4YXCA

Complex of flim(spoa)::flin fusion protein and flih(apar)::t4lysozyme fusion protein
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
182
structure length
182
Chain Sequence
GPVDMSNELPWQVWTPDDLAPPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Protein transport
molecule keywords Flagellar assembly protein H,Endolysin
publication title A common assembly module in injectisome and flagellar type III secretion sorting platforms.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar enteritidis str. se30663
total genus 61
structure length 182
sequence length 182
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-03-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4yxcA00
1EPYA 1L00A 1L55A 2RB2X 137LA 1L22A 1L0JA 3G3VA 1L19A 1LI2A 2F2QA 1P37A 259LA 4W57A 1L87A 2RBQA 1L24A 4I7TA 1D3MA 2OU9A 1L80A 1C6AA 3FADA 1QT5A 4YXAC 1L45A 260LA 181LA 1CV1A 2OEAX 3FA0A 1C67A 1L47A 226LA 111LA 241LA 1L10A 3L64A 2O7AA 2B6ZA 1L63A 1OVJA 1L56A 257LA 1P3NA 3HH5A 2Q9DA 1G0GA 1L11A 1LYGA 3CDVA 1G1WA 1QSBA 2RBRA 3HUQA 1T6HA 261LA 1L39A 164LA 1L70A 222LA 1PQKA 3HH4A 1L88A 1CV4A 4K5YA 120LA 4PK0A 216LA 253LA 1L46A 168LA 1C6BA 1L18A 1DYCA 1C6MA 1ZURA 1L57A 174LA 1C65A 167LA 229LA 150LA 1QT8A 178LA 122LA 1QTZA 3NY9A 1L61A 2OTZX 112LA 129LA 3GUOA 2IGCA 1C6EA 159LA 237LA 1T97A 3HH6A 3SB5A 127LA 1LGWA 3VW7A 3OE9A 173LA 2F47A 1C66A 1D3JA 212LA 1QTVA 1CU5A 217LA 113LA 4LZMA 1QS9A 1L02A 1SX7A 1C6JA 1I6SA 220LA 1QT7A 1XJTA 3PDSA 1K28A 2B73A 1L04A 3HT9A 1CUQA 3GUIA 3DNAA 4ARPA 1KW5A 1L0KA 1C6FA 1L48A 142LA 249LA 1JQUA 180LA 2NTHA 256LA 2Q9EA 4EXMA 1OVHA 4ARJA 156LA 1L86A 205LA 3HTBA 3CDQA 1KNIA 1C68A 1L74A 2HUKA 4ARMB 199LA 1CX6A 1G1VA 145LA 110LA 1L84A 228LA 206LA 3OE8A 115LA 3GUNA 243LA 1C62A 3OE6A 1C6QA 4E97A 1D2YA 233LA 152LA 3UONA 1C63A 4LDLA 247LA 107LA 239LA 102LA 3GUMA 1OYUA 221LA 3F8VA 3NYAA 3SB9A 1CU3A 1G06A 1L31A 2OE7X 4W58A 177LA 4I7KA 4I7JA 201LA 165LA 1QS5A 1C60A 3CDRA 223LA 2ANVA 3D4SA 2NTGA 3V2WA 