4XS1 | Genus

Total Genus 53

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	53
sequence length	165
structure length	165
Chain Sequence	SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFVFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVC

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Salmonella typhimurium AhpC T43S mutant rcsb
molecule keywords	Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule tags	Oxidoreductase
total genus	53
structure length	165
sequence length	165
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2015-01-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4xs1A00

4GLTA 3VLNA 1YEXA 2HZEB 4FO5A 4BWSA 3HHVA 3GKXA 3FYGA 4K1FA 2AJQB 3DWVA 4XIHA 1A24A 2PERA 4XHMA 2C0GA 4Q5NA 2CVKA 2G0FA 3FR6A 2YOIA 1F2EA 3L0HA 4D73A 4TOPA 5A4UA 1Y25A 2HSHA 2YWMA 1DUGA 1EOHA 2B7KA 2YV9A 2LRCA 1ZYEA 1YZXA 1J08A 5B6MA 1JLVA 3GV1A 5J9BA 2MYGA 1EV9A 1XWGA 4EDZA 3ISOA 4ACSA 4XCSA 1OC9B 1XOAA 4NWYA 17GSA 1GNWA 3KTBA 2FA8A 2F9SA 2JACA 5JCUA 1C72A 3DKSA 1NSWA 4IQAA 2AAWA 1DSBA 4PQIA 3F6FA 1K0BA 4IVFA 4NHZA 3VPQA 1SJIA 1T3BA 4ZBBA 7GSSA 2LJAA 1X5DA 3D4MA 4NHWA 2FA4A 1GP1A 5ECPB 3LXTA 2FLSA 4ZBAA 4YH2A 4RQXA 1GTUA 4KE3A 1TOFA 4H86A 5HFKA 3TOUA 2J9HA 2JZTA 2JZRA 2H1DA 3IA1A 4E8HA 1G6YA 1AQWA 3PH9A 4MJCA 2VCQA 3F63A 2HZFA 5GSTA 4NV5A 2ZNMA 2C0EA 5J9CA 4G9HA 5COHA 3TUEA 4HQSA 2L5LA 4MK3A 2OBKA 1PD21 3LFLA 3JCML 3H79A 4XRDA 2IL3A 1XVWA 2YWIA 1AQXA 4V2MA 16GSA 1K0AA 2LNTA 1ZCPA 4KGIA 3MNGA 3GH6A 5CRDA 5J3RA 1SKSB 1T1VA 2J23A 4WETA 1SK1A 4MCUA 3NOFA 2I4AA 1ZYQB 2RIIA 1SYXA 3TKPA 3FRCA 1WIKA 4GSTA 2DBCA 2F51A 5IIZA 2GQLA 4OMVA 4IBPA 3UJ1A 1TRWA 2YJ7A 1TK0B 2D2ZA 4TXVA 4OCFA 1JZDA 2LEGA 1A2JA 4QQ7A 4IKHA 3IC4A 1TI3A 3QD9A 3UEMA 3KJYA 3A3TA 4PNGA 3GSSA 4I6XA 4K0GA 3GL5A 2H19A 2MBTA 4O92A 4HEA2 3H4KA 4EO3A 1NHOA 1BQ7A 2X8CA 1G6WA 2G2QA 3M8NA 5HFGA 1X0RA 1Z6NA 2IPAA 3DGQA 1HNBA 1TP9A 5GAND 1T8EB 1Z7PA 4EVMA 1GSFA 4ZB9A 4JEDA 2O85A 3HD5A 5CRHA 3GKNA 4K8MA 2H70A 2VM2A 4Q5QA 2LRTA 2PBJA 4MJAA 3RPNA 2PN8A 1XCCA 