4Y0WA

Yeaz from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
MSTLLALDTSTEACSVALLHEGRALSHYEVIPRLHAQRLLPMVRDLLDEAGVALSAVDAIAFGRGPGAFTGVRIAIGVVQGLAFALQRPVLAVSDLAILAQRAYREQGAERVAAAIDARMDEVYWGCYQLQQGEMRLAGSEAVLPPERVAVPWDAAAADWFGAGTGWGYVERMPQRPVALDASLLPHAEDLLSLAGFAWARGEGVEAEQALPVYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of YeaZ from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords YeaZ
source organism Pseudomonas aeruginosa pao579
molecule tags Biosynthetic protein
total genus 62
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00814 Peptidase_M22 Glycoprotease family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4y0wA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4y0wA02
3KZBA 2P9NB 4BRQA 1BO5O 5FPEA 1NGBA 2PAVA 4DB3A 3ATUA 1RFQA 4K42A 1T6CA 1RGIA 3A5OC 3GBTA 4FOIA 3VENA 3EN9A 4J8FA 2VCPA 4H0TB 1KAXA 4CZEA 3EL2A 1ATNA 3P4IA 2HF4A 3MK6A 1EQYA 3FZFA 4BRFA 1Z05A 5JLFA 3VERA 2F9TA 3QB0A 1GLEG 4WQ5A 3WEEA 4PL8A 4CJ7A 3DXMB 4K43A 4IWVA 4XEIA 3ENOA 4RWTA 2V7ZA 4AM7A 3O80A 1Z6RA 3RSEB 4RCHA 4BR5A 2NLXA 1ZBSA 3UKUA 1GLJO 3D2FB 1QZ6A 4NO7A 1C0GA 4IJAA 2Q1NA 2QWNA 3FE1A 3EKUA 4H0VB 5EOYA 2Q0RA 4FWMA 2HOEA 4BRNA 4BC5A 1E4FT 3GG4A 2E2PA 3LDOA 5F1XA 1KXPA 1MDUB 2QWLA 3UB5A 1NGHA 1YXQA 4E1JA 3CJ9A 3WUHA 3ID8A 3A0IX 3SMSA 1XC3A 1IJJA 3UKRB 3VF2A 5BRHA 3WXKA 4PKIA 2E1ZA 4QS8A 3SJHA 3VF4A 4BGBA 1BWFO 1NGJA 4NB4A 4CZIA 1HKCA 2V51B 3GE1A 1TUUA 2IVOA 3I33A 4WQ4C 1QQOA 4H0OA 5AQLA 3VEZA 5ADXH 3CJAA 5EY4A 4BR2A 4QS9A 2ZGYA 2ASMA 3FR0A 1BDGA 1T6DA 1NGGA 4M7YA 4CZMA 5AQSA 3MCPA 3CQXA 3GL1A 3U9DA 4M63C 4CZLA 2P9PA 3ZX2A 4BRLA 2P9LB 2GEMA 3CQYA 1GLDG 4B1YB 2UYTA 4EAHD 4RTFD 1H1VA 1K8KA 1RDWX 1WOQA 3HBTA 5BPLA 2Q31A 4CD1A 1BOTO 1X3MA 4BRHA 2FF6A 1HPMA 2FSKA 3H1QA 3OHRA 5AQNA 2ZWHA 3C7NB 2P9NA 3AAQA 4JN4A 1NMDA 3F9MA 3LDLA 2A3ZA 3A5NC 3ENHA 3LDQA 4B1WB 4WYBA 3WQTA 5ADXA 4I6MB 2CGKA 3S41A 3I8BA 3IFRA 5AQVA 2AA4A 4YDUC 4EHUA 5BRFA 5KPTA 1GLLO 2QM1A 4EHTA 4BR9A 1SAZA 3H6EA 2P9UB 3HM8A 5E84A 3QFPA 3D7EO 5AQIA 2VYPA 5JMVA 4BVPA 3DXMA 1NBWA 3H3NO 