4ZL7A

Crystal structure of pseudomonas aeruginosa dsba e82i: crystal i
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
b'DYTAGKEYVELSSPVPVSQPGKIEVVELFWYGCPHCYAFEPTIVPWSEKLPADVHFVRLPALFGGIWNVHGQMFLTLISMGVEHDVHNAVFEAIHKEHKKLATPEEMADFLAGKGVDKEKFLSTYNSFAIKGQMEKAKKLAMAYQVTGVPTMVVNGKYRFDIGSAGGPEETLKLADYLIEKERAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Sent packing: protein engineering generates a new crystal form of Pseudomonas aeruginosa DsbA1 with increased catalytic surface accessibility.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Oxidoreductase
total genus 63
structure length 185
sequence length 185
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4zl7A00
1W89A 4KX4A 2GLRA 3H4KA 2CQ9A 1DE1A 3UL3A 2B3SA 4L0UA 14GSA 1U87A 5HQPA 4EXJA 5ECNB 3H8QA 3EU4A 4RQXA 1A23A 5AISA 4FH8A 2GSRA 5IPHA 5ELGA 1MEKA 4G19A 1ZYQB 2XPEA 4PNGA 1IYHA 2L57A 3ERWA 5IO0A 3CRTA 2OADA 3IE3A 4GSNA 4RI6A 4O5RA 2MMZA 3IK9A 2H72A 1Z5YE 4F0BA 5EVOA 1QMVA 1ZZYA 4I97A 2A2SA 1FW1A 1B8XA 3F4TA 1K0MA 1YQ1A 2FA8A 4ID0A 4TKYA 2GVPA 3DVWA 1YKAA 3LQ7A 2N5BA 1USBA 3EE2A 1NSWA 2HLSA 1VF1A 5DVBA 3QOUA 3LG6A 2BMXA 2DJ2A 2V2GA 5J9CA 3FEUA 3ERGA 3D4MA 2ON7A 2YN1A 1XWAA 5IMCA 1TI1A 1AUCA 4HZ2A 3HY2A 5LCZA 4QQ7A 2C3NA 3HJMA 3GHAA 3TRPA 3Q19A 1S3CA 2V32A 3KMOA 3ED3A 3ZIJA 2E2GA 3HCZA 1N2AA 4XS1A 1QFNA 2HNLA 3TCOA 2FWHA 3FR3A 4V2NA 3QAGA 4MZWA 4N0ZA 3GA4A 2DJ0A 4OFNA 1XW6A 3DWVA 1TXXA 4XHMA 1GNWA 2VLTA 4L5OA 1V2AA 1U6TA 2HFDA 2ZNMA 4QL9A 2IMFA 2YCDA 4MPFA 2X8GA 2MMNA 3EVIA 4EF0A 4Q5RA 3IOSA 1SYRA 2GGTA 2MYGA 1I9DA 4E8HA 1O8WA 2JZTA 2WS2A 5CNWA 2HRNA 1GWCA 2WCIA 4N10A 6GSWA 4P3YB 2VCQA 4ECIA 5H5SA 5LNKe 5F0GA 1TI3A 4K7NA 5CRWA 