4YMAA

Structure of the ligand-binding domain of glua2 in complex with the antagonist cng10109
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structure-Activity Relationship Study of Ionotropic Glutamate Receptor Antagonist (2S,3R)-3-(3-Carboxyphenyl)pyrrolidine-2-carboxylic Acid.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ymaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ymaA02
4DCXA 2Y7IA 2E0SA 4I1DA 2F8DA 1FQAA 3TYHA 1B32A 2CMOA 3S4UA 2DE4A 5CMCA 1HSJA 3M8UA 3QUFA 3RPWA 1B52A 3K6WA 2ONRA 2QS1A 2G93A 4ESWA 5A5XB 5ITPA 5JTYA 4LVQA 4U21A 4GL0A 1O64A 3R6UA 5CMBA 1NL5A 3VDFA 1LB8A 2F6PA 2DYXA 4KCCA 2V3TA 2VOZA 4PQJA 3P7IA 3GBAA 3IK6B 1JW1A 3VLUA 4EQ9A 4GFRA 1ANFA 3HHFA 3OEKA 2OK2A 2BJJX 1H3DA 1SQYA 3FJ7A 2R6GE 1XC1A 5B70A 1M5DA 1QW0A 5H8QA 1B6HA 3N26A 3FGSA 5AA2D 3OEMA 1LAFE 5B7DA 1XS5A 4LATA 1B5IA 1XT8A 2HZLA 1ZKBA 2QMWA 4RA1A 4HTGA 3HSTA 1JW4A 4KI0E 4RXLA 2D21A 4ZECA 4OYVA 1UTHA 5AA3A 1Y3NA 2QJEA 3LUYA 5J1DA 1DPPA 4ZZEA 3MVYA 1B51A 1B1XA 3WAFA 2F7BA 1A8EA 3ONMA 2NUVA 1H45A 3W9VA 1LCFA 1LAHE 5L8DA 1MY2A 3G3FA 3FZVA 4LP2B 3FASA 3MQ9A 2UYEA 3TUSA 5CMMA 3T9XB 1L5TA 3CI8A 1B3EA 1EZPA 4ZE8A 3IB0A 2P0SA 1Q1KA 3K0VA 3L6GA 1B58A 3KJ7A 2M8CA 4NMYA 4F19A 1OQHA 3PU5A 5I2KB 4R75A 4GQOA 2H98A 4OZ9A 2H99A 2XD2A 3OMBA 3TTNA 4U23A 1M5FA 1PDAA 2HFBA 4KYDA 2OWTA 3SKPA 4QFLA 3RGYA 5L9SA 2Z8FA 1TT1A 2IEEA 5AA4B 4AB5A 1NH7A 2I0CA 4TLLB 1FTKA 1UQWA 3OO8A 2R71A 5H8QB 3PPQA 4ESXA 1OLCA 5I59A 4NF8A 5DVIA 1UTBA 1MS7A 4XIGQ 1MH3A 1XVYA 1AIVA 3CFZA 1SW5A 3S9MC 5I57B 3QK6A 5FTHA 3FD3A 3IAZA 4GL8A 2DWAA 3RTFB 1WODA 3PUYE 2F97A 1GV8A 3T9UA 1IEJA 3E9XA 4BDQA 1SW2A 4X1BA 1WVJA 5DVFA 2FYIA 2YLNA 2XXIA 3OSQA 1MPDA 4F2QA 2PT1A 