4YGFA

Crystal structure of the complex of helicobacter pylori alpha-carbonic anhydrase with acetazolamide
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
KWDYKNKENGPHRWDKLHKDFEVCKSGKSQSPINIEHYYHTQDKADLQFKYAASKPKAVFFTHHTLKASFEPTNHINYRGHDYVLDNVHFHAPMEFLINNKTRPLSAHFVHKDAKGRLLVLAIGFEEGKENPNLDPILEGIQKKQNFKEVALDAFLPKSINYYHFNGSLTAPPCTEGVAWFVIEEPLEVSAKQLAEIKKRMKNSPNQRPVQPDYNTVIIKSSAETR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Alpha-carbonic anhydrase
publication title Structural Basis for the Inhibition of Helicobacter pylori alpha-Carbonic Anhydrase by Sulfonamides.
pubmed doi rcsb
source organism Helicobacter pylori
total genus 46
structure length 226
sequence length 226
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4ygfA00
3DC3A 2NNOA 1IF6A 1CVBA 3M2XA 1RZCA 4Q7SA 2FOSA 2CBDA 2QO8A 2WEHA 5SZ7A 1ZFQA 1J9WA 1RZBA 3CZVA 3CAJA 4Q8XA 4HU1A 3KS3A 4QK2A 4ITOA 1CZMA 1RZEA 1OQ5A 4Q07A 1CAYA 3M04A 4G0CA 3KWAA 4Q99A 1THKA 3MNKA 5CACA 1CNGA 4QSIA 3V3IB 5BNLA 4E3HA 3B4FA 1KWQA 1DMXA 4Q83A 1G54A 1FR4A 5SZ3A 4YGFA 9CA2A 1XPZA 4HBAA 4CNXA 1DCAA 4CQ0A 1ZSCA 2X7SA 4QIYA 3RZ0B 1BZMA 3MHCA 5FLQA 2NNVA 2HD6A 2AW1A 4QY3A 5EH7A 3T82A 3V7XA 1V9IC 1CANA 5FLRA 2NWYA 4Q7PA 3ML5A 3M1QA 3P3JA 5DSLA 3M2YA 4XIXA 4G7AA 3DC9A 2ABEA 4XIWA 4N0XB 4FIKA 4RUXA 3JXGA 3DCWA 4ILXA 2NNGA 1HUGA 1LG5A 12CAA 1BNWA 4KP5A 3MZCA 1ZH9A 3U7CA 3EFIA 5BRVA 5DVXA 2OSMA 1DMYA 3OILA 3SAPA 1YO2A 5JG5B 1TBTX 3M67A 4WUQA 1BNNA 4R5BA 1G3ZA 1AM6A 3DD8A 1IF7A 3K34A 4PXXA 4Q6DA 4CNWA 4RIVA 3Q31A 3RLDA 3RZ7A 4E5QA 3MWOA 2FNKA 4HEZA 1UGEA 2WEOA 1ZSBA 3ZNCA 1H9QA 1I9MA 1YDDA 1ZNCA 1CINA 3IBIA 4YXOA 4MLXA 3OKVA 1UGFA 2H15A 4FVNA 4HT2A 5SZ6A 2X7UA 5CLUA 4KUWA 4PQ7A 5FDCA 1IF5A 3M1KA 2NN7A 3PO6A 3ML2A 3T83A 2VVAX 1KOQA 3HS4A 3KKXA 1MUAA 2AX2A 2FNMA 1Z97A 3IEOA 5FLPA 5DOHA 3P3HA 1G0EA 1I91A 1ZE8A 4KUVA 4RUZA 4QK3A 3S76A 5L3OA 3RZ1B 1FSRA 4E3DA 4K1QA 3K2FA 1JD0A 4WUPA 3C7PA 3QYKA 3D92A 5DSJA 4HT0A 1KEQA 4Q0LA 4JSAA 1BNUA 4CNRA 2EZ7A 1I9NA 1IF8A 3KONA 1FSQA 3MHMA 4HEYA 2FW4A 3DBUA 3UYQA 4Q7WA 2Q38A 1I9PA 3SBIA 4ETQC 5DSQA 4RUYA 5SZ1A 1I90A 5JG3B 4KAPA 1IF9A 2NXTA 4XFWA 2NXRA 1G53A 1CCTA 1BNQA 1CA3A 1CNCA 3DVBA 4QSBA 3F4XA 