4Y83A

Crystal structure of cot kinase domain in complex with 5-(2-amino-5-(quinolin-3-yl)pyridin-3-yl)-1,3,4-oxadiazole-2(3h)-thione
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
317
structure length
299
Chain Sequence
LSSVRYGTVEDLLAFANHRPQESGILLNMVITPQNGRYQIDSDVLLIPWKLTYRNIGSDFIPRGAFGKVYLAQDIKTKKRMACKLIPVDQFKPSDVEIQACFRHENIAELYGAVLWGETVHLFMEAGEGGSVLEKLESCGPMREFEIIWVTKHVLKGLDFLHSKKVIHHDIKPSNIVFMSTKAVLVDFGLSVQMTEDVYFPKDLRGTEIYMSPEVILCRGHSTKADIYSLGATLIHMQTGTPPWVKRYYLYIIHKQAPPLEDIADDCSPGMRELIEASLERNPNHRPRAADLLKHEALN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of Cancer Osaka Thyroid Kinase Reveals an Unexpected Kinase Domain Fold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 299
sequence length 317
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.7.11.25: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase.
pdb deposition date 2015-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4y83A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4y83A01
2PK9A 4MBIA 2YLEA 2GFCA 5KBRA 3RAKA 3ZO2A 4IAAA 3A4PA 4OT5A 3D14A 2LGCA 4HGSA 4G5PA 4CLJA 3OC1A 2PVMA 4EQCA 3TUCA 3NWWA 5BMSA 3DXNA 5D12A 3CBLA 3MY5A 1PJKA 3EQHA 4JG6A 4QTCA 4ANSA 4DGGA 5IQDA 3F2AA 5JFVA 2C0OA 4ASXA 2BTRA 3ZFYA 2X39A 4CFWA 1JAMA 4GYGA 4NZWB 3S00A 3R1QA 3KB7A 3NIEA 4FIJA 3R9OA 4F6SA 5J5SA 5FP5A 4N0SA 4G17A 4ITJA 2BDWA 3FMEA 4AS0A 3Q4ZA 4F0FA 2WXVA 4BCPA 3FLZA 1ND4A 3OT3A 2UW6A 3P9JA 4NM3A 4KBAA 4C59A 3ET7A 4R7HA 1NT2A 3D5XA 4IDVA 3V3VA 4KSQA 4JBVA 4P7EA 5CAVA 5HORA 2VTPA 4B8MA 4CTCA 1I09A 2V5QA 1UNLA 3DGKA 4FNYA 3RWQA 1NVRA 1PYXA 1VZOA 2GTMA 2YWVA 4BCNA 1O6YA 4CFMA 3DTCA 3O8TA 5EI6A 2XM8A 3MVHA 2YCQA 4K1BA 2CN8A 2ITTA 5I5ZA 2WU6A 2VNYA 4FKRA 5CTPA 4IC7A 4QMNA 5A4CA 2GFSA 1URCA 3H9FA 4RVTA 5DEWA 5K0XA 4H58A 4M69B 5CX9A 1MRYA 4FSRA 5IMEA 2PVYA 4JNWA 4M67A 2BMCA 5ETAA 3G9NA 1H24A 2DYLA 4DTKA 4YJTA 