1AIUA 3GTUA 3KH9A 4TXOB 1J0FA 1EGOA 5ECSA 3LJRA 4EKZA 1TRSA 2BJXA 3GMFA 3EMXA 3F3RA 5DQYA 1URMA 2OE0A 4TR1B 3HD5A 1PGTA 4X1UA 2FNOA 2OA7A 3N9JA 4ZL8A 3M3MA 13GSA 4DSSB 5JWQB 3Q74A 4V2MA 4LA1A 4GCIA 2H70A 5ECPB 2IMEA 4I5QA 3J7Yk 2VAFA 3QAWA 3QD9A 4ECCA 1BX9A 4LL4B 4MP4A 3S9FA 3UBLA 3I9V2 1RQMA 4TR3A 4HU7A 5ECIB 2LQQA 3D0ZA 3U5RE 2H01A 2GT5A 4I2UA 4MMMA 1MD4A 3W6GA 2F9SA 3EINA 3TKQA 1SD8A 4J2FA 1KEBA 3KJYA 1FVKA 1WWJA 1V40A 3CSJA 3BD2A 5IPGA 3VI5A 3FY7A 4Z7XA 1PMTA 3UOMA 4V1Ap 2WULA 4WXTA 1XVWA 4PQIA 4ZB9A 1J08A 4F9ZA 1K3YA 1SKRB 1LU4A 4N0VA 1J9BA 5FWGA 3ZMLA 2JADA 3G9BA 3UVHA 2PPTA 4MF5A 4D73B 1TU8A 1XPVA 5G31A 3I69A 2K8VA 3UARA 1OVNA 1M9AA 5IMDA 3W8SA 1ABAA 5F07A 1ACVA 1O73A 4HQSA 2KOKA 4FYUA 3JCML 4EC0A 3Q6OA 4LMVA 4Q5QA 4WR5A 3CTFA 2OE3A 2XBIA 2CZ2A 3HZ4A 1TOFA 3NIVA 3DVXA 3ZL5A 1PKZA 1QK8A 2PBJA 5CAXA 4XIHA 3QPMA 5ECRB 2Z9SA 1F3AA 4KSMA 1GTUA 1M2BA 3DXBA 1M2DA 2HSYA 1X5EA 2C0GA 3APSA 1YF0A 1YDKA 2V6OA 1PX7A 1FB0A 2LNSA 1NM3A 2WGRA 5IQYA 4TR4A 3WGXA 2LKUA 5IMAA 3W8JA 3O6TA 4MABA 1RK4A 1YZXA 1G7EA 1GULA 3ERFA 2VUPA 2FWGA 4HZ4A 3FZAA 4IKHA 4POKA 2KP2A 3EURA 2RM5A 2KHPA 1V57A 1SL1B 1YF1A 5G1KA 2C8UA 2NDOA 1G6YA 2E0QA 4ECBA 1I5GA 4ZXGA 2XBQA 4POBA 3A2VA 1XBSA 4ACSA 2WJUA 1N8JA 1ON4A 1G0TA 4PX1A 2H73A 2YZHA 3P7XA 5JCWA 4JU5A 4ZILA 2OE1A 4IN0A 4G10A 5CRDA 3TB2A 6GSVA 4NWYA 2I81A 4MDCA 2O8VB 3PINA 3APQA 5JWRB 1MDIA 1R5AA 3KP8A 2NBSA 2GDRA 4BWSA 3HZ8A 5HFKA 1Z7RA 4YQUA 2XC2A 5IO2A 2MBTA 1EEMA 5CRGA 3ZREA 1EV9A 4WKWA 3KXOA 3L4NA 1VRSD 4X43A 2VCWA 3GUSA 3GH6A 1A8LA 2O7KA 1R26A 1SJIA 1Z6NA 4K1FA 3RBTA 1THOA 5DALB 5IMZA 3LEFA 1CQHA 4AJ8A 1O6JA 1VF4A 2HZEA 4GQCA 4IP6A 2LJAA 1B9XC 2GT6A 1ZMAA 1NW2A 2C4JA 4J57E 