4XH4A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase a88v mutant, in complex with amppnp and propionate
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIVHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of substrate- and nucleotide-bound propionate kinase from Salmonella typhimurium: substrate specificity and phosphate-transfer mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords Propionate kinase
molecule tags Transferase
source organism Salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720)
total genus 140
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2015-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A02
1CZAN 3O4WA 5ELZA 3MN6A 3SMSA 1G99A 5AQVA 3M1FA 4XH1A 5I9EB 3FLCO 3VENA 5JLFA 3KHYA 1QQNA 4BR7A 5BPLA 3ZETA 2YI1A 5AQWA 4BRMA 3UB5A 4FOEA 2V52B 4FOIA 4NB4A 4CZGA 1DEJA 2W41A 3ULEB 1TUUA 2ASPA 3CJBA 4QS9A 2Q31A 3U4LA 4DB3A 3DWLA 3BF3A 4CZKA 2BTFA 2FLOA 3QFPA 2HF4A 1KAZA 3HBTA 4ISEA 5LJWA 1P8ZA 3P4IA 2D0OA 1QHAA 3VF4A 4PKGA 5FPMA 1GLAG 3SLCA 2Q0UA 3VEOA 2E2NA 3CIPA 3W3DA 4JN4A 5BN8A 1C0GA 4A62A 2GUPA 3UKUA 3WXKA 3FE1A 3ZETB 4WQ4A 5JLHA 3F9MA 4CZFA 5B8HA 4J8FA 5AZIA 3VGMA 2QWPA 4YDUA 5EVZA 5LY3A 1S22A 3ENHA 3EN9A 3O80A 2HOEA 1ESVA 2FF6A 3QBWA 1ZXOA 4H03B 5AQGA 2BUPA 4H0TB 1RGIA 2YHWA 4FWOA 4CZLA 2QWQA 3ATVA 3ENOA 3H1VX 3I33A 3VEYA 2AP1A 3IFRA 4CZIA 3D2FA 1YUWA 3ZEUA 2A5XA 3BP8A 1NGJA 3UKUB 3O1BA 1BO5O 4FWRA 2FSJA 5F0XA 3CJ7A 4BREA 5AQLA 5LJVA 5KQ8A 2NRHA 5AZIB 4QS8A 4WQ4C 4BRCA 3CJCA 4FL9A 4WYBA 4QS7A 4BRHA 1WOQA 5EXWA 4M7YA 4O5FA 3O8MA 4YDUC 3VGKA 1SZ2A 3O6WA 5AQRA 1BUPA 3VF6A 4MO4A 2E2OA 3FZFA 2Q2RA 4A61A 3CJ1A 2P9IA 4HWIA 4H5NA 3SK3A 3D2FB 5BN9A 1MA9B 3ZEUB 2ZGZA 5BR9A 3R6MA 4PKHA 4HTLA 2ASMA 2CGLA 4BROA 3DXMA 2IVOA 4BG8A 4RWTA 4BRLA 1EQYA 5BPMA 3WEEB 5EOYA 5AQNA 4K43A 1QQOA 2P9LA 3GDQA 3LDLA 3WUHA 2QWLA 3EKSA 4C23A 4JNEA 4MLHA 2YJFA 4JAXA 5EX5A 1JCGA 3H6EA 3MN7A 4DCHA 2D1KA 2I7NA 4A2AA 2Q0RA 3WT0A 1HKGA 5AQHA 3LDPA 3GE1A 2YHXA 3CQXA 2H3GX 2F9WA 3CJ9A 1YVNA 3VF2A 4BRAA 3BF1A 5BRHA 2V51B 1HPMA 