4Z0UA

Rnase hi/ssb-ct complex
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Interaction with Single-stranded DNA-binding Protein Stimulates Escherichia coli Ribonuclease HI Enzymatic Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ribonuclease H
molecule tags Hydrolase/peptide
source organism Escherichia coli o139:h28
total genus 49
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2015-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4z0uA00
4CESA 3L2UA 2DY4A 4FLZA 4FW1A 4HCBA 3HP9A 3HVTA 1A5WA 2E6LA 5CZ2A 3NAEA 3QESA 1IKXA 2FBXA 2E6MA 4CK1A 1KRPA 4OVLA 3VQ5A 4CFCA 2IDOA 3ZSQA 3QNOA 3LP3A 1MU2A 4NYFA 3NGZA 3OYIA 5DK5A 4ZTFA 1C0UA 4OKKA 4M3UA 4CF0A 3IG1A 4KI4A 4E0DA 1KVBA 3VN5A 3KK2A 4C8LA 3O4QA 1RBVA 1S1TA 4CJQA 2OZMA 3L3VA 4CF1A 5E41A 4DTXA 4M3RA 4F2SA 1CXUA 4E7KA 5D3GA 4Z4GA 2HMIA 4BE2A 2YNIA 2HW3A 1ASVA 3LALA 3AO5A 3L8BA 1IH7A 3S3NA 1YTUA 2ZQBA 3AVFA 4IG0A 4HVJA 2GV9A 5CZ1A 1CXQA 2QK9A 1RBUA 4WE1A 3AA4A 1VSKA 4CJ4A 3B6PA 4YNQA 3CFRA 2G8WA 4AHTA 4IFVA 2OPQA 1WN7A 4CIFA 3KD5E 3DRRA 3MXIA 3QO9A 4FLUA 3BDPA 4CJ3A 1Z26A 1L3VA 5T7BA 2YKMA 4KHQA 3KKRA 5J2PA 3TAPA 1LW0A 1LV5A 2QXFA 3CYMA 3AVJA 3K5NA 3KTQA 3AO4A 1IKYA 1VSJA 3TAMA 1S9GA 2WOMA 1JLGA 4E1MA 3NH1A 4RW6A 1RDAA 1BGXT 4K8ZA 1RT6A 1C1AA 4CJ5A 1N6QA 1JLAA 1ZBIA 1KCFA 4FK2A 4NCGA 3S3OA 4BDPA 2IGIA 4K8XA 4IKFA 2HNZA 5CYMA 3TR8A 4CEZA 1Z25A 3ZT3A 1U47A 1QTMA 1WNSA 3I8DA 4N76A 4EZ9A 1SL1A 3V6DA 3PV8A 1NJXA 3OYEA 4ID5A 2XY8A 5J2MA 4TSXA 1L3UA 4HUFA 4FK0A 2HHQA 5J1EA 4F4KA 2KZZA 3VQCA 1EETA 4ELUA 1DTQA 4ZTJA 4LSNA 3FFIA 4H4MA 3LWMA 3MEGA 3T1AA 3AA5X 1UWBA 4DS5A 3QEWA 1QSLA 5JS1A 2D0BA 4KHYA 1T8EA 4OLAA 1YTAA 2EHGA 2VG6A 4CJLA 3O3GA 1BIZA 3OS2A 2OZSA 5CYQA 