4X22A

Crystal structure of leptospira interrogans triosephosphate isomerase (litim)
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
RKTIIAGNWKMNLSLKEAVFLAHSIREKIPSISKDKVSMVFPSTLHLENVSKILEGSSVIVGAQNCYHSGLAAFTGETSPDQLKEIGVKVVMVGHSERRQFLGESNFFCNDKIRFLLKNEFTVLYCVGETLSERESGKTLEVLSSQIREGLKGIDSVFFSNLILAYEPVWAIGTGKVATPSQAQEVHSFIRKEISGLFVGASSISESISILYGGSVKPDNIQDLLKEKDIDGGLVGGASQKISSFAGLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Connecting Active-Site Loop Conformations and Catalysis in Triosephosphate Isomerase: Insights from a Rare Variation at Residue 96 in the Plasmodial Enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Leptospira interrogans serovar icterohaemorrhagiae str. rga
total genus 91
structure length 249
sequence length 249
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2014-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4x22A00
3L68A 1H7RA 4ONVA 2VFFA 3DHDA 4IMCA 4JEQA 3S9YA 2ZRWA 1TPFA 1MXSA 2DZTA 5HR6A 4Z1BA 5HUOA 3TSMA 3G1XA 3GK0A 3GVGA 1VHCA 5DXYA 2RKXA 4M6PA 1GOXA 3SFKA 4CNNA 3STGA 4RZ6A 2WSYA 1UUOA 4LVGA 2V0TA 3TXVA 4X9SA 4LV4A 2RDTA 1K3UA 3W1XA 5BOOA 1KM1A 1SO4A 3HQ1A 3W74A 3WK2A 2H3DA 1TYGA 3B0UX 3I7SA 4BK9A 4WY0A 3E96A 4Z0SA 4GUHA 1SW3A 1VYPX 1YPIA 3B8DA 1EUAA 3IGXA 4ZQRA 1OYBA 3S42A 3LOTA 4NJKA 3QH2A 3MMTA 1GPWA 3D0CA 5DN1A 4KWWA 2NXIA 1PS9A 3TJLA 1A5BA 1C9DA 1QCWA 2DU2A 1VQTA 4MYXA 3HMJG 2EHHA 2QCNA 4GRSA 1WV2A 4DO5A 3W1LA 1VCFA 1SZEA 1OFDA 3ABOA 3EWUA 2QAPA 3VKJA 1H50A 1O94A 3W7DA 1ML1A 2F84A 5FEWA 3NM3A 3YPIA 4NXSA 2E1DA 3IVUA 5AHFA 2ZA2A 3PF3A 4LS0A 3IGUA 3LHYA 1AL7A 3SSJA 4IPIA 1OVDA 3A9IA 1KV5A 1RR2A 2B4GA 4GFSA 4U4MA 3P5ZA 4M19A 4LWWA 2ZFAA 3BG3A 3S6DA 1G7UA 5AC6A 3DZ1A 4LNYA 1Z41A 3GXPA 1KM0A 4KFPA 2YW3A 4N9DA 3F4WA 1Q6RA 2GQ8A 1MO0A 2EF9A 3HPXA 3UWQA 3FIGA 4LY8A 1XBZA 1YTDA 4CQ9A 3L21A 3PSVA 1FWRA 2P1FA 1F76A 4O53A 5F4XA 3B0PA 5HMSA 3B4UA 5J5DA 3W7NA 1HO4A 1OX6A 4UCGA 1W5NA 2V5BA 3LTSA 1FDZA 4UFKA 5D2YA 5A5WA 2TMDA 1AW5A 5FI8A 3TROA 5G4EA 3CQ0A 4IXHA 3RF9A 3SZ8A 3RLUA 5CPLA 2ZYFA 1K8YA 1Q6OA 1UCWA 