4X2NA

Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
303
structure length
303
Chain Sequence
GTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Selection of fragments for kinase inhibitor design: decoration is key.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
total genus 101
structure length 303
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2014-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4x2nA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4x2nA01
1UKIA 3H0ZA 4JS8A 4EOMA 3IDBA 3SLSA 5DI1A 4EBVA 4IX3A 3NW7A 3RHXA 2WMAA 3QTIA 4FKLA 4YZNA 4JRVA 5I9YA 2DWBA 3LXNA 5ANIA 2X4FA 1JVPP 3C5UA 4GSBA 3BRBA 4L6QA 3QA0A 4AA4A 4ALWA 4F70A 5IH4A 5IMXA 3T3UA 3NCZA 5JT2A 5FG8A 2Y4IB 4QMOA 4YJSA 4Y73A 3V8WA 3FZRA 2YDJA 3VS1A 2BPMA 3HNGA 4IW0A 3DBFA 3P5KA 4F99A 4R78A 1ND4A 2C5OA 3PZHA 4L00A 1U59A 2A1AB 2J0LA 4FNZA 5EM5A 5A6OA 3ZFYA 4EORA 1REKA 1V0OA 3RI1A 4Y83A 3MYGA 5DR6A 1R78A 2CKQA 2EU9A 4YZDA 3BYMA 5JMSA 1OECA 1XQZA 3KXZA 3MA6A 4J95A 5DEWA 2VTRA 2PK9A 4ZK5A 1NXKA 3QHWA 3EQDA 4ANLA 5CVHA 2IZRA 5HU9A 3LFCA 1G8AA 4YGAA 4RX8A 4DBXA 1K3AA 5AV2A 5CQUA 4QO9A 3S4QA 4AOIA 4E4NA 3TUCA 2BCJA 4GJ2A 5C01A 2XIYA 3GGFA 4RLLA 4BCNA 4DC2A 1B39A 4MXXA 4BHNA 2HWPA 3IW5A 2XRUA 3DJ5A 4L43A 3LE6A 1ZOHA 1XH4A 2FGIA 4OBQA 4X7QA 5BQ0A 3NZ0A 4E4XA 4DGNA 4EQCA 1RW8A 3R7VA 4C4JA 4LGHA 4BZNA 4EOLA 1MQBA 5HTBA 2G01A 5K3YA 4FIGA 3FZPA 2PVJA 3Q4UA 3KRWA 5KZ0A 4ZSGA 5HD4A 1Y6AA 2YCSA 3HV4A 2Q0BA 4RGJA 5FEQA 2QR8A 4MAOA 4B0GA 2RSVA 4A4OA 4CYJA 1WCCA 2BIKB 4ZTRA 2PYWA 2W4KA 5IQEA 4HCUA 3FQEA 4OUCA 5LJJA 3QLGA 5AR7A 4HZRA 1UU9A 4CCBA 2OJJA 2BZJA 1KE6A 3FMLA 4V01A 3ULIA 2GQGA 3VS2A 4TZRA 5EH0A 2E9NA 3C4CA 1YKRA 4HCVA 3HRFA 2P2IA 3SOAA 3U54A 5FDPA 2JAVA 4FT3A 3HMIA 2CCIA 3VUDA 3OCSA 3QQHA 4U79A 3VW6A 3R6XA 4I94A 4MD8E 4CFXA 3F2RA 4O86A 3H10A 2VX0A 4G9CA 1YHVA 4YJQA 3O2MA 1WBOA 1PYXA 2DS1A 4YJPA 5K0XA 2RGPA 4IACA 4I6FA 5ETAA 3C13A 5GJDA 3E93A 1ZYLA 3KULA 1T46A 4YZ9A 5ANEA 