4YKKA

Mnemiopsis leidyi ml032222a iglur lbd d-serine complex
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
NLIGRHLRLGSVEEQPFMFFATEGCEGNDCWSGMVNDMVVKLSEDLGFTYEYIQPDDRKFGALNKTTNEWNGMIRDLLDDKTDMIAIDLSTNSARKSAIDYSFPFMDAGIKAVVKGEGTTLNQVLELLDQDKYKWGVIGSRHPETLLKTHRDSRYSRLVDEGVELKDLNHAIETLRGGLFVFIDEGPVLAHNLISDCDVFSVGEEFQSFEYAFGLPKDSPYKSLIDSHLLKFREEGFIDILWEKWSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords ML032222a iGluR
publication title Glycine activated ion channel subunits encoded by ctenophore glutamate receptor genes.
pubmed doi rcsb
source organism Mnemiopsis leidyi
molecule tags Membrane protein
total genus 78
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ykkA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ykkA02
4WKMA 3TTNA 2D5WA 1URSA 3C36A 4MF3A 3ONMA 3RGYA 2B3BA 1B40A 1N7XA 1P1WA 4TLLB 3Q26A 2B65A 2VHAA 4YKIA 3KSXA 4F31B 4IO4A 3SEWA 3TDJA 2I58A 2Z8DA 3VXBA 3KBRA 1SD3A 3TZAA 1M5FA 3VE1B 3SEYA 4RPOA 2DYXA 1EZ9A 3EHTA 3W9WA 5AA3A 2QS4A 2Y7WA 2O84X 3IR1A 4EQ7A 3FJMA 4Q5TA 3MP8A 4ISUA 4GD5A 3G7WA 2V3UA 5KDTB 2HAVA 3B6WA 1S9TA 3S9EA 1QKAA 4MBPA 4R6HA 1B7UA 3QK6A 4RJZA 1B7ZA 3MC2A 5HPQA 2HZLA 1FQAA 1Z7ME 3RT6B 4GVOA 4C1TA 1H76A 2V25A 2ZNUA 2RINA 3K6VA 3Q27A 4KYDA 1QUKA 3TTMA 4OYVA 1B4ZA 2QMWA 2R6GE 1NH8A 1URGA 4JWXA 3CFXA 4C0RA 4GF8A 3SETA 4JXIA 4X9TA 4UACA 5ELVA 1M5CA 3HHFA 2P2AA 5JEIA 3EF7A 4NF8B 3E3KA 4M4GA 3MVZA 1WDNA 3EQ1A 3T9XB 3KFMA 1BTJA 1NKXA 1S50A 4R2FA 3B7DA 2HXWA 4XKQA 1PDAA 2FNCA 1Y9UA 2ANJA 4GQOA 1ZTYA 1H3DA 5JTYA 1IXGA 1HSJA 1Y4TA 2F5XA 1FTLA 4QSDA 5I56A 3PMWA 3SEUA 3GXAA 1I69A 1FTOA 5TPAB 3A3UA 3IK6B 2DE4A 2PBWA 5AA2D 5CBSA 4KPTA 2NWJA 4DXCA 4HCYA 4YICA 1USYH 3IOUA 3VLVA 1Y20A 2DOJA 1PBPA 5CC2A 1FQEA 1DTZA 1XC1A 3ODBA 5EHSA 4H5FA 3HV1A 