3LV6A 3MHUA 4IMGA 5G2IA 4HNNA 1H61A 3M5VA 5DCBA 1G69A 3VI2A 4CCEA 3T7VA 3STCA 3C61A 3QC3A 1R46A 2VOMA 3LB0A 4AF0B 1KFBA 3W73A 3IIZA 2V2DA 3L67A 1BEUA 1AL8A 3W88A 3VE7A 2GVGA 3HG2A 4JGDA 2C13A 2FLIA 3HPSA 4M6QA 3UD6A 2YZRA 4DELA 4PL2A 3MP5A 2ATMA 4HSNA 4HPJA 4WXZA 3T4CA 2B7OA 2FQIA 3FJLA 3W7KA 5I3JA 3ZS4A 1YXCA 3DI0A 4N9BA 3BPWA 3C2OA 3C4UA 5E0KA 3W7QA 4JYFA 4TR9A 3LXCA 1NF7A 1UB3A 4E2DA 2QJIA 3LBCA 2Y70A 5CPMA 4IWWA 1OK6A 1EUNA 4Q4KA 4PEKA 1K03A 2ZA3A 1KW1A 2QR6A 3P82A 2VFDA 3MI6A 3L0GA 2W0UA 3L66A 3M16A 3M1ZA 4O1AA 3AO0A 3QW3A 4UFIA 3LRKA 3DKLA 2DZSA 2ZRXA 3LCWA 4LW7A 3QM3A 1O60A 4K7YA 2YYUA 1VHNA 1JCLA 2ZRYA 4JTKA 3HOJA 2V30A 5KSWA 2H3BA 3MBDA 1F73A 3GXTA 4QISA 2CLIA 4ZVJA 1KFEA 2GJNA 3HGRA 4XTIA 5LGZA 4YCPA 2J88A 4QM1A 3LM7A 4G1KA 4AXKA 1QFEA 1F5ZA 3NQAA 1GVSA 4S2CA 2E5BA 3GIYA 5AHIA 3FYOA 4JNMA 3PC0A 4L4LA 3FS2A 3IVTA 2A7RA 3LDVA 2NZLA 5J5RA 4UIOA 1HTIA 3P5YA 1O4UA 3G3DA 3GAYA 1VJIA 1DL3A 3EWBX 5LHFA 2B7PA 5KZEA 5KZMA 4K36A 2VEIA 4BF9A 3QRHA 5HNRA 3BGJA 3P84A 1PHWA 3DFSA 4MPQA 1K8ZA 3GR8A 1PV8A 3G1DA 5G5IA 2NUXA 4Y6GA 4NJIA 3ATYA 1IGSA 3JR2A 1HFBA 3WJYA 4KFOA 2F7FA 3PUOA 2FPVA 5EY5A 3WJWA 4O14A 2VEKA 4DPPA 3O16A 3C56A 1SFLA 3CC1A 3PM6A 3PULA 3L0KA 2C15A 1KLYA 2C16A 2YR1A 4UTLA 2HTMA 3O6CA 4OWGA 3HB9A 1FUYA 2E68A 3A23A 4UR7A 1XUUA 4UNLA 1SZNA 2XN1A 3VE9A 2WSRA 4LVBA 1F74A 3NZRA 3WFAA 5DXXA 4AH7A 3A5FA 4E38A 3W2KA 5CSSA 3TSBA 3HG4A 3M47A 3UWUA 4BI7A 1G4EA 3M44A 4MY8A 2NUYA 1EWDA 5KTLA 1D3HA 3P8JA 4IXXA 2FDSA 3T40A 2IQTA 3PG8A 2VFHA 3DFQA 3UZ5A 4PCFA 1W3NA 2G97A 2VKZG 5D30A 1F6KA 1CX9A 1QAPA 4WY0F 3W2UA 2RH9A 3U6WA 1M5WA 4IQLA 4XZ9A 3TAKA 2NX1A 3FLUA 4MY9A 3A24A 3FKRA 4RXFA 3Q94A 3OA3A 1A50A 2C18A 4JYEA 1XBVA 1YDOA 3W85A 1NAL1 1QPQA 2NXHA 4HSOA 3S1XA 1Z48A 3UPWA 3KVMA 3THQA 3W1MA 4ZQMA 3NQCA 3EXSA 4Z1AA 4HNVA 4NJHA 4ZQCA 3UWYA 4QIUA 1GJPA 1W0MA 1T8XA 2PURA 4LVDA 2H6RA 5DCEA 3TX9A 1FXQA 1Q6QA 1KTNA 5D2WA 3IIOA 4O1DA 5A8GA 1QWGA 3B0VC 1TTPA 1D9EA 1P4CA 3I65A 1FCVA 1JRCA 5FF2A 1C29A 1GWJA 2WOQA 4AF0A 2VC6A 2PRHA 3IEBA 3M41A 5AB3A 3S1UA 1W54A 2DP3A 3NQGA 