4YJQA

Syk kinase domain in complex with inhibitor gtc000224
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
270
structure length
264
Chain Sequence
YLDRKLLTLEDKELGGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
publication title Discovery of GSK143, a highly potent, selective and orally efficacious spleen tyrosine kinase inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 264
sequence length 270
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yjqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yjqA01
2DUVA 3VUDA 2V55A 4PMSA 4Y5HA 5M55A 5L8LA 4O7NA 2BZHB 3P1AA 1Q99A 3TEIA 5B0XA 2BAKA 1YWNA 4OTRA 3UBDA 5KMJA 2X8EA 4FR4A 3RK7A 2VTRA 4KWPA 3HDMA 4UEUA 4RJ6A 2ITYA 4CTCA 1YXTA 1T46A 2WEIA 2R7IA 4D5KA 2RG5A 3ZUTA 5GZ9A 3F5XA 4RJ7A 5LMBA 1SVHA 3LOKA 5TE0A 2G2HA 4WHZA 3G2FA 3NAYA 4C2VA 1P2AA 4MK0A 2XK4A 5F94A 4PTEA 4RFYA 3BU5A 4YGAA 2CLQA 5HBEA 1SM2A 4ZXTA 2FA2A 1Y91A 3DBEA 4JR7A 4U97A 1FGIA 5KUPA 3QTIA 2JAVA 3EFJA 3G0EA 3FLQA 3Q52A 4FKUA 4K18A 2OU7A 2ZB1A 2X9FA 2RGPA 3TCPA 3JR1A 4R1YA 3R7YA 4CV8A 1WBWA 4PPAA 4O0XA 5J8IA 3H9RA 4FIGA 4RX8A 3ZSIA 5J7BA 3PY3A 4CFMA 3OCBA 5IA1A 2QVSE 4YSJA 5IDNA 3AC3A 3C50A 2VTOA 3QKLA 5CU3A 4BCQA 4F1OA 5TT7A 3FJQE 1J7LA 2O63A 4UB7A 3HV4A 4OUCA 2ITUA 1BI7A 3FQHA 3CTQA 3NW7A 2RKUA 4RBLA 4ZSJA 2YZAA 5IA3A 3ORIA 5FXRA 2X8DA 3OP5A 3C1XA 4P5ZA 4U9AA 4QMQA 3LMIA 1RDQE 3WOWA 2XMYA 4J95A 4AT3A 2FB8A 1Q8ZA 3U4UA 4FV9A 3NYOA 2Z7QA 3NMUF 4W4VA 4TXCA 1TKIA 3F88A 3HV3A 3BYUA 3WIGA 4TYIA 4QRCA 4R7HA 3VVHA 4D2RA 4JOAA 3LFSA 2PUPA 4BKYA 3FEGA 1OL5A 2ZMDA 3HV7A 3RMFA 2C3KA 4FKRA 3FY0A 4DGOA 4FNZA 4IB1A 2YWVA 2XNEA 1DI9A 2OIDA 4QMOA 4BICA 5ITAA 3D14A 4AW0A 5A4EA 2XUUA 4QNAA 4LOPA 2WAJA 2CJMA 4IANA 3Q4CA 3DZOA 1J3HA 3Q4TA 4MHAA 5EDPA 4XH6A 3R6XA 1H25A 2C4GA 3D83A 5FLFA 3G90X 3F3UA 3QQGA 5EKOA 2ERKA 3ALOA 5DPVA 5AUYA 2SRCA 5FEQA 3HMOA 4FKPA 5CEQA 4F7SA 3FSFA 5A4CA 4QO9A 2J0KA 3F3WA 4DTBA 1MQ4A 4CMUA 5KMOA 4R7IA 4DFUA 4O1PA 1Y6BA 3EB0A 4BCIA 