4XH4A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase a88v mutant, in complex with amppnp and propionate
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIVHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of substrate- and nucleotide-bound propionate kinase from Salmonella typhimurium: substrate specificity and phosphate-transfer mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720)
molecule tags Transferase
molecule keywords Propionate kinase
total genus 140
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2015-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A02
1J6ZA 3H45C 1C0FA 4GNIA 1GLCG 3QICA 1TYQA 4LC9B 1YAGA 3GBTA 4HTLA 1QHAA 2W41A 3TPQA 1TUUA 1GLDG 2P9PB 4BG8A 2P9LA 5BPLA 4H0TB 5AQLA 3ENHA 4FL9A 1SQKA 3GOIA 4H5TA 5E84A 5FPNA 3O1BA 2BUPA 2V52B 1NGFA 4IJNA 5JLFA 5KPTA 5AR0A 5BREA 3BUZB 3ZX0A 5I9EB 3D2EB 1HKCA 3BF1A 1NGDA 4IXCA 3U8XA 1HX1A 2NRHA 5AQHA 3VETA 2YI1A 2GWKA 3CIPA 3A8YA 3H6EA 3ID8A 3SJHA 1TUYA 2BTFA 2ZGYA 4FWKA 1EQYA 1KXPA 3EO3A 2HF3A 3AAQA 3AY9A 1WOQA 3BP8A 3H3NO 4H0YB 4I6MB 4BREA 4DHYA 1XUPO 3G25A 2E20A 3KVGA 5F1XA 3ULEB 4CZFA 4ISFA 5BPNA 2YCHA 4DCHA 3CQXA 1T6DA 2FF3B 1S22A 1U2VB 1BO5O 4FWLA 4PL8A 5KPZA 4FSVA 3FGUA 4BG9A 1X3MA 3QBXA 1X9JA 1RFQA 5AQFA 2CH5A 4EHUA 5KQDA 1YVNA 4O8KA 1GLEG 2ZF5O 3O1WA 2ITMA 4FWOA 2FSKA 4JNEA 1JCFA 3WXJA 4BC2A 3EL2A 3W0LA 5AQVA 3WQUA 3MMVA 2ZGZA 2D4WA 5AQSA 4B1XB 4CZKA 3VEZA 1XC3A 4FWSA 3GE1A 4NB4A 2P9NA 4YDUA 2J4RA 3MCPA 2IVNA 2E1YA 1GLFO 3KZBA 2D0OA 1S3XA 1K8KB 4PKHA 2HOEA 2CGKA 3MN6A 3M3ZA 3H1QA 1T44A 4CD3A 1WUAA 4FWPA 2VCPA 4BRCA 3FE1A 3ULEA 1HKGA 3MN7A 5AQZA 2P9SA 3O08A 1BA1A 2GWJA 1LCUA 4IO8A 3I8BA 2P9NB 1SAZA 5BN9A 5JMVA 3SK3A 3DAWA 3B8AX 3MDQA 1NLVA 4CD1A 2AP1A 1QZ5A 3LL3A 3LM9A 2QWMA 1YXQA 5FPEA 4MLEA 2Q2RA 1ZXOA 4CBWA 4IJAA 1Z05A 3VEOA 2GTDA 4QS8A 4E1JA 4CBXA 4BR9A 3LDNA 4H5VA 1NGCA 4K43A 1ZBSA 4Z94A 3DXMA 3CI5A 3UE5A 1BA0A 1U6ZA 4WQ5C 4CBUA 3JS6A 3CHWA 4BRDA 1NGEA 4DB3A 5AQXA 3ZETB 3VGKA 4BQZA 3HBTA 3AAPA 4FOEA 4H0OA 3HZ6A 4WQ5A 4MO5A 