4XH4A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase a88v mutant, in complex with amppnp and propionate
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIVHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Propionate kinase
publication title Structures of substrate- and nucleotide-bound propionate kinase from Salmonella typhimurium: substrate specificity and phosphate-transfer mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720)
molecule tags Transferase
total genus 140
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2015-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A02
3DAWA 3UB5A 5BREA 4IO8A 3H1QA 2Q1NA 3VEYA 2H3GX 3CETA 4JAXA 1U2VA 2IVPA 5LJVA 4PL7A 4B1XB 4BRQA 1NGDA 5I9EB 2P9KA 3VGMA 5EY4A 3W0LA 3A5MC 4FWMA 5AZJA 2YHYA 1S3XA 1X9JA 2P9UA 4BR5A 2HF4A 3O80A 5ADXH 3KVGA 3LDQA 5F2RA 1LOTB 1T44A 1MWMA 3WXIA 1GLDG 1ATSA 3WUHA 3VEVA 4E1JA 1LCUA 4KBOA 1KXPA 2W41A 5BN9A 2YHWA 2ZWHA 4H0VB 1OKJA 2V7YA 2F9TA 3HTVA 3ZETB 3JXUA 2P9NB 3U9ZA 2YI1A 3M1FA 4H5TA 4L3QA 4BR9A 3S41A 3FFKB 3QB0A 2YCHA 3QMLA 5KPZA 1NGAA 2QM1A 2FF6A 2QWQA 2QWRA 4AM6A 3DXKA 3FZHA 5AQMA 5BPNA 4H0XB 2EWSA 3JS6A 3CJ1A 3AARA 1RFQA 3QBXA 2E8AA 3EL2A 3GDQA 4XH1A 3WEEB 3LM9A 3HSCA 3EZWA 4BR2A 2CGKA 2QWOA 4CZKA 3O1BA 5F1XA 3H46O 5AQVA 2ZGYA 3FLCO 3WXJA 2IVOA 4EHUA 5AFUA 4PKGA 3VEOA 3ATVA 4BRCA 3LDNA 3H45C 4O5FA 1NM1A 1RDWX 1C0GA 5AQLA 4CBUA 4IJAA 3QBWA 1G99A 4RTFD 2FXUA 3LDLA 5JLHA 5KPRA 5AQOA 4XH4A 3DWLA 4I6MB 5KQDA 3HBTA 2A5XA 4CBXA 5EOYA 2E20A 4H0YB 2D1KA 4JD2B 4CZGA 4BC4A 4HWIA 3WT0A 3D2EA 4BQLA 3FE1A 3ID8A 4K43A 3GL1A 4WYBA 3A8YA 3DXMB 1QQOA 4K41A 2QWPA 3O6WA 4EAHD 1YUWA 1HKGA 1NGIA 3EKUA 3D2FA 1BG3A 3EO3A 3SMPA 1SQKA 3FZFA 1BA1A 3EN9A 3HM8A 1KAZA 3AAPA 4BRKA 3UE5A 2P9IA 4A2AA 4M7YA 2V52B 2E88A 2P9PB 2CGJA 4BR4A 3CHWA 3QICA 2WUSA 1TYQA 4JHDA 3MCPA 2Q0RA 1WUAA 2YJEA 1GLJO 3M6GA 1TUUA 3O1WA 5AQHA 4FWSA 4MLEA 4BC3A 4EHTA 3RSEB 1KAYA 2AA4A 5EVZA 5BPMA 4IZ9A 1XQSC 4BGBA 1HPMA 2Q0UA 1HX1A 3VF2A 4PL8A 1IG8A 2ASPA 4FWOA 5AQGA 4AM7A 3VESA 2GTDA 