3MDKA 18GSA 4ILFA 2H75A 3F0IA 2C3TA 1OKDA 2VL2A 4V1Ag 2P0GA 3LSZA 4JR6A 2WRTA 1HQOA 2EIRA 4IVFA 4MCUA 5G1LA 5G5FA 5B7CA 5HR1A 2LRCA 4IHUA 3ZYWA 4TVEA 4ULXA 1XVQA 3HVXA 6GSUA 2VD1A 1X5DA 3FW2A 1PX6A 3R2QA 1R4WA 3KMNA 2AUVA 2ES7A 1GSUA 3HVVA 1M2AA 1JZDA 5LD0A 4HJMA 3F3QA 1PRXA 1T3BA 2J9HA 5CP1A 3F4SA 1AW9A 4ZL7A 1SL2B 2IFQA 5CO3A 4F03A 3DMLA 4WF5A 2NPBA 4MLYA 4IP1A 2GS3A 1T4ZA 2VCXA 20GSA 4JZQA 3DKSA 3L9VA 1S3AA 4QL7A 3GX8A 6GSXA 4MJCA 3FYGA 2JZRA 1SJZA 2LTKA 2K9FA 5AGYA 4HU9A 4PUFC 3KEBA 4EDYA 3LWAA 1F2EA 1B4QA 5IMVA 3ZVJD 3TKSE 3ZFBA 3QFAC 3KZQA 1SKWB 3QDNA 3VK9A 1SENA 2ON5A 1JLWA 2JZSA 3GL5A 1TDIA 4YQMA 2LNTA 2WDUA 4I6XA 4O92A 3LORA 3C73A 1NHYA 4DSRA 5AIVA 1JZWA 5E59A 4MH3A 2B1LA 1X0RA 5JWOB 1PL2A 3M9KA 2DJJA 1SU9A 1XXUA 2ZCTA 2YV7A 2GZPA 2LSTA 3ME8A 4WR4A 4ML1A 3VPQA 1BQ7A 4WBRD 2LJKA 1PQNA 2B5XA 1MDJA 3PR8A 6GSTA 5F8BA 2GQLA 2KP1A 2QGVA 2H6XA 1JHBA 2HYXA 2F8FA 3VLNA 2VL2C 2AHEA 4ML6A 1EZKA 2AYTA 2YNXA 3HJOA 4NMUA 3QCPA 3RAZA 2EC4A 1FB6A 3MWHA 2CT6A 2JL4A 1Z7PA 2H30A 1A2JA 1ZGNA 10GSA 4JRRA 4NV5A 3BCIA 3M8NA 2OKAA 3J7Yb 5AIXA 3DIEA 2P5QA 2RLIA 1OKTA 4FYCA 1GSYA 2HRFA 2OJLA 3TJJA 1BJXA 2TIRA 4XRAA 1TKDB 2YZUA 5F06A 1X9MB 3GNJA 3LFLA 3TRXA 3A5WA 1SK1A 3WGEA 4EDZA 4WF4A 1YEPA 2G0FA 3H79A 2M80A 5KN3A 4AJ6A 3FZ9A 3CBUA 4KDYA 5G2ZA 2TRXA 4MF7A 2H1AA 1K3OA 2H0GA 4MZCA 3HJPA 1ZYEA 2CVDA 4GQFA 3GKKA 4DSQA 3O3TA 2PVOC 1Y25A 5HR2A 2AV4A 2LRNA 5INYA 3RPPA 1M0UA 1OC9B 5ABRA 4ZBAA 1WE0A 3LXTA 5IOXA 5A4WA 2H19A 5ID2B 2GSQA 1THXA 5EY6A 5D93A 3I6AA 2IMIA 2G2QA 3IC4A 4F0CA 1MD3A 2VOCA 1GTBA 1KBNA 4HEA2 4AF2A 3PGTA 2L6CA 1W4VA 1A2LA 1XW5A 2XPDA 5JCGA 2VM1A 2H6YA 2GSTA 1A2MA 2YJHA 1YJ6A 2HE3A 3TGZA 3HKRA 2H1DA 1XIYA 