4XH1A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase in complex with amppnp and propionate
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
394
structure length
393
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIAHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Propionate kinase
publication title Structures of substrate- and nucleotide-bound propionate kinase from Salmonella typhimurium: substrate specificity and phosphate-transfer mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720)
molecule tags Transferase
total genus 139
structure length 393
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2015-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh1A02
5BPNA 4A61A 1WUAA 5BREA 1WOQA 2P9LA 4H5NA 4J8FA 5AQKA 1S3XA 4BROA 4WQ5C 1NGAA 5FPEA 3FZFA 2P9LB 5AQMA 5F1XA 1H1VA 2P9PB 4CI6A 1GLBG 2Q0RA 3C7NA 1KXPA 3O4WA 3ZEUA 3WT0A 1V4TA 2A6AA 2F9TA 2YHWA 2P9UA 3A5LC 5JLHA 3C7NB 4H0YB 3KVGA 2FXUA 1SQKA 4JHDA 3UB5A 2ZGZA 4YDUC 3QB0A 3CJ9A 1HX1A 2DPNA 3O8MA 2HOEA 1QQOA 3D7EO 3M6GA 5CE3A 3DJCA 1C0FA 3CETA 1RDWX 2P9NB 2V51B 4FSVA 4GNIA 2VWBA 5I9EB 4ISGA 4B1VA 1ATSA 3ID8A 3BUZB 3WQTA 5FPMA 5FPNA 1QZ6A 2GWJA 3U4LA 4FPAA 4BGBA 4BRFA 3VESA 4O8KA 5EVZA 1X9JA 5AQUA 2E20A 3DXMA 3VERA 2ASMA 1X3NA 3TPQA 4NO7A 2CH6A 3WEEB 3W3DA 3DXMB 2FSNA 1ATRA 2I7PA 2YHXA 4RWTA 1GLAG 4EHTA 1SAZA 2W40A 2A5XA 3O1WA 4YDUA 3QDKA 4CD1A 4FOEA 2Q2RA 2YJFA 5AZIA 1NGJA 1IJJA 2YHYA 4CBWA 5LY3A 4EFHA 3G25A 5KPTA 4PL7A 2GEMA 5AZIB 5AQOA 3CIPA 1GLLO 2BUPA 3QFPA 1BDGA 3MK6A 2ASOA 4BR5A 2QWOA 1KAYA 2QWMA 4BVOA 4H5TA 4CZHA 2IIRA 4FPBA 4CZIA 1GLCG 2QWLA 3EKSA 3HSCA 2Q0UA 3A0IX 4CBXA 1HKCA 3SMSA 2V7ZA 3VF4A 5KQDA 4XH5A 3S41A 2CGKA 3WXKA 3A5OC 5AQIA 5ADXH 5AQQA 4BRHA 3EO3A 4L3QA 5BRFA 4B1XB 5AQTA 1NLVA 5AQNA 3VENA 2VYPA 3L0QA 5AQSA 4BRDA 4C23A 3CERA 2F9WA 4XH4A 3O6WA 4CZJA 1Z6RA 5EX5A 3LDNA 4IXCA 4FWOA 2D4WA 3VGKA 5AR0A 4FL9A 4PL8A 1T44A 2E2NA 1NBWA 4QS7A 2HMPA 3DWLA 1NGFA 4H0PA 2E1YA 5B8HA 3H1VX 1YAGA 1TYQA 2HF4A 3ENOA 4H0OA 3WXLA 2AP1A 4DHYA 5BRHA 3FR0A 3QFUA 4FWKA 2P9PA 