4BQLA 1ATRA 2D1KA 3I33A 2P9IA 3M6GA 4QS9A 3CJ7A 1NGGA 2KHOA 3C0BA 4CZLA 4EIAA 3IFRA 3L6QA 3FZKA 5B8HA 1DEJA 1K8KA 3QFPA 3D7EO 5ADXA 3QFUA 4YDUC 3WXIA 4AM6A 4JHDA 3VEXA 2HF4A 2ASPA 5EOYA 1Z6RA 2FXUA 3VEWA 1BG3A 3A0IX 3GL1A 3VF6A 3QMLA 3GG4A 4EAHD 2QWNA 2IIRA 2E2QA 2PBDA 3SLCA 3P4IA 1KAYA 4RTFD 3ZETA 4FWQA 2QWQA 5AQGA 3TU5A 3UKUA 2VWBA 2E8AA 5KQ8A 4BR2A 2A42A 3DXMB 4L3QA 4H5RA 4KBOA 5AQQA 3CJ1A 1NGJA 3JXUA 2F9WA 1NGAA 3UKRB 2EWSA 4EHTA 4F9OA 1T6CA 3GDQA 2QM1A 5AZIB 3RSEA 4BVOA 3IUCA 1DKGD 4BGAA 2VYPA 4BR7A 3ATVA 3F9MA 1HPMA 3ZX2A 4FPAA 1XQSC 2H3GX 4QS7A 1G99A 2E1ZA 3VEYA 4DQ8A 4WQ4A 4BRHA 4BRFA 1GLBG 3EZWA 2Q0RA 5ADXH 3QDKA 2I7PA 5AFUA 4EFHA 2IVOA 4M7YA 2P9KA 4RWTA 2QWLA 3EKUA 3HM8A 2PAVA 1RGIA 2E88A 2YHWA 3UKRA 3H1VX 4A61A 2FLOA 2FSJA 4BRMA 3LDOA 3WUHA 4HWIA 4XEIA 4BRAA 3SMSA 4H5WA 3ZX3A 3A5MC 4BC3A 3BF3A 4BRNA 4I6MA 3VPZA 2E2PA 4H0VB 3DJCA 2WUSA 5FPMA 3VESA 1H1VA 5EY4A 2FSNA 4CZJA 1GLAG 4B9QA 4PKGA 3U4LA 2CH6A 2QWRA 3BEXA 3CJAA 3VOVA 1IJJA 3EN9A 5JICA 4J8FA 4XH1A 4BC4A 1R59O 3VGMA 5BPMA 1QQOA 2NLXA 3IDHA 5LJWA 3ATUA 5LJVA 1ATNA 3LDLA 2Q31A 1HLUA 4K42A 2D0PA 3WXKA 4MO4A 4BR0A 4H03B 5F2RA 2Q97A 4BRKA 1BOTO 4JN4A 3VEVA 3M1FA 4MLHA 3VF4A 3DXKB 1NMDA 2W40A 2P9SB 3WEEA 1MWKA 4A62A 4B1ZA 4CZMA 5JLHA 3QB0A 4H0PA 5AQKA 4B1WB 2ASOA 1BWFO 4FWRA 5AQNA 5BRDA 2YHYA 1YUWA 3AARA 3R9PA 2Q1NA 3ENOA 4NO7A 3SMPA 4A2AA 4JHDB 2QXLA 2ZWHA 2DPNA 4RCHA 5AQMA 3VGLA 1NGBA 4CI6A 1Q18A 3FZHA 3DWLA 3WXLA 5KPRA 1OKJA 4BRLA 4BVPA 1V4TA 1Y64A 3FFKB 4AM7A 2P9IB 1CZAN 2GUPA 3CERA 1E4FT 2P9KB 3A5OC 3MN5A 3ZEUB 3H3OB 5BRFA 2UYTA 4CZEA 4BRQA 4FPBA 3VF2A 3HTVA 1ESVA 1D4XA 5BRHA 1QQMA 1NBWA 3L4IA 3WEEB 4Y0WA 4BRPA 1GLLO 4IWVA 3J8AA 2QW9A 3O5BA 3C7NA 3U9DA 4B1VA 4FWNA 4BRGA 4BGBA 3CETA 5AQTA 3O80A 5BN8A 4BRIA 3MK6A 3DXKA 2YHXA 1X3NA 5AZJA 3MN9A 4PKIA 1MDUB 1HKBA 1KAXA 2ASMA 3D2FA 3FZMA 4FOIA 3VENA 3WQTA 4M63C 4A2BA 5AQJA 5CE3A 2A40A 1MWMA 4CZHA 1SZ2A 3O8MA 4B1YB 2QWOA 2A41A 3R6MA 1GLJO 1V4SA 1BDGA 5EX5A 2A5XA 2I7NA 3CJCA 1JCGA 3O6WA 3EKSA 5AFUH 2CGJA 2V7YA 1RDWX 