4YN5A

Catalytic domain of bacillus sp. jamb-750 gh26 endo-beta-1,4-mannanase
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
391
structure length
391
Chain Sequence
IPKDSEGQSFKLVDSNASTLTKSLYAYLQDTSGRQILFGHQHAVDEGLTLTNSGDRVGSTQSEVKNAVGDYPAIFGWDTLSLDGYEKPGNEKNSQAQNRANVVQSMRTVHELGGIIALSMHPENFVTGNQYNDTSGDVVKNILPDGSHHEVFNAWLDNIAAFAHELTDQSTGELIPVIFRPFHEQNGGWFWWGAQTTTASEYKALYRYTVDYLRDVKGVNNFLYAFSPNAPFDGNLTQYLRTYPGDQYVDIFGLDQYDNKANAGQATFLNGLTQDLAMISKLADEKGKIAAFTEYGYSPQGFNETGNYLQWYTAVLEAIKKDPNASRIAYMQTWANFGYPTNMFVPYRDVNGNLGGDHELLPNFVEFYEDDYAAFLTEASGWNLYQDISTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. jamb750
publication title Crystal structure of Bacillus sp. JAMB-750 GH26 Endo-beta-1,4-mannanase
rcsb
molecule keywords Mannan endo-1,4-beta-mannosidase
total genus 146
structure length 391
sequence length 391
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4yn5A00
1UR8A 3WMBA 1UR9A 1GQKA 4XB3A 2AMGA 4CCDA 3NSXA 4TTGA 1VAHA 3OA5A 2XTKA 1QOXA 2JEQA 3VNZA 1B30A 3ALGA 3WUGA 1CWYA 2ZX7A 4WKHA 4NRSA 2XWDA 4PYSA 3TONA 3AMLA 3GH5A 2VJXA 1KFWA 1UD6A 5E0CA 1H5VA 1SYTA 1TA3B 4LX4A 3CHFA 1C8YA 4MNKA 2JEPA 1NWSA 4W89A 3T09A 5JBDA 1XSIA 4W93A 1U33A 5A8PA 4WSJA 1NP2A 3AMDA 3K8LA 3BCFA 4JAWA 1Z32X 1JGIA 2ZXDA 4AD0A 1V3JA 4PMNA 3UESA 1HKMA 4X0NA 1QHZA 2B31A 3W81A 3HN3A 2E40A 4TXEA 4C7GA 4EK7A 2E3ZA 3WBEA 4TX8A 3WDQA 3IANA 4UFIA 3MV01 2V38A 4R27A 3SUTA 1AVAA 5M3WA 2BNJA 3CIVA 4QP0A 1E6ZA 1WNOA 2UY4A 3PN8A 1H11A 3IAQA 3PZQA 2WB5A 1WAWA 4HZ7A 1HKKA 1BYBA 1OIMA 2X0HA 3AHYA 1HJUA 3FXYA 2GK1A 1JDDA 1JZ2A 2YBUA 2FH6A 5JBFA 2BVTA 2CERA 4AEEA 3A4XA 1KQYA 1W3JA 1UWRA 5CSYA 4J28A 5CGTA 4PTWA 4WKAA 1BTCA 3AIVA 3ZR6A 4ZENA 1MW1A 3ZT6A 1VFMA 3OLIA 3LPPA 2Z1SA 5KZ6A 4JIEA 1D2KA 3ZJ6A 4Z2IA 2YL5A 5BRPA 1V0NA 4GKLA 3OIHA 3WKZA 3VOCA 1PX4A 3CUJA 2WMJA 1H49A 1EDTA 1KGUA 9CGTA 1WDSA 3OB8A 3N1AA 1QNQA 