4Z2JA

Serratia marcescens chitinase b complexed with macrolide inhibitor 31
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Creation of Customized Bioactivity within a 14-Membered Macrolide Scaffold: Design, Synthesis, and Biological Evaluation Using a Family-18 Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 161
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 4z2jA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4z2jA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4z2jA01
1ZJAA 4W7UA 3GYCA 4B9ZA 5BWFA 4Q22A 1H0IA 3VINA 3VTRA 2WKGA 3BCDA 3BSHA 3CUGA 3OLEA 3ZJKA 2AOSA 4AY1A 3MUIA 5I24A 3TP4A 3OLDA 2IXVA 4TOQA 3AS3A 1JNEA 2VZOA 3IK2A 3BLKA 4M81A 3S2CA 3T0AA 2ZE0A 1K9FA 1E4IA 3L4ZA 4KRUA 4MADA 4AD4A 3T08A 3PZUA 2B31A 1JZ2A 3OLGA 2EXOA 3AHVA 1EOKA 3QOMA 1AQMA 3MV01 1LL7A 3W26A 5JBDA 3WL1A 2V3GA 4D6DA 3WH8A 7CGTA 3OB8A 2E8ZA 1QBAA 3PBGA 1EDTA 3UETA 2VCAA 2CESA 5BROA 1C91A 1NP0A 5M3WA 1ZU8A 4JCLA 5GQBA 1DEDA 3VNZA 2WVVA 1F4HA 3VNYA 2J7DA 4RL3A 3GH5A 1KWKA 3K4DA 4AD3A 2QLYA 2CHNA 2J7EA 4UQBA 2D49A 1UD2A 4M29A 2VJXA 3AMCA 2PWGA 1F4AA 4GZIA 5DT7A 3AIVA 4ATWA 3EMCA 1QI4A 3VIOA 2CKSA 5M17A 3AICA 1QOXA 1SR0A 2UWFA 2ZUWA 2X05A 4CN4A 3GXIA 3CZGA 3L2MA 2Z1SA 5CSYA 1BYCA 2ZX5A 2VL4A 1E0WA 3PZOA 2WANA 4P8UA 3I3BA 2WMFA 3WF2A 3SCSA 3AHZA 2V3FA 1TG7A 2E9LA 2CXGA 5FL1A 1QNRA 2UY4A 3MS8A 1Q4NX 2BS9A 2CYGA 1IV8A 1JNDA 2OWWA 3RM9A 5AC4A 3B9EA 2JALA 1MFUA 4PSPA 4Y7EA 1E1EA 4PTVA 2D0FA 4H7VA 1V0NA 4UFIA 3BMWA 4HMEA 2DT1A 2QMKA 1JIBA 5GNZA 4D6IA 4AIOA 4F66A 4DWSB 2JEQA 4F9DA 1UD6A 2EPKX 4UQ9A 4W5UA 4PTWA 3CUJA 1XH2A 1XCWA 3VGGA 1V3MA 1AQ0A 4JKMA 1LJYA 1XSKA 3CUIA 1ZBKA 3WNOA 3EBVA 2WLZA 5LA0A 2A3AA 2WYSA 2XG9A 4IPNB 4CCEA 2UY3A 2WMIA 2W92A 1TZ7A 2XFYA 6TAAA 1EDQA 1NQ6A 3BXWA 4MAVA 3IAQA 3SCRA 2WZEA 3WF1A 2J78A 2FH8A 1EXPA 4CU7A 1GQIA 3WQ4A 1IT0A 4AYSA 1BTCA 1J12A 3LMYA 5IFPA 2WC4A 1XSJA 2BNJA 1CGTA 3L4UA 3CGTA 3GH4A 1MQQA 1CGYA 3VD4A 3PZGA 4ACZB 1I1WA 3GDBA 5D9PA 5FOOA 4TXEA 2GVYA 1J0YA 2WZHA 1ZL1A 1Q6FA 3A6OA 1BYDA 1E5NA 4J3SA 