2ZYOA 4F2QA 2REGA 4QFKA 4F19A 2OLBA 5HBCA 2YLNA 1MDQA 1DOTA 4F18A 4R74A 3RNNA 4EF1A 4EF2A 3IOTA 2XXUA 3S9LC 2DE3A 1IITA 2Q89A 3CVGA 1NNKA 3PD9A 3SEVA 1XS5A 1B46A 5JTYB 1DPPA 2Q8JA 4G8HA 2OWTA 4ZE8A 2NXOA 3MPKA 1B0LA 1Q35A 2UVGA 3I6VA 1B7HA 3THIA 1HSLA 2OWSA 5CRYA 2A5TA 1SDXA 3PMVA 1D9VA 3HPIA 4KHZE 1I6BA 3PPQA 3U94A 5I56B 4R9FA 2PX1A 4GXAA 1RYXA 1MY2A 5I2KA 2DE2A 4NMYA 1A7LA 1US4A 2HFBA 3QIMA 3C35A 2I0BA 3GZGA 3FXRA 4LATA 3SEXA 3FVKA 1YCJA 1ANFA 4OZ9A 2ONRA 4BDNA 1SBPA 5DT6A 4EQ9A 2XXQA 3OO6A 3QUJA 5TP9A 4OWDA 3E9XA 3ZKKA 2ZMBA 2H99A 1MPDA 1POTA 3E4RA 1B2HA 1AMFA 2I0CA 1FTKA 2Y7IA 3S2VA 3U92A 3OELA 4OQOA 3EHSA 4TLMB 3CSGA 1MM7A 1B5IA 2DXRA 3PUXE 3C31A 3C32A 4QFLA 4XXUA 1UTBB 1A8FA 3CR9A 2A5TB 4PFWA 3ZSFA 1D3KA 4PP0A 4AB6A 3KEIA 3PUYE 3B6QA 4BLAA 3CG1A 4LP2B 5ICTA 1T0KA 1MH4A 5I2KB 3K02A 3PPPA 3A09A 5CMMA 3K4UA 1SQYA 3MQ9A 4QSEA 2OCUA 2F78A 4IO6A 1LBBA 5DVFA 5TP9B 2Z23A 1B1XA 3R7XA 1XHYA 4XKRA 2X26A 1S7YA 3FVOA 5CI5A 3TTKA 3UN6A 4JWOA 2P0SA 4IO2A 3OSRA 5F7VA 2IEEA 1UTHA 4LVQA 1B0HA 2ZYNA 2DQVA 2F6GA 3WAFA 1Q1KA 1IXHA 1BKAA 1QUJA 4E0XA 4NWCA 2HZKA 3JYRA 4GL8A 3BKIB 3RY3A 2Y84A 3P7IA 3T9HB 3R26A 1TFDA 3MWBA 4BDQA 3FV2A 4Z0IA 4MLQA 1PEBA 2F34A 4JBZA 2AL4A 4QHQA 3O6HA 1JEVA 3K1NA 2RF1A 4ZEIA 3SESA 4IY5A 1MS7A 4EXLA 3D4CA 1P1NA 4LZ7A 1LFGA 3KN8A 3O9PA 4EXKA 1IXCA 4XKNA 4GXSB 1IZ1A 2I6EA 4RY1A 3M3FA 3TYHA 4H65A 4WXJA 4BDOA 1ZJLA 1LAHE 1H43A 4JSOA 2Q2AA 1PB7A 2OZZA 1GVCA 3RQTA 4X1DA 4FAJA 1JW5A 4NWDA 1UTHB 3TQWA 1UQWA 1QKBA 4OETA 1MXUA 3ILTB 5B70A 4ECFA 3V83A 3G3GA 1N0TA 3T9UA 5CMCA 2IA4A 4U1ZA 1SI0A 1MQHA 3IORA 4NF5B 4BDRA 4DZ1A 1EZOA 1B1HA 1LLSA 1MM6A 4F1YA 2LAOA 4ELOA 4NEDA 1JW4A 2E1SA 3ILUB 4IY6A 3PPRA 1NL5A 1B3LA 2DVZA 1BP5A 3K1PA 2HQ0A 4PFYA 1B5HA 3LUYA 5I58A 3TKDA 4QF9A 4PQJA 2NUVA 