4Z0UA

Rnase hi/ssb-ct complex
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
b'MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADKKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Interaction with Single-stranded DNA-binding Protein Stimulates Escherichia coli Ribonuclease HI Enzymatic Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ribonuclease H
source organism Escherichia coli o139:h28
molecule tags Hydrolase/peptide
total genus 49
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 2015-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4z0uA00
1YTAA 1RDDA 2PZSA 2Z1GA 3SPZA 3THVA 4FK2A 3OVNA 2IOCA 1X9SA 5CZ2A 2FBVA 4FM2A 2YHBA 4AHUA 4DU4A 3LAKA 4W5QA 3DYAA 3HJFA 3WNEA 1RBVA 4EZ6A 1TGOA 1J9AA 5C42A 4M3UA 3SV4A 3V9UA 3AO4A 1R0AA 1BCMA 1QE1A 4CE9A 3NFAA 1SKRA 4B9MA 3LALA 3HXMA 3O4NA 4OKJA 3SPYA 2Q3SA 1RDBA 2HHSA 1Q9XA 1IKWA 1TL1A 4HVJA 5E41A 3LP3A 2Y1IA 3M8PA 1J5OA 4CF1A 4LD0A 1IKXA 3NAEA 4FZYA 1WSFA 3OYCA 4CIGA 3L3VA 1TK5A 3PX6A 2XY8A 3HP6A 4O5BA 3VQDA 4CJEA 1RCHA 3BGRA 3D45A 3OYHA 1U4BA 3KD5E 2DFEA 3EYZA 5CY4A 4B9UA 5SZTA 2B4JA 2D0AA 1LW0A 1NKBA 3HVRA 4DTPA 2OPPA 4UQGA 1EETA 3MXIA 4N76A 4O0JA 4CJPA 3K2PA 1C1AA 4DTOA 4F3OA 5J2NA 1HYSA 2EX3A 2NUBA 5CYQA 3RMBA 2KZZA 1TAUA 3HK2A 4KHUA 4OGCA 3SQ1A 4RW9A 3OYBA 1VSFA 4CECA 4CGJA 4HTUA 2ITGA 3VQPA 4CFCA 1U45A 1KRPA 2IAJA 5SWMA 1RBSA 1S1UA 3NF6A 5HRNA 4CF0A 2W42A 3RMCA 4ELUA 4DQIA 1S1VA 5FRNA 3HL8A 1IG9A 1NKEA 5I3UA 5C25A 4F3TA 1JXEA 5HRSA 1RT4A 4Z4GA 2E6LA 3L3UA 1JXBA 2AJQA 3EY1A 4NCGA 5T7BA 2FBYA 3AVJA 3WNHA 4FJ7A 1BI4B 4ZTFA 4E1NA 3AVFA 1A5WA 4LSLA 5KGWA 4CK2A 3EZ5A 1KFSA 4NCAA 4KHWA 1C0UA 3G0ZA 4HCCA 5KGXA 2VG7A 3MECA 4DQSA 3V9XA 1L3SA 3OYNA 2OPSA 2X78A 2P5GA 1FKOA 4FJLA 