4XUBA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with baz2-icr chemical probe
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure Enabled Design of BAZ2-ICR, A Chemical Probe Targeting the Bromodomains of BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 40
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4xubA00
4YH4A 4O7AA 5CGPA 4QNSA 5A7CA 2LSPB 5H85A 5F25A 5EWHA 5H1UA 4IR6A 3O35A 4A9EA 4NUCA 5CU8A 5KO4A 4UYHA 4MEQA 4IR4A 4YC9A 5EPRA 5IIDA 5JWMA 3S92A 5BT3A 3LQJA 4YBSA 5FE7A 4QC1A 5FB0A 4TZ8A 2D9EA 4NS5A 2I8NA 4O7EA 5I1QA 4NR5A 4A9KA 3U5PA 5CQTA 5LKXA 4Y03A 4ZQLA 5TCMA 4YK0A 4CUTA 4HXNA 3AQAA 4GPJA 5CRMA 3NXBA 2YDWA 3UVWA 5C7NA 4CURA 5F2PA 4WHWA 4LDFA 3Q2FA 5DY7A 3QZSA 4YAXA 4YATA 5I29A 1ZS5A 3UV4A 5CS8A 2L85A 4UYFB 5I89A 5A81A 5IGLA 3JVMA 5C89A 1X0JA 4BJXA 3O33A 4A9HA 4PCIA 4DONA 3P5OA 5CQ4A 4YBTA 5CQ3A 4LZSA 2RNXA 5L97A 5I40A 2RO1A 4Q0NA 5EWCA 4C66A 5DKDA 5EWVA 4UIYA 5F5ZA 4O7CA 4J0RA 4O74A 4LYSA 4O76A 5FH7A 2YQDA 5L98A 5ENEA 4QYDA 2KTBB 2FSAA 5EM3A 3IU6A 4TU6A 3D7CA 3S91A 3ZYUA 5DLXA 5F60A 3O36A 5HCLA 5FE5A 5IG6A 2L5EA 5EGUA 5FH6A 2DVSA 2F6JA 5D3NA 5I88A 4YYGA 5D3HA 4QZSA 4NUDA 3MB4A 4LZRA 3LQIA 3MQMA 5FG5A 4YY4A 4YYJA 3UVDA 3RCWA 4J0SA 4TU4A 5KTUA 4TYLA 2OUOA 3UV2A 4NQMA 5I7YA 5I80A 5A5QA 4XY9A 1F68A 3U5NA 2OSSA 5HENA 3MUKA 5CP5A 5DFBA 5II2A 4O7BA 2E7NA 3HMHA 4UIWA 5HQ6A 5FB1A 5G4RA 5F62A 3UV5A 5FE2A 5D26A 5FDZA 4ALGA 5BT5A 2E7OA 4QEUA 4A9JA 5EV9A 5A5OA 4IORA 4QR3A 4QSWA 3UVYA 5D3LA 4N4HA 5DKCA 5CUGA 3SVGA 5AMEA 5D3SA 4CL9A 4A9NA 4CUSA 4HBWA 5HELA 5LVQA 4MR4A 4O78A 5FFWA 4HBYA 3G0LA 4O77A 3JVLA 4YABA 4UITA 4QSRA 4QUUA 5FE4A 4BHWA 5CUCA 2YYNA 4PS5A 2I7KA 4QSQA 5CQAA 4WHUA 5A5RA 5DW2A 5LJ2A 4QUTA 5DKHA 4PKLA 5C87A 4PTBA 4YYMA 4UYDA 3MULA 4NR9A 4IR5A 3TLPA 4OUFA 4QSPA 2F6NA 5TB6A 5A5PA 4QR4A 5J0DA 4QR5A 5E3GA 4LRGA 4J1PA 4O72A 5DBMA 4CUQA 4KV1A 4Z6IA 4HBVA 5JI8A 4X2IA 5LUUA 5CQ5A 4E96A 5F61A 5I83A 3ONIA 3FKMX 