4F9WA 2UVXA 5JQ8A 3GOPA 3P78A 4GFGA 2X7FA 3G5DA 5J9YA 4Q5EA 4R1YA 3ZBXA 3DCVA 3GC7A 3RCDA 3KK8A 5GINE 4YC3A 3U4WA 5EQPA 2JDTA 3MWUA 4NCTC 4I3ZA 3TJDA 4R7BA 4C59A 5LVMA 3GENA 1R0EA 2WMQA 5HU3A 1FBNA 3PDTA 3WYXA 4FSMA 3R2BA 1H27A 4M15A 4USDA 1PXOA 4ASDA 3HP5A 3OT3A 3WF5A 2W9FB 3HLLA 3N4VA 2PZYA 1L3RE 3NYVA 4ZSJA 2J5EA 4EKLA 3DY7A 2EWAA 3HKOA 3JVRA 4A9RA 3RMFA 4O2PA 4F7LA 3QKMA 3UMXA 2ONLA 2FSOX 3DAKA 3E87A 4RJ5A 1DI9A 4RWJA 4KIOA 2OBJA 4JQEA 2HXLA 1Q8ZA 4A4XA 1MP8A 3NYNA 5AX9A 2X4ZA 3BCEA 3P9JA 5EW3A 4WG3A 4QYEA 4QP2A 4I92A 2J0KA 4RIYB 2C6KA 3QX4A 5EYKA 1PMEA 4ZTNA 2VWZA 2YACA 4IM2A 3LCKA 1NA7A 2BHHA 3MPAA 4U44A 3CJFA 3HV7A 4FSNA 4RFZA 3RZBA 1SNXA 3MJ1A 4EC9A 3QQLA 4FT9A 5ETIA 4AF3A 3VNTA 3W55A 3QTQA 4FTLA 4TTHB 4NT4A 3R71A 5C4LA 3R7UA 1CSNA 3DB6A 2F57A 2CGXA 4RA5A 5GIPE 1PXNA 4KIQA 4O7RA 3GU8A 3I4BA 3DBCA 2BUJA 4K6ZA 3U8WA 3DV3A 2OG8A 4G3DA 5CANA 5I9WA 5CZHA 4U7ZA 4B99A 5FWKK 4WKQA 4FKGA 5E90A 4BTJA 4FTNA 4WNKA 4X2NA 3Q3BA 5IH6A 3POOA 2AC5A 4DG3E 3ORPA 3IG7A 5EDPA 5E8UA 1U54B 1U4DA 4LOQA 2BIYA 4HJOA 5ETCA 5CXHA 3B2TA 3MN3A 3U9NA 3WF8A 4UWYA 4UV0A 3HAVA 3QC9A 1L8TA 4H3PA 2PUPA 2VV9A 4G6LA 3TZ8A 4DEGA 4U41A 2W1EA 2WMTA 3OD6X 4PL4A 4AZEA 3UO5A 1KV1A 3FMDA 2XNOA 4BCGA 5C1QB 3Q5ZA 1CKIA 3R83A 1O6YA 4HGLA 2W96B 2LAVA 5M44A 5AV0A 4AN2A 2G2IA 3KXHA 4QQCA 1PJKA 4EJNA 5IQAA 3PA4A 3EZRA 4HNIA 1SNUA 3UOHA 1SZMA 3VS6A 3GCPA 4J1RA 2YIQA 4BDFA 4MYGA 4OR5A 4QMWA 4RQVA 4CRLA 4L67A 4E5WA 4E5AX 5LMAA 5CAQA 1GZNA 4O1OA 5FM2A 2GNIA 3A7HA 2ITYA 3DKOA 3MESA 1S9JA 2ZDUA 4XMOA 4X3FC 5KBRA 4O27B 4OTGA 4IAFA 4DGMA 4I1ZA 3QD4A 4XG4A 3VQHA 5BYYA 2UUEA 4UZHA 1P2AA 5K4JA 4D55A 2PUNA 2R3PA 4QYHA 4QMZA 4TYHA 3ZFMA 2CKPA 5F20A 4EONA 3HDMA 2VTPA 3HL7A 2HWOA 2E9PA 4CFWA 3AT2A 4FODA 2OH0E 4FT0A 4BDBA 2BZKB 5CEIA 2VD5A 2J51A 3Q52A 1W84A 3DBQA 2XBJA 3VUTA 3IS5A 4CV9A 2R7IA 2W06A 1Q8WA 2B53A 1KE9A 1ZLTA 3E8CA 4FV2A 5DR2A 5CF8A 5L6OA 3LM0A 5IQHA 2CHLA 4CEGA 3Q2MA 1H08A 3BBWA 1NT2A 2WMWA 4NH1A 2VTOA 