3RSEA 3QMLA 5AQUA 3AARA 3U4LA 4MLHA 1NGFA 1BA0A 4B9QA 3D2FA 4FWKA 4HTLA 1NWKA 5BRDA 2D0PA 3QFUA 5AQYA 1NGEA 3QDKA 4H5TA 4ISFA 1OKJA 4PL7A 1BG3A 5F0XA 1TYQA 3BF3A 1SZ2A 1T44A 4ISGA 4MO5A 1G99A 4BRGA 1GLFO 5BN8A 3FFKB 3VF6A 3C0BA 3GOIA 5JLHA 2E2NA 3BEXA 4FWQA 4IO8A 5AQFA 1DEJA 4CBXA 3EKSA 4H5RA 3UKRA 4GY2B 2V7YA 3AAPA 4XH4A 3D2EB 3R8EA 1NGAA 4B1XB 4DHYA 2I7NA 4BRMA 1BA1A 4BQZA 5FPMA 4FSVA 2E1YA 1YUWA 3LL3A 3VGLA 3M6GA 5AQQA 3FZMA 2A41A 1HKBA 2BUPA 1TYQB 2YJEA 5AQHA 3HTVA 1NM1A 3O6WA 4L3QA 3O8MA 4FWNA 3VESA 4CZFA 3HSCA 1NLVA 5AQPA 4A2BA 4CBUA 2GELA 1R59O 4BQLA 4XH5A 1YVNA 4CBWA 4WQ4A 2QWMA 2FLOA 3H1VX 3DWLA 4IZ9A 4Y0WA 3SK3A 1CZAN 3SLCA 2IVNA 2FSJA 4BROA 2WUSA 1QQMA 4XH1A 4BR7A 2P9SA 1HX1A 2YJFA 5AQXA 5KPRA 2P9LA 5ELZA 4BRAA 3CJCA 2GWKA 2W41A 5EX5A 1ZXOA 1NGIA 1S3XA 3O1BA 2NRHA 2VWBA 1J6ZA 1ATSA 1BUPA 1LOTB 3LDNA 3A5MC 2NZTA 2QWPA 4BRIA 2V52B 3BP8A 1BU6O 3KHYA 3C7NA 1GLAG 4DQ8A 4IXCA 4BG8A 2P9SB 2P9KA 4FWSA 2KHOA 4PKHA 3VGKA 4ISEA 2YHYA 4H5WA 5JICA 4FWRA 4JD2A 4I6MA 4FPBA 2BTFA 5KQDA 3MDQA 2A5XA 4C23A 3ULEB 4GNIA 1JCFA 3DJCA 4QS7A 3FZKA 3QBWA 4A2AA 5EVZA 1ATRA 4BR4A 2P9UA 2PBDA 4BVOA 4BGAA 2P9IA 1HUXA 3U9ZA 5KPZA 3TU5A 3MN5A 3EO3A 3R6MA 4YDUA 3A8YA 3CJBA 4EFHA 4M7XA 5AZIB 2P9KB 2GTDA 3ZETA 5EXWA 2YCHA 1QHAA 2ITMA 1V4TA 2Q2RA 3H46O 4JD2B 2ZGZA 2HF3A 4JAXA 4JHDB 4CZKA 1GLCG 2AP1A 5AQGA 1X9JA 2FF3B 3FGUA 5AQWA 3VETA 1IG8A 2Q36A 4H5NA 4BG9A 1NGCA 4JNEA 2P9IB 4FWLA 1WUAA 2F9WA 2QXLA 3WXIA 2E2OA 2OANA 3L0QA 5BPNA 3D2EA 3FZHA 5AQMA 4BC4A 2D4WA 4FO0A 4B1VA 2QWRA 3ATVA 3ZETB 3L4IA 5FPNA 3ZX3A 3BUZB 4H0YB 5FPDA 5AR0A 1JCEA 3IDHA 4CD3A 5BREA 2IVPA 1KAYA 4A62A 1QZ5A 3IUCA 2IIRA 2YHXA 3VOVA 2J4RA 2CH6A 3H3OB 2ASPA 2QWOA 5BPMA 3CHWA 5BR9A 3VGMA 1Y64A 3KVGA 1U2VB 4CI6A 4H0XB 1TUYA 2FXUA 4K25A 2GWJA 3W0LA 3O4WA 4H0PA 1HKGA 1MA9B 3GDQA 4MLEA 3CIPA 3DAWA 3O1WA 2D0OA 3ZX0A 3BF1A 3EZWA 5AZJA 5CE3A 3MMVA 2CGJA 5KQ8A 4CZHA 3M3ZA 3B8AX 4BRCA 3HZ6A 4HWIA 3MN7A 3CERA 3M1FA 3JS6A 3SMPA 3JXUA 2A6AA 4PKGA 3H45C 1MWMA 2YI1A 3CJ7A 3A5LC 1XUPO 3QBXA 5AQOA 2EWSA 5AFUH 5B8HA 1DGKN 3L6QA 