4A3H | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	300
structure length	300
Chain Sequence	SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	PROTEIN (ENDOGLUCANASE)
publication title	Snapshots along an enzymatic reaction coordinate: analysis of a retaining beta-glycoside hydrolase. pubmed doi rcsb
source organism	Bacillus agaradhaerens
total genus	122
structure length	300
sequence length	300
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1998-07-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4a3hA00

5A1AA 3L4VA 4PMUA 2XVLA 1IZKA 1K6AA 3MMWA 3OGRA 4UZSA 3W29A 1V03A 7CGTA 5I0DA 3GH4A 3VD7A 1OT1A 2D1ZA 1Q6GA 2YLLA 8CGTA 5KEZA 2O9OA 4TVDA 1VBUA 3FW6A 1B31A 1ZL1A 4AIEA 4GZIA 4UCFA 4XX6A 1KGXA 3K4DA 5IHRA 3WH9A 3NSXA 2XM1A 4XZBA 1LQ0A 1XCWA 1A3HA 5A6AA 1I1WA 4UR9A 2D3NA 3SUTA 3OLDA 4QDMA 4PRWA 5JUVA 2IUZA 1GQKA 1UD8A 3ZMRA 4B15A 1GQJA 4CCCA 3U5YA 1MW1A 5LA0A 1Q6DA 4JZ5A 1BVNP 2XIBA 4GI8A 4TOQA 1G0CA 4BQ3A 3BAXA 1JD9A 4ML4A 1D3CA 1GHRA 3BMWA 3ARXA 3F5LA 4TUFA 1BAGA 1ISWA 5CPTA 5FL0A 4W7WA 2GK1A 2PC8A 3BCDA 1GORA 2BY1A 5AY7A 4F66A 1KB3A 2VX6A 1EO7A 3BSGA 2W63A 1JGIA 3ZM8A 4OOUA 3BLKA 3VMNA 4PMQA 1F4HA 4M56A 4KH2A 2WB5A 3OZPA 1IT0A 3AZSA 4W84A 1QNQA 3VIIA 5CLTA 5CJ5A 3W27A 2WCAA 1KXQA 1US2A 4GO9A 1B90A 2BY3A 3PTQA 3S2CA 4WJXA 2OYMA 5CSUA 5EMYA 3VX1A 1KGWA 5E0CA 1RP9A 2OYLA 2YL9A 3WEMA 2ZX8A 1BYBA 5DT5A 3WMBA 1XGZA 2W92A 5A6SA 4NRSA 3VIFA 2DSKA 1IZJA 2GK1B 2WVSA 3AIUA 2VRQA 1VF8A 4TVUA 2CKSA 5ABEA 1N82A 1FP9A 2XVGA 2VZUA 2Y2WA 4A3HA 5CXPA 5HDRA 3WD2A 3ZR5A 3CUFA 4AMCA 1BF2A 2ESCA 4P7OA 1CGUA 1BTCA 3VD4A 2QF8A 2WSPA 3PZIA 1QVBA 5CG0A 2D23A 2V5CA 3T0DA 3RCNA 3KWXA 5AYBA 5HXMA 2WM0A 1JI1A 2PF0A 1WDRA 2D0FA 1V6WA 1V3KA 4P7NA 3UCQA 5EFDA 2C0HA 3WH7A 2JF7A 3W0KA 5I2UA 3MU7A 4AXNA 2VT0A 3AIQA 4GQQA 3APGA 3VIMA 3GNPA 3VD5A 3SCTA 3AYRA 1HP4A 4WSKA 3T2OA 4MPKA 4N0RA 3VU2A 4W87A 1JZ5A 2BY0A 4CKQA 2VL4A 1QBBA 1K9FA 2YBUA 5A6BD 3WNLA 1JF6A 1F4AA 1UH2A 4M8UA 3SUVA 1M7XA 3GTNA 3AMCA 4PTWA 1E4LA 1E0XA 