2CVBA 3F6DA 3IK7A 3RPNA 5J5NA 4V2LA 1O85A 3DGQA 1ST9A 2DMLA 2PGTA 4N30A 1DE2A 4YAVA 2QSIA 2VL3A 4TXOA 5A5KA 5L71A 2CZ3A 3ZTLA 5G30A 3FK8A 1TRWA 1GUHA 5FHIA 3WGDA 4MK3A 3M9JA 4YAPA 4CW9A 1XWCA 1YKCA 4O32A 1GSSA 2YP6A 3KGKA 4TR1A 1E2YA 3EWLA 4OCEA 5F05A 1F6MC 3KP9A 2TRCP 2K6VA 1K0DA 4X0XA 2JACA 5DAKB 4CHSA 4OO4A 2VCZA 2K18A 4MA9A 4DSSA 1QQ2A 2R6KA 1AAZA 2FWFA 1FO5A 5G5EA 3VURA 3CSHA 2X99A 4KGIA 2B7JA 4K7IA 5ELAA 3TKSA 1PD21 1GL8A 2WZ9A 4IJ3A 4POLA 5DJMA 2PU9C 5IOWA 2H8LA 2WFCA 1K0CA 3G7JA 2LRTA 3US3A 1H4OA 1XCCA 4DVCA 4Q5FA 4EVMA 3SWLA 4XS6A 1WOUA 3UEMA 4OMVA 3FR9A 2FD3A 3ME7A 1AC1A 3CRUA 4HQZA 1EP8A 1TRVA 1JLVA 3TDGA 1B48A 3U6VA 5IMFA 4IGJA 2M46A 2QKEA 1FHEA 7GSSA 3TRQA 2RUEA 1DBYA 2V41A 2GSSA 2VLUA 4G9HA 1SD9A 4EUYA 1GLQA 3MAKA 4TRXA 4PNFA 1C72A 2REMA 2H0IA 1V58A 4MJAA 2LJRA 4D73A 2L5LA 2R4VA 3TOTA 3K8NA 1HNAA 5ECKB 2IIYA 5JCUA 4HUAA 2N5FA 4IELA 5CYYA 1H75A 3SBCA 4I2TA 1MTCA 2EIQA 1V9WA 1FVJA 1ZL9A 4ZB8A 4XS4B 2H6ZA 1TW9A 2R3XA 2XHFA 1AQVA 1DSBA 5ECOB 3GRXA 1V98A 5IIZA 4KDUA 3ZIVA 2H1GA 5J9BA 1OAZA 3IA1A 5C04A 1TP9A 2FWEA 2GQKA 1PSQA 1Q4JA 4Q5NA 5B6NA 3C1RA 5DQSA 2H66A 3ZFLA 1SJ6A 2FCHA 3HYPA 6GSSA 2HSHA 2OACA 5D9VA 3EYTA 1OC3A 4KE3A 4F2IA 3TUEA 2GQMA 2I1UA 1K3LA 2JSZA 1EWXA 1TK0B 3A3TA 2R37A 3L9SA 1HD2A 3F4RA 5H5RA 5E4WA 1UC7A 4TN8A 5GAND 1IYIA 4HOJA 3D21A 3TKSC 3IR4A 2IJYA 4HJ2A 4NPBA 4NV2A 2CVKA 3BOAA 4G2EA 4K7OA 4POMA 1LJRA 4L5LA 3GYKA 4DEJA 4N11A 4K0GA 1F37A 1UVZA 2DIZA 2B5YA 3WYWA 2J23A 3UMAA 3WT1A 3FZ4A 2F3MA 3CTGA 3MSZA 1FAAA 2VCVA 2OBIA 3TJFA 4K6XA 4MZBA 3TKPA 5KN0A 3P90A 3M1GA 4BVYA 2VM2A 5DCGA 3FRCA 3GIXA 4IW9A 3GURA 2I9HA 1K0AA 4KH7A 3EU3A 1G7OA 2PERA 5GSSA 1GTAA 5B8BA 1ERWA 3LGCA 1UN2A 