5E7DA 4CFLA 5KU3A 5EISA 3AADA 5EK9A 4TZ2A 4LR6A 4NYXA 5HRVA 5D3TA 5ENJA 4UIVA 1E6IA 5D24A 4O71A 3O34A 5FE3A 3MB3A 4YBMA 4TT2A 5F1HA 5F1LA 5DW1A 5EICA 2D82A 3UW9A 5EPBA 5L8UA 4TS8A 4N4GA 4MR6A 5A5NA 5C4QA 3LXJA 2G4AA 4MR5A 2RI7A 2DWWA 4YYDA 4Z6HA 3U5OA 4MR3A 5CRZA 4A9MA 3DWYA 5COIA 4QSVA 5D25A 4YADA 3P1CA 2H60A 5L96A 4NYVA 4QYLA 4UYGA 4Z1SA 3QZVA 4OGJA 2RS9B 5HFQA 2DATA 5LVRA 3G0JA 2E3KA 5EP7A 3P1FA 5AD3A 4N4IA 4NRCA 2YW5A 5E73A 2OO1A 4J3IA 5IGKA 2R0SA 5II1A 5E9VA 4PCEA 4PY6A 5A83A 4A9FA 4LZ2A 5ENCA 5L99A 4NR7A 4HXOA 5EWWA 1EQFA 5AD2A 2DVQA 4YH3A 4WIVA 3LJWA 2R10A 5A5SA 5CQ7A 5ACYA 3Q2EA 4F3IA 5F63A 5C8GA 4LYIA 4UIZA 4HXMA 4NUEA 3U5LA 5AMFA 5H1VA 4O70A 2YEMA 5F3AA 2L84A 4BW1A 5BT4A 5HLSA 5I7XA 4ZC9A 4NR4A 4A9OA 5FFVA 4HXKA 5FBXA 4QY4A 5ENBA 1WUMA 3I3JA 5KHMA 2R0VA 5L8TA 5LJ1A 5LKZA 5G4SA 5CUAA 5IGMA 5DYUA 5D3PA 5ENIA 5HEMA 5DFCA 4BW3A 1N72A 2MJVB 5E9LA 5FE0A 1WUGA 5FE6A 5CY9A 2R0YA 3GG3A 4TT6A 4UIXA 3U5JA 5CUEA 2RNYA 3UVXA 4KCXA 5ENGA 5EWDA 5EQ1A 4UIUA 4IOQA 4NQNA 5A82A 4FLPA 5FG6A 4ALHA 5D3JA 5CUBA 5EA1A 4IOOA 5E0RA 4CFKA 2RFJA 3SVHA 5E3DA 3U5MA 1JSPB 5E74A 4NRBA 4YYNA 4HXRA 5DFDA 5CQ8A 5F36A 2DVRA 3DAIA 2YEKA 4XY8A 5CQ6A 5FE9A 4BW4A 4IR3A 4Q0OA 4XUAA 5HQ7A 4LC2A 4MENA 5ETBA 4XYAA 5E9IA 3P1EA 2GRCA 4HXLA 3MXFA 5D7XA 4N4FA 2RNWA 4Z93A 4XUBA 4QSTA 4O7FA 4YYKA 4UYFA 5HRXA 5LJ0A 3JVKA 4OGIA 4QC3A 5HJCA 5EPSA 4QEWA 4QSUA 5E9MA 3K2JA 3SVFA 5A85A 5KTXA 4TTEA 2YELA 4QEVA 4BW2A 5LKTA 5FH8A 3HMFA 4NR8A 2NXBA 4YYHA 5D3RA 5FG4A 4Z1QA 4QSSA 5CZGA 5ENFA 5D0CA 2WP1A 5HRWA 5DLZA 5H1TA 3O37A 5CPEA 2N9GA 5FE8A 5EU1A 4NYWA 5KTWA 1JM4B 5DYXA 3LQHA 4HXPA 4QBMA 3QZTA 4HBXA 3IU5A 4UYEA 5ETDA 4YY6A 4LYWA 4TT4A 2DKWA 5FFYA 5CUDA 5ENHA 5E9KA 4QSXA 5DYCA 5HFRA 4A9IA 5CFWA 5C85A 5E9YA 5I86A 4O75A 5EVAA 4RVRA 4N3WA 4CLBA 4MEOA 4QB3A 4TQNA 4CUPA 5LKUA 4MEPA 5IBNA 4ZW1A 5DX4A 2DVVA 5K29A 3P1DA 3HMEA 5DYAA 3U5KA 5FE1A 4HXSA 5CTLA 4A9LA 4KV4A 4YYIA 3JVJA 5HQ5A 4NR6A 