4Y4JA

Endothiapepsin in complex with fragment b97
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Structures of endothiapepsin-fragment complexes from crystallographic fragment screening using a novel, diverse and affordable 96-compound fragment library.
pubmed doi rcsb
total genus 78
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2015-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4y4jA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4y4jA01
3SA9A 1LYWB 3RTMA 5AH6A 3EM6A 3IAWA 3PM4A 1GNMA 1SIPA 2FMBA 3ZKGA 4CPXA 4Z4XA 1AJVA 3WZ6A 1QBUA 1FFFC 5P2LA 2P3DA 2QD8A 4FCOA 2PWRA 2NMYA 5CONA 3WSJA 5I3VA 4J0ZA 3Q6YA 5P0NA 4QJAA 3LPIA 1C70A 2CEMA 2OHTA 4Y3WA 4OBZB 4YE3A 4JPEA 5DR0A 4Y38A 1ZLFA 3GGXA 1EPPE 3BVAA 5E5JA 3GGUA 2HS1A 3ZPUA 4ZSMA 5I3WA 3KFSA 3PHVA 5P08A 2IKUA 2ZJJA 3O9EA 5P3BA 3NDUA 2Z54A 3PCWA 5P8EA 5P0CA 5P4DA 2IKOA 1YM2A 5P7VA 2FNSA 4Y58A 1ODXA 5P01A 4AMTA 4FRKA 4D8CA 3VSWA 5P0SA 5P26A 1B6PA 4Y3EA 4PEPA 5P3XA 5P00A 4PYVA 2AZ9A 1NPAA 3OUAA 4GJ9A 5DR3A 5I3YA 4Y37A 3OUCA 5P15A 3KDCA 3KF0A 4FE6A 2HB4A 5P17A 5P8MA 5P27A 2XYFA 4TVHA 4NPTA 1KJ7A 2RMPA 2P4JA 5P7DA 2VIYA 4FRSA 4HVPA 4Y39A 5P5OA 4GJ6A 3OGQA 5P2NA 4DJQA 2WL0A 2PQZA 1MT9A 5APRE 2APRA 5T4SA 2F3EA 1IZIA 3SM1A 4I0DA 2I0AA 5P81A 2P3AA 1PFZA 4OC6B 3L5CA 4ZLSA 5P2RA 2VS2A 4MC1A 1B6KA 2Q64A 3NU4A 4WY1A 4EJ8A 3KMYA 2ER0E 3LZYA 5KR0A 5P8SA 3S43A 3NLSA 4FAEA 3OHHA 5P4OA 1EPNE 7UPJA 3VYDA 3VYFA 4Y4BA 2G1OA 1K1TA 3INDA 1APVE 1EPRE 5P0UA 2R5QA 3EL5A 1HEFE 3ER3E 3OTYA 5P4WA 1D4YA 5P7SA 5P7NA 4Y4AA 2Q5KA 2I4WA 3BUFA 1MEUA 5P42A 2OHLA 3OY4A 5P2QA 5KQYA 4S1GA 3PCZA 3OAGA 3ER5E 4YD5A 5P3CA 1BXOA 2QK5A 4F75A 4ZEAA 2ZHSA 5P2XA 2AOHA 5P8UA 4Q1XA 3VYEA 3O9FA 5P7LA 3UQRA 5AGZA 4I0HA 5P5DA 1TQFA 2CENA 1Q9PA 4EXHA 3EKXA 1GNOA 5P13A 5KQFA 4Y57A 5C9BA 3UDRA 2AZ8A 4Y3ZA 3ZKMA 3RTNA 4B72A 5KQXA 5P0EA 3R0WA 1IDAA 4B0QA 4EQJA 2NPHA 2QCIA 2BPXA 3G70A 3EKWA 5HCTA 1T7IA 3KDDA 1BILA 1F7AA 3HVPA 5OZOA 4ACXA 5P60A 5P1UA 5P1XA 1BVEA 1AVFA 4Y3GA 