4XS1A

Salmonella typhimurium ahpc t43v mutant
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFVFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
total genus 53
structure length 165
sequence length 165
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xs1A00
5G30A 5D9VA 3ERWA 4YAPA 4MDCA 5CRDA 4MH3A 3HVSA 3I69A 2LEGA 5CRGA 3F8UA 4O7HA 3TJGA 2H66A 2GQMA 3JCML 2RLIA 1V2AA 4MJCA 2H73A 4K0GA 3BBYA 1MDKA 1X0RA 4ML6A 4EL1A 3FR3A 2HFDA 2CQ9A 1R5AA 4FIWA 4PXOA 4XIHA 2YWIA 4BPYA 4YQVA 2H19A 2VCQA 4J56E 1G6WA 12GSA 1MD3A 1QFNA 2DSAA 2L59A 4AJ6A 1EEMA 3P2AA 3EINA 2GZZA 3F4SA 1EP7A 3FZ9A 5JCWA 2N5AA 1K3OA 4RI7A 4TR4A 1LU4A 1J9BA 2C0DA 2HZEA 3GTUB 2ON5A 1SD9A 1XPVA 2JSZA 4RQRA 3ZMKA 5ENUA 3TCOA 4WF5A 5HR2A 4HEA2 4PQHA 4JEDA 4YQUA 1QMVA 2VUPA 2FHEA 1XFLA 2LTKA 3QFBC 4DEJA 2CZ3A 4K8MA 4MZBA 1SJ6A 1K0OA 1T3BA 4TR3A 1U3AA 1TP9A 1PKZA 3IRAA 4NV2A 4ZIJA 2CT6A 2GZYA 1DE1A 1PMTA 3F4RA 2C3NA 5HFIA 2VAFA 1WJKA 3PR8A 2MMZA 1AW9A 2ZUPA 4JBBA 4MF6A 3DKSA 1ACVA 3UAPA 4EDZA 2VOCA 2K9FA 3FZ5A 1M2AA 2LQOA 1WWJA 2QKEA 4OFTA 5J5NA 2WULA 2GVPA 1TK8B 1U88A 2E2MA 4Q5NA 1GSYA 2GSTA 3GUSA 1GH2A 4PUAA 4EF0A 3EYTA 5CP1A 2DMMA 4IBPA 1T1VA 3WT1A 2GS3A 1OC9B 5KN2A 4KUNA 3V1WA 5C04A 4POBA 4TKYA 3UIWA 5AIXA 1VGLA 1GTIA 4IQAA 2B5EA 3LQ7A 3DYRA 2PGTA 1A24A 1SYXA 2H0IA 1N8JA 1HD2A 2REMA 4IP1A 1GSSA 2R3XA 4FO5A 2DJJA 2F8AA 1SL2B 2X8GA 2H1AA 4ECBA 5IMVA 4F82A 4I6XA 1U6TA 1RK4A 1NHYA 1X9SB 1O7UA 3D6IA 3IAM2 4K0NA 2O87A 4EKZA 3QPMA 3TJBA 2EIOA 2B1LA 2DMLA 2V41A 3VWWA 1X9MB 1GSDA 3U5RE 4KSOA 4HOJA 1G7OA 4TVEA 2IMIA 1PKWA 4OFMA 4AF2A 1TI1A 4HDEA 2DJ1A 2GSRA 2L6DA 4HQZA 4V2MA 4H86A 3WYWA 3IK7A 1W4VA 4GTUA 2L4CA 4MPFA 4E8EA 2E7PA 1R4WA 2H75A 4ML1A 3WGXA 5DJMA 20GSA 2CZ2A 1NW2A 2X8HA 1OC8A 4J57E 4RQXA 5B8BA 1YF1A 4PNFA 3LGCA 3ED3A 3H8QA 4OCFA 3UL3A 2OA7A 1PA3A 4LMWA 4F03A 1DE2A 5E59A 3ISOA 3HXSA 3ZREA 3NZNA 1AXDA 2JADA 2HNLA 1Z3EA 3M3MA 4NHWA 1PD21 4G2EA 2O89A 2A2RA 2L57A 3ZRDA 