2VWKA 1IKVA 4C8NA 1EKEA 4OLBA 1U04A 3ZT0A 3PO5A 4BDZA 1O1WA 1WLJA 2P5GA 4I2PA 3E01A 5KRTA 1BI4B 4OPJA 1IG9A 5EU7A 4BDYA 1T7PA 4YFUA 4DSLA 4O0JA 3VQPA 3NH2A 4C8OA 4AHRA 4I2QA 3CG7A 4XIUA 4DSIA 1XWLA 5SZTA 2Q3SA 2OPSA 1HQUA 4W5RA 2QKBA 4LH5A 2DFFA 3AV9A 1JLCA 1NJWA 2B5JA 3KLHA 4EZ6A 4KPYA 4CEFA 3SI6A 4FXDA 3KK3A 4DTPA 4MQ3A 1T03A 3TWHA 4C8KA 4FZYA 4UQGA 4FVMA 1QHTA 1J5OA 1HNVA 1NJYA 1RT1A 4KV8A 4CHZA 3U3YA 4PY5A 1Q8IA 2B4JA 4DTUA 1GOCA 3WNFA 4CF9A 4KHWA 4DTRA 3NFAA 2PYLA 4PUOA 4DTSA 1LAVA 3OYGA 1RDCA 4QAGA 3I0RA 4CF2A 2FBVA 3VA3A 2G8UA 3DLGA 3HL8A 3ITHA 1NK6A 4DQPA 4KKOA 4AHSA 3B6OA 4L8RB 3C94A 3OYHA 4E19A 3HM9A 5HBMA 2DFEA 3AVIA 3DRPA 1BHLA 2BANA 3V9XA 1D9FA 3ALYA 4M45A 1VSHA 1D5AA 1FKOA 3ZSWA 4E1NA 3ZSVA 3OYDA 3HPOA 4PWDA 1KVAA 3C6UA 2F8SA 1NJZA 1RTIA 1X9MA 3LP1A 1JL1A 1UAXA 1C0MA 2O4GA 5J2NA 3SV4A 4DQSA 4M3XA 4ELVA 1ZBHA 1WSFA 1JLBA 4LD0A 3HO1A 2KW4A 4FJ5A 1RDBA 3NF6A 4CHYA 4FLYA 3DLEA 3OJUA 2ZE2A 3SJJA 1A5XA 3PY8A 3OYKA 4ICLA 3KLEA 1F21A 4KREA 2QKKA 3QEPA 1J53A 4CFBA 4F3OA 1QSYA 4HUGA 1KTQA 3U3GA 3AVGA 1TK5A 1TKDA 3HXMA 4Z4EA 3MAQA 2HB5A 4J2EA 1SKWA 3P1GA 4Z0UA 1S6QA 4CEQA 4C8MA 3M8SA 3DLBA 2ETJA 3G10A 1D8YA 3DLHA 1RT3A 4N56A 3HYFA 4KHUA 4I7FA 3NCIA 4CHQA 3VQQA 3O4NA 1WAFA 3VQEA 4DSFA 1ZYQA 2PY5A 3M8PA 1ASUA 1FXXA 3PX4A 3CM6A 4QOZB 2P5OA 4FJ7A 3C95A 1C1BA 4RG8A 4DLEA 2XO7A 3M8QA 3V4IA 1NK8A 3L2WA 3NGYA 3DOKA 4ZHRA 3VQ4A 4FK4A 1TGOA 1I3AA 4CJSA 1HNIA 3OJSA 4CE9A 3KD1E 1L5UA 1JLQA 4CJWA 3OYAA 4DLGA 4B9VA 3HT3A 3K5MA 3LWLA 1C6VA 4IDKA 2D5RA 3L2QA 3DYAA 4CERA 4KB0A 2YHAA 3TAEA 4B9LA 1B9DA 3RR8A 1HQEA 3OS1A 5HRNA 4CJKA 4DQQA 3KIOA 3KLFA 4FCYA 4KAZA 1RTHA 2F8TA 2AJQA 1VSMA 1RBSA 4DSKA 4M3TA 2Z1GA 3QIOA 3PUFA 3OVNA 4KRFA 2O4IA 