4XS4 | Genus

Total Genus 56

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	56
sequence length	186
structure length	185
Chain Sequence	SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFTFVPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAHPGEVSPAKWKEGEATLAPSLDLVGKI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant rcsb
molecule keywords	Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus	56
structure length	185
sequence length	186
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2015-01-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
B	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4xs4B00

3L78A 4TVEA 4XS6A 1MD3A 3HVSA 2KUCA 1WE0A 1R26A 3TGZA 2C0GA 2LJAA 1WWJA 2LV3A 2GZPA 2FNOA 3TKSE 2YV9A 2YWNA 3HVXA 4AJ7A 3ZTLA 1WJKA 1WMJA 3IRAA 2YZUA 2CA8A 2LJRA 4WKWA 1QMVA 2OE1A 4POMA 1XXUA 4GTUA 2H74A 1H4OA 1QQ2A 3BJ5A 4ML1A 2GT6A 1A2JA 5DCHA 14GSA 2ZNMA 3TJKA 4JRRA 3UMAA 1PN9A 3WGEA 3KH9A 1RW1A 4D73B 2CVKA 2E2GA 4ZBDA 2DIZA 4ECJA 1OYJA 1GTBA 4G10A 2I1UA 1T4ZA 3ME8A 1M9BA 4O32A 3ZMKA 4MCUA 1XBSA 2IL3A 3TRQA 5J9CA 5H5RA 1U3AA 4AGSA 5DJMA 1ILOA 4H86A 4L5LA 3TRPA 1SJIA 5JCWA 4TR3A 1Q98A 1U88A 3IC4A 1Q4JA 3NIVA 3QCPA 1HNAA 2YANA 3HDCA 5ID2A 2O87A 3GX8A 3UARA 1F2EA 1S3AA 4IGJA 2FWEA 5CRDA 18GSA 1X9WB 3HY2A 2YNXA 3KIJA 4Q5NA 2MBSA 1U6TA 2I3YA 1JZRA 5A4VA 2L57A 2RM5A 1MEKA 2DC5A 3D5JA 1J08A 3HZ4A 2TIRA 13GSA 1T8EB 1TRSA 3IHQA 3DD3A 4NXIA 2YWOA 5D73A 4N0VA 1K3YA 1FAAA 1Z9HA 1OC9B 1H75A 5IMZA 2CZ3A 2V6KA 1TW9A 4TRXA 2HSHA 3TKPA 2GSTA 3HD5A 3IXRA 5F05A 2GTUA 1PL2A 4XTSA 1T4YA 5LNKe 2ALBA 1O85A 1PSQA 4DSSB 4BL7A 3C7MA 1EWXA 2GZZA 3GKMA 1BQ7A 2JSYA 1X9SB 4MA9A 1GSYA 4D73A 5CNWA 2IFQB 1RK4A 2MMAA 1OAZA 4K6XA 4RQRA 2HE3A 4BVXA 4EKZA 3KM6A 1YEXA 2XHFA 1TOFA 1BG5A 5CAXA 4XCSA 2C3QA 1XWAA 1PD21 2LRCA 3F6DA 3ZFLA 4BA7A 2CT6A 3EE2A 1O7UA 1SK0A 2KP1A 3GIXA 1NSWA 3GN3A 1TU7A 4V2NA 2DJ2A 4ECIA 2C0FA 5IOWA 2DSAA 3L9UA 4RUVA 4G19A 2MZCA 4IELA 3TRXA 6GSTA 1AUCA 3M9JA 3F4SA 5G31A 5COHA 3GKNA 1KBNA 5B7CA 3LEFA 1EGOA 2LSTA 