4XH4A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase a88v mutant, in complex with amppnp and propionate
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
b'FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIVHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Propionate kinase
publication title Structures of substrate- and nucleotide-bound propionate kinase from Salmonella typhimurium: substrate specificity and phosphate-transfer mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720)
molecule tags Transferase
total genus 140
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2015-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A02
3FLCO 4YDUC 4EIAA 3MN5A 3WXLA 3D2FB 1OKJA 4JAXA 4BRMA 4FOEA 4CBXA 1YXQA 5JMVA 4M7YA 3UKRA 3ZEUB 4CBWA 3UKUB 3EKUA 2HOEA 3VF2A 3A5MC 3MDQA 4IJNA 5BREA 3CJ9A 1RDWX 1GLAG 1X3MA 3CQYA 2Q0UA 2QWMA 2NZTA 2BUPA 3D2EB 3ZEUA 1ESVA 1H1VA 3R8EA 3D7EO 3EKSA 3UKUA 3CETA 5JICA 4BC3A 3CERA 2YHYA 1NGJA 2P9SB 2E2OA 2CH5A 3LDLA 1R59O 5ADXA 3QFPA 1NBWA 4H5VA 4A2BA 3A5NC 4B1YB 1X9JA 1JCFA 2I7NA 3W0LA 3A0IX 4E1JA 3GG4A 1MWKA 3UE5A 4BRKA 4H5TA 5EOYA 1MDUB 3D2EA 3W3DA 2F9WA 1DGKN 3MMVA 1T6DA 1GLJO 2A40A 1SQKA 2A42A 3O5BA 1NLVA 2P9SA 2UYTA 4I6MB 2PBDA 3ZX2A 2IVNA 1D4XA 2E2PA 3BEXA 3QBXA 1IG8A 3O80A 3BF3A 5BRHA 5AQNA 4FWOA 3VF6A 2GTDA 1KAYA 5BPNA 2P9NB 5AQLA 2Q97A 3CIPA 4I6MA 5AR0A 1GLDG 2Q1NA 4BRGA 2HMPA 4EFHA 2EWSA 3UB5A 4CZFA 3TU5A 4RWTA 5JLFA 5KQDA 5AQXA 4NB4A 1HPMA 5AQWA 1BO5O 3MN7A 4B1WB 1NGEA 3ULEB 2P9NA 1ATRA 2E88A 4H5WA 5FPNA 3H46O 3DJCA 1TUYA 3VEZA 3VEXA 3BUZB 2Q36A 3IFRA 2VCPA 3CI5A 4WYBA 2GWKA 4BR2A 4CZKA 2D4WA 3BP8A 2P9IB 3H1QA 4H5RA 4FWSA 3ULEA 2FSNA 4FL9A 2CH6A 4CZMA 1BUPA 1NGCA 2GUPA 2YJFA 3GL1A 3CQXA 3FFKB 1TYQB 4BG8A 4FWKA 3A5LC 3L0QA 4FWMA 2AA4A 1ATSA 1YVNA 3DXKB 5AFUH 2D1KA 5AQGA 5AQJA 4BC2A 4BRQA 4O8KA 1DKGD 3I33A 4CZHA 1J6ZA 2WUSA 3QICA 4CD3A 3ATVA 2E2NA 4GNIA 4ISFA 3HTVA 4WQ4A 1IJJA 3MK6A 4BC4A 4BVPA 3G25A 3DXKA 5BR9A 2QWOA 3O1WA 4K42A 4B1VA 4Z94A 3HSCA 1XUPO 3GBTA 3H3NO 1CZAN 3SMSA 4MO4A 