1BYEA 2H30A 3NZNA 5JCGA 4QL7A 2O7KA 4HZ4A 1PL1A 5D9VA 4WXTA 1HD2A 3C1RA 2B1LA 3IPZA 1Z6MA 6GSXA 2WZ9A 2VUPA 5D8IA 19GSA 5J4UA 3WT1A 4E8EA 4K7NA 4YAVA 1H4OA 2B5XA 4DSSA 4ZB8A 3FZ4A 2VCZA 2B5EA 1SU9A 3UBLA 3ERGA 3UMAA 2VO4A 4IJIA 3QAGA 4AGSA 1EZKA 1LU4A 3IBHA 2EIQA 3V1WA 1VF1A 2OA7A 3VFIA 3GTUB 5KEJA 4G2EA 3SBCA 3F3RA 1USBA 2PVOC 3D21A 1WJKA 3WD6A 1U6TA 2IMDA 3O76A 2IMKA 4HU9A 3EU3A 3ZZXA 2XPDA 3ZREA 2TIRA 4ZBDA 1XW5A 1R5PA 2CVDA 3EU4A 5EPFA 3QOUA 2XC2A 2HI7A 1M2BA 4GXZA 4O32A 3IV4A 3WGEA 3GURA 4MMMA 4V1Ag 4ZXGA 4ULXA 3LYKA 4HQZA 2C3NA 2FNOA 1U87A 1W4VA 1SD8A 5LNKe 1FB6A 5A5KA 4ID0A 3WGDA 1F3BA 1XBSA 3VWVA 2REMA 2C4JA 2GSTA 2GS3A 2L5OA 3DVWA 3FZ9A 1UVZA 3KMNA 1AXDA 1K3YA 2GLRA 3HYPA 3FK8A 4ML6A 2CZ2A 5CYYA 3LJRA 2VL2A 1QXHA 5ECRB 4ILFA 3RDWA 2H6YA 2FCHA 3F0IA 4EKZA 3PINA 5ELGA 3DRNA 5D9XA 1O8WA 4EF0A 2E2GA 4JR4A 5ECQB 2AV4A 3VI5A 2VCWA 5G2ZA 2GQMA 2PMTA 5CNWA 1M9BA 4LL4B 1WRYA 4FYUA 3J7Yk 1TTZA 4JU5A 2L6CA 5CREA 1FG4A 3I9V2 1SL1B 5GAPD 4KCAA 5CO3A 1M0UA 1YJ6A 2DLXA 4K9ZA 2H6XA 2PU9C 4XRAA 3CMIA 4KDYA 1AQVA 4MF6A 2VD0A 3GRXA 2XPEA 2LQOA 3TRPA 3L9VA 1SL2B 3N5OA 1K0OA 22GSA 3VI7A 2XHFA 4TR1A 5IQYA 2CT6A 1TKDB 3K8NA 1S3CA 2P0GA 3L9SA 3KXOA 1N8JA 4AJ7A 1A8LA 4IS0A 2WS2A 4GRFA 1ABAA 1EV4A 4JRRA 3CXGA 1UN2A 1FVJA 1ZGNA 2H75A 3KCMA 3IRAA 3GKKA 5IMDA 2VD1A 2FWFA 3QCPA 2V6KA 5G31A 2H0IA 1F9MA 2QSIA 5DBQA 2E7PA 4ML1A 3U6VA 1T4ZA 4PUAA 2P5QA 4TXOB 5B7CA 5L71A 5EY6A 2RUFA 2CVBA 2H1BA 1RK4A 4JZQA 1K3LA 2IMFA 4GQCA 2N5FA 3KH7A 2QGVA 5ID2B 12GSA 4V2LA 5IOXA 3LORA 3CRUA 5DQYA 1OC3A 4PURA 2HZEA 3EYTA 1E2YA 3LGCA 3L9UA 3UBKA 4XS4A 4ZL7A 1XWKA 4TVEA 5IPHA 4ZB6A 5B6NA 3ZFBA 4MPFA 2DMMA 1K0CA 4PUFC 3BJ5A 2B1KA 2RUEA 3APOA 1YEPA 1GSQA 3F4RA 1QK8A 4OFNA 5EL8A 1U88A 1CQHA 2VAFA 1O73A 1WOUA 2KOKA 4OO5A 2V1MA 1BG5A 4P3YB 8GSSA 4PQHA 2OADA 3UVHA 1JZOA 3D4TA 1MDKA 4V1Ap 3TKRA 1OC9A 2C80A 3CTFA 3VK9A 3E9JB 4CHSA 1QFNA 4ECBA 2QC7A 3W6GA 2YZHA 4PX1A 5IOWA 5J5NA 5DAKA 5DDLA 1ZL9A 4OFMA 2B6MA 2PWJA 4XS4B 2P5RA 2GGTA 2YJHA 4IHUA 5F0GA 4GSNA 4IW9A 4GTUA 