4YQVA

Glutathione s-transferase omega 1 bound to covalent inhibitor c4-10
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
b'SARSLGKGSAPPGPVPEGSIRIYSMRFCPFAERTRLVLKAKGIRHEVININLKNKPEWFFKKNPFGLVPVLENSQGQLIYESAITCEYLDEAYPGKKLLPDDPYEKACQKMILELFSKVPSLVGSFIRSQNKEDYAGLKEEFRKEFTKLEEVLTNKKTTFFGGNSISMIDYLIWPWFERLEAMKLNECVDHTPKLKLWMAAMKEDPTVSALLTSEKDWQGFLELYLQNSPEACDYGL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mechanistic evaluation and transcriptional signature of a glutathione S-transferase omega 1 inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase omega-1
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 80
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.20.4.2: Methylarsonate reductase.
pdb deposition date 2015-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4yqvA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4yqvA01
3DYRA 1PX6A 1GUKA 1EP8A 3CTFA 3IE3A 2FWEA 3DVWA 3WGDA 2ZCTA 4YQMA 2B1KA 4TRXA 1G6WA 1SYRA 3FK8A 4O92A 4BVYB 1GNEA 2G0FA 2L5LA 4ZIJA 5H5RA 4DSSA 1T4ZA 2QSIA 5DQYA 2JZRA 1XVWA 2LJRA 2VOCA 1YF0A 1M2DA 2AJQB 3IDVA 3G7JA 4MJBA 1GTUA 4ZBAA 3APOA 1TW9A 3C71A 3Q6OA 3MNGA 3KTBA 4N30A 18GSA 2ZNMA 4X1UA 1B4QA 4XRAA 4BWQA 4FO5A 3HKRA 1GSUA 3DKSA 4PUAA 1H75A 5FWGA 2DMLA 1K0OA 2FNOA 3IR4A 2L57A 1PN9A 4GF0A 5J5NA 3HZ8A 3QMXA 2GSQA 4I2TA 1MDJA 5CRHA 5IQYA 2WB9A 1EV4A 3TJJA 3LJRA 4G0LA 3KJYA 2MMAA 4V2MA 3TGZA 4YAPA 2GZYA 1F3BA 1TRUA 4K7IA 1QXHA 1CQHA 5D9VA 5HFGA 4ZB6A 1ZMAA 5F07A 2JADA 3A2WA 3TKSA 3ME8A 2VIMA 3EMPA 4HDEA 2H6ZA 1XWAA 4XS4B 5JWQB 4NV5A 1WWJA 4L5OA 5IPGA 3VPTA 4E8HA 5ECOB 1A2LA 1G6YA 5EPFA 3FZAA 1K0CA 3DEXA 3FZ4A 4TR3A 3GTUB 2BTOT 3TRQA 1T1VA 4I2UA 3E9JB 1QFNA 2N5BA 2OE0A 3H93A 