2QMFA 5P4FA 3OUDB 1SDUA 5DQ1A 3TPRA 2O4LA 1SMRA 5P1BA 3NU9A 4Y50A 2R8NA 2P8HA 5P23A 2FGUA 1FB7A 4H3IA 3RU1A 2HPEA 3OGPA 5P5LA 5P4JA 5P7MA 3K5GA 3ZKQA 4Y5KA 3PJ6A 1XN3A 4ZIPA 4K4RA 4DPIA 2FS4A 5P05A 5P5CA 5P1YA 1WKRA 2PYNA 5P67A 2R5PA 4Y4TA 3K5FA 4A6CA 3O9IA 5P75A 2WHHA 2AOJA 4U7QA 3OU4B 3K4VA 2RSPA 4PZWA 5P78A 2HPFA 5P5KA 1HRNA 3VCMA 3QRSA 4N00A 4B1EA 1UPJA 3PGIA 3QBHA 5P32A 4LXKA 1EC1A 6APRE 1BBSA 3BGBA 2V11C 3O9GA 4I11A 3OWNA 1G35A 3UTLA 4XXSA 5P3KA 1HPOA 4CP7A 9HVPA 3O9LA 1GVVA 2ZJIA 4WTUA 1D4HA 3L3AA 3D20A 1DIFA 1QS8A 5P5RA 5P6WA 2ZHUA 5OYYA 5P3IA 1EPQE 3OQ7A 4J0PA 5AH7A 3UDQA 1FEJC 3HVGA 4BFDA 4YD7A 3EM3A 5HE4A 4TRWA 2QI5A 3BGCA 1IVPA 2VA7A 4L7GA 3VF5A 5P2HA 5P2DA 5P38A 1XE6A 3L38A 3NWXA 2G24A 1K6VA 3L5FA 2I4VA 3ZKIA 4OD9A 3OOZA 5P62A 1A8KA 2OHQA 2ZE1A 2BPYA 4J0TA 4PHVA 1LS5A 1BDQA 5P47A 5P8FA 4DQBA 3BXSA 4Y5LA 5P8IA 5DQ5A 3T11A 4J1IA 3S53A 3EXOA 5P6GA 2HB3A 1WBMA 3TPJA 4Z50A 3VF3A 3TH9A 4Y3AA 4NJSA 5P87A 1LYBA 2AVQA 5P4PA 4X7IA 1FLHA 1KJFA 3NDWA 3O9CA 1E5OE 1FQ7A 4J1EA 1T6GA 3U71A 3SA8A 3NXEA 1SH9A 5KQZA 5P4SA 2O4KA 2I0DA 1HTEA 4B05A 5P8GA 4R93A 1MUIA 2WEZA 2R9BA 4DJWA 3VLBA 3JVYA 4Y4DA 4Y51A 4Y35A 5P2FA 1META 4LXAA 3L5DA 5P1IA 4RZ1A 3BUHA 3EKYA 3UQXA 1HVKA 3LIVA 5P4BA 1U8GA 4D85A 1T3RA 1EC2A 1RNEA 3TKGA 3LPJA 3K4VC 5P0TA 5P7GA 5OYUA 3T3CA 1IDBA 5P57A 3UDNA 4DVFA 1RQ9A 5P2IA 4FS4A 1K6TA 5OZ7A 2IL2A 4J0YA 2ZJLA 5KAOA 5P7BA 3I6OA 5P2OA 5B18A 1IVQA 4YOAA 4I1CA 2ZJKA 1BDRA 4YCYA 3OHFA 5OZ3A 4Y3PA 3RTHA 3SACA 5P3GA 1MESA 3N3IA 5P3HA 2VJ6A 2OHRA 3GGVA 3OXXA 4PZXA 3SO9A 4E43A 3KFNA 5P6KA 5OZHA 5OZQA 1HVJA 4Y5CA 4Y3NA 2NXDA 4H3GA 4Y36A 1IZEA 4FAFA 1APWE 3VV7A 3VUCA 5P4MA 4NJTA 4J5JA 4A6BA 3KMXA 4LAPA 1EPLE 5DPZA 3LIXA 5P2KA 5AHBA 2AVMA 5P7TA 4CPQA 2QHCA 3IGBA 5P30A 3OXVA 5P35A 2UPJA 1HPSA 1IIQA 3GI6A 3HDKA 4I0ZA 3Q3TA 4OBFA 5DQ4A 4I12A 5P7IA 2VIJA 5SY3A 5P5ZA 3LITA 5OZ5A 2UXZA 5HDVA 5P0LA 3TPPA 3UCBA 4QLHA 1ZSFA 1APTE 1DP5A 5P83A 1HVLA 4J54A 1IZHA 4NKKA 5P89A 5P4QA 2P83A 5OZCA 3S2OA 3VG1A 