3G3JA 4RJZA 3U93A 2REGA 4DE8A 2O51A 3VXCA 4OEVA 1CE2A 2IA4A 3MZ1A 1M5EA 3VLVA 1N7XA 2E1SA 2RCBA 3UIFA 4PE5B 4EUOA 1B5JA 3QXMA 4DXCA 2ZYOA 2B3FA 1R9QA 5H8HA 4GXAA 4F3PA 1R1NA 1B3HA 4ZEKA 3K2DA 3KJTA 4EDPA 3DELB 3DP4A 2YPNA 1FCKA 1IUDA 5CRYA 5H8SA 4DDDA 4RPNA 2ZYNA 3ZKLA 1O7TA 3IB1A 5AE4A 1IXCA 5H8NA 5M2VA 1HSEA 3SETA 1XOCA 1PC3A 1ZU0A 1QJMA 3UP9A 1FW0A 2Z8EA 4ZEDA 1MY0A 1EU8A 1QKAA 2XX7A 1B3GA 5FTIA 3FVOA 1R6ZA 2XXVA 2QSXA 3WAEA 1JVYA 3U1OA 1LFGA 4I62A 4IO4A 2D3IA 2ZNSA 4HW8A 3IOWA 1RYXA 3BBRA 3IOUA 3TELA 1II5A 4NF6A 3ILUB 3SEUA 4TOZA 1YCJA 2I4CA 3G3GA 3EHSA 3QYTA 4ISUA 3LSWA 1A55A 4QSEA 4Z0IA 1US5A 5I2NB 3FJMA 4PFYA 3HN0A 4TQUQ 4BDNA 4WXJA 3K02A 3UORA 4IGRA 1B3LA 1B0HA 3IX1A 3SEYA 1EZ9A 1AOVA 5HM4B 4R2BA 2DS9A 2F6GA 3CR9A 4P11A 5EYFA 2XXQA 3EPEA 4U4XA 4EQ7A 1MXWA 2PVUA 3L6HA 4ONYA 3T9VA 4M1VA 4R72A 4U1OA 2I49A 4YKJA 3RUMA 3FV1A 1D4NA 4GVOA 3FVKA 3S9LC 1IXGA 1URGA 1B1HA 3TTMA 3MJNA 3CG3A 4RYAA 4R6YA 3S2VA 4HCWA 1GGGA 3K01A 4JWXA 3LSXA 4PFUA 4DCYA 3S9EA 1LB9A 3H7MA 3QAXA 5TP9A 2ALUA 4KR5A 1ZTYA 1ZLQA 3TQLA 1VFEA 5DT6A 1MQIA 5TPAB 4BLAA 4WEPA 3O66A 2RINA 4QFKA 1YAEA 4GOTA 5KCJA 2HXWA 3T22A 3FIRA 3IO6A 4POXA 1BLFA 3SERA 2XXUA 1SBPA 4PETA 5TU0A 2XX9A 3TPAA 4ELPA 1ZJLA 4N6PA 4QF9A 1BP5A 4G8HA 1B0LA 3TCHA 2UVJA 1PBPA 2PYYA 1XHYA 3C33A 1MG1A 4G68C 4YB7A 4U4SA 3K00A 3CRBA 3VLWA 1B4ZA 1JVXA 4ELRA 1LFHA 5JK4A 3B6TA 2WKYA 2HEUA 4I9DA 3BFUA 1I69A 4G8MA 4IO7A 2ZYKA 4OXVA 2Q8JA 3C9HA 4MLQA 4X9TA 1MDP1 2QS3A 2V3QA 5AA1A 3OELA 4C0RA 3MUQA 4O3CA 3SESA 5I58B 2I3VA 2AL5A 1MPBA 2PBWA 4MH5A 2XXYA 3TTLA 2I3WA 4G77A 2F7CA 4OVJA 3TTKA 3LBSA 1QUJA 3U92A 3FVNA 4G68B 4QSDA 3GZGA 1O63A 3K1PA 3G3IA 4OFLA 4H0WA 5I56B 3QSLA 4F1VA 1XVXA 3K4UA 