1FHEA 1R5PA 3DVWA 4TR1A 4I5QA 1PX6A 1QGVA 4XRAA 5A4UA 2JACA 3H79A 3M0FA 2FWHA 4NXIA 4POMA 2GSSA 2L6CA 3E9JB 4WR5A 2D2ZA 1BX9A 5D9TA 4PQIA 2XC2A 4F2IA 2R5GA 4XTSA 1XW9A 3ZL5A 4ZL9A 5DBQA 1FVKA 2YNXA 4MP4A 4QQ7A 1QQ2A 5DCGA 4EVMA 4LL4B 2RUFA 3SBCA 4HI7A 3EE2A 4AJ7A 1EGOA 1XWGA 2AHEA 2NVLA 3S9FA 1PQNA 5C00A 4KCEA 2HSYA 1XW6A 1QUWA 3O6TA 2I81A 1YEXA 5IMDA 2TIRA 1U87A 2G2QA 2YP6A 2M80A 1AIUA 1XWBA 3L0HA 2I4AA 3TDGA 2C3TA 2PVOC 2IWTA 3WGDA 4IJ3A 5HR1A 1TXXA 1A2LA 4EO3A 5GAPD 2L5LA 1GSUA 1IYIA 4IHUA 2LSTA 1ZCPA 3TJKA 1PGTA 3ERFA 3HJMA 2PUKC 4OO5A 1A8LA 4GSSA 4ILFA 5KN1A 1G0TA 3TRQA 3HHVA 3J7Yk 1OKTA 2WB9A 3C73A 1ZGNA 4TW5A 4BWQA 4OCEA 1GL8A 1YKAA 4GWRA 1PL1A 2OE3A 1Z7RA 5D96A 1G6YA 3N5OA 2YV7A 1A23A 2YCDA 1ML6A 3PINA 2J23A 5KN3A 4PUFC 1V40A 5DALA 4OMVA 1EEJA 2QC7A 3G7JA 4V2LA 2V1MA 2FGXA 4QL7A 3ZIJA 2H1DA 3LJRA 1TJDA 3ZZXA 3MNGA 1WMJA 3H1NA 2XHFA 1BYEA 4OD7A 2IIYA 3LFLA 5J9CA 3RAZA 4L5OA 3HA9A 4TXOB 3VWVA 4BVXA 2C0GA 4N10A 1T4ZA 1B4PA 4ISDA 14GSA 3FEUA 4K2DA 3R2QA 1B4QA 2P0GA 2MBSA 1V57A 3KMNA 1AQXA 1VF3A 2VO4A 2C1YA 1ON4A 1ERTA 3TOTA 2CVBA 3TJJA 2HLSA 4D73A 5H5RA 1G7EA 3OR5A 3Q18A 4EDYA 2H6YA 2V6KA 3UBLA 1OAZA 5F05A 4RI6A 2DJ2A 2WFCA 4BWSA 1AC1A 5J41A 2JSYA 4FYUA 1GTUA 2OE1A 3EURA 1EOHA 1LJRA 2O7KA 1TRWA 3DRNA 3LG6A 5DAKB 1HNAA 17GSA 3VURA 3UJ1A 5IMCA 1K0CA 5GAND 2GT6A 5GSTA 4G19A 1EV9A 1WP0A 3PH9A 4ID0A 1K3YA 2FD3A 4MZCA 4HQSA 2C0EA 5AGYA 3Q74A 2HZFA 5JWOB 3CRTA 1ZYEA 1TK0B 2C3QA 2YZHA 3GH9A 5CO3A 4EC0A 1K0DA 3NOFA 4TXVA 3GL3A 4XS4B 1MEKA 1R26A 2GT5A 2YN1A 4J2FA 3TKRA 2R37A 4L5LA 2YJ7A 2PWJA 4L8EA 2XBQA 3ZFBA 2LRCA 2NTOA 4V1Ap 3GYKA 3DXBA 1GSQA 3KTLA 1THXA 2LRTA 4KA0A 4XCSA 1IYHA 2CV4A 3DIEA 2FUG2 1NSWA 2H71A 2R6KA 4JU5A 3ZITA 4TRXA 1GRXA 3H93A 1F37A 2VCXA 5FHIA 3CTGA 3LYKA 2H0GA 3M9JA 5DQYA 2B6MA 3GV1A 4F9ZA 2YANA 3BJ5A 3CRUA 4PNGA 3IE3A 2WGRA 2R4VA 1B8XA 3A2XA 3WT2A 2WZ9A 1X5EA 4GXZA 3EU3A 3D4MA 2XPEA 3VWXA 4O32A 3QFAC 3APSA 2B3SA 18GSA 