1ZYJA 2GNJA 2ONLA 4ZP5A 3LXKA 3EYGA 3WZUA 3ODZX 2Y6OA 1J3HA 2G01A 4UMTA 4ZSAA 4ZJJA 4PTGA 4QMQA 4QPSA 4X21A 3V04A 5IEXA 3P7BA 5AUXA 1CM8A 4RT7A 3Q9YA 2WELA 4USEA 4CMOA 3U6JA 1FBNA 4AW0A 3A61A 3PSBA 3R9HA 4F09A 2UZLA 5J87A 2IN6A 2YIYA 3H0ZA 4JJRA 1NA7A 4O82A 4RIXA 3ZDIA 1ZXEA 2C5VA 2I1MA 2JDTA 2RFDA 4FSQA 1IAJA 3W16A 5HEZA 5IA5A 3TV4A 3A60A 2OXDA 2HOGA 4LQMA 3IDPA 4PV0A 3TZ7A 2XK9A 2C69A 4XJ0A 4XRJA 1YDRE 4FT3A 4IAFA 4XP3A 1F3MC 1IRKA 2PVFA 3HP5A 5AX9A 4DG0E 3TTJA 4DH8A 1E1XA 4O7ZA 4OW8A 3KFAA 1UV5A 1GOLA 1XHAA 4IZAA 4XCUA 2QOLA 4FKGA 5ACBC 3MJ2A 5GJGA 1BL7A 3U9NA 5J7BA 4C38A 4PDOA 3KY2A 2C3KA 3KEXA 2OKRA 3R73A 2E2BA 4PPBA 4GKHA 2UVZA 3QRKA 4USFA 3PP0A 4KRDA 3GB2A 1H0VA 3P1AA 2WMQA 4XV2A 4FG7A 4YTIA 4D1XA 2ERKA 2PULA 4FL1A 3LQ5A 4R78A 4FEVA 4I4EA 3E7VA 2SRCA 4MVFA 2WTJA 2F7ZE 3QUPA 4ARKA 4PMSA 3PVWA 2UZBA 2GNHA 2UW5A 2QR7A 2UW8A 3BU6A 4FTJA 3BEGA 3UO4A 2CSNA 4YO4A 5JT2A 4FI1A 3BBTB 3EL7A 2JEDA 3LCKA 3OCTA 2G2IA 1P4FA 3GFWA 5CAPA 2OJIA 1JKSA 4YC3A 1SZMA 3BHHA 3QCSA 5HO6A 4XBRA 4GIHA 4RIOA 3FMLA 5M4CA 3ZBXA 1QCFA 2J9MA 4O2ZA 4CZUA 3T9TA 1OKYA 2XK6A 2BR1A 3AGMA 3K54A 4IAKA 2J50A 3SRVA 3WF8A 5M07A 1XH9A 3ENMA 3FL5A 4EH4A 2CKQA 4JT3A 3TI1A 4W4YA 5GIOE 4D4SA 5KZIA 4MXZA 4FR4A 4AGWA 2OU7A 2WU7A 5CU4A 4NIFB 4DE4A 3BHUA 4O7LA 2VTAA 2G2HA 5L6WL 5JFWA 4C37A 3BX5A 4PX6A 4UZHA 5CWZA 2WMVA 4N6ZA 2OI4X 4FUYA 1VR2A 2OIDA 3OWJA 3KMMA 3KRLA 3P86A 4O22A 4DFYA 4DGMA 5HE3A 3QU0A 2XNNA 2A27A 4L7FA 5KMKA 3CIKA 2OZAA 3QKLA 2ITXA 3PZHA 4OUCA 5B2KA 4DYMA 2G15A 3EKKA 4V04A 3LJ1A 1WVWA 4G5JA 4YZDA 3R8VA 4E20A 5HHWA 4EK3A 1YOLA 3TXOA 3OZ6A 1R78A 3G0FA 3CTJA 3H9OA 4FKWA 4ANNA 3PJ2A 5A4LA 2QNJA 2RGPA 5CEOA 4MWHA 4TL0A 2GNIA 4MYGA 4FG8A 3WZDA 3NCGA 2QOIA 2HELA 4BDAA 5EKOA 3UMXA 4DLIA 2CHLA 5AV3A 3QRTA 4ALVA 2ZM4A 3G2FA 2H34A 4F7NA 4NTSA 5HE0A 3NR9A 3VUIA 2UW3A 4YBJA 3VS0A 1Q61A 4FG9A 4EK4A 4OAVB 4IB3A 2EXEA 4CD0A 4CMTA 