 1TJRA 5DY3A 1R46A 1L2UA 2P10A 4IQLA 2QR6A 3UXDA 4C1LA 2GVLA 3L67A 2P1FA 3E12A 2V2DA 3MYOA 3DXIA 4O19A 2JGYA 3TW6A 4JTFA 1KV8A 2QEZA 2V5LA 5D2TA 3NVTA 3RNDA 1P4CA 3SY5A 2DJXA 1VS1A 3WJXA 3P81A 1SFJA 1RQHA 1K8YA 2TSYA 3N34A 2H3DA 1EP2A 1THFD 1W3TA 3LCXA 3EX2A 2FLIA 4RX0A 2YPIA 2A5HA 3EKZA 1G6CA 1YXDA 2A6LA 3NM3A 1NF0A 1LORA 4FXSA 3EXSA 3ZWSA 1ZAJA 3WJZA 3M6YA 2VEMA 4N2YA 1F74A 3B06A 1X1ZA 2A0NA 3F03K 3C61A 4GBUA 3W7MA 3DHFA 2EKCA 3O8AA 1TPDA 2V81A 2X30A 1KTNA 3M9YA 2FDSA 2DORA 4FB7A 1GVOA 3QSRA 4FF7A 1Q6QA 2B4GA 2R8WA 3MYPA 3O06A 2QJGA 3PAJA 2QAFA 3R8RA 2Y7FA 2ZZ1A 4BWLA 1EUAA 3L5MA 2ZDRA 3EWWA 2G5WA 2YSWA 2YYUA 3G8EA 2C18A 4O12A 3DKLA 4TU1A 2ZTJA 4UTKA 1YTKA 4WOZA 3T78A 3TMQA 2QCEA 4HNTA 2GUUA 1G4TA 4QITA 3CEUA 3K30A 3W2LA 1AL8A 4WY0F 1V5XA 3OG3A 1I45A 1N8FA 4CQAA 4N9CA 1QAPA 2C19A 5C2XA 1LZOA 4ORIA 3M5VA 3PG8A 4KWWA 4LNYA 1RR2A 1FCUA 4JTGA 3W74A 2B7NA 3L21A 5D30A 3W1TA 4JYEA 2FB2A 3G3MA 3HG3A 2ISVA 3RFAA 1FQ0A 4RLIA 3LTYA 3LCIA 1WX0A 2WO5A 3GAKA 1SU5A 3GDRA 3LHTA 4HSOA 4AVFA 1JCYA 3T7VA 4M5PA 3NQCA 3NQVA 1KM3A 3BV4A 2PRMA 1YDVA 1DKWA 2J9ZA 1RD5A 3EKLA 4IPJA 4QISA 5DBUA 4AEOA 1GYLA 5F2IA 3A22A 1L6SA 3NNTA 2I1OA 4LVAA 1VCGA 3TROA 2Y7DA 1OHLA 3PVFA 3LTSA 4JEQA 3MO7A 1TPC1 1TIMA 2Y85A 1QPNA 3TU9A 3TC6A 2A7NA 4FX6M 2O7QA 1MSSA 2ZYFA 3R13A 5BW6A 4UTIA 1SPQA 3NQ8A 3NM1A 2C15A 2Y70A 3BPWA 1F76A 1C29A 3AJXA 3G0SA 1LOSA 1ME7A 5SWUA 4X3ZA 1VGAA 1TTJA 3CB8A 3NQ2A 1TTQA 5FEXA 2HMCA 5EYWA 2V2HA 3B0PA 1K03A 2DZVA 4ORMA 2BX7A 4XBSA 1TPEA 2AGKA 3GR7A 1OFOA 1EIXA 1QOQA 1K3UA 3R5EA 3M0ZA 2C16A 4YCPA 3TIMA 3CEPA 1F5ZA 4RV8A 3NPWA 1OK4A 4Q4KA 1C8VA 4LVFA 1TCDA 3S1UA 3DZ1A 3LCGA 3MHGA 3OIXA 3HGJA 5A8GA 1OF8A 1H7OA 2VFFA 5G4EA 3W72A 2E09A 4OT7A 2ZCGA 4IX2A 1ICSA 1YDOA 2NXHA 3ZR4A 1E51A 2GPTA 3O07A 1MZHA 1NEYA 3MP5A 4ZQCA 4RR4A 4HPXA 3W1RA 1VH7A 2E1DA 2A7PA 4MIMA 4P2VA 3UNDA 1VC4A 4CCDA 1F2JA 1LLZA 2XN0A 2ISWA 3KXQA 1SO6A 4NX5A 4WX2A 2WJZA 1MEWA 3NQDA 4X2RA 3W1AA 3HG5A 1J5TA 2E6FA 3QJAA 4AB4A 4PC8A 2B7PA 4CQ8A 1GG0A 4AH7A 3KOFA 1HFBA 3W76A 2QCDA 1GJPA 3W7EA 3W1NA 1FWSA 1AW5A 4TMCA 3G0UA 3I7QA 2FPVA 4FIQA 3WFAA 3Q58A 4LT9A 4UFMA 5LGZA 1G4EA 5DN1A 3UWYA 1RV8A 2R91A 4JY8A 1OFQA 4N9BA 3W1QA 4EF9A 4M6PA 1KTCA 2DZPA 4XTDA 3TFXA 3M41A 3A9IA 3I65A 1BWKA 1PCWA 4ML9A 4O10A 4OHQA 3WJWA 5G2WA 4GJ1A 