4YMAA

Structure of the ligand-binding domain of glua2 in complex with the antagonist cng10109
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure-Activity Relationship Study of Ionotropic Glutamate Receptor Antagonist (2S,3R)-3-(3-Carboxyphenyl)pyrrolidine-2-carboxylic Acid.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Signaling protein
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ymaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4ymaA02
1ZLQA 3QXMA 3FJ7A 4GWOA 2M8CA 2GHBA 1HSLA 4IY6A 4JB7A 1GVCA 5F1QA 4ZEKA 1CB6A 2X7PA 1JETA 1B4HA 4I9DA 4JSOA 2FYIA 4GOTA 4OESA 4G8NA 3C31A 1URGA 1MY0A 3E3KA 3EQ1A 2FNCA 3C36A 4F31B 4OWDA 1FQBA 1R6ZA 5FHOA 3DELB 4XXUA 3MP1A 3MVXA 2PX1A 1SBPA 2AIXA 1O63A 1Z7ME 4Z7EA 4DDDA 1UTHB 3SESA 3OXNA 2NWJA 1Y3PA 4IO6A 4Q0CA 3FZVA 1MG1A 3H6WA 2QSXA 3A09A 4GRKA 3K01A 2ESNA 3H6TA 3FVKA 5ITOA 4ZE9A 3RT6B 5A5XB 4IO7A 1B6HA 4KR5A 5EHMA 1MDQA 4KPTA 4ELOA 5I84A 3FV1A 3KSJA 3VDFA 5DYHA 3V8XB 3DP4A 4YKPA 2PT2A 1PB7A 2IA4A 3K6VA 3FVOA 4BDOA 3M8UA 3KEIA 2BJJX 5JK4A 2DP8A 1NMUA 3OO9A 5L9MA 1JW5A 3ZKLA 1B58A 1IITA 5ISUA 1MXZA 1SVXB 1NNKA 2ABHA 2E1SA 3OO6A 3QYTA 3WAFA 1JEUA 3O9PA 2UVJA 2Y7KA 3EN3A 3G3GA 4NF4A 1QVSA 4QHQA 3MVYA 1QUKA 2PYYA 3RY3A 4KCDA 3M3FA 3K6WA 2O7UA 3TODA 1XC1A 1MM6A 3N6UA 3S9LC 1MXWA 2ZXTA 1UQWA 4DCXA 2F7CA 1VFDA 5ELVA 1IXCA 4X1DA 5HPQA 4NTLA 5M2VA 2NXOA 4R9GA 5B7DA 2DWJA 4QRZA 5TPAA 5L9OA 1GGGA 4JSDA 2REJA 1MY2A 4HCWA 3OD7A 1FTMA 2R9JA 2I3WA 3RT8A 4F22A 3OEKA 5BWJA 2V3QA 3C32A 1NKXA 4AB6A 2O51A 4ONYA 3T22A 2Z8DA 3FXQA 4PFUA 4WEPA 1GR2A 1P1NA 4MF3A 2VP1A 4M1VA 2OK2A 3PMWA 5AA1A 1MXUA 2QS1A 1N3WA 4H67A 1RKMA 4MBPA 4KI0E 4YKJA 3KZGA 1AMFA 4LQ5A 1JW1A 2UVGA 3IO4A 3KN8A 2UYFA 