2PPTA 1DSBA 1N2AA 3PGTA 4MCUA 2LQQA 5CYYA 5HFGA 3TB2A 2EIRA 8GSSA 1I5GA 3DWVA 2BMXA 2PN8A 2HI7A 4GSTA 2CVKA 2H30A 4XHMA 2GLRA 1YJ6A 1ZL9A 3P90A 4HJ2A 2Z9SA 5ECQB 1YQ1A 1JHBA 1Z5YE 1O8WA 1T00A 3GIXA 4KNDA 1Z7PA 2IFQB 3EMPA 1EZKA 5IMFA 4CW9A 1Q98A 1TTZA 5ECHB 4FYCA 2DBCA 1XVQA 1GTAA 2VL2A 5LCZA 2MMAA 4KW6A 3IHQA 1T7PB 4NPBA 1DBYA 3ZYWA 2KLXA 16GSA 3DD3A 2OKAA 2CX4A 3LSZA 3KCMA 4IW9A 1FAAA 2X99A 4JZQA 2PU9C 4GLTA 4TR1B 6GSUA 4HU9A 1F3AA 3ZLPA 3ME8A 2IMEA 4NMUA 3BD2A 4XS1A 1X9WB 3CXGA 5EPFA 2C4JA 2XPDA 2MBTA 3QDNA 5G1KA 5ECLB 5J4UA 4LMVA 1AQVA 1SL0B 5ELAA 4PURA 4XS6A 2H0HA 3C1RA 4KB3A 5IO0A 3CMIA 3L9SA 5LD0A 1UN2A 2N5FA 1MD4A 1M9AA 2K8VA 3D22A 2G0FA 3IAS2 4I8BA 1Z6MA 3GKNA 2WDUA 3UARA 2O8VB 1Q4JA 3RPNA 4BA7A 1F6MC 3HJOA 3BCIA 5D73A 5FWGA 4Z7XA 2O85A 3UMAA 2QGVA 2VM2A 1UA5A 1AAZA 4PGTA 5ECSA 5G1LA 1TW9A 3RPPA 4KDUA 1S3DA 3E3EA 1O85A 1JLVA 2DLXA 1WPIA 5F07A 1V98A 5H5QA 2R2JA 3HVXA 3FY7A 4Q5RA 3ZTLA 5INYA 2ALBA 3K8NA 3FR9A 4MABA 2B1KA 3LORA 3RDWA 2WS2A 2GGTA 1USBA 4DSRA 4GSNA 1YDKA 4KH7A 2M72A 5B7CA 2I9HA 2V2GA 3CTFA 5IOWA 1FO5A 2FCHA 4WBJA 2VD0A 2KUCA 5FT3A 10GSA 5G31A 5ECKB 3TRPA 1OVNA 3M1GA 3ZVJA 5E4WA 3O76A 3IK9A 4ZB6A 1TRVA 3ZVJD 1GTBA 5DVBA 1A8YA 2X8CA 2B5YA 4DSSA 2H1GA 5CRWA 2HYXA 3HCZA 3HD5A 5LNKe 3BOAA 4ZL8A 4JR4A 4E8HA 5GSSA 2VLUA 4V2NA 3F9UA 3W6GA 3U6VA 2LNTA 1QXHA 4LLRA 2PVQA 1ABAA 4KE3A 4WF4A 2YJHA 1J0FA 2PMTA 3HJPA 4GF0A 2MMNA 4NV5A 4ZB8A 1F3BA 4N30A 2YWNA 1J08A 2F9SA 3G7IA 3VI5A 3FKFA 1M9BA 1ZMAA 1S3AA 5B6NA 6GSWA 3EWLA 2ZNMA 2NDOA 3QCPA 4IS0A 1MDJA 5ECMB 1JZWA 2YZUA 1XVWA 2DC5A 1XCCA 13GSA 1HQOA 3LXTA 1HYUA 3I43A 2GDRA 3C7MA 1SD8A 1BEDA 2GTUA 1FB0A 4MF5A 3D5JA 3HVVA 4MA9A 3GX8A 1MTCA 2H1BA 1B9XC 4KCAA 3CBUA 4XRDA 1ILOA 2E0QA 1A2MA 2OE0A 1EV4A 2VD1A 3TGZA 1K3LA 3IPZA 5COHA 1M2DA 4GQCA 5ELGA 2JZSA 1SJZA 1FB6A 2JL4A 2TRXA 3L9VA 3TKSA 1PRXA 5CRHA 3F3QA 4L0WA 5JCGA 1CQHA 2FLSA 1XOBA 4EE0A 4FH8A 1ZOFA 2OACA 1WE0A 1KNGA 4POKA 2FNOA 5F06A 