4XN6A

Crystal structure at room temperature of hen-egg lysozyme in complex with benzamidine
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Combining `dry' co-crystallization and in situ diffraction to facilitate ligand screening by X-ray crystallography.
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4xn6A00
1QTKA 4LYTA 4GN3A 4NGZA 4YF2A 135LA 1IP4A 2BQIA 4LT0A 1LJNA 5E4PA 1GE0A 4H93A 4NG1A 2FBBA 2ZQ3A 5KKJA 2HU3A 5KXZA 1D6QA 4XJFA 1AKIA 1OUBA 1GF3A 2GV0A 2Z38A 5KXYA 4WLDA 3RT5X 1GF4A 4Z46A 1LSFA 4GCEA 1GE4A 2DQGY 4XADA 1I56A 4L41A 3TMWA 1FKVA 5APFA 2ZWBA 2RSCA 4RW1A 1GHLA 1EQ4A 3M3UA 1GBWA 1A2YC 1IWYA 5B59A 1JISA 1GD6A 1LZ5A 1IWTA 1GXXA 1TDYA 1UIGA 3W6EA 2DQIY 2H5ZA 3WPLA 154LA 2IFFY 1IWXA 1HELA 1JITA 1GF7A 2VB1A 2ZIJA 1KXXA 3GXKA 1B5WA 1OUFA 3P68A 1GFEA 1W08A 1YKYX 2Z2FA 3D9AC 4H9AA 1LKRA 5C6IA 5KXNA 4ETDA 1GB9A 1H6MA 1YAOA 5D5CA 5HLLA 5F9UA 1D9UA 5KJ9A 1B5VA 1JTOL 4WG7A 1LJFA 4ETAA 3WW6A 4UWVA 4PRUA 3TXJA 1HEPA 4AGAA 3SP3A 1OUAA 2BQFA 5LVKA 5LIOA 5DN5A 3B0OA 5KKIA 5B06A 1J1OY 1RI8B 1SLYA 3AZ7A 2Z18A 1LHMA 4NGYA 1B5ZA 1LMTA 1UC0A 4GN4A 1QIOA 3TMUA 1IWWA 5L3HA 5IHGA 1REXA 5LAGA 2XBRA 3AGGG 1O23A 1LTMA 5I53A 4RDSA 1LYYA 2ZNWY 3LYTA 1BHZA 5LA5A 1GB2A 4GN5C 1FDLY 3HFMY 5I4YA 1GFRA 1LSDA 4HPEA 5ILFA 1LZ8A 1IY4A 1NKHA 1I1ZA 1XGQC 2MECA 3AW6A 4WM2A 4XN6A 1LMAA 4YENA 1QDRA 4G9SA 1WVVA 1IR8A 1C46A 5KXKA 1IP5A 1KXWA 3A93A 3B0IA 4DD3A 1BWHA 1LCNA 2A7DA 1GXV2 3P65A 5KXSA 1E8LA 5FCPA 1BWIA 3CT5A 2FYDA 4YEOA 1D0LA 1FKQA 1D0MA 1UIFA 3CSZA 4LYBA 1LZTA 3BKVA 5KXPA 1IP3A 4PHIA 3QE8A 5I4WA 3HBDA 1IWZA 3AGIA 2DQFC 1GE3A 1TEWA 1UA6Y 4WG1A 3WUAA 4GCCA 5A3EA 4LT2A 3B6LA 1IO5A 1YAPA 3J6KA 4XENA 3AZ5A 1DQJC 1XGRC 5KXXA 1JIYA 4NSJA 1YIKA 4H1PA 3WXTA 1FN5A 2B5ZA 1JJ1A 2FYCA 3IJVA 5DM9A 2D6BA 5AMYA 1HC0A 2FBDA 1IORA 1B5XA 2IHLA 1CJ7A 4P2EA 