4Y9WA

Aspartic proteinase sapp2 secreted from candida parapsilosis at 0.82 a resolution.
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
333
structure length
327
Chain Sequence
SPSSPLYFEGPSYGIRVSVGSNKQEQQVVLDTGSSDFWVVDSSASCQKGNCKQYGTFDPHSSTSFKSLGSSFSIGYGDKSSSIGTWGQDTIYLGGTSITNQRFADVTSTSVNQGILGVGRVETESANPPYDNVPITLKKQGKIKTNAYSLYLNSPGAATGTIIFGGVDNAKYSGKLIEEPLVSDRYLAVNLKSLNYNGDNSNAGFGVVVDSGTTISYLPDSIVDDLANKVGAYLEPVGLGNELYFIDCNAQGSASFTFDNGAKITVPLSEFVLQACVWGLQSSDRQNVPPILGDNFLRHAYVVFNLDKETVSLAQVKYTSASSVSAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Aspartic acid endopeptidase Sapp2
publication title Aspartic Proteinase Sapp2 Secreted from Candida Parapsilosis at 0.82 A Resolution.
rcsb
total genus 93
structure length 327
sequence length 333
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4y9wA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4y9wA01
2Q55A 4DQFA 3QROA 2APRA 5P71A 5I3VA 4XX4A 4KE0A 4PZXA 2AOEA 2NMZA 2P83A 4KB9A 2VA5A 5P3HA 1HIVA 5P2BA 5P61A 5OZ8A 3ZPUA 3OXVA 3LNKA 1WBMA 1K2CA 3T3CA 3VYEA 1BV9A 2CEJA 2AVSA 2ER6E 4DI2A 3VYFA 4D83A 3L59A 2I4VA 5P22A 5P2UA 4APRE 1QBRA 3CICA 3SKGA 2V13A 2AOGA 3HVGA 3SM2A 4Z2ZA 4EQJA 3EM4A 2FIVA 3OU3A 4YD4A 4RVJA 1KJGA 1EPRE 2OHKA 4Y5AA 4JPEA 4RCDA 4JECA 4OBZA 5P3KA 4B1CA 1MESA 2HAHA 5P2MA 5P56A 3OAGA 1M0BA 2G94A 3K4VC 2FNTA 3D1ZA 4ZPEA 4APEA 5SY3A 5OZ3A 5P5JA 3NUOA 5P1PA 3VLBA 2ZDZA 3CYWA 5P4ZA 5I70A 2UPJA 5P8JA 4QJ8A 3MSKA 4QJ6A 3TKWA 4Y43A 5P82A 1APVE 1APTE 4Y3NA 4Y5BA 2G27A 1XE6A 1DP5A 1YTIA 4GJBA 5P76A 3CKPA 1KJHA 3IVHA 3INEA 5P7BA 4RYCA 3RTHA 2AVQA 3D1YA 5P86A 5P40A 4PPHA 3OQKA 2HB2A 5P28A 3SAAA 5P3DA 2UXZA 5P0RA 5P46A 4FS4A 4EHCA 3DJKA 1HHPA 3OGQA 5ER1E 5P06A 2HIZA 2QP8A 4L7GA 2FDPA 5P1DA 4EP3A 5OZ9A 2QU3A 3HAWA 2V00A 3U6AA 3OUDA 3ER5E 4LXAA 2VIYA 4DJOA 3F9QA 1HTEA 5P8DA 5BRYA 1BXOA 5P72A 5P3CA 5P5GA 3UDHA 