2GEMA 1BUPA 1IG8A 4XH5A 2A3ZA 4BC5A 3LM2A 3LDPA 3H46O 4H0XB 5AQIA 3HI0A 3KHYA 4K41A 3W3DA 4C23A 4PL7A 3LDQA 3A5NC 4XH4A 3UKUB 3D2FB 5AQWA 5TKYA 3FZFA 3HSCA 2Q0UA 1HJOA 2AA4A 4FO0A 4IZ9A 5AQUA 4CZIA 5BR9A 2YJEA 1U2VA 2E2OA 3CJ9A 3C7NB 1NGHA 4FWMA 3CJBA 3IMXA 2YJFA 4JD2A 1ATSA 5AQRA 2A6AA 4H5NA 4ISEA 3ZEUA 1P8ZA 1BU6O 2NZTA 1TYQB 5F0XA 1E4GT 1NWKA 1C0GA 4CJ7A 4ISGA 4JD2B 5AZIA 3FZLA 4CZGA 4WQ4C 2V51B 1MA9B 3FLCO 2CGLA 2P9UA 4BR4A 4JAXA 3CQYA 2V7ZA 2Q36A 5AZJB 5AQPA 3R8EA 1LOTB 4K25A 5LY3A 3A5LC 4WYBA 4BR5A 2HMPA 3QBWA 1KAZA 2GELA 3UB5A 2P9PA 2P9LB 2QWPA 1QZ6A 3FR0A 5EXWA 4B1UB 3U9ZA 3O4WA 1DGKN 1JCEA 3L0QA 5AQOA 3VERA 1NM1A 1QQNA 4M7XA 1HUXA 5FPDA 5AQYA 3S41A 2IVPA 2F9TA 2FF6A 3OHRA 4O5FA 5E26A 1ZC6A 1NGIA 2P9UB 3RSEB 4BROA 2E2NA 5ELZA 3WT0A 4GY2B 5EVZA 2OANA 3D2EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H45C 3ZSWA 5HRNA 1C0FA 1GLCG 1TYQA 5FLXO 1M90O 2OPRA 2W41A 3SQ4A 1DTQA 5M1KA 3OS2A 3VA0A 5BPLA 5AQLA 3ENHA 5E84A 1O13A 5FPNA 1QVGM 3DLLL 4FLYA 1L3VA 1SKRA 5JLFA 3KK2A 5AR0A 2P51A 5BREA 3SPZA 3KK1A 4AHRA 4E89A 1Q9XA 2KLAA 3ZX0A 5I9EB 4PUOA 1N32K 1C1BA 1VAZA 3D2EB 4IXCA 3CYMA 3S3NA 1U04A 3HP9A 5AQHA 2Z1IA 1RDCA 3OBYA 3HXMA 4B9UA 3ID8A 3AVLA 1TUYA 2BTFA 4WCEL 3OYKA 3L8BA 3OW2M 1KXPA 3AVGA 2HF3A 3MX5A 4DHYA 4E19A 3S9HA 4LF9K 4JKHA 4IOXA 4CZFA 2VWJA 2YCHA 3NF6A 3LZJA 4O44A 3J80O 1U2VB 1VQ6N 1ZBIA 4FWLA 5GIOA 4BWJA 4CECA 1NJWA 2NRTA 4A57A 4A5BA 3HVRA 3SAHA 1X9JA 3TWHA 1RFQA 1RTHA 1RDAA 1LV5A 3G71N 4KTWA 3SUOA 1UOCA 3SI6A 3ZT0A 2FSKA 2YX6A 4JNEA 1DT9A 3PO5A 4PQUA 1X9WA 3MMVA 2ZJQL 4JI2K 4DV6K 1S72N 2ZGZA 4B1XB 3ENBA 4NB4A 4JK8A 3K57A 5E41A 4YDUA 1SL0A 4B3TK 2E1YA 1S9GA 2D0OA 1S3XA 2QI2A 1REVA 3MAQA 3ZT1A 3DLRA 1WUAA 3MEDA 4DV3K 2VCPA 3KTQA 3FE1A 1QVFM 3AA2A 1HKGA 3QINA 3SYZA 5AQZA 3ISNC 4WFNL 2JGUA 3CC4N 4YNQA 4CF9A 4IO8A 2P9NB 4CEBA 4DU3A 5BN9A 5JVGL 1CLQA 5JMVA 3SK3A 1XWLA 3MDQA 4CGHA 1QZ5A 3LM9A 2QWMA 3K5NA 4EZ6A 3OYNA 1YXQA 3SJJA 3TARA 4B9NA 1OVQA 2G8HA 3OYBA 5IT9O 4DQQA 1YTAA 1Z05A 3HVTA 3VQ5A 1WAFA 2W6KA 4DG1A 1JJ2M 