4X0XA

The structure of ahpe from mycobacterium tuberculosis revisited
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
HMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFFPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Revisiting sulfur H-bonds in proteins: The example of peroxiredoxin AhpE.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Putative peroxiredoxin MT2298
total genus 54
structure length 153
sequence length 153
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4x0xA00
3W8SA 2AAWA 4JU5A 5DALA 1OVNA 4MJAA 4TVEA 6GSUA 3FKFA 2FA4A 3M9JA 1GULA 4O5RA 1V98A 1LJRA 4MA9A 1SYRA 2LRNA 4YQMA 5DQYA 3VLNA 2JU5A 1G7EA 1I9DA 5A4WA 4BWSA 2LV3A 2DJ3A 5F05A 3QAWA 3NIVA 4NXIA 2PERA 3VURA 2C3NA 1SJIA 2MMNA 3O76A 4WF4A 1K3OA 4F03A 3VWUA 1DUGA 4KX4A 5HR0A 3J7Yb 4ISDA 3QOUA 5CYYA 5F8BA 1SKRB 2OJLA 1BYEA 5D8IA 1YJ6A 4DVCA 3EYTA 2N5AA 3G9BA 3VFIA 3DVWA 5ECQB 2H01A 3ERWA 4MJEA 3F6FA 3VK9A 1F3BA 3C71A 4V2MA 1ZYEA 2H72A 1O8XA 4NMUA 4MMMA 2B1LA 2LJAA 3WYWA 2N5FA 2HSYA 1PX7A 6GSYA 5ECRB 4MLYA 3UEMA 1PGTA 2PVQA 2EIQA 2CQ9A 4V1Ap 3LSZA 1XFLA 2O7KA 4TOPA 3GX8A 4LMWA 3HVVA 2H6YA 1PSQA 1XOBA 1MEKA 4F0BA 5EVOA 1SK2A 4NWYA 2YZUA 1FAAA 1R4WA 4FO5A 2C0DA 2GT5A 5FWGA 2VOCA 3ZMKA 2P5QA 2VCVA 1MDKA 5G5EA 3CTFA 3TKSA 1VF3A 5DAKB 2FGXA 2OBIA 4MH3A 2NTOA 4PURA 1XWBA 1X9MB 3WT2A 2KP2A 3L9UA 2J23A 4ZB8A 1KTEA 4DSSA 4E8HA 1AUCA 1NHYA 4RQRA 4Z7XA 2CT6A 2JZRA 5GSTA 5KN1A 13GSA 4L5OA 4YQUA 3L4NA 1SKSB 3ERGA 4ECIA 3U5RE 2CZ2A 2GSQA 2QGVA 4IVFA 3HZ8A 3IDVA 5GSSA 2LNSA 2CVDA 5LCZA 2J9HA 1B4QA 3W8JA 3ZZXA 2WULA 1GSQA 1A23A 5ECKB 4XHMA 2LJRA 3LORA 4OD7A 2G0FA 5KEJA 1JHBA 2GZPA 3D6IA 2H8LA 4JBBA 3LXTA 1GSEA 5ABRA 2DIYA 5IO2A 1PKWA 4OCFA 3H79A 3JCML 2I4AA 4ZBDA 1EP8A 4FYBA 3TOUA 3KM6A 3EWLA 3KGKA 3E0UA 3KJYA 2EIRA 3EE2A 2VL2A 3A2VA 5IOXA 3G7IA 2WCIA 4ID0A 2MBSA 1AQVA 2GLRA 1X5DA 4ZB9A 1FB6A 2O89A 4Q5QA 5COHA 1TU8A 1GSFA 1T8EB 5IMDA 5J9BA 1K0MA 1GUMA 2OADA 3F4SA 2ZCTA 1VF1A 2DJKA 2FHEA 1V40A 1XWAA 3FW2A 