2V51B 3UKUB 3L4IA 1U6ZA 2GWKA 3D7EO 3ZEUB 2D0PA 5LJWA 4K25A 4FPAA 4H5RA 2HMPA 4H0TB 4RCHA 4IWVA 2DPNA 3CI5A 1NBWA 4Y0WA 5FPNA 5AZIB 4DCHA 2F9WA 4DB3A 5FPDA 1NGHA 1NGGA 1E4FT 3A5LC 1NWKA 1BUPA 2QWLA 4FOEA 3UKRB 3CJ9A 3DJCA 3VEXA 3VOVA 4BR7A 2VWBA 3IUCA 3R9PA 3VF6A 3W3DA 5AQTA 3O4WA 2I7NA 5ELZA 1TUYA 2P9SB 2V7ZA 1YVNA 4BR0A 3O8MA 4RWTA 4BRFA 2E1YA 1QZ6A 2PAVA 2ASOA 5BRDA 5LY3A 3KHYA 3CJAA 3GBTA 3QFUA 3R8EA 5AR0A 1YAGA 3G25A 3H3OB 4YDUA 2D0OA 4CJ7A 5JMVA 4CD3A 1JCGA 4BRIA 1R59O 4CZIA 2A3ZA 4CZJA 4H0PA 4DQ8A 3QFPA 3MN6A 1NGCA 2AP1A 3ENHA 4BC2A 3C0BA 3ZX2A 3IMXA 4YDUC 3TPQA 3ZX0A 4PKIA 3ATUA 3MDQA 1BU6O 1QZ5A 4FWLA 2A42A 2BUPA 5AQRA 4M63C 3ZETA 1HKBA 2P9NA 5AQZA 4BRLA 2IVNA 4BRNA 4ISFA 3U4LA 3ZX3A 2ITMA 5AQWA 4CI6A 3MN5A 1JCEA 5AQYA 3LL3A 3FGUA 2HOEA 1Y64A 4J8FA 4QS8A 3WQUA 2A40A 3QDKA 3B8AX 3I33A 3ULEB 1MWKA 5AQJA 2NRHA 3SLCA 4BRHA 2GUPA 3WEEA 4FWKA 4ISGA 3IDHA 4FL9A 2FSNA 5BN8A 1ATNA 3FZKA 3WQTA 3CQYA 4K42A 1U2VB 1P8ZA 3KZBA 1CZAN 4BVOA 4GY2B 1NGBA 5AQQA 5AFUH 2P9KB 2UYTA 4WQ5A 3VF4A 1GLCG 3SJHA 5AZJB 4NO7A 4A2BA 2E2PA 1ZC6A 3A0IX 3MN9A 2P9UB 1D4XA 3CJ7A 4H0OA 1NGJA 1S22A 4H03B 4JN4A 2PBDA 5FPMA 3SK3A 4I6MA 1HUXA 2VYPA 3R6MA 4C23A 4CZMA 4A62A 4CBWA 4WQ5C 1NLVA 4JD2A 1BOTO 3FR0A 3TU5A 3GOIA 3I8BA 2A41A 2NLXA 5AQUA 5AQNA 4MLHA 2NZTA 3DXMA 3SMSA 3VEZA 4H5VA 1X3MA 4FOIA 3C7NB 4A61A 1HJOA 3O08A 1XUPO 5KPTA 3CJBA 2GEMA 4PKHA 2FF3B 2W40A 2HF3A 1MA9B 1NGEA 4QS9A 3BF3A 3DXKB 1Q18A 2J4RA 5AQKA 5F0XA 2P9PA 1BDGA 1SAZA 3AAQA 1GLFO 4EFHA 4CD1A 1Z6RA 3CQXA 5CE3A 1GLAG 3EKSA 4B9QA 4BQZA 4IXCA 4BRPA 5BPLA 4IJNA 3OHRA 3RSEA 3M3ZA 5AQXA 1HLUA 1XC3A 4JNEA 3U9DA 4BRGA 4BVPA 4F9OA 2Q2RA 3C7NA 3UKUA 3VGKA 2I7PA 1QQNA 1KAXA 5AQIA 4H5NA 5JLFA 1BWFO 2ZGZA 3ZEUA 4MO5A 1E4GT 3AY9A 1K8KB 4O8KA 1H1VA 1ZXOA 1ATRA 4B1WB 3CJCA 5TKYA 3H1VX 4HTLA 4FSVA 2Q31A 3L0QA 3BF1A 4FPBA 5AQPA 1NGFA 5AZIA 1JCFA 4GNIA 4BGAA 1WOQA 2BTFA 4XH5A 2GWJA 4DHYA 1QHAA 3UKRA 3GE1A 4BROA 2FSJA 4BC5A 5JICA 3D2EB 5KQ8A 1MDUB 4BRAA 2VCPA 1V4SA 2QXLA 1Z05A 4BG8A 1T6CA 2ASMA 4MO4A 4Z94A 