4XRDA

Salmonella typhimurium ahpc w169f mutant
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
b'SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant
rcsb
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule tags Oxidoreductase
total genus 55
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xrdA00
3Q74A 4WKWA 1V9WA 1K0BA 1XW5A 4MJEA 4G10A 17GSA 4HQSA 3MSZA 2XBQA 1A8YA 1Q4JA 2ZCTA 1MDJA 1OC9A 1YZXA 4F03A 1ZYQB 1QMVA 1YKAA 2IMFA 2PVOC 1EV9A 4MJAA 1A24A 4HEA2 1ERVA 1XIYA 4Q5FA 4I6XA 5G2ZA 4G2EA 4NV2A 4OO4A 1SL1B 3D4TA 1YF1A 12GSA 2AV4A 2H75A 1F37A 3PH9A 1FW1A 3KP9A 5HFIA 5HR2A 1U6TA 1B48A 2R5GA 1T8EB 5IIZA 5IPHA 3APSA 4L5LA 5JCUA 2QSIA 1YJ6A 3GIXA 3M9KA 3C73A 1G7OA 2H30A 3VK9A 2LRTA 2XC2A 1SU9A 1O8XA 3RPPA 1KEBA 2VCWA 5A4VA 1QXHA 4MZBA 4MF6A 1T1VA 1B8XA 2H1AA 4F82A 2XPEA 4ZBBA 5DJLA 2I4AA 4PUFC 2PU9C 1B4PA 4RQRA 4EUYA 1PMTA 4KNDA 5HR3A 4F0CA 10GSA 3TJFA 3IR4A 2PPTA 2GZYA 3F9UA 3VWVA 2TRXA 2JZRA 1THXA 5AN1A 4GSSA 2FLSA 13GSA 1JLWA 2LJRA 4KCAA 1KNGA 3ZMLA 2CVKA 1AW9A 1GTAA 1K3YA 4QL7A 1JFUA 4MF5A 1TRUA 3DKSA 4EKZA 2GGTA 5G5FA 3J7Yk 2C1YA 2C3QA 4LLRA 4IBPA 3VURA 4TVEA 5IMAA 2NVLA 5DJMA 4KE3A 2QKEA 5IMZA 3ZFLA 3QAGA 3I43A 2XBIA 3DVXA 1OKTA 3L78A 4IP1A 3TCOA 4ZB9A 3CTFA 2NTOA 3HCZA 1HNCA 4V2NA 2G2QA 2O8VB 2RIIA 1A23A 3F8UA 4YQUA 1GTUA 1GP1A 4POBA 2HT9A 3WGEA 2YOIA 1VF2A 5ECLB 5GZZB 3V1WA 3KMNA 1Z7RA 5CAXA 1UVZA 3FR9A 2WFCA 4K0GA 1USBA 2VL2A 4EDZA 5CRWA 1S3CA 1GLPA 3WGXA 4BVXA 2PBJA 4IJIA 2JSYA 1SK1A 1FVJA 4Q5NA 1YDKA 4HJ2A 4J57E 1PGTA 11GSA 3VPQA 2B5YA 2FA8A 3DGQA 1G6WA 4TOPA 2WCIA 6GSXA 1EGOA 2VAFA 3QOUA 4WEYA 4V2MA 1DUGA 3US3A 1SJZA 4F9ZA 2L6DA 1TU7A 3JCML 3MNGA 1MD3A 2GDRA 3QDNA 4J2FA 1T7PB 1TK5B 3O6TA 2IMIA 1N8JA 2FWEA 4D73A 3GN3A 3U6VA 1PKZA 1FOVA 1YF0A 3W8SA 4TXVA 5DCGA 2DJ2A 2MBSA 1M99A 1ERUA 3FR6A 4MK3A 5H5SA 1MD4A 1ABAA 1CQHA 2DLXA 1IYHA 2H1GA 2VM2A 2N5AA 4EL1A 2LQQA 2A4VA 4WF4A 4YQVA 2KHPA 2K6VA 3IK7A 3P7XA 2OE0A 2VLVA 1GTIA 