4XX4A

Renin in complex with (4s)-4-isopropyl-4-methyl-6-oxo-1-(3-(2-oxo-4-phenylpyrrolidin-1-yl)benzyl)tetrahydropyrimidin-2(1h)-iminium
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
339
structure length
339
Chain Sequence
TLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Renin
publication title Iminopyrimidinones: a novel pharmacophore for the development of orally active renin inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 91
structure length 339
sequence length 339
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 2015-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4xx4A02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4xx4A01
2VJ6A 3PBZA 1HTEA 1M0BA 5P3ZA 9HVPA 3SLZA 1C6ZA 4MC6A 2QZLA 6UPJA 5P8CA 4ZPGA 3BGBA 4RCEA 4K8SA 4KE0A 5P5OA 1HVHA 4OBFA 1ODWA 4EP3A 3I6OA 5P7VA 5C9DA 2AOJA 5P2NA 1MPPA 3VF7A 4IVTA 5P5UA 3NDWA 3PI5A 3QPJA 5P1RA 2F81A 1IIQA 5P0LA 4Y43A 1FMXA 3T7QA 5KOQA 5P4DA 1NPVA 5OZEA 5P6FA 1D4YA 1HIHA 3GGXA 3VSXA 2AOHA 2BPZA 1BDQA 4JECA 5P4NA 2AZCA 5P7JA 4Z2ZA 3DK1A 4OD9B 1IVPA 3ZPTA 3O9BA 2WEBA 3JVYA 4YD3A 2XYEA 4FRSA 5P4HA 5BWYA 3U6AA 2VJ7A 2VJ9A 3GW5A 3Q5HA 2JE4A 2HS1A 5DR1A 5AHCA 5P1UA 2ZJIA 3K5FA 2ZHTA 2G1SA 3FIVA 4Y38A 1SP5A 5P53A 3O9DA 3OAGB 4YD5A 4Y58A 3O9IA 4OBGA 4ZE6A 3L3AA 1E80E 2NNPA 5P4RA 1DMPA 5P0KA 5P89A 1W51A 1BWAA 2B7FA 4Y5GA 4TRYA 4GJ7A 3S7LA 5P5PA 4Y5CA 1T6EX 4PEPA 5OZDA 1SDVA 1TSUA 3URLA 1ZSRA 3KN0A 4QLHA 3S85A 1MT9A 5P2EA 4FCOA 4EQ0A 5P86A 5P18A 1E81E 2CEMA 1MERA 5P1QA 1EC3A 4JP9A 4FRIA 3FSMA 4LXMA 3TTPA 1T7KA 5P0ZA 3I8WA 3NWXA 3PGIA 3PCWA 3K5CA 3MSJA 5P8SA 1KZKA 2WHHA 1LYAB 5P0FA 3CICA 5P08A 5P77A 5OZSA 2A4FA 5IVTA 1EBKC 4AZYA 5DQ1A 2Q63A 2FNSA 5P06A 1ODYA 4L1AB 5P7CA 1QBSA 4J1HA 2OHMA 5P8IA 3SA7A 3M9FA 1PSOE 4DJWA 4J55A 1XE5A 1HVCA 2PH6A 5P6PA 2QD6A 3I7EA 5P1EA 2G27A 3WZ7A 4AA8A 1FB7A 3KDBA 3EL0A 5P6HA 1BIMA 5P04A 4ER4E 5P1ZA 3DUYA 1J71A 3QIHA 5P3CA 4DPIA 3VLBA 5P0CA 3OU1B 1W5YA 2WEZA 4X7IA 4I12A 3BUHA 5P1VA 1MT7A 5P71A 5KQYA 4Y3ZA 5OZ2A 3G72A 5P59A 4CPWA 5P1LA 