2ZGYA 4FWLA 3VGLA 1TYQB 3VOVA 3J8AA 1RFQA 3H1QA 2A3ZA 4JN4A 3LDPA 4K25A 5KPRA 3MN6A 2QWNA 2D0PA 4H5WA 1J6ZA 3A8YA 4K41A 4CZMA 3H3NO 4IJAA 1GLJO 3JXUA 4BVPA 2QWPA 2QWRA 4B1ZA 3LL3A 4WQ4A 1KAXA 4BG8A 3QMLA 3KHYA 3FZMA 3VEXA 3MCPA 3BF3A 4HWIA 1IG8A 4BC5A 5KPZA 3MDQA 1NGIA 4K42A 4FWPA 4DB3A 3HZ6A 2P9NA 2YJEA 3I8BA 3IFRA 1GLDG 1HJOA 4M7XA 1BU6O 3M1FA 3GE1A 4BGAA 3SJHA 1G99A 5AQZA 3DAWA 4A2BA 5LJWA 2AA4A 2QWQA 4FWNA 4LC9B 1QQNA 4CZGA 1SZ2A 3CJAA 2Q1NA 3MN5A 1BA0A 4DCHA 1X3MA 3L6QA 3IUCA 5F2RA 3ATVA 5AFUH 3L4IA 3WXIA 3U8XA 3O08A 4HTLA 3VF2A 2IVOA 1E4GT 1HKGA 1XQSC 4BC2A 3WEEA 3AY9A 4H03B 4DQ8A 3IMXA 3CJBA 3VGMA 4BRKA 4BQLA 1GLFO 4BR4A 2YI1A 3EKUA 4NB4A 1T6DA 4BRIA 3EZWA 3M3ZA 4M7YA 4K43A 1C0GA 1NM1A 1EQYA 4H5VA 1YUWA 2P9KA 2Q31A 1ZBSA 4PKHA 3LM9A 1U2VA 1YXQA 2P9KB 2KHOA 3BEXA 3GBTA 1BA1A 3UE5A 3B8AX 1U2VB 5AQHA 1NGEA 3AAPA 2NRHA 1Q18A 2NLXA 1NGGA 5AQWA 4BR9A 1NGHA 1NGBA 3QBWA 3VF6A 4KBOA 3ULEA 3R6MA 3QBXA 3GDQA 3LDOA 1MWMA 4H5RA 4A62A 3ULEB 2IVNA 3SLCA 4Y0WA 4FWMA 1RGIA 1U6ZA 2GTDA 2E8AA 1DEJA 1ZC6A 3O80A 1TUUA 3ATUA 3W0LA 4IWVA 3GOIA 1HKBA 4WQ4C 1T6CA 2QW9A 3H6EA 2H3GX 3FLCO 5ADXA 3CQXA 3TU5A 3EL2A 3CJCA 3LM2A 3VEZA 1NWKA 1XC3A 3CHWA 4WYBA 3C0BA 4JNEA 5AQJA 4BC4A 2UYTA 4BR0A 4CZFA 5FPDA 1BWFO 3GL1A 2A42A 3WQUA 4MLHA 4BG9A 3CJ7A 5F0XA 2Q36A 2V7YA 3D2FA 4MLEA 2BTFA 4BRGA 5BPMA 3U9ZA 4H0XB 2EWSA 3VEOA 3D2FB 4BQZA 2J4RA 5EXWA 4EAHD 4EIAA 3MMVA 1HPMA 3SMPA 1QHAA 1Y64A 2E1ZA 4O5FA 4RTFD 1NMDA 2E2QA 3A5MC 3F9MA 4BRQA 4B1UB 2V52B 2QXLA 2YCHA 4Z94A 4CZEA 2PBDA 2W41A 4FOIA 2Q97A 3H46O 3AAQA 5AQVA 5BRDA 1LCUA 2HF3A 2QM1A 3ZETA 3I33A 3DXKA 2ASPA 4FWSA 4FWRA 2CGLA 1DKGD 4E1JA 1MWKA 1OKJA 1HLUA 3FZHA 1S22A 2GWKA 5AQLA 3ZETB 3DXKB 3SK3A 2ZF5O 2PAVA 3ZEUB 5BPLA 1E4FT 1QQMA 2FF6A 2WUSA 4JD2A 2P9UB 1GLEG 3MN9A 4PKIA 4BRLA 3CJ1A 3AARA 4I6MA 1MA9B 4JD2B 3CQYA 3OHRA 4BREA 3BF1A 3FZLA 4JHDB 4B9QA 4CBUA 1BUPA 1YVNA 1JCEA 2P9IA 4I6MB 3VEYA 1BO5O 4AM6A 4FWQA 5E84A 2P9IB 2I7NA 4PKGA 2A40A 3ZX0A 5LJVA 2A41A 3FGUA 2GELA 4IZ9A 3A5NC 5AFUA 4H0VB 4ISFA 4QS8A 5JLFA 5KQ8A 4F9OA 2CH5A 