2PWHA 5E09A 1AQHA 4UR9A 4JFUA 3T2PA 2D23A 3AYSA 3OGSA 1UR4A 5D4YA 5EFDA 4B9YA 2DIJA 4LYRA 3N1AA 3PZMA 1GHRA 3GTNA 3WEZA 4JKKA 1V08A 2ZUMA 2J74A 2DH3A 4QCFA 5D8ZA 1C92A 3L4TA 3UERA 1EH9A 4XZBA 1UYQA 3QOKA 4W8AA 4B3KA 2VRJA 5FIPA 2RGMA 3W6LA 1W9VA 1J0JA 1US2A 3BAXA 2E40A 4PUEA 3UESA 2QPUA 1ZJBA 3SUWA 1V02E 5JH8A 1UKOA 2JF7A 2A3CA 3ZJ8A 4W84A 2DH2A 4AC1X 2YDSA 3ARXA 1CGUA 4Z2IA 3SCQA 3RILA 1ISZA 5A8PA 1W9BM 2XYLA 4GINA 2O9OA 2DPEA 1GOIA 3NUKA 1NH6A 3PZIA 3CTTA 2XFRA 2WSKA 3WF4A 1K6AA 1E71M 3MSDA 4UQCA 1VEPA 2VR5A 1H09A 4GXPA 1ISVA 3NSNA 5IDIA 2AAAA 3IANA 4QP0A 2J4GA 1PPIA 3RM4A 1HVQA 4CVWA 1NWUA 4A4AA 4DWSC 4QLKA 2YOCA 4J7RA 2XM1A 1C8XA 1DWHM 3ARQA 1DHKA 5DMYA 1C8YA 2CBUA 1EIBA 3WNLA 4H8UA 1EO7A 1VJSA 4CCCA 3NSMA 1CLXA 1R7OA 4HOZA 4FF5A 3ARSA 3N11A 1O7AA 1V3LA 4QFUA 4CN1A 5E6ZA 4UQDA 1B3XA 8A3HA 1XD0A 3J7HA 2BXZA 1KWGA 1GUVA 2EPNA 2YBUA 3K4AA 1E3XA 3SURA 5I77A 2WZIA 3VO0A 3W37A 3UR7A 3WUGA 1C90A 2YBTA 3VGHA 3BAYA 3GZAA 3M6DA 2ZX7A 3AMKA 2QMJA 5AC5A 4J3XA 1WE5A 1JD9A 5E0FA 3VDCA 1VBUA 1KCLA 3WELA 3MMUA 3BCFA 4R5EA 3ZSTA 1W3LA 3POCA 3WQVA 4E8DA 1WB0A 4PBGA 3SCOA 3GNRA 1E15A 1U2YA 3ARPA 4B3LA 4LX4A 1W32A 4ACYA 1JFHA 4M1RA 1GQKA 4FLQA 1LWHA 1B1YA 1J0KA 5I5RA 2XGBA 2PWFA 4PCSA 3EDEA 1KXHA 2FH6A 4M80A 2VTFA 3O9NA 1MFVA 4CD6A 5ECUA 3VMNA 3WD1A 4TX8A 1B3ZA 1UD3A 1BG4A 2ZUNA 3AS0A 1LWJA 1HVXA 1WZAA 5KEZA 4LYPA 1TVNA 1WDPA 1EDGA 2G3JA 1JL8A 2E4TA 1KXQA 4D1JA 1FH7A 2DGAA 3EDFA 4TX6A 3II1A 1HT6A 2DQXA 1PZ3A 1GVIA 4UZSA 2J75A 4U2ZA 3S6TA 1OT2A 3K46A 2YDRA 1SMDA 4ML4A 2W5FA 3G6MA 1OBAA 4QDMA 4B16A 2C0HA 1NOWA 1V6XA 5M03A 1NARA 4WKAA 4P8WA 3W24A 3BMVA 4NZCA 1H4PA 3I3DA 4PMZA 1G9HA 1HIZA 2CETA 4PCTA 4D6JA 4TUFA 2D3LA 4U3CA 5A6LA 2IUZA 5C8BB 1QNQA 1BFNA 1CXIA 3K8MA 4OZOA 5TD4A 2ZUTA 1H41A 5EB8A 2QHAA 5D9OA 1UA7A 1QNOA 2EJ1A 1W3JA 2OLHA 1W3HA 4F8XA 4RE3A 3SCVA 4W85A 4D6EA 2WMJA 3CMJA 2QF8A 1OCQA 2CHOA 1RD6A 1E4NA 3VD9A 3VDBA 2GK1B 1EGZA 3SUUA 4MNLA 4FMVA 3WUBA 1H49A 1EHAA 1UR8A 4GI6A 4ZENA 2VZVA 4MJ4A 1BHGA 4U2YA 2CKRA 5A6BA 1GORA 1XGZA 3FHAA 4PMUA 