4ZIXA

Structure of hewl using serial femtosecond crystallography of soluble proteins in lipidic cubic phase
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Serial Femtosecond Crystallography of Soluble Proteins in Lipidic Cubic Phase
doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4zixA00
1CJ7A 3WU8A 2MEBA 4WM6A 1AKIA 2DQDY 1B2KA 5KXKA 2DQGY 2MEHA 1NBYC 5DN5A 1VFBC 5C6IA 4WM4A 1C45A 1CJ8A 1SQ2L 3A67Y 4H9BA 4LYTA 3OK0A 4CFPA 1IP1A 2BQIA 4XADA 4NGKA 5E9RA 1FKQA 3TMVA 133LA 1QTEA 2CWIA 2Z39A 1KIQC 1LSZA 4WO9A 1UICA 1JJ0A 3VWOA 3WU9A 3W6DA 1JKDA 1GFKA 3M3UA 1TEWA 2BQBA 4HV2A 1BVXA 1DI3A 2DKVA 3A94A 1XGPC 5KKIA 5LVKA 2N5ZA 1ALCA 1WQMA 4H9FA 5DL9A 4DD7A 4H94A 1UIEA 1GBXA 1CJ9A 5T3FA 4ETCA 2XBRA 1UIHA 1JTPL 1C43A 5HNCA 1B7QA 2Z2FA 2ZNXY 3WL2A 3B6LA 4PPOA 2LYOA 1D0LA 3HBEX 1I56A 1HENA 2EPEA 1RI8B 4PGJB 4NHSA 1LZYA 2A7DA 3A91A 5LVHA 1WQOA 1CNSA 4DWXA 1HELA 2ZQ4A 5ILFA 4LGKA 4H9HA 1RFPA 2Y8PA 4GN3A 2ZWBA 1OQMA 1XGQC 2VB1A 4XJFA 2H5ZA 4NFVA 1GB0A 1JKAA 4B4JA 2DQCY 1LJ3A 1Z55A 3A92A 1P2CC 3W6BA 3LZ2A 4GCBA 4EOFA 4NHPA 4RDSA 4OWHA 4LYBA 1TDYA 1QIOA 1BB7A 4ETBA 1UIGA 1LJGA 4XN6A 1VAUA 4PRQA 1JTOL 1OUGA 4WM3A 5F14A 1IEEA 4CFOA 3SP3A 2HEFA 1I20A 1KXXA 1GFJA 4GCFA 4RW1A 3T36A 4B1AA 1TCYA 1IWTA 1IP4A 1BB4A 1REYA 4G9SA 2BQJA 1QTKA 4MCKA 154LA 2Z37A 4HJZA 1QQYA 1QSWA 1WVUA 5II3A 1NHEA 207LA 2BLXA 3RW8A 3WMKA 5APFA 4II8A 4H93A 1GF9A 1JISA 2G4QA 1REXA 5KXYA 2BQFA 4IASA 4ET8A 1IOCA 5KXSA 2I25L 5FDJA 1LJHA 3WPLA 4DDAA 1LSFA 1GFGA 2MEAA 3WPKA 1VEDA 2DQAA 3W6CA 2Q0MX 1YAMA 1GAZA 4NSIA 5LYMA 2F2NA 1IWWA 1LPIA 3EMSA 4ZFPA 1H87A 2IHLA 134LA 4H9CA 1IORA 1XEJA 4ZEEA 5KXOA 4Z3MA 3AGIA 6LYTA 1LZ5A 1EQ4A 1LSGA 2HUBA 1GDWA 4GN5C 4YEMA 5L3IA 1B7OA 1LJEA 4H8YA 2C8PA 4LYCA 4RLMA 4N1CC 3RNXA 1JITA 1LMNA 1DPWA 2AUBA 2FBBA 4ML7A 1QDTA 1XSFA 3B0IA 1JIYA 5IELA 4BADA 1LZNA 3AB6A 1ZMYL 1HEQA 4H90A 1GD6A 3A8ZA 3ULRA 2F4GA 4GLVA 5DN4A 3RZ4A 2XJWA 2BQAA 1A2YC 4HSFA 1B5UA 1YKYX 2YVBA 1NMMA 3AZ5A 2EIZC 1GF0A 4H9AA 4HTKA 4NSGA 4OOOA 1C10A 1LZ1A 5LVGA 4GCCA 3LYTA 4KT3A 2D4JA 3A6CY 5D5FA 4XJDA 1C7PA 1LZTA 4TX7A 3TXIA 4HJYA 2MEFA 2DQEY 1LJ4A 1LSMA 3ZVQA 1XGUC 4M4OA 2I26L 5K7OA 3TXKA 1EQ5A 9LYZA 1EL1A 3LZTA 1IC7Y 3A95A 4OWEA 1INUA 1AT5A 1LJNA 2DQHY 1HEWA 2WARA 193LA 4O34A 5FSTA 1HF4A 208LA 4FDYA 1RE2A 3ZVQB 2EKSC 4H9EA 1IP3A 6LYZA 3WUAA 2A7FA 4OWBA 4C5FA 5M1YA 5I4XA 2BQKA 5AMYA 3AGGG 2YBIA 1B5XA 2PC2A 3RT5X 4QY9A 1UBZA 1FLYA 5B1GA 1OUAA 1GEZA 4LFPA 1ZVYB 2IFFY 3WH1A 2BQCA 2MEGA 3TXBA 2BQLA 5I4WA 2D91A 2GV0A 2YBMA 1LSCA 4RW2A 1QUSA 5D5CA 4NGVA 5LA5A 1J1XY 2EQLA 4H91A 4HTQA 4G4CA 1IWYA 1D6PA 1JKCA 1YL0X 3TXHA 5HQ1A 1IWXA 1T3PA 4NHIA 1B7RA 4NY5A 3WXUA 4NWEA 1LSEA 3LN2A 4FJRA 1DKKA 1CKFA 1LJFA 1G7JC 1LMPA 3WW6A 1LSPA 1LMAA 3CT0A 4WOAA 1NKHA 3TMUA 3FE0A 3N9AA 1REZA 3CB7A 1FKVA 4B49A 2ZIJA 2HEEA 1W08A 1GB5A 4R0FA 1D6QA 1LHJA 5KXWA 1CKGA 1GF7A 1DI5A 4YF2A 4LZTA 5LIOA 1DPXA 1OUEA 1HHLA 3TXDA 2BQEA 2BQDA 1KXWA 3P4ZA 2H9JA 5APCA 1GB9A 1GE1A 5F16A 4DD0A 4N5RA 1VDQA 1LYYA 4NGLA 1RJCB 1HERA 1WQPA 2W1XA 4LT3A 3ATOA 1BVKC 1JJ1A 1CKHA 1VATA 1WVVA 4N9RA 4NGJA 4ET9A 1XGTC 5C6LA 2BAAA 1NDGC 4PRUA 5C6JA 3AJNA 5I53A 4OW1A 1JPOA 4NHTA 1D0MA 4TUNA 1BWIA 4OOTA 3E3DA 4TTDA 3CSQA 4WLDA 4J1AA 2BQGA 1T6VL 4I8SA 4L41A 1OUIA 4WG7A 4YEOA 1DZBX 4ETAA 5FEKA 1XFPL 4OWCA 1LOZA 1LZAA 4UWVA 2LZ2A 3T6UA 3TXEA 4B0DA 1LHMA 3AZ4A 1HFZA 1GFRA 1B7NA 3CSZA 1B0DA 5KXNA 4M6DA 5L9JA 4WLXA 4J1BA 1LZBA 4H9IA 2ZYPA 4H1PA 4NHQA 5FCPA 4Z41A 1HMKA 5KXMA 4E3UA 1FLQA 2RSCA 4XJGA 1LJKA 1N4FA 4NSJA 1XEIA 4D9ZA 2BLYA 3AW7A 1EQEA 1UC0A 4WL7A 4ETEA 2FYCA 2DQIY 3TMWA 5B1FA 3WVYA 2BQOA 4LT2A 1VDPA 1D9UA 4NG8A 3A6BY 2HU1A 3FI7A 1J1PY 153LA 1IC4Y 1IP6A 5J7CA 1MLCE 5LAFA 4A7DA 5KKJA 3K3TA 1UA6Y 1LMQA 1IX0A 1HEPA 2B5ZA 1HEOA 1IC5Y 4G49A 4Z98A 1KIPC 5FHWA 5F9XA 3AW6A 1O23A 1HC0A 1AM7A 1ZVHL 2YDGA 4R6CA 1GFAA 1GXV2 5L3HA 3WUMA 1FLUA 1FLWA 1BWJA 1OP9B 4DD9A 1B5WA 1GFTA 2HECA 1NDMC 3CT5A 1GF5A 3P64A 3A3QA 1IOTA 2D6BA 4IATA 4PJ2C 1J1OY 4YM8A 1NQIA 3EXDA 4QDNA 4GCDA 4BAFA 5B05A 5B06A 2YSSC 4HPEA 1GE4A 1B7LA 1C46A 3G3AB 1G7IC 4NGIA 1GFVA 1IR9A 1AT6A 1IP5A 4DD3A 1H6MA 2CJLA 2W1MA 4CHXA 1QDRA 4G4HA 2NWDX 1C08C 1B5VA 5KJ9A 2FBDA 2ZILA 7LYZA 3A90A 5I5QA 5KXTA 5APDA 3B0OA 3W3EA 5I4YA 2BPUA 3BKVA 5I54A 1YKXX 1GF8A 5HNLA 4UWNA 2DQFC 1IIZA 4DD2A 1JEFA 3ZEKA 1LZDA 1YIKA 1VDSA 3WUNA 1LSDA 2BQHA 1HFXA 2YBLA 2F30A 3QY4A 3J6KA 4PHIA 1GE2A 3D9AC 1GEVA 5KXRA 4KPMA 1QSAA 3P68A 4G4BA 5HLLA 1YAQA 5A3EA 194LA 4GLAA 3G3BB 1JKBA 3KAMA 1HSWA 3W6EA 1UIBA 1D0KA 3A34A 3M18B 2LHMA 4P2EA 1PS5A 2YBNA 4NIJA 2ZYCA 3EO5A 5F81A 3CSRA 1GB7A 1GBOA 4HP0A 1IP7A 3N9CA 4NGZA 4UWUA 4W96A 5LA8A 1OUFA 1FN5A 1B5YA 4WL6A 1GDXA 4HTNA 1G7LC 1LJJA 5APEA 5KXLA 4BAPA 1LAAA 3A93A 4CGEA 1OUHA 1UCOA 4U3XB 4J0LA 5JENB 1F6RA 2DBTA 1HSXA 1BB6A 1SLYA 3TXGA 1LHLA 4ETDA 1LMCA 2W1YA 2Z2EA 3B0KA 2C8OA 3AYQA 1DQJC 1GFHA 1LZ4A 1B7MA 1LYZA 1IY4A 3LYOA 1IO5A 1IWZA 1LMOA 2HU3A 3OJPA 1GF4A 1WQQA 1GAYA 1IY3A 1LHKA 1PZYA 2XBSA 1JSFA 2G4NA 4OWAA 1GHLA 4WMGA 4LYOA 1XGRC 1IR8A 1B9OA 1LHIA 4YOPA 1GBWA 3CT1A 3BKHA 4XJIA 1B7PA 3LYZA 1IWUA 4W94A 5LYZA 5ILCA 5KXZA 3HFMY 3GXRA 2F4AA 5IDDA 1WQRA 4LYMA 4WM2A 4TSCA 4KL7A 4XENA 5LXWA 3W6FA 1BB5A 1FDLY 3MGWA 1LYSA 4ANRA 1FBIX 1TBYA 1IWVA 5KY1A 4XYYA 5HMJA 1NF5A 1W6ZA 4GN4A 2MEIA 2ZQ3A 5F9UA 2XTHA 4DDBA 5B59A 4N8ZA 1OUDA 3W6AA 3RU5A 2MEEA 4NGOA 1IOSA 2BQNA 4X3BA 1LSBA 3P65A 1GE0A 2D4KA 1GB2A 1LZRA 1BWHA 1LZCA 1UIDA 2HEBA 2W1LA 4NG1A 1B7SA 3GXKA 4HPIA 1QUTA 5FELA 1LTMA 2HEDA 1YANA 2LYZA 1OUJA 3F6ZA 2Z12A 1HMLA 1GF3A 5EBHA 1HEMA 4HJVA 5LVIA 1JHLA 2ZIKA 1IVMA 2HEAA 2YBHA 1HNLA 5LAGA 2LZTA 4NGYA 3CQLA 1WQNA 5IHGA 4QEQA 1REMA 1IOQA 1UIFA 1NBZC 3LHMA 2CGIA 4HV1A 1UUZC 1LSNA 2ZNWY 4DDCA 1MELL 4Z46A 1LZ6A 2YBJA 3IJUA 1KIRC 3WVXA 1OUBA 4TWSA 1GWDA 4H8XA 3QNGA 3WPJA 2G4PA 2CDSA 3HBDA 1GBZA 3EBAB 4NEBA 3A96A 3HBHA 3WYHA 4TSBA 3TXJA 1GPQC 5DM9A 1UACY 4H92A 8LYZA 4AXTA 4ZIXA 1LYOA 4H8ZA 1YILA 1GB8A 1B5ZA 3IWRA 1WTMA 1KXYA 5HMVA 1HFYA 1DI4A 1LZSA 1YAOA 1LSAA 3AZ6A 4WLTA 5E4PA 3WXTA 4LT1A 3WULA 4WM1A 1LJIA 1DXJA 1YAPA 2FYDA 2Z19A 1YL1X 3ATNA 4WG1A 2DQJY 4MSTA 4N1EI 1GFEA 4XJBA 1LSYA 4IJ4A 2HTXA 1CJ6A 1GBYA 1WTNA 1JSEA 4GCEA 4J7VA 3A3RX 4B4EA 5LVJA 135LA 1IP2A 4BS7A 1F6SA 3P66A 1LMTA 5LYTA 3AGHA 1GE3A 4MR1A 2D4IA 3B72A 1JWRA 1JUGA 4LYZA 1GFUA 3WU7A 4DC4A 1NWGA 1LHHA 5DLAA 1V7SA 1GF6A 1F0WA 4N0JA 1LZGA 1CKCA 1RCMA 2LYMA 3QE8A 1XEKA 2BQMA 1TAYA 2X0AA 2MECA 2Z38A 1JTTL 3TMXA 1A4VA 1LCNA 1LZ9A 3WW5A 4DD1A 1YKZX 4NSHA 4WLYA 1GB3A 1UIAA 5LINA 4NGWA 5A3ZA 3AZ7A 2Z18A 1CKDA 2I6ZA 1GB6A 4RLNA 1OUCA 1I1ZA 1BQLY 4CJ2A 4WM5A 4C3WA 3D3DA 1GBSA 4EMNA 1IR7A 1GXXA 1F10A 1YQVY 3J4GA 4DYGA 3LYMA 1G7HC 1LKSA 4B4IA 1JJ3A 1AZFA 1YROA 3TXFA 1LZ8A 1LKRA 1VDTA 1DKJA 1E8LA 3IJVA 4I0CA 4NWHA 4QGZA 1LZEA 3N9EA 4AGAA 4KXIA 4DT3A 1BB3A 4LT0A 132LA 2MEDA 1ZV5L 5KXPA 2H9KA 1BGIA 5KXXA 1BHZA 4LFXA 4YENA 5B07A 1G7MC 4XJHA 1V7TA 4WO6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KNIA 2DQDY 1L04A 2DQGY 3DN2A 141LA 5DN5A 1VFBC 1PQOA 1C45A 2B70A 4NGKA 5E9RA 1FKQA 3HU8A 1QTEA 2CWIA 3TMVA 1L40A 2HUKA 3C81A 3GUOA 107LA 2BQBA 1P37A 5LVKA 1ALCA 5DL9A 1SWYA 1GBXA 5T3FA 3FA0A 3B6LA 1HENA 244LA 3A91A 1SSWA 2ZQ4A 2RBPA 4GN3A 1OQMA 1XGQC 2VB1A 171LA 2H5ZA 1GB0A 1LJ3A 1Z55A 3A92A 4GCBA 111LA 4RDSA 1L94A 1L80A 4LYBA 1BB7A 4ETBA 1DYDA 1UIGA 4XN6A 1VAUA 5F14A 1IEEA 4CFOA 165LA 2HEFA 2RB1X 3HT6A 1GFJA 4W58A 1TCYA 4I7MA 4MCKA 4ARMA 2OTYX 1QQYA 1WVUA 5II3A 1NHEA 166LA 1L59A 1JISA 4IASA 1IOCA 4ARMB 4NSIA 4EKRA 5LYMA 3C80A 1IWWA 1T6HA 1CU3A 129LA 5KXOA 1EQ4A 2HUBA 4EPIA 5L3IA 251LA 260LA 4RLMA 4N1CC 1DPWA 4I7SA 191LA 4PK0A 3A8ZA 3NYAA 3RZ4A 2XJWA 4OOOA 1LZ1A 4KT3A 1DYEA 5D5FA 1LZTA 2DQEY 1LJ4A 3HH4A 189LA 2I26L 3TXKA 9LYZA 1IC7Y 3ODUA 1INUA 4O34A 1KS3A 2WARA 1CV4A 1D2YA 4FDYA 1IP3A 3AGGG 2YBIA 3HUQA 199LA 3HDEA 1KY1A 2GV0A 2EQLA 3TXHA 253LA 1YL0X 3WXUA 1LSEA 4FJRA 1LMAA 3CT0A 4WOAA 1C6LA 1FKVA 4B49A 122LA 1GB5A 4W53A 3HUAA 1GF7A 1HHLA 3TXDA 2H9JA 5F16A 1GE1A 1L54A 4NGLA 167LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CJ7 A;  3WU8 A;  2MEB A;  4WM6 A;  1AKI A;  2DQD Y;  1B2K A;  5KXK A;  2DQG Y;  2MEH A;  1NBY C;  5DN5 A;  1VFB C;  5C6I A;  4WM4 A;  1C45 A;  1CJ8 A;  1SQ2 L;  3A67 Y;  4H9B A;  4LYT A;  3OK0 A;  4CFP