5COKA 1PSOE 3I6OA 4A6CA 3CYXA 4B70A 2ZYEA 4YD6A 5P7AA 3EKQA 5OYXA 2QI3A 4B00A 3QRSA 3L5FA 5P02A 4JOOA 5P44A 3OU4A 1FQ5A 5OZDA 3O9FA 5P5SA 3TL9A 4ER1E 1W6HA 4H1EA 5JODA 4Y4UA 1QBSA 1IZHA 1HVLA 1YTGA 2R9BA 3AIDA 3G6ZA 3TKGA 1XE5A 5F00A 2Z54A 5OZCA 2QD6A 2WF1A 3TPJA 2BPWA 5OZ4A 1MRWA 4EJKA 4Y45A 2XFKA 3N3IA 5P16A 4J1EA 3HW1A 2V16C 5P7YA 4Y5PA 5P3TA 2IRZA 5P6QA 1GVUA 3T11A 7HVPA 4FCOA 3C9XA 4Y3ZA 2Z4OA 5OZOA 4OBHA 1YTJA 3SM1A 5P5PA 5P39A 3DUYA 2Q3KA 3IGBA 3GW5A 3O99A 3UQRA 1JLDA 5DQ1A 5HCOA 4Y4WA 4GIDA 4Y3EA 3VFBA 4CPXA 4FRKA 5P5TA 5P5LA 1IZDA 3VSWA 4Y54A 5P0UA 3S43A 2OHUA 5P0QA 5P2NA 5P55A 3ZKMA 5P1TA 1F7AA 5IVSA 5P8FA 3RSXA 3I7EA 5P3RA 3GGVA 1AZ5A 4J5JA 5P08A 4Y3WA 5OZ1A 4NJUA 1KJ7A 3NDUA 1AM5A 4DJQA 5P43A 3EMYA 4I0HA 1ODWA 4F73A 1PPME 5P0YA 5P7OA 4Y4EA 5SXNA 5P2RA 5P8LA 5P2CA 1YT9A 2RENA 4IVTA 2BKTA 3LIYA 3APRE 5OZWA 5P70A 4R8YA 4BFDA 4Y37A 4LHHA 3S85A 5C9DA 5P1JA 1LYWB 5P3EA 5P73A 1A94A 5P8MA 3OADA 2QCIA 2PYNA 4I0GA 3GI0A 3OQAA 4R91A 4Y5MA 1D4KA 5HTZA 5DPZA 1APWE 3UQWA 5P4CA 3HBOA 2EWYA 1W5WA 5P6EA 4PEPA 1HVSA 2B7ZA 1MT9A 4HDPA 5P30A 2PH8A 3NUJA 1HVHA 4K4QA 1W50A 3URLA 1SMRA 3GGXA 4WY1A 3BHEA 3FSMA 2IKOA 5DQCA 1MIQA 1KJFA 2PH6A 5OZ5A 5P6YA 3RTNA 5P1UA 1PPLE 3O9LA 4KUPA 2VA6A 5P5VA 5P8TA 3UDNA 3CMSA 4Y3PA 5P74A 4J0YA 2MIPA 5KR0A 1LV1A 1TCXA 5OYSA 3KMYA 5HE4A 2QU2A 3L3AA 5P3VA 5P6HA 4FM6A 4I8WA 5P1BA 1IDBA 1FB7A 5KR8A 2I4QA 1B5FB 2QMPA 5P26A 4HVPA 2HB3A 3O9GA 5OYYA 4Q1YA 3URJA 5SY2A 2WHHA 4J0VA 1IIQA 2R3WA 5P52A 5P5OA 2JXRA 5J25A 5P6LA 1SIVA 3K5DA 5P7IA 4FSLA 3G72A 2BKSA 4ZEAA 5OZKA 3LPJA 3NWXA 5P5RA 5P6PA 5P4KA 4H3GA 4JPCA 5P15A 1HTRB 4FE6A 4MC9A 3SACA 5P66A 3DM6A 4DQCA 4J54A 5HE7A 1YG9A 1ZSRA 5P7LA 1A9MA 3RVIA 1TCWA 4HDFA 5P2GA 4I0ZA 3TOFA 1BVGA 5P3AA 5P1XA 1MEUA 1W51A 4OBKA 1XS7D 5P85A 1B6JA 3ST5A 2BPYA 2F8GA 2ZGAA 3UFLA 1C6YA 3JVWA 5P5MA 5APRE 3OQDA 5I3XA 4DQBA 4I0DA 