4XH4A

Crystal structure of salmonella typhimurium propionate kinase a88v mutant, in complex with amppnp and propionate
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
FPVVLVINCGSSSIKFSVLDVATCDVLMAGIADGMNTENAFLSINGDKPINLAHSNYEDALKAIAFELEKRDLTDSVALIGHRIVHGGELFTQSVIITDEIIDNIRRVSPLAPLHNYANLSGIDAARHLFPAVRQVAVFDTSFHQTLAPEAYLYGLPWEYFSSLGVRRYGFHGTSHRYVSRRAYELLDLDEKDSGLIVAHLGNGASICAVRNGQSVDTSMGMTPLEGLMMGTRSGDVDFGAMAWIAKETGQTLSDLERVVNKESGLLGISGLSSDLRVLEKAWHEGHERARLAIKTFVHRIARHIAGHAASLHRLDGIIFTGGIGENSVLIRQLVIEHLGVLGLTLDVEMNKQPNSHGERIISANPSQVICAVIPTNEEKMIALDAIHLGNVKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Salmonella typhimurium (strain lt2 / sgsc1412 / atcc 700720)
publication title Structures of substrate- and nucleotide-bound propionate kinase from Salmonella typhimurium: substrate specificity and phosphate-transfer mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords Propionate kinase
total genus 140
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 2.7.2.15: Propionate kinase.
pdb deposition date 2015-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4xh4A02
1HKCA 3MN9A 3SMPA 3MDQA 3U8XA 5KQDA 2E88A 4BRDA 4HTLA 4IXCA 3W0LA 1E4FT 3QFPA 1S3XA 3H3NO 5JLFA 1CZAN 5AQWA 3HI0A 2VWBA 5AQYA 1C0FA 2Q97A 5FPNA 5EX5A 4XH4A 3FZMA 4JHDB 4WQ5C 2ASMA 4ISFA 5BN8A 3O08A 4BQLA 1KAZA 2Q2RA 5ELZA 3LDNA 5AQGA 5LJVA 1QQMA 1LCUA 3QB0A 1TYQB 3D2FB 4FOEA 4CJ7A 5AFUA 3FZLA 4CZJA 4EHUA 4JAXA 4BC5A 3H6EA 2ASOA 1NGCA 4NO7A 2FLOA 3LM9A 1Z6RA 3GG4A 3FFKB 2P9SB 3CQXA 4B1YB 4QS8A 2Q0UA 2ITMA 2Q36A 1ATNA 4FWNA 4PKIA 4H5RA 4FWMA 3M1FA 2H3GX 4Z94A 5AQFA 3QFUA 5E84A 4BC4A 3QBXA 3ID8A 4M7YA 2ZGYA 3VESA 3C7NB 5KPTA 1SZ2A 3C0BA 4B1VA 2F9WA 3DXKA 3CI5A 4BRPA 3D2EA 2IIRA 5F1XA 1HUXA 4XH5A 2GUPA 4WYBA 2D0PA 3VOVA 5BRHA 2P9NA 4EHTA 3WXJA 4H5WA 1QHAA 1NGEA 1XC3A 1NBWA 3BF3A 4CZLA 2E8AA 2YI1A 5JMVA 1BG3A 1GLFO 2CGLA 2Q31A 5B8HA 3FZFA 2D4WA 2GELA 3LM2A 4FWOA 2E20A 3O8MA 4I6MA 2D1KA 4QS7A 4RWTA 2P9UB 3VERA 4O5FA 3VEZA 1IG8A 3VPZA 3D7EO 1GLJO 2F9TA 3MMVA 3WT0A 3QDKA 5KQ8A 1MWKA 2V51B 4LC9B 3CIPA 5AQRA 3O80A 1HKBA 5JLHA 2ASPA 4PL8A 3JXUA 4RTFD 5AQJA 4A62A 1NLVA 2NZTA 2QWOA 