2HRNA 1U6TA 4G10A 1YZXA 3ZIVA 5JCWA 2GQMA 4RUVA 2H6YA 2H1AA 1K3LA 4BVYA 4D73B 1GSSA 4NMUA 4PNGA 1TRSA 1EOGA 5H5SA 2N5AA 1YF1A 1AQVA 4MF5A 4NPBA 1GNWA 1GP1A 3F6FA 1HNBA 1PA3A 1YEPA 5DJMA 4NAXA 3ZTLA 1MD3A 4K9ZA 2HT9A 3UIWA 2NBSA 1TKDB 1WPIA 2Z9SA 3MAKA 3GH9A 4ECIA 4EXJA 4GCIA 1FAAA 2F3MA 3IXRA 5ECHB 2EC4A 3UMAA 1E6BA 2LQOA 3L0HA 3DGQA 2YWMA 1SK2A 2YWOA 4MZBA 1AW9A 2XC2A 1KNGA 1V40A 4ZBDA 3MWHA 2DC5A 4IW9A 2CVBA 3GV1A 3GRXA 4WR4A 3ED3A 5IPHA 2VLTA 1EP7A 4AJ6A 3M0FA 1X9WB 4PUFC 4TOPA 4EDYA 4XHMA 3EINA 4XS4A 2I1UA 1JHBA 1XWKA 20GSA 3PH9A 1VGLA 4FYUA 1TJDA 5D9TA 3KD0A 3GTUA 1T7PB 3LFLA 1XWCA 2AHEA 3A2VA 4IKHA 3EVIA 2L4QA 2GVPA 2HSYA 3IK7A 2I4AA 2REMA 1THXA 1XZOA 2KHPA 2RUFA 4L0UA 1XWBA 3IAM2 5AGYA 3EC3A 1O6JA 5IMVA 4H86A 1U3AA 3L9SA 4TKYA 1VF2A 4EVMA 4O7HA 3VWWA 2ALBA 3I9V2 5D96A 3TJKA 3HVSA 1TU7A 1M7TA 2H1GA 2DJ2A 2JZSA 1OC8A 2OA7A 5J4UA 4IJIA 4LL1B 3QAVA 1R7HA 2IPAA 4HUAA 3FZ5A 4L0WA 1LJRA 1PSQA 3F63A 1JZRA 1PQNA 2R2JA 1M9AA 2P31A 3W8JA 4PX1A 3EU4A 3HJMA 2GZPA 1AXDA 4K0NA 4WBJA 2R3XA 3A2XA 4MZWA 1KEBA 4TR4A 2B7JA 4XIHA 4I8BA 3TKSC 2KUCA 1VF3A 4OCFA 1SJIA 1WRYA 5B6MA 3HZ4A 3RBTA 5G5FA 2YZHA 4F9ZA 1GUMA 2EIRA 3ZLPA 5H5QA 3ZVJD 2WULA 4MPGA 2DMMA 2YJ7A 2FUG2 2O85A 2C0DA 1O7UA 2L5OA 4HQZA 1PKZA 1JZOA 4PURA 2N5FA 1J9BA 3QAWA 2HI7A 4MDCA 2V6OA 1YJ6A 4L8EA 1URMA 1PMTA 2IMDA 2C1YA 1NHOA 3FEUA 4IP1A 3G7IA 4HI7A 1SYXA 1KTEA 2ZUPA 3KZQA 4NV2A 4MPFA 5HR1A 3IRAA 1EEMA 1NSWA 4ZBBA 1SL1B 3QD9A 5GSTA 4DSRA 4ZB8A 4RQXA 4Q5QA 3CSHA 2IWTA 2JSYA 3CRUA 2VLVA 5CREA 4PGTA 4BVXB 3VURA 3D21A 1RW1A 1PGTA 1R5AA 4IHUA 5DDLA 3ZRDA 1PL1A 2C8UA 4GRFA 2VAFA 4JE1A 4HS1A 1O8XA 1PD21 4MZCA 1K3OA 1N8JA 4DVCA 2HYXA 4DSSB 3L9VA 1WIKA 2B7KA 2P5QA 1XOAA 2AUVA 2LQQA 3APQA 