4XBSA

2-deoxyribose-5-phosphate aldolase mutant - e78k
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
LTTEQLAKYIDHTNLKADATEADIKQTCDEAKKFNTASVCVNSYWIPFVTEQLKGTDVNPIAVVGFPLGAMATESKIFEATTAIDQGAEEIDMVLNVGELKGGNDEKVLADIQGLADAVHAKGKILKVILENALLTKDEIVRACQLSEKAGADFVKTSTGFSTSGAKVEDVKLMRETVGDRLGVKASGGIHSREEALAMIDAGASRMGVSATVAILT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Efficient synthesis of a statin precursor in high space-time yield by a new aldehyde-tolerant aldolase identified from Lactobacillus brevis
doi rcsb
molecule keywords Deoxyribose-phosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Lactobacillus brevis atcc 14869 = dsm 20054
total genus 91
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.4: Deoxyribose-phosphate aldolase.
pdb deposition date 2014-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4xbsA00
1F05A 2BSLA 3QW4B 1ZY9A 2A6LA 4CCEA 1OG0A 3FA5A 1KW1A 4DO5A 2V5BA 1KV5A 1DHPA 4RZ4A 3NDOA 1SZEA 2NWRA 2DU2A 3OA3A 4UMAA 4RXGA 4TMCA 2VC6A 5HUOA 5AC6A 3TJLA 4UFJA 4C1KA 2H8ZA 3MBDA 5C6MA 1JUEA 3O6DA 5HWNA 3UD6A 2PURA 5F4WA 4Y9AA 2Z2UA 3C2RA 5LKYA 4UFKA 3Q37A 2QCHA 3BVJA 3TAOA 3DHDA 3F1QA 3W85A 4FIRA 4DXVA 1O4UA 3NO5A 2DZTA 4LT9A 1OJXA 4IMDA 3BW3A 3HGRA 1SZGA 1PL9A 3NQFA 3G0UA 1FUYA 1ME7A 2G97A 4JTUA 3DFOA 1FWNA 3U8GA 4ORIA 2TPSA 1SW0A 4HSNA 1WBJA 1ZENA 3NZRA 4YL2A 5IBXA 1F5ZA 1FCVA 1PHWA 3LCGA 3BG3A 2NUXA 5EL1A 1GQNA 5G2WA 3DH7A 2FB2A 2I14A 3T7VA 3C2FA 3A23A 1JQXA 2RDTA 2VFGA 3W1MA 4DQWA 1T99A 4IMEA 4IXHA 3QW3A 3I7SA 1QWGA 1ONRA 1YTKA 1O60A 4RV8A 4A22A 4O57A 1H7NA 4GE8A 5BW6A 3VE9A 1LRNA 1KLYA 4CNOA 1VCGA 1ML1A 3W7CA 3TV8A 2E5DA 4O28A 1CI1A 3M16A 3M0ZA 3U6WA 3GZ3A 3W7JA 3RK8A 1FXPA 1VYSX 1IXNA 2XN1A 1B3OA 1M6JA 3NM1A 5FF7A 1KTBA 3PR2A 2GVJA 1F76A 1HFBA 3BLFA 5D04C 1UUMA 3CPRA 2QDHA 4JGDA 3TFCA 2RDWA 3BLIA 5CSRA 2E77A 2HSAA 3IIOA 3PBVA 1H50A 3L66A 1DQXA 1IIHA 3ABOA 1VS1A 3W07A 1DKWA 3SECA 4FB7A 1I2PA 2BWGA 1JVNA 3RNDA 5U4NA 2DZUA 3CM4A 4N9CA 1K3UA 1I2QA 1W37A 4DF2A 1W56A 3TC6A 1SO5A 3UXDA 3VKJA 3ZWTA 1HTIA 1O5KA 4X3ZA 