5HE1A 5KZ0A 4MXYA 2JKMA 4Y5QA 3V5QA 1KOAA 3UNZA 3T8OA 1AQ1A 3WE8A 3IDBA 4PP9A 3C4XA 3NYNA 3PUPA 4IX6A 5E1SA 1SVHA 4NU1A 3NUSA 4ZTMA 4RC2A 4O7RA 4DF3A 4HYIA 3QCQA 1OKZA 1MQ4A 4XV3A 3WARA 2P33A 4AFEA 4BIDA 4HVHA 1IG1A 4NSTA 4RMZA 5AP4A 3R7VA 2NRUA 5HG9A 3UTOA 5H8EA 2PU8A 3QTWA 4DEEA 2PVNA 2YM3A 5AUYA 5CU2A 4WNMA 5EM8A 3MTLA 3FI3A 2ITUA 4GJ3A 4WD5A 4ANQA 1KV1A 2G1TA 2JKKA 4M3QA 4W4XA 4FUXA 5G1XA 3HNGA 3RM6A 3N4VA 3JPVA 2PZ5A 2C68A 2ITPA 3E8CA 2BUJA 3O0GA 4GVAA 4RIXB 4UWCA 4E5WA 4YMJA 4WO5A 3RMFA 5CF5A 3QZFA 1M52A 2WEVA 3Q5IA 3QTUA 4BGQA 5DPVA 1URWA 3OY1A 2O5KA 2WD1A 1OL7A 4ZSLA 5JQ8A 2JKQA 5KMJA 3EN6A 3GCQA 4R5YA 3HVCA 5CSHA 2OGVA 4MNEB 1YXTA 4AZWA 2Z7SA 3WI6A 3PXRA 3VO3A 4Y72A 4D2VA 4EBWA 5EQYA 2YWPA 2X9EA 4LUEA 2DQ7X 2PUIA 1BMKA 3ORTA 1PMVA 1ZRZA 3OWKA 4FT9A 4PTCA 1WFCA 2WO6A 3GT8A 3B2WA 3NZ0A 2OWBA 2H6DA 4O0XA 4KKGA 5IKWA 3ZLWA 4JDHA 4IHPA 2OIQA 4WRSA 4WRGA 1PYEA 2R64A 4RX8A 5M4UA 1PMEA 2CLXA 1JSTA 3KCKA 2VTTA 4ZTSA 4BZOA 5JKGA 4IAZA 4XV1A 3U51A 2BZJA 2WTCA 3UZTA 1R0EA 4XG9A 2EB3A 2NRYA 1FVVA 4E7WA 3DKFA 3ZOSA 3EB0A 5AP3A 5L8LA 5I9YA 5D7AA 4ACDA 2XIXA 4ZJIA 2PUNA 2YABA 2XVDA 5AP7A 4QYFA 3BU5A 5CI6A 5HNBA 1P2AA 3Q32A 4GV1A 1A48A 4EHGA 3SOCA 5CENA 3MVMA 3VUHA 3HRCA 2C47A 1BKXA 2O65A 4LGGA 1Y57A 2B7AA 4U45A 4FV0A 5HG8A 3SRVB 4IJPA 3HZTA 4KIQA 2IPXA 4LM5A 4P90A 4AGCA 4NEUA 2JIIA 3OW3A 3QXPA 4L7SA 3HKOA 1G8AA 3MH0A 3EH9A 2C1AA 4CG8A 3R8MA 1OM1A 3SV0A 4IFCA 4GT4A 4DGLC 3NIZA 5IQBA 2WIPA 4BIBA 2R3QA 3ZC5A 1A06A 3UG1A 3NNUA 5DRBA 3KF7A 3N4TA 5BVDA 4TYJA 5AR4A 4BICA 4U41A 5H8GA 1DAYA 3MV5A 4RJ5A 3EZVA 1XR1A 4S32A 4EOSA 3HA8A 1ZYLA 4YLLA 3OBGA 3G90X 3R2BA 3NVMB 2AC5A 3FYKX 4RJ6A 5CNNA 5C9CA 2OZAB 5IDNA 3QQKA 3W55A 2ZOQA 2W5BA 3HMOA 1PXIA 2QKWB 5BVNA 4PQNA 3QZHA 4EJ7A 2WMWA 4IM2A 3QYWA 3NNVA 4ZTHA 4YZNA 3CXWA 4JX7A 4O0RA 2QOFA 3A7IA 1KV2A 4AGDA 2QHNA 3B8RA 4U8ZA 3DT1A 3DJ5A 3O51A 2YCRA 4AU8A 