1PSNA 5IVQA 3LZYA 5P42A 4HZTA 3PLDA 5JFPA 3ZOVA 5F01A 4YCKA 4Y37A 2PYMA 4LAPA 2AOGA 1MRWA 2QMPA 5ISKA 1WKRA 5P6KA 3HLOA 5P02A 4B0QA 4Y3PA 3D1ZA 1HSHA 2FIVA 5P7ZA 5P3UA 2NXDA 1T3RA 5P30A 2PC0A 3TKWA 5P07A 5P1WA 5P3MA 2AOFA 4D83A 5P1YA 5P56A 2O40A 4M8XA 3EKYA 4AA9A 2QZWA 3D1XA 2F3EA 4HEGA 1KJ4A 2H6TA 4DJOA 3PVKA 5P5TA 4LL3A 4OC6B 3VSWA 5P39A 3OQFA 2G22A 4Y4EA 3CKRA 5P7XA 4GJDA 3UDKA 3MWSA 2QU2A 4Y4TA 4HLAA 3MXDA 3EL1A 2FDEA 4MC1A 5P1SA 4L7HA 2Q54A 5I3YA 3SFCA 2PQZA 3T6IA 3WB4A 2HB2A 1QDMA 4Y35A 1G0VA 5OZCA 4R92A 5P7KA 1PPLE 5P17A 2XFIA 2XYFA 3D1YA 3OU4B 3APRE 5P5BA 1LYWA 2WEAA 5KAOA 2CEJA 5P3XA 1D4JA 1WBKA 3QRSA 3KMYA 1SIPA 2G1YA 5P5DA 4HVPA 3VF3A 3QN8A 4TVHA 4U8WA 3FNUA 2IEOA 5P76A 3NXNA 5AHAA 1KJ7A 3L5FA 5OZAA 2G1NA 3BGCA 1GKTA 1SIVA 1MSNA 5OYRA 3TOFA 3UQPA 5P5SA 5P3RA 5SY3A 2IS0A 5P8PA 3UDJA 3INDA 4FL8A 5P68A 4ZSQA 4A6CA 3OHHA 3N3IA 5P8NA 2F3KA 1FLHA 1F34A 2V16C 4FIVA 1UH9A 1D4IA 3UDRA 4DFGA 3PCZA 3FKTA 5DQ5A 5OZWA 1FG6C 1G6LA 5KR2A 5P6TA 4B1DA 5P1TA 1UH8A 3ZKSA 4PZXA 5P7WA 5P75A 4Y44A 1OHRA 4YD6A 3SKGA 3VV7A 5P3PA 1FFIC 5P2AA 3IAWA 5P8GA 1IZEA 4N00A 1CZIE 2OHSA 4Y5LA 5P2VA 4Y3AA 2HC0A 2VKMA 2WL0A 1SH9A 1B6KA 1B6LA 3CYWA 4GIDA 5P7RA 3EL4A 2QU3A 4QJAA 5P4ZA 5P57A 1A94A 4Y4AA 3OUDB 5P2SA 2V0ZC 5P1GA 3IN4A 4QJ6A 4J0YA 3RTHA 4S1GA 1C6YA 4J1FA 5OZVA 2JXRA 5P2UA 4FM6A 3TPPA 3EMYA 3MXEA 2QHZA 5OZLA 4Y3GA 1RV7A 4NJTA 2HPFA 5P5YA 5P3SA 3CKPA 2R8NA 3UFLA 3FNTA 1NPWA 4COEA 5P6ZA 3U7SA 3U71A 3OHFA 5P2XA 3L59A 5ISJA 5OZPA 4ZSPA 4E43A 3SM1A 3BXSA 3QAAA 3BVBA 4MC2A 5P24A 2FGVA 1AXAA 1SDTA 5OZUA 1LF3A 3PLLA 3ZKNA 1EBYA 5P29A 5P6AA 4ER1E 5ENKA 5P85A 2HB3A 1LF2A 5IS4A 3ZPSA 3JW2A 4YDGA 5HE7A 5P6EA 1AZ5A 2H6SA 5P7LA 1C6XA 2AVMA 1HPVA 3G70A 5P1MA 3D91A 3LPJA 4XX3A 3ZKXA 3PEPA 4WY6A 4XX4A 1EPQE 3B80A 4TRWA 5P0EA 4ACUA 5UPJA 4FM7A 1FG8C 5HCTA 5P1AA 4Y48A 5P51A 3SA8A 3K1WA 1HXBA 1N49A 2HIZA 4NJSA 1YTGA 3EKVA 1B6JA 5P12A 4ACXA 5P23A 2ZJHA 5P5IA 1SGUA 5P3YA 3OGPA 3BHEA 1PPKE 5P20A 3ZPUA 4I8WA 5P4CA 5P7AA 5P7BA 3VFAA 4GMIA 4DQBA 1HTGA 2P4JA 2PSVA 5P4SA 