3IAIA 4QSAA 5EKJA 4Q6EA 4PYXA 3T84A 6CA2A 3DAZA 5EIJA 5DOGA 3DVCA 1ZFKA 4FVOA 3P55A 3W6IA 3KOIA 3MDZA 5FNMA 4CNVA 3MNAA 2CBCA 2QOAA 5DSPA 4KNMA 3OYSA 3NJ9A 5J8ZA 2HFWA 1FQMA 2NXSA 4M2VA 1CVDA 1CNJA 3IBNA 5JEGB 4RIUA 1CVCA 1FR7A 4KUYA 1UGGA 1URTA 4Q49A 5E2MA 4LHIA 4Q87A 4WW8A 4XZ5A 2H4NA 4ZWZA 3B1BA 3S8XA 2CBAA 4MTYA 1G48A 5FNIA 5EHVA 4BF1A 1YDAA 3GZ0A 3CYUA 1G52A 3P5LA 1BN4A 4KP8A 3U3AX 4JSSA 1FQNA 2CABA 1FLJA 2EU2A 3M40A 3F8EA 2FOQA 3MHLA 3OKUA 3RG3A 5DSOA 5CJFA 2Q1BA 3S97A 4QIZA 1I9QA 4YYTA 5E5RA 3M2NA 5AMGA 1CNHA 3M5SA 1TEUX 4IDRX 4M2WA 4Q78A 5DSNA 1XQ0A 3FW3A 5E2NA 4E9OX 5FLOA 2CA2A 1FQLA 1CRMA 4RH2A 3T85A 3S71B 1CNKA 4Q06A 4QEFA 4QSJA 5E2RA 4YGKA 5G03A 5EOIA 4K0SA 1CNXA 4R59A 3M96A 5C8IA 3RYJB 3N0NA 3TVNX 4Q9YA 3FE4A 2WEGA 4Q7VA 4BCWA 1OKMA 5IPZA 2WEJA 3D0NA 3OY0A 4ZX0A 4RFCA 1TG3A 5DSRA 4Q8ZA 5FNJA 4E4AA 3MHIA 4TWLA 3L14A 3PYKA 1RZAA 1A42A 4DZ9A 3HLJA 1CCSA 3V3FA 4YGNA 1BNVA 4K0ZA 3W6HA 1CIMA 5JQTA 4YXUA 3RYZA 3F7UA 2HKKA 1CRAA 3JXFA 1T9NA 4HEWA 5DRSA 3V3JA 1HVAA 5E2KA 4TWMA 2HL4A 1ZSAA 2POVA 1BNTA 3DV7A 2QP6A 5SZ2A 3V5GA 4DZ7A 2HOCA 1H4NA 1YDBA 1YO0A 1G45A 3MNHA 3OYQA 2VVBX 2NWOA 4MDGA 5FL4A 1BN1A 4YX4A 3P58A 5FL6A 5SZ4A 1HCAA 1KOPA 2OSFA 3N3JA 4PYYA 2FMZA 2ZNCA 2WD2A 1I8ZA 4N16A 1CA2A 4WL4A 3JXHC 4L5VA 4M2UA 4QJXA 1I9LA 5EHWA 4KNIA 4M2RA 1CILA 5FDIA 1CCUA 1V9EA 5E28A 1RJ6A 1FQRA 4YGJA 4HF3A 2Q1QA 3V3GB 1EOUA 1CAJA 2FMGA 5SZ5A 8CA2A 1CAMA 3NB5A 3NI5A 3BL1A 3MYQA 4RFDA 4QJWA 1CAKA 3S78B 4QJOA 3OIKA 3IGPA 4WR7A 1KWRA 3S75B 5A25A 4Y0JA 4L5WA 4PZHA 3MNJA 4BF6A 4E3GA 5BRUA 1UGAA 4Z1KA 5AMDA 3SAXA 1CAZA 2HNCA 3P4VA 4FU5A 5EKHA 3VBDA 5EH8A 3DA2A 1CVEA 4RN4A 2CBBA 3F7BA 3RZ8A 3KIGA 3BETA 3MHOA 4JSZA 1UGCA 3HKTA 1YDCA 3TMJA 1CALA 1HUHA 5DSMA 3PJJA 5LMDA 3RJ7A 3KNEA 1I9OA 3P5AA 4FL7A 4JSWA 1HEBA 3N2PA 2W2JA 3IBUA 4KNJA 1TE3X 1ZGFA 3P44A 4Q08A 1BICA 3T5UA 1G6VA 5G0CA 2CBEA 1AZMA 2GD8A 2NN1A 4ZWXA 3RGEA 5FNHA 1AVNA 2FOYA 3M5EA 1CVAA 2NMXA 5EZTX 1RZDA 4ZWIA 3OIMA 4Z1JA 2X7TA 4X5SA 3M5TA 4MO8A 4YXIA 1CAIA 1JCZA 4JS6A 1HCBA 3D9ZA 5G01A 2O4ZA 2EU3A 3LXEA 4LU3A 3M98A 4UOVA 5A6HA 2IT4A 3UYNA 1Z93A 3KLDB 5JEPB 1XEGA 3RYVB 5HPJA 3M1JA 4Z1NA 5G0BA 1RAYA 1ZGEA 5JDVB 1JV0A 1TG9A 3FFPX 