3ORXA 5KZ0A 4FV0A 4O0SA 3R9DA 4N6YA 4RC2A 4S32A 3TKHA 4KKEA 5EM6A 4Q9SA 4BTFA 3ZBFA 4TN6A 1KE5A 5CAQA 4O0YA 3BYSA 2CMWA 3CTHA 4YLKA 4EHZA 3D94A 4FV8A 3TJDA 3H30A 2PUNA 3FUPA 3C4XA 4ENXA 2EUFB 3COIA 3R01A 4JG6A 4AN3A 4E6QA 5M4IA 3LQ3A 4FK6A 5HHWA 4IEBA 3POZA 5K5XA 3WZJA 2CLXA 2Y7JA 1QPJA 1R3CA 2IO6A 3L9MA 3VHKA 1YWRA 2XJ1A 1U59A 3D15A 2VAGA 2ERZE 1DM2A 5A4TA 4XNEA 4G6OA 4L01A 4BCOA 4KSQA 5C8NA 2UVYA 2QURA 3K3JA 3UODA 4EC9A 5ANKA 5HG7A 1WBPA 5DN3A 3NUAA 3GCUA 4IVCA 5E8TA 3AD4A 2X81A 2ITTA 4V0GA 5HE0A 2ITOA 4R7BA 3IO7A 2OICA 4LGDA 2YIYA 3RPOA 4OTQA 5F4NA 4AQCA 2I0HA 5I9VA 2FO0A 5IH4A 5JGDA 4C4IA 3WARA 1YDTE 4GU9A 3RAKA 3D5XA 4XBRA 2E9PA 4YPDA 2F7EE 4AP7A 5DIAA 5EOBA 4EOMA 3KRJA 3GI3A 2C69A 3R1SA 3U9CA 2XEYA 1DS5A 3HEGA 3LZBA 2WZJA 4FG7A 4IJPA 2JDRA 1UU3A 2XNOA 3SRVB 3BGQA 3DJ5A 3IW8A 4PTGA 4RFMA 3QD4A 1YI6A 2VV9A 4BZNA 4F7NA 3BRBA 5H2UA 3LVPA 4O7ZA 3NUXA 4E93A 5AV2A 3AT3A 3KK8A 4PMTA 3UP7A 5CASA 4FTOA 5L6PA 5C8MA 4N0SA 3FMNA 4O0WA 5E8WA 5FM2A 2XCHA 3JUHA 3G9LX 4WUNA 1OL2A 5M53A 1URWA 3WBLA 3DU8A 5JZNA 4C3PA 3O2MA 4XG6A 1UA2A 2JD5A 3Q6UA 5CQUA 2YDKA 4F65A 5KMNA 4HGEA 2GQSA 3PTGA 5AR5A 3GGFA 3POOA 4D28A 1GZOA 5H3QA 3LFEA 2P2HA 3FDNA 4YBKA 5ANIA 4FIHA 5JGAA 3PLSA 3W2QA 3GCVA 4U80A 4KAOA 4X3FA 4ALUA 4G3CA 4QQCA 4QP6A 1JSUA 2UW8A 3EYHA 4AACA 5IEXA 4OTPA 2JAMA 3R8ZA 4DITA 4UWCA 3NR9A 2AC5A 3RWPA 3FMKA 4APPA 5M4FA 1XWSA 4Z55A 2WMQA 3Q9XA 4QTBA 4OGRA 2WOTA 3FYKX 1YOMA 3FLZA 4JT3A 4MBJA 2PHKA 3LFAA 3ZFYA 2PVYA 1UU8A 4GH2A 4L3LA 4FIIA 3RK9A 4NIFA 4FZFB 4JR3A 4L43A 4EYMA 4ANBA 4OBOA 3V8WA 2CGUA 4EHGA 2QOKA 2ZMCA 4ZAUA 3PVBA 3V5LA 4A06A 2H34A 1QPEA 2ZM3A 3R1QA 3MY5A 2VX0A 3JXWA 5DR2A 3KF7A 5C27A 4ERKA 5M51A 1PXNA 2R3JA 3FQEA 4ASDA 3DZQA 4TWPA 2QOOA 3COKA 5BYYA 1MP8A 4MXXA 4DF3A 4JQ8A 2ZJWA 4NKSA 3QUEA 2QKRA 3OZ6A 4ITIA 2WD1A 4NZWB 4C58A 2QHNA 2VTTA 4BYJA 2UW6A 1ZYLA 2CNQA 2F4JA 3UC3A 4FKGA 4EH3A 3RINA 3SOAA 4P4CA 5AUUA 5CEKA 3WZUA 1YHSA 4F63A 4FUYA 3PVWA 3V6SA 3GU5A 4IMYA 5CI6A 3OG7A 