2YDAA 3LCXA 4P61A 3WJZA 1G4SA 3W7GA 4LT9A 4N4PA 5T26A 2DZPA 1A5AA 4Z08A 2Z1BA 5FEXA 3UZJA 1KM3A 1Z42A 3CM4A 1OF6A 2CLEA 4HNUA 4GJ1A 4GUJA 2QCDB 1DHPA 3ZWTA 2Y7DA 4OU1A 3RK8A 4JX5A 3CTLA 5K2ZA 1W3TA 3TJXA 5D09A 1ADOA 2Q8ZA 1ZALA 3MI2A 2ZBTA 4JICA 2GQ9A 1YYAA 1FDJA 1NEYA 2ATSA 1OFBA 2CFFA 1BWKA 4TMBA 6TIMA 3NA8A 3TQ0A 3MYOA 1S5WA 4AB4A 5EMUA 4MUZA 2W6RA 2A6LA 3G22A 1O5KA 1VCVA 3L65A 3N73A 4BFAA 1YDNA 3CLMA 3OVQA 1PCKA 3W22A 3TUUA 3W7JA 4K7VA 3CEPA 2E6AA 1FXPA 1OFAA 3QW4B 1KM4A 2AGKA 3TXZA 2H8XA 1H63A 3O15A 4N9EA 2NUWA 1A5CA 4DQWA 1PVNA 1QNVA 4ADUA 1V7YA 3NQVA 1SU5A 3HO8A 1YLVA 5BRBA 5EPDA 4N9CA 2J9YA 3TW6A 2BZNA 2DZUA 1H7WA 4FEZA 1G67A 5G2HA 1JR1A 4MZ8A 3AJXA 4JTTA 4UFHA 3PBUA 5DELA 1DORA 1OFQA 1TV5A 3CHVA 3W7HA 3IGSA 3PB0A 4WX2A 4Y90A 5FF7A 2QDHA 3LCFA 4ZQPA 1VLIA 1ZAIA 1SZFA 2BTMA 1LRTA 4JDBA 4DEFA 1ICPA 1KA9F 1L6WA 1FQ0A 4ADTA 5HQEA 4BWLA 1RZMA 5BW6A 3TFXA 4Q33A 3TA6A 5LGXA 2ZTKA 3NPUA 3PS7A 4XUGA 2ZZ4A 4WQ6A 1ALDA 4FO4A 1OFEA 1EP3A 1RQEA 3OIXA 4O17A 4JD4A 1OG0A 4AHOA 4FHAA 4OE7A 3LCGA 2C0AA 2OT1A 3GDRA 4S2BA 1W1ZA 4YL2A 3UNDA 1LOQA 2FIQA 4JTIA 5FF3A 4NQ1A 3HG5A 3N14A 5FESA 4JY8A 4K8EA 3O8AA 2OT0A 3W1NA 4Q32A 1X6UA 3W6YA 4ALDA 2JKEA 5ABTA 3OBKA 2YX0A 3QEZA 4I7UA 3LLDA 1AW1A 4UTTA 4NNAA 1TTIA 3QZEA 3O07A 4UUIA 3MP3A 3N9RA 3FOKA 2OX1A 3NQ6A 4O18A 4AEOA 2R94A 2Y89A 3W7IA 2Q8LA 3NL6A 4ZQOA 3SW6A 3O63A 4UFLA 3GDKA 1JQVA 1GQNA 1M7PA 3EEGA 4RJEA 3UYCA 1JULA 3Q37A 3W7MA 4JTFA 3BLIA 3PWAA 3W07A 3TH6A 2Y88A 1W3IA 1SZGA 4Z1DA 2PE4A 1G4PA 3W1TA 5AHNA 3DENA 3E02A 1FBAA 1ICSA 1TPEA 4JY9A 2X1SA 4WD0A 1TPH1 2QKFA 2QUTA 3H53A 4WJEA 5DY2A 5FF0A 3DH7A 5HJLA 3LXAA 1GYNA 2ISVA 4JIQA 4FNSA 5CPOA 4XQ6A 3E12A 1R30A 4E2BA 2Y6ZA 3TSDA 1I2PA 4IMEA 3G8EA 5HWJA 1XDMA 3FA5A 4O57A 4UMCA 1LOSA 1FY6A 4QNWA 3QMSA 3W7EA 3NPWA 2EGZA 3P61A 4X22A 2UV8G 4C1KA 4CQAA 4UC5A 4O54A 1JCJA 1H7PA 5LNUA 2YSWA 5K9XA 1S5VA 5D04C 3W3OA 4R34A 5KZDA 3NL3A 2WKJA 1WBJA 1FCBA 2A7PA 1SSDA 1X8FA 1UUMA 5AYYA 2NWSA 1RQHA 1JCNA 3W2LA 1ZJIA 3KVJA 1X1ZA 2X2GA 4TU1A 2QCDA 3GB6A 3T78A 5F2GA 1WOBA 2WPBA 1EP1A 8TIMA 3LRMA 