5AA4A 3T9VA 4TLMB 4DXUA 1MXXA 2DVZA 1ELJA 3MAMA 1Y9UA 3RN8A 4F2OA 3CFLA 2ZYNA 4F39A 4KYSA 4GXSB 1FTJA 4PFYA 1LBBA 3IK6B 1LAGE 5DVFA 4X1BA 1RYOA 4NE4A 4I62A 1LFIA 5HM4B 4YICA 1YCJA 2VHAA 1A54A 2DS9A 3FJMA 1QW0A 2ONKE 5CMCA 4ELQA 1B5IA 4H0WA 3MC2A 3EHUA 1DOTA 2V93A 4FECA 5I58B 3KJ7A 1KWHA 4R6YA 4OEVA 4R6HA 4JWXA 2ALUA 2H25A 2HXWA 3TTLA 3VVFA 2I4CA 2HAUA 4LVQA 5DEXA 1B3EA 1I69A 3FGSA 1EZOA 4TOZA 2Q2CA 4XKRA 1I6QA 5I2KA 2PMSA 3KSXA 4F1YA 1IUDA 2DOJA 2XX9A 3IR1A 2F35A 1MS7A 1M5CA 2D3IA 2UVHA 4GQOA 1LGBC 3FD3A 4IO5A 3MWBA 1D9YA 2F8DA 4DXCA 1POY1 4XKPA 5CMKA 2F97A 5CM6A 4ZS9A 2CZLA 3HCQA 3S4UA 3TKDA 1US5A 3TZAA 4XKQA 3O29A 1MH4A 2O1LA 4ECFA 3T9HB 5H8NA 4P0IA 2E0SA 1MY4A 3JYRA 4DIGA 2D5WA 1F9BA 3HHGA 4F19A 1UIVA 4G68A 4OQOA 3H6UA 3OO8A 1H76A 4P11A 4P0GA 3R26A 3CVGA 3CR9A 3CI8A 4N07A 2DYXA 1IXGA 1WDNA 1UTBA 4RY1A 1M5EA 4QFKA 3IOTA 3T9XB 2YJPA 1Y20A 3LR1A 2DXYA 4AQ4A 4H8JA 2RC9A 3HN0A 2DE3A 3B6QA 4F3PA 4WXJA 1JW4A 2AYSA 3T96B 1LLSA 4MLQA 4QSCA 1EU8A 1DTZA 2GHAA 1D4NA 1SW1A 5FHMA 4DZ1A 2D21A 5CMMA 2XX7A 2UYEA 2XHDA 3F11A 4OERA 2F6GA 1B1XA 3Q25A 4QF9A 4ZDMA 2Q9TA 1SW4A 3M3LA 4FEDA 1LCFA 1SYIA 2H98A 3SEUA 2HAVA 4U21A 1FQCA 4NF8A 5JTYA 3FJGA 4BDLA 2P1SA 1FQEA 1B7HA 5LOMA 4F3SA 3JV9A 3KJTA 1MDP1 3IJOB 4QFPA 2PT1A 1FTLA 1H3DA 3USDA 2XXHA 1Y3NA 4I8CA 3HSTA 1AOVA 4NF6A 3FUZA 3QUJA 1MQHA 3TELA 2ZNTA 1P1UA 5DT6A 1B5HA 3BFUA 1CE2A 4HTGA 4GFRA 4RK2A 1B3LA 2I6EA 1Y4TA 2DWHA 2THIA 3DP6A 3MW0A 5CBRA 4ZEBA 4DXBA 1NH8A 1S9TA 3VLVA 1P1QA 1PB9A 4RPOA 3Q26A 1BIYA 1FW0A 2G29A 4YB6A 1OVTA 3HO7A 5K2XA 3RNNA 3CFZA 2AL4A 5AA2A 4YMAA 1R1NA 1MQIA 1YAEA 2H5YA 1N04A 3A3CA 3C33A 3S9MC 3IOVA 3K1MA 3AXFA 4R75A 2O84X 3U72A 3MPLA 4OTEA 2R6GE 2W7YA 3GXAA 1URSA 3RPWA 1MH3A 