4YXCA

Complex of flim(spoa)::flin fusion protein and flih(apar)::t4lysozyme fusion protein
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
182
structure length
182
Chain Sequence
GPVDMSNELPWQVWTPDDLAPPNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Protein transport
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar enteritidis str. se30663
publication title A common assembly module in injectisome and flagellar type III secretion sorting platforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Flagellar assembly protein H,Endolysin
total genus 61
structure length 182
sequence length 182
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-03-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4yxcA00
201LA 3DN1A 1DYBA 127LA 1P46A 2ANXA 5I14A 3SBBC 217LA 1OVHA 1C65A 1CX7A 1D3JA 2OU9A 1PQJA 3HTDA 1KY0A 221LA 4EPFA 2F47A 1L44A 2IGCA 157LA 1L55A 1L75A 1L02A 1L53A 1L31A 1C6CA 1L68A 4ARLA 1T8GA 1L29A 1CV3A 1L77A 1PQIA 1L38A 1C68A 1L27A 4I7RA 2RBNA 122LA 164LA 215LA 3C8RA 1L88A 1CU6A 1L67A 1CU3A 1OV7A 1L80A 3C7YA 219LA 167LA 262LA 1LI3A 1LWKA 247LA 195LA 224LA 1T6HA 3OE8A 244LA 3GUOA 242LA 1G07A 161LA 2CUUA 216LA 1P2LA 1NHBA 1C6MA 200LA 233LA 130LA 1QS9A 3SBAA 4ARQA 111LA 2A4TA 3HUQA 163LA 4I7OA 1LYJA 2B6WA 1QUGA 188LA 1QSBA 110LA 1P5CA 1T97A 137LA 3NY9A 1QTHA 2HUMA 2B70A 1L26A 1XEPA 1JTNA 1JQUA 2O7AA 206LA 1C6TA 2OE4X 1LYHA 1QTVA 1DYAA 123LA 1DYEA 1L05A 1L96A 1PQMA 2B6XA 148LE 1L49A 1G0JA 1QUOA 1KW7A 4ARQB 1L08A 4W55A 4I7JA 1L43A 3HDFA 1CU0A 3C81A 1L07A 1L59A 103LA 4E97A 1DYDA 131LA 1XJTA 4W58A 2ANVA 113LA 1L33A 1L66A 1L74A 3PBLA 1L89A 1P56A 1L40A 2F2QA 1L45A 1OYUA 2LCBA 4I7QA 187LA 4EXMA 3DNAA 256LA 1L22A 1CX6A 3D4SA 1L61A 1P36A 4LDOA 3GUIA 2LZMA 2OE9X 1SWYA 3C80A 1C62A 1D3FA 1L00A 241LA 155LA 3C83A 3GUPA 230LA 1L0JA 3DN4A 1L21A 1L95A 1C67A 3DN8A 191LA 205LA 1L10A 1SX7A 3DMZA 3CDTA 1C6PA 3LZMA 2B7XA 1L47A 1L54A 139LA 3CDQA 214LA 1QT8A 3GUNA 4PK0A 1L90A 3EMLA 3HH3A 2HUKA 7LZMA 