1W8CA 3ZS5A 3ENHA 3MFTA 3LLAA 2XJ1A 4C8BA 3PSDA 1O9UA 5AADA 5K4JA 2B0QA 3F3WA 4O27B 3N4UA 3GXLA 5I9WA 3DK7A 1ZZLA 2Y4IB 4QP2A 3R7YA 2IZSA 3NRMA 3FAAA 3I81A 3ORNA 2OH4A 3VWAA 1REJA 4C2VA 2HW7A 2WMAA 3TKIA 3W2SA 1M7NA 3GOPA 4S2ZA 4AA0A 4QMWA 4RBLA 4AZTA 5HGIA 3OOGA 2OLCA 4KABA 3VHEA 5H2UA 3RHXA 3FV8A 4YTFA 2VO6A 2ZDTA 5M44A 4U80A 2WQMA 5T68A 3ZBFA 4CEGA 3ZCLA 4CFUA 2F9GA 2XEYA 3QWKA 4MEDA 3UC3A 3FEGA 2ITNA 3MA3A 4EZ3A 2W99B 2J0IA 3OTUA 3R7GA 3OWPA 4R3RA 4ZZMA 4EOOA 1BL6A 2BRGA 3Q9ZA 2WKMA 4D2SA 4NYEA 3DTWA 3VJOA 1W7HA 4MAOA 4I5CA 2ITOA 4L9IA 4RX5A 2VX3A 4FT0A 3ACKA 4J97A 4TY1A 2X4FA 3QF9A 2XYNA 5K0KA 4S34A 2W9FB 3KN5A 4QP8A 4XX9A 2BZIB 2I7QA 4BGHA 3CS9A 3CGFA 1W82A 2V55A 5ETCA 5AV1A 3EN5A 4FTOA 5CSPA 5IQAA 3ERKA 4KA3A 5TF9A 3BZ3A 5EFQA 5FEEA 3QALE 3Q9WA 3OXTA 1WBNA 5TT7A 1ZY4A 3LKMA 3HDNA 2QR8A 4HYHA 3ULIA 4TW9A 2DUVA 2QD9A 3NUUA 1IAHA 5D9HA 5HTIA 1QMZA 2BCJA 3VIDA 3VRYA 4M68A 4CSVA 3CKWA 4KSPA 4TTHB 4E93A 5KX8A 4IZYA 2OBJA 4K33A 5LMAA 3TIZA 4BBEA 4DEIA 5JQ5A 3NW7A 3FC2A 4U5JA 3VUGA 3L9PA 5LARA 3LMIA 1TQPA 5FLFA 3IGOA 3QQJA 4J52A 4PWNA 3F5PA 4FV3A 2FGIA 1TVOA 4QP6A 4D0WA 4FZDB 4KS8A 3MSSA 4MH7A 5AR7A 3RALA 3FZRA 4E6QA 4BI0A 2BRNA 2GS2A 1Z9XA 4C36A 4WG3A 4F1OA 2FB8A 2BHHA 3RK7A 4P5QA 4UMPA 3G6GA 3S95A 4F6WA 1YHWA 4YHJA 4BWKA 3NUAA 4JDIA 2P2IA 2YDJA 4ZY4A 4G34A 4IVDA 3F6XA 3MY1A 4BCKA 2W1DA 4IZ7A 4EH7A 4UXQA 3OTVA 4C33A 2FUMA 4OTRA 4U79A 1Q8WA 1K2PA 5FXSA 3EZRA 4FK3A 5F20A 4E6DA 3TKHA 4LV5A 5KMIA 3IW7A 4I0RA 3KGAA 3TIYA 3TT0A 1CMKE 3S1HA 3CY3A 3DB8A 3RAIA 3L8PA 4K0YA 4MKCA 4BKZA 4CRLA 2YITA 2XA4A 1J91A 3GVUA 2PMOX 2VWYA 2QLQA 3ATSA 5HVJA 5AR2A 2CCIA 5H9BA 3QD3A 1NVSA 2X1NA 3QLFA 2GQSA 3I7BA 4IC8A 4KD1A 5KMOA 4I0TA 1BLXA 5CF6A 4E4MA 1B39A 1H08A 2YACA 3LLTA 3HV5A 4BDIA 4C02A 4CFVA 3KVXA 2GMXA 2UW9A 3V01A 1RW8A 3DK6A 3P7AA 4RWIA 3SKCA 4Y95A 4Z9LA 4TT7A 4BI1A 4E5BA 1PXJA 5DVRA 3D7TA 3QQFA 3OF0A 