4AKNA 4CUUA 5EI4A 5IGNA 4C67A 2WP2A 5HM0A 4NXJA 4NRAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YH4A 4O7AA 5CGPA 4QNSA 5A7CA 2LSPB 5H85A 5F25A 5EWHA 5H1UA 4IR6A 3O35A 4A9EA 4NUCA 5CU8A 5KO4A 4UYHA 4MEQA 4IR4A 4YC9A 5EPRA 5IIDA 5JWMA 3S92A 5BT3A 3LQJA 4YBSA 5FE7A 4QC1A 5FB0A 4TZ8A 2D9EA 4NS5A 2I8NA 4O7EA 5I1QA 4NR5A 4A9KA 3U5PA 5CQTA 5LKXA 4Y03A 4ZQLA 5TCMA 4YK0A 4CUTA 4HXNA 3AQAA 4GPJA 5CRMA 3NXBA 2YDWA 3UVWA 5C7NA 4CURA 5F2PA 4WHWA 4LDFA 3Q2FA 5DY7A 3QZSA 4YAXA 4YATA 5I29A 1ZS5A 3UV4A 5CS8A 2L85A 4UYFB 5I89A 5A81A 5IGLA 1PUOA 3JVMA 5C89A 1X0JA 4BJXA 3O33A 4A9HA 4PCIA 4DONA 3P5OA 5CQ4A 4YBTA 5CQ3A 4LZSA 2RNXA 5L97A 5I40A 2EJNA 2RO1A 4Q0NA 5EWCA 4C66A 5DKDA 5EWVA 4UIYA 5F5ZA 4O7CA 4J0RA 4O74A 4LYSA 3VKHA 4O76A 5FH7A 2YQDA 5L98A 5ENEA 4QYDA 2KTBB 2FSAA 5EM3A 3IU6A 4TU6A 3D7CA 3S91A 3ZYUA 5DLXA 5F60A 3O36A 5HCLA 5FE5A 5IG6A 2L5EA 5EGUA 5FH6A 2DVSA 2F6JA 5D3NA 5I88A 4YYGA 5D3HA 3D1DA 4QZSA 4NUDA 3MB4A 4LZRA 3LQIA 3MQMA 5FG5A 4YY4A 4YYJA 3UVDA 3RCWA 4J0SA 4TU4A 5KTUA 4TYLA 2OUOA 3UV2A 4NQMA 5I7YA 5I80A 5A5QA 4XY9A 1F68A 3U5NA 2OSSA 5HENA 3MUKA 5CP5A 5DFBA 5II2A 4O7BA 2E7NA 3HMHA 4UIWA 5HQ6A 5FB1A 5G4RA 5F62A 3UV5A 5FE2A 5D26A 5FDZA 4ALGA 5BT5A 2E7OA 4QEUA 4A9JA 5EV9A 5A5OA 4IORA 4QR3A 4QSWA 3UVYA 5D3LA 4N4HA 5DKCA 5CUGA 3SVGA 5AMEA 5D3SA 4CL9A 4A9NA 4CUSA 4HBWA 5HELA 5LVQA 4MR4A 4O78A 5FFWA 4HBYA 3G0LA 4O77A 3JVLA 4YABA 4UITA 4QSRA 4QUUA 5FE4A 4BHWA 5CUCA 2YYNA 4PS5A 2I7KA 4QSQA 5CQAA 4WHUA 5A5RA 5DW2A 5LJ2A 4QUTA 5DKHA 4PKLA 5C87A 4PTBA 4YYMA 4UYDA 3MULA 4NR9A 4IR5A 3TLPA 4OUFA 4QSPA 2F6NA 5TB6A 5A5PA 4QR4A 5J0DA 4QR5A 5E3GA 4LRGA 4J1PA 4O72A 5DBMA 4CUQA 4KV1A 4Z6IA 4HBVA 5JI8A 4X2IA 5LUUA 3ERRA 5CQ5A 4E96A 5F61A 5I83A 3ONIA 3FKMX 4AKIA 5E7DA 4CFLA 5KU3A 5EISA 3AADA 5EK9A 4TZ2A 4LR6A 4NYXA 5HRVA 5D3TA 5ENJA 4UIVA 1E6IA 4O71A 5D24A 3O34A 5FE3A 3MB3A 4YBMA 4TT2A 5F1HA 5F1LA 5DW1A 5EICA 2D82A 3UW9A 5EPBA 5L8UA 4TS8A 4N4GA 4AI6A 4MR6A 