3WXJA 4H03B 4WQ5C 5BN9A 5F2RA 1Q18A 4MO4A 3VPZA 1QQNA 3ULEA 1HJOA 2Q0UA 3LDPA 3TPQA 5AZJB 4BRDA 4LC9B 4BC3A 3WT0A 1MWKA 5LJWA 3J8AA 4FL9A 3WEEB 4IJNA 3HI0A 4O8KA 3ZEUA 4KBOA 1NGDA 2E8AA 2A40A 3IMXA 2CH5A 4Z94A 1S22A 1XQSC 2GUPA 5I9EB 3UKUB 1KAZA 3FZLA 5AZIA 3VEXA 2W40A 3O5BA 4B1UB 2QWQA 3LM2A 3VEOA 3LM9A 5AQTA 1YAGA 3DXKA 4JHDA 1D4XA 4BR0A 1U6ZA 5LY3A 3VEYA 3CJ1A 5AQRA 5AQKA 3R9PA 1JCGA 3CI5A 3ZEUB 5AFUA 4K41A 5E26A 3VEVA 3WXLA 4BRPA 1C0FA 2FSNA 4BREA 4B1ZA 1DKGD 5LJVA 4FOEA 2E88A 4CZGA 2DPNA 3FLCO 4FWPA 3W3DA 1LCUA 1ESVA 1GLBG 2HMPA 2Q97A 5TKYA 4FPAA 3DXKB 3MN9A 2E20A 2YHWA 2E2QA 5AQZA 1HLUA 4CZJA 2ASOA 4EIAA 1X3NA 1V4SA 2ZF5O 3U8XA 2QW9A 4F9OA 1E4GT 3UE5A 3AY9A 4DCHA 3QICA 3VEWA 3WQUA 1P8ZA 2P9PB 4BRKA 2CGLA 3O08A 1ZC6A 4FWOA 2D1KA 1U2VA 4AM6A 2H3GX 3CETA 1SQKA 4BC2A 4O5FA 2I7PA 1K8KB 2A42A 4A61A 3G25A 5AQJA 4H5VA 3MN6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NJZA 5KGXA 3KZBA 4GV6A 2P9NB 1KTQA 1VAZA 4QAGA 2OTJN 1NGBA 5DMRA 4DB3A 3U6FA 4K42A 1IV0A 1ZBUA 1X9WA 3GBTA 3EN9A 1SV5A 2WOMA 4CZEA 4Q5VA 5CYMA 2G8HA 2HHVA 3EL2A 4OGCA 4JI5K 3AO1A 5FRMA 3FZFA 3M8RA 3I56N 1ASUA 1EXQA 1N36K 1GOCA 4DSKA 1SL2A 3WEEA 1GOBA 2IOCA 5MLCQ 4CJ3A 3AVMA 3RSEB 3T1YK 3ULDA 2FBVA 1QZ6A 4E3SA 1Q9YA 4FWMA 2ETJA 4CFBA 3J7AP 3LDOA 1Z26A 2HHSA 2QWLA 3CMAN 1RT7A 3CJ9A 4AHUA 1QSSA 4OX9K 3KK7A 4W5RA 1IJJA 5AJ3K 1NKEA 4PKIA 4N41A 4IEIA 4QS8A 3O3HA 3O9QA 3C6HA 4BGBA 2G8IA 4FW2A 1JL2A 4NB4A 1HKCA 1KVCA 3VQEA 4Z4GA 4N56A 2W6KA 3GE1A 5I42A 4JI6K 1RTDA 4FCYA 1VK0A 1ILYA 1HMVA 4F2SA 5GAHP 3U3GA 2O4IA 4CJPA 4DS5A 4V19S 4GKJK 3U9DA 3AV9A 2P9PA 2HHWA 1IKXA 3QETA 3CQYA 1VSIA 1GLDG 3R1XA 3ISNC 2F8SA 2HVIA 4CFDA 1JKHA 2UYTA 4JKFA 4I2PA 4M45A 1K8KA 2UXCK 3HBTA 2Q31A 1BOTO 4KKOA 4W5QA 1HPMA 2FSKA 5E41A 4F2RA 4JI0K 3PX0A 3I0SA 1NMDA 3LP1A 4KI6A 3A5NC 3ZT0A 2HHUA 3SZ2A 2ZM6K 4B9NA 4EP4A 1VQ6N 2AA4A 4YDUC 5BRFA 1HPZA 4OKKA 5KPTA 4EHTA 4BR9A 3LPUA 3VA0A 2QEXN 4UQGA 3HM8A 3THYB 3NMUA 3NFAA 1ASVA 5GADP 4OJRA 1NJIO 3DXMA 2DFFA 1XNRK 3H3NO 3RWUA 5AQUA 4QCLA 2BANA 3V1OA 3KLIA 4HTLA 1TVRA 3QDKA 4DTPA 