4Z46A

X-ray structure of the bis-platinum lysozyme adduct formed in the reaction between the protein and the two drugs cisplatin and oxaliplatin
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Oxaliplatin vs. cisplatin: competition experiments on their binding to lysozyme.
pubmed doi rcsb
total genus 52
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-04-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4z46A00
1B7MA 1IEEA 1XGTC 1W08A 1YL0X 4HJVA 4QDNA 4RLMA 5KJ9A 5KXXA 5LA5A 4WM5A 4HPIA 1B7NA 3LN2A 4J7VA 4GN4A 1LSZA 4XJGA 1DI5A 4L41A 1BHZA 4OW1A 1WQNA 1GDXA 4QY9A 1HEMA 153LA 2AUBA 1JKDA 2LZ2A 4HSFA 3A93A 2YSSC 1NBYC 4MSTA 1LMPA 3ZVQA 1GXV2 1B5ZA 1WTMA 2IFFY 1LZTA 1LMOA 3LZ2A 4YENA 1IVMA 4ET9A 1KIPC 2EKSC 4NGIA 4TX7A 1IO5A 4R0FA 3M3UA 2ZYCA 1GB5A 4C3WA 4TUNA 1XSFA 1A2YC 1CKDA 3A3QA 2H9KA 4HV1A 5DN5A 4HV2A 1I56A 5APFA 2BQGA 3A91A 1FLUA 2DKVA 3CSRA 1YROA 4GCDA 4NSIA 5KY1A 2F2NA 3WPKA 3WYHA 4NGLA 3CSZA 4EMNA 4OWHA 5LYZA 1VATA 2DQJY 3HBDA 4RW1A 4GCEA 1BB6A 1XGPC 4DD3A 4YEMA 1IR9A 2PC2A 1MELL 4LYZA 1F10A 4ML7A 1IWXA 4PGJB 4DDBA 5B06A 2D4KA 1GE2A 1BWIA 3W6DA 1IOTA 3GXRA 1GBXA 1NWGA 4GLAA 1H6MA 3OJPA 193LA 4XJBA 1BB3A 4WM3A 1NMMA 1LHKA 1DI3A 4MR1A 194LA 1GE0A 4IJ4A 4WOAA 5HNCA 2ZQ4A 4HJZA 5KXPA 1LJJA 2WARA 2LYZA 4UWNA 4M4OA 1GFAA 5KXRA 1G7MC 5DM9A 4YEOA 5IELA 1LZSA 1IC7Y 1GF5A 1LSMA 4H1PA 2BQNA 2ZILA 2YBNA 4XN6A 4WM4A 4PPOA 5DLAA 3A96A 1KXWA 1XGQC 2HEEA 2LHMA 4OWBA 2A7DA 3A90A 2F30A 5E4PA 1IR7A 3J4GA 3A95A 1LZ8A 1IWVA 1HEOA 1UIAA 4WM1A 5FDJA 1GE1A 5A3ZA 4TSBA 5LVIA 3WH1A 1IC4Y 3WUAA 3EMSA 1F6RA 1VAUA 1IY3A 4G49A 1LZ4A 2Z18A 4H8YA 1NBZC 3ZVQB 3AZ4A 4XYYA 2VB1A 1BWHA 3WU8A 4HTNA 2MEAA 4NHIA 5LVJA 1QTKA 4I8SA 1VDTA 4GN5C 3N9CA 4H9CA 3WPJA 1D9UA 1HFZA 3P64A 4CJ2A 1GAZA 3D3DA 1JIYA 1QDTA 5KXMA 2YBIA 1JPOA 3FE0A 1B7OA 4I0CA 2BQFA 1UC0A 3IWRA 2ZIJA 