5P0XA 3PSYA 4Y3QA 5P2FA 5P22A 4Y36A 4I8ZA 3T11A 1HVLA 4QJ8A 5P3DA 5P6MA 2NMYA 4FAEA 1FGCC 5P7HA 4QGIA 2P3DA 2I4UA 3S43A 3S8IA 2IDWA 1FFFC 5P8EA 1HTFA 4Y54A 2P3CA 3OXXA 3IVHA 5HVPA 2BPWA 4GJCA 5OZ1A 1FQ7A 3OADA 5P3VA 5P6RA 2OF0A 1AVFA 3VYEA 5T4SA 2QK5A 5P67A 1HPOA 3OQDA 3UFNA 1FEJC 3OU3A 2BQVA 4RRNA 3PB5A 5P3OA 4APRE 4Z50A 2HAHA 4Y53A 3PBDA 1W5VA 1HVRA 5P5GA 4Y3WA 2Z54A 4Y51A 2WEDA 3LIZA 1FIVA 5AH9A 5P3QA 3WZ6A 4UPJA 3VUCA 5P58A 2QAKA 7UPJA 2FXEA 5P2LA 1B6PA 5P5MA 2RKGA 2G21A 1PPME 5HDUA 2QZKA 3KYRA 2OAHA 3ZMGA 2R43A 3SACA 5DPZA 1LZQA 4Y3TA 5P3EA 2ZGAA 5PEPA 1ZJ7A 2I4WA 4RRSA 2F3FA 5BRYA 4TRZA 2ER7E 4FAFA 3HW1A 3SQFA 4ZSMA 5P7IA 1B5FA 1AM5A 4ZSRA 5DGUA 5P7OA 3PSGA 1EPME 5OZ6A 5P11A 1U8GA 3PMYA 5I3VA 2IGYA 2NXMA 2PK5A 1W50A 3R1GB 3H0BA 3APPA 4HDPA 2QNQA 5P2OA 5P7TA 5P60A 2JJIA 2HS2A 4B78A 1OD1A 2I1AA 3KFNA 5P41A 3I25A 1MEUA 2UPJA 5P2TA 2G1OA 4CPRA 2BPXA 3PJ6A 1QBRA 4J1CA 3URIA 1LS5A 2Z4OA 5P7PA 1A8GA 1YTJA 2ZE1A 4PHVA 2BKSA 1AAQA 4EHCA 1BBSA 3CMSA 4Y4WA 4JPEA 3NDXA 3K5GA 4J5JA 1LYBA 5ER1E 4U7VA 5P2IA 4Z4XA 1YTHA 4Y5NA 4ZLSA 1META 2J9KA 1W6IA 1ME6A 2ZJJA 2P8HA 4R5NA 5OYUA 2FS4A 1K6CA 5P6DA 5P6CA 3A2OA 1DW6C 3HD8A 2P83A 3KF0A 4I0ZA 5COPA 5P0MA 2NPHA 1BDRA 5P6LA 4HE9A 5P4AA 2OHKA 5P13A 2VA7A 5P64A 1GVVA 3SABA 3EM6A 5P3JA 1AJVA 2I4QA 5P70A 4DJXA 2V10C 4H3JA 4RYCA 3LPKA 4CPSA 2AZ8A 3UQWA 1E5OE 5P69A 2RKFA 2ZJKA 2QD8A 4J0PA 2AOCA 3NXEA 5P3TA 3VYDA 5P1CA 4Y4ZA 1HPXA 1FQ4A 5P8FA 3PRSA 4Y56A 2VNNA 4Y3YA 5JFUA 4NJUA 1Z1RA 3BC4A 3VG1A 5OZIA 4BEKA 4CMSA 4Y41A 5P6WA 4B1CA 1D4LA 2IKOA 2BPVA 1EPOE 3UQRA 4NPUA 5P3IA 1HSGA 4YDFA 4FRJA 1EPLE 5F00A 1XN3A 3HAWA 4I0FA 1MRXA 2ZYEA 1SGZA 2O4PA 5DR7A 5P5WA 5COOA 2Q5KA 1NPAA 4RVJA 4KB9A 4LBTA 3MSKA 2WF3A 4LXAA 4BFBA 4K4QA 5P1NA 4DVFA 3TNEA 3KFRA 1YM4A 5OZ5A 3IGBA 5P48A 4L7JA 4QJ9A 2G26A 5OZGA 5P7EA 1MVPA 1OEXA 3RSXA 2NR6A 2QI4A 5P09A 3UCBA 5P2RA 2OHLA 3NUOA 5P4VA 3H5BA 4I10A 1FF0C 2QMGA 1EPNE 1TSQA 1SMEA 2P3BA 3SA3A 4F76A 3QBFA 3OXVA 3LIQA 4Q1NA 2RENA 5P5LA 4CPQA 2CENA 1LEEA 2ZJNA 4FLGA 3PWMA 2UY0A 3QP0A 