3TDVA 2W0JA 1Y8YA 3HZTA 3CGOA 5HQ0A 1WCCA 2BDJA 4O0UA 4BBFA 3HLLA 3SXFA 4CEGA 4ZTRA 1APME 3CXWA 3IW5A 2QD9A 1JAMA 4G31A 3GU4A 3BE2A 4X2JA 2W4OA 3QC9A 4J8NA 1OUKA 5CENA 2E9OA 3MVHA 4CG9A 4O22A 2GCDA 1YI3A 3BLRA 3DJ7A 1B38A 3L8VA 1YXSA 5EW3A 3K5UA 4MQ1A 4EK4A 5CAOA 4AFEA 4DH7A 5JGBA 4C4GA 4TPTA 3IONA 1H08A 5J1WA 4TYJA 3PPKA 3UZRA 3OMVA 2GNGA 2WB8A 3IDBA 3MH1A 4ANLA 5AR4A 2BIYA 4BI2A 3Q5IA 4XMOA 1VEBA 3HMMA 1BLXA 3PUPA 4GIHA 4ZMFA 2XM8A 4PDSA 2JDOA 3BI6A 4U0IA 2Z7SA 4BDDA 1CKIA 1U54A 4F7LA 1OIQA 3PVGA 3NNWA 3CE3A 4DGGA 3W1FA 3Q4ZA 1H0VA 4D1ZA 5EYMA 5DEYA 2QODA 5E1EA 2PMOX 4C38A 2W9ZB 5T3QA 4UN0C 3ZRKA 4AGDA 1A06A 3DGKA 5IUHA 5CAUA 2XYNA 4H1MA 4RJ4A 3GVUA 1PMVA 5CZIA 4GUBA 2C6MA 3DLSA 4TRLA 5EI8A 2ZYBA 1BKXA 5C8KA 3IOPA 5DR6A 2B9FA 4ACMA 2B9HA 3MSSA 3EYGA 4LRKA 3CKWA 2I7QA 4QP2A 3UQCA 2X6EA 4RVKA 4QP7A 3P78A 3IK3A 4IAAA 4BBMA 2OK1A 4IFGA 3FMJA 2FSTX 3KXZA 3E8NA 4KIOA 5HG9A 5I3RA 2PL0A 1R0EA 3MIYA 4CMOA 4EORA 3RTPA 1TQMA 4FEUA 5AFVA 2YIXA 5LVLA 3HA6A 3KFAA 2OGVA 4UZHA 3P4KA 1ZY4A 2X4FA 4HVHA 3KN5A 2Y4IC 2P2IA 4IX5A 5H8EA 4JBPA 2WTVA 3AG9A 1RQQA 2OJJA 3FXXA 5GJGA 3EKKA 3F3TA 4ENYA 4W9WA 4YO6A 5F1ZA 5EQYA 3F5UA 4XEYA 4E6DA 4BVUA 5HNGA 3HUBA 3NCGA 4RVLA 4AN9A 3C0IA 3PXYA 3QGWA 4FT5A 4YZNA 4J71A 3P7AA 3U51A 5CSVA 1PMUA 2IW9A 2VWVA 3MS9A 4L9IA 2C30A 2W1FA 3NW6A 4FKIA 3SD0A 4QMMA 4UMQA 4FVQA 5DG5A 5HNBA 4W9XA 5AV3A 1MRYA 1URCA 3D7TA 3ATSA 4LRMA 3GENA 2QC6A 4F9WA 5JMSA 3AC2A 3PG3A 4AX8A 1GY3A 4D9UA 2BKKA 4R3PA 2J50A 3RPRA 3MFTA 4D2VA 2HXQA 1ZY5A 3FLNC 5I9YA 4IIRA 5C03A 4B99A 4F9CA 2YWPA 4X21A 4PL3A 1H1SA 2BZKB 5IQBA 4NJDA 1ZWSA 3JS2A 3FZ1A 2UW9A 3DNEA 3KY2A 2UW7A 5JRQA 3BLQA 4DGLC 5HNIX 1ZOGA 3A8XA 3LQ8A 3S3IA 5CI7A 3VAPA 5HVKA 5DE2A 3EN9A 3WZEA 4Y72A 3EQFA 4EH2A 2CGVA 3MESA 4BKZA 2I1MA 3VS4A 2YCFA 3ZLXA 3BKBA 3ZLYA 3N51A 2PZ5A 3FYJX 3E88A 2IG7A 1M17A 2REIA 5HG8A 4JIAA 4BWPA 2YIWA 2XK9A 3D5WA 3R7OA 4CGAA 4NSTA 1P14A 5EW8A 1NT2A 2XH5A 3OBGA 2W99B 3CQWA 1K3AA 1XQZA 2BIKB 4RWIA 4W8DA 