1QT3A 1DYFA 1OVKA 1G0LA 1L69A 181LA 1C6FA 250LA 1QUHA 3HUKA 1L64A 2B6TA 1L82A 4EKQA 2F32A 3DKEX 1L91A 2LC9A 243LA 3OE9A 4W53A 1L35A 1SSYA 1L73A 149LA 1TLAA 2Z6BA 4W56A 1LLHA 3VW7A 1QTBA 3C8QA 119LA 165LA 1P64A 1L72A 2QB0B 3GULA 185LA 2OTZX 1ZYTA 2RB1X 1T8FA 1CU5A 1C6DA 196LA 159LA 4EKSA 143LA 2RBRA 180LA 1L60A 1B6IA 3SB6A 1PQDA 222LA 253LA 1L86A 4S0WA 1L83A 2OTYX 4DJHA 115LA 1P37A 1P2RA 2RBPA 1LGWA 260LA 3GUKA 1KS3A 3CDVA 170LA 1L93A 1K28A 138LA 1L36A 1L92A 3G3WA 146LA 1L46A 1D3MA 3HDEA 3K2RA 3SB8A 178LA 1OV5A 1L51A 1DYCA 4LDLA 3F9LA 1L16A 3NYAA 1D3NA 1L01A 4ARMA 3SB9A 175LA 4GRVA 1C6AA 1L48A 2HULA 2OU8A 1L03A 4EJ4A 1LW9A 1CVKA 4YXCA 3DMXA 4EKRA 3SN6R 3L64A 235LA 2L78A 2B75A 1KW5A 1L0KA 1L70A 107LA 1OVJA 252LA 4PJZA 160LA 1L12A 156LA 3HH4A 3HH6A 218LA 1ZWNA 2QARC 3FI5A 1G0KA 4W59A 4IAPA 3PDSA 174LA 1LGXA 4ARMB 220LA 2NTHA 1P3NA 1LYFA 3ODUA 3F8VA 227LA 1L04A 2OU0X 1CV1A 1G06A 1L18A 1XJUA 4YXAC 3HT8A 158LA 254LA 4I7KA 4I7PA 240LA 3HWLA 1G0MA 3CDRA 1T8AA 1D2YA 1KY1A 213LA 1L76A 1P7SA 112LA 2RAYX 141LA 1L52A 2Q9EA 1G1WA 198LA 147LA 2RBSA 2RBQA 1C61A 1L79A 1CUQA 1C6LA 1L85A 2B6ZA 232LA 3V2WA 190LA 144LA 1C6GA 118LA 1C64A 1WTHA 1L28A 228LA 239LA 3FA0A 3GUMA 126LA 2B72A 1QSQA 3OE6A 1PQOA 1CV4A 4GBRB 212LA 4W52A 1QS5A 248LA 3G3XA 3HTFA 251LA 1SX2A 128LA 197LA 4I7MA 1C60A 2B6YA 2O4WA 4AQNA 1L65A 173LA 3C7ZA 3L2XA 246LA 3HT6A 1P6YA 4W57A 199LA 4ARPA 108LA 1QUDA 166LA 1OWYA 172LA 4LDEA 223LA 1L23A 225LA 3HUAA 3HT7A 1C69A 1JTMA 2OE7X 1L99A 4W54A 3DMVA 1G1VA 261LA 1L71A 1CUPA 1PQKA 211LA 3QAKA 1C66A 3G3VA 1L39A 4LZMA 1QT7A 114LA 169LA 3HT9A 1L17A 3SB7A 1DYGA 2B73A 3UONA 229LA 3DN2A 258LA 4YX7C 1L13A 1L11A 4ZPUA 4OO9A 245LA 1L50A 3DN3A 184LA 1C6KA 4I7SA 3C8SA 189LA 209LA 1C6IA 1L62A 257LA 4EPIA 2RB0X 1D2WA 1L56A 4I7TA 1G0PA 2RB2X 120LA 1CV5A 168LA 1C6JA 2RAZX 238LA 1L84A 1QT5A 234LA 3CDOA 3DN6A 255LA 1LGUA 1LYDA 237LA 1LPYA 3V2YA 4I7NA 183LA 3C7WA 192LA 4K5YA 249LA 1C6BA 4DKLA 1C63A 3JR6A 1QTZA 1CV6A 1C6NA 150LA 