4Z0UA

Rnase hi/ssb-ct complex
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/peptide
molecule keywords Ribonuclease H
publication title Interaction with Single-stranded DNA-binding Protein Stimulates Escherichia coli Ribonuclease HI Enzymatic Activity.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli o139:h28
total genus 49
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2015-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4z0uA00
3OYHA 1SKRA 4AHSA 1G15A 3OS1A 1SL1A 3ZCMA 4IFVA 5KRSA 4B9MA 4JS5A 4BE1A 4M41A 3LWMA 3ZSYA 4HHTA 2E6MA 1B9DA 3O3HA 3KD5E 1IKXA 1YT3A 4FVMA 4RG8A 3TAPA 2A1SA 1KFSA 2P5OA 4DSLA 4FJ8A 4CCHA 3AVAA 4GVMA 5CYQA 2ITGA 3LAKA 4AHRA 1IG9A 1WSHA 4B9TA 4B9SA 1HNVA 3L8BA 3V9XA 3KD1E 3I0RA 3AVLA 4DFPA 2YV0X 1NOZA 3HPOA 1SV5A 4DF4A 4LSLA 4ID5A 3V9WA 3F73A 1FKOA 4KREA 4HUEA 3KKSA 3SUQA 1TKZA 2VG5A 1SKSA 3AVKA 3HP9A 4W5OA 2EHGA 3NGIA 4R5PA 2Z1JA 4DFKA 1N6QA 1W9HA 4E7LA 3SPZA 4YNQA 3DI6A 3KLIA 3OYJA 1TL3A 3ZSQA 3KJVA 1RDCA 2OZSA 4CJVA 3BGRA 4OPJA 1EETA 2VWKA 5SWMA 3S3OA 4KAZA 3LALA 4H8KA 4M3UA 3ITHA 4M3TA 4FW1A 4KTWA 3TWHA 2HNYA 2ZE2A 3L2UA 3NH0A 3C94A 4O44A 4ELUA 3ZT1A 3LZIA 4PY5A 1RCHA 3AVCA 4CEOA 3NCIA 2G8WA 4Z4FA 1GOAA 4LY7A 4CJRA 4AILC 2KZMA 1S1WA 3RRHA 4L8RB 4B8AB 3TAQA 4F3TA 5C24A 4FK2A 1VSJA 2D0AA 1RTJA 4CGJA 2EX3A 2XY5A 1TAUA 4C8OA 3SI6A 4ICLA 4IDKA 2X6SA 3O3FA 4M3YA 3NGZA 2OPSA 1TVRA 4AHTA 1NJWA 4FW2A 1RBSA 3PX4A 4B8CA 3S3MA 1UA0A 4NCGA 1BL3A 1BQMA 2PY5A 2HB5A 4CHYA 3QEVA 4BWJA 4Z4HA 3SUPA 4CECA 2Y1IA 2HNDA 2HHUA 1EP4A 2YNFA 3P5JA 1SKWA 4OLAA 1WN7A 1O1WA 4OKEA 1UAXA 4CGIA 4HVJA 3OYKA 4CEFA 5JS2A 3VQ5A 3LP2A 5SZTA 3TARA 1XWLA 3ULDA 3AVGA 3K2PA 4FZYA 4DQSA 5I42A 3ISNC 4HTUA 1BI4A 