3EX3A 1VCVA 1RQEA 2QKFA 4FNUA 4IGHA 1JCYA 5D30A 1J5TA 3AJXA 2GVLA 4Y8FA 4MYAA 5DCEA 2NLIA 1LOQA 5BOOA 4Z1DA 3UWWA 3AO0A 3LHVA 1W54A 1Q6LA 3G3DA 1W5MA 3NL6A 3BG9A 4U4MA 1JR1A 2BZNA 4GBUA 2J9ZA 5G2IA 1G4TA 3TMLA 2ZRYA 2H8XA 4GFSA 3KRZA 3MO7A 1YTEA 3DFTA 2WKJA 2VEPA 3NQ2A 1H1YA 3DZ1A 3VNDA 3USBA 4DELA 4GJ1A 3GK0A 1F73A 2CLEA 2G95A 4O1DA 1GJPA 2WJZA 2DP3A 5F2LA 3QRHA 3SI9A 3C2OA 1XDMA 5K4ZA 3LHUA 4UTWA 1DL3A 3LHZA 3W84A 1XKYA 3NPVA 4JY9A 5D2WA 1SSGA 4NX5A 3P81A 4LC6A 1RV8A 4UMBA 3E02A 3PB2A 3A9IA 1OYBA 2C19A 2LLEA 4O16A 3LV5A 1OFBA 1TREA 2A1YA 5I3JA 2X2GA 3S1XA 3MW7A 2ZRWA 1I45A 1AK5A 3TA6A 3W7RA 2CU0A 2OCZA 4IXXA 5IBXC 2CLOA 3GDKA 1AL8A 2Y7FA 4X9SA 3MI6A 1LCOA 4ZQMA 3CWNA 1QOPA 4FXSA 4QNWA 4MUZA 4NU7A 4HNVA 3NPWA 2GQ8A 2VOMA 4UFIA 1MO0A 1JCJA 2QUTA 2ISWA 3TMQA 4FNTA 4WOZA 5H91A 5KINA 3G1SA 4IUOA 2V2CA 4OV4A 1L6SA 4N9BA 3IVTA 4I7UA 4LOCA 4JDYA 2DJLA 4Z1BA 2Y63A 1ICSA 5L9FA 3NQ6A 4UUIA 1TPFA 4CNNA 3WJSA 1Y0EA 2YX0A 1A5SA 4HPXA 4I9AA 1WOBA 1RQHA 3MUXA 2QAPA 1K02A 4K6AA 5FEPA 3OVRA 2NX1A 1B4KA 3MBFA 4N02A 3QEZA 3DFQA 4Q33A 2PCQA 3UQNA 2A7NA 1DOSA 4CNPA 3WJYA 4K37A 2V8ZA 1NAL1 1LYXA 2NXHA 2C13A 1WAUA 4IMGA 3T55A 3DGRA 1ZNNA 3LI1A 3HJZA 5BMWA 2WSRA 5DLCA 2WNZA 4YLWA 2VFIA 4O18A 3FYOA 4WUIA 2GQAA 5DBTA 3PUEA 3L0GA 4BI7A 3NQMA 1QPNA 3B03A 1UJPA 4WY0B 5BNKA 2Y62A 3GNNA 1OF6A 1KM3A 1L6WA 3K30A 3G1AA 4A2SA 3NEVA 1QOQA 3NL5A 3G8RA 4RCXA 2FJKA 5TBOA 4XTDA 4GXMA 2J88A 4IMCA 1OYCA 1V5XA 5AHNA 2FB3A 4AXKA 4XKYB 4XTIA 1NFBA 3P80A 5CZJA 3EWXA 1LRTA 3EXRA 3QPZA 1P4CA 2Q3OA 4MVAA 1LBFA 4O50A 3GKFA 2V9DA 4JTSA 4UCGA 2R8WA 1Z42A 1TQJA 1XBXA 3W7DA 1P1XA 3S9YA 4Z1AA 3GAKA 3O63A 1EB3A 1TSIA 1OX4B 2WO5A 3WK0A 4TMBA 2WNQA 4O4VA 2JKPA 2W0UA 3LCIA 2FFCA 3LM7A 4JS3A 2JGQA 2ZA2A 5C5YA 2X16A 4NNCA 5EBUA 4UTWC 3RU6A 4IWWA 2Y88A 1H5YA 3OHIA 1Z48A 2GJNA 3N73A 5K2ZA 4XBKA 3W7HA 1F6KA 1TV7A 1BWKA 5HJLA 4JTKA 4NJHA 5C2XA 1ZCOA 4FHAA 4JICA 3TW7A 3DU0A 3M5YA 1VHCA 1EIXA 3A5VA 3UZ5A 2J9XA 2YCEA 5LNSA 3BARA 2I1OA 1W1ZA 3GIYA 1YDNA 4M7TA 5AOUA 3A5FA 2DORA 3LCLA 2F7FA 4UXDA 1KFEA 1DORA 3NQAA 