1QTDA 176LA 3HTGA 2B74A 1I6SA 1L98A 210LA 151LA 1L15A 1QT6A 1L94A 236LA 145LA 6LZMA 5LZMA 1SWZA 1LI6A 129LA 1G0GA 125LA 1L42A 3SB5A 1L20A 1L41A 1L19A 1L09A 3FADA 4DAJA 3GUJA 3C82A 1LYEA 142LA 3RUNA 152LA 182LA 1L58A 4ARJA 1C6QA 1QT4A 1G0QA 1L37A 1L97A 186LA 2OEAX 3HU8A 1CTWA 3HU9A 140LA 2NTGA 3RZEA 1EPYA 226LA 1L87A 4EKPA 259LA 1L57A 1L30A 1LYGA 2O79A 1KNIA 1CU2A 1LI2A 1CV0A 1C6EA 162LA 1L63A 109LA 2RBOA 1L06A 171LA 1L25A 1L34A 1C6HA 3HH5A 3OE0A 1QTCA 104LA 1L32A 3NY8A 1L14A 4W51A 1ZURA 1D9WA 2RH1A 3DN0A 1LWGA 4I7LA 177LA 1LYIA 102LA 1OWZA 1L24A 1L81A 2Q9DA 1SSWA 231LA 3HTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
201LA 1JIYA 4LT1A 1ALCA 1B7RA 3W6DA 1D3JA 1PQJA 4DDAA 2F47A 1XGRC 1L02A 1GFTA 3AW6A 4DQJA 1WQQA 1HENA 2PC2A 1L29A 1C68A 1WQPA 4J1BA 1NHEA 122LA 2Z2EA 3C8RA 1CU6A 4A7DA 1L67A 1NDMC 4OWBA 3C7YA 167LA 247LA 5LVIA 1T6HA 3OE8A 5KY1A 3GUOA 1AZFA 3A8ZA 4H9HA 2CUUA 1P2LA 1LJHA 200LA 233LA 2WARA 1LZEA 1G7JC 163LA 1REMA 1VDPA 2BLYA 3AB6A 1OUBA 1VAUA 137LA 3NY9A 1XEPA 1RI8B 4H90A 1JTNA 2O7AA 1OUFA 1GBXA 123LA 1G7MC 1L05A 4QGZA 1PQMA 4WLYA 4W94A 2B6XA 1UACY 1L49A 2F4GA 4LFPA 1SLYA 1QUOA 4ARQB 1L08A 2Y8PA 4I7JA 4NHTA 2HU3A 1GB7A 4QY9A 3C81A 1L07A 3RNXA 5A3ZA 103LA 5ILCA 1XGTC 4WLTA 2MEDA 1L33A 3EMSA 1A2YC 2XJWA 1B7QA 1L45A 4H93A 3A67Y 1LKRA 2G4PA 1GFRA 1CX6A 4II8A 4WMGA 134LA 1L61A 4LDOA 3GUIA 3B0OA 4KXIA 1C62A 1D3FA 241LA 1LZ6A 3WMKA 1HELA 1LZSA 2LHMA 205LA 1L10A 1HERA 1WTNA 3CDTA 3GXRA 4HPEA 4ETDA 3AZ4A 5E4PA 5F9XA 4PK0A 1L90A 3N9CA 4RW1A 2ZYCA 132LA 3T36A 7LZMA 1DPXA 1LSEA 1LJ4A 1G0LA 1QUHA 5D5FA 4LGKA 2F32A 4TX7A 1L91A 2LC9A 4ZFPA 4W53A 1DI4A 2Z6BA 1B5WA 1GFVA 1GE0A 119LA 165LA 1P64A 4WM1A 5DL9A 1CU5A 4PRQA 1OUCA 4WM6A 1XEIA 159LA 4RW2A 5LA5A 2YDGA 4XYYA 4CJ2A 1LHIA 4OW1A 1GF5A 1IP2A 3RU5A 3A90A 5FCPA 1CKDA 2ZWBA 3FI7A 3G3BB 253LA 1LHHA 4BADA 4U3XB 2BQNA 1L36A 2XBRA 1L46A 4H8ZA 1VDQA 3B6LA 3K2RA 4N9RA 178LA 1F6SA 4XJDA 1L16A 4NSJA 1FN5A 1JKDA 3VWOA 1C6AA 2OU8A 3DMXA 4KT3A 5KJ9A 1KW5A 