3CSJA 3LQ7A 4G19A 2OADA 4KX4A 5ECPB 2OKAA 3EU3A 4GTUA 1V57A 1FW1A 5ELAA 3PINA 3HHVA 1QUWA 1THOA 4GSNA 5F8BA 4FYBA 1O81A 5E59A 3CXGA 1A0FA 4F0BA 1QGVA 3UAPA 3HXSA 2GQLA 4GSTA 3TKRA 1ZGNA 1YKAA 3TJBA 4X0XA 3GKKA 2OE1A 3H1NA 1UA5A 1XW5A 1Y6EA 5HR2A 9GSSA 3APSA 1M0UA 3F4SA 2H70A 3GX0A 1Z9HA 5DCGA 5G30A 1OE7A 1SK0A 5IO2A 4KGIA 2HSHA 4L5LA 1WOUA 1JZWA 2A2RA 4HOJA 10GSA 3BBYA 2GZZA 4XRDA 2HSMA 4JZQA 2H71A 4JEDA 2FD3A 2PERA 4YH2A 2H0IA 2NDOA 1JZDA 2HQTA 1CQGA 2K9FA 3WGXA 2V6KA 5L71A 5KEJA 2MZCA 2RLIA 1KBNA 2C80A 4BVXA 1TI3A 3P90A 4JRRA 1K3YA 3ZMKA 5EY6A 1H4OA 4ACSA 1PL2A 3UVHA 5G31A 4QL7A 1ERVA 1ST9A 3CTGA 1TK5B 5IMAA 3CBUA 3E0UA 4DEJA 4POKA 5KN0A 2K18A 2C3NA 3TRXA 3GSSA 2RM6A 3IHQA 5J3RA 4TR1A 5HFIA 4TVEA 4TXVA 2IFQB 3ZIJA 1UC7A 5AIXA 1TTZA 3KP9A 3F6DA 3VWVA 5LNKe 2AYTA 2PGTA 3A3TA 4OO4A 2PMTA 2M80A 3DVXA 1M9BA 4ZXGA 5IMDA 2MYGA 3HY2A 2LSTA 3PPUA 2OJLA 2L6DA 3QPMA 4MMMA 4MP4A 4I5QA 2EIQA 1GH2A 1YKCA 5A4WA 5HR3A 3J7Yb 3KH7A 2HE3A 3EWLA 3IBHA 4KH7A 2K8VA 4USSA 4PNFA 2CZ2A 1F3AA 3ZVJA 3HVXA 16GSA 1ILOA 4HEA2 2C3TA 1MDKA 2TRXA 4ID0A 1VF1A 3C8EA 2LTKA 2JSZA 2IMEA 5CYYA 2HRFA 2H75A 2H6XA 1NM3A 1FG4A 1PRXA 2C0FA 2QGVA 2PN8A 1U3IA 2AB6A 2WZ9A 4TR0A 4WR5A 3LYKA 4LLRA 1WMJA 3UJ1A 3I6AA 4GWRA 3FZ9A 1WP0A 1BEDA 4POMA 4BPYA 2GT5A 1A8LA 2CX3A 3KTLA 1U88A 1W89A 3FY7A 5ECIB 1JLVA 4I97A 4EDZA 3GN3A 2H66A 2IJYA 2IFQA 4KW6A 2B5EA 3UOMA 4PQHA 2B6MA 1JFUA 2FWGA 2JACA 1USBA 5JWRB 3KH9A 6GSTA 3UBKA 1G7OA 3RPNA 1IYHA 2A2SA 4MH3A 5ELGA 2PBJA 4WETA 1GRXA 2C3QA 1S3AA 1ACVA 4HJMA 4V1Ap 4IQ1A 1GSEA 4KAEA 1V98A 4QL9A 3TOTA 5IMZA 2UZ8A 4K7OA 3GYKA 3VLNA 5DAKB 1G7EA 1T8EB 2FWHA 2LNTA 2PVOC 2YV7A 2YNXA 3HYPA 2LUSA 4HZ4A 1XPVA 1F9MA 3VI5A 6GSWA 3D22A 3VFIA 4TW5A 2QC7A 