2P9SA 3MMVA 1X3NA 1ESVA 4CZEA 4BRMA 2E1ZA 3D2FB 3P4IA 1IJJA 3IFRA 4CZHA 3WXKA 3A5OC 1V4TA 1GLLO 4BRDA 4NB4A 4ISEA 4FWQA 1BA0A 3L6QA 2P9IB 3VETA 4XEIA 4B1YB 4WQ4A 3J8AA 5E84A 5EX5A 3FZMA 2P9LB 2QW9A 1TYQB 4JHDB 1K8KA 2FLOA 4M7XA 3MK6A 1NMDA 4FWPA 2ZF5O 3BP8A 3BUZB 5AQFA 1QQMA 5BRFA 3BEXA 2CH6A 4B1ZA 3H3NO 3LDOA 4WQ4C 2YHXA 2E2NA 1RGIA 3FZLA 3VEWA 3GG4A 2D4WA 1HKCA 3CERA 2E2OA 5BR9A 1DGKN 2IIRA 3U8XA 5ADXA 1T6DA 2FSKA 3VERA 1C0FA 4FWRA 3H6EA 1J6ZA 4B1UB 2CH5A 1GLBG 2E2QA 4BG9A 1YXQA 3HI0A 4H5WA 3F9MA 5AQSA 1DEJA 2QWMA 3LM2A 3HZ6A 3VPZA 1GLEG 2YJFA 4FWNA 4CZLA 1BO5O 1ZBSA 4FO0A 2OANA 2QWNA 5E26A 4LC9B 4CZFA 3CIPA 3A5NC 3ULEA 4BREA 3O5BA 2Q97A 2CGLA 1SZ2A 2GELA 5B8HA 3VENA 4B1VA 1EQYA 2Q36A 3LDPA 5BRHA 5FPEA 4EIAA 2P9LA 1DKGD 3ENOA 3VGLA 2KHOA 3MN7A 2A6AA 5EXWA 4QS7A 3WXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DAWA 4YORA 3ALYA 5BREA 1NJZA 3VEYA 5M1NA 4V19S 5FRMA 4DR5K 3D6RA 2IVPA 5GADP 4WCEL 4BRQA 5I9EB 1NOZA 4CJTA 3SZ2A 3THWA 2DTUA 1S3XA 2B4JA 1X9JA 3P1GA 1M1KO 2P9UA 2HF4A 3TSUA 1XWLA 1BCMA 3OYFA 5J1EA 2DY4A 2GV9A 4DTJA 3HVTA 1BIZA 1M90O 1IG9A 3OBWA 2HHHK 2O8CA 2ZWHA 2UUBK 3K5LA 1OKJA 1FXXA 3THVA 4JEPA 5A2QO 3KK7A 3S41A 3QB0A 3VQ9A 1CXUA 1X1PA 5KPZA 2LSNA 3AVMA 2PYJA 3AO4A 5GAGP 3M8QA 4AQYK 3OW2M 4GV3A 3OVNA 2QWQA 3J7YP 4M3RA 4E7HA 1VQPN 4LFBK 2VG5A 5BPNA 4L8RB 3LPUA 3AARA 3VQDA 1RFQA 4Z4HA 4KHUA 4JYAK 5C0YA 2OPPA 4CEEA 4E7KA 1A5XA 4W5QA 4CZKA 4DSFA 4J2EA 3TTFA 3M8SA 1XC9A 4CJEA 4DV4K 4EHUA 1S9EA 1QQCA 4FM2A 4CBUA 4KREA 3OTOK 5KPRA 4DTRA 5AQOA 5TKWA 3HOSA 1N32K 2XO7A 1B9FA 4H0YB 4JKDA 2D1KA 1YJWN 3MEGA 3HPOA 4BC4A 4O4GA 3RRGA 4LF4K 4K43A 4K8XA 1QQOA 2OCEA 4CF9A 1RTIA 3OYJA 1HKGA 3DMJA 4RW6A 1NU0A 1S1XA 4NXNK 4CEAA 1WB9A 3UE5A 1S6PA 1TAUA 2O8FB 3AGRA 2E88A 4KTQA 3CHWA 3E1YA 1QS4A 3AA4A 2WUSA 2XY5A 2OA8A 1UAXA 4RW8A 1GLJO 4CHQA 3ZSOA 1TUUA 5AQHA 4FWSA 3UIQA 4FW1A 4OPHA 1KRPA 4KB1A 1N33K 4FK4A 4GW6A 2YNHA 3AV9A 4YFUA 4BGBA 1U48A 4F8RA 1HPMA 2Q0UA 2HHXA 3PLAA 1ITGA 4DFJA 4NYNA 3UKUB 3L4IA 1JJ2M 4I7FA 3D7EO 4O0IA 3NH1A 1BI4B 