4KD5A 2Y7RA 2QS2A 3EF7A 1F9BA 2ESNA 1MQGA 1MXVA 2VP1A 2RF1A 1NNPA 4F31B 2Q2CA 1LCTA 2O69A 2D5WA 3U94A 4JSDA 1IITA 1RYOA 4THIA 4AB6A 3PPPA 4G4PA 3KFMA 1YTVA 5CMKA 2DOJA 1OVBA 1YPNA 1N7WA 4ZE9A 3JV9A 3D4GA 3PMXA 2F5XA 3O2AA 2GRVA 1B9JA 4LQ5A 1FTJA 4OENA 3O9PA 1LAGE 2X7PA 2Y7KA 4F18A 2F35A 2UXAA 3CG1A 3CVGA 3SDFA 3JYRA 5JTYB 4RK2A 2NVUB 4DXUA 3RTWB 1UIVA 4H5FA 2O68A 3A09A 4IO6A 2H5YA 2VHAA 3IR1A 3VXBA 2DWJA 4KYSA 1MY1A 2Z8DA 4IO5A 2Q89A 1ATGA 2QRYA 2OBGA 4ND9A 5CI5A 3DM0A 1UIUA 4Q8RA 3N5LA 4IY5A 4KPTA 3PUWE 3OXNA 2Z22A 1JW5A 4N13A 4ELQA 3CFLA 3MVZA 3QUJA 1B05A 3ZS6A 4H5GA 2DVCA 2CZLA 3TCFA 4IY6A 3S9NC 2VD3A 4R6HA 1B7ZA 1NMUA 4OWDA 2QPQA 3TZAA 3M3FA 2NOOA 5EHSA 4Q0CA 3H6TA 1SI1A 4NWDA 3PD8A 4QHQA 1UTHB 4O3BA 4R74A 2ZNTA 1D9YA 2ZYMA 1I6BA 3USDA 2DQVA 1Y3QA 3QIMA 3K1NA 4H67A 3UK4A 3Q27A 3W9WA 1D9VA 4XXUA 2P2AA 1AMFA 4KYEA 4XTCQ 3JZJA 5H8FA 4NE4A 2O6AA 1VE4A 4E0XA 4FAJA 3RT8A 4P0GA 1URDA 3KZGA 3THIA 3IOVA 4OHNA 4KQPA 2GH9A 1LGBC 3C32A 3G3HA 1N3WA 3MPKA 3CFXA 4OQOA 2RC7A 2HAUA 4YKKA 5KDTA 3OO7A 5ITOA 4X1DA 1Y1MA 1JETA 4QFOA 5DVJA 2KLFA 2A5TA 4PP0A 4MF3A 4F1UA 2ANJA 1H44A 3T66A 3RQTA 5AA2A 3FV2A 2HZKA 2I0BA 1LAXA 1VSOA 1QUIA 3A3CA 3KGCA 1TFDA 4HCYA 5K2XA 4IO3A 1Y1ZA 1B2HA 2ONKE 1PB8A 4OFJA 3T9HB 2I58A 3N6UA 1MY4A 2R9JA 3ZSFA 2UVIA 3VVFA 1P1QA 3VVEA 1IXHA 5I59B 4NF8B 3T93B 1UTBB 3R26A 3I6VA 1EH3A 1MQJA 4YMBA 1OVTA 1PEBA 1QUKA 3C31A 3TODA 2NWJA 5IKBA 4ZEIA 3B6QA 5FHOA 4U2RA 3IJXB 1J1NA 4K3FA 4JWYA 3E3KA 1B7UA 4F2OA 4RNSA 1FQFA 5CBSA 4N07A 2XXRA 4BDLA 1USYE 5CM6A 3CSBA 3VV5A 4DLDA 4F3BA 1GTKA 2V25A 3TEPA 3LR1A 2O7IA 2DWHA 2XXXA 3VVDA 4AQ4A 4U22A 2Q9TA 4LONB 1CB6A 5FHMA 3IL1B 2H9BA 1FQEA 1A99A 1FTLA 4F39A 4RK9A 1MPCA 4JB7A 1WDNA 