2H9KA 1HNLA 4II8A 1LJEA 4NHSA 2Z37A 2Y8PA 4H9BA 1HFZA 1NWGA 5KY1A 5B1FA 3TXDA 1IP1A 4XJBA 1NHEA 1JKDA 3WUMA 3AGHA 1B7QA 1GB7A 1UBZA 4NGVA 1JTPL 1GE1A 4G49A 1LAAA 1DKJA 4H94A 1LSNA 1LSEA 1DXJA 2BLXA 4WL7A 1JKBA 5LVJA 5LYTA 194LA 1WQMA 2HU1A 4HTKA 5FELA 3WH1A 4XJIA 1HERA 3HBHA 3IWRA 4LGKA 4ANRA 4NFVA 3RNXA 2BQHA 3D3DA 1B0DA 1LSCA 1NBYC 3OK0A 4H8XA 3A94A 1JKCA 3FE0A 1REYA 4GLVA 3WULA 2BAAA 2HUBA 4MSTA 3M18B 1KIRC 4LZTA 4H9HA 1LZAA 3FI7A 4PRQA 4MCKA 4E3UA 4M4OA 1LJGA 2DBTA 5I4XA 1IWVA 5K7OA 3AJNA 4G4BA 2MEGA 5ILCA 4G4CA 2Z39A 1B7SA 4HP0A 1OUGA 3WPJA 3LZTA 4NHQA 1GF8A 2W1MA 2MEEA 2CJLA 1W6ZA 1TCYA 2BQKA 1LZDA 3AZ4A 5HMVA 1GF6A 5II3A 1G7JC 4NSGA 2XTHA 2ZQ4A 1H87A 3EO5A 2W1YA 2XJWA 2I26L 1B5YA 1GDWA 1LKSA 1JKAA 3G3BB 3A8ZA 4HSFA 4X3BA 4BAFA 1RE2A 1CJ6A 1LJIA 3LYMA 5EBHA 1WQNA 4B0DA 1GF9A 1LJJA 3ATNA 3K3TA 1BB5A 6LYZA 3A91A 4NEBA 3A92A 2HTXA 3WVXA 4KT3A 2D4IA 134LA 4C5FA 1HFXA 2ZNXY 3ULRA 1F10A 1C7PA 4CGEA 2YBNA 1VDSA 1CKCA 3EMSA 5APCA 5APEA 3RU5A 1AM7A 1G7LC 1V7TA 1UACY 3F6ZA 3QY4A 1EL1A 4NGWA 4HPIA 1LSGA 5D5FA 3TXHA 4IASA 1WQOA 1PS5A 5B07A 2LZ2A 4OWAA 3ZEKA 1UICA 2ZYPA 1GFVA 3MGWA 3WUNA 4NWEA 4CJ2A 1LZ6A 1FLWA 1VDPA 4LT3A 3P4ZA 3P66A 1GEZA 3WU9A 3KAMA 1DKKA 1UIEA 1IP7A 3A95A 1BB3A 3CSQA 3TXIA 4TTDA 1LSBA 4KPMA 3WPKA 1HENA 4KXIA 4QEQA 4DD9A 2BQDA 4EMNA 5KXOA 2YDGA 3N9CA 4WO9A 2HECA 4H9EA 1FBIX 4GCFA 1BB7A 2F2NA 3A90A 4N1CC 1CKHA 2C8OA 2HEEA 1LPIA 1YANA 4Z98A 5KXMA 5KXLA 1LZ1A 1CJ9A 2H9JA 4XJHA 1I20A 1T6VL 4HV1A 1GB3A 1GFGA 1TBYA 2DQCY 2HEDA 5LYMA 4DD1A 1WTMA 2YBJA 4BAPA 1IEEA 1RJCB 3BKHA 4WL6A 3WXUA 5KXWA 3W3EA 4DD7A 1GB8A 3OJPA 1KIPC 1RCMA 1G7HC 1OQMA 4QDNA 1HF4A 4ZIXA 3B72A 4WOAA 1GBYA 4OWEA 1CJ8A 4H9CA 5LYZA 2ZIKA 1XEKA 4LFPA 5LA8A 5I54A 3A6CY 1UIBA 1DPWA 3W6DA 1JJ3A 2X0AA 3AZ6A 3CQLA 3LZ2A 3TMXA 1BGIA 4LYZA 4B4IA 1JPOA 1YILA 1LOZA 