5P49A 3KT2A 1MSMA 3HAWA 4FSEA 5P02A 2P3CA 4QJ6A 4DI2A 5F01A 5P6RA 2HC0A 5P3WA 2NNKA 3LZVA 1RL8A 5P7WA 3S54A 3PVKA 3INHA 3QVIA 1IBQA 3SQFA 2ZHVA 4Y3YA 2QP8A 5P8LA 3NU5A 5KOQA 4HEGA 4XX4A 1B5FA 4AA8A 3CYXA 2Q63A 1FG8C 2AVVA 3ZPSA 4GJ7A 4PPHA 4GIDA 1NPVA 2G20A 1HPXA 1TCWA 3O9DA 5OYXA 5OZRA 3OQFA 5P8KA 3TOFA 5P84A 5BS4A 5DR8A 1QBSA 1LYWA 4I0EA 2AVSA 3C9XA 1MERA 2PH8A 2J9JB 2WF1A 2B8LA 3TKWA 5P1NA 3HW1A 2QI4A 4RGHA 5OZUA 2QU3A 2QZWA 5P37A 5P0IA 3Q4BA 2I4UA 4K4PA 2ZJMA 5P5NA 4Y5EA 5P6UA 2HAHA 1HVHA 3CKTA 4D83A 5P28A 1SMEA 4DJOA 5P10A 3URJA 5UPJA 5COPA 3WZ7A 4CKUA 5KR2A 3WB5A 3DUYA 5P59A 2WF0A 3MSJA 4IVTA 5AHCA 4ZSRA 3T7PA 2FDEA 5OZ4A 3SA6A 4DJXA 4KB9A 5OZFA 1M43A 3CIBA 2V0ZC 5P0GA 5P0QA 4Z2ZA 5OZAA 4ACUA 2QMGA 1GNNA 4XKXA 5P6XA 5ENKA 1HVIA 5P0KA 3CMSA 5OZNA 3KDBA 5OZ0A 4Y4ZA 3PBZA 1UH7A 1ZP8A 3FSMA 3EMYA 2IENA 2AIDA 4A4QA 5P3ZA 3QS1A 4ZE6A 5P11A 3UHLA 3DV1A 4Q1WA 1TZSA 3LZSA 5DGWA 5P6IA 5P50A 2A1EA 1HXWA 2QHZA 4FRJA 3PBDA 3IN4A 3PLDA 1EPME 3INEA 1LYAA 3FNSA 1E80E 5P4RA 4EPJA 5P82A 5P4ZA 1GKTA 3GI0A 4Y3MA 1OD1A 5P5AA 2G1RA 5P2ZA 5P3FA 3PEPA 3UDMA 3MXDA 3NR6A 2R3TA 5P70A 5P06A 5OZ9A 1FMXA 4BFBA 3K1WA 2QI0A 2ZHRA 5P20A 4Y5PA 1IZDA 2ZYEA 4CPRA 4Y43A 5P2UA 4B1DA 2O4PA 2PSVA 4B78A 4FM6A 1FIVA 1W6IA 1B6LA 3SFCA 5P4LA 3S43B 4ZSQA 2JJJA 2IQGA 2OHSA 1A8GA 3NXNA 5HVPA 1KZKA 3IA9A 2ZJHA 2OHKA 3ZLQA 3Q5HA 3OOTA 2G22A 3WB4A 5P6HA 3NDXA 2WJOA 5OZ1A 1AIDA 3QIHA 2OHNA 4EJKA 2MIPA 5P46A 1MIQA 4YD4A 1B11A 5P2TA 1FKNA 5P4KA 3UF3A 4Y3TA 6UPJA 1OEXA 2F81A 5OZVA 1YTJA 5P88A 4HDBA 3S56A 3QI1A 3HAUA 3EM4A 3GI4A 3S7MA 5P2EA 2BB9A 4DQCA 1E82E 1K1UA 3CIDA 4RCDA 2BJUA 6FIVA 2JE4A 5JFPA 2QAKA 5P5BA 5IVSA 1YX9A 2BPZA 4NJUA 5P8OA 1BWAA 2ANLA 5P5TA 2G21A 1W5XA 1BV9A 3QPJA 3SKGA 1EEDP 4Y4XA 1D4JA 5P8BA 4H3JA 1W51A 5P86A 1GVTA 5P5IA 1AXAA 3T7XA 4GJ5A 5AHAA 5BRYA 1D4IA 2IGXA 5P1DA 1ZPKA 5P2AA 3UQUA 5OZWA 5P7AA 3DOXA 3QAAA 1BXQA 5P1TA 1W5VA 2QD6A 5P6DA 3KN0A 1TCXA 5DQCA 2PC0A 3UFLA 3HZCA 4YBFA 4HDFA 5P77A 4IVSA 3CKRA 3QRMA 5DQ2A 3PMUA 