5BRPA 4DM2A 5I3DA 1HKKA 4AD5A 1M03A 4D6HA 2XVLA 1TA3B 2BY0A 9CGTA 4YHEA 2OYKA 3RCNA 4MB1A 3AISA 3WMSA 2VVNA 1HJSA 1V3KA 1UR2A 2V5CA 2VT0A 4D6GA 3N15A 2MANA 1U30A 3WD0A 1E6XM 5GNYA 3OGVA 4FLOA 3GXMA 2VR4A 4PMNA 3VGBA 3WFLA 4ACZA 1E73M 4PN2A 3PTKA 1SFSA 1E55A 1G1YA 4C7DA 1LG2A 3BC9A 4P7LA 1W1VA 3PZTA 3BAWA 3PZ9A 4UNIA 3VGEA 5C70A 2VCCA 3NJ3A 3KE0A 1MQPA 2WVUA 2O9TA 2J7BA 1V03A 2V5DA 1B9ZA 3ZIZA 1JD7A 1FP8A 5CPQA 3WNKA 4UCFA 4J28A 4LQ1A 4GKLA 6CGTA 1GZJA 5CGMA 4P7RA 4OOUA 2BFGA 2ESCA 3BAIA 1E43A 2VZUA 4W8BA 4W89A 4HMCA 1PX8A 4P7NA 3MUAA 1UH3A 3VIKA 3D3AA 3WBEA 1FHLA 1KR1A 1JZ8A 1OD8A 1ISWA 1A3HA 4GZEA 5DEZA 1VBRA 3MMWA 1V6VA 2BHYA 3ZT6A 2PC8A 2DSUA 2XSBA 5GPRA 5A6JA 1HN1A 5E70A 3KWXA 4URIA 1BLIA 4D1IA 2VQUA 3L4WA 4J3TA 4AZ5A 2E9MA 3HU7A 1DWJM 3L2LA 2WBKA 5ABFB 4F9JA 1CGXA 1GQLA 2IXUA 5IHSA 2VX5A 4YPJA 4AD0A 4BF7A 2D3NA 1W9XA 2YLLA 3NYDA 4WF7A 3WQ8A 3WQWA 3AMDA 3N17A 3WENA 2YDQA 1J11A 1XC6A 2W63A 4UTFA 1KXTA 1DWIM 1PJ9A 2YL6A 1CWYA 3N04A 4GO9A 4OBSA 4TVUA 2DSVA 2VURA 3SUVA 4P7OA 1L8NA 1E0VA 4P8XA 4LXFA 1JZ5A 1PZ2A 1MW3A 1E6ZA 1LG1A 1AVAA 3MV11 1WZMA 2WHLA 1V3HA 1GW1A 1RPKA 5CGTA 5FCZA 4CU8A 2DSKA 1OM0A 1B90A 3QHNA 4AD1A 1XHGA 1E56A 5DO8A 2G3IA 3SCTA 1XV8A 1JYXA 2XWDA 3TTYA 4GQRA 4BZYA 1NWTA 3KL0A 4HZ7A 3WY1A 1UR9A 3UG5A 1CXHA 3VKKA 4YN5A 1FH8A 4AZCB 1UWTA 3NIYA 5JUVA 1EHNA 5BRQA 2GJPA 4HA1A 4YHGA 3U7BA 4XB3A 3AXIA 4NF7A 3TA9A 3AXHA 1BVNP 3SUTA 3MUZ1 1MWOA 4HMDA 4PMYA 4XUYA 1GONA 3ARTA 2J7FA 4W7WA 1LL4A 1E4LA 1V0KA 2Q8XA 2YL9A 2JIWA 5CSUA 1BAGA 2CPUA 3WL0A 4GIAA 2WKLA 4BQ2A 1ED7A 2WMHA 4E4PA 1UKQA 2ZX8A 4X0VA 1UWQA 2O9PA 3CZJA 1FFQA 4M56A 3APGA 4ZE4A 3VD3A 1UH4A 1KGWA 4MB3A 5A2BA 4PTXA 1OGGA 1H11A 2VVSA 1JYWA 1VF8A 3N18A 1UKTA 4BS0A 4JKLA 2X0HA 1BF2A 4TTGA 1LF1A 4MNKA 2BVYA 2PWDA 3EDKA 4U33A 5D9NA 3EMZA 4J3VA 2C8NA 3NCOA 2ZUUA 4AIUA 3U5YA 1JYNA 1YHTA 3OZOA 1OGBA 2XTKA 3EMQA 2WMKA 3WBAA 1ZBVA 1I1XA 2YIHA 3VIPA 1KQYA 4UFJA 4UOZA 1JF6A 3AJ7A 2CBJA 1JGIA 5KZ6A 1CPUA 2F2HA 4B15A 1FA2A 1J0IA 1CZ1A 1JYVA 2BXYA 3RM8A 3F5KA 3ZR6A 3VIIA 5A2AA 