1H45A 3ZS6A 2Z8FA 1MPCA 4ELRA 1XVXA 3QAXA 1OQGA 3H3GA 4OVJA 3PMXA 4OEVA 3K6UA 5L9MA 3KJTA 3FD3A 1B6HA 3MP6A 5KCJA 4Z7EA 3U72A 2D3IA 4FECA 4G68A 3ECRA 2A5SA 1B51A 4POWA 3QSLA 5H8QA 3MZBA 2ESNA 5TU0A 1LCFA 4LA9A 2WKYA 3TMGA 3QXMA 5DEXA 5DTBA 3RTFB 1MY0A 5FTHA 4DE8A 2H9BA 1NFTA 3MZ9A 2F35A 5I2NA 3FATA 3G3FA 4U1OA 4G8MA 1IQ7A 2XX9A 1N84A 3GLBA 4XTCQ 3CIJA 3CI8A 1QUIA 3FZVA 1Z7NE 2VOZA 4YAHX 3IL1B 3DM0A 3H6UA 4I9DA 1WODA 3A3CA 5L9OA 1O63A 3IOVA 4ELPA 4DXBA 5KCJB 5ISUA 2QMXA 1LB9A 3VDFA 2GHAA 2F97A 1RYOA 1B32A 3U93A 2O51A 4XKPA 5H8QB 1O64A 2UVIA 2GH9A 1TWYA 5EYFA 2R71A 4YB5A 1LAFE 5DEXB 4ESXA 3HN0A 2RC8A 1OIBA 1Y1ZA 5H8FA 1JQFA 3RUMA 2UVJA 2DWJA 2QPQA 5I2NB 3H06B 3MVWA 2XXPA 1NNFA 3FV1A 3O29A 2VGQA 1B58A 3PUWE 3RN8A 4Q0CA 4OEUA 1FQDA 2F7CA 4H1XA 4RK2A 3M3KA 1B52A 1R9QA 3LC8A 2PT1A 2PVUA 4WEDA 1A55A 2Q9TA 1AOVA 3RT8A 1N3XA 2B3FA 4O3BA 1R9LA 1OLAA 3IOWA 1EH3A 5DYHA 3H03A 3OD7A 4DIGA 5H8HA 3C4MA 4NE4A 5H8SA 1QW0A 1ZIUA 1MY3A 4PE5B 2V84A 3F11A 4TOZA 1A99A 3TEPA 4DDDA 3MVYA 3E13X 1MY4A 5K2YA 3I5OA 4U22A 3H6VA 3O66A 1EZPA 2M8CA 1PBQA 3G3KA 1JVXA 5H8FB 1MXXA 2Y7RA 1ZKBA 1B4HA 2F8DA 2XXWA 4JDFA 5M2VA 1II5A 3S4UA 3TAJA 2O68A 3HHGA 3VLUA 4LZ8A 2F7AA 4IO7A 2QJEA 2ABHA 3UIFA 4P0IA 3S9MC 1BIYA 3LBSA 3BFTA 4GLIA 1QJMA 3PD8A 3IJXB 5AA4A 4FE8A 3KN3A 4MFIA 5IAIA 3VVFA 1SYHA 5CMKA 3T9VA 3VLWA 5H8HB 3W15C 5ITPA 1M5BA 2XHDA 2DXYA 2THIA 4H8IA 4ZEDA 3IJOB 2DVCA 3SERA 3TUSA 3N5LA 3WAEA 3HSTA 3FUZA 3O6IA 1O7TA 5LOMA 4EUOA 3IB2A 1GR2A 3FVGA 1Y3QA 2F6PA 3H6TA 3RLFE 3DLNA 1KWHA 2ALUA 1PC3A 1P1UA 5ICQA 3KN7A 4FATA 2I4BA 2ONKE 4YU0A 4ZZEA 4NF6A 3OOAA 4OERA 1YPNA 2FA7A 3MP1A 3S9NC 5IKBA 1FQFA 4L17A 5I57A 3QUFA 2DP8A 5BWJA 4I8CA 5FHMA 1GGGA 2BJJX 3N6TA 2V3TA 3G3JA 1CE2A 1A40A 5HM4B 3I3VA 3JZJA 2QS1A 4N07A 4ZE9A 3K6WA 