3DVWA 2R3XA 2LJAA 3A2VA 4V1Ap 4MLYA 3DRNA 2YZUA 2N5FA 1TJDA 2FHEA 2LS5A 14GSA 3BOAA 1GSFA 4AJ8A 2JACA 2KP1A 2HSHA 4MH2A 3WT1A 4KDYA 3N9JA 1ZGNA 3H4KA 1MDIA 2OBIA 1X9MB 5B6NA 2HZFA 4GSNA 2CAIA 3RPNA 3E3EA 1JZWA 2F3MA 2BMXA 1WWJA 16GSA 3IDVA 1T4YA 1LJRA 1XPVA 2VCTA 3QFBC 1WRYA 1K0OA 2V32A 1AQVA 1A8LA 5DQSA 4YAPA 3UBKA 5J4UA 3IA1A 1M2DA 4XRDA 1SK2A 1JZDA 2PGTA 1TI1A 3QPMA 1QGVA 2Z9SA 1XVQA 3AY8A 1AC1A 4GRFA 3BD2A 4L8EA 2LJKA 4BA7A 2PVQA 3OR5A 3C8EA 1PL1A 3DEXA 3KMOA 4PURA 5DCHA 4TXOB 3PGTA 3EMPA 1Z6MA 4LL4B 1XW6A 1W89A 1X0RA 3Q18A 4TKYA 1PA3A 1Z6NA 4N10A 3HJPA 4N0ZA 4EE0A 2PWJA 1YEXA 2HZEB 1EEJA 2DMMA 2CZ3A 6GSYA 2DJJA 2LRCA 2GSSA 4CW9A 1XWGA 3WGDA 1ERTA 3GMFA 3IXRA 2KP2A 2QC7A 2WGRA 2AAWA 5F0GA 3QD9A 2B3SA 4NHZA 1PX7A 5ECSA 3GSTA 4J56E 1Z9HA 5C04A 1DE2A 4MZCA 1GUKA 3FRCA 2B5XA 4YH2A 4HZ2A 3LYKA 4TW5A 3J7Yb 3ZZXA 2AUVA 4EF0A 4HS1A 5KN2A 1LBKA 4EVMA 5ELGA 2OJLA 3FZ5A 3F4TA 4KSMA 1K0MA 3QR6A 3TRXA 4K9ZA 2GLRA 1KBNA 3GX0A 4KSOA 3IPZA 3LWAA 7GSSA 5IOWA 2N5BA 2J23A 4PGTA 1XXUA 5JCGA 3M8NA 3HJOA 4XS4B 5F06A 3A5WA 4MZWA 4MJBA 5HFGA 2KLXA 5G5EA 1J0FA 3M3MA 3ERWA 1ZCPA 4XIHA 3H79A 2J9HA 1GH2A 1U3IA 2ZNMA 3FK8A 3ZIJA 1SD8A 4I8BA 4AJ6A 3CYNA 5AGYA 2YWIA 2CAQA 2H6ZA 2R37A 2VL2C 1TTZA 5DAKB 5CYYA 5B6MA 5INYA 3TUEA 1OKDA 2TRCP 4LA1A 3G7IA 3KGKA 2GTUA 4E8EA 1TDIA 3LGCA 3TGZA 3M0FA 2K9FA 4KW6A 3G9BA 4ZL7A 3D5JA 3FZ4A 4OCFA 5KN0A 1JHBA 3EU3A 3IOSA 4PNFA 1CQGA 1SD9A 2GT5A 1OE8A 3FZAA 1VF4A 4ECJA 3P90A 1TW9A 2MYGA 4HZ4A 5IMVA 3FHKA 1O6JA 5CRDA 2REMA 5ECHB 2NDOA 5IMCA 4IJ3A 2FA4A 3BBYA 5DALB 3WD6A 1ILOA 2YPMA 4NV5A 5D96A 3BCKA 2H73A 1K0AA 3O76A 1HNAA 2B6MA 3UBLA 3E9JB 2CZ2A 3KD0A 2ON5A 3ME8A 4OCEA 2VCQA 5ECIB 1BJXA 3VLNA 3KH9A 1K0CA 4G19A 4TR1A 4P3YB 3UOMA 4EO3A 2C3NA 4MA9A 1DBYA 2M46A 2O89A 3TJKA 2IJYA 1GSSA 4PQIA 4EDYA 2MMAA 3KIJA 1H4OA 1SYXA 2LTKA 1WOUA 1UC7A 5J5NA 3FY7A 4ZIJA 3VPTA 2GVPA 1PX6A 2F8FA 3KXOA 3C1SA 2H0GA 2LRNA 3N5OA 1ON4A 2VUPA 4RI6A 3ZYWA 3EE2A 5AISA 