1KAZA 4BGBA 3ENHA 1U2VB 3QMLA 3LDNA 3AARA 3VERA 2GEMA 5E26A 5AQTA 5BN8A 4BRIA 3WXIA 1XC3A 4L3QA 1QQOA 3ZX0A 3P4IA 4K43A 3AAPA 4IJAA 1P8ZA 2HF4A 3SJHA 2ASMA 1U2VA 1BU6O 3D2FA 4PKIA 1QQNA 2P9KB 1BA1A 1HX1A 1RGIA 4H0VB 3JS6A 5EXWA 3FZHA 5KPZA 3O08A 3VGLA 4CI6A 1GLLO 4XH4A 3H3OB 5AQPA 2QW9A 4CZEA 3KZBA 4H0PA 4F9OA 1WOQA 2PAVA 3VPZA 4BROA 3SLCA 2Q31A 3WT0A 1GLCG 5ADXH 1TUUA 2P9KA 2QWLA 2E1ZA 2V7YA 1HKBA 1S3XA 4XEIA 3U9DA 4BRFA 1QHAA 3TPQA 2GELA 4BR7A 5FPMA 3H6EA 1KXPA 1ATNA 3ATUA 3GDQA 5KPTA 5BPMA 3M1FA 4AM7A 3AAQA 1YAGA 2D0PA 3EO3A 5KPRA 4H0TB 4DB3A 1S22A 4B1XB 3U4LA 3VEWA 3QFUA 3ID8A 1QZ5A 5CE3A 2ASPA 2H3GX 4IZ9A 5TKYA 3EN9A 4ISGA 2ZF5O 1Z6RA 2E8AA 3HM8A 1EQYA 1Y64A 3M6GA 2DPNA 4ISEA 2F9TA 3WEEB 1C0GA 3QB0A 4PL8A 4B9QA 4C23A 4H0YB 2QWRA 4WQ4C 1V4TA 1NGFA 2YI1A 4H0OA 4QS8A 3FE1A 4BG9A 1RFQA 3WQUA 2HF3A 2E1YA 1T6CA 1QQMA 2J4RA 1QZ6A 4CZIA 4FWLA 1BOTO 2FLOA 1XQSC 3LM2A 3R9PA 3WEEA 5AZIB 1Q18A 3GE1A 4O5FA 5BPLA 4RCHA 1HLUA 3C0BA 4FWQA 3SK3A 1K8KB 4FO0A 3MN6A 2W41A 5AQZA 5ELZA 2V7ZA 4J8FA 5LJVA 2P9IA 4MLEA 2ZWHA 3AY9A 4JN4A 1HKCA 2BTFA 4EAHD 2W40A 1MA9B 4BR5A 1K8KA 3CJBA 3HI0A 3M3ZA 1E4GT 4NO7A 3CJ7A 1MWMA 1NGAA 3VGMA 3F9MA 1TYQA 4WQ5C 3MCPA 4IXCA 2NRHA 3ZETB 3VEOA 5AFUA 1HJOA 3B8AX 4BREA 3VEVA 2CGKA 2CGLA 3U8XA 1KAXA 2YHXA 3A8YA 5AQUA 3FZKA 4A61A 4JNEA 3EL2A 4A2AA 3VETA 2IIRA 3HZ6A 2D0OA 3VF4A 1LOTB 2VYPA 1ZXOA 3ZETA 2Q2RA 4PKGA 3A5OC 3I8BA 3QDKA 1GLEG 2YHWA 3C7NB 3VGKA 3FGUA 2ITMA 3GOIA 5AZJB 4H0XB 4GY2B 1NGDA 5B8HA 4MO5A 5I9EB 4B1UB 1HUXA 3VEYA 4BRPA 1NGGA 1GLFO 4BRAA 3C7NA 3S41A 5F2RA 3DAWA 3O8MA 3KHYA 1V4SA 1YUWA 3LDOA 5AQOA 5AZJA 4BR0A 4WQ5A 4BRDA 2P9LB 2FF3B 2OANA 3LDQA 4CZLA 4BVOA 2FSKA 3LDPA 4FSVA 5EVZA 4CJ7A 1C0FA 1SZ2A 3FR0A 1JCGA 5BRDA 1NM1A 4H03B 5AQVA 5JLHA 4IO8A 1BDGA 4QS9A 2QWNA 2KHOA 1E4FT 3RSEB 4H5NA 2P9LA 3MN9A 4FWNA 4BRLA 5EY4A 4DQ8A 4JD2B 1NGHA 4BRHA 3SMPA 1LCUA 3JXUA 1ZBSA 3EZWA 2IVOA 2V51B 2ZGYA 3CJAA 3WXJA 4CZGA 3RSEA 3J8AA 3H1VX 4HTLA 3ENOA 4YDUA 2IVPA 5AQFA 5AQYA 3WUHA 3ZX3A 4IWVA 5AQKA 2QM1A 4JD2A 3O4WA 1Z05A 4BR9A 4CZJA 