2DY4A 1HQEA 4RW6A 4FLTA 4AHTA 1HNVA 2WOMA 4CF8A 4KHSA 4ZHRA 5DK5A 1HYZA 4W5TA 3AO1A 3L2RA 2RKIA 3QINA 3T19A 3TAFA 1W0HA 4M3WA 1NK8A 2G8WA 4DTMA 3KTQA 4FZZA 2BDPA 1WNSA 4CHOA 1JL2A 4CJFA 1RBRA 3AA5X 2R7YA 4DF4A 4CEOA 3FFIA 2KFNA 1KTQA 4CERA 4KAZA 3NDKA 1RT6A 1FK9A 1Q9YA 3L2QA 3V6DA 1JLFA 2YV0X 2OZSA 1C0MA 1BCOA 2ATQA 1KVBA 1ZBUA 4CJ4A 1C0TA 3E01A 2G8VA 4AILC 3T1AA 1J53A 4N41A 4R5PA 3HPGA 4CGGA 3VQAA 4CJRA 4KKOA 4MQ3A 3QEVA 2DFFA 3DRSA 1KVAA 3TABA 2BANA 1X1PA 4BDYA 3QNNA 1REVA 3ZT2A 1N5YA 3MXJA 3KLGA 1JLEA 3NHGA 3K5LA 1WSJA 1N6QA 2B6AA 3OY9A 4ID1A 4LH4A 4FJXA 1WSHA 2E6MA 1ASWA 1YT3A 4H4MA 3C6TA 1XHXA 5J2QA 1HMVA 4CEAA 1D5AA 1LWEA 1TKDA 4FJNA 2LSNA 4M41A 1J54A 3TWHA 4M3RA 3AO3A 4CJ5A 3AVBA 5HBMA 3P1GA 1RT7A 4FW1A 4CF9A 1DLOA 3TAEA 4DQRA 1GOBA 1CXQA 3AVAA 4CJQA 2Z1HA 3TI0A 2G8UA 3L2WA 4IG3A 3AO2A 1Q8IA 1RTIA 1D8YA 3ZT4A 4KHNA 3OYMA 3NF9A 4JRPA 3BDPA 2HNZA 3NH0A 5JS1A 1XWLA 4FVMA 4OLAA 1WLJA 1B92A 1C1CA 1RDCA 4FJJA 4NYNA 3SYZA 1U49A 5HROA 4CEEA 4EZ9A 1T03A 1RTDA 4KTWA 1CXUA 4E7LA 3SCXA 1WN7A 1A5VA 3C94A 4YFUA 4PQUA 1UAXA 4LY7A 2P5OA 1RTHA 3AA2A 4O4GA 1NOZA 3NBPA 4RG8A 3RR7A 4B08A 4B9TA 3G10A 4DSJA 4CHQA 1X9WA 3AA4A 3VQ7A 4BDPA 3OYDA 1SUQA 3KK1A 1ASUA 4QAGA 2D5RA 5JS2A 5KTQA 3S9HA 2OZMA 4H8KA 4CFDA 4QCLA 1C6VA 4CHYA 2F8TA 4LSNA 4N47A 2ZQBA 3OYIA 2FC0A 1UA1A 1SL1A 4L8RB 5J2PA 1VSIA 3L8BA 2PYJA 2HNDA 5I42A 1L3VA 3QIOA 3QNOA 4KTQA 3DOKA 4KI4A 3ZSZA 1VSKA 3HM9A 1EXQA 4M42A 3DI6A 4KHYA 1YTUA 1K6YA 2QKBA 4IKFA 1C1BA 5EU7A 3SI6A 4HHTA 3KK2A 1RBTA 3QERA 4CJVA 4JLHA 1RILA 2YKNA 4KRFA 4FJMA 4FYDA 1NK0A 3VQBA 4Y1DA 4FJKA 1S6PA 1ASVA 2XHBA 1QTMA 1QQCA 1L5UA 2HHXA 3SUNA 3TAQA 3AVHA 1S1TA 3ZSWA 1HNIA 2QKKA 3LWMA 3AVNA 1L3TA 3VQEA 2HHTA 4AHCA 4AHRA 1NKCA 4E1MA 