3ZIVA 2JZRA 2AJQB 3GKXA 1GULA 1TRSA 1XWKA 2OBIA 3KEBA 1T4YA 1B9YC 1FG4A 4I2UA 3GX0A 3ZFLA 3FHKA 4OWYA 4MF7A 4ZBBA 4KGIA 3GKKA 3QAGA 4ZXGA 2IPAA 3GSSA 2VCTA 5D8IA 9GSSA 2ON7A 2VCWA 1OE8A 1H75A 1KTEA 4YH2A 1HNBA 1Y6EA 5EVOA 2L5OA 2VIMA 3C1SA 1YZXA 1B48A 3VI7A 4NAXA 5ECPB 2NPBA 1UC7A 3GFKA 5IM9A 4DSQA 3L9UA 5AIVA 1CQGA 3FRCA 4K7IA 4ZL7A 1FW1A 1NHOA 2P5RA 3FR6A 1EGRA 4WR4A 1JZOA 7GSSA 4O5RA 2JU5A 3GMFA 3LWAA 3HY2A 4V1Ag 3D21A 1VRSD 3BCKA 5A5KA 4DVCA 1XXUA 1WOUA 3TOUA 4FYBA 5CAXA 1VF4A 1BAYA 1PN9A 2HZEB 2K6VA 2MYGA 5JWQB 5D9WA 1A0RP 4MMMA 3TJFA 3UVTA 3TKQA 3APOA 5HR0A 3W8SA 1SK2A 6GSVA 1LBKA 2N5BA 3UEMA 4TXOA 1M0UA 1QK8A 4ACSA 2FWEA 3GHAA 1PX7A 2H72A 5ECOB 4AJ8A 3DMLA 5IO2A 2VLVA 1Y25A 2DJ0A 3I6AA 2CX3A 4MH2A 4IELA 5ID2A 3M8NA 1GLQA 3D0ZA 3DVXA 1SYRA 3IBHA 1SK1A 2H01A 2LRNA 5B8AA 1NM3A 3MWHA 4I2TA 4HZ2A 4N0VA 3KZQA 4ECIA 1R7HA 3KXOA 2RIIA 4TOPA 1MDIA 3FW2A 2FY6A 5CREA 3CYNA 2BJXA 3L78A 2YWMA 3RBTA 1C72A 1SU9A 4K9ZA 5A4VA 5DDLA 1TK5B 4WXTA 2NBSA 5F8BA 1GUHA 4EXJA 1A2JA 5GZZB 4KDYA 5DAKA 2LUSA 3G7YA 5IPHA 2LJRA 3O3TA 3VK9A 4KAEA 1M2BA 1VF1A 5ECIB 5JCUA 5HQPA 4YAVA 2I3YA 5DJLA 1SL1B 5ECRB 2FA8A 4MK3A 3GNJA 1UVZA 2LV3A 4GQFA 4POLA 1E6BA 3EU4A 4MJEA 1JZRA 2HRNA 1V9WA 1XWCA 2CAIA 4IVFA 4XS4A 4QL9A 4K7NA 11GSA 4JRRA 6GSSA 5G5FA 4IJIA 2KOKA 1EP8A 3TRXA 1ERWA 1K0BA 2DJKA 1GSEA 3IDVA 3CSHA 2IMDA 3IA1A 2CVDA 2LS5A 2A4VA 2LNSA 3GTUA 1SKSB 1F9MA 2WCIA 1RW1A 3MDKA 3Q19A 1BQ7A 2LKUA 3QMXA 2YPMA 2CA8A 4ECJA 3A3TA 1F2EA 1GSFA 2IJYA 4PQ1A 2FA4A 4LA1A 3HKRA 2GSQA 5JWRB 4ZBDA 2H6XA 2IL3A 3HYPA 4ZILA 1SKWB 2M46A 2I1UA 2YV9A 3E0UA 2HE3A 1WRYA 5AN1A 1GUKA 1WIKA 4N0ZA 3H4KA 2OBKA 2F3MA 2HRFA 3GH6A 1BJXA 1K0NA 4WEYA 5IMZA 1GLPA 1GNWA 3EMXA 6GSTA 3AY8A 4KX4A 5J9BA 3HDCA 3TKPA 3VPQA 2HSHA 1EWXA 2AB6A 2K8SA 3GSTA 4JE1A 3HZ8A 2WJUA 3DEXA 2F51A 2X64A 5ABRA 1XWAA 1XIYA 4AGSA 3L4NA 3FK8A 2HXKA 3LEFA 3TKSE 2P31A 5D9XA 4IN0A 4MPGA 3FYGA 1OC9A 4G10A 4MZWA 2JZTA 4I97A 2EIQA 