4JD4A 1X7FA 2YSWA 3KVJA 3L5LA 4Z0SA 3EXTA 3Q94A 3W2JA 3QSRA 4FX6M 1DJNA 2CLIA 2CZEA 2VFHA 3I6RA 3TC7A 4UNKA 3SGUA 3TIMA 3UPWA 2V5LA 4O0ZA 5I3IA 3IEBA 4K38A 3UWYA 1H62A 3M5ZA 3LXCA 4JTFA 4JTHA 3W1RA 3S1UA 4Z08A 1EA0A 1JCLA 3TSDA 3HPXA 5K4XA 3L21A 2E6YA 2ZYFA 5HWJA 3IIPA 5FEZA 1N8FA 3P7YA 3G1FA 1FDJA 2YGYA 3THAA 3L68A 2NV2A 4WX2A 3LERA 1OK4A 5CSSA 2QAFA 3W3OA 4JN6A 5EYWA 2V81A 3IGUA 5KZMA 4DO6A 4KKXA 1IXOA 3CIWA 3L2IA 4HNTA 1K03A 4FNRA 4WZHA 5FI8A 3W76A 3W86A 5AC7A 2ZDRA 4TX9A 4LUJA 4LS0A 4KFNA 3G0SA 4MLJA 3O06A 4M5PA 3B04A 4AB4A 3QFEA 3JRKA 3UXAA 4TU1A 3OVPA 2J27A 1TRDA 4AF0B 2CZ5A 3EWWA 4YWIA 1C8VA 2QUUA 3EB2A 2X1SA 1TPDA 1TPVA 5K9CA 2KZHA 4OV9A 3STCA 1UB3A 4MZ8A 1RQBA 4O1CA 1I2RA 2ZRXA 1XBYA 5AB3A 2Y7EA 5FF3A 4RR4A 4I7WA 3W7KA 1SFJA 1I4NA 3C6CA 3LXBA 2JBMA 1L6YA 1T0OA 1EUNA 1M7PA 2Q3RA 3PC0A 1W5PA 5DELA 3NA8A 3DKJA 3FKRA 3C56A 4KWWA 4OHQA 4O1AA 1PCWA 1JQVA 2DZVA 3DFSA 4N6FA 1X1ZA 3MI2A 3W1AA 5MHBA 1YPFA 4ZQOA 3LCXA 3I68A 4Z0JA 4RZ6A 3W1NA 4RXFA 3IV3A 1PIIA 2E5CA 4U28A 5GVJA 2XN2A 1H63A 3HG4A 4GUFA 3F4WA 3P74A 4K8HA 3M9YA 2FPVA 1F6PA 3T78A 3HB9A 4ZQPA 3W72A 2ZZ7A 4JYEA 2QCCA 2YW4A 5K3VA 4WOQA 4Y90A 1XBZA 1X6UA 3R8RA 5KZDA 1TIMA 3DKLA 4ZQNA 1QMLA 3OBKA 5FEWA 3W1PA 2X1RA 4ZZ9A 2YW3A 1SPQA 2QCDA 1GYLA 1GG1A 3G0XA 2ZZ3A 1G7VA 3DFNA 3IGSA 1HO1A 4A2RA 4EF9A 1AMKA 2QCGA 1BKSA 3F03K 3TUUA 5KMYA 3M5VA 4NJGA 4MJZA 1E51A 2Y7GA 4O14A 3LRMA 5I3KA 2DZXA 4IQLA 2WSQA 3O16A 3IIXA 2ISVA 3GX9A 4MKNA 1MSSA 2RFGA 2OX1A 1EP3A 3E0IA 4IJBA 4AWSA 2HS8A 2J24A 2NZLA 3B0UX 4QIUA 3W71A 2QCNA 4AH7A 1B4EA 4UR7A 3C52A 4BR1A 1ZAJA 1JCXA 5CPOA 3CC1A 3NQVA 4WY0F 4N4PA 3CTLA 3R12A 1GEQA 3FLUA 3DI1A 1P0NA 1TTJA 1QO2A 3QQ1A 4WJEA 4Y96A 2EAWA 4LRSA 3S5OA 4BF9A 3N9SA 5IM51 2R91A 1FQ0A 3NQ7A 5CZSA 4JTEA 3TXZA 1SW3A 1UBSA 1ZAIA 1LORA 4BWLA 3M44A 3W7PA 5C55A 2E6DA 1WDWA 3SJ3A 3BV4A 2QJHA 2YPIA 4R34A 3ABQA 4N6EA 2C3ZA 2VXNA 4O8RA 3G24A 4TIMA 2W79A 2CLMA 1I8JA 2GVGA 1H60A 1QPQA 4ZVJA 4LVFA 3WFAA 4O1BA 3HGSA 3NL3A 2Y7DA 3R5EA 5A5WA 4I7VA 3LHYA 1G67A 5D2TA 3PUDA 3W1TA 3TQKA 3ATZA 1OFDA 5FEXA 