1PQJA 1L51A 3DN2A 3C7ZA 157LA 1L77A 3QAKA 1L38A 4W56A 1L95A 218LA 1G07A 172LA 1L92A 219LA 1C6PA 2O79A 3C82A 128LA 1L03A 248LA 141LA 4LDEA 118LA 123LA 1L71A 1CU2A 1P56A 3C80A 3HH3A 1QUOA 231LA 2RB1X 1L65A 160LA 144LA 163LA 4ARQA 1C61A 210LA 4DKLA 1C69A 2B6WA 2OTYX 1L66A 1L83A 170LA 4YXCA 1DYGA 1P2RA 200LA 1G0JA 1LYEA 196LA 211LA 1C6LA 1G0MA 140LA 1P5CA 3C7YA 1G0KA 2B70A 1D9WA 3DN3A 1LPYA 1B6IA 1L27A 2RB0X 3CDTA 244LA 147LA 4I7OA 2O4WA 1L34A 1P6YA 3ODUA 2B6XA 3JR6A 1P64A 190LA 1L93A 131LA 3HTFA 1T8AA 2RBNA 3OE0A 245LA 4W55A 187LA 1QTDA 4I7SA 2RBSA 4ZPUA 1D3NA 4OO9A 1QT4A 3L2XA 1PQOA 1L50A 175LA 4I7PA 246LA 251LA 3GUJA 1D3FA 250LA 4EPFA 3V2YA 1L96A 1KW7A 1L94A 3C83A 4W52A 1C6CA 1L97A 1LGXA 4EJ4A 3SB6A 4EKPA 3DMVA 1L82A 1CTWA 1L62A 2B6YA 1WTHA 1NHBA 4EKSA 4EKRA 109LA 225LA 3HT8A 4EPIA 149LA 3HT6A 155LA 3G3XA 1DYEA 3HU8A 1G0LA 4PJZA 232LA 4S0WA 162LA 2LCBA 158LA 1XEPA 230LA 2LZMA 1JTNA 1L37A 1P36A 1CU6A 5LZMA 143LA 1DYDA 1L59A 1SX2A 1CV3A 262LA 258LA 1C6DA 4YX7C 3DN4A 1C6HA 4AQNA 3HTGA 1CV6A 3RZEA 1L89A 1SWYA 3K2RA 3C81A 3FI5A 1LI6A 4ARLA 1CV5A 3G3WA 1L81A 1LYIA 255LA 2QARC 1L07A 1L60A 176LA 1TLAA 191LA 1C6NA 185LA 4LDOA 1L32A 3GUKA 1LYHA 1L72A 1T8FA 2A4TA 1L36A 3DN0A 224LA 114LA 1QUHA 3DN8A 3GULA 1LWKA 2ANXA 1L05A 1L42A 1L16A 183LA 4EKQA 161LA 1DYFA 1L73A 3SB7A 3PBLA 1JTMA 1QTCA 1L91A 3HUAA 1QUDA 1PQMA 234LA 2OE4X 198LA 1LLHA 119LA 4W59A 195LA 2RH1A 1L68A 148LE 1SWZA 2QB0B 3EMLA 184LA 1C6KA 1PQDA 214LA 254LA 1CX7A 104LA 252LA 2HUMA 1QTBA 236LA 3HDFA 1T8GA 1ZYTA 3HWLA 1L25A 3HTDA 4IAPA 242LA 2RAYX 3SN6R 146LA 1L69A 2OU8A 1QSQA 1P46A 3SB8A 3DMZA 1L14A 2B72A 1L28A 4I7LA 1LW9A 139LA 1L40A 1KS3A 1L41A 1SSYA 4ARMA 1OWYA 1L44A 166LA 4I7RA 189LA 6LZMA 169LA 130LA 1DYAA 1G0QA 1P2LA 1CVKA 1LI3A 1XJUA 3DKEX 2OE9X 4GBRB 3SBBC 1LYJA 1QTHA 4I7NA 171LA 1L12A 1L15A 1L54A 1OV5A 2OU0X 1L01A 3HT7A 3DMXA 1C6TA 3C8SA 4DJHA 1P7SA 1L09A 3SBAA 2RBOA 1L85A 4I7QA 126LA 1L29A 3HUKA 209LA 2CUUA 1L67A 3RUNA 197LA 2HULA 1D2WA 1CUPA 103LA 