4YMAA

Structure of the ligand-binding domain of glua2 in complex with the antagonist cng10109
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure-Activity Relationship Study of Ionotropic Glutamate Receptor Antagonist (2S,3R)-3-(3-Carboxyphenyl)pyrrolidine-2-carboxylic Acid.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ymaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ymaA02
2Q9TA 1MS7A 2O1MA 4F3BA 1WDNA 3ILTB 3TTMA 1I69A 3T9XB 3KN3A 3RTFB 4QSCA 2VD2A 1TXFA 3FXUA 4YB5A 5ICQA 2V25A 1IUDA 2GFEA 3H06B 3VLWA 1B0HA 3CSGA 2XXIA 4C1UA 3G7WA 3LUYA 1P99A 3OXNA 1FQBA 2HQ0A 2OZZA 1R6ZA 3UIFA 3IR1A 1PB9A 4RXLA 4KCCA 1XVYA 2XXUA 1GV8A 1P1WA 1Y4TA 3IOUA 4NF8A 2VOZA 1M5FA 2OCUA 4JWXA 2UVGA 2GHAA 2PBWA 4IY5A 4HCWA 3O66A 4IO2A 5H8FB 1Y9UA 2R9JA 1BLFA 4QFPA 2VHAA 3KN8A 4OFLA 3EHUA 3DELB 4XXUA 1O7TA 4MLQA 2DWIA 1A8FA 1Y4CA 2I6EA 1MH4A 3Q28A 1QVSA 4LP2B 5HBCA 3VLUA 4OTEA 4XKQA 1YCJA 1LAGE 4YMBA 3PD8A 3CR9A 3PD9A 1UTBA 5AA1A 3OO9A 2F36A 3FASA 4QFOA 3K2DA 3FJ7A 3TYHA 1IXHA 4NEDA 2ABHA 1Y1ZA 1VSOA 1N3WA 1B3LA 1VR5A 4RY1A 4GXSB 1YTVA 1XS5A 3G3FA 1NNTA 1URGA 3VE1B 4QHQA 4M4GA 5TP9B 1II5A 4MFIA 3TELA 5AA3A 4IO5A 3MPKA 3B6TA 4BDQA 1SW1A 1OLCA 1ZKBA 4H6DA 4R6YA 1JEUA 2DWAA 1US4A 1VE4A 2Q2AA 1MY2A 4TQUQ 1SYIA 3TMGA 5CC2A 4N07A 2DE4A 3PPRA 2Z8FA 4OFOA 1B6HA 5H8HA 1QUJA 4PETA 2HZLA 2Y7WA 3G3IA 3I3VA 3RT8A 3MP8A 3U93A 3PPQA 1GGGA 2UYEA 4XKNA 2D5WA 3R7XA 4QFKA 3FXRA 2H4IA 2AL5A 4Q8RA 2Q8JA 4YKJA 5L9MA 3Q26A 1JETA 4OFJA 2H25A 3MZBA 4O3CA 4KYDA 2DE3A 3U72A 5I58B 2D3IA 1LBBA 3O28A 4R2BA 4DZ1A 4H5FA 4KPTA 4YKPA 1RYOA 3SEVA 1D9YA 1MPBA 4L17A 1H76A 4G68B 4LQ2A 3PU5A 4OWDA 4UA8A 3DP8A 2QS3A 3BFUA 1MXUA 3MWBA 1FTKA 4GQOA 1R9QA 1B40A 