3Q25A 5B7DA 1SI1A 4HW8A 3SDFA 1XOCA 1US5A 2DS9A 2UXAA 3MBPA 1ZBMA 4ONYA 2O7UA 1R1NA 3K6XA 1LAXA 3KGCA 4WEPA 1JVYA 4H0WA 1H44A 4N6PA 2I49A 3Q28A 2F7BA 4OFLA 3G3HA 3PUZE 4KYEA 1GTKA 4X1BA 4THIA 1SW1A 3T93B 1M5EA 3UORA 1NNPA 4Q8RA 3CFZA 2XD3A 3PUVE 2OJTA 3MPLA 2I4CA 4YZZA 3MW0A 5I57B 4AB5A 3VXCA 4E0WA 2PMSA 4G2ZA 2DWHA 3FXQA 2OK2A 5I59A 2VD2A 3QYTA 1POY1 3EHUA 3LSFB 5KZTA 3MZ1A 4UA8A 5ITOA 2NOOA 3ZKLA 3FGSA 4OHNA 4YKPA 1UIUA 4GOTA 4QFPA 5FHNA 2UVHA 3H4ZA 3KG2A 4U21A 4RNSA 4LONB 3TTRA 1LSTA 2Q2CA 3CRBA 4LUBA 1RKMA 2PYYA 1AH5A 1OQHA 2XXVA 1F9BA 1FQBA 3HO7A 3O97A 2QSXA 4ZEKA 4ZZAA 1MH3A 3T96B 1A8EA 3N6UA 2XXRA 1D9YA 1D4NA 4EDPA 2P1SA 1SW4A 5FHOA 1TT1A 4DXUA 5KDTA 5J1DA 5AE4A 4I62A 2O7IA 4G77A 1LGBC 4F3SA 3U1OA 2RC9A 4ND9A 2ZYMA 1MG1A 3L6HA 2DSFA 4O3CA 5I59B 3G3IA 2Y7PA 1LFHA 1DMBA 2H4IA 3M3LA 1HSEA 3O28A 4QFNA 1DPEA 1Y1MA 3M8UA 5L9SA 2DWAA 4H6DA 3OO7A 3GBAA 2XXHA 2UYEA 3CFLA 3UGWA 1R6ZA 1MY1A 4QFOA 1Y3NA 3D4GA 3KOSA 4NF8A 4C1UA 2ZNSA 4OXVA 3K1MA 3DELB 4IGRA 2V3QA 1LBCA 4F3PA 3MAMA 1FCKA 2D21A 3IO6A 4G8NA 1N04A 5AA2A 3HCQA 1I6QA 1VFDA 4IO3A 3PPOA 3TODA 1OVTA 5I58B 1FQCA 3FVNA 4ESWA 1VE4A 1MXWA 4KYSA 4KQPA 3H7MA 4H8JA 1Y3PA 2HAUA 2XXTA 2YPNA 3FJ7A 2ZXTA 3OXNA 1B05A 3TPAA 3V89B 4FORA 2V93A 4R73A 2I3WA 5TPAA 4F22A 2VP1A 4OESA 4AQ4A 1TXFA 1DSNA 1DTGA 2HEUA 2XX7A 1B3FA 4G68B 1ZU0A 1N7WA 4P11A 4R75A 5H8NA 1AL3A 1B3HA 4ZECA 1NNTA 4MH5A 1N76A 3VVEA 3CSBA 2XX8A 4GFRA 3TCHA 4DLDA 4U2RA 1JW1A 3TQLA 1XVYA 3LSXA 5EHMA 3BFUA 5AA2B 3U8QA 3OO8A 1B5JA 3TCFA 2XXYA 4KI0E 4PFUA 3OMBA 5AA1A 1LCTA 3OENA 4R72A 3UK4A 2OBGA 3PPNA 2G29A 2QS2A 1I6AA 2Y7KA 3FIRA 3K01A 1B3GA 3KSJA 4FEDA 2QS3A 3UP9A 1SW2A 3PGFA 4RPNA 4RK9A 4ZEFA 3GBBA 3VVDA 4G68C 4TQUQ 3TTLA 4JSDA 4M1VA 4IB2A 1MQIA 4F3BA 5H8NB 1CB6A 1MXZA 1Y4CA 3IX1A 