4FW1A 4CF1A 4BDPA 2O8DA 4Z94A 4CHOA 4O55A 1RBSA 1GOAA 1WLJA 4WQ5C 2XY6A 3CHWA 3RRHA 4DB3A 2HBJA 5AQXA 4BQZA 4DFJA 4JKDA 3HZ6A 2D5RA 1WBDA 3THYA 1ATRA 3SV4A 2KHOA 3C0BA 1WSEA 2WTUA 1M1KO 3IFRA 2O8BA 3L3VA 1SKWA 4GV3A 3NBPA 4UQGA 4B08A 4B9MA 2A1SA 1TKXA 1CXQA 3WXIA 4DTRA 4Z4EA 1NJXA 2GX9A 1TK0A 3B6OA 4FXDA 3BZCA 4EAHD 3TSUA 5KRTA 3O4QA 3SLCA 1ZBUA 4RTFD 5GIPA 3ZETA 2VWBA 5C15A 4KH4A 1VSFA 3TAFA 5KQ8A 3T1HK 2IAJA 1VK0A 3WNFA 3PIPL 4IFYA 4L3QA 4A5AA 2NRVA 5AQQA 3E01A 2HHUA 3UKRB 3CQ8A 3VQ8A 4AHVA 4C8KA 4CESA 4F9OA 4G1QA 1NK4A 2QM1A 3RSEA 4BVOA 1J5EK 2BGGA 1KVAA 5J1EA 3CCEN 2VYPA 4ILJA 4DSKA 3ATVA 1OH8A 3WNGA 2H3GX 4DQ8A 3AVIA 3EZWA 3T3FA 1SV5A 1LAVA 2LSNA 2JLEA 3P39A 2BDPA 1JLFA 3ZYYX 3SV3A 3JAMO 4FW2A 4M3RA 3SBTA 3L2RA 1L5UA 5HRRA 2PAVA 2RF2A 2E88A 1VQ8N 3H1VX 1ZYQA 2FBVA 4HWIA 4XEIA 1RBTA 1HR0K 4I9QA 2O8FB 3ZX3A 1QE1A 4BC3A 4CJ3A 3NGZA 1BIZA 3ZSVA 2E2PA 2DFEA 3VESA 2WUSA 2NRZA 1H1VA 4E7HA 3CF5L 1VSLA 3QEWA 3SUPA 4JI7K 1GLAG 4GV6A 2CH6A 3T19A 4JS4A 1IJJA 3ZT4A 3IS9A 4LD0A 1VQ7N 1R59O 3VGMA 4DLGA 3IDHA 3ZSRA 4Q0BA 1L3TA 2O8BB 5LJVA 3WXKA 2KZMA 4MO4A 3QO9A 4CF2A 4HVJA 2D0CA 3HYFA 5CY4A 5F2RA 4BRKA 3HJFA 5C2FA 3VF4A 4MLHA 4GMJB 3F9KA 2BE2A 5AQKA 4W5RA 3CCJN 2UUBK 1BWFO 4CJ4A 4FWRA 1BCOA 1C1CA 4A2AA 5DM7L 3HM9A 1RT2A 2P5OA 4OPHA 3OTOK 1KFDA 1DLOA 3D0PA 1W7AA 3NDKA 4JS5A 3J7YP 4CI6A 5HOOA 3WXLA 3DLKA 2OA8A 5KPRA 4DR7K 1YVUA 4AM7A 2GUPA 3CERA 3EZ5A 2P9KB 1QQCA 3LPUA 4JI6K 3TAPA 4FPBA 4CIGA 1D8YA 3IG1A 5AJ3K 4F4KA 3J8AA 3C7NA 3U9DA 4DSIA 1RDBA 2EX3A 4X64K 2F96A 3L3UA 4OVLA 5K14A 2ATQA 3E66A 4FJ9A 4OX9K 5AZJA 3MN9A 4PKIA 4CJLA 1NK0A 3D2FA 1RILA 4WFBL 2QK9A 4ELTA 5FDLA 2QTDA 1MWMA 1Q86O 4PWDA 4CZHA 2WONA 4FZZA 4F8RA 4ELVA 4CGDA 3R6MA 3OA9A 1X9SA 5EX5A 2P1JA 1C6VA 2A5XA 2I7NA 3O6WA 2D0BA 1VSJA 2V7YA 4CK3A 2IOCA 2VQEK 3LM2A 1NJIO 3SPYA 3J81O 3W3DA 1I94K 4PL7A 2JWKA 3ID6A 2XY8A 3UKUB 3LPTA 4DQRA 3R3LA 5TKYA 4MQ3A 2E6LA 4U67L 2Q0UA 4IZ9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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