1EC2A 2P3AA 2AOIA 4DJVA 5P87A 4EJDA 3OQKA 3EKTA 2AZ9A 4D89A 5P25A 1LYWB 1FMUA 2O4SA 4WY1A 2IGXA 2NTRA 1ZBGA 1TCXA 4EWOA 4EXGA 5P72A 4Y4DA 1ZPKA 1TCWA 3DJKA 5P66A 5HDXA 3L38A 5P6UA 2FXDA 3KMXA 3GI0A 2Q11A 1GVWA 3ER3E 3NDTA 4B77A 3JVWA 2V00A 3OGQA 5IVSA 4EPJA 3OXWA 4LC7A 1EPRE 1EPPE 3GI5A 3SO9A 4YD7A 5P0RA 1A30A 2FDPA 4H3IA 1M4HA 5P8OA 3EKQA 5HU1A 3HVPA 1FQ5A 5APRE 4YOAA 4Y3MA 3SPKA 1GNMA 5P31A 3R0YA 2VIJA 3FV3A 3NSHA 2JJJA 5P83A 4DQHA 1XE6A 5KR0A 1MSMA 3NLSA 4AUCA 2Q55A 3OOZA 1QBUA 5P3HA 5IE1A 3HDKA 3KA2A 5P6JA 1CMSA 2VA5A 3ZLQA 1AJXA 3O9HA 4R93A 2V13A 5P7NA 5OYQA 3LZUA 2XFJA 5OZOA 1HEFE 5HDZA 5P6YA 3INEA 4JPCA 5P3LA 4BFDA 4I1CA 5EZZA 1XDHA 3GGUA 5HD0A 3INFA 5OZJA 4I0IA 4DH6A 3BVAA 5IVRA 1BV7A 3KDDA 2VS2A 5OZTA 3EL5A 5P4KA 5P44A 4NJVA 4F73A 5P4FA 4OBZA 5P8AA 2AOEA 4FRKA 3UF3A 1KJHA 2F80A 6APRE 5P16A 5P62A 5P5EA 2J9JA 1RPIA 3O9FA 4Y4JA 5OZQA 1K6VA 5OYYA 1W6HA 4I0DA 3RTNA 4YA8A 1APWE 2R5PA 5P2CA 5P5CA 2ANLA 2ZHUA 4FE6A 5P19A 1QRPE 1MUIA 2QCIA 4Y4GA 3VFBA 2NXLA 1ZAPA 3QROA 4Q1WA 5HE5A 3UTLA 3KDCA 3KFSA 5P7UA 5OYTA 4Y5PA 5DGWA 3L5DA 5P55A 1C70A 4MC9A 3K4VA 1OEWA 3AIDA 1K1UA 5P7MA 5ER2E 1KJFA 2OHQA 5P2WA 1IZIA 4LXKA 3Q70A 4XXSA 5I70A 4WTUA 4ER2E 2AODA 2PYNA 3DCRA 5OZ8A 2VA6A 4GJ9A 3DCKA 3F9QA 5P37A 4Y3FA 5I3WA 4Y3LA 4KUPA 4JOOA 3SM2A 4OBKA 3S2OA 2WKZA 3TOHA 2I4XA 4I0GA 5P4MA 2I0AA 3GI4A 3TL9A 4BELA 5OZFA 3SA9A 2VIZA 3S54A 5KOSA 3EKXA 2OHUA 3SKFA 3LZSA 4OBJA 2Q64A 4Y3DA 5P84A 3DV1A 5P2KA 5OZ4A 3OTYA 4GJ5A 2I4DA 1IDBA 4Y4XA 1HVJA 1BDLA 4DJYA 2IRZA 2XFKA 3NU5A 5P05A 5P4OA 3S43B 1HTRB 5P81A 3LZVA 5P5NA 5P5QA 2Q3KA 4J1KA 2I4VA 2WF4A 2V12C 1XS7D 3UDYA 3UDQA 2AVSA 3EKWA 4Y3HA 5HE4A 3UQUA 3OADB 4J1EA 3RU1A 5P4BA 1G2KA 1W5XA 2A1EA 1HOSA 3VYFA 5P0GA 3TPRA 1HSIA 1K2BA 5P0WA 5P4WA 1VIJA 4J0TA 1Z8CA 2BJUA 3ECGA 5OYWA 4Y5BA 4PYVA 4Y50A 5OZRA 4DJRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2VJ6 A;  3PBZ A;  1HTE A;  1M0B A;  5P3Z A;  9HVP A;  3SLZ A;  1C6Z A;  4MC6 A;  2QZL A;  6UPJ A;  5P8C A;  4ZPG A;  3BGB A;  4RCE A;  4K8S A;  4KE0 A;  