4EF0A 3FR3A 2MMOA 1FVKA 5DBQA 2CX4A 3MNGA 1XWBA 12GSA 1ERWA 1GL8A 4L8EA 5ECLB 3FKFA 1M0UA 2N5FA 2V6OA 2AJQB 2HI7A 5EL8A 1VGLA 5IQYA 3VWXA 3M0FA 3DWVA 1G0TA 2VCTA 1HNBA 1ZMAA 2DMMA 3LYPA 5JWOB 2KP2A 4K7IA 4L5OA 1OC8A 4JR4A 1A2MA 2L6DA 3KTBA 5INYA 1OVNA 2IPAA 4AJ6A 11GSA 3D22A 2V32A 3L9SA 5IO0A 1SD9A 2IMIA 3D0ZA 2H8LA 2FHEA 5ECSA 2WRTA 3D6IA 3GH9A 1C72A 2FLSA 2WFCA 2AUVA 2FUG2 1A0RP 2IFQA 1GLQA 5D96A 1YJ6A 1K0AA 4MDCA 4P3YB 2F9SA 1F3BA 2B5XA 4FYBA 2P5RA 2B3SA 4MZWA 4KUNA 1M9AA 3O3TA 1K0BA 2H1DA 4NHWA 1YKCA 2H70A 1Y25A 4O7HA 2PUKC 3HCZA 2PWJA 2OJLA 2LRTA 4MJAA 4Q5RA 2H75A 2I81A 2PVOC 4PX1A 4ECCA 4HU7A 1FVJA 3HJOA 2VLVA 4IJ3A 4CHSA 7GSSA 4PQHA 5IMCA 2PPTA 2MMZA 3V1WA 4I6XA 3ZYWA 2JZSA 5A4UA 1XPVA 2CVDA 4NPBA 3FY7A 1W4VA 1PKZA 3N9JA 5G1KA 1MTCA 3CBUA 5ECMB 2WS2A 3HXSA 4IP6A 3F63A 3ZIVA 1SYRA 1T1VA 3UJ1A 2V2GA 1ML6A 3EMPA 1SL0B 4JR6A 5IOXA 1V9WA 1FG4A 2AHEA 3VFIA 1M2DA 2M46A 5DAKA 2H6YA 2AAWA 2FWGA 2GS3A 4DSQA 3KEBA 2QGVA 3C8EA 2FA4A 3GURA 1GTAA 4F9ZA 1S3DA 2JACA 2JU5A 5IMFA 3ERWA 2IMFA 4JZQA 4EVMA 2VLTA 2GLRA 3HJMA 3KGKA 1SJZA 5G5FA 4MH3A 2L5OA 4NV2A 1EV4A 3C73A 1YY7A 2FWFA 5ENUA 3EURA 3GFKA 1X5DA 3HVVA 4MLYA 1JLWA 3UOMA 3ZRDA 4I97A 4TR1B 3LQ7A 4I8BA 2YWMA 2X8HA 4ACSA 1B9XC 1EGRA 3Q19A 1ZOFA 3IOSA 5JWQB 4ZB9A 2VLUA 2XPEA 3TCOA 2C3NA 1K3LA 1TK8B 1WP0A 1A8YA 1QGVA 2CZ2A 4ML6A 3F9UA 3A2WA 2GSSA 1Z7RA 3TOTA 5IMVA 3MWHA 2TRCP 1YKAA 2KLXA 5D9VA 2P0GA 2O8VB 1K0OA 1Y6EA 2PMTA 3LFLA 5ECQB 3FYGA 1E2YA 3SWLA 4ZL8A 3TOUA 2DJ0A 3JCML 1A23A 1ZYEA 4GSSA 3G9BA 2ON5A 3KZQA 5G5EA 2FWHA 8GSSA 2VD1A 1F6MC 1R7HA 1V58A 3Q18A 2H19A 4L0WA 5IM9A 4DEJA 6GSSA 16GSA 4PGTA 2H76A 4OO5A 1SJ6A 3GKXA 3F4TA 1N2AA 1VRSD 3DVWA 2P5QA 1EOGA 4MK3A 1VF1A 2F51A 5AN1A 1BX9A 4ECBA 2VOCA 2NDOA 1NHYA 3PINA 3K8NA 1K0MA 3WYWA 4XRAA 4KCEA 2LNTA 2GQMA 3DRNA 1GSQA 2CQ9A 3LWAA 3RBTA 1SK1A 1XIYA 1SU9A 1PKWA 5H5QA 3FK8A 1A2LA 2DJKA 3FZ4A 2NTOA 4TR1A 2QC7A 1BEDA 2LUSA 3W8SA 1PX6A 4XRDA 3F3RA 2DMLA 5HR1A 2IMEA 3NZNA 1SL2B 2IN3A 4HQSA 2F3MA 2AV4A 5AGYA 1TK0B 1M7TA 4QQ7A 5FHIA 5GSTA 5G30A 1OE8A 