2VIMA 2LQQA 4GSTA 5F06A 3I43A 1T4ZA 5B8BA 5DAKA 4ML1A 5EY6A 3KP8A 2I9HA 3F3RA 2P31A 2VCXA 4FH8A 4K0GA 5AISA 4DSRA 2RIIA 1AIUA 1QK8A 4O92A 2PWJA 4J57E 2H1GA 3CSIA 2RM5A 3LWAA 2VO4A 3HZ4A 4MPFA 4TR4A 2GGTA 3C1SA 5H5SA 3GL3A 1U87A 5JCWA 4KUNA 2V32A 4IS0A 1EGRA 3VI5A 4K7NA 4LLRA 3GURA 2BTOT 1F2EA 3QMXA 1T00A 5D9XA 3QD9A 1EV9A 2WFCA 1SENA 2I3YA 3GUSA 1OE8A 4O32A 1EGOA 1SJ6A 3E9JB 2CAQA 2JACA 3CMIA 3VWVA 3TB2A 4AJ8A 1OC9B 3APQA 3RHCA 3DMLA 4ZILA 4WBJA 2ALBA 1ERTA 2DMLA 2O87A 2I81A 3IAS2 3TDGA 3UAPA 3F4TA 3H93A 1BAYA 4XRAA 4L8EA 1QQ2A 1XWKA 2XHFA 4QL7A 4I6XA 1PD21 3P7XA 4ZIJA 22GSA 5D96A 4ZL9A 3SBCA 4JR4A 2IMFA 3UVTA 3KIJA 2YWOA 2MMZA 4JEDA 4MK3A 3GRXA 1YZXA 1U6TA 3A3TA 3PINA 3VWXA 1O85A 4XTSA 4WR5A 4G9HA 4HU9A 4H86A 2R6KA 5CO3A 3O6TA 2GQLA 4PXOA 4IHUA 2LJKA 2DIZA 5EPFA 2L4CA 1SL2B 1U3IA 2WS2A 1ZZYA 4F82A 4YH2A 1WJKA 1M7TA 1YF1A 2L5LA 3US3A 1URMA 6GSTA 4KDYA 5HFKA 3HVSA 2M72A 2OACA 1TP9A 1WP0A 1TDIA 1A2MA 2DJ2A 2D2ZA 2FLSA 5D9VA 3PR8A 1AQXA 2GZZA 5E59A 2YANA 5DQSA 3VPTA 3FR9A 2F8AA 4D73A 2H73A 3BJ5A 2CAIA 3ZREA 3EINA 1R26A 4OFMA 3F8UA 1YEPA 2LRCA 4PQIA 2VD0A 2GQMA 1OC9A 2NVLA 4FYUA 1X0RA 1M9BA 1ON4A 1JZOA 5DJLA 3RPNA 3IA1A 4GWRA 2OA7A 3H4KA 4MJCA 1PL1A 3GKMA 2H6XA 4KAEA 4V1Ag 3NZNA 3TKRA 2TRCP 5JWRB 4K7IA 1SD8A 2L4QA 2MMAA 4JE1A 3WGXA 1A24A 8GSSA 2IFQB 1TW9A 3RHBA 2YCDA 3LGCA 1GP1A 3LQ7A 4BA7A 2CVBA 2IL3A 3IXRA 4IELA 1RK4A 3C73A 4GCIA 2C1YA 2C80A 3TKPA 2WB9A 3TRPA 2FWGA 1SKWB 1A0FA 2MYGA 4GXZA 1PQNA 3HD5A 4PUFC 4HZ4A 2QSIA 5B7CA 5HQPA 1HNCA 2K6VA 4BVYA 3FZ5A 5FHIA 3GHAA 1PMTA 4N10A 2AYTA 3D4TA 3GL5A 4TXOB 1JLVA 4MP4A 3KCMA 1UA5A 4ZBAA 3TJBA 2L5OA 1EOHA 1HQOA 4CW9A 4MF5A 4BWQA 2R4VA 2WJUA 5HR3A 5E4WA 3RDWA 3CSJA 4I5QA 1JZWA 2FUG2 2IMDA 5ECIB 4J2FA 2H0HA 4Q5FA 3KXOA 3CXGA 4LMVA 3MSZA 2PN8A 2F3MA 3TKQA 3UL3A 4HQSA 3MNGA 1SU9A 1HNBA 1M9AA 1EWXA 3FRCA 3GH9A 2E0QA 2DC5A 1JFUA 4EDYA 3ZLPA 5ECMB 2FCHA 4GRFA 4RUVA 1JLWA 3LFLA 5IPHA 2ES7A 2MBTA 2V6OA 3DVXA 4NPBA 1NSWA 1O8WA 1TU7A 1YF0A 4I2UA 1SL0B 3QFAC 