2A2SA 4MJBA 1GSEA 3BOAA 2MMAA 2K9FA 5IMVA 4F03A 3KH9A 6GSUA 3G7YA 2LS5A 3IR4A 1SKWB 3DVXA 2O87A 5AGYA 5B8BA 3TDGA 1EGOA 1VF4A 1SK0A 4CW9A 2WGRA 2A2RA 2M80A 2YZUA 4PGTA 3ZVJA 5AIVA 3DD3A 3EC3A 3HZ8A 3IOSA 4WR5A 5DAKB 1TI1A 2V6OA 3UARA 1M2DA 2X8HA 4YQVA 3I6AA 4IP6A 3FHKA 3KD0A 3TJGA 4WBRD 1K0MA 4TW5A 5CAXA 2OE3A 5H5QA 4K6XA 4LL1B 4LLRA 4MPGA 5ECSA 3DXBA 5LCZA 4IGJA 3LG6A 4HDEA 1WMJA 1B4PA 1XZOA 2I81A 3MWHA 2CX3A 3A5WA 3EE2A 1V98A 1I9DA 2MMZA 2H72A 1B48A 3FEUA 3M3MA 3MAKA 2DJ0A 5C04A 4OCEA 3D22A 1BAYA 3UVTA 6GSYA 2C0DA 3Q6OA 4O5RA 4X43A 3KP9A 4XS1A 1GH2A 1XW9A 1F6MC 4NV2A 1W89A 2NPBA 4K0NA 5HR0A 1DBYA 3N9JA 3HY2A 5IMCA 3D6IA 2WCIA 4K2DA 3TKSE 2LQQA 4WF5A 4TKYA 5E59A 1XWBA 1GUHA 4DEJA 2ALBA 1G0TA 4KSMA 2L59A 1GSDA 4ZILA 5H5RA 4J57E 2H1GA 3RAZA 1SK2A 3Q74A 2A4VA 4OWYA 4BPYA 2I1UA 3DEXA 2VL2C 3BCIA 2L4CA 2MZCA 4HJ2A 3VWUA 2ZUPA 1QQ2A 1PKWA 1MDJA 3GL3A 3GMFA 2E2MA 1KNGA 5F07A 1F3AA 2VLUA 3PR8A 2DIZA 5A4WA 3C1SA 1XOBA 1VF2A 5KN1A 3EMPA 2EIRA 3CSHA 4POMA 1A0FA 1H75A 2NVLA 2VOCA 3HVXA 4MP4A 4KAEA 4ZL9A 1T7PB 5IPGA 2M72A 3HZ4A 3G9BA 1XFLA 2VCTA 5F05A 1PKZA 4Z7XA 2VM1A 4NAXA 4FIWA 4NXIA 2HYXA 2LKUA 4KCEA 4BWQA 4KUNA 1SL0B 3GTUA 3GSTA 3M1GA 1EGRA 2PUKC 4ISDA 2BJXA 2CAQA 3EWLA 1S3DA 2H0HA 2HE3A 1EP8A 4DVCA 1OYJA 1ZZYA 4HOJA 4LMVA 20GSA 4MF7A 4YQUA 1R5AA 3IK9A 1ERUA 2DJKA 3F3QA 1PL2A 3QAWA 1JZWA 1O8XA 2LV3A 3L78A 2FD3A 3EMXA 3FKFA 2JU5A 1TJDA 3IXRA 2H73A 5G5FA 3M9JA 1TW9A 18GSA 2KUCA 3F9UA 1FHEA 2DSAA 3ZRDA 3ED3A 5ABRA 1AAZA 1PA3A 1KTEA 1ERTA 1JLWA 2JSYA 4LA1A 13GSA 3QPMA 3QFAC 2MMNA 1X9SB 3LEFA 3HVVA 3VWWA 5G1LA 6GSSA 1X9WB 2YANA 2HLSA 1WE0A 5IO2A 3GN3A 4F9ZA 5DVBA 3LXZA 1O81A 1AW9A 2LUSA 2LNSA 4RI7A 2ON5A 2OJLA 4WF4A 2WDUA 2CQ9A 4J2FA 1XWAA 4RUVA 3LYPA 1WWJA 3S9FA 3GKMA 4IQ1A 2KP1A 4F2IA 4FYBA 2XBQA 4AF2A 1KEBA 5GZZB 2H66A 3F6DA 2FUG2 4Q5RA 2IIYA 2TRXA 1IYHA 4XTSA 1SYRA 3AY8A 3FW2A 1SKRB 1ERWA 4EUYA 1TRVA 2HNLA 3VPTA 4PQ1A 3CTGA 1GNEA 4YAPA 1V9WA 1PSQA 9GSSA 2K6VA 5D9TA 2CA8A 5D96A 3D0ZA 1YY7A 3IAM2 2ZCTA 1I5GA 4OFTA 3W8SA 2FHEA 3FY7A 