1ZWNA 5I14A 1L17A 1L08A 240LA 1L75A 1L13A 125LA 2F32A 1OV7A 108LA 1L23A 1SSWA 2B75A 3LZMA 1CU0A 3NY8A 2B74A 1QT6A 1L58A 4W51A 4DAJA 1KY0A 1LGUA 1C6GA 1L76A 1OVKA 186LA 1PQIA 1L98A 1C6IA 1QUGA 4ARQB 215LA 238LA 182LA 1L49A 1QT3A 1L06A 1L43A 3C8RA 213LA 1L33A 1L20A 2B7XA 1L35A 2LC9A 1L30A 1CV0A 1L79A 1L99A 4W54A 2L78A 1LYFA 138LA 1C64A 4W53A 192LA 3CDOA 4I7MA 3C7WA 2B6TA 1L26A 1LYDA 3DN6A 1KY1A 1L21A 3HU9A 227LA 3HDEA 1L53A 2RBPA 3DN1A 1OWZA 1L64A 3GUPA 1DYBA 2RAZX 4GRVA 1L90A 3C8QA 1L52A 2Z6BA 188LA 1G0PA 151LA 235LA 7LZMA 3F9LA 1LWGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2MEEA 3A6CY 4NGOA 4DQ7A 3G3VA 1L19A 2XBRA 1L87A 1L24A 4LYMA 1L80A 5FELA 3N9CA 1C6AA 1YROA 5F9XA 4DC4A 2I25L 5B06A 4N8ZA 2OEAX 3A91A 3FA0A 5KXMA 3SP3A 1IY4A 1L10A 3L64A 1GF8A 1VDSA 1OVJA 1YANA 3HH5A 5F16A 2Q9DA 1GBZA 2RBRA 1AZFA 1GE2A 1T6HA 4ETDA 3WUMA 1L70A 3HH4A 1IR8A 120LA 5APFA 1RE2A 216LA 4DD1A 168LA 4NGWA 5K7OA 1C6BA 1L18A 4NFVA 2CWIA 1D0MA 1OUAA 1GFKA 2LZ2A 3HBHA 3CSZA 1TBYA 4ET8A 122LA 2CDSA 1LSCA 3GXKA 4LT1A 1GB5A 127LA 4ZEEA 3VW7A 3OE9A 173LA 2YDGA 4R0FA 3IWRA 1D3JA 2BQDA 1QTVA 4R6CA 217LA 1GB0A 4CFPA 5LVGA 1BB7A 1FLUA 3P64A 1L02A 1SX7A 1T3PA 1IR9A 1QT7A 4NGJA 3PDSA 1RI8B 4X3BA 3A3QA 3HT9A 1CUQA 2DQAA 3QNGA 4KXIA 1LZBA 1OUHA 4H91A 1L48A 249LA 1JQUA 2F30A 156LA 4TSBA 1F10A 1JJ1A 3WL2A 3P65A 2HUKA 1G1VA 1LMNA 2Z2EA 4H1PA 4N5RA 4XJGA 1C62A 1HFXA 3OE6A 2C8PA 1C63A 5KKJA 153LA 4H9IA 1OUJA 2DQCY 4HJVA 1F6RA 4LYZA 3P68A 1F6SA 3F8VA 3SB9A 1RJCB 1G06A 1DI3A 1IP2A 1LHIA 4QDNA 4N9RA 3CDRA 2ANVA 4ML7A 2NTGA 1YAPA 5KXNA 5LAGA 1AKIA 3TXKA 1L51A 1XFPL 3D9AC 1IOCA 1UIEA 4NGLA 5HLLA 1FN5A 1XGQC 2HTXA 1GF0A 4W56A 1B5YA 4MCKA 128LA 2BQEA 3CT5A 123LA 5KXKA 4GCEA 4B0DA 1JPOA 1DPXA 1UIAA 1VFBC 1LZ9A 5FCPA 160LA 163LA 4ARQA 210LA 1C69A 4NHTA 2B6WA 1L66A 1L83A 2DQDY 4RDSA 1LYEA 1C6LA 4WM6A 1G0MA 140LA 3C7YA 1DXJA 7LYZA 208LA 1D9WA 9LYZA 1LPYA 3T6UA 4O34A 1LSPA 5L3HA 2YBLA 1P6YA 4G4CA 1P64A 1BB5A 1L93A 3HTFA 2FBBA 2ZQ3A 207LA 2RBNA 