1QVGM 2HB5A 1TYQA 4LH4A 3VA3A 3RMCA 5BN8A 4CJ4A 1BIUA 3BY5A 2UU9K 3C0BA 3QNOA 4GW6A 3EE8A 2E2NA 3BEXA 5AQFA 3UKRA 3BZCA 4IFEA 3D2EB 3R8EA 4DHYA 1UWBA 2I7NA 4BRMA 4CHPA 3V9ZA 2E1YA 2XRIA 3S3NA 1UA0A 5CYQA 1BQMA 4DR4K 3LL3A 4FLTA 3M6GA 5AQQA 2W42A 2A41A 4KTZA 2YJEA 3TANA 1NM1A 3CCJN 1W9HA 3ALYA 1IO2A 3O8MA 4CEBA 4FWNA 2JWLA 4JS5A 1NLVA 4A2BA 1O13A 4BQLA 3OYGA 4DQRA 3CC2N 4OLBA 4WQ4A 2QWMA 3DWLA 3V4IA 2YNGA 1LWEA 3K57A 3T7ZA 1R0AA 4YORA 3HT3A 2GWKA 5EX5A 5DM6L 1N8RO 1S3XA 2JGUA 1WAFA 4AHCA 3SV4A 4BRIA 4E7LA 1J54A 4FJLA 2V52B 3BP8A 3KHYA 5FROA 3C7NA 3MEDA 2OPQA 2UUBK 4CGJA 2EX3A 3VQQA 2P9KA 3THWA 3AO3A 3IS9A 1B92A 4FM0A 2BTFA 1E3MA 4C23A 3S9HA 4DR7K 4QS7A 4C8OA 4LF5K 1WSJA 2QK9A 5EVZA 2HNZA 1EWQA 2P9UA 4PA1A 3OS0A 2YX6A 3TU5A 3EO3A 4CVNE 3A8YA 3ZSYA 4M7XA 1YJNN 3P83D 3DRRA 5EXWA 3C6UA 1V4TA 1KVAA 2ZGZA 2HF3A 5FDLA 1VQ8N 4M3WA 4JHDB 2ZJPL 4BDZA 1S6PA 1P90A 1X9JA 3FGUA 2IC3A 3G6EN 3ZSZA 3DRSA 4FWLA 3MXIA 1KRPA 4MQ3A 3ZSQA 2OANA 2Q3SA 1BL3A 3RVCA 4KTQA 4B1VA 3ATVA 4DV0K 1Z25A 4DR3K 3L4IA 1T8EA 5FPNA 2F7TA 3ZX3A 3J80O 4B9MA 2AJQA 5AR0A 1I94K 4CD3A 1D9DA 3WNHA 1VRUA 2J4RA 3H3OB 3ZT2A 4DQPA 1CZBA 4OPAA 3CC7N 1FKPA 2ZD1A 3L2WA 2BDPA 5BPMA 3SUOA 4WFAL 3VGMA 1Y64A 3KVGA 2RPIA 1HKGA 4CJEA 4DF8A 5J2MA 3VQ7A 4K8XA 3KWIA 3KIOA 1S72N 1RBSA 5CE3A 2B4JA 3DOKA 3ZT1A 4FM2A 4FJIA 1L5UA 1BGXT 3HZ6A 5C10A 3M1FA 5HRSA 3SMPA 2GV9A 4CCHA 1QHTA 2KQ2A 5M1FA 2A6AA 1DLOA 3H45C 2YI1A 2YV0X 3VQ4A 4AILC 5AFUH 5B8HA 3AVIA 3L6QA 5J1EA 2BGGA 3PO4A 2YHAA 1Q18A 2YHBA 3VPZA 3EY1A 3ULEA 3LDPA 2D0AA 1NK8A 4DKWA 3HSTB 1T03A 4PY5A 1MWKA 4H8KA 3HI0A 4O8KA 3ZEUA 5J2QA 1NGDA 3DMJA 2HVHA 1C0UA 2O8BB 3P5JA 2CH5A 3E01A 4RW6A 1BCMA 3UKUB 4OKJA 3VEXA 3PX4A 2QWQA 3SV3A 2E4LA 5IT9O 4Z4EA 3WNEA 3KD5E 5I3UA 3SYZA 3AVAA 4IKFA 1CXUA 4JI4K 3R9PA 1IKYA 2BH1A 4A59A 3CI5A 5LMUK 1BI4B 3CM5A 4FJGA 4B3TK 3QEPA 4CJQA 1DKGD 5LJVA 1JLGA 5GINA 3HP6A 4M3YA 2E88A 2DPNA 3CPWM 1ESVA 1GLBG 5TKYA 4FPAA 4LF4K 2VQEK 4NCGA 2E2QA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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