2VL2C 3LXZA 1T8EB 2GZPA 3A2WA 2IFQA 2KP1A 3KP8A 3J7Yb 4LL1B 1KEBA 3F63A 5IPGA 1RQMA 3GA4A 4DSSB 3IR4A 3KP9A 2BTOT 4GCIA 4CDOA 3GRXA 2FWGA 4HJMA 5IOXA 4ZB9A 4PX1A 3APQA 1O6JA 2VL3A 3KIJA 1DUGA 4G9HA 2IN3A 2E2GA 1I9DA 1TDIA 4NWYA 4YQMA 3WGEA 1YY7A 1TI3A 4TN8A 3IC4A 1XBSA 2H70A 1TU7A 3MSZA 3VFIA 5B6MA 2GQLA 3C71A 1O81A 2AUVA 1ERUA 1XOAA 2YWOA 3A5WA 3GKMA 4OFNA 2F8FA 1KBNA 5EY6A 1ZZYA 3D4TA 3ERGA 4IKHA 1S3CA 5HFKA 2RM6A 3ZMLA 2VCVA 2PBJA 3F4TA 1K0MA 5H5SA 1E2YA 1TRUA 4WKWA 2AAWA 3SWLA 4IQ1A 3HZ4A 2LJAA 2B7JA 3ME7A 4EUYA 2OJLA 3GL5A 3KTBA 3KJYA 3N9JA 2VLTA 1Z6NA 1XZOA 2VM1A 5F0GA 5AISA 5DALB 3F6DA 3UBKA 5J3RA 3CSIA 3CSJA 4X43A 1AQWA 4TR0A 1EOGA 4X0XA 4MJAA 5IQYA 4CHSA 2MZCA 1SJIA 1AUCA 1JZDA 6GSXA 2L4QA 1PSQA 5EL8A 4K7OA 2P5QA 4MLYA 3F3RA 1JLWA 5A4WA 2H74A 5D93A 5KN0A 1A0FA 5IMAA 6GSYA 2KP2A 2LJKA 2TRCP 4K6XA 2FWFA 3KH7A 2A2SA 4NHZA 1OE7A 4N11A 3I9V2 2VCZA 4HU7A 4ULXA 1H4OA 4JR6A 3C8EA 3UVHA 3RHBA 3IV4A 2J9HA 5KEJA 1OKDA 3GURA 1HNCA 2C0FA 2C8UA 2EC4A 3WD6A 1TU8A 1X5CA 2RUEA 2XBIA 4WETA 2DIZA 3P8WA 1BG5A 4IP6A 3QAWA 3US3A 3EC3A 2MMOA 1YEPA 4GRFA 5HR3A 3KD0A 1K0AA 2KHPA 3TUEA 5L71A 3VWUA 3NIVA 3Q6OA 4D73B 4BVYA 1SENA 3QAVA 1VF2A 2H76A 2HT9A 5DCHA 2V6OA 3KM6A 1ZYQB 2AV4A 3KMOA 3F0IA 1M99A 2IMKA 4Q5QA 4RUVA 2IMFA 1SK0A 2ES7A 2CAQA 5G5EA 3VPTA 2B5XA 4P3YB 5DQSA 4KSMA 3M9KA 4HZ4A 4K1FA 3DGQA 1TOFA 3GN3A 3KGKA 3KH9A 3RHCA 5G2ZA 2H8LA 1YKCA 3QR6A 1M7TA 3MAKA 3FZ4A 1YF0A 2C80A 1FOVA 1ST9A 4F0BA 3EVIA 4ECCA 1O8XA 2VL9A 2WRTA 4OO4A 3G9BA 1JFUA 1TKDB 3FZAA 4Q5FA 3F6FA 1ERVA 4HUAA 2GQKA 2PERA 1OYJA 3TKSC 3VLNA 1X5DA 1O73A 1V58A 3A2VA 4X1UA 5CNWA 3P7XA 1URMA 5ID2B 1W89A 2DJ3A 2B7KA 2RM5A 5ECNB 4BL7A 3IXRA 3QD9A 4HS1A 2H6ZA 5IIZA 1PL2A 1XW5A 2DIYA 4WBRD 2K18A 3QOUA 1THOA 4KDXA 1Z9HA 1SKRB 1OC3A 1GP1A 2QSIA 4IGJA 22GSA 1GWCA 4O92A 2AYTA 2YOIA 1FVJA 3IOSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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