5I5QA 1G7JC 3A67Y 4W55A 4I7SA 1QTDA 4ETAA 1L50A 3WH1A 3A8ZA 1PS5A 3CT0A 250LA 2LHMA 3V2YA 1L96A 1KW7A 1HEWA 2CGIA 3T36A 3AZ4A 4EJ4A 1CKDA 2XQOA 1L62A 1LHJA 1WTHA 1NHBA 4EKSA 1CJ7A 4LFXA 3HT8A 3LN2A 1LYYA 3HT6A 3HU8A 162LA 5LA5A 4CHXA 1P36A 143LA 1DYDA 3DN4A 4J0LA 4AQNA 1OUCA 3HTGA 1PZYA 4ET9A 1L89A 2ZWBA 193LA 1WQNA 1IWTA 3C81A 1DQJC 1LI6A 1IP3A 3G3WA 2I26L 191LA 185LA 2BQMA 4Z41A 1KXWA 1L36A 1QUHA 1BQLY 1SLYA 1L16A 1HERA 3SB7A 2N5ZA 1QUDA 1PQMA 234LA 1D0LA 198LA 1WVVA 4GCDA 4LYBA 2QB0B 1PQDA 4DWXA 1LZEA 214LA 3TXJA 4H9HA 1BWJA 3HWLA 1GD6A 1OUGA 4YEMA 3WPKA 5JENB 1MLCE 1UUZC 2Z19A 3RU5A 3SB8A 1GE0A 2B72A 1IR7A 5LVJA 4HTKA 139LA 1L41A 1SSYA 2G4PA 1B7RA 3A34A 166LA 1YAQA 1VDTA 6LYTA 189LA 4YF2A 169LA 4PRUA 1LSNA 1DYAA 3OJPA 1LJKA 1P2LA 1CVKA 4GBRB 1LHHA 1LYJA 171LA 1WTMA 1LCNA 1GF6A 2LYZA 5I54A 1CKCA 2YBHA 1JHLA 1YKYX 3C8SA 1P7SA 1V7SA 3LYOA 1YILA 1LJJA 1L85A 4HPIA 1BB3A 2YSSC 3HUKA 209LA 3WPLA 1D2WA 1BB4A 1L08A 1I56A 2B74A 1FBIX 5L3IA 2DQJY 1KY0A 1PQIA 1XGUC 1L98A 1NMMA 1HFYA 5T3FA 3TMXA 1UIHA 1L43A 2DKVA 1LZAA 1RCMA 2BQLA 1REXA 1L79A 1QDTA 1C08C 2L78A 138LA 1LHLA 1QTKA 1GFAA 3N9AA 5EBHA 1J1OY 2W1XA 3TMVA 1C46A 1D9UA 1L21A 3HU9A 3TXDA 227LA 4Z3MA 1YIKA 1OWZA 1D6QA 2RAZX 2BQOA 4GRVA 1L90A 188LA 151LA 235LA 3HFMY 3A94A 4I8SA 1LJ4A 4OOTA 2ZYPA 1JJ3A 1IP6A 5J7CA 3CT1A 3EMSA 4NIJA 1P37A 1VDQA 2RBQA 4I7TA 3FADA 3TXBA 1L45A 2A7FA 134LA 260LA 1JKBA 1NKHA 4TX7A 2O7AA 1JTOL 3F6ZA 1J1XY 1L63A 4NHIA 1JISA 1YL0X 257LA 1GWDA 1P3NA 1LJHA 2G4NA 1L11A 3CDVA 5LVIA 4NEBA 1EQ4A 1WQOA 3WXUA 1L39A 2YBMA 2VB1A 2MEFA 2YBNA 1UIGA 4NSJA 3CB7A 2YBIA 1QIOA 1DYCA 1E8LA 1ZURA 2Z39A 2H9JA 174LA 3EBAB 4RW1A 1G7HC 1QTZA 1L61A 5LIOA 4YEOA 4DT3A 1GBOA 1CNSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 113L A;  4LZM A;  1QS9 A;  1L02 A;  1SX7 A;  1C6J A;  1I6S A;  220L A;  1QT7 A;  1XJT A;  3PDS A;  1K28 A;  2B73 A;  1L04 A;  3HT9 A;  1CUQ A;  3GUI A;  3DNA A;  4ARP A;  1KW5 A;  1L0K A;  1C6F A;  1L48 A;  142L A;  249L A;  1JQU A;  