1UVZA 5IOXA 2DIYA 3RHCA 4K1FA 5B6NA 4YQUA 2DJJA 3KP8A 3N5OA 3D4TA 3GKMA 3L78A 3ZL5A 1GSFA 3WD6A 2DLXA 5LD0A 3V1WA 1M2AA 2R37A 4K8MA 2XHFA 3SWLA 2CV4A 5CP1A 2L6CA 4AF2A 3BCIA 4OD7A 1PX7A 3DRNA 2DJ3A 4ECJA 4KNDA 2LRNA 3LSZA 3BJ5A 3KGKA 5AIVA 3TKSE 4BWSA 1FO5A 1ERTA 4KE3A 1O73A 3FRCA 2RUEA 1ERUA 1OVNA 1TU8A 2FY6A 3DD3A 3O76A 3GFKA 4IQAA 1MTCA 2HRKB 4KDXA 2VCXA 1XXUA 3KXOA 4ZL7A 1OKTA 3C73A 3QFAC 1XBSA 2IL3A 1ZZYA 4FH8A 2R6KA 3BCKA 2B3SA 3RDWA 4AGSA 1GSDA 1IYIA 3D6IA 2WGRA 3HA9A 5COHA 1HD2A 2J9HA 1A8YA 2TRCP 3EURA 3RAZA 3VK9A 4AJ7A 3ERWA 2IMKA 2YWNA 4WF5A 4ZL9A 2OACA 2K8SA 1EZKA 2V32A 1U87A 2GQKA 4ECBA 3CRTA 4F0CA 2V41A 3A5WA 4RI7A 3ZFLA 4KUNA 2HXKA 4IN0A 3FR6A 2J23A 2KOKA 1QK8A 2GGTA 3I43A 4AJ8A 4V2LA 3IC4A 2BMXA 1GUHA 5DAKA 1AQXA 3C1SA 4KSOA 4BL7B 5J9BA 6GSYA 5IO0A 3ZZXA 1MEKA 5DCHA 1XVQA 3GH6A 3KM6A 4JBBA 4EC0A 4MABA 4GQCA 2GS3A 4IVFA 1HQOA 1VF4A 4NHZA 3TKQA 3QOUA 2GSTA 1K0DA 3QDNA 2H0GA 8GSSA 2F8FA 2GSSA 5AISA 3RHBA 1FB6A 2A4VA 1LU4A 4E8EA 3D0ZA 1NW2A 1AAZA 3Q18A 1T4YA 1ABAA 2YANA 4JR6A 4XS6A 1ZOFA 1XW6A 4PQ1A 2X8HA 3GSTA 4EUYA 5D9WA 4K2DA 4LMWA 4WBRD 5EL8A 2I3YA 4JR4A 5CRWA 3LXTA 3GHAA 1TRVA 3R3EA 2MBSA 1GL8A 1XCCA 2VD0A 4ULXA 5ABRA 5IM9A 2YJHA 1AQWA 2ON5A 1OAZA 4TXOA 2HSMB 4KB3A 1I9DA 2HRKA 1TK0B 5C04A 2F9SA 2YN1A 1B9XC 4Q5FA 14GSA 4BA7A 3AY8A 3LEFA 3FW2A 4J2FA 1SJZA 1ZCPA 4J57E 3GX8A 3GL5A 5C00A 3HVVA 3IPZA 1C72A 1V2AA 3UBLA 2VUPA 3M8NA 4HU9A 3ZYWA 4V2NA 2P5RA 5CRDA 1SD9A 5ENUA 5G1KA 3TJFA 3TRPA 3W6GA 1EGOA 3L4NA 2NVLA 2M72A 4OWYA 5BMUA 6GSVA 3O6TA 2CQ9A 4TR1B 4HJ2A 5B7CA 2HFDA 4BL7A 3KMOA 2FA4A 3L9UA 2B1LA 5A5KA 3ERGA 4PTSA 2CVDA 3WYWA 3DXBA 3TOUA 5ECMB 3RPPA 4N0VA 4MLYA 2IMIA 4KCEA 2FA8A 4J56E 1EEJA 3LGCA 1K0AA 2KLXA 3KIJA 