4YYCA

Crystal structure of trimethylamine methyltransferase from sinorhizobium meliloti in complex with unknown ligand
Total Genus 173
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
173
sequence length
487
structure length
479
Chain Sequence
GPGPSLPYIQRRIREYEVLDEEGLQLIERNADVVLEEIGIEFRDDAEALDLWKAAGADVRGQRVHFPKGLCRELLKTAPKDFTWHARNPERNAQIGGKATVFAPVYGPPFVRDLDGNRRYATIEDFRNFVKLAYMAPSMHSSGGTVCEPVDIAVNKRHLDMVYSHIRYSDKPFMGSVTAPERAEDTVAMAKILFGDDFVENNAVTLNLINANSPMVFDETMLGAAKVYARHNQACVVSPFILSGAMSPVTVAGTLTQILAEVLAGAAFTQLIRKGAPVLFGTFAASISMQSGAPTFGTPEPSLVSYGAAQLARRLGLPFRTGGSLCGSKVPDAQAAHESANTLNMTLLAGTNFVLHAAGWLEGGLVSSYEKFMIDQDQLGMMQKMAEGVDLSEDAQALDAIREVGPGSHYLGCAHTYRSPLADNNSFEQWEIEGEKRIEQRANALARSWLEHYEAPYLDPAIDEALKEFIAKRKDSMPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Protein purification and crystallization artifacts: The tale usually not told.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative trimethylamine methyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Rhizobium meliloti
total genus 173
structure length 479
sequence length 487
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06253 MTTB Trimethylamine methyltransferase (MTTB)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.480 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel TIM Barrel 4yycA00
4YYCA 2QNEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1I8JA 1MUCA 2F8QA 1W1A1 1WDRA 1H7XA 3PSWA 3PZ9A 1AW5A 3EPNA 4PUDA 3W27A 4E6MA 4HVXA 1KM1A 3BPWA 3C2EA 3I3BA 2PC8A 4CQCA 3KOYA 5JBFA 4O50A 3BURA 1F07A 3P93A 5H6HA 3TONA 1IV8A 3WQ5A 5BU6A 2VI0A 1RJQA 3AYSA 4NJJA 3O07A 3BV4A 1UD3A 3AALA 2WQPA 4GQRA 3ALGA 3SIZA 3NZRA 4PMDA 4M24A 1XLGA 1V3MA 1H7PA 1OIMA 3UR5A 2H3DA 1CLXA 3LCHA 1R46A 1VRXA 2PRHA 3W1PA 4DN1A 2C3ZA 2AL1A 3WLRA 4RX0A 1JCTA 4G9PA 5CAHA 2OGYA 1L8NA 3G8RA 4LJ3A 5E0CA 4D6HA 4ZO7A 2C18A 3KHDA 1DORA 5EFFA 1T8QA 3T05A 4JTFA 2ZE0A 1RSCA 3PTQA 1QVBA 3FYYA 3QRHA 1UH4A 3UBPC 2ZXBA 1EF3A 1JPIA 2CWNA 3CHEA 3QGVA 3GM8A 1YDVA 5CXPA 4J5NA 2WSKA 1NEYA 3DYPA 4A8LA 4Y9NA 2XUCA 3DBPA 3W72A 4E8CA 1LLOA 1VS1A 4JNMA 3ABOA 3VNDA 1FWCC 4EAMA 4QSHA 4JQ3A 4IQLA 1RBOB 1WPCA 3TWAA 2QDGA 1BXBA 