4XUBA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with baz2-icr chemical probe
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Structure Enabled Design of BAZ2-ICR, A Chemical Probe Targeting the Bromodomains of BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 40
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4xubA00
5L96A 5DKCA 4NYVA 4A9FA 3G0JA 4UIXA 4YH4A 4HXSA 5EICA 4LC2A 5CUAA 4O7AA 1N72A 4PCEA 5D25A 5DW2A 3S91A 2DVSA 4QY4A 5CUGA 3MUKA 4HBXA 4NR8A 2E7NA 5E3DA 3P1EA 5FG5A 5I7XA 2DVRA 2OO1A 4QC3A 5FE3A 4NQNA 5DLZA 3O34A 4PKLA 4A9NA 2RO1A 3Q2EA 5CQ4A 4CUTA 4IR3A 2H60A 4MEOA 4QEUA 4RVRA 4Y03A 4CUUA 4ZQLA 5FE7A 5DFDA 3U5OA 4QSWA 4HXMA 5CUBA 4DONA 4YABA 4QC1A 4IR5A 4HBYA 3U5KA 5EWWA 3RCWA 4CUSA 5D3NA 4Q0OA 5L99A 4A9HA 4LYIA 3LQHA 4E96A 4HXRA 4O75A 5FE9A 5ENEA 5EWVA 4IOQA 3LQJA 4YYDA 4TTEA 4QUUA 4NRCA 2R0VA 4Z6IA 4QR4A 5CY9A 5F60A 2YEKA 3HMFA 2E3KA 5C7NA 5D3HA 5C4QA 5EGUA 5HRWA 4IORA 5JI8A 2D9EA 3P1DA 4O7FA 3TLPA 3QZSA 5EP7A 4O72A 4UITA 4PY6A 5II2A 4PTBA 5CU8A 5E74A 5HFRA 2OSSA 1E6IA 5L98A 3MQMA 5D3JA 2FSAA 5F1LA 5HQ6A 5HRXA 4NYXA 2N9GA 3QZVA 4LZRA 3UV5A 5D0CA 5H1VA 5BT3A 4MR4A 4TZ8A 2RFJA 4Q0NA 4WHUA 3UVDA 4YYKA 4IOOA 4QEWA 5LVQA 5A5NA 5F62A 5A5PA 3MXFA 4QSQA 5KHMA 5DLXA 5I86A 4TT6A 5EI4A 4A9LA 5F25A 5H1UA 4A9JA 5H85A 5CFWA 4UYFB 4QSVA 2R10A 3HMHA 4HBVA 5DBMA 4ALHA 4YK0A 3JVJA 5DKDA 5FG4A 4TT4A 5E9IA 5ENIA 5FFWA 1JM4B 4UIUA 4YC9A 3P5OA 3O36A 5LJ1A 4NUCA 4IR6A 4BHWA 4J0SA 5LJ2A 4NR5A 4LYWA 4QYDA 4NS5A 5COIA 4YYGA 5FE5A 3U5PA 3S92A 4OGJA 4UIVA 5CGPA 5I7YA 5IGNA 4YYHA 4UIWA 5EPRA 4PS5A 5DY7A 4YY4A 5CQ8A 4YBSA 4NQMA 5FB0A 4IR4A 4A9EA 5JWMA 3UVXA 4YYNA 4XY9A 4LZ2A 4TS8A 4O70A 5BT4A 4A9IA 2WP2A 4HXNA 5CZGA 4WIVA 3Q2FA 5KTXA 4YAXA 3LJWA 5E9KA 4QR3A 