3T66A 1OMPA 2X7QA 2Z22A 3V8XB 1VR5A 1ZLQA 1MRPA 1MQJA 4DCXA 4OMBA 1PB8A 5A5XA 4OENA 1FTMA 4POXA 4KD5A 4GL0A 2AYSA 2H5YA 3CG3A 4HCWA 3R6UA 1SYIA 3K2DA 1ELJA 2QRYA 4F2OA 1P1OA 1EU8A 5CBRA 1UTBA 1YAEA 2XXIA 2O1MA 4LQ5A 2I48A 4ELQA 1IEJA 2F36A 2ZNTA 1URDA 5L8DA 1UIVA 1NMUA 3EN3A 1LFIA 1TFAA 1MPBA 1OLCA 4F29A 4KR5A 2HCAA 4R6KA 5K2XA 4MLVA 4YKKA 1OVBA 2GFEA 2GRVA 1MQDA 1GV8A 2Q88A 1MXVA 5DVIA 3DP6A 4F1VA 3Q29A 1VFEA 4NF4A 5CM6A 2GHBA 3DP4A 4PETA 4GRKA 3VV5A 3W9VA 3C9HA 3RPWA 2AL5A 5FTIA 1MXYA 4EQBA 1JETA 1MDP1 2NVUB 4ZEBA 1LAGE 1MQGA 3IB1A 5A5XB 4U4SA 4GIZA 2X7PA 2G93A 3FASA 3LSLA 4F39A 1IUDA 5DVJA 2RC7A 4PFTA 3TFLA 5JK4A 2ONSA 1LB8A 2E0SA 4YMBA 3AXFA 2RCBA 4KFQA 1J1NA 4RYAA 3BBRA 3K0VA 3JV9A 1AIVA 4JWYA 5AA4B 1B9JA 3UA8A 1QULA 2FYIA 2O69A 1IIWA 4F3GA 1XT8A 4G4PA 4HTGA 1P1QA 2H25A 4KCDA 3V5AA 3DP8A 3KOTA 5BUUA 4QRZA 1L5TA 1PB9A 2CMOA 4NTLA 3C33A 1P99A 4H5GA 4FEBA 1SVXB 4NF4B 2RCAA 4O3AA 3LR1A 3K00A 3VFJA 3N26A 3MUQA 4KCCA 4BDLA 2R9JA 4LQ2A 1YTVA 1M5DA 2REJA 2KLFA 3LSWA 3L6GA 4YB7A 5CMBA 3C34A 4OFOA 2W7YA 4BDMA 3N94A 4LZ5A 3TCGA 3KZGA 4P0GA 2VD3A 4K3FA 2UYFA 2PT2A 3RTWB 1FW0A 4NF6B 4IGTA 1JEUA 3MJNA 2CZLA 1ZMGA 1NH7A 4NF5A 3IO4A 1IXIA 3B6TA 3OEMA 1VSOA 3SKPA 1USYE 3H6WA 1A54A 4U4XA 4YMAA 3TELA 4N13A 1B3EA 4R9GA 3O6GA 3IB0A 4OFJA 5F1QA 4X48A 4IO5A 2XXXA 2DWIA 1SW5A 4Q30B 2QL3A 3FJGA 4FIMA 1JNFA 5I84A 2O1LA 3PU5A 1WVJA 2Z8EA 2XD2A 4RA1A 4QSCA 3KJ7A 3USDA 2ZYKA 1N3WA 2YJPA 4ZS9A 3O2AA 4H67A 3T22A 2H98A 4R2BA 4F1UA 3MVXA 2RKMA 4GWOA 2I3VA 4RXLA 1FTJA 3EPEA 4HS7A 2AIXA 4FJPA 4YKJA 4ZDMA 3OO9A 1ATGA 4U23A 3PV0E 3IAZA 3FXUA 4JB7A 4DCYA 2O6AA 3OEKA 4XIGQ 3OSQA 1QVSA 1BLFA 4YB6A 4R6YA 4OTEA 4I1DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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