2Y7RA 3S9NC 3O6GA 1N7XA 1QKAA 3MP6A 4UA8A 2P2AA 1UIUA 3LSFB 2XD3A 2XXQA 4R9FA 2XX8A 3PU5A 1LFGA 1XOCA 1TFAA 1NL5A 3THIA 1A7LA 1P99A 3VV5A 2IEEA 3IO6A 5HBCA 1LFHA 1XT8A 1A55A 3GLBA 4F29A 4F1VA 3MQ9A 3PUWE 2QL3A 5EYFA 5H8QA 4E0XA 4XIGQ 1MY3A 4U4XA 3UK4A 4NF4B 1PBPA 3RQTA 4XKNA 4UACA 1JNFA 3TCGA 4QSEA 2F6PA 4BDNA 2Z8EA 4NWCA 4POXA 5I59A 3K0VA 1B40A 5J1DA 1LSTA 5TU0A 2QMXA 4H65A 4N6PA 4F1UA 3UGWA 2VGQA 1ZIUA 3W15C 1J1NA 1DPPA 5TPAB 3IJXB 2I0BA 1VFEA 2QS2A 3U8QA 3K1NA 2QS3A 1LAFE 3TQLA 2RINA 3VXCA 3PMVA 4TQUQ 3EHTA 1O64A 1II5A 1AIVA 5AA2D 3UA8A 1LBCA 3FXRA 4BDQA 2ZNSA 4ELRA 4HS7A 1B5JA 1AL3A 2OWSA 3IB0A 3PUXE 5KCJA 4KCCA 2V3TA 2ANJA 2O6AA 4H1XA 5TP9A 3R6UA 3LC8A 1T0KA 3FV2A 4ZECA 3ZKKA 3SEYA 5F7VA 5AA4B 4Q5TA 4R72A 1Y3QA 2R71A 4U1OA 1B1HA 2B3FA 5KDTB 2ONRA 3QSLA 1HSEA 5IKBA 5CC2A 1NFTA 1SYHA 2PVUA 1N76A 1WVJA 4NWDA 3CG3A 4IY5A 3EHSA 1NNPA 2REGA 3T93B 1MQDA 3EPEA 1OMPA 2NOOA 4KYDA 5KDTA 1B0LA 4R2BA 4KYEA 1ZMGA 5K2YA 3C34A 2F7BA 4OHNA 3V5AA 2GRVA 2XXPA 1Q35A 4U1ZA 4QSDA 1AH5A 3IL1B 5DEXB 3SKPA 3CG1A 2XXXA 4K3FA 3ILTB 4R73A 4H5GA 4PQJA 4NF5A 5I2KB 3SEWA 1MPCA 1TXFA 4LZ5A 4E0WA 3RUMA 5DVIA 5I56A 4IGRA 5EHSA 1XHYA 2DWAA 4YB5A 4LP2B 3UIFA 3ONMA 3T9UA 1URDA 4PFWA 3ZS6A 2DVCA 5CI5A 1N84A 4ZZEA 1IZ1A 2XXIA 1N0TA 4HW8A 1IQ7A 1Q1KA 4YU0A 3OEMA 3HV1A 4PP0A 4I1DA 1DMBA 1B05A 3TQWA 4QFOA 4FORA 3GBBA 3N26A 1A99A 1B3HA 2OJTA 4O3AA 1B2HA 4EQ7A 1H43A 3PGFA 5H8NB 3G3HA 2XXRA 3K00A 2Q2AA 1ZBMA 4G68B 4MLVA 1I6BA 3VE1B 4IO2A 3OSRA 1O7TA 2Y7PA 4L17A 3PUZE 1WODA 3QUFA 4C1TA 4LZ7A 3OELA 3IORA 1B7ZA 2HEUA 1OVBA 1UTBB 4BLAA 2DE2A 4GXAA 5KZTA 2RC7A 1MPDA 3N6TA 4IO4A 2XD2A 3ECRA 1HSJA 4YB7A 4WEDA 3SDFA 2H9BA 1A8FA 3RLFE 1M5DA 1FCKA 3SETA 1USYH 2VD2A 3B6WA 