5AQMA 3KVGA 4RTFD 3L6QA 2E20A 4XH5A 5F1XA 1DEJA 3U9ZA 2AP1A 3DWLA 3VESA 3H45C 1GLBG 4BQLA 3LL3A 4FPBA 3IUCA 3HBTA 5AQIA 4M63C 4CBUA 1BA0A 1X3NA 3CHWA 2P9PB 4XH1A 4BRCA 4EHTA 3DXMB 1G99A 3IDHA 5FPDA 4BGAA 1U6ZA 2QXLA 2V52B 4DCHA 2YJEA 5LJWA 4Y0WA 4A62A 3WXKA 1BWFO 2P9UB 2CGJA 1NWKA 5BRFA 3VOVA 1NMDA 2A6AA 4BQZA 3O6WA 2P9PA 3BF1A 2FSJA 3DXMA 3WQTA 4BR4A 1HKGA 4M7XA 5AQRA 2GWJA 2A5XA 4BRNA 2QWPA 4LC9B 3FZMA 4MLHA 5AZIA 2YCHA 3VENA 4KBOA 1SAZA 3L4IA 3IMXA 5F0XA 2VWBA 1NGBA 2NLXA 1WUAA 3FZLA 5AQSA 4AM6A 1ZC6A 3QBWA 4HWIA 4EHUA 3O1BA 2FF6A 2P9UA 4FWRA 4PL7A 5BN9A 5FPEA 3FZFA 4QS7A 3OHRA 5E84A 4FWPA 3CJ1A 4B1ZA 1BG3A 2QWQA 5EX5A 1NGIA 4JHDB 2A41A 2FXUA 3R6MA 4PKHA 2A3ZA 2ASOA 5KQ8A 4FPAA 4FOIA 3CJCA 5LY3A 4BC5A 4DHYA 2ZGZA 2Q0RA 4K25A 1T44A 4K41A 1JCEA 3UKRB 5AQHA 4CD1A 5AQQA 2I7PA 4JHDA 3LM9A 2E2QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AO2A 3HXMA 2D0BA 1RTIA 3RRHA 4XIUA 1NJYA 4DUYK 1OKJA 4JI4K 4CBXA 2VWJA 3RVCA 4CBWA 2OPRA 3CCQN 3UKUB 5KRSA 3HP6A 3VF2A 2HOEA 1L3TA 3A5MC 3NHGA 1S1VA 4JYAK 1SKRA 2F8SA 4FJ5A 1K73O 1JLGA 3EY1A 2QWMA 1JLCA 2ZE2A 2BUPA 2RF2A 3D2EB 3LWLA 1ESVA 3R8EA 2RHKA 3EKSA 3UKUA 4FVMA 4JKBA 4GV3A 4BC3A 3OYBA 3ALYA 2YHYA 3CYMA 4TSXA 5ADXA 2Z1JA 3NF9A 1NBWA 4IDHA 3A5NC 4B1YB 1JCFA 4DS4A 2I7NA 1VQLN 1VSLA 3GG4A 1LAWA 1MDUB 3D2EA 3W3DA 2F9WA 3ENBA 4ZTJA 4WFAL 1T6DA 1WAFA 3NF7A 4CESA 3IKMA 2ZD1A 2UYTA 4B3MK 3SUOA 3OYEA 3P83D 4CECA 3QBXA 3VQ6A 4YOXA 1HYZA 3OS1A 4NCGA 3OYCA 3AA5X 3V9WA 3TWHA 1ZBHA 4IFYA 4E7IA 2ZM6K 3HPOA 1GOBA 3VQBA 1RBSA 4JKDA 2Q1NA 3RR8A 4IOCL 2FC0A 4FZZA 4B9NA 5JLFA 5DM7L 4OPKA 3OW2M 1HPMA 5AQWA 1L5UA 2UXDK 3HOTA 5M1FA 1NGEA 1VSDA 2E88A 1Q7YO 5FPNA 4JKGB 4IOAL 3DJCA 1TUYA 3DI6A 3IFRA 4O4GA 2VCPA 2XY7A 1KLMA 3MXJA 1FK9A 3LALA 3QNNA 2VG7A 4FJJA 3CMAN 3MX2A 2FSNA 4JKGA 4CZMA 3GL1A 4LF9K 3CQXA 1S6PA 4JLHA 3V9ZA 4CW7B 1W2BM 1UOCA 3C6HA 4NXMK 3BY5A 5KTQA 4FJIA 5FRMA 3ATVA 1I39A 3OYGA 3PUFA 1RTDA 1O13A 4ISFA 1IJJA 2KQ2A 4BVPA 5J2MA 2HHHK 3O9UA 4RG8A 2O8FB 3NAEA 1CZAN 3OA9A 1UAXA 2KKZA 1EKEA 3NDKA 3L2QA 1FKOA 