1K3LA 2HSHA 4I97A 1ABAA 1JZDA 4IKHA 1QGVA 3QAGA 2X64A 5ECOB 1A0RP 2QC7A 2VCZA 3L0HA 3GSTA 2E2MA 1Z3EA 2A4VA 4WF5A 2V1MA 3O3TA 4EDZA 5IPGA 1F9MA 1X9WB 3DIEA 4EC0A 4NV5A 3F4RA 5FT3A 1UVZA 1Q98A 1TRWA 5ID2B 5J5NA 2H1BA 3DWVA 3F0IA 3HY2A 2DJ0A 2LRTA 3TUEA 2DJJA 2HXKA 3A2WA 4IJIA 2JSYA 4IP6A 4MZBA 4PNGA 4TXOA 1ERWA 1IYIA 2F8FA 5HR1A 1R5PA 1TRVA 3BCIA 2K18A 1XPVA 2YP6A 5G30A 4EXJA 1ZGNA 2GVPA 4TR1B 4I8BA 2OKAA 2X8CA 4HUAA 4HDEA 1TRUA 4WXTA 3UVHA 1WPIA 2TIRA 4G19A 2PBJA 2VLTA 2RUFA 3UMAA 4V2NA 2IN3A 4XS4B 2VUPA 2H30A 2H1AA 2YOIA 1T7PB 2G2QA 3TJFA 2CX3A 1A2JA 4NHZA 5ELAA 5AIVA 17GSA 1MDIA 3N5OA 1XXUA 4Q5NA 4MH2A 1GWCA 1A8YA 1V9WA 4POLA 1PL2A 4OMVA 2C0FA 1NW2A 4HJ2A 4CDOA 2VM2A 5CP1A 3IRAA 1OKDA 2H76A 3HKRA 2AB6A 4IGJA 4KW6A 1BJXA 2ZUPA 2L59A 1JZRA 3GSSA 2WRTA 2X8HA 1FB0A 3F3QA 1V2AA 4ZL8A 3TJJA 4EO3A 1VRSD 6GSSA 3D0ZA 5C00A 3EU4A 2ON7A 3L9VA 1Z6NA 3QR6A 3A5WA 4K9ZA 3QDNA 3CRUA 3Q74A 1GTAA 1U88A 1EEMA 1QUWA 5JCGA 3GTUB 4AJ7A 1G6WA 2R3XA 4WETA 3V1WA 5HR2A 3KMNA 5CRWA 3EMPA 3KP9A 1ZOFA 5IMFA 4TR1A 1GSYA 3KD0A 3GYKA 3DD3A 3W6GA 1Y25A 2L6CA 1XVQA 1DE1A 1M0UA 4XS4A 3P2AA 1F6MC 2RM6A 2X8GA 1KEBA 1F37A 2PGTA 5GAPD 4EL1A 4OO4A 2YPMA 1Q4JA 1EV4A 2YV7A 3TJGA 1GNWA 2P0GA 2V2GA 2XBQA 4QL9A 4N0VA 1VF2A 4AF2A 4HOJA 2WDUA 4RI6A 4HS1A 3OR5A 3ZYWA 4TKYA 3SWLA 1TKDB 4I2TA 2VL9A 5AIXA 1USBA 2HE3A 16GSA 2B5YA 1X9SB 1AQWA 3QPMA 5IQYA 3APOA 4QQ7A 1TOFA 3M1GA 2GZYA 2GSRA 1OC8A 3F63A 5IMVA 1KNGA 1SYXA 5AN1A 2LSTA 4L5LA 2DBCA 2H19A 2LEGA 4KSOA 3IR4A 3P8WA 1K3YA 1FHEA 1YKCA 4NHWA 1WE0A 3WD6A 3BD2A 1Z7RA 3I6AA 1GUKA 1AW9A 1FW1A 1YDKA 1PN9A 1SJZA 1B48A 2DJ1A 2QKEA 1TI3A 1EP7A 3GTUA 3HYPA 5CRGA 2LUSA 3CTGA 2EC4A 3ZFLA 4N11A 1GSDA 2H70A 4E8EA 3VI7A 1T1VA 1THXA 3IPZA 3HVXA 2VCQA 4GQFA 4TRXA 1TTZA 1MTCA 2K8SA 1XWGA 4BVXA 3E3EA 1WMJA 12GSA 1OC3A 1XW5A 3LJRA 4XIHA 4IQAA 2GDRA 3IK7A 2XPEA 1MD4A 4NV2A 4KB3A 4ECJA 1E2YA 3CRTA 2H71A 3D21A 2HRNA 2CVKA 3DKSA 1G0TA 2VCWA 1XCCA 5KN3A 2V41A 2KHPA 3LEFA 2K9FA 3ME8A 3FR6A 2B7KA 4LA1A 