3A2XA 4GQFA 2DMLA 1ACVA 1FAAA 3HA9A 3GUSA 1TDIA 3F4TA 3ZL5A 1PQNA 3M9KA 5AN1A 2OE0A 1R26A 1FO5A 1XPVA 3TRXA 1EEMA 2H6ZA 3GFKA 3TJKA 4TXOA 4TRXA 2DJJA 3HVSA 3RBTA 4I8BA 5JCWA 4MLYA 4WKWA 2JL4A 2PVQA 3RHBA 4J56E 4IJ3A 5ID2A 3CRTA 1TRUA 4RQRA 1YDKA 1A23A 2VLVA 4EDYA 3FR9A 3CSIA 2VLTA 3UL3A 2CV4A 1OKDA 2HXKA 1X5EA 2L6DA 5A4VA 3KGKA 1ST9A 1Q4JA 2FWEA 3US3A 2DC5A 4HU7A 5JWRB 3PGTA 4KDUA 3ZIJA 4WEYA 5ECIB 4O7HA 1TU8A 1O85A 3P8WA 4EC0A 1J9BA 2KHPA 5B8AA 2GSQA 5CRWA 5ENUA 5FWGA 1Z7RA 3O3TA 2GSRA 2YV7A 4ZL8A 1GRXA 4K7IA 4JBBA 4IELA 3BD2A 6GSVA 3GIXA 4L0UA 1R7HA 4I5QA 4HUAA 2BMXA 4G10A 1XVQA 3Q19A 5IMFA 3GH9A 2DJ2A 1U3AA 4L5OA 4F82A 5ECOB 3HJMA 2B5YA 1OE8A 3KMOA 3TJJA 3WT2A 1A2MA 3GHAA 2WB9A 1GSSA 5GSSA 2F3MA 4TR3A 1NHYA 1PX6A 4HZ2A 2GZPA 2GT6A 3HKRA 1PN9A 4KSOA 1MD3A 2LRNA 1ON4A 4GF0A 2HT9A 1U3IA 2HFDA 1OE7A 1FOVA 3M0FA 2GSSA 3TB2A 3KTLA 1UC7A 2YP6A 4MZBA 3HJPA 1LBKA 4DSQA 2R4VA 1SENA 1TRSA 3KP8A 3NIVA 1CQGA 3QFBC 1NM3A 4GCIA 4HS1A 2RLIA 1A0RP 3UAPA 1HNAA 1K0NA 3GYKA 4EXJA 3TKQA 1IYIA 3GX8A 2NTOA 5IMAA 4HJMA 2E0QA 5D9WA 2H76A 4N0ZA 3ZMLA 5ELAA 1G7EA 2FGXA 1HYUA 4N11A 3TKSA 3DYRA 2YPMA 4BVYA 3ME7A 1OVNA 5DQSA 1BEDA 2C1YA 2Z9SA 3GA4A 2H1AA 2N5AA 1RW1A 3ZYWA 2HRNA 2MBSA 1T00A 2WFCA 3D5JA 5IO0A 3H8QA 4MJEA 5DCHA 11GSA 3R2QA 4D73B 3ERWA 5FHIA 4KW6A 1RQMA 3CYNA 2PGTA 5HQPA 1YF1A 4L5LA 4KB3A 1M99A 2AB6A 1SJZA 1THXA 1YKCA 1BJXA 3RPPA 1QUWA 4EE0A 2GZZA 1OAZA 2R2JA 3FZAA 5JWQB 4WR4A 5EVOA 5D73A 3QR6A 4PXOA 1F37A 2AYTA 2IMIA 1X5CA 2B7JA 1GWCA 5LD0A 2H0GA 5CP1A 5IMZA 2YWOA 3TJBA 1AC1A 4GWRA 3OR5A 1Y6EA 1MEKA 4RI6A 2KP2A 1GL8A 3TCOA 1A2LA 4NPBA 3HCZA 1VF3A 3A2VA 1UA5A 5ECHB 2I3YA 2R37A 3KZQA 1FW1A 2FWGA 3ME8A 4PNFA 3C73A 5DCGA 2HRFA 4EL1A 3C71A 1B9XC 1E6BA 3HJOA 1GLQA 4WBJA 1Z5YE 2IWTA 3MSZA 4I2UA 1VRSD 2CZ3A 3RHCA 1JZRA 1ZMAA 3BCKA 3G7JA 5INYA 4IN0A 3FR3A 1GSYA 2O8VB 4LMWA 4TN8A 1J0FA 2O89A 5C00A 2AHEA 2R5GA 5D93A 1O6JA 14GSA 2YNXA 2GQKA 3QMXA 2FWHA 3ZVJD 2F8AA 3QAVA 2XBIA 5H5SA 1SD9A 5J41A 3ERFA 3TRQA 3APSA 3APQA 3IK7A 2YN1A 3O6TA 4L0WA 