3MFUA 3R04A 1CDKA 4J8NA 4P2KA 3CGOA 4M0YA 4F0FA 2ZOQA 2WO6A 3E64A 4S33A 3R8UA 1BYGA 4HYHA 5CF5A 3GUBA 2ETKA 1Q41A 5CVFA 5FDXA 2OFVA 3HMOA 5IISA 3QTZA 1A06A 1BI7A 4K9YA 4FKVA 5CALA 3HRBA 3PE1A 4RIWA 4JBPA 4RLKA 4UB7A 3TWJA 5DN3A 5JFSA 2W1ZA 3QD3A 4OTIA 1UU3A 1K9AA 2VNYA 3BHUA 3FI2A 4N6ZA 3WIKA 4ASEA 4DH5A 2IVVA 5F1ZA 4FICA 3QRIA 2ITPA 3FQHA 2VTLA 1OKZA 3OXTA 2OIQA 4UALA 2C5NA 3DTWA 3MTLA 3TZ9A 3NW6A 4FX3A 4XP0A 2XK4A 2J0MB 3UNJA 4FK6A 5EM6A 2GSFA 3VBYA 2UV2A 4MH7A 3P7CA 3PIXA 4TRLA 4EOJA 2CDZA 4NM0A 3ANQA 2Z7QA 3EKKA 2ZV9A 3V5QA 2WTCA 4DLJA 2QO7A 3R8VA 1JKSA 3NS9A 2VTNA 2JGZA 4O82A 4WNPA 1AQ1A 5AR2A 4BCHA 3HYHA 5JH6A 3EZVA 4RC3A 3AGMA 5KO1A 5J8IA 5JRQA 3AC8A 2R3HA 2GS2A 3NNXA 5J1VA 3G33A 3F3WA 3C4EA 4FTAA 3ODYX 4M69A 5EOBA 4XX9A 4DCEA 2FSTX 3A7JA 5I9XA 4DEHA 4L46A 4DA5A 2EXCX 4FKTA 5C8KA 4HOKA 5KHWA 3UQCA 4O38A 3P1AA 3VULA 3PVUA 5EKOA 4AXAA 4FZ7A 4D2VA 2UW8A 4NIFB 2YM3A 3PJ3A 3PP1A 3QUEA 1B6CB 4LFIA 4E1ZA 2PZPA 3OC1A 2ETRA 4RFMA 3OF0A 4V0GB 4FF8A 4QQTA 4FSQA 4GU9A 3UIXA 4EEVA 5G6VA 4BDHA 2XYUA 2HAKA 5E8ZA 3E7VA 3E5AA 4E26A 4IC7A 2P55A 5TF9A 3TXOA 4KIKB 4CD0A 2YEXA 2J90A 4IB3A 4F6UA 4F63A 4APCA 1DAWA 4EH4A 5IMEA 2ZV2A 5GIOE 3GB2A 3GP0A 5HLPA 5L8LA 3CLYA 3V5WA 4AFJA 2I0YA 4LMNA 2XUUA 4EH6A 4CZUA 3O0GA 4JL9A 2PE2A 2R7BA 4WIHA 4YJTA 5HO6A 4D4RA 4C34A 2EXMA 5DG5A 5CSPA 4IANA 2OZAB 2PZIA 2UZWE 4S31A 2B55A 2CJMA 4P7EA 5JFXA 2IG7A 3SDJA 1M17A 3KC3A 4XV9A 4ZJJA 1W98A 5IZFA 1Q97A 2CPKE 4B8LA 5DFPA 5M55A 5HIEA 5A14A 2I0EA 1EH4A 3KVXA 4HGTA 3ZLYA 1ZZLA 3FLWA 1E1VA 2BZIB 4Y5HA 4YLKA 4FEXA 4U45A 2A0CX 1AGWA 4C4EA 4FIIA 1HCLA 4KIPA 3FL4A 4FZDB 4WG5A 4ASZA 3G6HA 3MGYA 3FYKX 3NGAA 4FVPA 3SXFA 4CTBA 2PUIA 5M4FA 1M2RA 1BL7A 3WILA 1SYKA 3MPTA 2KULA 3Q9YA 5FLFA 3UO6A 4AGWA 4EOKA 3KMWA 4FEQA 1IAJA 3E88A 5BMMA 2XKDA 4YSMA 3IDPA 3QKLA 1H1RA 4DFXE 4K18A 3F3UA 5BVFA 3D4QA 2YM7A 1XWSA 2XEYA 2Y4IC 1FVVA 2FUMA 4EBWA 4UY9A 1BX6A 2W05A 3ET7A 3F69A 3NNUA 1OI9A 1XH6A 1Y8YA 4YO4A 2BRHA 4W4VA 5A46A 