2HBMA 3QMLA 2ETJA 4FJ9A 3NF8A 1EO1A 4L3QA 2DTUA 4LF4K 3KLGA 1YT3A 1SL0A 4FK2A 1K9MO 1OVQA 2O8FA 3EE8A 2R7YA 3KJVA 2ASMA 2UXBK 3OS0A 3D2FA 4DFPA 3NE6A 2X6NA 3PO5A 1RDDA 1ASWA 2P9KB 1EP4A 2KW4A 1RBTA 1VSKA 1BQMA 4YOUA 4CJ3A 4U67L 3VGLA 3K57A 1TK8A 4BY9C 5C2DA 4DR3K 4Z4FA 4DWIA 4CJQA 3QERA 1REVA 3KZBA 3VPZA 3SLCA 2P9KA 3U9DA 4KB0A 1XMQK 1TV6A 3H6EA 2BANA 1ATNA 4IFVA 3ATUA 1BISA 4Y1CA 2OZSA 3AAQA 1N8RO 1YAGA 2G8VA 2D0PA 2D0AA 4DF4A 4OX9K 5KPRA 2YNFA 3TARA 3MXMA 3U4LA 2NRVA 1RBVA 3KWIA 2OPSA 3HJFA 1QZ5A 4CJTA 2ASPA 4GKKK 5TKYA 4M3UA 2EX3A 3DLHA 2E8AA 1EQYA 3J7AP 2F9TA 3S3OA 3CF5L 2QWRA 4K0KK 4RW4A 2YI1A 4FW2A 4DR4K 4KTWA 1X9SA 2J4RA 4CZIA 4I2PA 1BOTO 1XQSC 3M5RA 4L8RB 1NKEA 2GV9A 2IGIA 1Q18A 1UWBA 4OKKA 5DMRA 2IOCA 1HLUA 3C0BA 3C95A 3E66A 3TANA 4OKEA 5ELZA 2V7ZA 3K58A 3KIOA 3OVNA 1JL2A 1JLAA 3CQ8A 3EEQA 4W5TA 3SUPA 2BTFA 3LAKA 1C0TA 1WSEA 4DF8A 1LWCA 3HI0A 3CJBA 3M3ZA 4R5PA 1E4GT 3LAMA 4FM1A 3MCPA 4N41A 1HNZK 3VEOA 4KHWA 1HR0K 4GMJB 3I56N 1J54A 3B8AX 4FJHA 2CGLA 3U8XA 3FZKA 4AH9A 4CE9A 3VETA 2IIRA 3VF4A 3L2RA 1VQNN 2NNWA 1ZXOA 3CCSN 1L3SA 1IKXA 1NU0A 1KFSA 1GLEG 2YHWA 4DFMA 3OYMA 1NGDA 1IKWA 3K0SA 3MECA 3P31A 2HNZA 3HVTA 3AVGA 1HUXA 1W97L 3TSQA 3VEYA 2E5LK 2RE2A 1BCOA 4UQGA 2RN2A 3O8MA 3LDOA 1HPZA 3E01A 2QXFA 1A5VA 2UUBK 2IAJA 3NMUA 3ZSVA 1BGXT 5CR4A 4CEOA 4W5OA 1C0FA 1SZ2A 3FR0A 4CJRA 4HUFA 1NM1A 3LP3A 1T3VA 5AQVA 3NGYA 5JLHA 3G6EN 1BDGA 2W6KA 2QWNA 1NOYA 4IKFA 3RSEB 4H5NA 3F5TA 3KK2A 4ICLA 5C12A 4JD2B 2RPIA 4Z4EA 1U48A 5J2QA 2IVOA 3JSMA 3QINA 1WBBA 4Z0UA 4CZGA 3RSEA 3LDSA 5AQFA 2ZJQL 4CF1A 4CEEA 4FLUA 3BDPA 4JD2A 3KKRA 1Z05A 2OZMA 3K5MA 3KVGA 2PYLA 3ULDA 2E20A 4XH5A 3SQ1A 5M1QA 4MFBA 3U9ZA 3M8SA 3DWLA 3Q7CA 4C8MA 4JI5K 3THYB 4ELUA 4BQLA 1Z25A 4DSIA 3LPTA 5CHIA 4CHQA 4FLYA 5AQIA 1EETA 3JAMO 3T19A 3OTOK 1G99A 3IDHA 3R1XA 4FK0A 5M1OA 5LL6Z 2OPQA 4DCHA 5LJWA 1JLEA 4CJKA 3THYA 3VA0A 1TVRA 4KHNA 5BR8K 4B9VA 2FSJA 3WQTA 3CC7N 1HKGA 2A5XA 3L2UA 4JS5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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