4OJYA 3JUGA 1J01A 1WDQA 1UR0A 1JAKA 1UD4A 1CXKA 4OIFA 1MVYA 1NWRA 1U33A 1JDAA 2XFFA 4GO8A 1FP9A 2NW0A 4D71A 1E40A 4IUGA 1B30A 2EPLX 2WMGA 1PX3A 3PTMA 4AZGA 2BV9A 3CBWA 3T09A 3IJ8A 3M7SA 1E1FA 1ZS2A 1VEOA 2EPOA 2WHKA 4TVCA 1KFWA 4J3WA 4M82A 4HZ8A 1K9EA 2Y2WA 2GDUA 2J7GA 3DHPA 3VD5A 1TE1A 3ARYA 4OBRA 4L4PA 4UOQA 1KGXA 3T2QA 1KQZA 5A95A 2CITA 5HNNA 3QHOA 3ZM8A 1E72M 2CEQA 4W7VA 2NT1A 4XZWA 4DUVA 4K68A 3ZJ6A 1KR0A 5F7UA 5HOSA 1A47A 2C7FA 3B8SA 1GOOA 1J0HA 1Z32X 2W4XA 2WVTA 5JIWA 4Z2JA 4WLCA 1D2KA 4E2OA 4FK9A 2WVVB 1LQ0A 1WAWA 3CZLA 3F5LA 4JL1A 5A6AA 4XV0A 3OGRA 4CD8A 1GCYA 2WAGA 4W93A 1MW1A 4AEEA 2GJRA 5AYBA 1UKSA 1UA3A 5BXSA 2CIPA 4OKDA 5D9MA 4Z2GA 2VQTA 2XVNA 5LA2A 5HPOA 4HOWA 4H41A 3K1DA 4JCMA 1MXDA 3UG4A 3HN3A 1E5JA 2ZOXA 1HL8A 3AQUA 2Y5EA 3GNPA 1VIWA 4H04A 4HPHA 3WNMA 2NSXA 5A6BD 1QNSA 1R85A 1WO2A 4GPNA 1V6UA 3VMPA 1QHOA 3ECQA 1X1NA 1CNVA 2FGLA 5HDRA 4AZIA 1MQRA 2FGZA 1JXJA 1YQ2A 2ZICA 4OOZA 1X6NA 4UFMA 5A1AA 3UCQA 1VRXA 3AOFA 4FLRA 2XGIA 2D0HA 3AFBA 3LPFA 3SCNA 2YJQA 3RMEA 5C71A 3VM5A 2UY5A 4HA3A 4N42A 1UQZA 1S46A 5GNXA 2WHMA 7TAAA 1PEZA 1H1NA 4BQ4A 4GI9A 2G3NA 4LYQA 1LLOA 3BLPX 2VI0A 4MDPA 1BGGA 3PN8A 2JFEX 1ESWA 3CUFA 3OIHA 3WH7A 3O2LA 2GDVA 1XH1A 1BVZA 4J3UA 2XHYA 3AIQA 1SMAA 2XWEA 6A3HA 1TFVA 2CBIA 1JZ3A 1Q6DA 3FW6A 4PMDA 5BXPA 4WJXA 2QV4A 1QI0A 3OBAA 4W5ZA 2X8RA 1OB0A 3W29A 5DF0A 1HJUA 1TVPA 3WUEA 3AI0A 4A3HA 2ZXAA 1AMYA 3WF3A 1J0ZA 4AIEA 2E3ZA 4Z2KA 1ZBCA 3GNOA 3CZEA 1QBBA 1GJWA 2J8GA 3WUFA 3W82A 4PEEA 3U5UA 4CD4A 2WMIB 3WMBA 1TCMA 2D2OA 2X09A 3AZRA 3ALGA 2XVKA 3VILA 1EA9C 2EPMX 3CIVA 2BVDA 3M46A 3FAWA 2NT0A 4LPCA 3NDYA 5CQ1A 1E6QM 5CPTA 1CXLA 5E0CA 4CU6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2OYM A;  1UG6 A;  2RGL A;  1HJQ A;  3VU2 A;  1J9Y A;  1OWQ A;  3RPM A;  3SUS A;  4TTU A;  1P6W A;  1EQC A;  4RE4 A;  1CLV A;  5ABF A;  4P7Q A;  1UR1 A;  1ISX A;  4RE2 A;  4EK7 A;  4MNM A;  1MXG A;  1QNP A;  2XVG A;  4PMO A;  4MNJ A;  3CZ8 A;  3F5J A;  1BGA A;  2ZXB A;  5HPC A;  1JI1 A;  1UQY A;  3WD2 A;  1OIF A;  1B3V