4JLCA 4R3PA 4CZYB 2WMRA 2X9FA 4UYNA 3TM0A 3SG9A 3TUBA 4BY9E 4HCTA 4DEAA 3F9NA 4LM5A 3ZXTA 2UZTA 4AOJA 3CQEA 1OITA 2F4JA 4PX6A 3WZUA 3NUAA 4OW8A 3TV7A 5HG7A 4HVDA 3VJNA 3ZLXA 3QRUA 2PVKA 4LUDA 3OCGA 3A7GA 1H28A 2GHGA 1O6KA 3PVBA 2WAJA 1ZYJA 2JFLA 2XK7A 3IONA 4D1ZA 5K5NA 4O7ZA 5AADA 3RP9A 3NAXA 2QOOA 4QP8A 3P08A 5DH3A 2PVHA 3IO7A 3ZO4A 3E7OA 3PPZA 1Y91A 2IVUA 1ZMWA 4IX6A 3V8TA 3SXSA 2ZB1A 4GUEA 3TNQB 1ATPE 3FZTA 3NUPA 4IAAA 2QOKA 5HVYA 4OLIA 4S34A 4EH2A 5HCXA 4BRXA 4DTAA 4BR3A 3BYUA 3BYSA 4XBUA 2ITXA 3TJCA 4RVLA 5BVOA 3A2CA 4BCOA 3K5UA 4L8MA 4L3JA 4E4LA 4ZLZA 4PDPA 3VS5A 2X8IA 2PULA 3SGCA 4FTMA 2P2HA 4Q2AA 4Y85A 1W83A 1PMVA 4BBEA 2H9VA 2OIBA 3V8SA 3TACA 3TDVA 4AN9A 2WQEA 3B8RA 3EN6A 4FT7A 4IFCA 4NSTA 4UBAA 4E6DA 5AP5A 3SV0A 1OBGA 4D9UA 5KE0A 4IZAA 4Y5QA 3PVWA 3C4XA 3O71A 3LXPA 2W17A 4TWOA 4EQMA 1BUHA 2IW9A 3WOWA 2BDFA 5CNNA 4TY1A 4QTAA 5FGKA 3M11A 1Q4LA 4L52A 4N6YA 1JSVA 4WBBB 5DWRA 3TI1A 3ZLSA 1YRPA 2WTKC 2YIYA 1REJA 1WBWA 2E9VA 3FMJA 3ZCLA 5F4NA 3K3JA 4FKUA 5FUTA 4FTOA 4RPVA 3ZM4A 2B0QA 1WVYA 3D14A 4ITIA 4QTEA 2X8DA 4IWPA 2V7AA 4LGGA 3OZ6A 3B2WA 4PNIA 4CMOA 3VJOA 1PKDA 4JJRA 3EYGA 2C5VA 3OUNB 3PA5A 4I5PA 4XG2A 3F82A 3I5ZA 2UZVA 4FMQA 3O96A 5LCKA 2F9GA 4ENYA 5L2WA 1H26A 4LGDA 4GT3A 2GU8A 4FNWA 1H1WA 4DFZE 3MA3A 2X7OA 1H1QA 2PMNX 4YJUA 3U9CA 5CAUA 5HG8A 2UVYA 1JLUE 4FV3A 5JKGA 1BKXA 3NLBA 1STCE 2JBPA 3QTWA 2A2AA 2X0GA 4PP9A 5AIKA 4FYNA 5D10A 3Q4TA 1TQIA 5LWNA 4WHZA 4XP2A 3UNKA 4KS8A 4ALUA 3HMMA 3VF8A 1PRYA 5M07A 4MF1A 3UIMA 4MEDA 2C4GA 4IZ7A 4DG2E 3PWYA 4EHGA 1FPUA 2BFXA 2CKOA 3PIYA 2X2MA 2FO0A 3KK9A 4C33A 4DTKA 4EOPA 3NVKI 4NFNA 4AFEA 4YUQA 3TN8A 2UW0A 4H3QA 3DFAA 4I0SA 3BGQA 2GNHA 5DR9A 2JIUA 3QALE 4KD1A 3RTPA 4C57A 4ORKA 5E1SA 3OEZA 1A48A 4OBOA 2OIDA 5H8GA 4YO6A 3NW5A 5BVEA 3MIYA 4D1XA 4FE2A 3OHTA 3R1SA 3PG1A 4CNHA 3DLZA 2QCSA 5L2IA 5CF6A 2B4SB 1KV2A 1F0QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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