4AM6A 2P9IB 3H3OB 5AQSA 1NMDA 1HLUA 2A40A 2F9TA 3U9DA 4FWMA 1T6CA 5TKYA 2AA4A 3HZ6A 3VETA 1X3NA 3DXMB 3IUCA 3L0QA 3MDQA 1D4XA 3A8YA 5E26A 5BRFA 2P9LB 4BRNA 4BR0A 1X9JA 3CJAA 3H1QA 4MLEA 3SMPA 4BVPA 1JCFA 3GOIA 3CQYA 5E84A 4E1JA 1NGDA 3LM2A 4BRIA 3DJCA 2WUSA 1NWKA 3FGUA 3EZWA 1U6ZA 1E4GT 2NLXA 2GTDA 5AQXA 4BVOA 1BWFO 3B8AX 4LC9B 4DHYA 3D7EO 3GG4A 3I8BA 1ATRA 1Z05A 4I6MA 2YJEA 2CH6A 3OHRA 4M63C 2VYPA 3FZKA 5AFUA 4B1YB 4RCHA 1T44A 4FWSA 2UYTA 2FSNA 5BREA 3VPZA 1GLFO 3H3NO 1XC3A 4BC5A 4EIAA 3GBTA 3LM9A 2V7ZA 2CGJA 4B1UB 4BQLA 4CZEA 2QWOA 1GLCG 1KAXA 1V4SA 4WQ5A 1NGBA 5F1XA 1NLVA 4CBXA 1GLDG 1NGCA 1RDWX 3H46O 3JXUA 3M3ZA 3CERA 3BEXA 2YCHA 4NO7A 4H0XB 4BRPA 1U2VA 2ITMA 1NGIA 4IO8A 4ISGA 3KZBA 3ID8A 4CBWA 3LDQA 3U9ZA 1Y64A 2FSKA 2Q1NA 4BGAA 2P9NA 2ZWHA 1RFQA 3FZMA 4IXCA 4FPBA 4I6MB 5KPZA 3BUZB 5AQTA 5AQUA 3A5NC 1NGEA 5AQFA 4MO5A 1IG8A 2CH5A 3QMLA 3CETA 4XH4A 1LOTB 3H45C 3HSCA 4JHDA 4EAHD 2IVPA 5KPTA 1BOTO 3QFUA 2FF3B 3VESA 4CBUA 4H5WA 1V4TA 3W0LA 5KPRA 3JS6A 4FSVA 3VGLA 1HX1A 3G25A 2NZTA 3VEVA 4M7XA 2HF3A 4PL7A 1NGHA 3DXKA 4H0VB 1OKJA 2KHOA 4FO0A 1KXPA 1ZBSA 2QWMA 4IWVA 5AQPA 3IMXA 2E1ZA 1U2VB 4WQ5C 3MN5A 3EL2A 1T6DA 5JMVA 2QWRA 4H5TA 4F9OA 4CI6A 2VCPA 1YXQA 3WQUA 4BRDA 4O8KA 2P9NB 4B1WB 3LL3A 3ZX2A 4BR4A 2D4WA 3FR0A 3A5OC 1SAZA 1XUPO 4RTFD 3L6QA 1DKGD 4CJ7A 1QQMA 4BC3A 1K8KA 5AQMA 4Z94A 1MDUB 3HM8A 4JHDB 4GY2B 3UKRA 5ADXA 2PAVA 3VEWA 3GL1A 5AFUH 2E2PA 2GWJA 1GLBG 1JCEA 2Q36A 3DAWA 2Q97A 3FZLA 4FWQA 3AAQA 1WUAA 4CZMA 4XEIA 4DQ8A 1GLEG 4BRFA 4CZHA 1BG3A 3R9PA 1E4FT 2QW9A 3WXLA 4A2BA 2FXUA 2W40A 3UE5A 4B1ZA 2YHYA 3J8AA 4BGBA 4BQZA 3MN9A 5JICA 2EWSA 4ISFA 3QBXA 1TYQA 2A6AA 4BR5A 4CD3A 2P9KA 1NGGA 3QB0A 5AQOA 3ATUA 2E2QA 3SJHA 1BA1A 1YAGA 4B1VA 3EKUA 1K8KB 4H0YB 3TPQA 5AQJA 2QWNA 3D2EA 3UKRB 4EHTA 3A5MC 5CE3A 3A0IX 1C0FA 4B1XB 2IVNA 5BRDA 5AQKA 3ZX3A 4BRQA 3LDNA 5AZJA 2GWKA 2E1YA 1ZC6A 2CGKA 2ZGYA 4BR2A 3A5LC 3IDHA 3M6GA 4CD1A 2GELA 1HKBA 3KVGA 4K25A 1ATSA 3EO3A 3O1WA 1TYQB 2P9UA 3AAPA 1SQKA 3C0BA 2P9KB 2E20A 3WQTA 3L4IA 4H5VA 4JD2A 5FPDA 2PBDA 