3AGIA 4AGAA 5K7OA 1B5UA 4N1CC 5FELA 5HQ1A 1LZDA 3A67Y 4NHSA 1UBZA 5M1YA 5I4XA 1HSWA 1ZVYB 4Z98A 5IDDA 3TMVA 1RJCB 4C5FA 4WLDA 4CFOA 2BQBA 4PJ2C 1DKKA 1W6ZA 2FBDA 1CJ8A 3WU9A 208LA 4NY5A 1UA6Y 5ILFA 4TWSA 1JUGA 2I26L 4H9HA 5B1FA 1HEQA 5LAGA 9LYZA 5LINA 3AJNA 4XJHA 4LFXA 4RDSA 5FHWA 4OWCA 4BADA 1LZCA 1VEDA 5APDA 3B0IA 4G4CA 1OP9B 4N8ZA 1KIQC 3QNGA 2BQKA 1GF7A 1LMQA 5C6LA 5J7CA 2ZQ3A 5I53A 1YANA 5LAFA 1B2KA 1B7SA 2HUBA 1LZ6A 2CGIA 1UUZC 1G7IC 1F6SA 4NSGA 2EQLA 1LSCA 3WXTA 2LYOA 4H9IA 4DD7A 1CKFA 2W1MA 4NG1A 1PS5A 4WO9A 2BLYA 1YKXX 3T6UA 4HPEA 1LZ5A 2HTXA 1B7PA 5FSTA 3SP3A 2MECA 4H8XA 1FN5A 5EBHA 1JSEA 3ATOA 3AGHA 1HSXA 1IP3A 1LSYA 5L3IA 4OOTA 1C10A 1YAMA 4IASA 1FKQA 1GFKA 4J1AA 3A3RX 3CT1A 3LYTA 1J1OY 1GE4A 2BQMA 1AKIA 4XJIA 4A7DA 2BQJA 1B7LA 1IWYA 2MEEA 1JJ3A 5C6IA 2BQOA 1D0LA 4N5RA 5B07A 1Z55A 1G7HC 1N4FA 2I25L 3EO5A 1GB2A 1OUBA 3TXDA 1TEWA 4DWXA 1LJ4A 1GBYA 1XFPL 5KXWA 1HEWA 3A8ZA 4NG8A 4WM6A 5DN4A 4UWVA 1LSNA 4E3UA 4LT3A 5LA8A 1J1PY 1EQ5A 1HHLA 1LMTA 1J1XY 1REMA 4KXIA 1IOQA 1D6PA 3QE8A 5T3FA 4G4BA 3TXEA 4H93A 2Z39A 1IX0A 1LSGA 1P2CC 2MEDA 1YKZX 1REXA 3HBHA 4NGJA 5LVGA 1INUA 4H8ZA 1WTNA 1LHJA 3N9AA 4ZIXA 1CKCA 5KXNA 1B7QA 4D9ZA 1WQQA 3TXHA 4P2EA 1NDGC 2W1LA 4DDCA 5ILCA 2I6ZA 2W1YA 3KAMA 1C46A 1LKSA 1GXXA 1IWWA 1BB5A 1ZV5L 1GAYA 1MLCE 1REZA 1NDMC 1RFPA 2DQCY 3E3DA 1JKBA 4AXTA 3B0OA 3OK0A 2G4QA 3AYQA 3AB6A 5KXYA 3WL2A 1B5YA 1SQ2L 5FCPA 5D5FA 1LSDA 4NFVA 1GF3A 2BQDA 1KXXA 3BKHA 4QEQA 5LVHA 1JJ0A 5LIOA 4WL6A 7LYZA 1IP2A 2D4JA 4TTDA 3VWOA 8LYZA 4PRUA 1DZBX 1XGRC 4GLVA 1LZ1A 3LZTA 2HECA 3W3EA 1DKJA 4DD1A 1YIKA 5LYTA 2BQHA 1GB9A 2CJLA 2BLXA 5C6JA 1BVXA 3TXFA 1SLYA 4ET8A 2X0AA 1EL1A 1LSFA 1QUTA 4WM2A 2FBBA 2B5ZA 4LT2A 1D6QA 3FI7A 5APCA 4ETEA 1QUSA 1LMCA 1UIBA 4QGZA 1FKVA 4YF2A 3W6AA 5L9JA 1JTPL 1IIZA 1BGIA 1GBZA 1I1ZA 2YBHA 3WVYA 4DYGA 4CGEA 3P4ZA 1IY4A 1EQEA 