3UDKA 5BWYA 1G6LA 3VSXA 2QNNA 5BS4A 3FV3A 5P4YA 4Y4TA 1BDLA 4Y5GA 5P5HA 3WZ8A 2QNQA 2OHTA 3GI6A 2IKUA 4Y53A 3OK9A 1LEEA 1Z1RA 1GVXA 2I4WA 1HSHA 4U7VA 2P3CA 5ENMA 1HVKA 3R4BA 5OZVA 4GJ9A 3SA3A 5ISJA 3Q3TA 1LYAA 5KQXA 4Y3JA 2BJUA 4B1EA 1BIMA 2QHCA 4R5NA 2WEBA 3T7PA 3UHLA 4EXGA 5P67A 4YD5A 1FFFC 1DW6C 3O9DA 3L5BA 3UDRA 5HVPA 5P88A 1Z1HA 4ER4E 2QZXA 2OHMA 2XFJA 3PBDA 2NR6A 5C9BA 4HZTA 3UQUA 4J1CA 4Q5MA 1FMUA 4B1DA 1HSGA 2G1SA 5P7XA 5P4MA 5P8CA 4Z22A 1A8KA 5P12A 5P1NA 5DR3A 2J9KA 3OUDB 5P6GA 4Y44A 5P0KA 3LZVA 3PMYA 1HPXA 3S2OA 1EBWA 1FQ6A 4Y50A 3TNEA 5P07A 1EC0A 1SBGA 3INFA 5P05A 3PM4A 4YCKA 1W5XA 2NXMA 5KR1A 5P5BA 3LIZA 5OZFA 5OZUA 5P6TA 3MWSA 2AVOA 5P4TA 2FMBA 3PI5A 3WB4A 4AMTA 5OZAA 4Y4DA 5HU0A 1DPJA 2XFIA 2AOIA 3MXDA 4J1KA 3VF7A 5P0NA 5DQ4A 5AGZA 1EBKC 3SLZA 1C6XA 1EPLE 2VJ6A 5P7PA 4RCFA 1N49A 3OU4B 3CIBA 2IEOA 1DAZC 3VV6A 5I3WA 2O40A 3LPIA 5ENKA 5OZJA 1BWAA 1IDAA 4FIVA 4J1FA 4OC6B 4L1AA 3NU6A 5P34A 4I0FA 2WEZA 3R1GB 3GI4A 3QRMA 4EYRA 3KDCA 5DR7A 1SDVA 5P4WA 3BVBA 1MSNA 4DFGA 2Q54A 5DQ2A 4H3JA 5P7MA 2F81A 1AJVA 1FMBA 1IZEA 2ZHTA 1D4HA 5E5JA 4ZSRA 3LHGA 4Y4BA 1AIDA 1ODXA 5P7HA 1SGUA 4HLAA 3KFRA 4U8WA 2BB9A 2R38A 2QI4A 3SA4A 5ISKA 4LXKA 3DCRA 3PEPA 1YX9A 3O9IA 5P4VA 4GJ7A 5P01A 3QVIA 2G20A 2VNMA 3URIA 5P2LA 1APUE 4RYGA 3TOHA 3O9HA 3PWWA 5P3QA 3FX5A 5P2OA 1EPQE 1HWRA 4XX3A 2AZBA 2BPVA 1BDRA 3PLDA 4DPIA 2IL2A 2R5QA 5P6BA 5P3LA 5P4LA 4B05A 5P7ZA 3EBZA 5OZMA 2Q63A 5P6SA 5P7UA 2R43A 3IN4A 4FM7A 3FNSA 3L5DA 2CEMA 4GJ5A 1NPVA 5IVTA 2IQGA 5FIVA 5P6MA 1HRNA 3OGPA 3ZKSA 5B18A 2I4DA 2NTRA 3QBHA 3OUAA 2I1AA 2P3BA 5AH8A 8HVPA 4CKUA 5P3ZA 1W5VA 2RSPA 4Y3LA 4Y57A 3EKWA 3K5GA 3JW2A 5IVRA 2AZ8A 5P5EA 5P7VA 1YM4A 2OF0A 3UFNA 4Y3MA 2ZJMA 4I0EA 5KQZA 1FIVA 2G1RA 3UDMA 1CZIE 5P3BA 1XDHA 4OD9A 2I4XA 4ACUA 3EKPA 4NKKA 2Q11A 4EPJA 5P35A 1FFIC 2ZHUA 5P1KA 5P64A 5P1AA 1MT7A 4DQEA 4R93A 1FEJC 3Q6YA 1FQ8A 