1IXIA 1EZPA 3TDJA 4RK9A 2F7AA 1VR5A 2F78A 3W9WA 3G3FA 3O66A 2ZYOA 4Z0IA 5I2NA 1N7WA 2QPQA 2GH9A 1JVXA 3RTWB 3HHFA 2Y7WA 3O6IA 3TUSA 4GL0A 3LSWA 1B0HA 3GBAA 2I4BA 4NF8B 5JTYB 2ZNUA 4EQ9A 2A5TA 3PD9A 2O68A 4ESWA 3IB2A 1PBQA 1SW5A 4ZEDA 2Q8JA 2ZYKA 2X26A 3W9VA 3CRBA 3I3VA 1OLAA 2V3UA 1LAHE 4G2ZA 4ZZAA 4NF6B 4LZ8A 2O69A 3A3UA 3KOSA 2RCAA 3C9HA 5H8HA 3ILUB 1Z7NE 2OWTA 5I57A 3IOUA 1DTGA 3CFXA 4EXLA 3FASA 1POTA 1R9QA 2RC8A 3TEPA 1BKAA 2F36A 5H8FA 4H6DA 2DQVA 1B52A 3IAZA 3IB1A 5AA2B 2NUVA 2AL5A 1PC3A 3LSLA 3VLWA 4R6KA 4YMBA 3JZJA 3B6TA 1B32A 1LCTA 3MBPA 1PB8A 4G8MA 4EDPA 1SI0A 2G93A 3U94A 2RKMA 2Z8FA 3PPPA 2FA7A 3V89B 3OSQA 1S50A 1NNTA 3S2VA 4G4PA 1JVYA 2YLNA 1R9LA 4THIA 1M5FA 4QFNA 3D4GA 3MVWA 4RXLA 2QMWA 2GFEA 2Y84A 1L5TA 3RTFB 5L8DA 2RF1A 3BKIB 4F3GA 4DE8A 2ONSA 3SERA 4OMBA 3HPIA 3KN3A 3CSGA 3G3IA 4XTCQ 4U2RA 1QULA 1B7UA 3KGCA 4POWA 3VVEA 4GD5A 1OQGA 3K6XA 3H4ZA 1MRPA 3UP9A 5H8QB 3FVNA 1MPBA 2ZMBA 4JWYA 3CIJA 3Q29A 3SEXA 1Y4CA 1M5BA 1JEVA 1FQFA 4G8HA 3VVDA 4RA1A 3N5LA 1MXYA 2VOZA 5IAIA 5I59B 1MQJA 1IEJA 4EXKA 4KD5A 3H03A 3R7XA 2QS4A 1D3KA 2Y7IA 3LUYA 3G7WA 3U92A 1B51A 1ANFA 4OFLA 4EF2A 3OENA 2DSFA 5AA3A 1VSOA 3Q27A 3C4MA 2O1MA 3FIRA 1MY1A 1IIWA 1UTHA 3V83A 1TT1A 1EZ9A 4NEDA 3TAJA 3TFLA 4Q30B 3MPKA 2B65A 2Q88A 4OEUA 2XXTA 3Q28A 4LATA 3M3KA 1B46A 5H8SA 3O6HA 2RCBA 1IXHA 3KBRA 5A5XA 4AB5A 2HZLA 5KCJB 3G3JA 1RYXA 3K2DA 4EQBA 1USYE 2QJEA 2O7IA 2Z22A 5TP9B 4WKMA 3E13X 4YAHX 2I0CA 4JWOA 2HQ0A 1XVXA 4OVJA 4YKKA 2XXVA 4PE5B 3U1OA 3PV0E 3VXBA 4MFIA 3B7DA 3MVZA 2UXAA 3E9XA 4IO3A 4YZZA 3UORA 1BP5A 4RJZA 2OCUA 4X9TA 3H06B 2ZYMA 1A40A 2PBWA 4GIZA 4QFLA 4HCYA 1XS5A 4FIMA 3MJNA 3PUYE 3OOAA 4JDFA 4H8IA 3TCHA 4RYAA 4U23A 4OZ9A 3LSXA 3KOTA 3OMBA 4FE8A 