3V9WA 4DQIA 4OGCA 3DLKA 2BGGA 2OPPA 4ELTA 4EP4A 2XRIA 3ULDA 4DF4A 1SKSA 2KFZA 4DFJA 1S9EA 4G1QA 2G8HA 4FJLA 4RW7A 1NK9A 1CZBA 2P1JA 4FZZA 4CHPA 4EP5A 1S1UA 3HPGA 3KLIA 4W5OA 4Q5VA 3HJFA 3VQAA 4M3ZA 3SUOA 1BIUA 5FRNA 4CGJA 4FLVA 4B8CA 3QEXA 3AO3A 1SL2A 2HHXA 1Q9YA 2LSNA 4CIGA 4Z4CA 4JS4A 4N47A 1IKWA 4CEEA 3VQBA 3QLHA 2A1SA 4M42A 1WSHA 4CJEA 4KB1A 4J2DA 1HRHA 2I5JA 3OYBA 2RPIA 4FLWA 4I9LA 3VQ9A 3DRSA 1CZ9A 3CFOA 1RT7A 3AVLA 3MEDA 3TI0A 1TL1A 2YV0X 3K58A 1HYZA 3TABA 5HP1A 4IFYA 3THVA 1NKCA 1NOYA 2HHWA 4FZXC 2KTQA 3RTVA 4ID1A 1J54A 4O5BA 3AVBA 4CFAA 3ASMA 2VG5A 4BE0A 2D0CA 5FDLA 2R7YA 3SUQA 1BQNA 4CJFA 4B9SA 3K5LA 4CIEA 3LP0A 4CGHA 1QS4A 1B9FA 1QQCA 4DU1A 1EX4A 3RMBA 4DF8A 4W5QA 3UIQA 5FROA 4BE1A 4HTUA 3WNGA 1QE1A 1ZBFA 4E7HA 1A5VA 1WSIA 3CQ8A 2PYJA 4BWJA 3KK1A 4FJJA 1XC9A 2P51A 4OPKA 3TAGA 1XHZA 2RN2A 3HPHA 4FJ8A 4DG1A 1VSEA 2BDPA 3ZSYA 4FJHA 2HNDA 1TKTA 3LAMA 3QETA 2DFHA 1SL0A 1RT2A 1WAJA 4J2AA 1S1WA 3OYLA 4JRQA 1BCOA 2OA8A 3D45A 2X6SA 1YVUA 4FLXA 3NBPA 1TK8A 3A2FA 1GOAA 2FBTA 1NK0A 3SYZA 4IG3A 1JLEA 3PO4A 4GMJB 4O44A 4DTMA 3TANA 3SQ4A 4DTOA 4NCBA 3MEEA 4CEAA 3V9SA 3LANA 1EXQA 2Z1HA 3AVAA 5C25A 3TAFA 3MXMA 1NK5A 1RTDA 2HVHA 1J9AA 1TK0A 2KZMA 3NH0A 2ITGA 3K5OA 1HPZA 4GW6A 2F96A 4FLTA 4CJPA 4I9QA 4H8KA 5FRMA 1FKPA 3V1OA 4FYDA 1KLNA 1TV6A 3RRHA 1HJRA 3SV3A 3CM5A 3AO1A 2RF2A 4F2RA 2G8KA 3ISNC 4CK3A 1UA1A 5SWMA 4Z4IA 4E7IA 3LP2A 2IS3A 1N5YA 1BCMA 2IOCA 4FM1A 3V1RA 2G8VA 4FJMA 1HMVA 4LSLA 1RT5A 1DLOA 5HLFA 2XY7A 4FJNA 1TAUA 1LWFA 1WSJA 4HCCA 4CGGA 3SPYA 2HHVA 1TL3A 3AA2A 3SPZA 3OYNA 1TAQA 3SQ2A 3RWUA 5CY4A 1NOZA 3MECA 4B9TA 4DWIA 4F8RA 4CJVA 3C6TA 1JLFA 1XHXA 5KRSA 4FJIA 4FJXA 1TKXA 1Y97A 2HHTA 1I39A 4E7LA 1RBRA 5KGXA 4E7JA 