5HE5A 4FM8A 3D1XA 2AODA 5OZTA 1XN3A 2WF4A 2Q64A 1PFZA 4EJLA 3OQFA 3VYDA 1TW7A 4Y48A 5P29A 3RSVA 5P09A 5P59A 3PI0A 2NXDA 4FGXA 4FAEA 5P2WA 2ASIA 5KQYA 2ZJLA 4Y41A 4FL8A 1T7JA 3SA6A 5P0IA 2HPEA 3O9LB 5P04A 5KAOA 1ZJ7A 5P2KA 2VIZA 3Q5HA 3TPPA 3LITA 4PYVA 4N00A 4Y3QA 2QMDA 1M43A 2B8LA 1B6MA 3KF0A 3UDPA 5P3FA 4Q1NA 1MPPA 5P53A 2FS4A 2AVVA 5P8IA 1ZLFA 1OEWA 3EC0A 3ER3E 2P4JA 3BUFA 2F3FA 4ZSQA 4X2LA 2Q5KA 4A4QA 3PMUA 4QGIA 4FAFA 2HB4A 1GNMA 4ER2E 3PSYA 1E5OE 3T7QA 4DJXA 2HS2A 1D4IA 3IAWA 3QPJA 3TH9A 3PJ6A 3CKTA 4YDGA 1QBTA 5P5CA 4EXHA 4UPJA 2QMFA 2ZJIA 5P4NA 3BC4A 5P1CA 5P8SA 1UPJA 4GJ6A 4Y3YA 2I4UA 3NU3A 5P7RA 3EL5A 4I10A 4YOBA 5P51A 3LZUA 3S54A 4L6BA 5OYWA 4Y5LA 3SPKA 5P89A 2J9JA 5P3YA 2QHZA 3PSUA 2WEDA 1T7KA 5P2YA 1YM2A 3K5FA 3O9CA 2G26A 4B78A 3TTPA 1K1TA 1YTHA 5HDXA 2WF3A 5P5ZA 4CPTA 2O4KA 5P0DA 5P0GA 5P77A 3OWNA 1BWBA 3UDQA 2AOCA 4AA9A 2QI1A 3S8IA 3VV8A 5OZZA 4D89A 1FLHA 2QI7A 4Y3RA 5P5KA 2FXEA 3EXOA 2B7FA 3INHA 3KT2A 5P0AA 5JFPA 2QI0A 2QNPA 3INDA 5DR0A 5P38A 1BBSA 5OZXA 1B6PA 2A4FA 2F3KA 2IENA 2BPXA 2QK5A 2QZKA 1EPPE 3QAAA 3BRAA 5P4PA 3FNTA 3WZ6A 3B80A 3HD8A 1IVQA 3KMXA 3O9BA 3IN3A 3JVYA 5P6RA 5HCTA 3UF3A 3NU4A 4Y5CA 5P54A 2O4NA 5P0SA 2G1OA 3OOZA 1ZPAA 5OZBA 3SA7A 3I8WA 3EL9A 4YDFA 3ZKQA 3OXXA 1A30A 4FLGA 1BDQA 3U71A 5P8RA 1LF2A 2PK5A 4J0TA 2QAKA 3U7SA 5P0BA 3VF5A 1NSOA 4Z50A 4RRNA 3QI1A 1NH0A 3PHVA 1HVJA 4YE3A 4B0QA 1FKNA 2AIDA 4FRJA 5DGUA 2H6SA 5P2SA 1EAGA 1B11A 2A1EA 3AUPA 1SIPA 4D8CA 2QD7A 5P0WA 1E81E 2QMGA 5F01A 4CPSA 2OHNA 5T4SA 5IVQA 5P0JA 3SABA 4Y51A 5OZYA 2BQVA 4Y4GA 2ZHRA 4YOAA 1K6TA 4Y5NA 4I8ZA 4I0IA 3Q4BA 5P37A 5KOQA 5OYTA 2ZJJA 3GGUA 5P68A 3S7LA 3Q70A 3KDDA 5OZGA 5P57A 4D85A 4GMIA 3R0WA 7UPJA 3BXSA 4YBFA 3OU1A 3NR6A 5DR8A 1ZBGA 1FQ4A 1HTFA 2UY0A 4L1AB 1RL8A 3M9FA 5P00A 4Y5EA 4QJ7A 5P4EA 1LS5A 5P0FA 5P7KA 1GVVA 5OYZA 4F75A 5P3JA 3H0BA 5P4JA 1HBVA 1LF3A 4F74A 