3KTLA 4MJBA 5D73A 3GFKA 4ECBA 5A5KA 1XIYA 1J0FA 1SD9A 5IIZA 4GTUA 3HJPA 2M80A 2JADA 1A2LA 2C3QA 4RQXA 5ECPB 1V58A 2GSTA 2GT6A 4N30A 3EC3A 2MMOA 1YQ1A 4ACSA 1SL1B 3DRNA 1GH2A 5G31A 4G10A 4EE0A 4L0WA 5GAND 3FYGA 3FEUA 4GSSA 3RAZA 3KTBA 3IOSA 2KLXA 2R37A 3TRXA 2OBKA 2KOKA 2OE0A 2FWHA 3GV1A 4PQ1A 1XW9A 1AAZA 5ECNB 5ENUA 3GN3A 2YNXA 5LD0A 5DVBA 4AGSA 1M2AA 4ULXA 4X0XA 4KCEA 3ZMLA 4RI7A 2FWEA 2X99A 4KDUA 2WZ9A 2C3TA 4LL1B 5G2ZA 1U3AA 2DSAA 4KH7A 4KNDA 5H5QA 1N2AA 1DE2A 4FYCA 3EU3A 2REMA 1ZCPA 3VWWA 2HYXA 3DGQA 1E6BA 2FY6A 4OFTA 4MABA 3EVIA 2OE3A 3GMFA 4KSMA 3ED3A 2AHEA 3A2XA 3ZIJA 4K8MA 4PUAA 4KE3A 1OAZA 1SK0A 4K0NA 3GKXA 1GTIA 1TK0B 4MPGA 4TXVA 3NOFA 4GF0A 5F07A 4F9ZA 2JZSA 3ZFBA 3ZVJA 3TRQA 5JWQB 1J9BA 2IWTA 2GSSA 4MF6A 2KUCA 2B5XA 2B3SA 3TOTA 3KMOA 3UBLA 2VD1A 3P90A 3CBUA 3Q19A 3N9JA 1TK5B 5ECSA 3Q18A 2YJ7A 4HU7A 3APSA 3LYKA 3WGDA 3PGTA 5CRDA 5H5RA 2PUKC 4BPYA 2HNLA 3WT1A 1GSUA 3ISOA 2YN1A 4ZBBA 2O85A 5B8AA 1A8LA 1Z9HA 2XBIA 2IIYA 4G2EA 2AUVA 1O6JA 5DDLA 5B6MA 3G7YA 1K0BA 5HFGA 3HXSA 1HNAA 3EMXA 3WGEA 1O73A 3GNJA 2H66A 1MDJA 3TJKA 3I69A 5A4VA 2OE1A 4DSSB 2XPDA 1GTBA 2IFQA 2TRXA 5G5FA 1W89A 3TCOA 3MAKA 3FHKA 2AV4A 3PH9A 1NHOA 1O7UA 1M2DA 5JWOB 5DCHA 1O81A 2P5RA 4K1FA 3R2QA 4TR0A 5IMZA 2H0IA 4OCEA 4N0ZA 3QFBC 1B9YC 4PQHA 5HFIA 2N5BA 4ZB6A 1F3AA 4WBRD 1GL8A 4OWYA 4PNFA 4KCAA 5J9CA 3ME7A 2IMEA 5IM9A 5D93A 1MD3A 2B6MA 4ZL7A 2L57A 2NDOA 2HI7A 4GLTA 1NM3A 19GSA 4MZWA 1IYHA 2V6KA 1K0OA 1Z7PA 1OYJA 3HA9A 4AJ6A 1VF4A 2CV4A 3HCZA 1K0DA 1WWJA 3DEXA 1EEJA 5CRHA 20GSA 4FIWA 2YWMA 1FOVA 3IHQA 2PMTA 1ZMAA 4TN8A 1XW6A 4TR3A 3M9KA 3TKSE 1WIKA 4F2IA 1EOGA 1QMVA 2VL3A 2L6DA 3BOAA 1J08A 2HFDA 5EL8A 1XBSA 4EKZA 4DSQA 4POMA 5F0GA 4O7HA 4V2LA 3ZTLA 3KH9A 4GQCA 4HQZA 3M3MA 1ML6A 4XS6A 1CQGA 4KGIA 3UBKA 1PKZA 5G1KA 3ZRDA 1X5CA 1LU4A 1TK8B 5IMCA 1QFNA 2ON5A 1QXHA 2PPTA 3Q6OA 4TW5A 1WRYA 5G1LA 3FR3A 1R5AA 1TI1A 1ACVA 2O8VB 1PX6A 4ILFA 4EF0A 1WOUA 1B4PA 2F51A 4GSNA 4OO5A 4HZ2A 2MZCA 1LBKA 2E7PA 1VGLA 5ID2A 3UIWA 