1KFDA 2QK9A 3RTVA 2DFFA 3CG7A 3QINA 4EZ9A 2HVIA 1IKWA 3HXMA 2KQ2A 3T1AA 4CFBA 3AA4A 1EKEA 3AO3A 1NK4A 3MEGA 4J2EA 4O0IA 2OZMA 3KIOA 4FLXA 4ID1A 4DU3A 1ASVA 1HNIA 1LW2A 3QEPA 1VSEA 4CJWA 5CYMA 5C42A 3AO5A 4KTQA 4ELVA 3KTQA 5HRPA 4DTNA 4NCBA 5CY4A 2G8IA 1JXBA 3TABA 1L3VA 3AVBA 1NJXA 1X9WA 2GBZA 1NKCA 3MXIA 3OYBA 3DLHA 3OYAA 2G8UA 1RDAA 3DLGA 3OYEA 4PUOA 1U49A 4F3OA 2QKBA 4JRQA 4WE1A 4DQQA 4ZTJA 4Z4IA 1HYSA 3O4NA 4M3ZA 2E6LA 1S1UA 2YNHA 4E7IA 2IDOA 3OJSA 1TAQA 3O3GA 1Z26A 3OY9A 3SCXA 5KRTA 4KHSA 2BGGA 2HHWA 4CJFA 5DMRA 1QSYA 1Z25A 2ZQBA 4Z4GA 4HUFA 2NUBA 1X9SA 1CZBA 1LV5A 1BISA 1KSPA 3SV3A 1LW0A 4FLTA 3AA3A 3AO1A 4KHYA 1RTIA 1K6YA 3L3UA 4W5QA 2KFNA 1D8YA 4XIUA 3LZJA 4E7KA 1REVA 2YKMA 3PX6A 3AVNA 3PO4A 4QCLA 1J54A 3DMJA 3LP0A 3VQ4A 5C25A 3PX0A 5HLFA 1UA1A 3D0PA 4C8KA 1BGXT 4GW6A 2HHSA 1CXUA 2BE2A 5FDLA 1S1VA 2YNGA 2R7YA 3AVIA 4CIFA 4F4KA 3TAFA 4K8XA 3K5OA 5HBMA 1WAJA 4CIGA 5T7BA 1A5VA 2FC0A 3S9HA 1I39A 4DTUA 3SQ0A 1NOYA 1VSKA 1KCFA 3VQCA 3QNNA 2WONA 3HP6A 1XC9A 4B9LA 4FJ9A 3DLKA 1RBVA 3HPGA 1F21A 1VSLA 4DS5A 1BI4B 1C6VA 2ETJA 4M3WA 4FXDA 3MXJA 4CJEA 4FLVA 4CGDA 1TK0A 3KLFA 4CF0A 3HK2A 5CZ1A 5HROA 4NCAA 1VRUA 4NYNA 2O4IA 1TKTA 1YTAA 2OPQA 2PZSA 4KI6A 1D9DA 2YHBA 4N47A 1T8EA 3AA5X 1UOCA 1TGOA 2PYLA 2Z1IA 1N5YA 1HPZA 4OKJA 4ELTA 1S9GA 3QO9A 4DTOA 2YNIA 4BWMA 1XHZA 4JLHA 1BIZA 4M45A 3VQBA 3SPYA 4E7JA 4N41A 5E41A 1DLOA 1HMVA 4KHUA 1FXXA 2LSNA 5CZ2A 1U4BA 4KRFA 4E1MA 2RKIA 4O0JA 4Z4EA 2HHQA 3TAMA 4Q5VA 1SL0A 2VG6A 2GUIA 2RF2A 4FLWA 5J2NA 1L3SA 3OYGA 4F2RA 1L3UA 4FJNA 4RW6A 3MAQA 1VSMA 3QNOA 1NJYA 4BACA 3C6TA 2G8VA 1HQUA 4FK4A 2XO7A 2YHAA 5FRNA 3ZT2A 4FJJA 1TK5A 4CJTA 1TL1A 1JLAA 1W0HA 4B08A 3SYZA 4W5NA 3RRGA 1GOBA 3SUOA 3AA2A 