1DPEA 3CSBA 1N3XA 4EF1A 5B70A 3EF7A 3TTKA 4LA9A 1ZTYA 3TTMA 4IGTA 1SW2A 1US4A 4U22A 1GV8A 1B4ZA 2HCAA 4ZEIA 1MXVA 3P7IA 4NF5B 3QAXA 4GLIA 4PETA 2OBGA 2NVUB 5I56B 3BFTA 4LUBA 4O3BA 3S9EA 1B9JA 2A5SA 3PMXA 4ND9A 4G68C 3GZGA 4F2QA 1LB9A 1MM7A 4OENA 3H3GA 5ITPA 3TCFA 1ZU0A 3IOWA 4F3BA 3O28A 5CMBA 5DVJA 3QIMA 2WKYA 1TWYA 4FEBA 3QK6A 1SI1A 3PPNA 1QJMA 3FVGA 1B3GA 3TTRA 4C1UA 3U93A 3LBSA 4TLLB 1GTKA 3H6VA 1NH7A 3K6UA 4OFOA 4GF8A 1BTJA 1PEBA 1TFDA 5FHNA 1ZJLA 4BDRA 4F18A 2I58A 2XXUA 4GVOA 5ICTA 2UVIA 4OFJA 4DLDA 1PDAA 1Y1MA 1YTVA 4FAJA 2DE4A 1YPNA 5FTHA 2X7QA 4IB2A 2B3BA 3C35A 3BBRA 1XVYA 3ODBA 3D4CA 2V84A 3PPOA 3FXUA 2F5XA 2OLBA 3O97A 5AE4A 3RGYA 1FTKA 3T66A 5DTBA 4JXIA 5I58A 2CMOA 1Y1ZA 5FTIA 1DSNA 1OLCA 2P0SA 1D9VA 3VLUA 3I6VA 4OYVA 1P1WA 3IX1A 2I48A 5L9SA 3I5OA 3TTNA 4ZE8A 5I2NB 1SDXA 2Q89A 5JEIA 2VD3A 1BLFA 2Z23A 1NNFA 2OZZA 4ISUA 4M4GA 1JQFA 3MZBA 3G3KA 3PD8A 3MZ1A 2YPNA 1OQHA 3K02A 1MQGA 2A5TB 4PFTA 2V25A 4YKIA 1P1OA 4LONB 4ESXA 4U4SA 3TPAA 1I6AA 3SEVA 3N94A 1EH3A 1H44A 3MUQA 4C0RA 3KG2A 3L6HA 5H8HB 3K1PA 4BDMA 5I57B 3L6GA 3PPRA 4FATA 3KFMA 4JBZA 2H4IA 1B3FA 1FTOA 3FATA 2DWIA 4OXVA 4EUOA 4N13A 5CRYA 5H8FB 1SQYA 3PUVE 4X48A 1FQAA 4O3CA 2LAOA 4KHZE 1ATGA 2HZKA 3MP8A 4R74A 4ZEFA 3TYHA 4Q8RA 3PPQA 4KQPA 3E4RA 1QUIA 3ZSFA 4FJPA 2DXRA 2I49A 1LAXA 4GL8A 4NMYA 3DP8A 5CBSA 4KFQA 1VE4A 1A8EA 3DLNA 2KLFA 4G77A 3VFJA 2F34A 3O2AA 2XXYA 1OIBA 3DM0A 3MZ9A 4RPNA 4RNSA 3UN6A 1FQDA 5BUUA 4OETA 3OO7A 4DCYA 4LQ2A 3KN7A 1SD3A 5ICQA 4ELPA 3WAEA 3H7MA 3K4UA 2QRYA 1QKBA 1LB8A 4MH5A 2I3VA 1H45A 2XXWA 1S7YA 2H99A 4R2FA 1QUJA 3TMGA 4H5FA 1ZKBA 2HFBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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