5LMBA 5EI2A 3W33A 3ZXZA 1OIQA 1U4DA 5GJDA 3DBDA 1A9UA 4PF4A 5DR9A 1SYKA 5J8IA 2VWUA 3HUBA 4FZ7A 3EL8A 1V0BA 3GCPA 3ANRA 2CDZA 2H9VA 1DI9A 3QTQA 2R3JA 2F7EE 1UNHA 1ZOEA 2QG5A 5EM6A 5BQ0A 2J7TA 1J7LA 3ZM9A 4HW7A 5CLPA 1OIRA 3KCFA 4IB1A 4EH5A 4FEXA 2IG7A 5CU3A 4QP9A 3K2LA 4I6HA 3G9LX 4DH5A 5IMXA 4S33A 3ZDUA 4UMQA 5CANA 4RQVA 4KAOA 3F3ZA 4HGTA 4I24A 3I6WA 4RWKA 5E8TA 3LM5A 4X2GA 3U4WA 3ZUTA 4YU2A 1JSVA 5F1ZA 2BAJA 4GG5A 3E3BX 3DV3A 4GCJA 4TYIA 4FIFA 2B53A 1AD5A 4K77A 4U44A 2VZ6A 3PXQA 2V0DA 3RHKA 2PVRA 1YWNA 3IGGA 3P79A 5IUGA 4K2RA 2B4SB 2WZJA 4O0VA 2HZIA 1PXOA 3DNEA 4PNIA 3R9NA 3C13A 3VUDA 5CEPA 4IWDA 3ATTA 4C4EA 3C9WA 4RVLA 5CU0A 1GAGA 4FL3A 4LOPA 2HZNA 4EHZA 3D5WA 3GGFA 2PPQA 4YGAA 4AG8A 3BYUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1GOL A;  1XHA A;  4IZA A;  4XCU A;  2QOL A;  4FKG A;  5ACB C;  3MJ2 A;  5GJG A;  1BL7 A;  3U9N A;  5J7B A;  4C38 A;  4PDO A;  3KY2 A;  2C3K A;  3KEX A;  2OKR A;  3R73 A;  2E2B A;  4PPB A;  4GKH A;  2UVZ A;  3QRK A;  4USF A;  3PP0 A;  4KRD A;  3GB2 A;  1H0V A;  3P1A A;  2WMQ A;  4XV2 A;  4FG7 A;  4YTI A;  4D1X A;  2ERK A;  2PUL A;  4FL1 A;  4QEB A;  4DDI A;  3LQ5 A;  4R78 A;  4FEV A;  2X0Q A;  4I4E A;  3E7V A;  2SRC A;  4MVF A;  2WTJ A;  2F7Z E;  3QUP A;  4ARK A;  4PMS A;  3PVW A;  2UZB A;  2GNH A;  2UW5 A;  2QR7 A;  2UW8 A;  3BU6 A;  4FTJ A;  3BEG A;  3UO4 A;  2CSN A;  4YO4 A;  5JT2 A;  4FI1 A;  3BBT B;  3EL7 A;  2JED A;  3LCK A;  3OCT A;  2G2I A;  1P4F A;  3GFW A;  5CAP A;  2OJI A;  1JKS A;  4YC3 A;  1SZM A;  3BHH A;  3QCS A;  5HO6 A;  4XBR A;  4GIH A;  4RIO A;  3FML A;  5M4C A;  3ZBX A;  1QCF A;  2J9M A;  4O2Z A;  4CZU A;  3T9T A;  1OKY A;  2XK6 A;  2BR1 A;  3AGM A;  3K54 A;  4IAK A;  2J50 A;  3SRV A;  3WF8 A;  5M07 A;  1XH9 A;  3ENM A;  3FL5 A;  4EH4 A;  2CKQ A;  4JT3 A;  3TI1 A;  4W4Y A; 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