4HCCA 2P1JA 3ASMA 2OYQA 1MU2A 3DLRA 3DRSA 3ZSZA 2DFHA 2JGUA 3LP3A 3L2WA 2HHTA 1LAVA 4HUGA 5J2QA 4BDPA 3AVJA 2YKNA 3U3YA 1WAFA 2KW4A 3ZSWA 4CEQA 1RBUA 1CLQA 4I9LA 4FLZA 1EXQA 3QERA 3MXMA 2HHXA 1QQCA 5JS1A 2X78A 5HRRA 3LANA 2IC3A 4ZTFA 4DFJA 2OA8A 1J53A 3ZSOA 2Q3SA 5KTQA 3VA3A 2RPIA 3AO2A 2XY6A 1HQEA 4CF9A 3CFOA 1A5WA 3HT3A 4FJ5A 4RW7A 4E19A 2KZZA 3SQ1A 1NK5A 3LAMA 1RT7A 2G8HA 3M8RA 3RMCA 4OGCA 3DLEA 3KK1A 4IBNA 3QLHA 3S3NA 1VSFA 1QTMA 5HRSA 1R0AA 3JSMA 2A1RA 4FJXA 2DTUA 4OLBA 1TK8A 3OYLA 3V6DA 4LH5A 4I9QA 4M42A 3RR7A 4O4GA 4CHQA 3VQAA 3WNGA 3OYDA 4ZHRA 3QIPA 3I8DA 1ZBIA 4FYDA 3ZSVA 3UIQA 3WNEA 4JRPA 5K14A 4HCBA 1FK9A 3DM2A 4BE0A 1L5UA 1LAWA 4CHPA 2FBTA 4Z0UA 2B6AA 4CIEA 4OGEA 1RDBA 3ZT0A 3RR8A 3T19A 1LWCA 4C8LA 2XRIA 1VRTA 4E7HA 3KK2A 1QE1A 3IAYA 1IKYA 2RN2A 3NFAA 3PUFA 4KI4A 1RBTA 1C1BA 1RT2A 1B9FA 2HNZA 3HSTB 1L3TA 5J1EA 4CJ5A 2VG7A 4JS4A 3TANA 1JLBA 2IAJA 2D0BA 3WNHA 5I3UA 1NJZA 1WSJA 4KKOA 1C0TA 4EP4A 4LSNA 1WSEA 2XHBA 3HYFA 3K5NA 4UQGA 4DFMA 3LPUA 3NF9A 1S5JA 3V1OA 3OYIA 3JYTA 1B92A 2HW3A 1J5OA 4FJLA 3CYMA 4DTMA 1RDDA 1JL1A 1GOCA 1Y97A 3VQDA 4CGHA 3V9ZA 4DU4A 1KLNA 4PA1A 4B9NA 4FJHA 3LDSA 4FJGA 4QOZB 3VQ8A 3NH2A 4CGGA 4RW9A 2PYJA 3NDKA 5D3GA 4OVLA 1SUQA 4N5SA 1S6PA 1KVBA 3K57A 3SJJA 2E4LA 4KFBA 3EY1A 1S9EA 3OYFA 4PQUA 3QETA 4KPYA 1KVAA 4KB0A 3OYMA 1XI1A 3LWLA 3RWUA 3DRRA 1KVCA 3V1RA 4FCYA 3HM9A 3NE6A 4C8NA 4DTSA 2X6NA 3K5LA 1A5XA 2OPRA 1RBRA 4OPKA 4KHNA 3BDPA 3AVHA 3EZ5A 3PV8A 4CE9A 1CZ9A 3U6FA 3VQ7A 4DMNA 4TSXA 1DTTA 3DRPA 1QHTA 3M8PA 4MFBA 4RW4A 4KHWA 4E1NA 5KGWA 4KHQA 4B9VA 4IG0A 4EP5A 4H4MA 3V81A 3C95A 3NF7A 4K8ZA 1RT4A 1EX4A 2KFZA 3HVRA 4DSEA 1JLQA 4CESA 1TKXA 1ZBFA 1VSIA 3AVMA 4DG1A 1TKDA 2QXFA 3DOLA 4CJKA 4FLUA 