1P1NA 1MXUA 3ODBA 3MZ9A 3H6WA 1NNKA 2LAOA 2A5TB 4Z7EA 3FVGA 1T0KA 5H8HB 2ZNUA 5A5XA 1OMPA 1OIBA 1Y20A 3EHUA 1FQBA 2ONSA 3KEIA 1DSNA 4YICA 1DTGA 5LOMA 3PD9A 3B7DA 1JQFA 1N04A 5ICTA 1SW1A 4X48A 5H8NB 4Q30B 1ZMGA 5JEIA 4GIZA 4TLMB 3T96B 3OENA 2RC8A 3Q28A 1PBQA 2O84X 1N76A 1H76A 4OETA 3U8QA 3N6TA 3UA8A 3UGWA 1QKBA 1R9LA 3MP6A 4JBZA 2Y7WA 2X26A 2RC9A 4YU0A 3Q25A 4YKPA 4GWOA 4LUBA 3K6UA 4EQBA 5BWJA 4YAHX 4LZ7A 3KSXA 3V89B 2XXTA 1OLAA 3MP8A 1IZ1A 1MQDA 3IB2A 1MXYA 1Z7ME 3RY3A 2DSFA 4FECA 4NF6B 4LQ2A 1P99A 2O7UA 3HPIA 4JSOA 3V5AA 4FJPA 3DLNA 3SEXA 4EXKA 3PUXE 3C34A 1IQ7A 3SEVA 3KN8A 2GHAA 3EQ1A 3I3VA 2QS4A 1LBBA 4F22A 1AL3A 2Q88A 4C1TA 2YJPA 1GVCA 3PV0E 4UA8A 5I2KA 2AYSA 2A5SA 2ABHA 2F34A 2RCAA 2GFEA 4G2ZA 1Q35A 3I5OA 2UYFA 3PPOA 3LC8A 1DMBA 1S9TA 1N3XA 1VR5A 3FXQA 2DP8A 4RY1A 3VFJA 3H06B 3BKIB 4QFNA 2F36A 5DTBA 3Q29A 4H6DA 2DE2A 3CSGA 4IB2A 1B4HA 1BKAA 3FXRA 2QMXA 2HAVA 3PGFA 1P1OA 4KHZE 3MC2A 1GR2A 4KFQA 4L17A 4BDOA 1NNFA 5AA4A 3TDJA 1DOTA 3MVXA 3A3UA 1ZIUA 3KOSA 5HBCA 3PMWA 3G3KA 5K2YA 1JEUA 5KZTA 4C1UA 2XXHA 4POWA 3HO7A 4NTLA 4PFTA 3TFLA 2VD2A 2RKMA 2PMSA 5I57A 3GXAA 2OJTA 2OWSA 4ZEBA 1JEVA 3HV1A 3KOTA 5TP9B 4QSCA 4UACA 4LZ5A 1TFAA 2X7QA 4GD5A 2I4BA 4EXLA 2Q2AA 1D3KA 1DTZA 3OSRA 3ILTB 4EF2A 3N94A 3O6GA 5KCJB 3C35A 4MFIA 3E4RA 3MAMA 4R9FA 4ELOA 4JXIA 1NH8A 3U72A 3PPRA 4QFPA 1POY1 5L9MA 1SD3A 3SEWA 3MZBA 3EHTA 4ZZAA 3TCGA 3ECRA 4BDMA 4YMAA 3H4ZA 1A54A 4FE8A 1BTJA 2W7YA 1Y4CA 2GHBA 4NEDA 2ZXTA 3MWBA 3ZKKA 3IOTA 4H8JA 4ECFA 4NWCA 4M4GA 3K1MA 3V8XB 4DXBA 1M5CA 4NF5A 4LZ8A 2V84A 2I6EA 3M3KA 1LLSA 5IAIA 4LA9A 4XKQA 1RKMA 3KBRA 3O6HA 4OFOA 3IJOB 4R6KA 2F78A 5FHNA 3VE1B 1FTOA 5CC2A 5DYHA 2DXYA 2O1MA 1S7YA 3C36A 3H6UA 1H43A 