3O1WA 3VGMA 3DJCA 4E1JA 1HPMA 4JHDA 3EO3A 1GLAG 4FOIA 1NGGA 5BPMA 3O4WA 5TKYA 1NM1A 3L6QA 2Q0RA 2FF3B 3KHYA 4H03B 3M3ZA 4JN4A 2A3ZA 1XUPO 3ENHA 4MO5A 5AQZA 4BR5A 1TYQA 2YJFA 3D2FA 4H0PA 2BTFA 1NGIA 3GOIA 4JNEA 3EN9A 1H1VA 2V52B 3CJCA 1ZXOA 2P9SA 2D0OA 1K8KA 4H0VB 4IZ9A 1QQNA 4PKGA 4WQ4C 3W3DA 4H0XB 3WXIA 1E4GT 5BN9A 4WQ4A 3O1BA 2P9LB 2HMPA 3H46O 3ULEB 4DHYA 5FPDA 3HSCA 3BP8A 2CGJA 3A5MC 3ZETA 3CQYA 4JD2B 1BA1A 1BOTO 2CGKA 2EWSA 3C7NA 1HX1A 4BC2A 1TUYA 4BREA 4CBWA 2OANA 4IJAA 2IVPA 5AZJB 2CH5A 5AQUA 1QZ6A 3WUHA 2QWLA 3BF1A 3B8AX 2Q1NA 5AQVA 3JS6A 4WQ5A 1RGIA 3G25A 3VEXA 1Y64A 2ZF5O 3KVGA 3DXMB 2A5XA 3KZBA 3R9PA 3SLCA 4MLHA 3SJHA 3U9DA 5AQHA 5AQQA 1DKGD 5AQTA 3EZWA 4FPAA 4ISEA 5AQMA 3FZHA 1HJOA 3AAPA 1Q18A 1XQSC 4J8FA 3UKUA 3HZ6A 4QS9A 4O8KA 2P9UA 1YAGA 2YCHA 4BRMA 4CBUA 1BO5O 4YDUC 3CERA 3LDQA 3ENOA 4YDUA 4CZMA 3HM8A 4CZHA 1YXQA 5EY4A 2KHOA 4BRHA 4BRLA 1T44A 4K41A 1ATSA 3CJBA 3QBWA 3A5OC 2AA4A 2DPNA 3EL2A 5F2RA 5KPRA 3L4IA 5FPEA 2FXUA 1BDGA 2E1YA 4DB3A 3AARA 1QQOA 5AQIA 1MDUB 3TU5A 4BRAA 3WEEB 3H3OB 3F9MA 4BRQA 2E2OA 3RSEB 4BRGA 1JCEA 3OHRA 4DCHA 1LOTB 2GEMA 2V7ZA 4EFHA 4EIAA 3IDHA 3QICA 2P9PB 4BR7A 4CD3A 3VEOA 2P9IB 4GNIA 2A41A 2W41A 2P9LA 1NGDA 3ULEA 3O6WA 5JICA 1GLLO 4FO0A 2FSJA 2E1ZA 4IJNA 4BROA 1TUUA 4FWKA 1BU6O 1QZ5A 4JD2A 3U9ZA 2YHYA 2PAVA 3ZX0A 2P9KB 5AR0A 3CJ7A 2GWKA 3VF4A 5AZJA 4PKHA 3VF6A 2VCPA 1X9JA 4XH1A 2QM1A 4MO4A 2NRHA 3BUZB 3A0IX 4GY2B 4BG8A 2AP1A 3VETA 4AM7A 1V4SA 4CZIA 4NB4A 1S22A 2BUPA 3LL3A 4PL7A 3DXMA 4BRNA 5KPZA 2I7PA 4DQ8A 3EKSA 4M7XA 4FL9A 3A5LC 1NGFA 3WXKA 3IUCA 5BREA 1X3NA 2IVNA 3DAWA 4BQZA 3P4IA 3CJ1A 4BRKA 2CH6A 4B1ZA 3VF2A 4CI6A 4FPBA 3GDQA 5AQKA 1GLEG 2GWJA 4BG9A 2A6AA 3R8EA 4F9OA 3FGUA 5AQNA 4FWQA 4H0TB 3LDOA 2J4RA 4FWSA 4AM6A 2A40A 1MWMA 3S41A 2UYTA 1HLUA 4H5VA 5F0XA 3L0QA 3QMLA 3IMXA 4B1WB 5AQXA 5E26A 1J6ZA 5BRFA 1T6CA 3VGKA 5AQPA 3UKRB 3FZKA 3WQUA 2E2PA 3WEEA 3CJ9A 1YUWA 2HF4A 2NLXA 1NWKA 3H1VX 3GE1A 2YJEA 3ZEUB 2QW9A 4BRCA 4CD1A 2PBDA 3VENA 1C0GA 5BRDA 2FSNA 1ZBSA 3RSEA 2FSKA 4A61A 3I33A 3VGLA 4BR9A 3MN7A 1NGJA 2P9PA 5ADXH 4K42A 5LJWA 2P9IA 1U2VB 4BGAA 1SQKA 3EKUA 4FSVA 3VEVA 4BR0A 1DGKN 1GLDG 3LDLA 4A2BA 5BR9A 