5CPMA 4Z1YA 4C90A 3LTPA 2BOFX 3GVQA 2R9RA 3R8GA 3B8TA 1ENUA 1SJAA 4GYFA 3WFAA 4LUIA 1X7FA 3DYMA 5HINA 2J4GA 5JIPA 3OOQA 3M07A 4OV9A 3NOEA 4S3JA 3M6DA 4W86A 3USZA 1XIEA 1UH3A 1CWYA 1C91A 4LUYA 3OVRA 1IXPA 3KVJA 2W63A 4WY0F 3KBWA 1J0HA 2QDEA 3RU6A 3UNTA 1HQTA 2GL5A 3GSMA 3KOXA 3TQVA 2UZ9A 4Z0JA 5JMUA 3QOMA 3MJMA 5HPCA 4WXYA 1UZDA 4G7FA 1SR9A 3W84A 3ZVIA 3VE7A 1O12A 3MI2A 4KQNA 3QBUA 3R25A 1IWPA 4HK7A 4IPJA 3MKVA 3PZGA 3ARXA 3A3WA 4AQLA 2PRLA 4QEEA 1I60A 2BY1A 4RDZA 1EYWA 4L64A 4IMDA 2E77A 2I16A 3RG6A 4JYEA 2VX7A 3V0TA 3VKKA 1OM0A 5BRQA 3SB0A 3I4EA 3PWGA 1GVQA 4HA4A 3D3FA 4O12A 1NJJA 5F2IA 2O4QA 2HZGA 1CEOA 4Q6XA 4L4PA 4DUVA 1FH9A 4RE0A 1XBZA 4Q7BA 4IWWA 3AISA 1FCUA 2HXTA 3GKFA 4WUIA 4QRNA 3C3UA 2NVAA 1GJWA 3UZWA 5HOSA 4L9YA 4C6DA 2A3HA 2YFOA 2BVWA 4XO7A 4H3DA 4AZCA 2G8ZA 5I06A 3WQ4A 3NQ2A 4KPLA 2NWSA 3UCCA 4AX7A 5BW6A 3CAKA 3ZVHB 3OIXA 1X8CA 4Q4MA 3KVKA 3RO8A 1EO5A 2VGGA 5E5CA 4W9TA 1W32A 3MMUA 4IIFA 3WH7A 3BW2A 4AZIA 4KGJA 1FUYA 1OCQA 4GJIA 3VGEA 3ZT7A 5IBXC 4HK6A 2FVLA 4YCPA 4AY1A 4AVOA 3VU2A 1W5PA 5EYWA 4YVVA 1IEXA 3HURA 1F4HA 5I3DA 1OCJA 3VGHA 4BWLC 1T8XA 1MEWA 1N55A 1K1DA 1GOXA 4NY2A 3TWBA 1VR6A 4U10A 1TJ2A 4ZOEA 1R3YA 1M6JA 3WL1A 4A2SA 3ICJA 1G01A 1H49A 1XC4A 3BLPX 3E3HA 5EY5A 4I7WA 4H9VA 3UJSA 4H6RA 3AMCA 4WSKA 3UVIA 1MFVA 2GJXB 5EL1A 4D9PA 1TX0A 3BCJA 4GI9A 2QS8A 5HA7A 3PUEA 2OEMA 3O7UA 4QP0A 3WF2A 4C6IA 1UZHA 1XR2A 3TN3A 3S0CA 3HFYA 2EEXA 2REQA 3K5XA 3S9YA 2X42A 3LERA 3MBFA 4ASTA 2E40A 3GIYA 2ZXDA 5A3HA 4GUGA 4I5XA 1V3KA 4ATLA 2ZZ1A 3GDKA 1FY6A 2WANA 3NR0A 3W6YA 3KCOA 2ZUSA 4AIUA 5FSEC 3NVDA 2VYOA 2RH9A 3LA4A 3WK3A 2FTWA 5I7GA 2ALRA 3QMSA 1AD1A 4JAWA 3PTKA 1IQ8A 1R3TA 1XICA 3W82A 4ZQRA 3WLIA 1XLLA 3BL3A 4R7WA 3I7RA 3MKKA 3GXIA 1K3UA 3COTA 4ERAA 3WBYA 3WK2A 3V5FA 1LJYA 5JIWA 4QLJA 1BXNA 1GYMA 3IJ6A 3VDHA 1W3KA 4M19A 4RNFA 4IQDA 1XLHA 3BOXA 1KGUA 1UIOA 2QCDB 4NZJA 2ALDA 2P8BA 3QR0A 5D30A 1C7TA 4QR6A 7ENLA 2VXNA 3GFYA 5CPLA 2EJ1A 4OHQA 5GNZA 3SFWA 2E7FA 3SSJA 3JW7A 5C2XA 3BAJA 2D22A 4FA3A 1X1NA 3DKJA 4H04A 2PDLA 3FX4A 2YXXA 4O57A 2VUNA 4MTVA 4ZE5A 1Q8AA 3EX6A 4KT2A 2OZTA 1M68A 4QQUA 2DZBA 4K7VA 4S3DA 3I7QA 1KD0A 3EEZA 5HNRA 3WH9A 3VIOA 1YIXA 1W3IA 4MJ4A 2A3LA 