2H76A 3LYPA 1XIYA 4O32A 4MA9A 5DQSA 4MH2A 2L4CA 1AIUA 2BJXA 2DIZA 2M46A 3CYNA 1F37A 5IMFA 1Y25A 3HCZA 3S9FA 1EOHA 2R5GA 1R4WA 4MJCA 5F06A 4K7NA 2X8GA 5KN1A 4KCAA 1JLWA 3Q19A 3H4KA 5J9CA 2V1MA 4KF9A 1Q4JA 4MF7A 5DALB 1SKWB 5ECLB 4XS1A 1A0RP 3VI7A 2GT6A 1K0BA 4KDYA 19GSA 1X9SB 3U6VA 3MSZA 4OFTA 6GSUA 2WCIA 1GLPA 4RQRA 2HZFA 1K0MA 1R26A 1Z5YE 1A24A 2OBIA 13GSA 1BYEA 5JCGA 4CHSA 1SD8A 1X5CA 2O8VB 2VD1A 1OC9B 4O5RA 4MK3A 1XW9A 4HZ2A 1BG5A 5ECRB 2DJ0A 4EE0A 1E2YA 2LRCA 1OYJA 4Q5NA 2HRAA 3VWXA 1SU9A 3F9UA 1DE1A 4QQ7A 2CZ3A 4RI6A 2K6VA 5B8BA 2VCWA 1NHYA 2YPMA 4LA1A 2IIYA 1F6MC 3GA4A 3LWAA 2WDUA 2PWJA 1RQMA 3EE2A 3GUSA 2VL9A 2X64A 3CSIA 2B5XA 2WFCA 1EGRA 1M99A 2LS5A 3TKPA 2YV9A 1ML6A 2MMOA 1ZL9A 3QR6A 1HYUA 5ID2B 3WT1A 3OR5A 4G9HA 4OFMA 2GDRA 1O8WA 4OCEA 5G5EA 4MJAA 5GZZB 1X5EA 1FVKA 5ECNB 2H72A 3TJGA 2YOIA 7GSSA 1WE0A 5CAXA 3NZNA 3CMIA 5D9XA 3GKNA 3GURA 1QQ2A 3H79A 4IELA 1Z6NA 5DALA 1N2AA 1X0RA 11GSA 3P8WA 3JCML 2VM2A 4ML1A 1W4VA 2H0HA 2CAQA 1FHEA 1B48A 3ZFBA 3K8NA 3M3MA 3UEMA 3GKXA 4YAVA 4ILFA 4WXTA 1GTIA 4G0KA 1TOFA 1A2JA 4POBA 5G2ZA 1F2EA 3Q74A 1A2MA 2PUKC 1SK1A 4ZILA 4LL4B 4N0ZA 4PXOA 2MMZA 1Z3EA 4EL1A 3D4MA 2D2ZA 4FYCA 1OC9A 1S3CA 1PKWA 3TB2A 2YCDA 1FB0A 3EYTA 2OE3A 3U5RE 2C4JA 3FR9A 2CT6A 2B5YA 3UARA 1HNAA 2KP2A 2F8AA 2PPTA 4KDUA 3LG6A 1TK8B 1SKRB 2H19A 5IOWA 2VL2A 5A4UA 1BAYA 1ZYEA 5D73A 2QKEA 1GULA 3GL3A 5A4VA 2VLUA 5EVOA 4G2EA 3M9KA 5CNWA 4ZL8A 3ISOA 4F03A 2RIIA 17GSA 5ID2A 3G9BA 4MJEA 1XOBA 5DJLA 2YWIA 4CDOA 4MF6A 3H8QA 4IBPA 2PVQA 3P2AA 1I5GA 2LKUA 1QMVA 3FR3A 2LRTA 2CVKA 2DSAA 1J0FA 2E7PA 1G0TA 2IN3A 1MD4A 3TUEA 1B9YC 2DBCA 2KP1A 4Z7XA 3W8SA 3F3RA 2H30A 4GSSA 4GXZA 4N11A 3IV4A 5CO3A 2H01A 2O87A 1DE2A 5LCZA 1SKSB 2GLRA 5G1LA 