4CFOA 2DKVA 1NF5A 1IR7A 1YAQA 5I5QA 1CKDA 4HV2A 1BB4A 2YBIA 1QUTA 1YQVY 3CSRA 1LMPA 1WQRA 3P64A 2XBSA 1LSZA 4WM3A 3IJUA 2CWIA 4H90A 2D4JA 4D9ZA 5KXTA 3ZVQA 2Z19A 4N1EI 1GBZA 5C6JA 7LYZA 4WO6A 2BQLA 4TUNA 4NSHA 1OUEA 5DLAA 1NDGC 1PZYA 4KL7A 2DQDY 1LHIA 4PJ2C 1GAYA 4NGOA 1LMCA 4OWBA 1QUSA 2BQMA 1LHHA 1LJKA 1LSYA 2N5ZA 2LHMA 3TXBA 1B7LA 5F9XA 2YVBA 1DI3A 1IC7Y 2MEBA 4O34A 4CHXA 5HQ1A 2BQBA 5HNCA 1GWDA 2HEFA 1GBSA 2BPUA 3LYOA 4AXTA 1MELL 4A7DA 5APDA 1LMQA 1B7RA 1HSXA 4UWNA 1NMMA 207LA 1IC4Y 1GB0A 3A6BY 4LYCA 4DD2A 3EXDA 1LZGA 1HEMA 2YBHA 2F4AA 1XSFA 4XYYA 1LZSA 1J1XY 2MEHA 1LSPA 1IR9A 1C08C 4NGIA 1LYSA 1UCOA 4MR1A 1VDTA 1LHLA 2CGIA 1VEDA 2BQEA 1C43A 1OUJA 2DQJY 4LFXA 2MEAA 3CB7A 1AT6A 4NIJA 4U3XB 3WYHA 4DDBA 2DQAA 4XJDA 5DL9A 1GE2A 5F81A 4IATA 4QY9A 1LJHA 2BQAA 1IIZA 1EQEA 1GBXA 1JSEA 2A7FA 4ETCA 1GFJA 1HSWA 1QTEA 4TSCA 1BVKC 1N4FA 1XEIA 1GB5A 2DQEY 4WM6A 1CNSA 1VAUA 4YM8A 1LZNA 1IP2A 1F6SA 4N8ZA 2Z2EA 4B4JA 1A4VA 5FHWA 1F0WA 2F30A 3ATOA 1LSMA 5JENB 1OP9B 4YOPA 3W6BA 1GFHA 4HJZA 5B1GA 5LVGA 1JSFA 4W94A 4ML7A 4R6CA 1IOCA 4BADA 4NWHA 3AW7A 1D6PA 1FLUA 1HEQA 1LHKA 3W6AA 1IWUA 4NHIA 1LSAA 1IOTA 5T3FA 5L9JA 2NWDX 3TMVA 5E9RA 1P2CC 3GXRA 1GPQC 1G7MC 1HFYA 3T6UA 3TXGA 1LZ9A 1BVXA 1YROA 1ZVYB 3A34A 4WMGA 1IOSA 3TXEA 3VWOA 3WMKA 4DDCA 1JWRA 1GEVA 1B7NA 5FEKA 1LHJA 5FDJA 1XFPL 2BQOA 1IVMA 5IELA 1FLYA 4IJ4A 5L3IA 1UIHA 5LXWA 133LA 2HEBA 153LA 2BQGA 3A3RX 1B7MA 1YKZX 1MLCE 4NGLA 4W96A 1D0KA 4FJRA 3N9EA 4Z41A 4I8SA 1GFKA 1LYZA 3AB6A 4DT3A 2ZYCA 4H9FA 1LYOA 4N0JA 8LYZA 6LYTA 4WLTA 4GCBA 1AZFA 4XJGA 3WL2A 2Q0MX 5LINA 3AYQA 1IOQA 4J1AA 5FSTA 1NQIA 4HTNA 4TSBA 1WQQA 4NGKA 4PGJB 3G3AB 1JJ0A 3HBEX 1B9OA 1INUA 1GF5A 2MEDA 1EQ5A 1RFPA 5J7CA 2G4NA 3RW8A 4H8YA 4WM1A 3QNGA 4NHTA 3WW5A 4DC4A 1TAYA 1UIAA 2EIZC 4OWCA 4WM5A 4YEMA 1F6RA 1HEOA 1QDTA 3J4GA 4NSIA 1B2KA 