2EPNA 5EBAA 5HDRA 5BXSA 5A2AA 3WNMA 4W7WA 1B0IA 3OBAA 1MXGA 1NWTA 1H4PA 1E5JA 2XWEA 5A95A 3GTNA 2F8QA 2W66A 1KCLA 7CGTA 4GI6A 5FIPA 3RM8A 3CUHA 1UWTA 1W91A 1E43A 3MMUA 3MUY1 1LWJA 5C8BB 2WAGA 1E55A 1V03A 4F9JA 1QI2A 1JDAA 4AZGA 1US3A 3WQWA 3J7HA 3VIIA 3AS1A 1V3MA 4K68A 1G01A 1RD6A 2Z1KA 4CVWA 3GNPA 4TVUA 4JL2A 2CNCA 3SCOA 1WZKA 3WNKA 3TOPA 4TVCA 2CESA 2HVMA 5I0DA 2VR4A 1OGBA 4D6IA 1NWUA 4MAZA 1DHKA 2A3AA 4HZ6A 3BAWA 2WNWA 3GXMA 1G9HA 4DUWA 5A69A 1E71M 4BQ4A 4S3KA 4EAMA 3ZJKA 4MPKA 1JYVA 2CCRA 5EFDA 4JFUA 2C7FA 1B90A 1FHDA 1JFHA 2F2HA 3AHTA 2WC3A 4J7RA 2D0FA 2G3MA 2WMFA 3K4AA 1SMAA 3VGHA 2VL4A 2X09A 1W9UA 1Q6DA 5FKYA 3SCTA 1UWSA 5AY7A 4W88A 3PZUA 8CGTA 3GBEA 1B3WA 1V0LA 3PTMA 1K9FA 2ZUUA 4MB1A 3OGSA 4AMCA 2WPGA 2CEQA 3VD3A 3NCOA 3CZ8A 1G0CA 1J0HA 5D9MA 1HX0A 1CIUA 3DHPA 4HPGA 3OLGA 1B3VA 1IZKA 4J3SA 2ZUTA 3T08A 1EO7A 2DT0A 3WUEA 2VCAA 2VCCA 3VD4A 4UZUA 4AISA 2FHBA 1ISXA 3N17A 4UFKA 3ARXA 3F5KA 1V3KA 1PX8A 1XV8A 3VIHA 4J27A 3WDRA 2WBKA 3ARUA 1H0IA 2Y8KA 3AS0A 2DIJA 3CHCA 1A3HA 3W24A 5BXRA 1BVNP 5IHSA 1F4HA 1V3HA 3ZO9A 4F8XA 3WF1A 4D6HA 5HOSA 1RP9A 2DT1A 5HBFA 2ZUVA 5ABHA 4MNJA 4AZ7A 1FFQA 2V3EA 1CGWA 3SCSA 4DWSB 3LPOA 1BYAA 3FAXA 3M6DA 3AZTA 1UD2A 1WO2A 1Q6CA 4H8UA 3WD0A 5A6BD 1UKOA 2VZTA 2GUYA 3KEHA 2ZUMA 1OM0A 4W7UA 2WC4A 4PMRA 1J9YA 4IPLA 1M03A 4CD8A 3SCUA 3OG2A 4W84A 1E6QM 2WVUA 2WMIB 4PMZA 2VO5A 3WH5A 3B8SA 1OIFA 3CHDA 4ZE4A 3PTQA 1RH9A 5FL0A 2Y5EA 4D1JA 3WNNA 4MNLA 2BY2A 3EDFA 1C90A 1QI3A 4ACYA 1JDCA 3A3HA 3IJ7A 3BCDA 1I1WA 2J7CA 4P8WA 1VBRA 4B16A 4GPNA 2MANA 3AISA 3WMSA 1UZ1A 2YLLA 2CITA 4WJXA 2G3JA 4UNIA 5JUVA 4A4AA 5GNZA 2YKKA 4A3HA 2ZIDA 4Z2LA 1W9DM 2D1ZA 3EDJA 2GJXB 1L8NA 4M24A 3GBDA 1H2JA 3PZNA 1MFVA 1EDQA 3O6AA 2GK1B 4FLRA 1IV8A 3WQ4A 3PZMA 3WSUA 1B2YA 2BHYA 4TVDA 1S46A 2A3EA 1XSJA 3VGFA 5HXMA 3VM7A 4MDOA 3GH7A 1NARA 3BMWA 3O9NA 1PIGA 3U5YA 1J0ZA 2XSAA 4S3JA 