2WF3A 3OK9A 1LF2A 5SZ9A 5P6QA 4RCEA 4LP9A 4R8YA 5P7PA 5P14A 5HE5A 4K8SA 2XYEA 1YT9A 4DQEA 5P2CA 4J55A 1MT7A 5P0OA 5P5PA 4K9HA 3DK1A 5HCOA 1HPVA 4Y3RA 5I3XA 1SDVA 3LHGA 2I4QA 1RPIA 3MSKA 2UY0A 2NTRA 5OZXA 3IXJA 4RROA 1SIVA 3UFNA 3RSXA 3PLLA 3PWWA 3UDKA 1SGZA 2G1YA 4JOOA 3NWQA 3TPLA 3BVBA 3O9BA 5E5KA 1WBKA 2P3BA 2AOGA 5P39A 5P0XA 1G6LA 1TW7A 4YD6A 1XL5A 5P1MA 5P52A 4Z22A 1OHRA 1T6EX 1ZTZA 4M8XA 5P40A 1N49A 1AM5A 7HVPA 3GW5A 4Y41A 3UDHA 2WKZA 4KE1A 5P3DA 5P8JA 5P2WA 2IDWA 5P36A 3PSYA 5P4NA 5HTZA 5OZBA 3I7EA 3N4LA 2G69A 4F73A 3U6AA 1EAGA 4OD9B 4QJ7A 3S8IA 1HSGA 5P33A 3SLZA 5P3YA 2VKMA 4Y53A 3EL4A 1C6YA 3ZMGA 1PPKE 1M0BA 4RRNA 2HM1A 2ER7E 4Y3DA 2QMPA 2Z4OA 2QHYA 4YD3A 2ZHTA 1QBTA 1SP5A 1MRXA 2FXEA 1LYBB 1CPIA 2R38A 2PWCA 5P0DA 5P2GA 5P4XA 1BVGA 1HIVA 5P69A 2V12C 5P1PA 2BQVA 5P3MA 3G6ZA 3VV6A 1AAQA 3OADA 1ZSRA 3R0YA 1HBVA 5P1HA 5P61A 2O40A 3NU6A 3UDYA 3LINA 5C9FA 3T6IA 1VIKA 5P45A 2QZXA 3UPJA 5OZPA 3TNEA 3KT5A 3G72A 4L6BA 3Q70A 4QJ2A 2QNQA 5P8CA 2VIEA 3R2FA 2OHUA 5P4YA 1ZBGA 5J25A 3URIA 5P24A 4D88A 2QI7A 5OYVA 4B00A 4ZPGA 1G2KA 2PK5A 4DQGA 1ZJ7A 3EC0A 5KR8A 5P5QA 4Y56A 1DPJA 3TL9A 3OQKA 5P6FA 4GB2A 2QI6A 4OBHA 1VIJA 3L5BA 5P8HA 3BXRA 5P73A 4Y3FA 5P6MA 5P6ZA 5P0FA 1ME6A 5OZYA 4R91A 5P72A 5P8TA 5P1GA 3ST5A 1HTGA 1KJHA 5P6AA 1K6CA 3PI0A 5P2SA 1SGUA 5P0YA 4Y4EA 1HIIA 3NU3A 3EKVA 3LIYA 5P65A 3PSGA 4ER4E 4DJYA 5P6EA 5P58A 5P2BA 4EJDA 5P7HA 2A4FA 3LIZA 3IXOA 4FIVA 4RLDA 1TSQA 2Q3KA 2H6SA 5P19A 1FQXA 2HS2A 5C9DA 4HLAA 4DV9A 1YM4A 5P31A 2WF2A 4LBTA 1C6XA 2R3WA 5ER2E 4U8WA 2VA6A 4DQHA 5OZIA 4DPFA 3SA7A 1FGCC 1HVRA 3OU1B 4TVGA 5P4VA 4D89A 3EL9A 5P64A 2OF0A 1HEGE 5P8DA 4HDPA 3HBOA 3OXCA 4HA5A 2BKTA 5P55A 2G1SA 3KFPA 1MSNA 4APEA 4FGXA 4L1AA 4RYGA 3AIDA 3DCKA 1LF4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3SA9 A;  1LYW B;  3RTM A;  5AH6 A;  3EM6 A;  3IAW A;  3PM4 A;  1GNM A;  1SIP A;  2FMB A;  3ZKG A;  4CPX A;  4Z4X A;  1AJV A;  3WZ6 A;  1QBU A;  1FFF C;  5P2L A;  2P3D A;  2QD8 A;  4FCO A;  2PWR