3SZ8A 3BO9A 4NX0A 1G4PA 1DORA 2E6AA 2E68A 2GVJA 3W7CA 4JX4A 1GTHA 3TJXA 4JICA 3RU6A 2E5CA 1W0MA 1KBJA 4O57A 1ZFJA 3S5OA 4LV9A 4A2SA 4NT0A 3GDKA 1PL9A 4MZYA 2X2GA 4PA8A 3QPZA 3GXTA 3Q2DA 2RKXA 2ISSA 1ZENA 3E96A 4FXRA 2W79A 1BEUA 1ME9A 4WOQA 2FQIA 3C3NA 3ELFA 4WXZA 1B9BA 2CLHA 3A5VA 3VFLA 4XZ9A 3L0KA 3EWUA 4CNPA 4A3UA 3S9YA 5DCBA 2XFWA 4AHOA 4JTSA 3DFQA 1G7UA 5F1VA 4YWIA 3S42A 3JRKA 5EY5A 3LHYA 3STEA 5LHEA 5CPNA 4W9TA 4NNAA 2QDHA 1G67A 3EWXA 4UNLA 4MJZA 1Y0EA 3FKKA 3KHJA 3WK1A 3UWUA 3OVPA 1LCOA 1VR6A 3M43A 3IVUA 4YMZA 2BXVA 1K8ZA 1V7YA 3N3MA 4Y8FA 3W2MA 2OX1A 3FS2A 4DBDA 4XWUA 3O63A 1A53A 3U6WA 4MY1A 2PRLA 3BARA 3PF3A 4ZL1A 3IIZA 1KFBA 1VZWA 5C6MA 4S1FA 1XBYA 4ZMGA 4MZ8A 4CLMA 4FHAA 2CW6A 1T0OA 3A24A 5I3HA 4YLWA 3C2RA 5F1UA 3SGZA 1BWLA 1VHNA 3USBA 4JTKA 4DBEA 2V82A 1R47A 1XDLA 5AOUA 1S3HA 1ZAHA 4YCOA 4MZ1A 3T40A 1R2RA 3NEVA 4BI5A 4BFAA 1ZAIA 5D09A 1AMKA 2VOMA 1Q6OA 4GE8A 4LC8A 1VCVA 4HIBA 2C0AA 4O54A 3GNNA 3QM3A 3SFKA 4DXVA 1VPXA 1W1ZA 2Y7EA 1GQNA 5D33A 3TV8A 4GUJA 1U5JA 1OFPA 3T4CA 3CT7A 3NO5A 5I3GA 1LDCA 3L2IA 1YPIA 4RK8A 5TQLA 3GDLA 3FA5A 3VKJA 1LTDA 3BG3A 3EX1A 4J9JA 1KFKA 5FF4A 3P8IA 4RKAA 2F7FA 4UTUA 3MWAA 4FIRA 1OVDA 4LV4A 3SIZA 1TO3A 2VENA 2QCFA 4RXGA 1FCQA 1KA9F 4LWWA 5C5YA 3QF0A 4Z1AA 2HSAA 1T96A 3NAVA 1EPXA 1EB3A 2ZZ5A 4EF8A 1DJNA 3FFSA 4QM1A 2CLFA 4NJHA 3BW2A 4KWVA 4N6EA 3UY8A 4IMEA 3BW3A 3FOKA 4RJEA 4Q32A 1ADOA 4UXDA 4O4VA 4O28A 1OX4B 5D32A 3SJ3A 4S2CA 3E02A 4O50A 1Z48A 4UTMA 1KM2A 4PH6A 5F2MA 1H1ZA 1PE1A 4EVZA 4IGHA 3C2OA 3NZRA 3M7WA 1TMHA 3QPYA 4AWSA 4N02A 4CCEA 4NXKA 4AF0B 2WKJA 2YW4A 3EWBX 4TIMA 4FNPA 2AAMA 3OVRA 1LYXA 3BLFA 4GFSA 3L65A 3MI6A 3HPZA 3FYOA 4LTSA 4MLRA 3C56A 2J9XA 2EHHA 1W31A 3W1XA 1FDJA 3LHVA 3DFSA 1JQXA 3EX3A 3STGA 2FB3A 3M5YA 5DCEA 1GT8A 4Y90A 4D2JA 3EWYA 5K3VA 1W5PA 3VI2A 2BWGA 3W7NA 2CWNA 3CM4A 3W23A 2J88A 4QSHA 3WJYA 4U4MA 3PSVA 1M7OA 3T55A 5AYYA 3NQFA 1EX5A 3TX9A 1IIGA 3QMSA 5H2ZA 1SZNA 3UPWA 3EWZA 2WV8A 2YZRA 3PC0A 2TMDA 3BLEA 1W3IA 5F2GA 1QPQA 5FF2A 3LV6A 1IXQA 3NQMA 3IIPA 2QAPA 3PS7A 3UPBA 1XUUA 3UQNA 2O7SA 4R7JA 3I68A 4JTLA 1J2WA 2FFCA 1SO4A 5FF7A 3HF3A 1HO4A 4N4PA 2ZRWA 3JS3A 3PUOA 5EMUA 4UR8A 1Z42A 4JDYA 4LUJA 2B0MA 1GVRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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