1BQ7A 5HR0A 4YQVA 2HLSA 3PR8A 3IOSA 5GAPD 1AUCA 2E2MA 2MMNA 3NIVA 2LJKA 4G0IA 12GSA 4ZB9A 3P7XA 3FKFA 3R2QA 4TXOB 5F0GA 1WJKA 2VCQA 5F05A 2OBKA 4DSQA 3KMNA 6GSSA 4V1Ag 2HSNB 1M2BA 4ML6A 2C0GA 4D73A 2O7KA 2V2GA 3KCMA 2RM5A 4TN8A 2H73A 2XBQA 4X43A 5CRGA 2FCHA 3ZITA 5AN1A 1YQ1A 1GSYA 3DWVA 1BJXA 2H74A 3ME7A 2XBIA 2FLSA 2CA8A 2I9HA 1SJ6A 4GLTA 4K6XA 1SENA 1Z7PA 4EF0A 3F4TA 3VWUA 4XTSA 1YY7A 5ECSA 2H1DA 4NXIA 2JZTA 3D5JA 4EO3A 2WJUA 1O85A 2L59A 1OKDA 1LBKA 3HJOA 1TP9A 1GLQA 3F3QA 2O89A 5IMCA 3F4RA 2GTUA 1YEXA 1XWGA 4GQFA 4IS0A 3VPQA 3J7Yk 2HZEB 4ECCA 2VCZA 3IC8A 2EIOA 3HDCA 4F82A 2JL4A 2H8LA 3F8UA 1DSBA 5J41A 4XCSA 4WKWA 1EV9A 3ZREA 1T3BA 1X5DA 4WEYA 2R4VA 1Z7RA 1VRSD 4OO5A 3UVTA 5D8IA 2LJAA 2NPBA 1AC1A 3QAGA 4KA0A 1X9MB 2FWFA 1B4PA 3I69A 2DJKA 4EKZA 4OMVA 4MCUA 1RK4A 5DBQA 2TIRA 5DVBA 3KEBA 3GIXA 3FYGA 5JWOB 2FHEA 1TRWA 1Z6MA 3ZMLA 3PGTA 3ERFA 1TDIA 2JU5A 1FOVA 5GSSA 2WRTA 2VO4A 2VL3A 2NTOA 4Q5RA 1XFLA 2ES7A 2ON7A 1DUGA 2WS2A 2CX4A 2VL2C 3M1GA 5HFKA 2E2GA 1B8XA 3C7MA 2LEGA 2C0EA 4NWYA 2F51A 2IMFA 3MDKA 22GSA 3EMXA 5IIZA 2MBTA 4PQIA 1OE8A 1BX9A 5FHIA 1YDKA 4FQUA 2H1BA 1K0NA 1A23A 3QCPA 5FT3A 1TI1A 3C1RA 3US3A 4IGJA 1GSQA 2FGXA 4I6XA 4NHWA 3WGEA 3WT2A 4KSMA 4IP6A 1ERWA 1FVJA 3BD2A 2PU9C 4WF4A 2I81A 4POLA 2YP6A 3F0IA 2X99A 4P3YB 5ECKB 3IK9A 3NOFA 4N10A 2HZEA 3IA1A 3O3TA 2VCTA 1T00A 1SL2B 2VM1A 5HQPA 5GAND 2XPDA 4OFNA 1ZYQB 5D93A 3GNJA 1MDIA 3DIEA 3LORA 6GSXA 2VCVA 2E0QA 4IJ3A 4JU5A 1V58A 2DJ1A 3SBCA 2HNLA 3BOAA 3UL3A 2XPEA 3HD5A 1S3DA 4HU7A 2LV3A 3M9JA 2G2QA 4K0GA 4F2IA 5KN3A 5JCUA 1GTBA 2LNSA 3N9JA 1V9WA 4FIWA 1GWCA 3LXZA 4HQSA 1EWXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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