5AQQA 3LDOA 3VERA 1HKCA 3VEXA 4FPAA 5AQYA 1NGAA 4BR9A 4H0OA 1HUXA 2P9SA 3R8EA 3TU5A 3ZX0A 4B9QA 1GLLO 3RSEA 3D2EB 4FWNA 4FWLA 4IJNA 4BG9A 3WXIA 4BRKA 2E8AA 1HJOA 3C7NA 3HI0A 1KAYA 1QZ6A 5BPNA 3FFKB 4Y0WA 2A41A 5ADXH 2A42A 5AZJB 1BU6O 5FPEA 2J4RA 1Q18A 1J6ZA 1XQSC 3O5BA 3QICA 2P9UB 4PKIA 4BC2A 1LCUA 4FWKA 1BDGA 2E88A 5FPNA 2QM1A 1BA0A 1ATNA 1MWKA 2D0PA 2P9PA 2VWBA 5KQDA 4JD2B 3MCPA 3U8XA 1QZ5A 2IIRA 4KBOA 3WEEA 4FWPA 3QDKA 4CZJA 4IJAA 2HMPA 2P9SB 1X3MA 4EFHA 1TUYA 3RSEB 2ZF5O 4EHUA 3S41A 1Z6RA 4K41A 1NM1A 3VEZA 1R59O 3AARA 3C7NB 2DPNA 5AQIA 3HTVA 4PL8A 2QXLA 4H0PA 4H5RA 2A3ZA 5F2RA 1IJJA 4BRGA 1DGKN 4BC4A 5AR0A 2ASOA 2I7PA 4GNIA 4AM7A 4K42A 4XH5A 1H1VA 3CHWA 1GLJO 3MK6A 1MWMA 4L3QA 3ULEA 3CI5A 5EY4A 3O08A 2P9PB 1S3XA 5AQZA 2GEMA 4IZ9A 3FZHA 2OANA 2V7YA 3WXJA 1NGFA 3DXKB 3VOVA 3MMVA 1NBWA 3AY9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O4WA 4FM2A 3QINA 3B6OA 4CJTA 5C15A 1N33K 4CJSA 1L3TA 1YT3A 2B5JA 4DS5A 3JYTA 5H1SQ 4BRMA 3TAMA 3NH2A 3Q7CA 2B6AA 4FOEA 4KHYA 4CZGA 4M3UA 4FJKA 2XY8A 3WNHA 5IWAK 3CCVN 4W5TA 3PV8A 1KC8O 1RDUA 2UXDK 3U4LA 1FW6A 1C0UA 5HRPA 3AVAA 3HBTA 3SQ0A 3HL8A 3P4IA 1NK6A 3TAQA 4N56A 4KRFA 3LP1A 3VEOA 5HP1A 3CIPA 3OYMA 2Z1IA 4IDKA 4DSKA 3V4IA 2EHGA 3FE1A 4JKCA 2WONA 4AH9A 4CEDA 4LH4A 3J80O 4OPAA 4JI2K 3CCQN 2BH1A 3S9HA 4CEFA 2QWPA 5EVZA 5LY3A 3OYJA 2IOCA 2HOEA 4JI6K 1ZXOA 3VQ8A 3P83D 3ZYYX 3OYNA 1IV0A 4CJPA 3I33A 5DK5A 3IFRA 3D2FA 4I7FA 4M45A 1YUWA 3ZEUA 3CF5L 1NGJA 3UKUB 5KTQA 3SPYA 3K0SA 4DTRA 1TAUA 1Y97A 3DYAA 3SBGA 4C1NK 1R0AA 1HJRA 3AA4A 1VQ6N 1Q9YA 4WFNL 4PA1A 4BRHA 3PUFA 3HP6A 1S6QA 2O8BA 1SZ2A 1JLGA 1BUPA 3LZIA 1NNEA 3QEPA 4DV6K 4KHWA 4B3RK 2E2OA 1TL3A 3AVIA 2E4LA 4FJ9A 3HYFA 3VQCA 4DSLA 3CJ1A 4KH6A 4H5NA 3SK3A 1MA9B 2HHXA 4KKOA 1FKOA 1C1AA 4HTLA 3DXMA 3SI6A 4BRLA 2O4GA 2G8UA 1QQOA 3WUHA 4ELTA 4JNEA 3B6PA 1BQNA 1XHXA 1SL2A 4X66K 5M1PA 1JLEA 2NRTA 3LDPA 3GE1A 4V19S 2F9WA 3CJ9A 3VF2A 2QKBA 4BRAA 4WE1A 4DSJA 4KAZA 2P9IB 1IKYA 3VQ6A 1NMDA 1HLUA 3V6DA 2BGGA 1X3NA 3I0SA 4CIGA 1YVUA 3L0QA 3CCJN 4IDHA 4WFAL 3DRPA 1WLJA 