1GE3A 2Q0MX 2Z19A 3CT0A 4XJFA 2BQAA 1IORA 2MEHA 1DPXA 1FLQA 4GCCA 3ZEKA 1IR8A 4BAPA 1GBSA 4H90A 4II8A 2ZYPA 4LYCA 1OUGA 4H9BA 2MEGA 4LT0A 4O34A 1IP5A 1LZNA 1REYA 1ZVHL 4TSCA 2YBJA 3IJVA 4J0LA 4FDYA 4Z46A 3CT5A 1KIRC 1LZ9A 3MGWA 1GF9A 1V7SA 4U3XB 3TMUA 4HP0A 3ATNA 5DL9A 4WLYA 3RU5A 4B0DA 1YAPA 2DQDY 1LYSA 4ANRA 4LYOA 4WG7A 3AZ6A 1BWJA 1CKHA 1CNSA 1GF4A 1HMLA 5KXTA 3IJUA 1JKAA 1D0KA 4WL7A 2N5ZA 3A94A 1YAOA 4NGZA 4H94A 4GCFA 2DQHY 1OUEA 2YBMA 1OUJA 3RZ4A 2DQAA 2HEDA 5F9XA 5KXSA 6LYTA 1QQYA 4N9RA 4WG1A 154LA 1AT6A 1IP4A 133LA 1VDQA 4GCBA 1JWRA 5F16A 1GB6A 1HMKA 1DXJA 1DI4A 4H92A 3TMXA 1NQIA 1LOZA 4NGOA 5I4WA 1CKGA 1LAAA 1YQVY 3T36A 1T6VL 4WO6A 3G3AB 1JTOL 3CQLA 1GDWA 2Z2FA 1GPQC 1TDYA 1OUFA 1IOSA 1WQRA 1UIGA 4X3BA 2DQGY 1C7PA 1LJEA 4N1EI 1GB7A 1UCOA 1H87A 1QIOA 1JISA 4DT3A 1LPIA 1V7TA 5APEA 3AW6A 1NHEA 2FYCA 1LSAA 5KXZA 1HNLA 5F14A 1GBWA 1UICA 4B1AA 3HBEX 4B49A 2F4GA 3LYZA 2IHLA 1HEPA 1GF0A 2H5ZA 1OUAA 1VDSA 5I5QA 5IHGA 4NEBA 2HEAA 4NHTA 2D4IA 1BB7A 1D0MA 1GFGA 1YKYX 2D6BA 4BAFA 5B1GA 5B59A 3TXIA 2DBTA 4PRQA 4H9AA 4LYMA 3W6CA 1FDLY 1GEZA 5A3EA 4NWEA 2G4PA 1LCNA 3GXKA 5D5CA 4B4EA 1LJHA 4NGKA 1TBYA 2ZWBA 4NGWA 4H9EA 2ZNWY 1JEFA 5LVKA 3A6CY 3P68A 1A4VA 3AW7A 4OOOA 3WPLA 3P66A 4XADA 3WXUA 4LFPA 1GB0A 1GFUA 2BPUA 4J1BA 1I20A 2XBRA 3WMKA 1B7RA 3J6KA 3A92A 3W6FA 4LZTA 4ETCA 2F4AA 3LYMA 1LTMA 1IP6A 1TAYA 1ALCA 1LSEA 5II3A 1WQPA 1IC5Y 1DQJC 1IWUA 3RW8A 1LJKA 2C8PA 1B5VA 2YDGA 2Z12A 1GFTA 1LYZA 3WW5A 2CDSA 4G4HA 1LZRA 1AM7A 1JSFA 2HEFA 1BB4A 4B4IA 1CJ6A 2MEFA 1LKRA 2D91A 1GF8A 1XEJA 5HNLA 5KXLA 2XTHA 4RW2A 2HU1A 1LHMA 3CSQA 4N0JA 3P65A 1LYOA 1C45A 2EPEA 3BKVA 3F6ZA 4LYBA 1HFYA 1GBOA 1UIDA 1LMNA 4LYTA 1YAQA 4NSHA 1LZAA 4NIJA 3LYOA 4ETAA 2C8OA 1C08C 5HLLA 1LZYA 2DQFC 2Z2EA 5B05A 4HTKA 4RLNA 1B5XA 5E9RA 3RNXA 1IWTA 4H9FA 1UIEA 207LA 1UIHA 4DD0A 4WLXA 1GHLA 1RI8B 