A;  2NMY A;  5CON A;  3WSJ A;  5I3V A;  4J0Z A;  3Q6Y A;  5P0N A;  4QJA A;  3LPI A;  1C70 A;  2CEM A;  2OHT A;  4Y3W A;  4OBZ B;  4YE3 A;  4JPE A;  5DR0 A;  4Y38 A;  1ZLF A;  3GGX A;  1EPP E;  3BVA A;  5E5J A;  3GGU A;  2HS1 A;  3ZPU A;  4ZSM A;  5I3W A;  3KFS A;  3PHV A;  5P08 A;  2IKU A;  2ZJJ A;  3O9E A;  5P3B A;  3NDU A;  2Z54 A;  3PCW A;  5P8E A;  5P0C A;  5P4D A;  2IKO A;  1YM2 A;  5P7V A;  2FNS A;  4Y58 A;  1ODX A;  5P01 A;  4AMT A;  4FRK A;  4D8C A;  3VSW A;  5P0S A;  5P26 A;  1B6P A;  4Y3E A;  4PEP A;  5P3X A;  5P00 A;  4PYV A;  2AZ9 A;  1NPA A;  3OUA A;  4GJ9 A;  5DR3 A;  5I3Y A;  4Y37 A;  3OUC A;  5P15 A;  3KDC A;  3KF0 A;  4FE6 A;  2HB4 A;  5P17 A;  5P8M A;  5P27 A;  2XYF A;  4TVH A;  4NPT A;  1KJ7 A;  2RMP A;  2P4J A;  5P7D A;  2VIY A;  4FRS A;  4HVP A;  4Y39 A;  5P5O A;  4GJ6 A;  3OGQ A;  5P2N A;  4DJQ A;  2WL0 A;  2PQZ A;  1MT9 A;  5APR E;  2APR A;  5T4S A;  2F3E A;  1IZI A;  3SM1 A;  4I0D A;  2I0A A;  5P81 A;  2P3A A;  1PFZ A;  4OC6 B;  3L5C A;  4ZLS A;  5P2R A;  2VS2 A;  4MC1 A;  1B6K A;  2Q64 A;  3NU4 A;  4WY1 A;  4EJ8 A;  3KMY A;  2ER0 E;  3LZY A;  5KR0 A;  5P8S A;  3S43 A;  3NLS A;  4FAE A;  3OHH A;  5P4O A;  1EPN E;  7UPJ A;  3VYD A;  3VYF A;  4Y4B A;  2G1O A;  1K1T A;  3IND A;  1APV E;  1EPR E;  5P0U A;  2R5Q A;  3EL5 A;  1HEF E;  3ER3 E;  3OTY A;  5P4W A;  1D4Y A;  5P7S A;  5P7N A;  4Y4A A;  2Q5K A;  2I4W A;  3BUF A;  1MEU A;  5P42 A;  2OHL A;  3OY4 A;  5P2Q A;  5KQY A;  4S1G A;  3PCZ A;  3OAG A;  3ER5 E;  4YD5 A;  5P3C A;  1BXO A;  2QK5 A;  4F75 A;  4ZEA A;  2ZHS A;  5P2X A;  2AOH A;  5P8U A;  4Q1X A;  3VYE A;  3O9F A;  5P7L A;  3UQR A;  5AGZ A;  4I0H A;  5P5D A;  1TQF A;  2CEN A;  1Q9P A;  4EXH A;  3EKX A;  1GNO A;  5P13 A;  5KQF A;  4Y57 A;  5C9B A;  3UDR A;  2AZ8 A;  4Y3Z A;  3ZKM A;  3RTN A;  4B72 A;  5KQX A;  5P0E A;  3R0W A;  1IDA A;  4B0Q A;  4EQJ A;  2NPH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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