1GQLA 3K8KA 4OUEA 1BLIA 1QBAA 5E9AA 4BQ5A 4GO9A 2WYSA 4D6CA 2OYKA 3AIRA 3L4VA 1ZJAA 5A6AA 1VRXA 4ML4A 5E6YA 1J0YA 3RILA 4AZ5A 3N11A 4P8XA 4ZXOA 2E9MA 5CZKA 1TG7A 2VOTA 2EPKX 1EHNA 1EQPA 3ZSSA 3WL1A 1HJSA 4QAWA 4W8LA 3UG5A 2VRKA 5EB8A 2VC9A 4JKKA 4E4PA 3CUFA 1B3XA 2CXGA 4PSRA 1HVQA 4MDPA 1CZ1A 1CLVA 3UERA 4V2XA 1EA9C 3W26A 1DP0A 1BG9A 3K46A 3HU7A 3WUFA 2CHOA 1E5NA 3SIMA 3MUAA 4W5ZA 1XD0A 3UR7A 3BC9A 3AZSA 4AIOA 3NSNA 2A3HA 2ZICA 3SCQA 2UY5A 3DC0A 3RMEA 2XGBA 3CO4A 2WHKA 4WKFA 2DSWA 4IUGA 2GJRA 1W3HA 4H2CA 2FH8A 3MV11 4EKJA 2DQXA 5D4YA 1XD1A 2VTFA 4E8CA 3ZJ8A 1J12A 1E15A 4UFMA 4URIA 4Z2KA 2V5DA 4Z2JA 1OGSA 4AWEA 1E56A 1PBGA 4MNMA 4YPJA 2YA2A 2DH3A 2CIPA 3FN9A 1FP9A 2CBIA 1TMQA 2JF7A 1JZ4A 1BQCA 3WNLA 2YDQA 1ESWA 1H0GA 3AIWA 3PHAA 2OSYA 1G5AA 4JFVA 2HISA 1MW3A 1V6UA 3WFLA 4AD4A 3DYOA 3CMGA 1JYWA 2UY2A 4GZIA 2ZUWA 4HMCA 2E8YA 1DWFM 1LQ0A 4PTMA 1JF5A 4OBRA 1MWOA 2JFEX 3W25A 3ARYA 1JG9A 1E4MM 3DYMA 3K4DA 2EXOA 3VD9A 4V27A 2D22A 1FH9A 1HF6A 3E1F1 4LYQA 1CGXA 3TTQA 3ZIZA 1V02A 1TE1A 3MS8A 1DTUA 2ZXQA 1VEMA 2X0YA 1ZBKA 1UA7A 2J62A 3WNPA 1TR1A 3ZSTA 4H04A 2E4TA 4JZ5A 3VIJA 3VDBA 2WMHA 4PN2A 2ZUSA 3ARVA 4LQ1A 4W8BA 3NSMA 4UQCA 1J18A 2OWXA 2EQDA 3EMCA 2UY3A 3VNYA 2ZX6A 1V6WA 3M7SA 4W87A 1W9BM 4X0VA 4QCEA 1KGXA 1ODZA 1PIFA 1CXIA 1GNXA 2IUZA 3L4UA 1TFVA 1X6NA 1CEOA 5GNYA 8A3HA 1MVYA 4NRRA 1R8LA 3M07A 2WMIA 3NDZA 3RIKA 4HPHA 2WSKA 4RE2A 2XVPA 2FGLA 2BY1A 3GH4A 1C7SA 3W37A 5A8NA 1RPKA 1LG2A 2WW5A 5HPOA 3BAKA 1JZ7A 5BWFA 2EO7A 2V3GA 3WBAA 1X1NA 4LGXA 1MQRA 3EDKA 1B31A 2WC7A 1PEZA 3CZGA 4E8DA 4PMOA 2O92A 4U33A 3FNDA 4QDMA 3THCA 2WCAA 3L4TA 5CQ1A 5E70A 1WKYA 1GOOA 2XYLA 1R7OA 1CGVA 2CKSA 3WQ5A 3WFZA 3AXIA 4AZHA 2PWHA 2JE8A 4B15A 3AYRA 3CBWA 1UQZA 3CMJA 4HP5A 2WLYA 4F9DA 1JI2A 2CETA 2GJXA 4OJYA 3UCQA 3B9EA 3SEPA 1VEPA 4HMEA 3VILA 1V6YA 4BQ2A 3WIJA 3OLEA 4UCFA 2F61A 1QW9A 3AIUA 3G6LA 1Q4NX 1B3ZA 