3HBTA 1ATNA 3FZKA 4BRAA 1K8KA 4WQ5A 2E88A 4CZKA 4QS9A 5BN8A 1Z05A 3FE1A 4A2AA 2NZTA 2E2PA 5TKYA 4JAXA 1K8KB 1LOTB 5E26A 3FFKB 3MN7A 4XEIA 2ZWHA 1JCGA 4M63C 5AQGA 2GUPA 3IDHA 2D1KA 3RSEA 3WUHA 4BRMA 3KZBA 4RCHA 4ISEA 1XUPO 5EOYA 2ITMA 3VPZA 1CZAN 3UKRA 4MO4A 3RSEB 1R59O 2FF3B 4GY2B 3QICA 4BRPA 2FSKA 3UKRB 4XH1A 5BR9A 2D0OA 1KAZA 1JCFA 3U9DA 3EN9A 3ENHA 5AZJA 2E2OA 4BR7A 1D4XA 2FLOA 1ZXOA 5EY4A 5JICA 4B1YB 3UKUA 4BR2A 4CD3A 3VEVA 4FO0A 5AZJB 4MO5A 2IVPA 5AQRA 3R9PA 3VEWA 3UKUB 2CGJA 3ZX2A 3CI5A 3VETA 4IO8A 1DGKN 2FSJA 5BN9A 3R8EA 3H45C 3LDLA 2OANA 4BRNA 1V4SA 4AM7A 2P9SA 5ELZA 4IJNA 5AQFA 5JMVA 3JS6A 3O1BA 1P8ZA 3LDQA 5AQYA 3D2EA 2P9SB 1NGDA 3HTVA 3GG4A 5AQXA 3H3OB 4CZLA 3HM8A 4BC3A 3D2EB 4H0TB 1BG3A 4B1WB 4CJ7A 2VCPA 1QZ5A 4BRCA 3P4IA 1ESVA 3ZX3A 1NGCA 1HUXA 1TUYA 1BOTO 5AQPA 1MDUB 3O5BA 4EHUA 3WXJA 3BP8A 3HI0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5BPNA 4YOYA 3IG1A 3V4IA 1WOQA 2OCEA 4H5NA 4J8FA 1S3XA 4CF0A 3E01A 1VQ4N 3FZFA 4GW6A 1QE1A 1REVA 1WAFA 4O5BA 3AVHA 1I3AA 3O4NA 3ZEUA 3WT0A 4CGJA 3SQ2A 2A6AA 3LZIA 3AO3A 4FLWA 2P9UA 3PX6A 5JLHA 3C7NB 4H0YB 1VSHA 2O8FA 3VQ9A 4R79A 3EEQA 2UUCK 4FJMA 2ZGZA 1DT9A 1SV5A 1SL1A 3HVTA 1NJYA 3DOLA 3NAEA 2BGGA 3M6GA 3TAEA 3DJCA 3VQ5A 1YI2N 2P9NB 2V51B 5KI6A 4ISGA 2E4LA 1ATSA 4FM1A 4DUZK 3BUZB 3VQDA 1DTTA 5FPNA 2A1SA 1VQPN 3OBYA 5M1OA 4JKHA 4LY7A 1VSDA 4O8KA 1X9JA 2D0CA 1BCOA 1ZBFA 1JLBA 2ASMA 4CEEA 4NO7A 3DXMB 2FSNA 4CGGA 4AHUA 3LPUA 2YHXA 1S9EA 1I39A 3MECA 2A5XA 2XY6A 3CMEN 3QDKA 1IBKK 5HP1A 1HPZA 3PX4A 2YJFA 3PV8A 4OX9K 1C0UA 1NGJA 2ZQBA 3OTOK 4EFHA 5I3UA 5KGXA 2HB5A 5AZIB 5AQOA 4JKGA 3CPWM 3MK6A 1J9AA 3QINA 3WXMB 4CHPA 1KAYA 5HRRA 1RTHA 3M5RA 3IKMA 3QIPA 1ZYQA 3HSCA 2Q0UA 1RTJA 3A0IX 4DMNA 4NXNK 2XHBA 1KQSM 3PO5A 3SMSA 3SPYA 3HPGA 2JWKA 5AQIA 5ADXH 1NJZA 5C12A 5CY4A 2OPSA 1TK8A 1R0AA 4CW7B 3VENA 2VYPA 4XH4A 2EHGA 2HNDA 4DV7K 3CCSN 3BDPA 4O8UA 1QSLA 1FXXA 3AGKA 1B9FA 4H0PA 5M1FA 4FLVA 1YAGA 4PY5A 4F2SA 3PIOL 1TYQA 3TAPA 1RDBA 5M1PA 3TANA 2PYLA 1ILYA 4FWLA 1X9SA 1VSIA 2A3ZA 4JN4A 1BHLA 4ZTJA 1U45A 2D0AA 