4H8ZA 4LYOA 1GFAA 1QQYA 3B0KA 1DI5A 1REMA 1LJ4A 1YL1X 2LYMA 2Z12A 1GFUA 1GFTA 1VATA 1KIQC 132LA 1OUDA 4I0CA 4N9RA 193LA 3W6CA 1ZVHL 2W1LA 1FLQA 2F4GA 4UWUA 1IP6A 4EOFA 5A3ZA 5IDDA 1SQ2L 1XEJA 3TXFA 2BLYA 1ZV5L 1T3PA 4DYGA 1OUCA 1YKXX 2LYOA 1BWJA 5DN4A 5LVIA 1CKFA 2WARA 4DD0A 5M1YA 4GCDA 5F14A 4RW2A 4CFPA 1JHLA 1DPXA 4H91A 1DI4A 1XGUC 2D91A 4J1BA 3ZVQB 1QSAA 1G7IC 4J7VA 4LT1A 4RLNA 5LVHA 4B1AA 1IY3A 4WLYA 2G4PA 1LZBA 5F16A 3WU7A 1V7SA 1HMLA 2ZILA 1JEFA 4NG8A 5KXRA 4WLXA 2MEFA 4NGJA 5B05A 1B5UA 4NY5A 3WVYA 4OWHA 4PPOA 1KXYA 3WU8A 1YL0X 4NHPA 1REZA 2YBLA 4QGZA 2DQHY 1NDMC 2W1XA 3LN2A 4HJYA 1XGPC 1OUIA 3CT0A 9LYZA 3RZ4A 1HEWA 2EQLA 1ZMYL 1LZ4A 4ZEEA 1VDQA 4B49A 4M6DA 3A3QA 3A67Y 3LYZA 4HTQA 4TWSA 1BQLY 1NBZC 1GF0A 1B7PA 1WTNA 2PC2A 1DZBX 4HJVA 1JUGA 1QSWA 5LAFA 1XGTC 5HNLA 1LJ3A 1B7OA 1LMOA 3CT1A 2LYZA 2YBMA 4OOOA 4H9IA 4OOTA 4ZFPA 3T36A 1WVUA 4WM4A 2G4QA 1HMKA 2LZTA 4ET9A 1C45A 208LA 2EKSC 2I25L 1LMNA 4BS7A 5C6LA 4C3WA 1HHLA 2YSSC 1AT5A 3EBAB 2CDSA 1IX0A 3A96A 4FDYA 2I6ZA 4G4HA 1OUHA 3E3DA 1LZEA 1C10A 1Z55A 1LZCA 1GBOA 4ETBA 4H92A 4LYMA 2BQJA 4J0LA 4DDAA 3N9AA 1UIDA 3W6FA 4GLAA 4RLMA 3TXKA 2BQNA 1IC5Y 1LZYA 4Z3MA 1WQPA 2C8PA 4R0FA 3LHMA 1ALCA 1BB6A 4B4EA 1CKGA 1JTTL 2EPEA 1J1PY 1YAMA 1LZRA 4ETEA 1UUZC 2BQCA 1VFBC 4TX7A 2D4KA 4OW1A 2MEIA 1GAZA 4DWXA 4N5RA 2HEAA 5HMJA 1GDXA 4ET8A 1GB6A 2AUBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
119LA 4GN3A 2BQIA 199LA 1GE0A 1L57A 4NG1A 2ZQ3A 5KKJA 2HU3A 229LA 1AKIA 1GF3A 1SX7A 1CV5A 3RT5X 4WLDA 4DQ7A 1GF4A 4GCEA 2DQGY 4XADA 1L53A 3HDFA 4RW1A 1GBWA 1GD6A 1KNIA 155LA 3W6EA 1L44A 3WPLA 1L73A 4ARQA 1GF7A 2ZIJA 2B6YA 1GFEA 1W08A 2Z2FA 3SN6R 1JTOL 4UWVA 2BQFA 5DN5A 3B0OA 1J1OY 1L24A 4GRVA 174LA 2RAZX 1IWWA 5IHGA 1REXA 1LTMA 4RDSA 2ZNWY 5LA5A 1GB2A 239LA 142LA 1XGQC 4W51A 1C46A 3A93A 2A7DA 