3PLAE 1KOBA 4MVFA 2AUHA 5JKGA 1U46A 4CFWA 3FHRA 3V01A 5ANGA 3BQRA 5CXHA 2AYPA 3GNIB 4JJRA 3TWJA 1OL7A 1Q3WA 2F7ZE 4C33A 3SAYA 4ASXA 4O0TA 3BBTB 3PXQA 4G5JA 4HZRA 4YZ9A 1PF8A 2QO7A 2BR1A 5ACKA 3UTOA 4UMUA 5LMKA 3DBCA 3QQKA 4PP9A 2IZTA 4YTHA 4EEVA 2YA9A 3ZONA 4O81A 4O6EA 4I21A 3HRCA 2OG8A 4L42A 3TM0A 4DEEA 3QTQA 5LWMA 4EWQA 3E8DA 5E92A 5D9HA 5KKRB 4NUSA 3GOPA 3MI9A 5HU3A 3U6JA 4UYAA 4FEXA 2HW7A 1OL1A 1P4FA 3G0FA 4QT1A 2X2KA 4WG5A 4R1VA 1ZXEA 4IB3A 5LCKA 4RX5A 2C3LA 5FGKA 3A61A 1YWVA 3TZ9A 2GHMA 4CKJA 3DQXA 2QLQA 4IWOA 1PXIA 4KBKA 5KBRA 2WTCA 3ODZX 1WMKA 1TQPA 4D58A 2OO8X 3A2CA 3HV6A 1A48A 3D0EA 1PXMA 4HCUA 5BQ0A 3EQDA 2XIZA 2XKFA 4QTDA 4MTAA 4XV1A 4GK4A 3BWJA 5HX8A 2J2IB 2WMRA 3C0HA 5D7VA 5LVMA 3O7LB 5FTOA 5C9CA 2XIYA 3IW4A 4FTKA 4ZS4A 1HCKA 4GK3A 5FDXA 3KMUA 3UP2A 3BHHA 3AXWA 4ZJIA 2QOQA 3FXWA 3IECA 4GCJA 5J87A 2WTKB 3RNYA 3VNTA 3U55A 4HYSA 4D4YA 5M44A 5IMEA 3R9RA 4NYEA 4JLCA 4TYGA 4AT4A 2GDOA 3KVXA 4QP1A 4YR8A 5C4LA 5AMNA 3ZRMA 3FMMA 2FSMX 4L46A 4DFYA 1XH9A 4KRCA 1SVEA 4MD9E 3BZ3A 4BFMA 4JAIA 2YM8A 3VS7A 3EKNA 3WF5A 3C4EA 3BYVA 4OTHA 2YM4A 3KF4A 4E20A 3F2RA 4DBXA 2XNNA 4G16A 2WO6A 5LCJA 3TIZA 1BYGA 2W1EA 4K0YA 4FV2A 4YJQA 4H3BA 2C6KA 2HK5A 4I0RA 1OI9A 3BEGA 2UZTA 3TNPC 1UNGA 4DINA 2QR8A 4V0GB 3QCYA 4NFMA 3HRBA 4QMSA 3P7BA 4XS2A 5ETIA 5HVJA 2LGCA 3VBQA 3CQEA 4N6ZA 2FVDA 3MJ2A 3EN6A 3ORZA 4TWOA 4TWNA 5A6OA 5CALA 4LGHA 1RW8A 2OXXA 2Y9QA 4O0RA 4UXQA 4O7SA 3ZM4A 3QHWA 3UNJA 3PYYA 3W2PA 2WTDA 4E4MA 3OWKA 4EH6A 4F6UA 4FNYA 1UU9A 4ACGA 2QU6A 1Q41A 3BX5A 3F6XA 4ASEA 3ZDUA 2RFDA 3FI3A 4AA0A 4AGWA 2BFXA 4ZTSA 2JGZA 3ZXTA 3EZVA 4Z16A 1J7IA 1ZMWA 4BIDA 3U6IA 2C1AA 4FIJA 2IPXA 3O0GA 4CZTA 2JDTA 4HNIA 2IWIA 3R7VA 2YCSA 5IKWA 2ACXA 4YJTA 4RSSA 4G1WA 4FZ6A 5FM3A 4FL1A 3PDTA 3DY7A 4FTLA 1GZKA 2VWYA 4H3QA 2GNJA 2JKQA 3VQUA 2B55A 3VHEA 2A4LA 3OW3A 3HKOA 4XG2A 2GS2A 3PSCA 2UW5A 1VR2A 1YOJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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