3TPQA 3VEYA 3WQTA 3SMSA 3UB5A 1Z05A 1RDWX 4B9QA 1ZC6A 3FLCO 2P9KA 2WUSA 1KAXA 1JCFA 3ZX2A 3DWLA 3ZX3A 4BC3A 3I8BA 5AZIB 4CZEA 3UE5A 4EAHD 1P8ZA 4K25A 1K8KB 1WUAA 4HWIA 2E2NA 5EOYA 3IFRA 5BPLA 2QXLA 3VEWA 3R6MA 4A2AA 3ZETB 3MN5A 5AQOA 5LY3A 4FWRA 1NGBA 2QWPA 4IO8A 4CZFA 1YVNA 1X3MA 1BA0A 1GLBG 1RFQA 4IWVA 4H5TA 4B1XB 3GL1A 1HKGA 1NGHA 3MCPA 3AAQA 4H0OA 2A42A 5EXWA 3A5NC 3AY9A 1G99A 3GBTA 4BRIA 4C23A 3ATVA 1ATRA 4FWLA 1BWFO 3FR0A 1IJJA 4BGBA 1D4XA 3MN6A 4ISGA 2I7NA 5AQLA 2W40A 3M6GA 1EQYA 1KXPA 5ADXA 4CBXA 4XEIA 3UKRA 3CJAA 1SAZA 4BRFA 5BPNA 1V4TA 3UKUB 4FWPA 4Y0WA 3ZEUA 2FF6A 3HTVA 4KBOA 4M63C 1NMDA 5FPMA 2VYPA 2GTDA 1GLCG 4B1UB 1KAYA 2ZGZA 1BUPA 3LDPA 3MK6A 4CZGA 5AFUH 3O5BA 1U2VA 3H1QA 3H45C 3DXKB 3J8AA 5CE3A 3WXLA 3D2EB 2ZWHA 3A8YA 2YHXA 4H0YB 4MLEA 3U4LA 2YHWA 3CETA 5EVZA 4BVPA 2E2QA 2HF3A 4CZKA 2QWMA 1DEJA 1U6ZA 1R59O 1T6DA 3ATUA 4BR4A 2P9NB 1MA9B 5I9EB 3CHWA 5AZIA 4BR2A 3HBTA 4K43A 3SK3A 4RCHA 1OKJA 4H5NA 1NGAA 2QWQA 2HOEA 4BVOA 4I6MB 2V7YA 3FE1A 4L3QA 1WOQA 5AQSA 2QWRA 2IVOA 1ESVA 3BEXA 1JCGA 2QWNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IT9O 3MXJA 4DV3K 4BRDA 3E66A 1JLBA 1KVBA 1S3XA 3H3NO 1G15A 3CFRA 3TI0A 2P51A 1KQSM 4KH5A 2XHBA 3PX6A 5BN8A 4KKOA 3QEPA 5C2DA 1QQMA 2ZJPL 2Z1JA 1LCUA 4ID1A 1HYZA 3D2FB 3ZSRA 3HSTB 1N33K 1LW2A 3T69A 4EHUA 1N6QA 3OTOK 2FLOA 1U48A 3ZT2A 2P9SB 3HPGA 3BDPA 3ZCMA 2ITMA 3NBPA 3ZSYA 5JS2A 4MQ3A 4DWIA 5AQFA 3O9SA 3L2WA 2VWJA 3KKRA 2ZGYA 3RRGA 3C0BA 4B1VA 4BRPA 3DM2A 1RT1A 4B3TK 3TABA 2WOMA 2KZMA 4U67L 1O13A 3K5NA 4B9SA 1VQ9N 5BRHA 3K5LA 2W42A 2NRRA 3WXJA 4CJKA 1BQMA 1D8YA 4DTJA 4IDHA 1VQKN 4FK4A 1BG3A 4KB0A 2CGLA 3BZCA 1JJ2M 4FJIA 2D4WA 4LF9K 1EETA 4I6MA 3I8DA 1TVRA 4KHWA 4CGFA 3CPWM 3RWUA 1QSYA 3D7EO 1J53A 3WT0A 1ZBHA 3ZT1A 2HBKA 3DLKA 4KHQA 4ELUA 3VA3A 4CGGA 5J2MA 2ATQA 4LSNA 2ASPA 4W5TA 2QA4N 3VGMA 1BGXT 2ZJRL 3AV9A 3ZSVA 4FLYA 4FOIA 5BPMA 3V1OA 2YKMA 3L6QA 4JKHA 4DV5K 2G8VA 3KHYA 4H03B 3ENHA 4MO5A 4BR5A 1TYQA 1A5VA 4H0PA 5DM6L 5M1FA 3T19A 4JNEA 4DQIA 1O1WA 4B3OA 2FC0A 3HRGA 2D0OA 3IG1A 3WXIA 3THWA 1QQNA 1X9SA 4KRFA 3W3DA 1E4GT 4K8XA 4WQ4A 3T7ZA 4UQGA 3O1BA 3LWMA 3RMAA 3LALA 4DHYA 3ULEB 3PO5A 2Z1IA 