5A5NA 5C4QA 3LXJA 2G4AA 4MR5A 2RI7A 2DWWA 4YYDA 4Z6HA 3U5OA 4MR3A 5CRZA 4A9MA 3DWYA 5COIA 4QSVA 5D25A 4YADA 4AKHA 3P1CA 2H60A 5L96A 4NYVA 4QYLA 4UYGA 4Z1SA 3QZVA 4OGJA 2RS9B 5HFQA 2DATA 5LVRA 3G0JA 2E3KA 5EP7A 3P1FA 5AD3A 4N4IA 4NRCA 2YW5A 5E73A 2OO1A 4J3IA 5IGKA 2R0SA 5II1A 5E9VA 4PCEA 4PY6A 5A83A 4A9FA 4LZ2A 5ENCA 5L99A 4NR7A 4HXOA 5EWWA 1EQFA 5AD2A 2DVQA 4YH3A 4WIVA 3LJWA 2R10A 5A5SA 5CQ7A 5ACYA 3Q2EA 4F3IA 5F63A 5C8GA 4LYIA 4UIZA 4HXMA 4NUEA 3U5LA 5AMFA 5H1VA 4O70A 2YEMA 5F3AA 2L84A 4BW1A 5BT4A 5HLSA 5I7XA 4ZC9A 4NR4A 4A9OA 5FFVA 4HXKA 5FBXA 4QY4A 5ENBA 1WUMA 3I3JA 3VKGA 5KHMA 2R0VA 5L8TA 5LJ1A 5LKZA 5G4SA 5CUAA 5IGMA 5DYUA 5D3PA 5ENIA 5HEMA 5DFCA 4BW3A 1N72A 2MJVB 5E9LA 5FE0A 4AKGA 1WUGA 5FE6A 5CY9A 2R0YA 3GG3A 4TT6A 4UIXA 3U5JA 5CUEA 2RNYA 3UVXA 4KCXA 5ENGA 5EWDA 5EQ1A 4UIUA 4IOQA 4NQNA 5A82A 4FLPA 5FG6A 4ALHA 5D3JA 5CUBA 5EA1A 4IOOA 5E0RA 4CFKA 2RFJA 3SVHA 5E3DA 3U5MA 1JSPB 5E74A 4NRBA 4YYNA 4HXRA 5DFDA 5CQ8A 5F36A 2DVRA 3DAIA 2YEKA 4XY8A 5CQ6A 5FE9A 4BW4A 4IR3A 4Q0OA 4XUAA 5HQ7A 4LC2A 4MENA 5ETBA 4XYAA 5E9IA 3P1EA 2GRCA 4HXLA 3MXFA 5D7XA 4N4FA 2RNWA 4Z93A 4XUBA 4QSTA 3D1BA 4O7FA 4YYKA 4UYFA 5HRXA 5LJ0A 3JVKA 4OGIA 4QC3A 5HJCA 5EPSA 4QEWA 4QSUA 5E9MA 3K2JA 3SVFA 5A85A 5KTXA 4TTEA 2YELA 4QEVA 4BW2A 5LKTA 5FH8A 3HMFA 4NR8A 2NXBA 4YYHA 5D3RA 5FG4A 4Z1QA 4QSSA 5CZGA 5ENFA 5D0CA 2WP1A 5HRWA 5DLZA 5H1TA 3O37A 5CPEA 2N9GA 5FE8A 5EU1A 4NYWA 5KTWA 1JM4B 5DYXA 3LQHA 4HXPA 4QBMA 3QZTA 4HBXA 3IU5A 4UYEA 5ETDA 4YY6A 4LYWA 4TT4A 2DKWA 5FFYA 5CUDA 5ENHA 5E9KA 4QSXA 5DYCA 5HFRA 4A9IA 5CFWA 5C85A 5E9YA 5I86A 4O75A 5EVAA 4RVRA 4N3WA 4CLBA 1ZKRA 4MEOA 4QB3A 4TQNA 4CUPA 5LKUA 4MEPA 5IBNA 4ZW1A 5DX4A 2DVVA 5K29A 3P1DA 3HMEA 5DYAA 3U5KA 5FE1A 4HXSA 5CTLA 4A9LA 4KV4A 4YYIA 3JVJA 5HQ5A 4NR6A 4AKNA 4CUUA 5EI4A 5IGNA 4C67A 2WP2A 5HM0A 4NXJA 4NRAA
chains in the Genus database with same CATH topology
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