3FHKA 1OKTA 3C1RA 3WT1A 3IA1A 1FHEA 3GA4A 5B6MA 2VAFA 3ZVJD 1I5GA 4V2LA 1KEBA 2H6ZA 2O7KA 1YF0A 1UC7A 2QSIA 1A8LA 4CDOA 2H71A 3E3EA 4OFMA 3LXTA 4EDYA 5HFIA 1THOA 2MBTA 3ED3A 1TK5B 4XS1A 2LTKA 2K8SA 5KN1A 5D8IA 2M72A 3US3A 3ISOA 3FR9A 3UBKA 3L4NA 2FD3A 5DQSA 5GZZB 1JFUA 1XOBA 2O89A 2NBSA 1N8JA 2JL4A 4HZ4A 3QPMA 3Q6OA 5A4WA 3QAWA 2LQQA 3APQA 1ABAA 5DQYA 2AYTA 4LMVA 1U87A 2LEGA 2LNSA 3QFAC 3G7IA 1TXXA 4EE0A 3ZL5A 3I43A 3F0IA 3DIEA 2H66A 4KW6A 2XPDA 5ECPB 1GSSA 2H0GA 1VF2A 3GNJA 2ES7A 1EEJA 2R6KA 3C71A 1TI1A 1TP9A 3ZITA 3I9V2 1A24A 4GQFA 4K7OA 5CREA 3BCIA 4V1Ap 1CQGA 3TJJA 3P2AA 1AIUA 4MJBA 2E0QA 4N11A 1SD8A 4QL7A 2VL2C 3LSZA 6GSXA 2FA8A 5ECHB 2N5AA 4WBRD 3LORA 5HFGA 1GNEA 4LA1A 4Q5QA 4J56E 3IPZA 4YQVA 1G6YA 2NVLA 1G7EA 1GLPA 4ISDA 3CSHA 1Z5YE 3I6AA 5ECRB 1MDKA 2H6XA 3W8JA 1XWKA 1I9DA 4K9ZA 2AB6A 3IV4A 4ID0A 3D21A 3GL3A 2X64A 1SYXA 3TJBA 2H0IA 1R5PA 3IAS2 2F8AA 2IMDA 4POKA 3D4TA 2B7KA 2XBIA 1AW9A 2PERA 3AY8A 1QFNA 2P31A 1DSBA 5EVOA 2OBIA 4F0CA 1NM3A 4WF5A 3BD2A 3WGDA 5IMAA 2WZ9A 1YQ1A 5B8BA 2H01A 1Z7PA 2HNLA 1Z6MA 2YOIA 2CAIA 1XOAA 3M3MA 1PGTA 2H0HA 4L0UA 1USBA 3ZMLA 3PR8A 2M80A 4N0ZA 1HD2A 4PURA 2EIOA 4MPFA 2J9HA 2WB9A 1WIKA 3ZIJA 3ZLPA 3RAZA 3H79A 4V1Ag 2K9FA 1SK2A 2QKEA 3HKRA 2L4CA 1DE1A 6GSUA 3UAPA 5CRGA 3DGQA 5IO2A 4OFTA 4GSTA 3GSSA 5DAKB 4JE1A 5EY6A 6GSYA 3FZ9A 1GP1A 2G2QA 1VF3A 3EYTA 5KN2A 1V98A 3KD0A 1GWCA 1PRXA 3O6TA 1HQOA 2X8GA 1G7OA 5E59A 2CAQA 3FZ5A 1TU8A 3APOA 2VM2A 4WR5A 3ZZXA 4PUFC 5J41A 4YH2A 2OE0A 3FR6A 5IMDA 1AC1A 1J0FA 4PNFA 2Z9SA 4IHUA 3MSZA 1ERVA 4HEA2 5GAND 2VCQA 1WOUA 2DIYA 2IIYA 4PXOA 4IW9A 2K6VA 2X99A 3EINA 3U5RE 3KP8A 1GUKA 5AIXA 2OBKA 1OE7A 3FZAA 4BWQA 5ECIB 3VI7A 3P8WA 3EWLA 3VPTA 3HJPA 1TRVA 4GCIA 3L9VA 3KH7A 4MJCA 4AF2A 2X8CA 1K0CA 2LJKA 3D4MA 2R37A 1XW6A 4V2MA 3L0HA 4XS4A 2H1BA 3CTFA 4TR0A 4MP4A 2RIIA 4YAPA 3GH6A 1NW2A 1X9MB 4NV5A 3GKKA 1YZXA 4E8EA 4IQ1A 5F8BA 1PQNA 4TOPA 4JBBA 2MMNA 4TXVA 5ECOB 4J2FA 3H4KA 1ST9A 2A2RA 1FB6A 1EEMA 1ZGNA 3LYKA 4YQMA 5F06A 3DVXA 3Q74A 4MABA 1SKWB 3VWUA 5G1LA 5JCGA 1XWGA 