3UVYA 5CUCA 5A83A 5D3SA 2YW5A 3D7CA 5DW1A 4BW4A 2RNXA 2L5EA 3U5MA 4CUPA 5D7XA 2YYNA 5IIDA 4TZ2A 5DFCA 4QSRA 4HXOA 5HJCA 4YYIA 3IU5A 3O37A 4AKNA 2NXBA 1WUMA 4N3WA 5G4RA 5HCLA 5HQ7A 5CQTA 5D24A 2DKWA 5G4SA 4NR9A 4NR4A 4X2IA 5ENBA 5ENGA 4BW3A 4O77A 5C89A 3IU6A 2OUOA 5IGKA 5I89A 3UV4A 4BW1A 4QZSA 4YYMA 5EVAA 5ENCA 4FLPA 2YELA 5LJ0A 5HELA 5EU1A 4O76A 5A5OA 5C87A 5FH7A 5AD3A 4MR6A 4O74A 1WUGA 4QB3A 3UVWA 4A9KA 5BT5A 2RNYA 5CQAA 4O7EA 5FFYA 5FH6A 4N4GA 4LRGA 4O7CA 5DYXA 4UYFA 3LXJA 4XYAA 5EM3A 5CP5A 5FE6A 4UYGA 4QNSA 5DYCA 4O78A 4YATA 2GRCA 2YQDA 4Z93A 5D3PA 4UIZA 4ZC9A 4NXJA 3MB3A 5KTWA 2RNWA 5J0DA 4F3IA 4KV1A 2RS9B 4YADA 5EWDA 5EWHA 3QZTA 4UYEA 4QBMA 4YBTA 3UV2A 5L97A 2F6NA 5EQ1A 4J0RA 5ACYA 5A82A 5FE0A 5F5ZA 5HEMA 5F1HA 5CUEA 4TU4A 5IGLA 3HMEA 5DYAA 5FFVA 5A5RA 5KO4A 4CUQA 5F2PA 5LKUA 5EPBA 5A5QA 4J3IA 4BW2A 4N4FA 5A81A 5EA1A 2R0YA 4QR5A 2L85A 4QSTA 5FE8A 3U5NA 4XUBA 5F3AA 5L8UA 5DYUA 4Z6HA 4NR7A 3ZYUA 5ENJA 1EQFA 3DAIA 5HRVA 2E7OA 4GPJA 5AD2A 5CS8A 2I7KA 1X0JA 2DWWA 2L84A 5LUUA 5FE1A 4CFLA 4LZSA 2DVVA 5L8TA 2LSPB 5CTLA 5C8GA 5E9VA 5ENFA 4NUEA 5E0RA 4WHWA 5FDZA 5F63A 5I88A 5ETBA 4YY6A 5A7CA 4A9OA 3O35A 4HXLA 5LKZA 1ZS5A 3NXBA 4CURA 2F6JA 4MR3A 3MB4A 5E9YA 5C85A 4QYLA 3GG3A 4XUAA 5FBXA 4QSXA 2RI7A 4MENA 4J1PA 5I29A 4TYLA 4ZW1A 5D26A 5CQ5A 4NYWA 4QUTA 3LQIA 5F61A 1F68A 4UIYA 5AMFA 4OUFA 5AMEA 3MULA 5FH8A 4YYJA 4CL9A 5LKXA 5E3GA 4YH3A 5CPEA 4A9MA 4Z1SA 5EK9A 5A5SA 5D3RA 4XY8A 3JVLA 4KCXA 5FG6A 4QSSA 5EWCA 5F36A 4BJXA 5CQ3A 3ONIA 5DX4A 4Z1QA 4OGIA 4NRAA 3AADA 4QEVA 4N4IA 5TB6A 3DWYA 5H1TA 5EISA 4UYHA 5IGMA 4PCIA 5E73A 4HBWA 5HLSA 5DKHA 3G0LA 4O7BA 4NUDA 5LVRA 3AQAA 5KU3A 4LR6A 5D3TA 2G4AA 5E7DA 5HQ5A 3U5LA 4KV4A 5I1QA 4C67A 5LKTA 4MR5A 4NR6A 5K29A 5CQ7A 5FB1A 3O33A 3UW9A 3K2JA 