3IO4A 3O97A 4GRKA 3H3GA 2F7AA 1JNFA 2B65A 4H8IA 4MBPA 1FTMA 4R73A 4WEDA 5ISUA 1Y3PA 5I84A 2FNCA 1P1WA 2HQ0A 2UVHA 3PMVA 3CIJA 3FJGA 3TQWA 3FATA 4DIGA 4Q5TA 4FEDA 2G29A 4RPOA 1IIWA 1N0TA 3MBPA 1NKXA 2OCUA 1SI0A 1HSLA 1ELJA 3B6WA 1B40A 3DP6A 1NNTA 2HCAA 3M3LA 1A7LA 1Y4TA 3R7XA 4PFWA 3UN6A 2XHDA 3TTRA 2Y84A 4IGTA 4NF4A 4IO2A 5I2NA 3RLFE 1POTA 4OTEA 5EHMA 3KG2A 3K6XA 4OESA 5F1QA 3RN8A 1MM6A 1Z7NE 1MH4A 2THIA 4F29A 1P1UA 1MRPA 1FQDA 1TXFA 4XKRA 1AH5A 3O6IA 1SVXB 1A40A 3H6VA 4H1XA 2XXPA 4YB5A 4NF5B 4KCDA 2DXRA 3GBBA 3LSLA 4GXSB 1I6QA 3OO9A 5HPQA 4FIMA 4P0IA 3G7WA 5F7VA 1OQGA 2FA7A 1VFDA 1LFIA 4OEUA 4XKPA 3KN3A 4U1ZA 3MPLA 3AXFA 1LSTA 1ZBMA 2AIXA 2REJA 5L9OA 3TAJA 2DVZA 3RNNA 5DEXA 2O1LA 3KSJA 1URSA 3LSFB 4F1YA 1N84A 5H8FB 1SYHA 4ZS9A 2B3BA 4FATA 1B7HA 3OOAA 3OD7A 1DPEA 3RT6B 2P1SA 3F11A 5TPAA 4GF8A 1A8FA 2NXOA 3O29A 4FORA 1MDQA 2V93A 5ICQA 1B3FA 3FUZA 2QL3A 3O28A 3H03A 1PB7A 1KWHA 4O3AA 1MXZA 1SYIA 1EZOA 1SW4A 3PPNA 3D4CA 5ELVA 4F3SA 2UVGA 2PX1A 1I6AA 4R9GA 5KDTB 1FQCA 2OLBA 1BIYA 2XXWA 1SDXA 4NF4B 2AL4A 3Q26A 2OZZA 4ZDMA 2I48A 3E13X 4QRZA 3TMGA 1QULA 1US4A 5AA2B 1MXXA 3MW0A 4YB6A 3PUVE 4YKIA 2Y7PA 4JDFA 4OERA 4H65A 3OO6A 3TKDA 4JWOA 4OMBA 4YZZA 1MQHA 3DP8A 1PB9A 2PT2A 1LBCA 4GLIA 5I58A 2Z23A 1B46A 1USYH 2ZMBA 1S50A 1M5BA 3BFTA 4WKMA 4XKNA 2DE3A 4G68A 3IORA 1QVSA 1B5HA 3MP1A 3PUZE 4MLVA 1TWYA 3C4MA 3MVWA 4ZEFA 5I56A 2VGQA 2V3UA 2XD3A 4DZ1A 4BDRA 4EF1A 3GLBA 5DEXB 2H25A 3K6VA 1MY3A 3HHGA 4I8CA 1Y9UA 3HCQA 5BUUA 1NFTA 5CBRA 2XX8A 1IXIA 3KN7A 3W15C 3FXUA 1MM7A 2H4IA 4F3GA 3V83A 4E0WA 4G8NA 4HS7A 2DWIA 4R2FA 4FEBA 3EN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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