2H30A 3J7Yb 3EC3A 3KJYA 1BYEA 2DJ1A 1THXA 2HYXA 2OA7A 3ZREA 2DLXA 5JWRB 3QOUA 2VL9A 2D2ZA 3LG6A 3GSTA 3OR5A 1K3OA 3WD6A 4KSOA 5GAPD 4FO5A 4HDEA 3H93A 2PN8A 1HNCA 2VM1A 4NMUA 3QAVA 2H73A 4IS0A 1CQHA 1K0NA 4AJ8A 3KMNA 2H1GA 5LD0A 3CSJA 1J9BA 4JEDA 2B5EA 2J23A 3BBYA 3FW2A 3H1NA 19GSA 1VF4A 1UVZA 1TI3A 1V40A 1KNGA 1PX7A 1MD4A 3F3QA 2OKAA 4PQ1A 5LCZA 5GSSA 1KTEA 2BMXA 1T3BA 3HYPA 5A5KA 3RDWA 2ZCTA 3PH9A 3MAKA 4G2EA 2VIMA 4BPYA 1G6WA 3TDGA 5C04A 4JU5A 3VWWA 4K1FA 1M2BA 4KDUA 1ZL9A 4CW9A 9GSSA 3F8UA 1QUWA 3GTUB 3DKSA 4POBA 1GSDA 4EXJA 4HQZA 5E4WA 2C0DA 3R2QA 4QL9A 2BJXA 4TN8A 1ON4A 2V1MA 1B4PA 4MF7A 3J7Yk 4LL4B 2B1KA 3GL5A 1AQXA 4LLRA 4MZBA 2VL2A 2JADA 3S9FA 2VCVA 4KE3A 4GF0A 1YF1A 1V2AA 4DSRA 1ERTA 3A2XA 1GUMA 4IBPA 1GH2A 2GGTA 4POLA 1AAZA 4ZBAA 3LXZA 3QFBC 2VCXA 3ERGA 1GSEA 4IJIA 3CSIA 2IWTA 2HFDA 5F0GA 4TW5A 2C0EA 4BWSA 2JZTA 4ZL7A 4IP1A 2IMKA 3GV1A 1TDIA 5DALA 5JCUA 4F82A 3ERFA 1X5CA 5CYYA 4K8MA 3EU3A 5G2ZA 2EIQA 5ECKB 3VPQA 4KGIA 3IE3A 5CRHA 1AQVA 2A2SA 2FCHA 3QMXA 2R3XA 4KAEA 2WDUA 2HLSA 3M8NA 2VL3A 4ZILA 2K18A 2YZHA 4FH8A 1B48A 3GRXA 5HQPA 1M99A 1RQMA 4XHMA 1Z6NA 3VURA 5D9WA 3IAM2 1WPIA 3TKSA 5DCGA 1XCCA 5CP1A 3FRCA 4TXOA 3GTUA 3SBCA 2VUPA 4X1UA 2NPBA 3IDVA 2I9HA 3IBHA 3ME7A 5L71A 5D93A 3G7JA 3IK9A 6GSVA 5B8AA 3A3TA 4YAVA 1O8WA 2VO4A 4XIHA 1XVWA 3VK9A 2MYGA 4F0BA 3A2VA 5D9XA 1TRUA 4KSMA 2H1AA 4ZB6A 1JZDA 3M1GA 4LMWA 1XWCA 2HSYA 1F9MA 3BCKA 3HHVA 3UIWA 5ECNB 2WULA 3CRTA 2EIRA 3F4RA 1B4QA 2C80A 2HT9A 3CXGA 4KNDA 4FYUA 1XVQA 4O92A 3N5OA 4PQIA 2GQLA 3UVHA 3DXBA 2GQKA 2L4QA 4E8HA 3DYRA 4ILFA 4O5RA 3MDKA 3EU4A 3U6VA 2JSZA 5KN3A 2CVBA 2GSRA 3E0UA 5DJLA 3TKRA 2ZUPA 1HYUA 5CRWA 1X0RA 1PMTA 4G9HA 4HZ2A 2PU9C 4MF5A 4ZL9A 1XZOA 3H8QA 4WR4A 3WT2A 2C1YA 1JHBA 4HUAA 3CYNA 2CX3A 2XC2A 5HFKA 1SENA 3GX0A 3HA9A 3UL3A 22GSA 5IIZA 3DEXA 1BAYA 2YWIA 3M9KA 5ABRA 3BOAA 3RPPA 1GRXA 3KXOA 1ACVA 3KTLA 1FO5A 1O8XA 5J4UA 2HZEB 3O76A 5F07A 3LGCA 2GDRA 3LJRA 2OE3A 3GYKA 4KA0A 4EUYA 1QK8A 1DE2A 2H72A 3P7XA 1GULA 3UBLA 2RUEA 2PBJA 2ON7A 2F8FA 1YDKA 3TKSC 2R2JA 2RUFA 