5P5O A;  1HVH A;  4OBF A;  1ODW A;  4EP3 A;  3I6O A;  5P7V A;  5C9D A;  2AOJ A;  5P2N A;  1MPP A;  3VF7 A;  4IVT A;  5P5U A;  3NDW A;  3PI5 A;  3QPJ A;  5P1R A;  2F81 A;  1IIQ A;  5P0L A;  4Y43 A;  1FMX A;  3T7Q A;  5KOQ A;  5P4D A;  1NPV A;  5OZE A;  5P6F A;  1D4Y A;  1HIH A;  3GGX A;  3VSX A;  2AOH A;  2BPZ A;  1BDQ A;  4JEC A;  5P4N A;  2AZC A;  5P7J A;  4Z2Z A;  3DK1 A;  4OD9 B;  1IVP A;  3ZPT A;  3O9B A;  2WEB A;  3JVY A;  4YD3 A;  2XYE A;  4FRS A;  5P4H A;  5BWY A;  3U6A A;  2VJ7 A;  2VJ9 A;  3GW5 A;  3Q5H A;  2JE4 A;  2HS1 A;  5DR1 A;  5AHC A;  5P1U A;  2ZJI A;  3K5F A;  2ZHT A;  2G1S A;  3FIV A;  4Y38 A;  1SP5 A;  5P53 A;  3O9D A;  3OAG B;  4YD5 A;  4Y58 A;  3O9I A;  4OBG A;  4ZE6 A;  3L3A A;  1E80 E;  2NNP A;  5P4R A;  1DMP A;  5P0K A;  5P89 A;  1W51 A;  1BWA A;  2B7F A;  4Y5G A;  4TRY A;  4GJ7 A;  3S7L A;  5P5P A;  4Y5C A;  1T6E X;  4PEP A;  5OZD A;  1SDV A;  1TSU A;  3URL A;  1ZSR A;  3KN0 A;  4QLH A;  3S85 A;  1MT9 A;  5P2E A;  4FCO A;  4EQ0 A;  5P86 A;  5P18 A;  1E81 E;  2CEM A;  1MER A;  5P1Q A;  1EC3 A;  4JP9 A;  4FRI A;  3FSM A;  4LXM A;  3TTP A;  1T7K A;  5P0Z A;  3I8W A;  3NWX A;  3PGI A;  3PCW A;  3K5C A;  3MSJ A;  5P8S A;  1KZK A;  2WHH A;  1LYA B;  5P0F A;  3CIC A;  5P08 A;  5P77 A;  5OZS A;  2A4F A;  5IVT A;  1EBK C;  4AZY A;  5DQ1 A;  2Q63 A;  2FNS A;  5P06 A;  1ODY A;  4L1A B;  5P7C A;  1QBS A;  4J1H A;  2OHM A;  5P8I A;  3SA7 A;  3M9F A;  1PSO E;  4DJW A;  4J55 A;  1XE5 A;  1HVC A;  2PH6 A;  5P6P A;  2QD6 A;  3I7E A;  5P1E A;  2G27 A;  3WZ7 A;  4AA8 A;  1FB7 A;  3KDB A;  3EL0 A;  5P6H A;  1BIM A;  5P04 A;  4ER4 E;  5P1Z A;  3DUY A;  1J71 A;  3QIH A;  5P3C A;  4DPI A;  3VLB A;  5P0C A;  3OU1 B;  1W5Y A;  2WEZ A;  4X7I A;  4I12 A;  3BUH A;  5P1V A;  1MT7 A;  5P71 A;  5KQY A;  4Y3Z A;  5OZ2 A;  3G72 A;  5P59 A;  4CPW A;  5P1L A;  1PSN A;  5IVQ A;  3LZY A;  5P42 A;  4HZT A;  3PLD A;  5JFP A;  3ZOV A;  5F01 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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