1CJ7A 4H91A 3B6LA 1LYYA 4DDAA 5LYMA 4KL7A 2BAAA 1RCMA 4R6CA 4NGYA 1LHHA 1PZYA 4BS7A 1EQ4A 1WQOA 3TXKA 4CFPA 1NKHA 1VDPA 2Y8PA 1GFRA 3B72A 4IATA 3WULA 4YM8A 2GV0A 4KPMA 1GFVA 4DD9A 135LA 4NGVA 5AMYA 2CWIA 3G3BB 4OWEA 3RT5X 4B4JA 1LJNA 4Z3MA 1HFXA 1GF6A 4HJYA 1JITA 2Z37A 1JTTL 1GWDA 1LHLA 2W1XA 2BQCA 1VFBC 1HC0A 2Z38A 4KT3A 3A6BY 4G9SA 1WQMA 1LJ3A 5L3HA 1YILA 5F81A 3K3TA 4W96A 5KKIA 1B5WA 2YBLA 4XJDA 5JENB 3WUNA 1E8LA 4OWAA 1LMAA 1WVVA 3TMWA 2DQEY 1C43A 1YL1X 4WMGA 3W6BA 1AZFA 3D9AC 3TXBA 134LA 1OUCA 1XGUC 1QDRA 2LZTA 2H9JA 6LYZA 3QY4A 3EXDA 4XENA 1GFJA 4UWUA 1BVKC 1F0WA 4DC4A 3ULRA 5I4YA 4NHQA 2RSCA 1CJ9A 1G7LC 4ETBA 4EOFA 5KXOA 1BQLY 5HMVA 3TXGA 1NF5A 1JHLA 1IP1A 2XJWA 3LHMA 1GFEA 1OUHA 2BQLA 3M18B 3TXJA 1IP7A 1QTEA 1IWZA 2MEBA 3WVXA 4YOPA 1LZBA 5F9UA 2ZIKA 4MCKA 1G7JC 1XEIA 1TCYA 1O23A 1GB8A 1UACY 1HELA 4GN3A 2A7FA 1ZMYL 4FJRA 1OUIA 4NWHA 2EIZC 3EBAB 2HEBA 1GB3A 1GEVA 1AT5A 2NWDX 2XBSA 132LA 1XEKA 2YVBA 4W94A 1UIFA 1RE2A 4ETDA 5KXKA 4LT1A 2ZNXY 2G4NA 3AZ7A 3AGGG 3HFMY 2LYMA 1B0DA 5I54A 2HU3A 1FLYA 1KXYA 1OUDA 1GFHA 2DQIY 2BQIA 4M6DA 4LGKA 3A34A 4WLTA 5HMJA 1LZGA 1JKCA 2BQEA 4DD2A 1LSPA 3W6EA 4CHXA 1WVUA 5LXWA 4ZFPA 1QSWA 4ZEEA 4NHPA 1T3PA 1IOCA 1FLWA 4PHIA 3WW6A 2MEIA 1HERA 1HENA 1B9OA 2FYDA 4HTQA 3B0KA 5FEKA 4Z41A 1LSBA 1FBIX 1LZEA 3N9EA 1DPWA 1JJ1A 1OQMA 3WUMA 4NSJA 3WU7A 3AZ5A 1LHIA 5KKJA 1GD6A 1LJFA 1QSAA 1HF4A 1LJIA 1LJGA 3CB7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XGTC 4RLMA 5LA5A 4QDNA 4J7VA 1P46A 4GN4A 4XJGA 1BHZA 4QY9A 1HEMA 2AUBA 1C69A 3OE6A 1NBYC 3ZVQA 1WTMA 1B5ZA 1LZTA 1LMOA 1P2RA 1KIPC 3HTFA 1IO5A 3FADA 3M3UA 178LA 1A2YC 1CKDA 4I7MA 2H9KA 4HV1A 198LA 3A91A 3LZMA 185LA 2DKVA 2CUUA 4NGLA 3CSZA 191LA 3SN6R 2PC2A 4ML7A 5B06A 1CV3A 3W6DA 1P5CA 4WM3A 1DI3A 4IJ4A 5KXPA 1CX7A 1GFAA 4M4OA 2ZILA 2YBNA 1QTCA 1L85A 3A96A 1KXWA 4OWBA 1T97A 