3VCNA 3IGHX 1EDQA 2QDDA 4PEEA 4DAFA 2W9MA 4HKPA 5LIKX 4TUFA 3WJWA 1IWBA 4MNLA 2HK1A 4PTWA 3GWQA 3O63A 4H9UA 3IGSA 1ICPA 2I17A 1JPHA 4QQ3A 4X60A 2FZ8A 2DFAA 4EPDC 4HHHA 3P5ZA 3KBNA 2PGFA 1ZENA 4GXPA 4I9JA 3B4UA 3O6YX 3FGCA 3LPPA 3CIXA 2GVYA 1E9YB 2BASA 1FWHC 3ANVA 2GDVA 2GLKA 1UZ4A 5B80A 1DJZA 3QR1A 5GJNA 1DQXA 5KETA 4XD5A 3QZ6A 1EP2A 3TTQA 3WJZA 4M82A 3W2LA 3M0IA 3DESA 1T40A 4PUMA 3FAXA 4LYPA 4O1BA 4ZZ9A 2Y89A 3MUY1 4FXFA 3D46A 1W5QA 3II1A 3TW7A 1YYAA 5ABFB 4AZ6A 5IRPA 5LKYA 1E5JA 4Q7NA 1RAKA 3LPOA 1WKEA 3MZ2A 2BVYA 1LOQA 1XRSA 4D71A 4KFNA 4M1BA 1XSJA 4DXXA 1KFLA 3AWOA 2OTDA 1WP6A 4KWUA 3HTWA 4AZ5A 4IL0A 3HPAA 2XM1A 3HG5A 4DWSB 1MUWA 2QIWA 3KS6A 1MXGA 2IQ0A 3M7SA 3Q45A 1JFHA 4AXKA 2EXOA 2PPGA 1B90A 2HNEA 3RF9A 5D2YA 3VOJA 1KXTA 4IIHA 5D9PA 4DZ5A 4JY8A 1QHOA 3MU7A 1R38A 1WAUA 1XINA 4Q6JA 3G77A 3RX3A 1OT1A 3GIPA 1L2QA 3OLEA 3IACA 4QJ1A 1CXLA 2F6KA 1R85A 1HTIA 3DDMA 1A5AA 1N82A 1UKTA 3INPA 3N29A 3WH8A 4M5PA 1ITCA 2FH6A 2OYLA 3VDGA 4LBSA 4IICA 3BZGA 5AB3A 3VNMA 4L7ZA 4BJHA 1CGXA 4JZ5A 1PX4A 4Q4RA 1S2CA 1DWHM 3RU8X 3K1DA 4RDVA 3QF0A 3GU2A 4KEVA 2CLKA 5HWNA 3G2GA 1BVNP 2CLOA 3GVRA 1JDEA 4M7SA 1D3GA 1W9XA 3GY1A 3G1SA 2F38A 2VRJA 2XSXA 3U2EA 2QGYA 3NIYA 3MSGA 3IJIA 5CJMA 3SW6A 3DAQA 3KXQA 2PF8A 3NFUA 1OGGA 1BRLB 2O9RA 4UMAA 2F7FA 5E93A 4IPNB 3UY8A 4ACZB 5CJNA 3M0XA 2YIHA 1O95A 3BTNA 1W1YA 2PDCA 2O56A 4A35A 1EF2A 2VNCA 1D2KA 3RDKA 6ALDA 1UMYA 4B5SA 1LP6A 4C1LA 1M03A 3CUHA 2VO5A 1EOKA 2UY2A 2G4FA 2HS8A 4CCDA 4IMFA 4K1WA 1PPIA 1QBAA 1MDRA 4DJFD 1VFUA 3N15A 4E2BA 1K9DA 1GW1A 2CZDA 1JZ6A 3BLIA 2BXZA 2C16A 5EMLA 1JZ2A 5K7JA 1CB7B 3NOYA 4EKJA 3CLMA 3SUTA 4X22A 1ZSXA 3W2KA 1UKQA 3GU1A 3SRDA 1P0DA 4C1NA 2WJFA 3BJTA 4F66A 1HT6A 3ORWA 1ZCOA 1B30A 1LCOA 1TX2A 1BF6A 1RCXB 1JZ7A 4IMGA 4U2ZA 4BF7A 1NM9A 2Z1WA 2P88A 5ABEA 4KRUA 1YTDA 4V1YA 2WSRA 1UD2A 3GXPA 2IXUA 4H4IA 4UWMA 2IW0A 2XG9A 1VFOA 1H0GA 1ZJBA 4DZIA 1R3QA 1Y0EA 3BLFA 4PTMA 3BCDA 3BICA 1GONA 1H1NA 3P62A 4S3GA 4IIDA 3JUGA 4MOZA 4D6IA 1E1CA 2VZVA 4DUWA 2QF8A 3EWYA 3FA4A 3LY0A 2WW5A 4FNUA 1TTQA 1MW0A 1Y5XA 3C56A 3BGGA 3SQMA 1M1BA 1W54A 2J77A 5AC4A 4TR9A 4P2VA 2A7NA 5DMMA 5EU9A 3UPWA 1W3HA 4I8DA 5FD0A 2WZEA 3P6LA 3W25A 3RGTA 