2V5CA 1CGYA 1LL4A 1W32A 3W82A 4OIFA 1JYXA 2CBUA 2IXUA 5A6BA 1JAKA 4M81A 5ABFB 3BSHA 3EMQA 2V3FA 2Y24A 2OWWA 4CGTA 1CXEA 2EBNA 3PZOA 1KGWA 1LJYA 3D5HA 4AC1X 2VQUA 1UYQA 2DSZA 4KH2A 3UG3A 5I77A 1YHTA 5JIPA 2BXYA 2YLAA 3LPFA 4HA1A 4RL3A 3B9AA 1EOMA 4U31A 3AXHA 1XC6A 2W62A 4B9YA 1CYGA 5FOOA 4PBGA 4Q7NA 4J3TA 2E0PA 4GI9A 2PB1A 4R5EA 3KL5A 2WZIA 1HNYA 3G6MA 3PZIA 4WF7A 3VIKA 1O6IA 1NP0A 3GXIA 3I3BA 2DIEA 1C3FA 4CD6A 2OLHA 5A2BA 1C7TA 2WWCA 3WL0A 4PSPA 4H8HA 2VX7A 1UG6A 2WXDM 2XFRA 1HJQA 1C8XA 1LL7A 1LWHA 4AD1A 3LPGA 1JNEA 2QHAA 1GOMA 2C8NA 2VCBA 1JL8A 3WEMA 3AIQA 3SUSA 5LA1A 1ZJBA 4N0RA 3VIMA 4P8UA 1GVYA 3OZOA 1EHAA 1W1VA 3WDPP 1K9EA 2BVYA 3AHVA 3M46A 1NOFA 4Z2GA 3ARTA 4U5IA 1D3CA 2FHFA 5LA2A 1WB0A 1JXJA 3PZGA 4MB5A 3BLKA 2YA0A 5HPCA 1J11A 1E40A 1QNOA 2PWFA 3POHA 2WKLA 3TA9A 1JD9A 3VGEA 3AROA 4HOXA 4NI3A 1XH0A 2ZWYA 1D7FA 2RGMA 1C91A 1HKJA 4CD7A 2BY3A 4OOUA 3CTTA 1MQPA 4UQEA 2XM1A 5JBEA 2VZUA 2GSJA 5E0FA 1UHVA 1KB3A 4C7FA 1Y7VA 2J7GA 3QR3A 3W28A 5A8QA 3BMVA 2UWFA 4PUEA 5CXPA 2J74A 4D6GA 2XPKA 5A8MA 2FGZA 3TTOA 1OD8A 1GOQA 4GQQA 4ACZB 2G8ZA 1Q6EA 2CPUA 3AI0A 4PMXA 1XYFA 2J7EA 4LYPA 3RDKA 1NH6A 2WKGA 1W9XA 4U2YA 1NQ6A 2WMGA 3AXXA 1HL9A 1FH8A 3BSGA 1GZJA 2O9TA 1WPCA 1KXTA 5F7UA 4ZFMA 5BXTA 5CLWA 1X6LA 1BYCA 3SCNA 1R7AA 1R87A 2JIEA 2XSBA 3A4WA 2W61A 7TAAA 4ZXLA 5CSUA 4KGJA 2DSVA 5CPSA 4AIEA 4KGLA 1HN1A 4QCFA 1GOKA 1CLXA 1QNRA 1ZBVA 2YIHA 5CLTA 2EJ1A 4GXPA 2J79A 3TTSA 4Z2HA 3AMGA 1E0XA 1E1FA 1KBBA 1TCMA 1J01A 5GNXA 1J10A 2XVNA 4BCEA 1GQIA 4PMVA 1GJUA 1EXPA 3SUWA 4FLSA 4M80A 3AYSA 3ARZA 2WVTA 3RCNA 3WQ8A 3WH6A 1DWJM 1CXLA 2J25A 3VVGA 3D3AA 2Q8XA 3L4YA 5CPTA 2J75A 3IK2A 4UQDA 5E6ZA 2OYMA 4U3AA 4IM4A 2WSPA 3BLPX 2OWCA 2J7FA 1GCYA 1UKTA 5DFAA 3BXWA 3WQ6A 1UKSA 1UWIA 3WNOA 2ZUNA 3ARPA 4MTVA 1HXJA 3SCWA 3L4ZA 4D71A 5CGMA 2WANA 4WK9A 1CXFA 1SMDA 4GQRA 2G3NA 1AQ0A 6A3HA 4MJ4A 4CN4A 1ZB5A 3CHEA 