1JLCA 2P9LB 4DS4A 1T3VA 3VA0A 3O9RA 5KRTA 2QXFA 1QTMA 5E84A 3LM2A 5T7BA 1NWKA 3VQ5A 1U6ZA 4WCEL 3EEQA 4AHRA 3G6EN 3D7EO 1O1WA 4DSFA 3CC4N 1Z05A 3OHRA 1S5JA 2O8EB 4B1YB 3KIOA 2A1SA 4B9NA 3UIQA 3VQQA 4FM1A 2O8CB 3VPZA 4CEAA 3KLGA 1S1VA 1EETA 1IBLK 3CFRA 3GBTA 3LM9A 4JKGB 3T1AA 5LMUK 2ETJA 1JL2A 1TKXA 1HQEA 3LP3A 1V4SA 3CM6A 4WQ5A 2UXCK 5F1XA 4CBXA 1GLDG 1NGCA 3H46O 3M3ZA 3THWA 2D0BA 1FJGK 5J2QA 1D8YA 3KWIA 4CEZA 4CK1A 1BGXT 3KK1A 4CBWA 1WSFA 3LDQA 2P9NA 3DOKA 4IEIA 5AQUA 3SBTA 3QMLA 3CETA 4M3ZA 3MXJA 3J7AP 1LOTB 3V9UA 3DRRA 3HSCA 4CJQA 3O3GA 1LWFA 4CBUA 4DV0K 4H5WA 3W0LA 4QOZB 4AF1A 1ZBIA 3G25A 1IKXA 4DU1A 3P38A 3VEVA 4DTNA 4LSNA 3DXKA 1KFSA 4OLBA 1RTIA 4OPHA 1ZBSA 2QWMA 3ENBA 2PFUA 1QVGM 4OGCA 4CHQA 2HVIA 3MAQA 1T6DA 4A5AA 4O8KA 2VWKA 4BR4A 1SAZA 1XUPO 2GBZA 1QQMA 4FZZA 3VA3A 3HM8A 3UKRA 4CGFA 1T8EA 1KD1O 4ELUA 2PAVA 4N41A 3VEWA 1HNWK 2E2PA 3CCMN 1BCOA 1OH5A 2Q36A 4DKWA 1QHTA 4XEIA 3Q7BA 3F2KA 3R9PA 1E4FT 2QW9A 4K8ZA 4M42A 2FXUA 3AO3A 3K5OA 5LL6Z 3KLHA 1OH7A 3UE5A 1SL1A 4BQZA 4DTJA 3OVNA 1ASUA 4CEEA 4DTXA 2GX9A 1XWLA 3VN5A 4HUEA 2RPIA 3CCEN 4FJ8A 2E2QA 1S9EA 3AV9A 1ITGA 4PQUA 4KB0A 4CVNE 3KJVA 4CJVA 1VSHA 3TPQA 2AJQA 2QWNA 3OYLA 3THXB 4EHTA 1VSEA 5CE3A 3A0IX 2O8DA 3V9ZA 4N47A 5GAHP 4CF8A 2IVNA 4NLCA 1C0TA 3AO1A 2YNFA 4BRQA 5J1EA 3T19A 2ITGA 4YNQA 5CR4A 4FVUA 3M6GA 2PZSA 5FLXO 4JKAA 2QEXN 3HSTB 4K25A 4DSEA 2OTLN 1T05A 4FJMA 2DY4A 1SQKA 3PIPL 3WQTA 3L4IA 3DI6A 2PBDA 5AQQA 1CZBA 1IBMK 1HKCA 3VEXA 4FPAA 4DUYK 2VG5A 4DV7K 2ZE2A 4UQGA 3TU5A 3R8EA 4HUFA 3FFIA 3D2EB 4BG9A 4FWLA 3KK3A 3WXIA 3OY9A 2UUCK 4E1MA 1HJOA 3SCXA 3C7NA 3S3NA 3HI0A 1QZ6A 1KCFA 1KVBA 4Y0WA 4LF7K 1EWQA 3EE8A 4MQ3A 5AZJB 4B3OA 4KTWA 4JEPA 2HHSA 2J4RA 3SYZA 1M1KO 3CXCM 1Q18A 1K6YA 1ASVA 3O5BA 2VQEK 2XO7A 2HNZA 1ATNA 4Q5VA 1X9WA 3IKMA 5KQDA 3VQBA 3U8XA 2IIRA 4CECA 3WEEA 3VQ4A 5TKWA 3RSEB 4I2PA 2ZF5O 5C10A 3CQ8A 3TAGA 3NGZA 4K41A 2D0CA 5HL7L 2DPNA 4PL8A 4YHHK 4H0PA 2HHWA 2NNWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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