5AC7A 1I45A 1Q6LA 3G0UA 1XKYA 2CZ5A 3NL2A 4RZ4A 1IXQA 3TR2A 3GLCA 3LTYA 2CLHA 1QR7A 3NVTA 1GT8A 2A4AA 3TIMA 1HO1A 3EX4A 6ALDA 2Z2UA 1TPUA 2B7QA 3UWZA 1X1OA 4LC8A 4UTKA 4TX9A 3G1SA 3KXQA 3GDLA 4IMFA 5HWMA 3TMLA 2H90A 1H5YA 1LBLA 1OFOA 2ZZ5A 1AW2A 2RDUA 2C19A 4MKNA 3P60A 3M0ZA 4GE8A 1VH7A 1ZCOA 3EWXA 3QPZA 1KTBA 3SGZA 3PBWA 3TC7A 1R2RA 1TPC1 5L9FA 3USBA 3W83A 3VNDA 1GVQA 5HR7A 1U5JA 4UTWA 5CZJA 4A2SA 1MEWA 5K3VA 3GDTA 1GG0A 1LORA 3OEXA 4NNBA 3G1YA 4MZYA 4RXGA 1UASA 4MLRA 2YGYA 2FPTA 2Y7EA 4LTSA 2TYSA 3I7QA 5GVJA 4YXGA 1QDSA 1EB3A 5TIMA 3B04A 3WK0A 3PSWA 4ZQNA 3R12A 5DBUA 1MEHA 4UR8A 2QAFA 5I3GA 5C5YA 1B3OA 3F1QA 4FXRA 2DORA 4CNOA 1SO3A 4FF7A 1W31A 1UJPA 1KFJA 4UTWC 1ONRA 2PRMA 4YWIA 4GUIA 3PBVA 3NGJA 1FWNA 3KFTA 1L2UA 2ABBA 4A2RA 4NXKA 2E77A 5D32A 4PODA 3UPBA 5K4ZA 4O1CA 1R2SA 3ZR4A 2A1YA 1VPXA 1VLWA 2P0OA 3W7OA 1JCMP 4I7WA 5E93A 3P81A 3BW4A 3TKFA 2DJLA 3LI0A 2JBMA 2CZDA 2GOUA 1PE1A 3ELFA 2I9EA 3SGUA 2X30A 1EIXA 2QCHA 4ML9A 4J9JA 3E0IA 3W1UA 1ZAHA 3PUEA 1X7FA 3B06A 3DAQA 4MVAA 2ZZ3A 2EAWA 3OG3A 4GXMA 1W56A 3GYEA 3TQKA 2GQAA 2YPIA 3TAOA 2QCGA 4LRSA 3S5OA 5K7JA 3BO9A 1W8SA 2EPHA 3KX6A 1VRDA 2VFIA 3TE9A 2LLEA 2BXVA 3LHUA 2ZRVA 5I3HA 4DBEA 2RHGA 3INPA 1TB3A 5IM51 1ZHAA 1BTMA 1GYLA 4KWVA 1WDWA 1M6JA 1MZHA 1SW0A 4OHQA 1TV7A 1TRDA 3W1QA 3LI1A 2J24A 2TSYA 1QOQA 3NPXA 4NX0A 3W86A 5F2LA 3STFA 1GEQA 2A5HA 3TFCA 1LCOA 2CLMA 2QJHA 2Y7FA 3GX9A 4H6KA 1VR6A 1FCUA 4QJ1A 4U28A 5TBOA 4ADSA 1MSSA 2GUUA 4LC6A 1NFBA 5K4XA 1U83A 4I9AA 3PUDA 3FKKA 1C8VA 1YXDA 1EX5A 1KBJA 1SR9A 3G1HA 2XFWA 3P80A 1UBSA 4E0CA 2NX3A 5U7SA 1GTHA 1LROA 3GNNA 4O4VA 4X2RA 4R7JA 3QPYA 5LHEA 3DBPA 2QJGA 4OGZA 2VEPA 1N8FA 1JUKA 4TO8A 4QNEA 2YFNA 4O1BA 1AK5A 1YDVA 3KRZA 3ABQA 3NQ2A 2HS6A 1LBMA 4DPQA 1R2TA 3EWZA 3W1AA 1JQXA 4MZ1A 1PHQA 5F2IA 1JUBA 4UFJA 2V5LA 1ME7A 4HHPA 1J2WA 2OCZA 2GVJA 1J4EA 1KM2A 1MEIA 3NO5A 1LM1A 1LRQA 5L6UA 4L4MA 1QO2A 2YFOA 1GVOA 3ZWSA 1ZAJA 5D02A 4PA8A 5K9CA 1TO3A 4IX2A 5HUPA 1DJNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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