3UR8A 1I1XA 1FP8A 1QVBA 1R86A 5IDIA 1WZAA 2XG9A 4UR9A 3EBVA 1QI0A 4CKQA 5ABFA 2D0GA 4AZIA 2PC8A 2WWDA 1OBAA 3DYPA 3L2LA 1GHSA 4CCCA 2EPLX 1VENA 1ZBWA 1E4IA 1OSEA 4NF7A 1H3GA 1JF6A 3BGAA 6TAAA 1DWHM 2VURA 3CUIA 3VMOA 1W9PA 4HU0A 1MQQA 1JI1A 3FHAA 1V02E 4UQ9A 4U3CA 1P6WA 4CUCA 3QGVA 2ZE0A 1CNVA 2FDMA 4CVUA 1ISZA 1E1EA 1V6VA 5A3HA 2J77A 2VQTA 1BVZA 1BFNA 2YL8A 3NIYA 3U57A 2QPSA 4EANA 3PZ9A 3L4XA 1WDQA 1J0KA 1LG1A 1V3IA 3ZQ9A 2VR5A 4GIAA 3W53A 3MO4A 3QHNA 4FK9A 3HMCA 1B1YA 2BV9A 4A3YA 3MMDA 1UR4A 1GHRA 4M1RA 1E3ZA 1E70M 1KWKA 3WD1A 3N9KA 1E6SM 4H8VA 3VD5A 4V28A 4UFLA 4ZEPA 4AZ6A 1UA3A 4OBSA 3FY1A 1DWGM 4JCMA 1VFFA 4D72A 4LPCA 1FA2A 1UUQA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UR8 A;  3WMB A;  1UR9 A;  1GQK A;  4XB3 A;  2AMG A;  4CCD A;  3NSX A;  4TTG A;  1VAH A;  3OA5 A;  2XTK A;  1QOX A;  2JEQ A;  3VNZ A;  1B30 A;  3ALG A;  3WUG A;  1CWY A;  2ZX7 A;  4WKH A;  4NRS A;  2XWD A;  4PYS A;  3TON A;  3AML A;  3GH5 A;  2VJX A;  1KFW A;  1UD6 A;  5E0C A;  1H5V A;  1SYT A;  1TA3 B;  4LX4 A;  3CHF A;  1C8Y A;  4MNK A;  2JEP A;  1NWS A;  4W89 A;  3T09 A;  5JBD A;  1XSI A;  4W93 A;  1U33 A;  5A8P A;  4WSJ A;  1NP2 A;  3AMD A;  3K8L A;  3BCF A;  4JAW A;  1Z32 X;  1JGI A;  2ZXD A;  4AD0 A;  1V3J A;  4PMN A;  3UES A;  1HKM A;  4X0N A;  1QHZ A;  2B31 A;  3W81 A;  3HN3 A;  2E40 A;  4TXE A;  4C7G A;  4EK7 A;  2E3Z A;  3WBE A;  4TX8 A;  3WDQ A;  3IAN A;  4UFI A;  3MV0 1;  2V38 A;  4R27 A;  3SUT A;  1AVA A;  5M3W A;  2BNJ A;  3CIV A;  4QP0 A;  1E6Z A;  1WNO A;  2UY4 A;  3PN8 A;  1H11 A;  3IAQ A;  3PZQ A;  2WB5 A;  1WAW A;  4HZ7 A;  1HKK A;  1BYB A;  1OIM A;  2X0H A;  3AHY A;  1HJU A;  3FXY A;  2GK1 A;  1JDD A;  1JZ2 A;  2YBU A;  2FH6 A;  5JBF A;  2BVT A;  2CER A;  4AEE A;  3A4X A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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