1GTIA 4KH7A 4OMVA 4IKHA 1TKDB 5AIVA 2LS5A 4TR4A 1R4WA 1UA5A 3VI5A 4NAXA 4XS4B 2HRFA 4MF6A 6GSWA 2V41A 4FIWA 1OC9A 1MDIA 4ZIJA 1IYIA 3GHAA 4DVCA 3GMFA 1TRWA 2L59A 3ZFBA 1O73A 1O81A 1Z3EA 1O6JA 1JLVA 1UN2A 2YJ7A 2VCZA 3APSA 4HJ2A 4I2UA 2REMA 1EV9A 4DSSA 3VLNA 3C1SA 3DMLA 5EPFA 1LU4A 2YP6A 2VCWA 4RI6A 4KB3A 5H5SA 1F3AA 2JZRA 2XBQA 2YCDA 4WETA 4OWYA 4OCEA 4KDXA 2B7JA 4EC0A 2HZFA 2O85A 3IR4A 3TJGA 1M2AA 3RPNA 5ELAA 2R4VA 4TKYA 2RM6A 3QAGA 3IK7A 4MH2A 5HR0A 2GVPA 3P90A 2KHPA 4K7NA 2B5YA 4X43A 2G0FA 2YV7A 4ZB8A 3WGXA 20GSA 3W6GA 5IPHA 4RQXA 1W89A 2BTOT 1U3IA 2HZEA 5HR3A 1GUHA 2LRNA 2B6MA 1DBYA 4WBJA 1F37A 4GQCA 1JZOA 1AXDA 2C4JA 3QD9A 4KDYA 1T7PB 3NOFA 4N10A 2K8VA 5HR2A 1GNWA 4I2TA 4MZCA 2E2MA 1GSFA 1FB0A 1URMA 3UEMA 1A0FA 4ULXA 2EC4A 3KP9A 4GSNA 2CV4A 4PUAA 3QDNA 1K0DA 1LJRA 4IN0A 2YJHA 3RHBA 4MMMA 4KCAA 1GSUA 1LBKA 5KEJA 1WRYA 1V57A 2OACA 1JZWA 4HOJA 5FWGA 2GZYA 4GXZA 5D9TA 1QXHA 4NHZA 5B6NA 2WCIA 4GWRA 2L5LA 1IYHA 2E7PA 5DVBA 2YPMA 3GUSA 4OD7A 1SKSB 17GSA 5KN0A 3F6FA 4EO3A 4MJEA 1EP8A 4J57E 3TUEA 2WGRA 1XFLA 4NWYA 2GT5A 4ZXGA 2YN1A 3HZ8A 4MPGA 1BJXA 10GSA 3RHCA 1PA3A 4LL1B 5J5NA 4HU9A 2DJJA 2N5BA 5C00A 1FOVA 3EMXA 4F2IA 1E6BA 2LQOA 5FT3A 4YQUA 4GLTA 1ZYQB 4PNGA 1ZZYA 1XW5A 1B9YC 5DALB 1SKRB 2KOKA 1DUGA 4KX4A 4OFNA 5J3RA 4HI7A 2C8UA 1TTZA 3ZVJA 3TJFA 4N30A 3A5WA 1AQWA 3KCMA 5DDLA 4K2DA 4K0NA 3FEUA 4WF4A 2DBCA 3UVTA 1GTUA 4EDZA 2LKUA 3I69A 4GRFA 1X5EA 2RLIA 3CTGA 2WJUA 1XW9A 1EP7A 2PVQA 2DJ3A 2OADA 1PL1A 1S3CA 4OO4A 2HRNA 1FW1A 4TXOB 5ELGA 2A4VA 2R5GA 5CO3A 1OC3A 4RI7A 1R5AA 2I4AA 4X0XA 1MDJA 3CMIA 2GSQA 4Q5FA 4BVYA 2FGXA 4F03A 4EL1A 3PGTA 5J9BA 3VWVA 3EVIA 3CRUA 4IVFA 1EOHA 4WXTA 1YEPA 1OKDA 5AISA 4ZBBA 5ID2B 2C3TA 4FYCA 2FY6A 4K0GA 1EZKA 5IPGA 4HS1A 1NHOA 2PGTA 3E9JB 4I5QA 1ERUA 2TRXA 4IQAA 3TKQA 1T00A 1SL1B 3QR6A 2HXKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4XS4B

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sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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