3P1CA 5KTUA 3SVFA 4NRBA 4N4HA 4LDFA 4TQNA 3P1FA 2DVQA 5II1A 4QSUA 4MEQA 2R0SA 4LYSA 4TU6A 4MEPA 3FKMX 4CLBA 4TT2A 3I3JA 5E9MA 5D3LA 5DFBA 5TCMA 5HM0A 3SVHA 4YBMA 2MJVB 4QSPA 5HENA 4C66A 4O71A 5EV9A 5HFQA 4UYDA 5FE4A 5IG6A 1JSPB 2KTBB 5CRZA 5CUDA 5I40A 3SVGA 5CRMA 3JVMA 5IBNA 5I80A 3JVKA 5I83A 5EPSA 2YEMA 5CQ6A 3U5JA 5FE2A 4ALGA 2DATA 5A85A 4HXPA 2YDWA 5ETDA 2WP1A 2D82A 4HXKA 5E9LA 5ENHA 2I8NA 4CFKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5L96A 5DKCA 4NYVA 4A9FA 3G0JA 4UIXA 4YH4A 4HXSA 5EICA 4LC2A 5CUAA 4O7AA 1N72A 4PCEA 5D25A 5DW2A 3S91A 2DVSA 4QY4A 5CUGA 3MUKA 4HBXA 4NR8A 2E7NA 5E3DA 3P1EA 5FG5A 5I7XA 2DVRA 3D1BA 2OO1A 4QC3A 5FE3A 4NQNA 5DLZA 3O34A 4PKLA 4A9NA 2RO1A 3Q2EA 5CQ4A 4CUTA 4IR3A 2H60A 4MEOA 4QEUA 4RVRA 4Y03A 4CUUA 4ZQLA 5FE7A 5DFDA 3U5OA 4QSWA 4HXMA 5CUBA 4DONA 4YABA 4QC1A 4IR5A 4HBYA 3U5KA 5EWWA 3RCWA 4CUSA 5D3NA 4Q0OA 5L99A 4A9HA 4AI6A 4LYIA 3LQHA 4AKHA 4E96A 4HXRA 4O75A 5FE9A 5ENEA 5EWVA 4IOQA 3LQJA 4YYDA 1ZKRA 4TTEA 4QUUA 4NRCA 2R0VA 4Z6IA 4QR4A 5CY9A 5F60A 2YEKA 3HMFA 2E3KA 5C7NA 5D3HA 5C4QA 5EGUA 5HRWA 4IORA 5JI8A 2D9EA 3P1DA 4O7FA 3VKGA 3TLPA 3QZSA 5EP7A 4O72A 4UITA 4PY6A 5II2A 4PTBA 5CU8A 5E74A 5HFRA 2OSSA 1E6IA 5L98A 3MQMA 5D3JA 2FSAA 5F1LA 5HQ6A 5HRXA 1PUOA 4NYXA 2N9GA 3QZVA 4LZRA 3UV5A 5D0CA 5H1VA 5BT3A 4MR4A 4TZ8A 2RFJA 2EJNA 4Q0NA 4WHUA 3UVDA 4YYKA 4IOOA 4QEWA 5LVQA 4AKGA 5A5NA 5F62A 5A5PA 3MXFA 4QSQA 5KHMA 5DLXA 5I86A 4TT6A 5EI4A 4A9LA 5F25A 5H1UA 4A9JA 5H85A 5CFWA 4UYFB 4QSVA 2R10A 3HMHA 4HBVA 5DBMA 4ALHA 4YK0A 3JVJA 5DKDA 5FG4A 4TT4A 5E9IA 5ENIA 5FFWA 1JM4B 4UIUA 4YC9A 3P5OA 3O36A 5LJ1A 4NUCA 4IR6A 4BHWA 4J0SA 5LJ2A 4NR5A 4LYWA 4QYDA 4NS5A 5COIA 4YYGA 5FE5A 3U5PA 3S92A 4OGJA 4UIVA 5CGPA 5I7YA 5IGNA 4YYHA 4UIWA 5EPRA 4PS5A 5DY7A 