4NF5A 2DVZA 2Z8EA 2NWJA 1MPCA 4U1ZA 3FXQA 3QUFA 5M2VA 3S9EA 2XXWA 3PUYE 1MDQA 2NVUB 3VLVA 1AOVA 3G3GA 1A55A 1BTJA 4GIZA 4GL0A 3CI8A 3W9WA 4OYVA 3FGSA 3KZGA 1WODA 1HSEA 5ITPA 3U92A 4F18A 4NF4A 5IAIA 3RQTA 4RNSA 5I59A 3WAEA 1UTHA 4HTGA 3QUJA 2NUVA 4G8HA 3MPLA 4R9FA 3MVWA 2M8CA 1QKBA 1Q35A 4F39A 3UK4A 3TQWA 1H3DA 3KFMA 2ZNSA 3VVFA 4JBZA 3JYRA 3FD3A 1ZBMA 4DCXA 4ELRA 1NL5A 1MG1A 4R75A 1DSNA 3K0VA 4F1UA 3PMWA 1POY1 1LGBC 4EDPA 1SDXA 1N7XA 4Q0CA 1B9JA 3PGFA 3H6UA 3M3KA 2QSXA 4I9DA 3O2AA 3LSFB 1B1XA 3QXMA 4IGTA 4QF9A 3IB0A 4U1OA 3S9NC 4DDDA 4F1VA 5KCJA 1VFDA 2H98A 1MQJA 3B7DA 2XXYA 3V83A 4OEVA 3OEMA 1IXCA 4JB7A 2O51A 4U22A 5CM6A 2DE2A 2F6GA 3K02A 3HPIA 4I62A 1B3GA 1CE2A 1SI0A 4R9GA 1NNFA 3UORA 5DVFA 3SEWA 3FVKA 4JWYA 3R26A 1H44A 5AA2A 2O7UA 4KCDA 3PUVE 5FTHA 1I6QA 1USYE 3PUWE 3KGCA 4THIA 3DM0A 2V3TA 3H4ZA 2HEUA 3CG1A 1QW0A 3K6VA 3N5LA 3CVGA 1EZ9A 5ISUA 2XXRA 4ZECA 3R6UA 3PMXA 1N7WA 4F29A 1T0KA 2UXAA 4ZZAA 4FEDA 4ZEFA 1POTA 1MPDA 4EQ9A 1MH3A 3TCFA 4RK2A 1ZMGA 3RNNA 3T9VA 4GVOA 3K1PA 4YKIA 2G93A 3H03A 1JEVA 1LBCA 2PT2A 3B6QA 1O64A 1A7LA 5TU0A 5JEIA 3QK6A 4POXA 2O69A 4XIGQ 3K00A 1FQDA 3V89B 4DE8A 2RC7A 3TDJA 4F31B 3RPWA 1SVXB 3IJXB 1B3FA 2DWJA 4HCYA 4F3GA 4I8CA 3FVNA 1XVXA 4ELQA 4GXAA 2Z8DA 1IIWA 3O97A 3D4CA 4BDOA 3M3LA 1LCTA 1MXVA 2YPNA 1D9VA 1USYH 4OZ9A 2Z22A 3MVXA 3O9PA 2F34A 2BJJX 2ZYNA 4EQBA 4LZ5A 1LFGA 1MQHA 2HCAA 3ODBA 3L6HA 1IQ7A 4R6HA 2XXTA 2DXYA 1JNFA 5AA4B 3B6WA 4FECA 5F1QA 3EF7A 4JSDA 5A5XB 3EN3A 4MH5A 1QUIA 4OQOA 4KQPA 2ZYMA 1H43A 1P1UA 3T9UA 1B52A 1LLSA 1GTKA 1XC1A 2PT1A 2QJEA 4OERA 2OWTA 4YU0A 1B46A 1TFAA 3F11A 4ZDMA 4OETA 5H8QA 3W9VA 3PPOA 1OVTA 2OLBA 5BWJA 2OWSA 1B05A 1DTGA 2V93A 4ESWA 4YMAA 2H99A 2QS4A 