2IJYA 2EC4A 5ECKB 5F8BA 2QKEA 4GSSA 5ECNB 1K3OA 2VL9A 2VIMA 2KLXA 3ZTLA 3FZ5A 1Z9HA 3ZIVA 2X64A 4AJ6A 1WPIA 1AUCA 3TGZA 2P31A 1K0DA 3SWLA 3ZFLA 2GDRA 2VCVA 5ECLB 3EINA 3LSZA 1KBNA 2CX4A 3GX0A 1B8XA 3DIEA 2WRTA 1URMA 1TU7A 1LJRA 4G19A 3KIJA 3VWXA 2R3XA 1B4QA 3TJFA 1XWCA 4F0BA 3KM6A 1MD4A 3G7IA 5HR3A 3Q18A 4Q5FA 3U5RE 2RM6A 1X9MB 4AJ8A 4MZCA 5HR1A 3VURA 4N0VA 1EP7A 1GUKA 2C3TA 3W8JA 4MABA 4TR0A 1ILOA 2ES7A 2HSYA 4L8EA 4OD7A 1MDIA 4K7OA 4HI7A 2OBIA 3DMLA 2PPTA 2C3QA 1PRXA 4TR4A 4KH7A 2WULA 1JFUA 6GSWA 1TK5B 1R4WA 1GTBA 5KN3A 2RM5A 2YCDA 5DALA 2GT5A 6GSTA 4JR6A 2C8UA 3WYWA 2JZSA 3IAS2 3CBUA 4DSSB 2OKAA 5JWOB 4ZIJA 2CAIA 3I43A 4NMUA 3P7XA 4POLA 1G7OA 4BVXA 1Q98A 2V41A 2L57A 1PX7A 3C7MA 4YQMA 4CDOA 1V58A 1FVKA 3J7Yb 4MZWA 4BL7A 4N30A 3I69A 1AIUA 4I97A 3ZITA 2GZYA 2X8GA 1FB0A 5F06A 1THOA 5DJMA 3UOMA 3IHQA 3BBYA 5DALB 4FH8A 4V2NA 3EURA 3F8UA 3A2WA 4POBA 3ZLPA 1DE2A 2K18A 2LJRA 2H71A 2H8LA 1GLPA 3C8EA 4X0XA 1JHBA 5IM9A 5DJLA 5HR2A 2GTUA 3IE3A 2NBSA 2GVPA 2VL3A 1QMVA 2V32A 1MTCA 4F0CA 1QGVA 4ECIA 1VGLA 1PMTA 4MDCA 2K8SA 2AUVA 5ECMB 3TKSC 1EOGA 1BX9A 2JSZA 5E4WA 2NDOA 2BTOT 2DIYA 3E0UA 4MH2A 2IFQA 1OC8A 2ON7A 1TXXA 1PGTA 1GUMA 1YF0A 1YKAA 1V40A 4JE1A 1GULA 2B3SA 2DJ1A 4KNDA 2VCXA 1EWXA 4KDXA 5FT3A 4MH3A 2C0FA 2YWNA 2V2GA 3P2AA 4KA0A 1Z3EA 1ERVA 2R6KA 5G30A 2OACA 5KN0A 2H74A 3H93A 4DSRA 3CSJA 1ZOFA 2L4QA 3QDNA 4KX4A 4XS6A 2H01A 5G5EA 2IN3A 5CRGA 2IFQB 1M9AA 4N10A 2K8VA 2X99A 3LQ7A 1A8YA 1M2AA 4POKA 5AIXA 1EEJA 4MA9A 1M7TA 4ECJA 1HNCA 2WJUA 3UIWA 3KEBA 4TR1B 4BA7A 3L4NA 1V57A 3IDVA 1GTIA 3MDKA 4X1UA 1YQ1A 2MMOA 1V2AA 1XIYA 3HXSA 2LTKA 2DJ3A 3H1NA 1GTAA 1B9YC 2TRCP 4ECCA 4FYCA 10GSA 5HFIA 3WGXA 4OO4A 5G1KA 1O7UA 1NW2A 1GSUA 4IP1A 1S3AA 1WP0A 1XXUA 2I9HA 1XW6A 3GNJA 3ZMKA 1OKTA 4MF5A 1TK8B 4I2TA 2M46A 3HDCA 2F8FA 2FY6A 2JADA 2OE1A 4QL9A 5KN2A 1HQOA 3TOTA 2LSTA 3LWAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4XS1A

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sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations