4ZIXA

Structure of hewl using serial femtosecond crystallography of soluble proteins in lipidic cubic phase
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
publication title Serial Femtosecond Crystallography of Soluble Proteins in Lipidic Cubic Phase
doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4zixA00
2ZNXY 1GEZA 1GFRA 3A91A 4L41A 4PRQA 4I8SA 1F0WA 1WQMA 4N5RA 1VDTA 4XJIA 5I54A 1C43A 1IP7A 4C5FA 1IR7A 1JTPL 2LYZA 4GCFA 3FI7A 5APFA 5KXKA 4LYZA 1RJCB 5ILCA 2BLXA 5IHGA 1V7TA 2DQAA 5DN5A 1DXJA 5B07A 1OUIA 2BPUA 3QE8A 4XJDA 3AGHA 3B0OA 1GHLA 4GN4A 4RLMA 4HTQA 1AZFA 1IWWA 1P2CC 2EPEA 4NGOA 1UC0A 2HU1A 1GFEA 4KL7A 1YKXX 3B0KA 4DYGA 2DQIY 1JIYA 4ETCA 1LJ4A 3A3RX 5D5FA 2HTXA 3AW6A 1LZ9A 5C6JA 3WW5A 1LSPA 3B0IA 3ULRA 1HELA 1J1OY 4NSHA 5KXWA 2Z38A 5F81A 1IWXA 1UIHA 1LZDA 1DQJC 1G7MC 4LYMA 3W6EA 3ZVQB 3N9EA 2W1LA 2ZQ4A 1GFGA 1DI4A 2MEHA 1GE1A 2MECA 134LA 1GWDA 4H8XA 4LGKA 5LVGA 2BQMA 1UUZC 1BWHA 4B4JA 4J0LA 2YBLA 4HJZA 5I5QA 4DDBA 1LZNA 4NHQA 4XJFA 2Z39A 1IOQA 2DQDY 4QGZA 4DD1A 4Z98A 1XGUC 1C08C 1HENA 1C46A 1D6QA 1FN5A 4YF2A 5I4WA 3HFMY 3TXHA 1QSWA 4N8ZA 1BGIA 1JJ3A 4I0CA 1FLYA 1OP9B 5I4YA 1W08A 1BHZA 2C8OA 2D4JA 1WQPA 2DQFC 2FYCA 1V7SA 1D0KA 1KXXA 1REYA 4NGLA 4CJ2A 1GF6A 1JJ1A 1I20A 1NWGA 5APEA 1QTKA 1LHJA 1HNLA 1LKRA 1B5XA 1GB6A 1UICA 2BQIA 1LJGA 2BQOA 2YBIA 1B5ZA 3EMSA 4GCEA 2Z18A 5LINA 1VEDA 1BB5A 135LA 4H9IA 1UIDA 3OJPA 1GDXA 4GLAA 2MEGA 1SLYA 1LJIA 1LZSA 1LYYA 4XJGA 1GF3A 4W96A 4H9AA 1CJ8A 2PC2A 4G9SA 4TTDA 1GXXA 1WTMA 2ZIJA 5AMYA 5FELA 4G4HA 3M3UA 4P2EA 4ZIXA 4NG1A 4NHTA 1KIRC 4WL6A 5HMVA 4LFXA 5F9UA 4O34A 4TUNA 2LZ2A 1IP3A 4WG1A 4NGVA 1UIEA 2Q0MX 1UIGA 2YBHA 4Z46A 3WPKA 4YEMA 1E8LA 1LJKA 4DD3A 3N9CA 2ZQ3A 3J6KA 1REXA 3T36A 1JITA 1IP4A 1TAYA 2EIZC 4HJYA 2ZYPA 1IO5A 5LVHA 1KXYA 1LJNA 2ZILA 5HNLA 5EBHA 1GDWA 4GCBA 4YENA 2BQFA 4ZEEA 1GBSA 5LA8A 3A96A 1ZVHL 5L9JA 3B6LA 1GB3A 4H8ZA 3OK0A 4QDNA 4TWSA 3EXDA 4WLXA 4H90A 5L3IA 1REMA 1HEQA 3WMKA 1LZCA 4C3WA 4LYCA 1YAQA 4YEOA 2LZTA 1LJ3A 4OOTA 5IDDA 132LA 5KXTA 4H9FA 1YAMA 5LA5A 4WMGA 5KY1A 1F10A 4G49A 1UIFA 1DKJA 1YAPA 1LCNA 2D4IA 2MEDA 3LN2A 3MGWA 4QEQA 5KXSA 2ZIKA 4ETDA 2I26L 1GFJA 3AYQA 1IC7Y 4OWHA 3RW8A 5FHWA 1LKSA 3TMUA 1VFBC 1XEKA 4CGEA 1HC0A 1NDMC 3AZ6A 1NMMA 1BVKC 1LMAA 3WUAA 1B5WA 4KPMA 1LSYA 1IVMA 1LZ8A 4H94A 2Z37A 3P68A 4NWEA 5KXYA 5KXNA 4WM2A 5F16A 6LYZA 4DD7A 2EKSC 1TEWA 1FLQA 3AW7A 4XENA 4CHXA 1LJEA 1AM7A 1GFKA 1GEVA 3A6CY 1G7JC 4OOOA 4BAPA 5A3ZA 1GB5A 1HMLA 4N1EI 1FLUA 3RNXA 1GF8A 1I56A 1LSMA 2EQLA 2DBTA 2ZYCA 1LSZA 4RW2A 2LYMA 4HV2A 3GXRA 5APCA 1JKBA 1GFHA 3ATOA 1QQYA 3K3TA 4OW1A 4ET8A 1B2KA 1OUBA 1OUCA 1NBZC 4XADA 1LMCA 3FE0A 4HJVA 5JENB 1GFAA 4ANRA 5ILFA 1B7SA 2W1YA 2RSCA 1HF4A 4WM3A 2FBBA 3BKHA 4MSTA 1QDTA 3ZVQA 4DD2A 4DC4A 5A3EA 1B7PA 1GBWA 3LYZA 1OUJA 2AUBA 4J1BA 1IWTA 1LZYA 2A7DA 1LZ5A 4GN3A 2F4AA 1JSEA 1NDGC 4EOFA 1D0MA 1WTNA 5LAGA 1CKHA 1LTMA 2N5ZA 4TX7A 1BVXA 1RI8B 4WM6A 5C6IA 2G4NA 2W1XA 1GFVA 4LT0A 1B7OA 4FDYA 3TXIA 1B5UA 1HFXA 4LT1A 1GFUA 1QIOA 2YBJA 5FSTA 1GB9A 5B59A 3W6CA 208LA 3WUMA 5FCPA 5I4XA 1UACY 1CKGA 1CKFA 1UA6Y 5KXXA 4D9ZA 4ET9A 4TSCA 1HEPA 2ZWBA 1GF7A 1XEJA 2HEBA 1CJ7A 4LT3A 5KJ9A 4H9HA 4X3BA 3TXDA 5HNCA 1GXV2 3CQLA 3IJUA 5B06A 1CKCA 1DKKA 1KIPC 4GCDA 4NGKA 1UIBA 4LYTA 4WL7A 4NHSA 4NGIA 4BAFA 4CFPA 1B7LA 2D4KA 1HMKA 4XJBA 5DL9A 3WU9A 4UWVA 2HEDA 1QUTA 1IP2A 1GB7A 1EQ5A 2XBSA 4QY9A 2YDGA 4HSFA 3A95A 2DQEY 1GBZA 2DQJY 2D91A 3W3EA 1OUAA 1JWRA 4NGZA 4Z41A 5HQ1A 1DPWA 1GFTA 4DD0A 5J7CA 1NKHA 2F30A 1WVVA 2LHMA 4ML7A 1LMPA 2BLYA 2XBRA 2YVBA 5KXLA 1FBIX 4WM4A 1J1PY 1G7HC 1GD6A 1OUGA 2HEAA 2BAAA 3A90A 3CT5A 4E3UA 1W6ZA 3M18B 1HSXA 2G4QA 1LAAA 1IX0A 4FJRA 2HECA 3CSZA 4R6CA 1HSWA 1LZ1A 3LHMA 133LA 5B1GA 5LVKA 4RDSA 1LZRA 1XGRC 1YL1X 3WPLA 2IFFY 4B4IA 1T3PA 2I25L 2MEEA 2HU3A 1KXWA 1GB0A 4WO9A 1IC4Y 2F2NA 3WVYA 3WVXA 1LSAA 4NIJA 1IIZA 1FLWA 1VDPA 5B1FA 3ZEKA 1LHHA 1QDRA 4OWAA 1B5VA 3TMVA 1AKIA 1LMNA 1Z55A 2MEAA 3LYOA 5II3A 3TXKA 2BQNA 4N0JA 4ETBA 4G4CA 3RZ4A 4XYYA 4NFVA 1CJ6A 2DQHY 3A67Y 1CKDA 1WQNA 2FBDA 3CSQA 3G3BB 4WM1A 4PRUA 3W6FA 2MEBA 4R0FA 1ZVYB 3CT0A 4H8YA 2I6ZA 4LZTA 1XGQC 3P64A 4DDAA 2BQAA 3LZ2A 2YBMA 1BB7A 4H91A 4B49A 3AGIA 4HTKA 1B7NA 1JPOA 3WH1A 1JTOL 3TXGA 5LYZA 1LZBA 5LYTA 1PS5A 4N9RA 1LSGA 4MCKA 1IOSA 1DPXA 3WL2A 154LA 1GF4A 1LJFA 2H9KA 1WQQA 4NGYA 3GXKA 4CFOA 1TBYA 1YILA 4WOAA 1H6MA 3WW6A 2H9JA 1INUA 5KKJA 5HMJA 1XGPC 2A7FA 1F6RA 1G7LC 1EQ4A 2HEEA 4H1PA 1NF5A 1GBXA 3W6DA 6LYTA 1I1ZA 4PHIA 1GE3A 1IWYA 4ETAA 4J1AA 1BWJA 4ETEA 2DKVA 4UWUA 3A3QA 1IY3A 3HBHA 3W6BA 5KXRA 1YROA 3AZ7A 1C7PA 1RFPA 1NHEA 5L3HA 1LHKA 4KXIA 1EL1A 1O23A 1YL0X 4NGJA 5D5CA 1IP5A 1IC5Y 2BQKA 4HP0A 4WLTA 1DI3A 1LHLA 3A92A 2NWDX 1WQOA 4NGWA 3WXTA 1JJ0A 4DDCA 1GAYA 4LT2A 1BB4A 3WULA 2HUBA 1DZBX 3A8ZA 1HFZA 1OUHA 2BQDA 1XSFA 5LIOA 1LYZA 1ZMYL 3RU5A 4NSJA 1IORA 1LMQA 5DM9A 2BQJA 4LFPA 1HEOA 1JUGA 4GLVA 5FDJA 4MR1A 5KXZA 5HLLA 5KXPA 3CSRA 2Z2EA 1REZA 2MEIA 4II8A 5KKIA 5I53A 5F14A 1D9UA 5T3FA 3IJVA 3TXFA 4NEBA 4B0DA 3AGGG 2BQHA 1T6VL 1FKQA 1LSFA 3P66A 1HERA 4NSIA 1WVUA 207LA 3A34A 3D9AC 1AT5A 1UIAA 2F4GA 1G7IC 3WU7A 3WU8A 1LOZA 1UCOA 3E3DA 1OUEA 1YIKA 4BS7A 1CJ9A 4EMNA 3KAMA 2BQGA 1BB6A 2CJLA 1JKCA 2LYOA 4HPEA 4GN5C 4U3XB 3IWRA 1NQIA 4YOPA 4NWHA 1A2YC 1GAZA 2C8PA 3TMWA 7LYZA 1LZAA 2BQCA 5F9XA 4M4OA 1B7RA 2IHLA 1IWVA 1QSAA 2BQLA 4G4BA 3D3DA 1LZ6A 4DD9A 5LVIA 2G4PA 3QY4A 1GE2A 1XEIA 4NHIA 4B1AA 2XJWA 2Z12A 3AJNA 1LSDA 1NBYC 4H9CA 5APDA 2Z19A 1IEEA 5LAFA 1YKYX 1IWZA 1N4FA 4NG8A 3SP3A 5IELA 1GE4A 4B4EA 2D6BA 2WARA 1GF5A 5M1YA 1YANA 3CT1A 4HPIA 4NSGA 1QTEA 4IASA 1IR8A 1IP6A 1B5YA 4TSBA 3A6BY 193LA 4RW1A 1LSNA 3A94A 1OUFA 1IOTA 4ZFPA 4N1CC 2Y8PA 5K7OA 1IY4A 1VDSA 1GF9A 1TCYA 2XTHA 3AZ4A 3WPJA 2DQGY 1HFYA 3W6AA 5DLAA 5LYMA 4H93A 4XJHA 4W94A 1XFPL 3J4GA 2YBNA 4GCCA 1F6SA 2GV0A 194LA 1LZGA 4DWXA 1D0LA 4PGJB 1JTTL 3TXEA 3LYTA 5B05A 5E9RA 1A4VA 1LMOA 1B9OA 1LZTA 1UBZA 1ALCA 1H87A 1D6PA 1B7QA 1LSBA 4H9EA 4M6DA 1IWUA 4WLYA 4YM8A 4BADA 1VATA 1VDQA 4IATA 2W1MA 1CNSA 2X0AA 1AT6A 1HEMA 1IOCA 4NY5A 5E4PA 1IR9A 4H9BA 5KXMA 4J7VA 4DT3A 1LPIA 1JKDA 2BQBA 4XN6A 1QUSA 2CDSA 1HEWA 5DN4A 1DI5A 1GE0A 4OWEA 3WXUA 1LSEA 2ZNWY 3LZTA 1JKAA 1HHLA 2YSSC 4AGAA 3ATNA 4PPOA 1FKVA 1RCMA 1YKZX 3T6UA 1OUDA 2CWIA 4A7DA 1JISA 1VAUA 1RE2A 1EQEA 1LHMA 2HEFA 1GBYA 3B72A 1GB8A 4HV1A 1LYSA 3HBEX 9LYZA 3EO5A 1GF0A 3N9AA 3BKVA 1LMTA 5KXOA 5C6LA 1TDYA 1ZV5L 1BB3A 1JHLA 1J1XY 1LHIA 3A93A 4LYOA 4UWNA 3G3AB 4WLDA 1PZYA 4WM5A 1C10A 8LYZA 1XGTC 4WO6A 1GBOA 2B5ZA 4AXTA 5LXWA 2BQEA 2H5ZA 1LZ4A 4OWBA 4LYBA 3HBDA 1LYOA 1MELL 1B0DA 4OWCA 3TXBA 2Z2FA 2MEFA 1FDLY 3WYHA 3RT5X 1B7MA 2DQCY 3EBAB 1BWIA 1JSFA 1GPQC 2FYDA 3F6ZA 1LJHA 3P4ZA 1YAOA 1GB2A 1YQVY 3VWOA 1C45A 4HTNA 4KT3A 4IJ4A 4NHPA 1IP1A 1KIQC 2CGIA 1BQLY 1LJJA 5LVJA 3CB7A 1OQMA 1LSCA 1MLCE 1SQ2L 3P65A 4PJ2C 1JEFA 4H92A 3AB6A 4WG7A 3QNGA 3TMXA 3AZ5A 4Z3MA 3LYMA 4RLNA 3TXJA 5FEKA 153LA 1LZEA 2VB1A 1WQRA 3WUNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GFRA 2RAZX 1L02A 3QAKA 1L55A 1VDTA 5I54A 112LA 3FI7A 2OE4X 5APFA 4LYZA 1T6HA 5DN5A 1DXJA 1C6PA 3QE8A 3GUKA 1L80A 1GHLA 4HTQA 1P2CC 2HU1A 2ANVA 224LA 2DQIY 1LI3A 2Q9DA 1LJ4A 3A3RX 1QTVA 2HTXA 1L83A 209LA 3B0IA 1HELA 4NSHA 5KXWA 5F81A 1DQJC 1DI4A 5LVGA 1UUZC 3L2XA 1L93A 4DDBA 1LZNA 4NHQA 2OE9X 4Z98A 1D6QA 1QSWA 1BGIA 4I0CA 1FLYA 1CU2A 2D4JA 2B74A 2RBRA 1I20A 1QTKA 2YBIA 2Z18A 2LZMA 1L86A 1VEDA 1BB5A 1UIDA 3OJPA 1SLYA 1LYYA 4G9SA 1WTMA 5FELA 126LA 4P2EA 4NHTA 4TUNA 4WG1A 2Q0MX 2YBHA 3N9CA 2ZQ3A 3J6KA 181LA 2EIZC 1IO5A 1KXYA 1LJNA 5EBHA 1GDWA 3B6LA 3OK0A 4TWSA 1PQIA 1LZCA 132LA 4WMGA 231LA 1LCNA 4QEQA 5KXSA 2ZIKA 4ETDA 4OWHA 1BVKC 1B5WA 4KPMA 1IVMA 4H94A 4WM2A 1D3NA 1SX2A 3C81A 4DD7A 6LYZA 2EKSC 3AW7A 4XENA 1LJEA 1L44A 1L38A 1GEVA 1L59A 1HMLA 3G3VA 1LSMA 3HT9A 1L97A 1GFHA 4OW1A 4ET8A 1B2KA 1LPYA 1OUBA 4XADA 5ILFA 2RSCA 4WM3A 4MSTA 3HDFA 5A3EA 1GBWA 1L32A 1L72A 1LZYA 1JSEA 3HH5A 1C6KA 104LA 1NHBA 3F9LA 3OE8A 1DYBA 2G4NA 1G0QA 103LA 4LT0A 4FDYA 1B5UA 1HFXA 1L46A 4DQJA 3W6CA 3V2YA 166LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ZNX Y;  1GEZ A;  1GFR A;  3A91 A;  4L41 A;  4PRQ A;  4I8S A;  1F0W A;  1WQM A;  4N5R A;  1VDT A;  4XJI A;  5I54 A;  1C43 A;  1IP7 A;  4C5F A;  1IR7 A;  1JTP L;  2LYZ A;  4GCF A;  3FI7 A;  5APF A;  5KXK A;  4LYZ A;  1RJC B;  5ILC A;  2BLX A;  5IHG A;  1V7T A;  2DQA A;  5DN5 A;  1DXJ A;  5B07 A;  1OUI A;  2BPU A;  3QE8 A;  4XJD A;  3AGH A;  3B0O A;  1GHL A;  4GN4 A;  4RLM A;  4HTQ A;  1AZF A;  1IWW A;  1P2C C;  2EPE A;  4NGO A;  1UC0 A;  2HU1 A;  1GFE A;  4KL7 A;  1YKX X;  3B0K A;  4DYG A;  2DQI Y;  1JIY A;  4ETC A;  1LJ4 A;  3A3R X;  5D5F A;  2HTX A;  3AW6 A;  1LZ9 A;  5C6J A;  3WW5 A;  1LSP A;  3B0I A;  3ULR A;  1HEL A;  1J1O Y;  4NSH A;  5KXW A;  2Z38 A;  5F81 A;  1IWX A;  1UIH A;  1LZD A;  1DQJ C;  1G7M C;  4LYM A;  3W6E A;  3ZVQ B;  3N9E A;  2W1L A;  2ZQ4 A;  1GFG A;  1DI4 A;  2MEH A;  1GE1 A;  2MEC A;  134L A;  1GWD A;  4H8X A;  4LGK A;  5LVG A;  2BQM A;  1UUZ C;  1BWH A;  4B4J A;  4J0L A;  2YBL A;  4HJZ A;  5I5Q A;  4DDB A;  1LZN A;  4NHQ A;  4XJF A;  2Z39 A;  1IOQ A;  2DQD Y;  4QGZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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