2H71A 3ZVJD 4O92A 2YWNA 2C0DA 4ZB6A 4IS0A 3HVXA 4K7NA 4DSRA 2OE3A 2JL4A 3ZTLA 1V98A 5IPGA 2I1UA 5DDLA 1XZOA 1A2JA 2V2GA 2HXKA 1HNBA 1UA5A 2VL9A 3UEMA 3F63A 1XWBA 1WPIA 4BWSA 1EWXA 5J41A 3HDCA 3D6IA 3L9VA 3HZ8A 3KM6A 1EP8A 1GLQA 2R4VA 4X0XA 4TXOA 2ES7A 3FEUA 4FO5A 5J9CA 1QUWA 2AJQB 5KEJA 1AAZA 4JBBA 4IHUA 1AXDA 2PMTA 1EOHA 3GH9A 4V2LA 1GSYA 5GAND 2XHFA 2MMOA 1M2BA 5KN1A 4F2IA 4NWYA 1GNWA 3VI7A 2HZEA 1TI3A 1K0NA 3FZ9A 1S3AA 2B5EA 3EVIA 3G7JA 4OFTA 5HR0A 2B7JA 2MMZA 2H72A 1VF1A 2VD1A 4ML1A 3HY2A 2C4JA 3TKQA 1HD2A 2DJ1A 3GKNA 1TU8A 3LYPA 1GTBA 4MP4A 8GSSA 3C1RA 4ZXGA 1X9WB 3GURA 1BYEA 4Q5QA 1OVNA 4IN0A 1XCCA 3ZITA 2EIRA 3ME7A 2YJ7A 4GQFA 5COHA 1BAYA 2WB9A 3ED3A 3A2XA 2RLIA 20GSA 3SBCA 2GQKA 2E0QA 2LSTA 5ECQB 1GSQA 4IGJA 1X5DA 4KB3A 4PUAA 1ZMAA 3TKRA 1IYIA 4YQMA 4XS6A 4MABA 5HR1A 3A2WA 2CX3A 4ZL8A 4XS4A 2FCHA 5JCWA 2YCDA 1LU4A 3IE3A 5HFKA 1AQWA 2X8HA 2LKUA 2HRFA 1PSQA 3GKMA 3W6GA 3EYTA 5D9WA 5A4UA 3QFAC 4HJMA 1EOGA 4DVCA 1SKSB 1SL2B 2WZ9A 4FH8A 1N2AA 5G31A 2YJHA 4QL9A 1UN2A 1GNEA 2H1BA 2WRTA 3ERGA 5EPFA 4XCSA 2H0HA 3UMAA 4WR4A 5DAKA 1NHOA 3C7MA 4KA0A 2X64A 4IKHA 1GL8A 3W8JA 3GNJA 4XTSA 2DJKA 2F51A 1WMJA 4DSQA 1JLVA 3H1NA 2CV4A 4JR4A 1A2MA 4MPGA 4TR1B 2YP6A 1F9MA 2GSQA 1K3OA 4KGIA 4GXZA 3IAM2 2YV9A 5LNKe 1GSUA 2DMLA 2WDUA 3TKSE 6GSSA 1ST9A 1WP0A 3APOA 2C0EA 3UAPA 1VGLA 3PINA 3GKXA 4BL7A 3I69A 2KUCA 3GL3A 3UVHA 1TRWA 1YEPA 1F6MC 5DALA 3ZVJA 3TRPA 1GULA 4OO5A 3A3TA 3DWVA 3GRXA 3CRTA 2L6CA 2H01A 4KAEA 3GTUB 19GSA 4XHMA 3TKPA 4DSSB 2B1LA 2K18A 2O85A 4GCIA 3Q19A 1O8WA 1MTCA 4K2DA 1T4ZA 3F4RA 2V41A 5FWGA 1M9AA 2HLSA 4TR3A 3PR8A 3LORA 4L5OA 5EY6A 1TOFA 4ECBA 1ZL9A 4WBJA 2VIMA 5LCZA 1OC8A 1OAZA 3ZRDA 1F3BA 3RHCA 5IO2A 5DBQA 2HSYA 5GSTA 2K8VA 5J3RA 4PX1A 3MAKA 2CVDA 2YN1A 2VLTA 2DC5A 3H93A 3IHQA 2HE3A 5KN3A 3WYWA 4HUAA 2EIQA 2R2JA 2QGVA 1B9YC 2PUKC 3R2QA 2H74A 4Z7XA 4DEJA 3SWLA 2H66A 5ECRB 4OFNA 2I81A 3TJJA 2CVBA 3EU4A 1SK0A 3K8NA 3NIVA 3EURA 4ZBAA 4AF2A 1ZOFA 