4KREA 2QWNA 3A8YA 4CZMA 3KLHA 5GAHP 1GLJO 2QWPA 3B6PA 3CCEN 4WQ4A 5C25A 3VA3A 1BIUA 3FZMA 3QNOA 1RILA 4AHRA 1BL3A 3JAMO 2P9NA 4KHSA 4M7XA 5C15A 3L2QA 2O8BA 1HMVA 3GE1A 1KRPA 4FK2A 3K9KA 4DSEA 1G99A 4FW2A 1ASVA 3VMFB 4A2BA 2QTDA 2AA4A 3LP0A 5LJWA 4FWNA 4AH9A 5AJ3K 3PIPL 3MN5A 4DCHA 4WFNL 2FBXA 4JI4K 3L4IA 3U8XA 4HTLA 4HVJA 3TTFA 2IVOA 3VF2A 1E4GT 3OS0A 3KLFA 3PLAA 4CEDA 1HKGA 2VGMA 4Z4GA 5CZ1A 1BIZA 3TAQA 3ZSXA 2YI1A 4C1NI 3G71N 4HCCA 3EKUA 4B3OA 1FJGK 3DLGA 3SQ4A 4FK0A 4C8KA 4H5VA 1YUWA 4CF1A 5C24A 3AVNA 4Q0BA 3TTDA 3C6AA 1YXQA 3BEXA 3GBTA 1S1XA 3SQ0A 1BA1A 5GAGP 1SKRA 1NGEA 3AAPA 1Q18A 1NGHA 4MDAA 4KBOA 3V1OA 4AHCA 3QBXA 1F21A 2AJQA 4YOXA 4A62A 4CEOA 1JLAA 3CCMN 1LAWA 3SLCA 4Y0WA 4FWMA 2GTDA 4M3TA 1RBSA 3RMAA 4JRQA 1TUUA 3ATUA 5CHIA 3I8DA 1YTAA 4IWVA 3SJJA 3LP2A 4JI0K 5I42A 4LF7K 3R3LA 1N32K 4DR6K 1LV5A 4JK7A 2H3GX 3QETA 3FLCO 3S9HA 3EL2A 3DLKA 3CJCA 4LF9K 2P5GA 3CHWA 4KTWA 1NK5A 5A2QO 3K5LA 4BC4A 1KLMA 3DLRA 2UYTA 4NYNA 1XC9A 5FPDA 3G10A 4BG9A 4LFBK 3CJ7A 2Q36A 3I55N 1U48A 3U9ZA 3D2FB 2Y1JA 4DQIA 2YV0X 1UAXA 3L8BA 1IKYA 3U3GA 4EIAA 5KTQA 1RDAA 1SS6A 4YNQA 4DR3K 5M1QA 4JKFA 3A5MC 4FJ7A 3VQEA 3AGRA 4RW8A 1XNQK 4CZEA 4DFKA 2UXCK 3H46O 1RCHA 1IV0A 1Q7YO 2ZJQL 4V19S 1C1BA 3LPTA 4CERA 2P5OA 1J54A 4FWRA 1MWKA 1OKJA 1S22A 2GWKA 3ZETB 4CJFA 3SK3A 1QQMA 4OGCA 4KHPK 1CXQA 3MN9A 5E41A 4BACA 3QIOA 3H08A 3Q7CA 4FJJA 4JD2B 3CQYA 1VSJA 4JHDB 3OJUA 1WB9A 2OPQA 1JCEA 1EETA 4I6MB 1NG9A 4LSLA 1Q86O 2UXDK 4GMJB 3S3NA 5E84A 4JI6K 4FLXA 4CFCA 2I7NA 3FGUA 4IZ9A 1D9FA 5KRTA 1YF5L 5CYMA 5JLFA 5KQ8A 1OH6A 2CH5A 3R1XA 3FZKA 5CZ2A 4WQ5A 3DRPA 2E88A 1RT1A 3NBPA 4CECA 4JI1K 4CZKA 3AVKA 3NVMA 2NZTA 4E19A 4DV1K 2G8FA 4JAXA 4CGDA 5JVHL 1D5AA 3Q7BA 4N41A 1N33K 3MN7A 5C2DA 4JKEA 2W42A 4DQSA 1JCGA 4M63C 2ZJPL 1HYVA 2D1KA 3CFOA 3WUHA 4KHQA 3C94A 3OYAA 2KQ2A 2ITGA 3TAGA 3ID6A 1JJ2M 2I5JA 4J2AA 3RSEB 4CGHA 4GY2B 2PFUA 4DFPA 3UKRB 2FSKA 3E9PA 2WC9A 2HNYA 4E3SA 3CYMA 4N76A 1TKZA 3EN9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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