3M2ZA 4YHAA 4FRCA 1MOOA 5L6KA 1RJ5A 1TH9A 1G46A 4LP6A 4ZX1A 5JGSB 4CACA 4ZWYA 2FOUA 5JEHB 4MLTA 1G4JA 1H9NA 3M3XA 5EH5A 4QJ0A 4XE1A 5CA2A 5JESB 3K7KA 3S9TA 3ZP9A 3S77B 1CNYA 4ITPA 2NWZA 5BYIA 1BNMA 3CA2A 4KV0A 1CVHA 4QK1A 5FLTA 1CAOA 1UGDA 4WW6A 4GL1X 4C3TA 3V3HB 1LUGA 2WD3A 4CA2A 5DSIA 5BRWA 2NWPA 5FLSA 4MDLA 1CNWA 3MNUA 1HEAA 3KOKA 3D8WA 5JGTB 7CA2A 1TEQX 4QJMA 4Q09A 4L5UA 4K13A 5EKMA 3IBLA 3DD0A 5E5UA 4FPTA 4R5AA 1F2WA 3U47A 4QJPA 1FSNA 3S74B 1G4OA 4COQA 3DCSA 1CNBA 4K0TA 3RZ5A 1HECA 1UGBA 4Q90A 1LZVA 3U45X 5JQ0A 5FNGA 3EFTA 5AMLA 3BL0A 1BV3A 1BN3A 3N4BA 1CNIA 1TB0X 1DCBA 2FOVA 3MMFA 4KNNA 1CVFA 1G0FA 1RAZA 1BCDA 5SZ0A 5FNKA 4QTLA 3HFPA 1XEVA 1OKLA 3RYYA 3S73B 4YWPA 3HKQA 2POUA 3DVDA 1IF4A 2NNSA 1CAHA 3RG4A 2F14A 3T5ZA 5EHEA 1HEDA 1OKNA 2POWA 4Z0QA 4YVYA 2FNNA 3RYXB 3D93A 3M1WA 3MNIA 3V2MA 4E3FA 1YO1A 4Q81A 3R17B 4Q8YA 3V2JA 4ZAOA 3TVOX 3SBHA 1LGDA 4MDMA 2ILIA 3HKNA 4IWZA 5FL5A 3HKUA 5DSKA 4YGLA 1LG6A 5FNLA 1Z9YA 3M14A 3DCCA 1Y7WA 2GEHA 5E2SA 3S72B 1G1DA 4Z1EA 3R16A 4E49A 1TTMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DC3 A;  2NNO A;  1IF6 A;  1CVB A;  3M2X A;  1RZC A;  4Q7S A;  2FOS A;  2CBD A;  2QO8 A;  2WEH A;  5SZ7 A;  1ZFQ A;  1J9W A;  1RZB A;  3CZV A;  3CAJ A;  4Q8X A;  4HU1 A;  3KS3 A;  4QK2 A;  4ITO A;  1CZM A;  1RZE A;  1OQ5 A;  4Q07 A;  1CAY A;  3M04 A;  4G0C A;  3KWA A;  4Q99 A;  1THK A;  3MNK A;  5CAC A;  1CNG A;  4QSI A;  3V3I B;  5BNL A;  4E3H A;  3B4F A;  1KWQ A;  1DMX A;  4Q83 A;  1G54 A;  1FR4 A;  5SZ3 A;  4YGF A;  9CA2 A;  1XPZ A;  4HBA A;  4CNX A;  1DCA A;  4CQ0 A;  1ZSC A;  2X7S A;  4QIY A;  3RZ0 B;  1BZM A;  3MHC A;  5FLQ A;  2NNV A;  2HD6 A;  2AW1 A;  4QY3 A;  5EH7 A;  3T82 A;  3V7X A;  1V9I C;  1CAN A;  5FLR A;  2NWY A;  4Q7P A;  3ML5 A;  3M1Q A;  3P3J A;  5DSL A;  3M2Y A;  4XIX A;  4G7A A;  3DC9 A;  2ABE A;  4XIW A;  4N0X B;  4FIK A;  4RUX A;  3JXG A;  3DCW A;  4ILX A;  2NNG A;  1HUG A;  1LG5 A;  12CA A;  1BNW A;  4KP5 A;  3MZC A;  1ZH9 A;  3U7C A;  3EFI A;  5BRV A;  5DVX A;  2OSM A;  1DMY A;  3OIL A;  3SAP A;  1YO2 A;  5JG5 B;  1TBT X;  3M67 A;  4WUQ A;  1BNN A;  4R5B A;  1G3Z A; 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