3UN6A 3KSJA 4QSEA 2CZLA 2QS1A 1LB8A 3IOTA 1A54A 1MY3A 1PBQA 2DS9A 2WKYA 2HAVA 2OK2A 4BDMA 4FJPA 3ILUB 1J1NA 4OESA 4X1BA 2F97A 3OEKA 1D3KA 1Y3QA 4YB7A 5L9OA 2A5TA 1ZTYA 3TQLA 1LFHA 3PPPA 3TUSA 1OQGA 4NWDA 4PFYA 3V5AA 3O6GA 2A5SA 3FJGA 3RLFE 2RINA 4WXJA 4G8NA 4MF3A 2PYYA 4U2RA 1YPNA 3VV5A 2XXHA 5F7VA 4G8MA 2XXXA 2RKMA 4NF8B 2F7AA 2I3VA 2RC8A 3IOVA 5FHOA 3TZAA 3MBPA 1XHYA 5BUUA 3TAJA 4AB5A 4PFTA 1IEJA 4DXBA 3IK6B 3CG3A 4JXIA 1MXWA 5H8NA 4IO4A 2P2AA 2B65A 3OENA 4NF6A 3FV1A 4E0XA 2QRYA 1OQHA 2I3WA 1BKAA 3MZ9A 1SYHA 2F6PA 4JSOA 5CMBA 3QIMA 3C32A 1B2HA 4ZEIA 4OENA 4ZE9A 1MXYA 1NH7A 2HFBA 1UTBB 1IZ1A 4LONB 3IO4A 3RTWB 2D21A 1A40A 3ZKLA 3O6HA 4IB2A 3GBAA 2O84X 1Q1KA 4GRKA 1DOTA 4H1XA 1LSTA 1FTMA 2H5YA 1OIBA 4U21A 5I57A 5JTYA 5L8DA 3C31A 4EF2A 3K01A 1AH5A 1NKXA 4OMBA 1B5JA 3Q25A 2YJPA 5DT6A 2G29A 5B70A 3SEXA 4FORA 3K6WA 3KJ7A 1N76A 2Y7KA 4HS7A 4WKMA 5HPQA 3JZJA 2R6GE 1LAFE 4RJZA 5H8HB 5TPAA 4N13A 3QAXA 5IKBA 2DP8A 1JW5A 2OBGA 4ND9A 3HO7A 2UVIA 1MY0A 1DTZA 3LSLA 1PB7A 4R73A 1FTOA 1RYXA 2E1SA 4F2OA 3E9XA 3CFXA 3DP4A 4PFWA 3TPAA 2DXRA 1GR2A 4H8JA 3UA8A 1FCKA 3PUZE 4IGRA 4IO6A 3RY3A 3N26A 1B4HA 5I56A 3TCGA 1NNKA 3BBRA 2I49A 1JVYA 3A09A 2E0SA 2FA7A 3GZGA 3TODA 1S7YA 3HV1A 1JW4A 4QSDA 5I2NA 1M5EA 3FATA 1P1QA 3KSXA 5J1DA 1M5DA 4ZE8A 1I6AA 2O68A 1FQAA 3MUQA 1PBPA 4PE5B 3K6UA 4RA1A 2DVCA 1NFTA 3G3KA 3HHFA 5KDTA 3PV0E 2B3FA 5CMMA 2XXVA 4KR5A 1MXXA 1FQEA 1B3EA 1B7UA 3V8XB 4H65A 4Z0IA 3SKPA 3T22A 2Q2CA 5HM4B 3VFJA 4NF4B 3O6IA 1UTHB 1B3HA 5DEXA 4R72A 3IO6A 1S50A 3TTKA 3M3FA 4ZEBA 1EH3A 2I0BA 2PVUA 1QULA 3VXBA 2Y84A 4F1YA 4Z7EA 4R6KA 5LOMA 4G2ZA 5I2KA 3BFTA 4TLMB 3OO6A 4PQJA 4C1TA 2F7BA 2XX7A 3OO7A 2VP1A 1EZOA 2VGQA 2AYSA 2KLFA 2UVHA 