4YY4A 5CQ8A 4YBSA 4NQMA 5FB0A 4IR4A 4A9EA 5JWMA 3UVXA 4YYNA 4XY9A 4LZ2A 4TS8A 4O70A 5BT4A 4A9IA 2WP2A 4HXNA 5CZGA 4WIVA 3Q2FA 5KTXA 4YAXA 3LJWA 5E9KA 4QR3A 3UVYA 5CUCA 5A83A 5D3SA 2YW5A 3D7CA 5DW1A 4BW4A 2RNXA 2L5EA 3U5MA 4CUPA 5D7XA 2YYNA 5IIDA 4TZ2A 5DFCA 4QSRA 4HXOA 5HJCA 4YYIA 3IU5A 3O37A 4AKNA 2NXBA 1WUMA 4N3WA 5G4RA 5HCLA 5HQ7A 5CQTA 5D24A 2DKWA 5G4SA 4NR9A 4NR4A 4X2IA 5ENBA 5ENGA 4BW3A 4O77A 5C89A 3IU6A 2OUOA 5IGKA 5I89A 3UV4A 4BW1A 4QZSA 4YYMA 5EVAA 5ENCA 4FLPA 2YELA 5LJ0A 5HELA 5EU1A 4O76A 5A5OA 5C87A 5FH7A 5AD3A 4MR6A 4O74A 1WUGA 4QB3A 3UVWA 4A9KA 5BT5A 2RNYA 5CQAA 4O7EA 3D1DA 5FFYA 5FH6A 4N4GA 4LRGA 4O7CA 5DYXA 4UYFA 3LXJA 4XYAA 5EM3A 5CP5A 5FE6A 4UYGA 4QNSA 5DYCA 4O78A 4YATA 2GRCA 2YQDA 4Z93A 5D3PA 4UIZA 4ZC9A 4NXJA 3MB3A 5KTWA 2RNWA 5J0DA 4F3IA 4KV1A 2RS9B 4YADA 5EWDA 5EWHA 3QZTA 4UYEA 4QBMA 4YBTA 3UV2A 5L97A 2F6NA 5EQ1A 4J0RA 5ACYA 5A82A 5FE0A 5F5ZA 5HEMA 5F1HA 5CUEA 4TU4A 5IGLA 3HMEA 5DYAA 5FFVA 5A5RA 5KO4A 4CUQA 5F2PA 5LKUA 5EPBA 5A5QA 4J3IA 4BW2A 4N4FA 5A81A 5EA1A 2R0YA 4QR5A 2L85A 4QSTA 5FE8A 3U5NA 4XUBA 5F3AA 5L8UA 5DYUA 4Z6HA 4NR7A 3ZYUA 5ENJA 1EQFA 3DAIA 5HRVA 2E7OA 4GPJA 5AD2A 5CS8A 2I7KA 1X0JA 2DWWA 2L84A 5LUUA 5FE1A 4CFLA 4LZSA 2DVVA 5L8TA 2LSPB 5CTLA 5C8GA 5E9VA 5ENFA 4NUEA 5E0RA 4WHWA 5FDZA 5F63A 5I88A 5ETBA 4YY6A 5A7CA 4A9OA 3O35A 4HXLA 5LKZA 1ZS5A 3NXBA 4CURA 2F6JA 4MR3A 3MB4A 5E9YA 5C85A 4QYLA 3GG3A 4XUAA 5FBXA 4QSXA 2RI7A 4MENA 4J1PA 5I29A 3ERRA 4TYLA 4ZW1A 5D26A 5CQ5A 4NYWA 4QUTA 3LQIA 5F61A 1F68A 4UIYA 5AMFA 4OUFA 5AMEA 3MULA 5FH8A 4YYJA 4CL9A 5LKXA 5E3GA 4YH3A 5CPEA 4A9MA 4Z1SA 5EK9A 5A5SA 5D3RA 4XY8A 3JVLA 4KCXA 5FG6A 4QSSA 5EWCA 5F36A 4BJXA 5CQ3A 3ONIA 5DX4A 4Z1QA 4OGIA 4NRAA 3AADA 4QEVA 4N4IA 3VKHA 5TB6A 3DWYA 5H1TA 5EISA 4UYHA 5IGMA 