1KTQA 4N76A 1TV6A 1VK0A 2ATQA 4H4OA 1IO2A 1HYZA 1RT6A 1WSFA 4CJSA 1U45A 5KGXA 3B6OA 1HYVA 3SV4A 1IKVA 4FJ7A 3VN5A 4AHUA 2IS3A 1ZBHA 1NKBA 2HVHA 1RT1A 3MECA 4DS4A 3U3GA 4B9UA 3KKRA 1S1TA 3OJUA 4CEDA 1ASUA 4DTJA 1C1CA 4CERA 4E3SA 4DSFA 1Q9XA 3P1GA 4CEEA 2F96A 1T05A 3HL8A 1JLEA 3AV9A 1T03A 3KLEA 1RTDA 4IFYA 3O4QA 4J2DA 1C1AA 2ZD1A 3NAEA 4IG3A 4FZZA 2DY4A 4PWDA 4CJPA 3CFRA 3ALYA 5J2PA 1WNSA 3V4IA 1VSDA 1RTHA 1S1XA 1WSGA 3OVNA 4KV8A 2QKKA 3L2RA 4F2SA 2OPPA 3RMBA 4BE2A 4O55A 3VQEA 3OS2A 3WNFA 2VWJA 1RT3A 1LWEA 4FJKA 1YVUA 4FM2A 3NH1A 3NF8A 4Y1DA 4FZXC 1KRPA 1RILA 3OS0A 4DWIA 1ZBUA 4DSIA 1JKHA 2DFEA 1UWBA 2O4GA 4YFUA 3TAGA 3SQ4A 4F8RA 3MEDA 4CHZA 4CJ3A 2Y1JA 1I3AA 4KTZA 4J2AA 4M3XA 1QSSA 3HO1A 4CGFA 4LD0A 3P83D 4CEAA 1D5AA 1QS4A 1NK7A 4QAGA 1D9FA 1QSLA 3L2VA 1WLJA 4I2PA 2F8TA 4OKKA 3HVTA 3H08A 3NF6A 1BIUA 4GMJB 1NK8A 3TR8A 2XY7A 1NK9A 5J2MA 2FBYA 4IKFA 1JLFA 3V9SA 4CF8A 3RMAA 4CFDA 3OYNA 2X74A 3K58A 4DF8A 2HMIA 3CQ8A 2BDPA 1XHXA 2Z1HA 4DQRA 3C6UA 3M8SA 2BANA 4DSJA 2IOCA 3QEIA 4DSKA 4KB1A 1FKPA 3PO5A 2B4JA 2FBVA 3DOKA 3F9KA 3EYZA 4EZ6A 4G1QA 4I2QA 1U48A 1X9MA 3QEXA 1BCMA 3HJFA 3CM6A 4DU1A 3B6PA 4MQ3A 4O5BA 2P51A 4AHVA 4DQIA 4E89A 3VA0A 4B3OA 1HRHA 2JLEA 4FLYA 4E0DA 4N56A 4Y1CA 4Z4CA 2Z1GA 3QEWA 2P5GA 3RMDA 4DTPA 3E01A 4CJUA 1NK0A 4DTRA 3LP1A 3PY8A 4W5RA 4CFAA 4Q0BA 3AVFA 3AO4A 5KI6A 1BQNA 3KLHA 1HJRA 3TI0A 3CM5A 3QIOA 3L2QA 1C0UA 3CFPA 3A2FA 3SNNA 3V1QA 5HRNA 4CK2A 4I7FA 4CJ4A 1NKEA 2G8KA 3T3FA 3V9UA 3VQ6A 4KO0A 1T7PA 5FRMA 4CHOA 3DYAA 3HPHA 4OJRA 4FJMA 1C0MA 3KK3A 1RT5A 4FM0A 3THVA 3K59A 4FK0A 4CF2A 3SZ2A 1YTUA 4M3RA 4CK3A 1ZYQA 4AHCA 4CEBA 1IH7A 2IGIA 4AH9A 1VSHA 2F8SA 4LH4A 1LWFA 4CK1A 1WSIA 2GV9A 4RW8A 2WOMA 3FFIA 2D0CA 