1E8LA 3HT8A 1C6TA 1LZTA 5KXPA 1C60A 2DQFC 1TEWA 1QTBA 1UA6Y 3WUAA 1IO5A 1YAPA 3AZ5A 1EPYA 4H1PA 2FBDA 1IORA 1C66A 3C8SA 4II8A 4NHSA 1L0JA 4H9BA 1IP1A 3WUMA 4ARJA 1B7QA 1GB7A 4G49A 1LSNA 205LA 5LVJA 1P2RA 1CX7A 3DN8A 1LGUA 1L13A 5FELA 3WH1A 3HBHA 3IWRA 4ANRA 2RBSA 3RNXA 2BQHA 3D3DA 1L81A 4H8XA 1L77A 3FE0A 4EPFA 3WULA 1C68A 3M18B 1KIRC 3HH6A 1LZAA 4PRQA 4MCKA 2L78A 4M4OA 2DBTA 218LA 2MEGA 1B7SA 1CV6A 3WPJA 3LZTA 1DYFA 4I7QA 1L76A 2BQKA 3AZ4A 2Q9DA 4K5YA 4LDEA 5HMVA 2B74A 122LA 2ZQ4A 3HU8A 2XJWA 4X3BA 1GDWA 1LKSA 2F32A 1CJ6A 1LJIA 1WQNA 1GF9A 1LJJA 3A91A 1L00A 4KT3A 2D4IA 1P7SA 171LA 2ZNXY 1F10A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QTK A;  4LYT A;  4GN3 A;  4NGZ A;  4YF2 A;  135L A;  1IP4 A;  2BQI A;  4LT0 A;  1LJN A;  5E4P A;  1GE0 A;  4H93 A;  4NG1 A;  2FBB A;  2ZQ3 A;  5KKJ A;  2HU3 A;  5KXZ A;  1D6Q A;  4XJF A;  1AKI A;  1OUB A;  1GF3 A;  2GV0 A;  2Z38 A;  5KXY A;  4WLD A;  3RT5 X;  1GF4 A;  4Z46 A;  1LSF A;  4GCE A;  1GE4 A;  2DQG Y;  4XAD A;  1I56 A;  4L41 A;  3TMW A;  1FKV A;  5APF A;  2ZWB A;  2RSC A;  4RW1 A;  1GHL A;  1EQ4 A;  3M3U A;  1GBW A;  1A2Y C;  1IWY A;  5B59 A;  1JIS A;  1GD6 A;  1LZ5 A;  1IWT A;  1GXX A;  1TDY A;  1UIG A;  3W6E A;  2DQI Y;  2H5Z A;  3WPL A;  154L A;  2IFF Y;  1IWX A;  1HEL A;  1JIT A;  1GF7 A;  2VB1 A;  2ZIJ A;  1KXX A;  3GXK A;  1B5W A;  1OUF A;  3P68 A;  1GFE A;  1W08 A;  1YKY X;  2Z2F A;  3D9A C;  4H9A A;  1LKR A;  5C6I A;  5KXN A;  4ETD A;  1GB9 A;  1H6M A;  1YAO A;  5D5C A;  5HLL A;  5F9U A;  1D9U A;  5KJ9 A;  1B5V A;  1JTO L;  4WG7 A;  1LJF A;  4ETA A;  3WW6 A;  4UWV A;  4PRU A;  3TXJ A;  1HEP A;  4AGA A;  3SP3 A;  1OUA A;  2BQF A;  5LVK A;  5LIO A;  5DN5 A;  3B0O A;  5KKI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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