1FQ7A 4QJ2A 1HVRA 4Y6MA 4S1GA 3WZ7A 2OHLA 4H3IA 5P6CA 3D3TA 2V10C 1SMEA 3LPKA 1RNEA 4DJPA 5HDZA 1EC1A 1D4LA 5P5NA 4AZYA 2AVMA 2R8NA 2QHYA 1UH8A 5P5YA 3KFSA 4OBZB 1TZSA 1HVIA 5P5QA 4TVHA 5P1YA 2AOHA 4DQGA 3PB5A 3L38A 3OHFA 3NDTA 6UPJA 3OAGB 4ZPGA 5P3IA 1HPVA 2O4LA 3OQ7A 3OXCA 4HEGA 1E82E 3QRVA 5P7JA 3HAUA 4YA8A 2WF0A 5OYQA 4RROA 4DH6A 5OZ7A 5P1RA 5P8OA 4R95A 1FF0C 4U7QA 3VLAA 3ZKXA 1AXAA 4I11A 1SP5A 1C6ZA 4TRZA 2FGUA 3PVKA 4KE1A 5CONA 2PSUA 5P7QA 1BAIA 1GVTA 1TQFA 3R0YA 5P24A 1XL5A 1HEGE 3LIQA 4Y4AA 1SDUA 4QLHA 4ZE6A 3NDXA 2Q15A 2P3BB 4Y3DA 3QN8A 3BUGA 3K5CA 5JFUA 1QS8A 5P4GA 3UCBA 4NPUA 2HM1A 2IS0A 3CIDA 4CPQA 5P3WA 4AA8A 3GGAA 2P3DA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2Q55 A;  4DQF A;  3QRO A;  2APR A;  5P71 A;  5I3V A;  4XX4 A;  4KE0 A;  4PZX A;  2AOE A;  2NMZ A;  2P83 A;  4KB9 A;  2VA5 A;  5P3H A;  1HIV A;  5P2B A;  5P61 A;  5OZ8 A;  3ZPU A;  3OXV A;  3LNK A;  1WBM A;  1K2C A;  3T3C A;  3VYE A;  1BV9 A;  2CEJ A;  2AVS A;  2ER6 E;  4DI2 A;  3VYF A;  4D83 A;  3L59 A;  2I4V A;  5P22 A;  5P2U A;  4APR E;  1QBR A;  3CIC A;  3SKG A;  2V13 A;  2AOG A;  3HVG A;  3SM2 A;  4Z2Z A;  4EQJ A;  3EM4 A;  2FIV A;  3OU3 A;  4YD4 A;  4RVJ A;  1KJG A;  1EPR E;  2OHK A;  4Y5A A;  4JPE A;  4RCD A;  4JEC A;  4OBZ A;  5P3K A;  4B1C A;  1MES A;  2HAH A;  5P2M A;  5P56 A;  3OAG A;  1M0B A;  2G94 A;  3K4V C;  2FNT A;  3D1Z A;  4ZPE A;  4APE A;  5SY3 A;  5OZ3 A;  5P5J A;  3NUO A;  5P1P A;  3VLB A;  2ZDZ A;  3CYW A;  5P4Z A;  5I70 A;  2UPJ A;  5P8J A;  4QJ8 A;  3MSK A;  4QJ6 A;  3TKW A;  4Y43 A;  5P82 A;  1APV E;  1APT E;  4Y3N A;  4Y5B A;  2G27 A;  1XE6 A;  1DP5 A;  1YTI A;  4GJB A;  5P76 A;  3CKP A;  1KJH A;  3IVH A;  3INE A;  5P7B A;  4RYC A;  3RTH A;  2AVQ A;  3D1Y A;  5P86 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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