3IANA 1ECEA 4W86A 1NOWA 2ZE0A 2WZEA 5D9MA 1ZJAA 2J7EA 2J62A 1J0IA 1DP0A 2D0GA 4EANA 1CNVA 2EJ1A 1VJSA 2XWEA 3T0AA 1CBGA 5LYRA 3U7VA 5AC5A 1VAHA 1XRVA 5JIPA 4X9YA 3SUWA 3WFZA 5BXTA 5I78A 2A3CA 4FMVA 4L4PA 2Y8VA 1EDQA 2HISA 4PMZA 3WKZA 3BAIA 1JYVA 3BMVA 1W3KA 4R5EA 5DFAA 1ZBCA 2ZUWA 4W89A 5BRQA 1CXLA 4JL2A 3AXHA 2A3EA 1QW9A 3SIMA 1V02E 3MMUA 2DT0A 3K46A 3RM4A 1CIUA 3WF1A 1V3IA 4ZENA 1B9ZA 2WMIA 1E6NA 2YDQA 2WBKA 3F5JA 3WF0A 1CGVA 2OLHA 3N18A 4JIEA 1XYZA 1ITXA 2WCSA 2J8GA 3LPPA 4UFMA 1MW3A 3SCQA 4H8UA 3OG2A 7TAAA 4AZBA 1E4NA 4OBRA 2CESA 5D8ZA 1UKQA 4CVUA 2BFGA 3QGVA 1GW1A 5HOSA 2VRJA 3SUUA 2VCBA 2W62A 2BXZA 2G41A 2DQXA 4PBGA 2NW0A 1UD4A 3AROA 2QHAA 4W5UA 5GNZA 5FCZA 4ACZA 1JAEA 3SURA 4HA4A 3ARVA 4CCEA 1ZJBA 4BA0A 4YPJA 2BV9A 3G6MA 1R86A 1BFNA 2XSBA 2G8ZA 3WD3A 4AISA 4A4AA 3VGGA 3A6OA 5A69A 2YL6A 3ARYA 2WMIB 3FHAA 4HOXA 1HVXA 1UUQA 1VBRA 2E4TA 4HZ7A 3POCA 1EGZA 1V0NA 3F5KA 3ARPA 1OGBA 5F7UA 1XH2A 4RE3A 4MJ2A 5DMYA 3VIHA 3BXWA 1B0IA 3MMDA 2WCGA 2ZX7A 3WUEA 1B3XA 4LXFA 1UD5A 1Q6FA 4AIUA 3BAKA 1RP8A 4UTFA 2NT1A 3ALFA 4NZCA 3WDIA 4UQEA 1GOOA 1V3MA 2PWDA 4PMYA 4ACZB 4AEEA 2OSYA 1HJXA 4W7UA 1J11A 1HP5A 4Y7EA 4JFWA 3RM9A 3VILA 4AZIA 5I23A 2FDMA 5GPRA 2Y8KA 4IM4A 5BXSA 2MANA 3WDPP 1QPKA 3B9EA 5C70A 1M53A 4NF7A 3DHPA 2W91A 3DYMA 2PWGA 1E3XA 1GJUA 2PWFA 2W61A 3KE0A 4KWUA 4DWSC 1MXGA 4J3XA 4FF5A 3WEOA 3CHFA 5HNNA 5IFTA 3MSDA 4HMCA 3AXXA 3WH8A 1I75A 2FH8A 2VX4A 1J0JA 2WHMA 4RE2A 4V27A 5C8BB 1B30A 4N42A 2VURA 4WLCA 1JXKA 3WL1A 3FNDA 1KFWA 3WQ4A 3TTSA 1E70M 4GZEA 1LL4A 1UH3A 4W8LA 2VC9A 3TTYA 3WDJA 4Z2IA 1EDGA 2E0PA 3AOFA 2ZUVA 2OWCA 3M7SA 3GBDA 4MB5A 4TX8A 4ZXOA 3WH6A 4DUVA 2D24A 3GYCA 3LPFA 3AICA 3AS2A 4CD7A 3L4XA 1BVZA 7A3HA 3W26A 2PBGA 1JF5A 4BQ4A 1V3LA 3B9AA 2WZHA 1WZAA 2UY4A 3T2PA 1RPKA 4NI3A 1NARA 3PBGA 4PMXA 3VGDA 5IDIA 1BG9A 2WLZA 2YA0A 3GNRA 5I79A 1LL7A 3CGTA 2XG9A 1ISZA 4FLSA 4PMVA 3HMCA 1M03A 1B2YA 3DYOA 4AD4A 1CPUA 2Z1KA 1CGXA 1HT6A 5E6YA 1W91A 4MDOA 3VDHA 2EPLX 2J7GA 4P7QA 1CWYA 4WF7A 1W3HA 1G01A 2VX5A 3PZVA 3VO0A 