2BTOT 3CSJA 1ERWA 3QCPA 2YV7A 2L4CA 3IK9A 1XWAA 3D22A 4IQ1A 3GUSA 2RM5A 2C8UA 2WS2A 4PXOA 2DBCA 2FD3A 2BJXA 2CA8A 2JU5A 3HVVA 1OC3A 3LSZA 1U88A 3ZREA 4EXJA 3KCMA 4FIWA 3DD3A 1MDKA 2FGXA 4MH3A 4CDOA 5G30A 3KZQA 6GSWA 2LUSA 1W4VA 4NAXA 1V40A 1FHEA 2O87A 2VCXA 5DVBA 5JWOB 1XVWA 1O85A 1U87A 1NM3A 4WBRD 4K8MA 3MWHA 2C3TA 1URMA 1XW9A 2VO4A 5ECMB 1PL2A 3IV4A 3VI5A 4OFMA 2JSZA 1Q98A 1M7TA 3I9V2 5H5RA 5AIVA 2FNOA 4FYBA 3TB2A 1T3BA 2L5OA 4IVFA 2VLUA 2FY6A 1MEKA 4FYCA 3ZIVA 4I2UA 4AJ7A 3CBUA 1TP9A 1Z5YE 1A2LA 2LQOA 4XS1A 1EGRA 1G0TA 2C80A 1Y6EA 1WJKA 6GSTA 4XRAA 2OADA 2B1KA 3HHVA 3WT2A 4MJCA 5ENUA 1WE0A 5CO3A 1V58A 2YNXA 1R5AA 6GSUA 4POKA 5ABRA 3L4NA 4ACSA 3RDWA 1X9SB 3Q6OA 2VCVA 1HQOA 2VM1A 3F6FA 3DXBA 4ZB8A 3GV1A 1KTEA 2IMDA 4EC0A 2O7KA 2VD0A 4O32A 2HRNA 4G9HA 2H19A 2DIYA 1VF3A 1PD21 4IP6A 4KCEA 1BQ7A 3UJ1A 2H6XA 4RI7A 5ECKB 2IMEA 4KDXA 2ALBA 3L9SA 2HFDA 1XWCA 4OMVA 2GSRA 2H0IA 4JR6A 2WULA 3GL5A 1QK8A 2MMNA 3GHAA 3EC3A 4GLTA 4HQZA 3UARA 1BX9A 3LJRA 3U5RE 3ZFBA 2H70A 1SKWB 3LXTA 3IRAA 4N11A 3TKSA 5G1KA 4NPBA 1O7UA 5IMDA 5D93A 4JRRA 4OD7A 4F0BA 5J9BA 1JZOA 2E2GA 3GTUA 5ECOB 2EIOA 4K7OA 4HOJA 4DSSA 1E6BA 3CTGA 4LL1B 1OYJA 2OKAA 2G0FA 4I97A 3ISOA 4JZQA 3KH7A 2OA7A 2IWTA 4TN8A 3O3TA 3CRUA 2E7PA 2LNSA 2TIRA 4RQXA 5FHIA 3TJGA 1FO5A 3HXSA 3GKKA 4ULXA 3ERFA 4POMA 3H8QA 3F0IA 4JE1A 5IMFA 4JEDA 5C00A 5G1LA 5IO0A 2GT6A 1K0DA 1M9BA 2L59A 1G7EA 2XPDA 2C0FA 2LNTA 1G6YA 5L71A 3LQ7A 2H76A 2PN8A 1GWCA 1U3AA 3F4SA 2DJ0A 1PRXA 1RK4A 1THOA 1TXXA 5ID2A 2M80A 1I5GA 2L5LA 3LXZA 1PKWA 18GSA 3TJBA 4NXIA 5IQYA 2C0GA 3FYGA 4AGSA 2YANA 3BCIA 2YWOA 4K6XA 2JZTA 2MZCA 3RAZA 4BWQA 3P2AA 3APQA 5D8IA 4ZILA 1R7HA 5B7CA 1FG4A 3CSIA 1V57A 4YAVA 1R5PA 4PQ1A 4NMUA 4MPFA 5D9VA 3TOTA 2L57A 5GSSA 1GUMA 2H8LA 1TKDB 1RW1A 2F9SA 2ZUPA 4ECIA 2DJ3A 3CMIA 3FKFA 4I5QA 3F6DA 1XOAA 4POLA 4RUVA 1A0FA 2P5RA 1K3LA 1FAAA 5A5KA 1NHYA 2X8CA 2I3YA 3IAS2 2CQ9A 1GRXA 2GZZA 3GA4A 1B9XC 3KTBA 4WF5A 2GSTA 2IFQA 