A;  2AMG A;  4D6C A;  1QW8 A;  4WSK A;  1DWF M;  2XUC A;  1W2P A;  3WD3 A;  4PMR A;  3AYR A;  1VFF A;  3GM8 A;  5JIP A;  2WXD M;  4EKJ A;  5A6M A;  4JFT A;  1E3Z A;  1GHS A;  3THD A;  1PX4 A;  2YL5 A;  1ZBW A;  1JG9 A;  4QAW A;  3W0K A;  4PMX A;  4J27 A;  2V3E A;  1HXJ A;  3PHA A;  3VD7 A;  5FD0 A;  5ABH A;  4JAW A;  1GQJ A;  2EQD A;  1WZK A;  1ISY A;  4IM4 A;  3OG2 A;  3A4W A;  3B9A A;  4BA0 A;  4ZEP A;  3MAN A;  2WCA A;  2WWC A;  1I75 A;  7A3H A;  1AIW A;  5JBE A;  3VX0 A;  4AZC A;  3RO8 A;  2ZX9 A;  1V6W A;  5I23 A;  3PZV A;  3B9D A;  2EO7 A;  1Q6G A;  3LPG A;  1XYZ A;  2DEP A;  2A3H A;  3CHE A;  5LYR A;  3ZR5 A;  1GJU A;  1WKY A;  2E8Y A;  3ZMR A;  3CMG A;  1CEC A;  4QLJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1UUO A;  1EF3 A;  3RM9 A;  4J2P A;  3FCP A;  1LOQ A;  3UR2 A;  4ZL1 A;  1E1E A;  3N3M A;  2HPI A;  4GXM A;  1FDY A;  3BL3 A;  2ZQU A;  4AIO A;  4F66 A;  5T9B G;  2JEQ A;  1F3E A;  2EPK X;  4UQ9 A;  3L5L A;  1GEQ A;  2ZR5 A;  3VGG A;  4LB3 A;  2C3Z A;  1Z42 A;  3QY7 A;  1SW3 A;  4DZ5 A;  1ZBK A;  4ICM A;  1LP6 A;  3WNO A;  2WLZ A;  2GGE A;  2XG9 A;  1QPO A;  4GIR A;  4O15 A;  1C29 A;  4GHL A;  1L6J A;  2WZT A;  4ITZ A;  3OVG A;  1TZ7 A;  3E5P A;  2XFY A;  3RUB L;  1Z69 A;  3GSM A;  1EDQ A;  1NQK A;  1QDS A;  1RCX B;  4PFH A;  3SCR A;  3B0P A;  3RHG A;  5HW7 A;  1K03 A;  1MZH A;  4IQJ A;  2X42 A;  4F2T A;  4ROP A;  1JCJ A;  1QK0 A;  1BTC A;  2XSX A;  3HV9 A;  3LMY A;  5IFP A;  4HHL A;  1CGT A;  3L4U A;  3GH4 A;  4POD A;  4QNL A;  3PZG A;  4ACZ B;  2C0A A;  4BK9 A;  2NQZ A;  4NZF A;  3GKF A;  4G7E A;  2GVY A;  3WQE A;  1G4T A;  2GVE A;  4KKX A;  3LEP A;  3A6O A;  1QFE A;  4J40 A;  4MKN A;  1NF0 A;  3THQ A;  1UP0 A;  1ZAL A;  1AQH A;  1BXC A;  2XN0 A;  1FKH A;  3EOU A;  4FNR A;  2OKO A;  4XZN X; 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 3INP A;  4FNP A;  1D7F A;  2M2A A;  2YCK X;  3RDK A;  1ZHA A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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