1KSPA 1UA0A 5HRRA 3DI6A 4FM2A 3IRXA 4JS5A 5K14A 2BE2A 1X9SA 4DTJA 3QERA 2OYQA 2PZSA 2IC3A 3VA0A 3AVCA 1U49A 3MXJA 3OYMA 4JLHA 4AH9A 4DTNA 4M3YA 4Y1DA 3K57A 4N41A 1BISA 2YHBA 5KI6A 4E89A 4FM0A 1G15A 4OKJA 3SUNA 1KVCA 3L2VA 4DMNA 1S5JA 1R0AA 3P83D 1KFSA 3PX6A 2VWJA 3RRGA 3EZ5A 2YNFA 3QIPA 1C0TA 3SZ2A 4B9UA 4CGIA 4O0IA 1UOCA 1JL2A 4DU3A 4KO0A 4CEOA 3LDSA 4DFMA 3OYJA 3AVKA 3G0ZA 3V81A 4FJ9A 3V9ZA 2A1RA 4R5PA 3VQ6A 1LWEA 1S6PA 3QEIA 4KHNA 1S1XA 2D0AA 4DSEA 3ZSRA 4IBNA 4CJUA 4BACA 2VG7A 3LZIA 3EYZA 3T19A 4BWMA 4CECA 3L3UA 3K2PA 4FW2A 4CHOA 1XI1A 2G8FA 4NCAA 1S1VA 1K6YA 4OGEA 2NUBA 1REVA 1FK9A 5HRSA 3HSTB 1NK4A 2KFNA 2W42A 3HP6A 3ZT4A 3AA3A 3OY9A 3RMDA 1IO2A 3NDKA 2FBYA 3DLRA 3O3FA 4M3WA 1JXEA 1RNHA 1KFDA 4CEBA 1X9WA 4H4OA 3SQ1A 2RKIA 1NKBA 4B9NA 1RILA 4MFBA 3M8RA 3CFPA 1U4BA 4OKEA 4DFKA 3RMCA 2GUIA 2XHBA 3TARA 3V1QA 4B8AB 3SNNA 2JGUA 2Z1JA 5DMRA 1L3TA 1ZBUA 5KGWA 3LAKA 4DQRA 4HUEA 1SUQA 3ZCMA 4RW9A 4JRPA 4RW8A 4CGFA 4DS4A 2GBZA 2G8IA 4CK2A 4PQUA 3OS0A 3PX0A 3AO2A 4HHTA 1L3SA 1VSLA 2E4LA 3TAQA 3LPUA 4PA1A 2YNGA 2HHUA 4F3TA 2HVIA 1KLMA 5HROA 4AHUA 3S9HA 2Y1JA 3ZT1A 3JSMA 3O3HA 2Y1IA 3S3MA 2YKNA 3VQ8A 1RTJA 3NHGA 1JKHA 4AHCA 1RT4A 3V9UA 1U48A 1VSFA 4DU4A 1D9DA 4B9MA 3F9KA 2JLEA 1SV5A 3AVNA 4KTWA 1EP4A 4DSJA 2ZD1A 4FJGA 3BGRA 2OPRA 3EY1A 1LWCA 4CF8A 4AILC 1QSSA 3NF8A 1NKEA 1W0HA 4CJRA 1ITGA 3WNEA 3JYTA 4KI6A 1JXBA 3DMJA 3KKSA 4GVMA 4W5TA 5J2QA 3SQ0A 1HYSA 3IAYA 1Q9XA 4KTQA 1WSGA 2EX3A 4KHSA 3QINA 3H08A 2HNYA 4Z4FA 3ZSZA 3NGIA 1VK0A 3L2RA 1TKZA 3OYFA 4AHVA 3DOLA 3K59A 4FJKA 4M41A 4B08A 2B6AA 2IAJA 2X74A 5C24A 3NF7A 4J2BA 2ATQA 4LH4A 3QNNA 4CGDA 2WONA 4CJTA 4CHNA 5I42A 4Q0BA 2Z1IA 5HRPA 3VQDA 1B92A 1BL3A 2KQ2A 4O4GA 3AVMA 1X1PA 4RW4A 