1TPUA 3EX2A 4ZCWA 3FKKA 2VKZG 4KERA 4HNVA 4H7CA 1OINA 3IAQA 1PKNA 4LCSA 3BOFA 3KM8A 2QULA 4D1JA 3AU6A 3MI3A 4PTVA 4MB3A 4BKNA 3W7CA 4JY9A 4UUIA 3OLGA 2QUUA 4RR4A 3WLOA 2OLSA 2J79A 3QY7A 4DUXA 2ZXAA 2C71A 3NYZA 3M0HA 3ARVA 3E1F1 1KM2A 9RUBA 2DSZA 1S2AA 1SUXA 3XINA 3O06A 1W1B1 4PMRA 1KBKA 4K6AA 3MO7A 3UWZA 2Z25A 5ENLA 1JYXA 2OQLA 5GQBA 4J4KA 4JN8A 5C55A 3GC4A 4KCTA 3PWIA 3CBWA 1WDDA 1TTIA 3TCSA 1REQA 3LDVA 3QLLA 3DGBA 4ATWA 2YXOA 3AS2A 4BI5A 4TQTA 3QGKC 3W7QA 3C2VA 3P8IA 4C6JA 1IZKA 1IXNA 2BP1A 4ZEPA 2NSOA 4UQBA 2ONEA 4M6QA 1DJHA 3QHMA 1TV3A 4PFMA 3IJ7A 2O55A 4QGCA 3L12A 4U28A 3DC8A 4PE8A 3ZXWA 1ALDA 3O9NA 1P1XA 4ICNA 1CGYA 2Y8UA 4LNCA 5FSDC 3TCEA 4ZO9A 4PR4A 4GYJA 1TPWA 1X97A 3GXFA 3ZR4A 3N17A 2D20A 1E9IA 1KCKA 3EPMA 7TAAA 5A8PA 4HHMA 3W76A 3AOFA 1EC8A 1DTNA 2AQWA 1SGJA 2V3FA 5I2UA 2GOKA 2VTFA 1TMLA 1H11A 1JGIA 4AC7C 1KGWA 1LBMA 3CIVA 3PBWA 5DN1A 4GUIA 4R88A 3VOIA 4K2SA 1U5JA 1HKKA 4LBRA 1GG1A 3B04A 1IEWA 2RDWA 1QATA 3UXAA 1V5XA 4XBSA 3CHVA 3HGJA 1GVIA 3QW4B 3IJ8A 3LOTA 1R9YA 1FCQA 4XZHA 5C9WA 1N7KA 5CBIA 4FNPA 1EPXA 4QE1A 1DXEA 1VFTA 1CI1A 2ZOXA 1BYDA 5JQ9A 4K37A 3MA8A 3QV8A 4XSMA 1ONEA 3VD3A 3OBEA 4R5EA 4WEVX 5PTDA 2FPTA 2ZUNA 3QPZA 4L9ZA 1QASA 4CNNA 2CLEA 2BZNA 4IX0A 4UBPC 4HYWA 1FKWA 4QLKA 4GGBA 4EXAA 1KO0A 3HF3A 2CBUA 3E74A 4FEZA 5J5DA 5DXYA 3EAUA 1CGUA 4DQWA 1ZS2A 5DRCA 1MO0A 3SO7A 1LROA 4CD6A 4XZBA 1FHUA 5A6TC 2OOFA 1TIWA 4PGLA 3W2UA 1NU5A 4NILA 4F48A 4ORIA 2OVLA 1DP0A 2UBPC 1OFRA 5D4YA 3U5UA 4R3UA 3MCMA 1Z48A 1A4MA 5H91A 3M5XA 4AD1A 1E6QM 3MUXA 4GYPA 1IE7C 3QKEA 1B3ZA 2H9AA 3T78A 3RM8A 1S5NA 2YB1A 2G5WA 4URIA 1X6NA 3GS6A 4HA1A 5FJRA 3MSYA 3FNDA 3KBSA 3PJUA 3FEQA 1UOZA 4O18A 4AVFA 2QMJA 5FIPA 3BH4A 3E0LA 5CQ1A 3BMVA 3NWRA 3HG4A 2J8FA 2W5FA 3DUGA 1H1YA 5MHBA 2WC4A 3B97A 4PA8A 3RPDA 2BGNE 4GO8A 4JEJA 3ZSSA 2VVSA 3BWWA 4INFA 2OJPA 2A5HA 3H2EA 4O0KA 3DKLA 1F9CA 3VDAA 1H0IA 2Z1BA 1RK6A 1NTHA 1DJNA 2OLAA 4K39A 6XIMA 3THDA 1ELSA 1CYGA 4G1KA 2OG9A 3UZ5A 1GK8A 1PTAA 3H70A 1AQ0A 1ODUA 2VOTA 3AWNA 1TA3A 1ZY9A 4ACYA 3S2MA 1SJBA 5D9NA 4JYFA 1BQCA 3KVLA 2PDBA 3LGEA 2ZA2A 4XAZA 1TB3A 4GNVA 4HPGA 1VGAA 4IUGA 4L61A 1EUAA 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