5HNLA 1GE3A 5KXLA 4PJZA 3B0IA 1LHJA 2BQEA 4NWHA 1D6QA 4W59A 4YF2A 3PDSA 1H87A 1LGXA 4ARMB 1GAZA 227LA 4H1PA 6LYTA 1G06A 4LT2A 4YXAC 1LZDA 1LSNA 3CDRA 4NHQA 4R0FA 3N9EA 213LA 3P65A 1CJ7A 112LA 1YL0X 141LA 2Q9EA 1RFPA 1LZ5A 2RBSA 3BKVA 3AGIA 1C61A 1I56A 2LYOA 3A6BY 1GD6A 190LA 1UA6Y 4GLAA 1REYA 4DD2A 1A4VA 1DPWA 126LA 2DQEY 1O23A 3TMXA 4W52A 1QS5A 1IP7A 251LA 1BWIA 1LKSA 2B6YA 4AQNA 1L65A 173LA 4L41A 1J1OY 246LA 1VFBC 4DDCA 4DD0A 1HFZA 108LA 4HSFA 4B1AA 166LA 5KXYA 225LA 2YVBA 3WUMA 3HT7A 1XGUC 1YAMA 1L99A 261LA 3A92A 1FLQA 4AXTA 4B4EA 4HTNA 4NEBA 1TCYA 4WLXA 3UONA 3DN2A 1L11A 2A7DA 2Z39A 3A93A 1LMTA 245LA 1RE2A 1UIAA 3DN3A 184LA 1GB6A 1AM7A 1C6IA 1D2WA 4I7TA 1GE4A 120LA 4IATA 1QT5A 1LMOA 1LMPA 3CDOA 3WUNA 5I5QA 4D9ZA 4TSCA 1GB8A 1LPYA 2G4NA 192LA 1HEQA 4YENA 150LA 1QTDA 176LA 1QT6A 1HEMA 4YEMA 3HFMY 5LZMA 4CHXA 4DWXA 1SWZA 2A7FA 5E9RA 2XBSA 2Z38A 1CKCA 1KXWA 125LA 1NF5A 4UWNA 1L42A 3A95A 4DQ5A 5II3A 1L41A 1L19A 1GXXA 3GUJA 1HMKA 2ZQ3A 152LA 1QT4A 5FELA 5HQ1A 1LOZA 1CTWA 1D9UA 3A3RX 3QE8A 3W6FA 1YAPA 1I20A 1CU2A 1PS5A 4GCEA 5KXXA 1L25A 5F14A 1L34A 1C6HA 1JJ0A 1DQJC 1L14A 1LYYA 1LWGA 102LA 1LCNA 1G7LC 1NBYC 2MEGA 1E8LA 4IASA 1F6RA 5IELA 3DN1A 1DYBA 2BQHA 3WUAA 1GBZA 3WVXA 1OVHA 1C65A 1CX7A 4LYZA 1B7SA 4DT3A 1L44A 2IGCA 1L75A 1BB7A 5KXPA 1C6CA 1L68A 1T8GA 1QUTA 1B7OA 1CV3A 1L77A 2H9KA 1BB6A 4PHIA 1PQIA 1L38A 2ZIKA 4X3BA 2RBNA 1IWYA 4KL7A 4DD1A 1YILA 215LA 4ETAA 1JHLA 1GF8A 2DBTA 1GFUA 2YBMA 1NBZC 1OV7A 1G7HC 219LA 9LYZA 262LA 1JJ3A 1LSPA 4WL6A 3TMUA 2BQGA 2HEDA 2ZQ4A 1DKKA 5L3HA 4RLNA 161LA 216LA 1NHBA 1CJ9A 4H9FA 2A4TA 1CKHA 4I7OA 1VEDA 1BHZA 1INUA 110LA 5D5CA 1T97A 2EIZC 1QTHA 1UIHA 2B70A 4ML7A 4NHPA 4HP0A 3BKHA 1LYHA 4B49A 1DYEA 3A6CY 1NWGA 1KW7A 3HDFA 1QSAA 1YKZX 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1PQOA 1CV4A 212LA 154LA 248LA 1RCMA 128LA 197LA 1C60A 3C7ZA 1GWDA 2HTXA 1FLWA 4KPMA 1XGQC 4ARPA 2ZYPA 5L9JA 2DQJY 5F81A 1OWYA 172LA 223LA 3LYTA 1C69A 1HMLA 1JTMA 2OE7X 1IIZA 5I4YA 