2V2DA 4CQAA 5HQEA 1RD5A 5HWMA 3DFPA 1OFRA 3U2OA 5J5DA 1HUVA 1A5CA 4NNBA 2QJGA 3TW6A 2ALDA 1LP6A 3LGEA 3TH6A 4W9TA 2VEIA 1KM0A 4ADUA 5D2XA 4JNMA 1YYAA 1OX6A 4DO4A 1MEHA 3KXQA 3TE9A 5LGZA 4GUJA 1GG0A 2ZA3A 3O6YX 3O1NA 4MZYA 1W3NA 3M7WA 3UPBA 3YPIA 1F7BA 3I7RA 5D38A 2C0AA 5U7SA 5AYZA 2VFFA 3M43A 4ADSA 2X1UA 3CEUA 3PB0A 1X1OA 3MHUA 4AEOA 3DI0A 3UNDA 4QM1A 4RLIA 3QMRA 5LHEA 2QR6A 3NG3A 3UZJA 4UFMA 1OABA 3EWZA 5F1UA 2DZPA 2TRSA 1LBLA 3FJ6A 5CGQA 3QC3A 1SSDA 3W7GA 1QR7A 4FXRA 1PCKA 4NVTA 4O54A 4LU0A 4RZ5A 1TPH1 3W1QA 4XUGA 3NAVA 3UY7A 3CIXA 1ALDA 4K39A 4QQ3A 1KFBA 2OT1A 1SU5A 3C2VA 3G1YA 3V1PA 4M6PA 1PE1A 2DZWA 2ZTJA 4O12A 1TRIA 3DXIA 3RFAA 4UFLA 3W83A 3CLMA 3PM6A 1XUZA 3MYOA 1I2OA 4GUHA 4AAJA 4EIVA 1YPIA 1VR6A 1RVGA 4R53A 3W74A 5D09A 1EWDA 3G1DA 2QDGA 2YDAA 1HG3A 3IIZA 4LUIA 2A6NA 1OFAA 4GNJA 1U83A 4O11A 4IMFA 4PODA 3B8DA 4JTGA 4WXYA 1GVSA 2A85A 4MJMA 1JRBA 1MZHA 3C8FA 3Q2DA 3GKAA 1O94A 3PULA 4YMZA 1AW2A 1A5AA 2CLHA 5AN7A 4LV4A 5AC8A 3OEXA 1Z44A 4N9DA 5AHFA 1IXQA 2NXIA 1GYNA 1M5WA 4XBSA 4BWLC 3G22A 2OMAA 5D33A 2Z0IA 3UWZA 4OE7A 3W7NA 1CX9A 4JX4A 2I9EA 2NV1A 3P5YA 1OK6A 1K8YA 1D9EA 1NSJA 4EWND 3O07A 4JIQA 1C9DA 3P8IA 3WK1A 4HN4A 1W3TA 2FDSA 4FX8A 1LTDA 3CWOX 3LOTA 3TR2A 4LS1A 3CU2A 2YFOA 4GUGA 1NF7A 2H90A 2AAMA 4M19A 1FXQA 3BGJA 3LBCA 5FESA 1R30A 4LRTA 3E96A 3LXAA 5KZEA 1KM6A 1FCQA 3N2MA 2OZ0A 3G18A 3GYEA 5I3FA 3PBUA 3PVFA 1P5BA 2TYSA 1B9BA 4IOTA 3M47A 2H3DA 1XCFA 3VE7A 1TTPA 2ATMA 3W2KA 3SZ8A 1C29A 3FS2A 1H7XA 2JGYA 4CCDA 1FDYA 4JX6A 4GWEA 1KV8A 1RR2A 1SZNA 3KVMA 1Q6OA 5DXXA 4FNQA 2ZZ4A 2ZZ2A 1TTQA 3WJXA 4GUIA 4KFPA 3CT7A 3MI3A 5D02A 2B7QA 5CZTA 3EXSA 1R2SA 4H4IA 3HQ1A 3VFLA 3HGOA 5C54A 2V82A 1W8SA 4QNEA 4QITA 3THQA 3HIJA 3RLVA 1G4SA 5HNRA 3B0VC 3HMJG 3NM3A 2C6QA 1IF2A 3F4NA 1HL2A 2DJXA 3TU9A 3E49A 3P84A 3H54A 3PAJA 4WD0A 4QISA 4OGZA 1S5WA 4A3UA 1GTEA 5HUPA 3TK7A 4A21A 2ISSA 2B0MA 3B06A 5EKYA 2A5HA 4POCA 3S1VA 4PTNA 3PG8A 4AHQA 1OFOA 1N7KA 1YADA 2Q8ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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