4W5TA 1SL2A 3SQ2A 4DQPA 1ITGA 3L3VA 2G8FA 3VQQA 3KLGA 1Q9YA 1X1PA 2XY8A 4C8MA 3D45A 4DLEA 1JL2A 4CFCA 5EU7A 3QESA 3I0SA 1BHLA 1CXQA 3IS9A 1Q8IA 3LPTA 3NBPA 4CF1A 4FJIA 4J2BA 1JXEA 2B5JA 5FROA 3TAEA 1KLMA 1S6QA 3ZSXA 2I5JA 3ZT3A 3ZT4A 4CJLA 3OYCA 4DLGA 5DK5A 3IRXA 2AJQA 4BDYA 3M8QA 3MEEA 1DTQA 3ZSRA 1JLGA 5HP1A 1ZBLA 3K5MA 3IG1A 4CJQA 1RNHA 4CEZA 2KTQA 2W42A 1ASWA 1NK6A 1U47A 3NGYA 1BCOA 2FBXA 3DLBA 2D5RA 4NYFA 4BDZA 3VQPA 3G10A 4DTXA 3SUNA 3G0ZA 4FM1A 1U04A 2HHVA 4CHNA 3VQ9A 3NHGA 1J9AA 1JLCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OYHA 3AARA 1DT9A 4HTLA 4BR2A 4HHTA 1IKXA 1KFSA 4RG8A 5FPMA 4BRAA 4CCHA 3QICA 3AVAA 2NRXA 3CJAA 3V9XA 3V9WA 1FKOA 4HUEA 4IXCA 2HF4A 3KKSA 2O8FA 2EHGA 3NGIA 4DFKA 4E7LA 1BO5O 4ELUA 2VWKA 4M3TA 3S3OA 4MDAA 1K73O 4CBUA 1E3MA 3I8BA 2IVPA 3AVCA 1GOAA 2KZMA 4BR4A 1S1WA 3WXLA 3IKMA 3TAQA 4F3TA 2D0AA 3A8YA 4C8OA 3SI6A 1LCUA 4ICLA 4M3YA 1NJWA 4FW2A 3S3MA 3PX4A 3CCLN 3OA9A 3O1WA 5AQVA 1K8KA 2HB5A 3CCJN 4CECA 2HNDA 2HHUA 1EP4A 2YNFA 4OLAA 1CZAN 1WN7A 3THWA 4CEFA 3TARA 3D2EA 3K2PA 1N36K 3E66A 1U2VB 3M6GA 1KFDA 3C6AA 1QQOA 4A59A 2DFFA 3CG7A 3RTVA 4EZ9A 1IKWA 4CI6A 3VEOA 1EKEA 3SBTA 3KIOA 4FLXA 4DU3A 4CJWA 5CYMA 1NGJA 4KTQA 1KQSM 3VERA 1HUXA 2WBNA 2G8UA 4Z4IA 4DQQA 1HKBA 1VQ6N 1HYSA 4JKBA 3J80O 1S1UA 5AQSA 1W7AA 1VQPN 3SMSA 4KHSA 4JNEA 2KHOA 2BGGA 2HHWA 5DMRA 2NUBA 1CZBA 1KSPA 3CIPA 1N8RO 3AO1A 4JKHA 4BY9C 3DMJA 5HLFA 1NMDA 1CXUA 3TAFA 4B3TK 4GV3A 3EEQA 5LMNK 3S9HA 3SQ0A 4CZFA 1VSKA 4B9LA 4FJ9A 2WONA 3DLKA 5BPMA 1OH5A 1RBVA 4FWMA 1F21A 4CZJA 4DS5A 1C6VA 2ETJA 3CERA 3E9OA 3HK2A 2CH5A 1SQKA 2P9KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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