2GBZA 4OKEA 1CZ9A 3HO1A 4FK0A 2KZMA 3PX4A 3TARA 3PO4A 1GOCA 4FJGA 2YNFA 3AVIA 1U04A 4F8RA 1SKSA 4DFMA 3QEWA 3NGYA 3S3OA 3IS9A 4DTRA 2IGIA 1XC9A 4CJKA 4Z4FA 1WAFA 4RW8A 3LPUA 3O4QA 3KIOA 4MFBA 1VSJA 2QK9A 1QSLA 3V9SA 4DSLA 4BE0A 3TAGA 4C8KA 4KTZA 4FK4A 4KHQA 3K59A 3K57A 3F73A 1CZBA 2E4LA 1RBUA 1RT5A 1VSMA 2ZE2A 3CM6A 1BGXT 2A1SA 1S6QA 3ZSXA 3LZJA 3VA0A 3V4IA 3SJJA 3DRRA 1D9DA 4Q5VA 3K5NA 3T3FA 4DQPA 1TL3A 3DOLA 1JLQA 3MEDA 4O44A 1T7PA 2HMIA 1B9FA 2RF2A 1LWFA 2BE2A 1DTQA 1I39A 5C24A 4FM1A 4DTNA 4IFYA 4BE2A 2IDOA 2IC3A 2YNHA 3QEPA 2X6SA 4Z4IA 4DSIA 4DSKA 3K5OA 3KLEA 1VSHA 4O55A 3ZSRA 4B9NA 1O1WA 1TV6A 4CEZA 4ICLA 2Y1JA 4DQQA 4F4KA 1EKEA 1NJYA 4DMNA 3OYJA 3ULDA 2QXFA 4C8LA 3U3YA 3RWUA 4PUOA 4E7KA 3CG7A 5DMRA 4F2RA 1TVRA 4BE1A 4IBNA 4K8XA 3AVGA 5CYMA 3MEGA 4CJUA 4XIUA 3OYGA 3QETA 2FBTA 3KLFA 4OJRA 4WE1A 4M45A 4CK3A 3QEXA 3DLBA 1NK9A 3LP2A 1KFDA 3MXMA 2KTQA 2B5JA 4EP4A 1SKWA 1GOAA 3LP1A 3P5JA 3ZCMA 4CESA 4E7IA 1KSPA 1F21A 1S9EA 2OPQA 3CYMA 4GMJB 4W5RA 2KFZA 3NGZA 4LH5A 4H4OA 4OGEA 5HRPA 3K58A 1BHLA 5FDLA 3ZT1A 2XY5A 3VQCA 4DFKA 3SQ4A 3PO5A 3AVMA 2VG5A 4CIFA 5J2MA 3V9ZA 2Z1JA 2YNGA 4I7FA 4C8MA 4FLZA 4E89A 1SL2A 4J2EA 1VSLA 4JS4A 1VK0A 4NCBA 2BGGA 4G1QA 1SL0A 1DTTA 2ZD1A 3VQ5A 3OJUA 2HVHA 3DLKA 3SV3A 3NE6A 4KPYA 4I9LA 4FJHA 2GV9A 2KW4A 3NCIA 1TK8A 1KLNA 1VRTA 4CJTA 1NK5A 4M3XA 2HHVA 1UOCA 3KKSA 1IKYA 1S9GA 1VSDA 3ZSYA 4ELTA 1Z26A 2F96A 4NYFA 1QS4A 4DS5A 3QESA 3HSTB 3IRXA 1B9DA 2HB5A 1RT1A 4FLVA 3VQ4A 3DRPA 1I3AA 3S3MA 2OYQA 3V81A 3OYAA 4DLEA 3IG1A 4AH9A 4OVLA 2O4IA 3DLGA 4KB1A 3F9KA 4AHSA 3AVLA 4B8AB 4Z4HA 3OJSA 1XHZA 1JLBA 3M8RA 1HPZA 3VQ9A 4E19A 1VRUA 2HW3A 2HVIA 1BQMA 3OS0A 1G15A 4IFVA 3OYKA 4J2AA 2D0BA 5KRSA 2YKMA 3LP0A 4FJIA 4CJWA 4FLXA 4E7HA 3AVKA 