A;  1IP1 A;  2BQI A;  4XAD A;  4NGK A;  5E9R A;  1FKQ A;  3TMV A;  133L A;  1QTE A;  2CWI A;  2Z39 A;  1KIQ C;  1LSZ A;  4WO9 A;  1UIC A;  1JJ0 A;  3VWO A;  3WU9 A;  3W6D A;  1JKD A;  1GFK A;  3M3U A;  1TEW A;  2BQB A;  4HV2 A;  1BVX A;  1DI3 A;  2DKV A;  3A94 A;  1XGP C;  5KKI A;  5LVK A;  2N5Z A;  1ALC A;  1WQM A;  4H9F A;  5DL9 A;  4DD7 A;  4H94 A;  1UIE A;  1GBX A;  1CJ9 A;  5T3F A;  4ETC A;  2XBR A;  1UIH A;  1JTP L;  1C43 A;  5HNC A;  1B7Q A;  2Z2F A;  2ZNX Y;  3WL2 A;  3B6L A;  4PPO A;  2LYO A;  1D0L A;  3HBE X;  1I56 A;  1HEN A;  2EPE A;  1RI8 B;  4PGJ B;  4NHS A;  1LZY A;  2A7D A;  3A91 A;  5LVH A;  1WQO A;  1CNS A;  4DWX A;  1HEL A;  2ZQ4 A;  5ILF A;  4LGK A;  4H9H A;  1RFP A;  2Y8P A;  4GN3 A;  2ZWB A;  1OQM A;  1XGQ C;  2VB1 A;  4XJF A;  2H5Z A;  4NFV A;  1GB0 A;  1JKA A;  4B4J A; 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 1NF5 A;  1W6Z A;  4GN4 A;  2MEI A;  2ZQ3 A;  5F9U A;  2XTH A;  4DDB A;  5B59 A;  4N8Z A;  1OUD A;  3W6A A;  3RU5 A;  2MEE A;  4NGO A;  1IOS A;  2BQN A;  4X3B A;  1LSB A;  3P65 A;  1GE0 A;  2D4K A;  1GB2 A;  1LZR A;  1BWH A;  1LZC A;  1UID A;  2HEB A;  2W1L A;  4NG1 A;  1B7S A;  3GXK A;  4HPI A;  1QUT A;  5FEL A;  1LTM A;  2HED A;  1YAN A;  2LYZ A;  1OUJ A;  3F6Z A;  2Z12 A;  1HML A;  1GF3 A;  5EBH A;  1HEM A;  4HJV A;  5LVI A;  1JHL A;  2ZIK A;  1IVM A;  2HEA A;  2YBH A;  1HNL A;  5LAG A;  2LZT A;  4NGY A;  3CQL A;  1WQN A;  5IHG A;  4QEQ A;  1REM A;  1IOQ A;  1UIF A;  1NBZ C;  3LHM A;  2CGI A;  4HV1 A;  1UUZ C;  1LSN A;  2ZNW Y;  4DDC A;  1MEL L;  4Z46 A;  1LZ6 A;  2YBJ A;  3IJU A;  1KIR C;  3WVX A;  1OUB A;  4TWS A;  1GWD A;  4H8X A;  3QNG A;  3WPJ A;  2G4P A;  2CDS A;  3HBD A;  1GBZ A;  3EBA B;  4NEB A;  3A96 A;  3HBH A;  3WYH A;  4TSB A;  3TXJ A;  1GPQ C;  5DM9 A;  1UAC Y;  4H92 A;  8LYZ A;  4AXT A;  4ZIX A;  1LYO A;  4H8Z A;  1YIL A;  1GB8 A;  1B5Z A;  3IWR A;  1WTM A;  1KXY A;  5HMV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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