4PQHA 5IM9A 2LEGA 4BPYA 1QQ2A 2L4QA 1X5EA 4X1UA 3RBTA 4MDCA 3HD5A 2H6YA 3ZMKA 3GFKA 4I2TA 3E0UA 2I9HA 2P0GA 3I6AA 2A2RA 5A4WA 4GTUA 3LFLA 2VCZA 3D21A 3P8WA 3FW2A 2H1DA 1T00A 1TK8B 3D4MA 4K0NA 1OC9B 1VRSD 5CRHA 3LEFA 1ZYEA 2KOKA 2GS3A 3LG6A 4LMVA 4ML6A 1S3DA 1XOBA 4K7IA 3C71A 3ZLPA 4HU7A 1BG5A 1QFNA 2DIZA 4V1Ag 2IN3A 4WR5A 2HI7A 4L0WA 1TRVA 4HDEA 3GSSA 1B4QA 5GAPD 5ECNB 3NZNA 5H5QA 3D0ZA 3KP8A 5EVOA 4GWRA 1AIUA 2RUFA 4MCUA 5F05A 1E2YA 5CP1A 3F3RA 3VWWA 2V1MA 4WXTA 5AIXA 2OBKA 22GSA 1HYUA 4E8HA 2FWFA 2V6OA 3DYRA 4X43A 4ILFA 2VOCA 4ECCA 1M2AA 1V2AA 3QAVA 4N30A 3S9FA 4KDUA 5F07A 4FYUA 4O5RA 2OACA 3VWXA 1SENA 1Z3EA 1WIKA 1PQNA 3RHBA 2AB6A 4GF0A 1R26A 1R4WA 2X99A 4LMWA 1ML6A 1TRSA 3VWUA 4MF7A 1DSBA 3L9UA 2ON7A 2MBTA 3TKSC 4QQ7A 4O7HA 5JWRB 2R6KA 5DQYA 1O73A 2F8AA 3KTLA 1C72A 1H75A 1XBSA 5ID2B 4K1FA 2E2MA 4H86A 1BEDA 2M72A 3NOFA 1EP7A 1X5CA 1M0UA 2YZHA 4KH7A 1EEMA 2OE1A 1SKRB 2GQLA 3VFIA 1SJ6A 2DSAA 1SYRA 3KJYA 2VL3A 4N0VA 6GSVA 1GSDA 1XFLA 4HI7A 3DMLA 3EINA 1O81A 4HU9A 4JU5A 4TR0A 4ZL9A 2IIYA 1NW2A 4ZBDA 3FR3A 2FUG2 2JZSA 2IL3A 1EZKA 1SJIA 2RUEA 2IMKA 5B8AA 1AUCA 5E4WA 2P31A 4KUNA 5D9TA 4CHSA 2HNLA 3EMXA 4TR4A 3GYKA 1A0RP 2CT6A 4Q5RA 4IW9A 3TRQA 2NPBA 3GH6A 2RM6A 2K8SA 1ACVA 1GSEA 2EC4A 2V6KA 1FB0A 4IELA 3M9JA 2AYTA 4TRXA 1RQMA 3EWLA 2YWMA 5D73A 2JADA 3G7YA 3HA9A 1SL0B 3HJMA 2PERA 2GQMA 2B7KA 3QMXA 3HKRA 1J08A 1XWKA 5F8BA 5CREA 2FWGA 5FT3A 5ECPB 5B8BA 3MDKA 3IBHA 3UVTA 1DE1A 1TK0B 5LD0A 3M1GA 4MMMA 4D73B 2IFQB 3DIEA 2HYXA 1F2EA 5IOXA 4IQAA 3QAWA 3HVSA 5EL8A 3BJ5A 1YKCA 3CSHA 5E59A 3HYPA 5CNWA 1PN9A 2P5QA 4WETA 1Z7PA 1F3AA 1AQXA 1EV4A 3L0HA 3GX8A 3IC4A 1YY7A 2IPAA 2X8GA 3UL3A 2LV3A 3ZL5A 1JZRA 3TOUA 3HZ4A 5JWQB 3TDGA 1OE7A 2GZPA 1GUHA 3UIWA 9GSSA 1FVKA 2D2ZA 3F3QA 4L0UA 4GSTA 2AHEA 1Y25A 2FWHA 5HQPA 1J9BA 4OWYA 4ISDA 2WJUA 4BVYA 1FB6A 4KX4A 2NBSA 1YQ1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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