4DG1A 3BP8A 3V81A 4JKGA 3A5MC 3R3LA 3FFIA 1BA1A 4DUZK 4CHOA 1HX1A 2NNWA 4FK0A 1RTJA 4DS4A 4J2BA 3D0PA 1D9DA 4JYAK 2KTQA 2QWLA 3BF1A 3B8AX 3CMEN 5CY4A 1NK5A 4PQUA 3G25A 3J7ZO 3A2FA 3L2UA 3SPYA 1KCFA 1OVYA 3R9PA 3SLCA 1KVCA 3OYMA 4FLVA 1VAZA 3C94A 4W5NA 5KRSA 3SJHA 3U9DA 3NGYA 3QLHA 5AQQA 1DKGD 4W5RA 3LP0A 4JLHA 4M3TA 3F5TA 1BCOA 1HJOA 1Q18A 5AJ3K 3OY9A 1YITN 4FJMA 4JKAA 3VQCA 3O3HA 2NUBA 3TANA 2O8EB 4YDUA 4CZMA 3P1GA 4FJJA 3AVKA 4KTWA 1N36K 4Z4GA 1T44A 4K41A 3CJBA 2AA4A 3EL2A 4BWMA 5F2RA 2R7YA 5KPRA 2FXUA 2E1YA 1J9AA 3AVCA 3AARA 5AQIA 1MDUB 3HPOA 2O8CA 3TU5A 3H3OB 3KWGA 4E1MA 4B9MA 1TKDA 4Z0UA 3KWIA 3RSEB 2OPRA 4OPHA 2HNZA 3OHRA 2D0CA 4DCHA 4EIAA 4Z4IA 3IDHA 3QICA 4IEIA 4HVJA 1W0HA 1JL2A 2P9LA 2VQFK 3O6WA 3CCSN 1TK0A 4E3SA 2F96A 3L2QA 1S6QA 2FSJA 2WBNA 4FWKA 4GMJB 4E7KA 1FJGK 4CJQA 2PAVA 1NK0A 5AR0A 4KFBA 3CJ7A 3MEDA 1WN7A 2GWKA 3VF4A 1E3MA 5AZJA 5FLXO 1S1TA 2VCPA 4XH1A 3EZ5A 3U3YA 1JL1A 4OGCA 4GY2B 1TGOA 2AP1A 3VETA 4OKEA 3G10A 2BUPA 4DF8A 2HHSA 4DR5K 4BRNA 3ENBA 2O8DB 3VQPA 5M1QA 4IFVA 5C12A 1BISA 4FL9A 5CZ2A 4CHNA 1GOCA 5HBMA 2UU9K 4DV0K 3WXKA 1IKVA 4NCBA 1KFSA 4FK2A 1QQCA 1RTIA 4BQZA 2FBTA 1RTHA 2AJQA 3L4QA 4JEPA 3VF2A 1J5OA 3AGKA 2A6AA 3JYTA 3MWPA 3R8EA 3DLBA 2DY4A 1BIZA 3TSQA 5GINA 3QETA 4H0TB 3LDOA 2J4RA 4CK1A 1N32K 4FVMA 3P31A 4QAGA 5TKWA 5F0XA 3QMLA 4B1WB 4CHPA 5BRFA 1KLMA 3CCQN 2XY7A 3CJ9A 3EE9A 2HF4A 3SAHA 2YJEA 3ZEUB 1NKBA 1UOCA 5HRSA 4CD1A 3S3OA 2PBDA 5BRDA 1C0GA 1M1KO 1ZBSA 1JKHA 5M1KA 4IO9L 3AA2A 3MECA 3I33A 3VGLA 4HTUA 4TSXA 3CD6N 4K42A 2P9IA 4C1NI 2VGNA 1RT3A 4U7BA 4FSVA 3VEVA 4BR0A 2E5LK 3HL8A 4DFMA 5DM7L 1GLDG 5BR9A 4A2BA 3KLIA 4DV6K 3QNOA 4MDBA 3VEYA 3ISNC 5D3GA 2OTJN 2YNGA 1Z05A 5HL7L 3OJSA 4YOXA 4JI1K 2P9KA 1NJYA 2HHUA 1W2BM 3AVNA 2FBXA 1KAXA 1M90O 1QTMA 3OYKA 4UY8O 1Q9XA 1K8KB 5C25A 5KTQA 4IOAL 4G9ZA 1BI4B 5BPLA 1VQ4N 2HBJA 3NF9A 3WNHA 3DI6A 4WE1A 3MN5A 5CYQA 5AQOA 2DFHA 2IDOA 4CZFA 3WXMB 3GL1A 3SUPA 1KTQA 3CFOA 3CCUN 3AAQA 5EXWA 3AVLA 1YF5L 2OYQA 3OYLA 3GBTA 3CMAN 4CF1A 1Q9YA 4CF2A 3SJJA 3MN6A 4ISGA 3HOTA 2W40A 3SUOA 1XWLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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