2RN2A 1FXXA 1UWBA 2HNYA 2KQ2A 1HRHA 4CFAA 2VWJA 4FJ9A 4FXDA 3KLIA 4DTUA 4DWIA 4CHNA 4KREA 4YNQA 3LANA 5HLFA 1LV5A 4Q0BA 4E7JA 1ZBHA 3MAQA 3LDSA 4OKKA 5KI6A 3O3FA 3CFOA 4DTXA 5J1EA 1FKPA 1S1WA 4TSXA 3VQQA 3JSMA 2ETJA 3CFPA 1BISA 1W9HA 4DS4A 1QSSA 1ZYQA 4F2SA 2HHWA 3AVCA 3VQ6A 3I8DA 3NH1A 2PY5A 4B9VA 3M8QA 3ZSOA 3B6PA 1RTJA 1WSEA 2GUIA 2XO7A 3TANA 1IO2A 1TKTA 3I0SA 4FW2A 4CHPA 1RNHA 4B9LA 1BQNA 1JL1A 4KFBA 4BWJA 4JRQA 1S5JA 2HHUA 4FJ8A 2P51A 2VWKA 2RPIA 3OS1A 2WONA 3ASMA 3B6OA 1YVUA 2HHQA 4FJ5A 1NOYA 4I9QA 4ID5A 3RMAA 2YHAA 4GW6A 4IDKA 1WAJA 3SQ2A 3HYFA 3ZT0A 2A1RA 1BL3A 4FLWA 1EP4A 3V9WA 4KO0A 4N5SA 3IAYA 3LZIA 2DTUA 1U48A 1LAWA 3CFRA 1BI4A 1QHTA 3AA3A 1EX4A 3L2VA 4Z4EA 1CLQA 4CJSA 2XRIA 4AHVA 5FRMA 4CIEA 3LPTA 4B9SA 2G8FA 4CGFA 4I2QA 4E3SA 4CEFA 4N56A 1NK6A 3TAPA 2OA8A 1NJZA 2VG6A 3PX0A 4KB0A 3OYLA 1WSGA 1XI1A 3WNFA 3PV8A 3DMJA 5HRRA 2JGUA 3RTVA 4CCHA 4FLYA 1Y97A 2JLEA 2X6NA 3JYTA 1ZBIA 4RW4A 3UIQA 2F8SA 1LW2A 4CK1A 1QSYA 4KI6A 2Z1IA 4FCYA 4O0IA 3NGIA 1JLAA 4BACA 3KKRA 1KVCA 1HJRA 3QLHA 3KJVA 3C95A 1RDAA 4M3TA 3SUQA 2FBXA 3RRHA 1L3UA 3ALYA 4BWMA 3SZ2A 4J2DA 3H08A 4DSFA 5KRTA 3KLHA 4BDZA 4B8CA 4DG1A 3SUPA 4CEQA 1TKXA 3TR8A 4JS5A 4FM0A 1NK7A 1JLCA 3AO5A 4Z4CA 4I2PA 1U47A 3S3NA 4QOZB 2G8KA 1UA0A 4DU1A 3K5MA 3P83D 1ZBFA 3C6UA 3ITHA 1Z25A 3U6FA 4ZTJA 4GVMA 4RW7A 2DFHA 2XY7A 3L2UA 3OS2A 1NK4A 3CM5A 4ELVA 4PWDA 2PYLA 2P1JA 5HP1A 3QO9A 4OPKA 3WNGA 2X74A 4DSEA 3MEEA 3TAMA 4DU3A 4W5OA 5K14A 3ZSQA 3HPOA 5CZ1A 3M8SA 4Z0UA 3QIPA 1X9MA 1KCFA 1T05A 3RRGA 2I5JA 5D3GA 4C8OA 1LAVA 4K8ZA 4CFBA 3O3HA 4CJLA 2XY6A 3VQ8A 4M3YA 3NF7A 3V1RA 4CJ3A 3ISNC 1NJWA 3HVTA 3PUFA 3RR8A 4CF2A 5FROA 2O4GA 2D0CA 4E0DA 3KD1E 4HUFA 2IS3A 4HUEA 3QEIA 3KK3A 4J2BA 4OLBA 2EHGA 3SUOA 