3LP2A 3CPEA 4OGCA 3LP3A 4KV8A 3K9KA 1JLEA 4Y1DA 1SKWA 1IKWA 5AZIB 2QK9A 3C6AA 4DSJA 2B6AA 1TKXA 3A5LC 1NWKA 1BUPA 3VEXA 1JL1A 1N8RO 3DJCA 3IUCA 4M41A 5MLCQ 3R9PA 3LP1A 3ZLJA 4M45A 1NK5A 3RMDA 4J2BA 3O8MA 1KFDA 3QETA 4O0JA 4GMJB 3CC7N 4CW7B 2PAVA 4DF4A 3C6UA 3GBTA 3QLHA 4YOUA 3CMAN 5JMVA 3KK3A 1JCGA 1I94K 3HYFA 2IDOA 1LW2A 2A3ZA 4H4MA 1KLNA 4H0PA 4DQ8A 1HNIA 3QFPA 4AH9A 1C6VA 3MN6A 2X78A 4Z4GA 1EO1A 4IDHA 2NNWA 3HO1A 2AP1A 3ENHA 4BC2A 4IKFA 1Q9XA 1QE1A 1HPZA 3NGZA 5AJ3K 2BANA 3HOTA 2XHBA 3SQ4A 3ATUA 3MDQA 1U4BA 3VTIA 4FWLA 4DS5A 3PO4A 4M63C 4X62K 1HKBA 2P9NA 1YI2N 3G71N 4DFPA 4ISFA 2JLEA 1BHLA 1JLGA 4FYDA 3MN5A 3TI0A 1OVQA 4JI2K 3FGUA 1RT5A 4J8FA 3AVFA 4ID5A 3V81A 1J5EK 1NKBA 5KRTA 1HYVA 3NMUA 4BRHA 4LFAK 1ASWA 4FL9A 4FLVA 2BDPA 2XRIA 2FSNA 1IV0A 1ATNA 1I39A 1WNSA 4ZHRA 4JI4K 1FKPA 4CHYA 4N5SA 1N34K 2UXCK 4BVOA 5AQQA 1Z26A 2VQEK 4WQ5A 3G6EN 3TSPA 1D5AA 3I56N 2NRVA 3F2KA 3OYHA 3SK3A 3TAQA 2VYPA 4LSLA 4U7BA 2O8BA 2KFZA 1WN7A 2KZZA 4WQ5C 4JD2A 2NRXA 1BOTO 3BGRA 5HLFA 4J2AA 4MLHA 4IG0A 2NZTA 3VEZA 4O55A 1FW6A 1RDUA 5FLXO 1HNXK 1VQNN 3NF6A 1UA0A 4DSLA 3V1RA 2GUIA 1EKEA 2GEMA 4IFVA 2FF3B 1BQNA 2GX9A 1QVFM 1MA9B 4QS9A 2DFHA 4O44A 3VQAA 3SUOA 1BDGA 4EFHA 1WBDA 4JI0K 3QEWA 2WONA 2YNGA 4OX9K 1BISA 5DMRA 3MAQA 3T3FA 1ASUA 3DOKA 5CE3A 5IWAK 4B9QA 2F7TA 1YJNN 1O1WA 1IKVA 2VGMA 4BWMA 4PHTX 2UXDK 3SAFA 3RSEA 3M3ZA 5C2DA 3IAYA 3BDPA 4BACA 4Q0BA 1XC3A 3U9DA 4AILC 1VQON 4JKFA 4F9OA 2Q2RA 4CGHA 2I7PA 5JLFA 4JKGA 5H1SQ 3ZEUA 1Q82O 3IKMA 3QIOA 3TTDA 1NKEA 4MO5A 1CZ9A 4PQUA 1XMOK 4KTWA 4B1WB 3CJCA 4FM0A 3H1VX 5HBMA 4FSVA 2Q31A 3C65A 1QVGM 2GWJA 4BROA 5KQ8A 2VCPA 4B3TK 1Z05A 2Y1JA 2P9SA 3IS9A 1ESVA 2P5OA 4BRMA 2E1ZA 3D2FB 1IJJA 4BY9C 5C25A 1XHZA 1V4TA 4NB4A 3WNFA 2P9IB 3VETA 4XEIA 1LAWA 3P83D 4B1YB 4WQ4A 1YTAA 5E84A 4CK2A 1WSIA 1TK0A 3FZMA 2ZJPL 2RN2A 4CEFA 2KZMA 1E3MA 3WNEA 2HSTA 2JWKA 2YX6A 1QQMA 3ZT3A 3BEXA 2CH6A 3S3NA 3CCJN 3MEEA 4WQ4C 3NVMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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