1OUHA 1PQKA 211LA 1C66A 1NKHA 1DYGA 2B73A 2MEBA 1XSFA 229LA 4YX7C 4J1AA 2ZNWY 1JTPL 3CSZA 1B5XA 3ATNA 3TMWA 1UIBA 1WVVA 1IOSA 1L62A 209LA 257LA 1L56A 1CV5A 4Z98A 3TXDA 2BLXA 1IC5Y 1HEPA 2HEBA 1IEEA 3WW5A 4LYBA 3P68A 3CT0A 5F16A 1LYDA 1B0DA 153LA 208LA 1CJ6A 183LA 3C7WA 249LA 4DKLA 1C63A 3JR6A 1CV6A 3LHMA 3HTGA 4Z3MA 1L98A 1L94A 5LVKA 236LA 4ETBA 3TXGA 3A3QA 1LYOA 1LZTA 1BWJA 3W6EA 1DXJA 4NY5A 1D0KA 1L09A 4DAJA 4H8YA 4XJFA 3C82A 2MEAA 1GAYA 1OUAA 1L58A 4ARJA 2OEAX 140LA 2NTGA 3RZEA 1AT6A 3W6BA 1EPYA 1LZ8A 1ZVYB 1L30A 3IWRA 1LHLA 3WXUA 162LA 1HF4A 1LHMA 1BWHA 2DQGY 3W6AA 4NGKA 2RH1A 1W08A 1LJKA 1JSEA 4I7LA 2FBDA 4NSHA 1LYIA 1LSYA 2Q9DA 2D91A 3HTBA 3B0KA 5KXOA 2ANXA 3E3DA 1GBWA 1LZ9A 1GF4A 2DQIY 3HTDA 221LA 4EPFA 3TXFA 1L55A 2DQDY 1LPIA 1L53A 4NGWA 1BB3A 4ARLA 4EMNA 1GFEA 1IR7A 1KIPC 4XJGA 2LYMA 4I7RA 3A34A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 201L A;  1JIY A;  4LT1 A;  1ALC A;  1B7R A;  3W6D A;  1D3J A;  1PQJ A;  4DDA A;  2F47 A;  1XGR C;  1L02 A;  1GFT A;  3AW6 A;  4DQJ A;  1WQQ A;  1HEN A;  2PC2 A;  1L29 A;  1C68 A;  1WQP A;  4J1B A;  1NHE A;  122L A;  2Z2E A;  3C8R A;  1CU6 A;  4A7D A;  1L67 A;  1NDM C;  4OWB A;  3C7Y A;  167L A;  247L A;  5LVI A;  1T6H A;  3OE8 A;  5KY1 A;  3GUO A;  1AZF A;  3A8Z A;  4H9H A;  2CUU A;  1P2L A;  1LJH A;  200L A;  233L A;  2WAR A;  1LZE A;  1G7J C;  163L A;  1REM A;  1VDP A;  2BLY A;  3AB6 A;  1OUB A;  1VAU A;  137L A;  3NY9 A;  1XEP A;  1RI8 B;  4H90 A;  1JTN A;  2O7A A;  1OUF A;  1GBX A;  123L A;  1G7M C;  1L05 A;  4QGZ A;  1PQM A;  4WLY A;  4W94 A;  2B6X A;  1UAC Y;  1L49 A;  2F4G A;  4LFP A;  1SLY A;  1QUO A;  4ARQ B;  1L08 A;  2Y8P A;  4I7J A;  4NHT A;  2HU3 A;  1GB7 A;  4QY9 A;  3C81 A;  1L07 A;  3RNX A;  5A3Z A;  103L A;  5ILC A;  1XGT C;  4WLT A;  2MED A;  1L33 A;  3EMS A;  1A2Y C;  2XJW A;  1B7Q A;  1L45 A;  4H93 A;  3A67 Y;  1LKR A;  2G4P A;  1GFR A;  1CX6 A;  4II8 A;  4WMG A;  134L A; 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