4PCIA 5E73A 4HBWA 5HLSA 5DKHA 3G0LA 4O7BA 4NUDA 5LVRA 3AQAA 5KU3A 4LR6A 5D3TA 2G4AA 5E7DA 5HQ5A 3U5LA 4KV4A 5I1QA 4C67A 5LKTA 4MR5A 4NR6A 5K29A 5CQ7A 5FB1A 3O33A 3UW9A 3K2JA 3P1CA 5KTUA 3SVFA 4NRBA 4N4HA 4LDFA 4TQNA 3P1FA 2DVQA 5II1A 4QSUA 4MEQA 2R0SA 4LYSA 4TU6A 4MEPA 3FKMX 4CLBA 4TT2A 3I3JA 5E9MA 5D3LA 5DFBA 5TCMA 5HM0A 3SVHA 4YBMA 2MJVB 4QSPA 5HENA 4C66A 4O71A 5EV9A 5HFQA 4UYDA 5FE4A 5IG6A 1JSPB 2KTBB 5CRZA 5CUDA 5I40A 3SVGA 5CRMA 3JVMA 5IBNA 5I80A 3JVKA 5I83A 5EPSA 2YEMA 5CQ6A 3U5JA 5FE2A 4ALGA 2DATA 5A85A 4HXPA 2YDWA 4AKIA 5ETDA 2WP1A 2D82A 4HXKA 5E9LA 5ENHA 2I8NA 4CFKA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 5L96 A;  5DKC A;  4NYV A;  4A9F A;  3G0J A;  4UIX A;  4YH4 A;  4HXS A;  5EIC A;  4LC2 A;  5CUA A;  4O7A A;  1N72 A;  4PCE A;  5D25 A;  5DW2 A;  3S91 A;  2DVS A;  4QY4 A;  5CUG A;  3MUK A;  4HBX A;  4NR8 A;  2E7N A;  5E3D A;  3P1E A;  5FG5 A;  5I7X A;  2DVR A;  2OO1 A;  4QC3 A;  5FE3 A;  4NQN A;  5DLZ A;  3O34 A;  4PKL A;  4A9N A;  2RO1 A;  3Q2E A;  5CQ4 A;  4CUT A;  4IR3 A;  2H60 A;  4MEO A;  4QEU A;  4RVR A;  4Y03 A;  4CUU A;  4ZQL A;  5FE7 A;  5DFD A;  3U5O A;  4QSW A;  4HXM A;  5CUB A;  4DON A;  4YAB A;  4QC1 A;  4IR5 A;  4HBY A;  3U5K A;  5EWW A;  3RCW A;  4CUS A;  5D3N A;  4Q0O A;  5L99 A;  4A9H A;  4LYI A;  3LQH A;  4E96 A;  4HXR A;  4O75 A;  5FE9 A;  5ENE A;  5EWV A;  4IOQ A;  3LQJ A;  4YYD A;  4TTE A;  4QUU A;  4NRC A;  2R0V A;  4Z6I A;  4QR4 A;  5CY9 A;  5F60 A;  2YEK A;  3HMF A;  2E3K A;  5C7N A;  5D3H A;  5C4Q A;  5EGU A;  5HRW A;  4IOR A;  5JI8 A;  2D9E A;  3P1D A;  4O7F A;  3TLP A;  3QZS A;  5EP7 A;  4O72 A;  4UIT A;  4PY6 A;  5II2 A;  4PTB A;  5CU8 A;  5E74 A;  5HFR A;  2OSS A; 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