3O3GA 1HQUA 3CQ8A 2G8HA 4M3ZA 4FZXC 4CGDA 2G8IA 4DFJA 3SNNA 4DFPA 4CEBA 3ZT3A 4EP5A 1IKVA 1S1XA 4OPJA 3A2FA 3DM2A 4PA1A 3V1OA 3LWLA 4PY5A 1RT2A 3AV9A 3PY8A 3I0RA 4HCBA 1ZBLA 3DLHA 1KLMA 1VSEA 3HP9A 4KV8A 1LWCA 3DLRA 4CEDA 1A5XA 3VA3A 4HUGA 3SQ0A 1T8EA 3HT3A 3OYEA 1NJXA 1HYVA 1IH7A 4DF8A 1D9FA 1RT3A 1WSIA 4DLGA 1MU2A 2YNIA 3DLEA 3U3GA 4DTSA 2OPRA 1TKZA 4CGIA 3NH2A 4DTJA 3VN5A 3RMDA 4C8NA 3ZSVA 3D0PA 1TK0A 3OYFA 3LAMA 4W5NA 3NF8A 1BIUA 3HPHA 1BIZA 4IG0A 4FLUA 4B3OA 1TAQA 4CGHA 4Y1CA 1JLGA 1SV5A 4CHZA 3V1QA 1ITGA 1JKHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UYTA 3EO3A 2PZSA 2Z1GA 4H5VA 5CZ2A 4AHUA 4W5QA 4EZ6A 1X9JA 4FWRA 1TGOA 2NRHA 3T69A 1NGHA 1SKRA 1TYQB 1OVYA 4OKJA 1Q81O 4BGBA 2HHSA 3E66A 5BR9A 5E41A 1BA0A 3LP3A 2Y1IA 1J5OA 4CF1A 4LD0A 5AQJA 3FZHA 1JCGA 3HP6A 4JKEA 4O5BA 4AM6A 4CJEA 1GLFO 3BGRA 3D45A 3F5TA 1U4BA 4B9UA 5SZTA 4UQGA 1EETA 4N76A 4CJPA 3K2PA 4DTOA 4F3OA 4MDAA 2NUBA 1HNWK 4JNEA 5CYQA 1TAUA 4RW9A 3AGRA 2ITGA 3VQPA 4CFCA 2IAJA 5SWMA 1RBSA 2W42A 3WXIA 3VERA 3R6MA 2NRVA 3E9PA 4BRNA 5C25A 4F3TA 3THYA 4Z4GA 1LCUA 3L3UA 1JXBA 2P9PA 5T7BA 3WNHA 4YOYA 4DV0K 4E1NA 1A5WA 4K43A 4LSLA 1JJ2M 4NCAA 3G0ZA 4HCCA 2VQFK 3MECA 4Z94A 5JLHA 1L3SA 5EVZA 2OCEA 2X78A 2VYPA 2F9WA 3CJ7A 4WQ4A 5TKYA 4FLTA 4H0VB 4AHTA 2YHWA 4RWTA 4W5TA 3L2RA 4FZZA 3KTQA 4RTFD 3KVGA 3J80O 3FFIA 1KTQA 1Q86O 4A59A 1FK9A 3L2QA 3V6DA 2YV0X 3THYB 2ATQA 4X62K 3E01A 1QZ6A 2P9PB 4AILC 4KHPK 3VQAA 1KC8O 1X1PA 1N5YA 3KLGA 3NHGA 1RDUA 2WFBA 3O9QA 5DM6L 4FJXA 1ASWA 1YT3A 1E4FT 1XHXA 5J2QA 3AO3A 3H46O 3P1GA 1RT7A 4FW1A 3TAEA 2KLAA 4UY8O 1T3VA 4QS8A 1HNXK 5F1XA 4CJQA 3TI0A 2Z1HA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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