2VCTA 1XZOA 3F6DA 1XOAA 3C8EA 4JRRA 4K7OA 1Z6MA 5GZZB 3GKNA 2RUEA 2C0GA 1BQ7A 3HJOA 2A2SA 2GS3A 4MCUA 2YZHA 4Q5RA 4ECCA 3FZ9A 3GH6A 1Y6EA 3FY7A 2FA8A 1RW1A 2RLIA 1YKAA 4OFNA 3FZ4A 2B7JA 1KBNA 1X5EA 4KDXA 1YY7A 5AGYA 2JZTA 5CNWA 2R5GA 5J4UA 4POBA 2LQOA 1OKTA 5A4UA 3KZQA 1I5GA 4PGTA 2YV9A 5INYA 3CSHA 1M99A 5IO0A 2NBSA 2YWIA 1OE7A 2BMXA 4KA0A 3QAVA 1GNEA 1TXXA 3KEBA 3C7MA 3HJMA 1ERUA 2JL4A 3I9V2 2FWFA 2DMMA 2YJHA 2ZNMA 1ERVA 1UC7A 2I1UA 3IBHA 3DXBA 3TGZA 6GSWA 2JSZA 3K8NA 4K6XA 1B8XA 3IE3A 5IOWA 5ECLB 4XS1A 3HDCA 4NAXA 2H75A 2XC2A 1K0NA 4IN0A 2PVOC 4IP1A 4D73B 1BX9A 3LYPA 3KH7A 7GSSA 1S3CA 3M8NA 2DLXA 3CYNA 1FVJA 4WEYA 5J3RA 3ZL5A 1DSBA 1W4VA 5B6NA 3RPPA 18GSA 5ELGA 5J41A 3H8QA 1THOA 1SK1A 3L9SA 5DCGA 2FNOA 2WGRA 4DEJA 4YQVA 4JR6A 4P3YB 3ZVJD 4CHSA 3RBTA 1M2BA 4MF7A 1S3AA 9GSSA 1FVKA 4WKWA 1ILOA 4YAPA 2HT9A 3TKSC 1FO5A 1XVWA 6GSXA 1GSSA 3ZIVA 5D9TA 1H75A 1V57A 1G6YA 1C72A 2CX4A 5D9WA 3FZAA 2HZFA 3BCKA 2HZEB 2LTKA 2BJXA 3MDKA 3UOMA 4F0CA 3GIXA 4MDCA 1GLQA 4LL4B 4J56E 5CAXA 3VPQA 4POKA 4XRDA 4HJMA 1AC1A 2A2RA 2HLSA 3UARA 2H6ZA 4HEA2 1UN2A 3BBYA 3H1NA 2IMKA 2LKUA 4ZXGA 1ZYQB 3L78A 2AJQB 3IK9A 4EVMA 1CQHA 4JZQA 2VM1A 2R2JA 14GSA 2CZ3A 2GTUA 3GA4A 2VLVA 3G7JA 1ST9A 6GSVA 1R7HA 5KN2A 3S9FA 4IW9A 5DALB 1AXDA 2VL2C 1ZL9A 5L71A 5DBQA 1S3DA 3D22A 1DBYA 2IPAA 5KN0A 1PA3A 2M46A 1HD2A 1GRXA 5C04A 1TJDA 3LG6A 2C0EA 3J7Yk 4K2DA 1T3BA 3D5JA 4IBPA 1G7OA 2GQKA 1YEXA 3MWHA 1BG5A 1K0CA 3DYRA 2IMIA 2EIOA 3GX0A 5ECHB 2LNTA 1RQMA 4EUYA 1TRSA 2H74A 2F9SA 4ML6A 2K8VA 2H0GA 3AY8A 5JCUA 3HHVA 4WR4A 3LXZA 2B5EA 4IQ1A 3D4MA 3M0FA 1Z5YE 1FG4A 4XCSA 2HZEA 2PU9C 11GSA 2KP1A 4L0UA 2YWNA 1N8JA 2E2GA 1XWCA 3GKKA 1B9XC 4X43A 2C8UA 1EZKA 5CREA 1GLPA 4YAVA 1K0AA 2NPBA 2B1KA 4BL7A 5IMAA 1BEDA 1HYUA 4IJ3A 2LS5A 1GUHA 3UJ1A 2C4JA 2FD3A 3QCPA 3IV4A 3IC4A 2H1DA 3ERFA 3F9UA 1H4OA 5LNKe 4X1UA 1GTUA 4HI7A 10GSA 3EURA 4PX1A 1PRXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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