3MVYA 3U1OA 3KBRA 4YZZA 5K2YA 1MY4A 2XD3A 3IOWA 2IEEA 3THIA 3OOAA 4M1VA 3T96B 1B32A 3K1NA 3RGYA 3HN0A 2V3QA 5KCJB 3MQ9A 4Q5TA 2P1SA 1SBPA 3OSQA 3EPEA 4RYAA 3A3UA 3MP1A 3SERA 2ZXTA 4LZ7A 4N6PA 3ZSFA 1RKMA 5AA4A 3EHTA 4FAJA 4LZ8A 3GLBA 2ALUA 3ZKKA 4E0WA 2GHBA 3HSTA 2DSFA 1HSJA 2REGA 4EF1A 4P0IA 1EU8A 3W15C 2RC9A 3UP9A 2ZNUA 3TFLA 5AA2B 4GFRA 3ONMA 2ZMBA 1NH8A 3LC8A 2F78A 1Z7ME 5H8FA 2AL4A 3ECRA 3TEPA 4DLDA 4QFLA 3IAZA 4H8IA 4GOTA 1B1HA 1P1OA 3I6VA 1MM6A 3Q27A 4X9TA 3VVEA 3H6WA 5ITOA 1DPPA 1PDAA 3E3KA 2CMOA 3C4MA 1IXIA 3EQ1A 3K6XA 3TTNA 3OELA 3SETA 3C35A 3PPNA 3T9HB 2Z23A 3JV9A 3U8QA 3CFZA 2ANJA 1P1NA 3FVGA 4WEDA 4KI0E 1MQIA 4LUBA 1QUKA 3PUXE 1AMFA 5FHMA 5CRYA 1MXZA 2XXPA 1QJMA 4FIMA 4ONYA 1UIUA 5L9SA 3SEUA 2F35A 1B0LA 2IA4A 3TTRA 4EQ7A 1R1NA 3TKDA 3DLNA 3FZVA 2QL3A 3LR1A 2ZNTA 4LQ5A 4RPNA 2PMSA 1OVBA 3U94A 3AXFA 5CMKA 4ZEKA 4XKRA 5TP9A 4GD5A 3OO8A 1SQYA 2H9BA 5H8SA 1JW1A 1TT1A 1O63A 3GXAA 4JWOA 4ISUA 1Y20A 5ELVA 2NOOA 1NMUA 3KEIA 2YLNA 4G68C 1PEBA 2UYFA 2P0SA 1MQGA 4PP0A 1A8EA 2F8DA 1B7ZA 4ECFA 1UQWA 3SESA 1N84A 2ESNA 3USDA 3MJNA 3RT6B 4KD5A 1FQCA 2O1LA 2I58A 2XX9A 2ONSA 4H0WA 1Y3NA 1DPEA 4OXVA 1BP5A 3TTLA 3D4GA 3VVDA 5KZTA 2Y7RA 4U4XA 4P11A 1TFDA 5I58A 1URSA 4H67A 2F5XA 3OSRA 3ZS6A 3KOSA 4AQ4A 5CI5A 1JVXA 5H8QB 4DCYA 2RCAA 4G68A 3MP6A 3CFLA 5AE4A 1ZJLA 1M5BA 1N04A 4IO3A 3CSBA 4C0RA 3S4UA 4BDLA 3IJOB 4LVQA 4ELOA 4H5GA 2VD3A 3H3GA 1A99A 1MDP1 1PB8A 1N3XA 2O6AA 4NWCA 2UVJA 1LCFA 3LBSA 2I48A 4GLIA 2REJA 3OD7A 4K3FA 5B7DA 3G3JA 3MZ1A 5ICTA 4F22A 4JDFA 1ZIUA 2ZYOA 2ONKE 2A5TB 3KN7A 4PFUA 1WVJA 4ZS9A 5K2XA 4QRZA 1ANFA 2DQVA 4XTCQ 1OLAA 2XD2A 3P7IA 3FUZA 1UIVA 4FATA 3UGWA 1S9TA 2XXQA 1SW4A 4DXCA 3C34A 3T66A 3K1MA 4TOZA 