3G7IA 1E6BA 2LS5A 3ZRDA 4K8MA 2P31A 1Q98A 4FIWA 3HDCA 3NOFA 1GNEA 2RUFA 3IAM2 4NAXA 2ALBA 3VPTA 4KCAA 2FUG2 1TK5B 1WRYA 1XFLA 2F8AA 4JR4A 2DIYA 4K2DA 1GTIA 4OO5A 5DALA 4BPYA 4PGTA 2B5EA 1X9SB 3GKXA 3FR6A 1XZOA 3IAS2 1DUGA 2CA8A 2VIMA 3VWVA 3L78A 1JZRA 3KH7A 3KTBA 5ECHB 3IXRA 2MBSA 3VWUA 4XCSA 2L5OA 3VI7A 4GXZA 3N5OA 2LEGA 1TTZA 1XWBA 3GKMA 1VGLA 2JSYA 3FHKA 1GSFA 4BA7A 1TRUA 6GSYA 2YANA 3LYPA 1M9BA 3EC3A 5IM9A 3IDVA 2MZCA 1ERUA 4TOPA 1EOGA 4YQVA 4K9ZA 3DRNA 3PH9A 2CAQA 19GSA 1SK2A 4ZBDA 3IRAA 5DBQA 2CV4A 4GTUA 1T4YA 4J56E 1X9WB 3G7YA 3D4TA 1U3IA 5B6MA 3GX0A 5GSTA 3GL3A 5D9WA 4RI7A 22GSA 1O8XA 3ZITA 1K0BA 4EO3A 2M72A 3UJ1A 2L4QA 3D6IA 3GTUB 4F82A 4LLRA 3F8UA 3DD3A 4OWYA 2O87A 1GP1A 2IMDA 2V6KA 1T8EB 4NXIA 1JFUA 4PXOA 5HFIA 1XWGA 4ZB6A 2YOIA 3GFKA 5GZZB 2C0EA 1K0NA 1ERVA 2B1KA 3UBKA 5CREA 3KTLA 4IBPA 1HNBA 4RUVA 1A8YA 4KCEA 3E9JB 4GSTA 3L9UA 3Q18A 4YH2A 5D96A 4I8BA 1G6WA 5D9TA 1Z6MA 1A0FA 1FG4A 3LYKA 2R5GA 5HR3A 3C8EA 4TXVA 1QXHA 3QAVA 1TU7A 1GSEA 4JE1A 2FLSA 2ZUPA 2VCTA 4LL1B 3ZZXA 3M0FA 4GF0A 1ERTA 3BCKA 3V1WA 2I3YA 2X64A 2X8HA 3P8WA 2VO4A 4WBJA 3KCMA 3QMXA 2E2MA 1VF2A 4IJIA 2A2RA 4TR0A 2AB6A 5ENUA 1M99A 4K0NA 1A24A 5KEJA 1SL0B 2FY6A 3C1SA 1YY7A 1VF3A 2YWNA 3UVTA 1OYJA 1Y6EA 3IBHA 3LXZA 1GH2A 2PN8A 4PUAA 1UA5A 3H93A 2OBKA 1K0OA 16GSA 1KTEA 3F9UA 2VD0A 2B6MA 3WD6A 3EMPA 3KIJA 1EGRA 2AAWA 3HVSA 3GN3A 1TJDA 2DJ1A 1EP7A 2AJQB 4KW6A 3IPZA 4PQ1A 1ZOFA 1XOAA 3TJGA 3C7MA 1BEDA 4NHWA 5ECMB 1GSQA 3H1NA 2H71A 3D5JA 2EIOA 3RHCA 1Z3EA 1HNCA 4GSSA 4GWRA 1B4PA 17GSA 4OFMA 2L4CA 4L8EA 5COHA 4MJBA 1OC8A 1PL1A 3CSIA 5EL8A 4KAEA 3DEXA 1GUKA 3I43A 2V1MA 2L6DA 2F51A 5J3RA 1WPIA 1T00A 2FHEA 5D8IA 2YWIA 1CQGA 3FKFA 1NHOA 2LV3A 1B9YC 3A2WA 2YWMA 1X5CA 1BYEA 3KM6A 2B7KA 3C71A 2MMAA 3ZLPA 2GZYA 4JEDA 2C1YA 4IQ1A 4KUNA 2YPMA 4KA0A 3OR5A 4KSOA 3GSSA 1QUWA 3E0UA 5H5QA 1YEXA 3IV4A 1AQXA 3MNGA 5DDLA 1OC9A 12GSA 1PA3A 5A4VA 4L0WA 1ILOA 5ECQB 5ID2A 1R7HA 1O81A 2DC5A 5GAPD 1GRXA 1M7TA 1RW1A 1BG5A 3DYRA 1PKWA 4IQAA 2YJ7A 3E3EA 2CAIA 3GV1A 3AY8A 2K8SA 2D2ZA 2NTOA 1OE7A 2O89A 1SYXA 5C00A 1OE8A 4BWQA 11GSA 2IN3A 5A4UA 3TJBA 4EE0A 2PWJA 3GKNA 3F6FA 2GTUA 2PVQA 2I4AA 1MDKA 2GZZA 2WB9A 5DJLA 4JBBA 1Z9HA 1SK0A 1GLPA 1T1VA 3BJ5A 3D22A 1WMJA 2A4VA 4IS0A 2IL3A 2NVLA 2BTOT 2H74A 2KUCA 4ISDA 3TKRA 2PMTA 4OCFA 2IWTA 1F9MA 2DJ3A 2HI7A 2HT9A 2E7PA 2L59A 4OFTA 3CXGA 1BAYA 1O7UA 5B8AA 2HZEB 4HDEA 5DAKA 4BVXA 2VLVA 4H86A 2CX4A 3HXSA 5D73A 4ZIJA 1KNGA 4MF6A 4KDXA 1F3BA 2MMOA 3QR6A 4FYBA 5D9XA 4GLTA 3ISOA 1GUMA 2JU5A 2DJKA 3NZNA 4BL7A 4O7HA 1GSDA 3CYNA 2IMKA 2RM6A 4MH2A 3BBYA 2N5AA 4CDOA 5KN2A 3VWXA 2H0HA 2LQOA 2DBCA 1WJKA 5EPFA 4PQHA 1EV4A 3ZVJA 5J41A 2O85A 1R5PA 3RHBA 4AGSA 2HXKA 4MPGA 4KB3A 3L0HA 4HI7A 2H1BA 9GSSA 1WIKA 1TK8B 4E8EA 1ML6A 3GH9A 1EEJA 3UIWA 2YV9A 3CMIA 2IFQB 3VWWA 3ZMKA 3P2AA 4ECJA 2CX3A 2C3QA 3APOA 2YWOA 5AN1A 1U88A 2FGXA 1JZOA 5HFGA 2H76A 2DLXA 4AJ7A 1XOBA 5HR0A 2FA4A 1EOHA 3IHQA 3GSTA 4WEYA 2DSAA 8GSSA 5DCHA 4HS1A 2QC7A 4ZL9A 3KD0A 2R2JA 5KN1A 3HA9A 3O76A 3A2XA 4NHZA 5CRHA 2C0DA 1FOVA 3UAPA 3HHVA 3F63A 1S3DA 1A0RP 3VFIA 4WETA 2C0FA 3RDWA 2VL9A 4XTSA 4XRDA 4OD7A 4GRFA 1XW9A 5ECLB 2DMMA 4FO5A 1HYUA 1LBKA 4EL1A 2KLXA 3WT2A 1ZCPA 4RQRA 1QGVA 5J4UA 1WP0A 1U3AA 4XS4A 1SKSB 4MJEA 3FZ5A 1PN9A 4LMWA 2PUKC 4PURA 4ZBBA 3TJKA 2HZFA 1AXDA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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