3J4GA 2RAYX 1HEOA 4ARPA 1GE1A 4TSBA 1L30A 3WUAA 1L75A 3EMSA 140LA 3ZVQB 3AZ4A 4XYYA 4NHIA 3HH6A 1QTKA 3GUJA 4GN5C 3N9CA 3WPJA 1QSQA 4DKLA 4EKSA 1L86A 1B7OA 4I0CA 2BQFA 3A67Y 4NHSA 1C6CA 1RJCB 2BQBA 3HU8A 3DN4A 208LA 1JUGA 242LA 182LA 3AJNA 4OWCA 1L70A 1C65A 4N8ZA 1LMQA 2ZQ3A 1B7SA 1LZ6A 2L78A 1G7IC 113LA 2EQLA 1CUPA 4WO9A 1LGUA 1B7PA 3SP3A 1L16A 4H8XA 1FN5A 1JSEA 3AGHA 115LA 4IASA 1GFKA 1QUOA 3A3RX 3CT1A 1GE4A 1L00A 4A7DA 183LA 5C6IA 4N5RA 1OUBA 246LA 2LC9A 3OE8A 1HEWA 1LSNA 4PJZA 1D6PA 1L50A 3TXEA 1IX0A 1CV5A 1WTNA 3N9AA 3CDOA 4EKPA 3G3VA 2O7AA 3HDFA 1LYJA 1NDGC 1CTWA 2I6ZA 4I7LA 1LKSA 1GXXA 237LA 1MLCE 3E3DA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B7M A;  1IEE A;  1XGT C;  1W08 A;  1YL0 X;  4HJV A;  4QDN A;  4RLM A;  5KJ9 A;  5KXX A;  5LA5 A;  4WM5 A;  4HPI A;  1B7N A;  3LN2 A;  4J7V A;  4GN4 A;  1LSZ A;  4XJG A;  1DI5 A;  4L41 A;  1BHZ A;  4OW1 A;  1WQN A;  1GDX A;  4QY9 A;  1HEM A;  153L A;  2AUB A;  1JKD A;  2LZ2 A;  4HSF A;  3A93 A;  2YSS C;  1NBY C;  4MST A;  1LMP A;  3ZVQ A;  1GXV 2;  1B5Z A;  1WTM A;  2IFF Y;  1LZT A;  1LMO A;  3LZ2 A;  4YEN A;  1IVM A;  4ET9 A;  1KIP C;  2EKS C;  4NGI A;  4TX7 A;  1IO5 A;  4R0F A;  3M3U A;  2ZYC A;  1GB5 A;  4C3W A;  4TUN A;  1XSF A;  1A2Y C;  1CKD A;  3A3Q A;  2H9K A;  4HV1 A;  5DN5 A;  4HV2 A;  1I56 A;  5APF A;  2BQG A;  3A91 A;  1FLU A;  2DKV A;  3CSR A;  1YRO A;  4GCD A;  4NSI A;  5KY1 A;  2F2N A;  3WPK A;  3WYH A;  4NGL A;  3CSZ A;  4EMN A;  4OWH A;  5LYZ A;  1VAT A;  2DQJ Y;  3HBD A;  4RW1 A;  4GCE A;  1BB6 A;  1XGP C;  4DD3 A;  4YEM A;  1IR9 A;  2PC2 A;  1MEL L;  4LYZ A;  1F10 A;  4ML7 A;  1IWX A;  4PGJ B;  4DDB A;  5B06 A;  2D4K A;  1GE2 A;  1BWI A;  3W6D A;  1IOT A;  3GXR A;  1GBX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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