1LAXA 4G4PA 4EXLA 2AIXA 4FEBA 2ONRA 1MY1A 4QFNA 4BDRA 2Y7PA 3IB2A 3VXCA 1OMPA 1PC3A 2GRVA 4IY6A 4F19A 4BLAA 4YICA 5H8NB 1ATGA 2DOJA 4KYEA 4ZEDA 3G3HA 3HCQA 4NF6B 3MW0A 3HHGA 2V3UA 1ZLQA 3SDFA 1KWHA 1IXGA 1SW2A 1B51A 1Z7NE 1L5TA 2QMWA 4U23A 1DMBA 4KFQA 4WEPA 1NNPA 5JK4A 1URDA 4X1DA 3A3CA 1LAHE 3IX1A 4GF8A 4F3SA 1CB6A 3GBBA 1B58A 4FE8A 5I84A 5EHMA 3C9HA 3RN8A 3N6UA 1SD3A 3S9MC 2V84A 3H6TA 4EXKA 3LSXA 3K4UA 5I57B 5JTYB 3WAFA 3TCHA 2GH9A 4GL8A 3EHSA 2QMXA 4TLLB 4DXUA 3FJMA 1F9BA 4BDNA 2OJTA 4KHZE 5DTBA 2NXOA 4NTLA 4LATA 4R74A 4MBPA 3SEYA 4NF5B 1QKAA 2Y7IA 1ELJA 4O3AA 2XHDA 2B3BA 4Q30B 1BIYA 3C33A 3Q29A 5CBRA 1I6BA 4KYSA 4YAHX 4HW8A 2RF1A 3I5OA 5TPAB 5FTIA 1Y3PA 1JQFA 4NE4A 3KOTA 4NMYA 2PX1A 4ELPA 4DIGA 2ZYKA 2HXWA 4P0GA 5I59B 1N0TA 3T93B 4ESXA 3LSWA 1TWYA 1VFEA 3OMBA 3DP6A 2R71A 4F2QA 3CRBA 1XOCA 2LAOA 3MC2A 1MRPA 3PMVA 2I4BA 1AL3A 1LFIA 5I56B 2X7PA 4R2FA 1Y1MA 4RK9A 3C36A 3L6GA 3KJTA 5DYHA 2XX8A 1LB9A 4GWOA 2X7QA 3BKIB 4I1DA 1D4NA 1AIVA 1B5HA 4EUOA 2DWHA 4YB6A 4UACA 5I2NB 3H7MA 3M8UA 3MAMA 5DVJA 3FV2A 3QYTA 4OHNA 1SI1A 1MQDA 1GVCA 1HSLA 5FHNA 2FYIA 4YKKA 2W7YA 3S2VA 3IORA 4POWA 4G77A 1B4ZA 5KDTB 4ZZEA 4AB6A 1MM7A 1XT8A 4F3PA 4U4SA 4OEUA 2F7CA 5EHSA 2QS2A 3MVZA 2Q88A 2HZKA 1EZPA 3FIRA 4XKPA 4MLVA 4IO7A 3VDFA 1SW5A 2I4CA 3H6VA 2O7IA 1B7HA 3IL1B 5A5XA 1M5CA 3FVOA 5DEXB 3IB1A 5AA2D 2DYXA 4O3BA 2QPQA 3O29A 3N94A 5DVIA 1B5IA 2THIA 2X26A 3QSLA 2RCBA 1YAEA 1IITA 3E13X 3RUMA 5CBSA 1FTLA 1FW0A 5I2KB 3E4RA 1H45A 3S9LC 3CIJA 1FTJA 4OVJA 4RPOA 2FNCA 5CMCA 3N6TA 1FQFA 4X48A 1US5A 4LA9A 3KG2A 2HAUA 1R9LA 5EYFA 2I0CA 2Q89A 1ZU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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