180L A;  2NTH A;  256L A;  2Q9E A;  4EXM A;  1OVH A;  4ARJ A;  156L A;  1L86 A;  205L A;  3HTB A;  3CDQ A;  1KNI A;  1C68 A;  1L74 A;  2HUK A;  4ARM B;  199L A;  1CX6 A;  1G1V A;  145L A;  110L A;  1L84 A;  228L A;  206L A;  3OE8 A;  115L A;  3GUN A;  243L A;  1C62 A;  3OE6 A;  1C6Q A;  4E97 A;  1D2Y A;  233L A;  152L A;  3UON A;  1C63 A;  4LDL A;  247L A;  107L A;  239L A;  102L A;  3GUM A;  1OYU A;  221L A;  3F8V A;  3NYA A;  3SB9 A;  1CU3 A;  1G06 A;  1L31 A;  2OE7 X;  4W58 A;  177L A;  4I7K A;  4I7J A;  201L A;  165L A;  1QS5 A;  1C60 A;  3CDR A;  223L A;  2ANV A;  3D4S A;  2NTG A;  3V2W A;  1PQJ A;  1L51 A;  3DN2 A;  3C7Z A;  157L A;  1L77 A;  3QAK A;  1L38 A;  4W56 A;  1L95 A;  218L A;  1G07 A;  172L A;  1L92 A;  219L A;  1C6P A;  2O79 A;  3C82 A;  128L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2MEE A;  3A6C Y;  4NGO A;  4DQ7 A;  3G3V A;  1L19 A;  2XBR A;  1L87 A;  1L24 A;  4LYM A;  1L80 A;  5FEL A;  3N9C A;  1C6A A;  1YRO A;  5F9X A;  4DC4 A;  2I25 L;  5B06 A;  4N8Z A;  2OEA X;  3A91 A;  3FA0 A;  5KXM A;  3SP3 A;  1IY4 A;  1L10 A;  3L64 A;  1GF8 A;  1VDS A;  1OVJ A;  1YAN A;  3HH5 A;  5F16 A;  2Q9D A;  1GBZ A;  2RBR A;  1AZF A;  1GE2 A;  1T6H A;  4ETD A;  3WUM A;  1L70 A;  3HH4 A;  1IR8 A;  120L A;  5APF A;  1RE2 A;  216L A;  4DD1 A;  168L A;  4NGW A;  5K7O A;  1C6B A;  1L18 A;  4NFV A;  2CWI A;  1D0M A;  1OUA A;  1GFK A;  2LZ2 A;  3HBH A;  3CSZ A;  1TBY A;  4ET8 A;  122L A;  2CDS A;  1LSC A;  3GXK A;  4LT1 A;  1GB5 A;  127L A;  4ZEE A;  3VW7 A;  3OE9 A;  173L A;  2YDG A;  4R0F A;  3IWR A;  1D3J A;  2BQD A;  1QTV A;  4R6C A;  217L A;  1GB0 A;  4CFP A;  5LVG A;  1BB7 A;  1FLU A;  3P64 A;  1L02 A;  1SX7 A;  1T3P A;  1IR9 A;  1QT7 A;  4NGJ A;  3PDS A;  1RI8 B;  4X3B A;  3A3Q A;  3HT9 A;  1CUQ A;  2DQA A;  3QNG A;  4KXI A;  1LZB A;  1OUH A;  4H91 A;  1L48 A;  249L A;  1JQU A;  2F30 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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