1SKRA 4Y1CA 1NK7A 1RCHA 1DTTA 4OJRA 3HK2A 4B3OA 2DTUA 1WSEA 3RMAA 3P5JA 4KFBA 4O55A 4QCLA 3HVRA 3WNHA 3KLGA 4LY7A 3F73A 3T3FA 4CEDA 1RBTA 4E3SA 1T05A 5KTQA 3D0PA 1HYVA 2YNHA 1C1CA 1BQMA 2FC0A 3SUPA 1ASWA 5C42A 2XY5A 3U6FA 1U45A 3LZJA 1BI4A 1YT3A 2X6NA 4W5NA 1VRUA 4CFDA 3KJVA 2HHSA 1ZBLA 3LPTA 3RR7A 2XY6A 3VQ7A 3IS9A 3ZSOA 1VSDA 1VRTA 2X78A 4Z4HA 1LAWA 3I0SA 3ZT2A 4N5SA 1LW2A 1VSIA 3DM2A 3AVHA 3OYCA 1W9HA 3NF9A 5JS2A 3QEVA 3SCXA 4KTZA 3NE6A 1RDDA 4DFPA 5I3UA 4CCHA 1CLQA 1GOBA 1TVRA 4NYNA 3ZSXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CF5L 4CESA 3PIOL 4HCBA 2GTDA 5LMNK 3LDOA 2O8DA 2E6LA 3I33A 2AA4A 5AFUH 3DAWA 1KRPA 2QWMA 3TSPA 4CFCA 4DV5K 3DXKA 1NMDA 4ZTFA 1MU2A 3OYIA 1XNRK 4OKKA 2NRVA 4M3UA 3IG1A 3VN5A 3O1BA 4C8LA 3O9UA 4BR0A 3KK7A 4M3RA 1CXUA 4E7KA 4EIAA 3ZX2A 1ASVA 4DR1K 3OBWA 1IH7A 2ZF5O 1ILYA 4GV3A 3PIPL 5E26A 3VEWA 4CJ4A 1OH7A 2G8WA 4CIFA 3BY5A 1TUYA 4NB4A 3QO9A 3KWGA 1L3VA 4KHQA 1LW0A 1HNXK 3AVJA 3KTQA 3AO4A 2P9LB 3QMLA 3TAMA 1VQ7N 1Z6RA 5FPDA 1RDAA 4ILGB 4K8ZA 1RT6A 1C1AA 4DB3A 4NCGA 2IGIA 4IKFA 4XH1A 2W41A 1QTMA 4V19S 4N76A 5GAHP 3I8DA 3PV8A 1NJXA 1IV0A 5J2MA 4FWLA 4HUFA 3CC2N 3CCQN 5J1EA 4A61A 1EETA 1DTQA 4ZTJA 3FFIA 5JS1A 1IBKK 2HF3A 1T8EA 2VG6A 1BIZA 1IKVA 3ZT0A 4WQ4C 3MN7A 2P5GA 4H03B 4OPAA 5EU7A 4BDYA 3WUHA 4YFUA 2FSJA 3NH2A 4C8OA 2HBLA 4I2QA 3THXA 1BA1A 2P9UB 2Q3SA 4AF1A 4H0YB 1K8KA 2QKBA 2DFFA 2B5JA 3Q7CA 5E84A 1T03A 4WFAL 3HTVA 2FF6A 2CH6A 3T1YK 2HBMA 4X62K 3LDPA 4DTUA 4H0TB 4CF9A 2GWKA 3I56N 2F7TA 4CF2A 2O8BB 4DV1K 3DLGA 3HL8A 5LL6Z 4KKOA 4L8RB 5HBMA 3AVIA 2BANA 4CVNE 1D9FA 3HBTA 5C0YA 4E1NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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