4U31A 1B3WA 4OJYA 1MQPA 3EMQA 3ARZA 4AD2A 3CMJA 3MKKA 5DT7A 1UKTA 1X6NA 4P7LA 1E5JA 5A8PA 1OSEA 1HJWA 4E8CA 5A94A 3THDA 2F2HA 1KWGA 3VOCA 5M03A 3AIEA 4HTYA 4JKKA 4WKFA 1IV8A 1C3FA 2DSVA 5HPOA 4UFHA 1OINA 2BNJA 2EO7A 2G3NA 1TR1A 3CZLA 4QP0A 1QI3A 4CU8A 2DDXA 1R7AA 3J7HA 1G5AA 4AWEA 1Q6CA 1SFSA 3RM8A 2J79A 3CLWA 3GBEA 1V02A 1JYWA 4V28A 5AC4A 4EAMA 1UKOA 4U5KA 1QNRA 3DHUA 1GOMA 2Y24A 3UEQA 1E55A 4UFJA 4PTVA 2VJXA 2DSUA 3ALGA 4FLQA 3II1A 2FHBA 1GVYA 4U3CA 4D72A 2V5DA 4C7DA 4PMDA 1GOWA 4OBSA 2VR5A 1Y7VA 3RO8A 1U2YA 2E8YA 3VGHA 3NSNA 4LQ1A 1E0WA 5CGTA 4C7GA 3AHZA 3W6MA 1HF6A 2WANA 5KZ6A 3O2LA 1V6YA 1E6ZA 1H11A 4PTMA 2WXDM 3CIVA 3VIPA 2E9BA 4X0VA 4CUCA 1CXHA 3AHXA 3TA9A 5ECUA 2J7BA 2XPKA 2YBTA 2Y4SA 4MB4A 1XCXA 1JYNA 5EFFA 4MNMA 3WD1A 4CD8A 3PZMA 3GH7A 4M29A 3MSGA 1H49A 1D2KA 1PBGA 2F61A 3GXDA 3EDDA 3KL0A 4JCMA 2UWFA 4HU8A 3VD9A 3N1AA 4M81A 9CGTA 1ISXA 5A8OA 4BCEA 1W1VA 3EDKA 4EK7A 2VR4A 2VOTA 2O9RA 3RJYA 3S6TA 3VGBA 5E0FA 3HU7A 1W3JA 2X1IA 4JFTA 4MAZA 1HL9A 2X0HA 2ZX5A 2J78A 4HMDA 1HL8A 2YA2A 3GNOA 4F9DA 3LPOA 1CXEA 1HKMA 2G4FA 2V3DA 1E40A 1E15A 1FH9A 4AY1A 1PEZA 3NCOA 3WNPA 2J7FA 1MXDA 4A3YA 2DIEA 1JNDA 4UZUA 4U2YA 3LMYA 1G9HA 4ZE5A 4E2OA 1EXPA 3N13A 5ABGA 3A4AA 2BHYA 4AW7A 4CU6A 3OIHA 4OKDA 2OYKA 3AJ7A 4AD3A 3IAQA 2JIEA 2TAAA 2YOCA 1UYQA 4HP5A 3W37A 3VTRA 1X6LA 1FHDA 1LWHA 1PX3A 3I3EA 2XFRA 3CTTA 3RIKA 4BS0A 2WVTA 1LJYA 1V0KA 3MUAA 5FOOA 1JD7A 1H41A 2WMKA 1DHKA 1DTUA 4D6CA 2WC7A 2Y5EA 1WNOA 4TTGA 4UOQA 5BRPA 2DSWA 1QHPA 4F79A 1QI2A 2DEPA 1KQYA 4U33A 3ARWA 1CGYA 2YDSA 1QI5A 2W5FA 3SCPA 4PMRA 3BAJA 4UOZA 1E6SM 5A6KA 1EO5A 1KQZA 3WMSA 1UQZA 3WNMA 2CBVA 1E9LA 1W9UA 1P6WA 1V08A 4MADA 5IFPA 3ARTA 2BY2A 1E43A 1PZ2A 1W3LA 3VPLA 2XFFA 5GQBA 3SUSA 3ECQA 4UQ9A 1HJSA 3QHMA 3WMCA 4JFVA 5D4YA 3VD3A 2EPOA 4TTUA 1UH4A 1QOXA 1PZ3A 2WLYA 3TTQA 4CD5A 3I3DA 4ZE4A 1JFXA 3VNZA 3MUZ1 1GPFA 4B3LA 2O9PA 2WVUA 4HA3A 1LG2A 1EOMA 3PHAA 4GINA 1BGAA 3PZNA 2Q8XA 4RE4A 4DWSA 4XZWA 1PX4A 1VFUA 4W93A 4D6EA 4D6IA 5BXRA 2ZX9A 1E6XM 5CSYA 4JFSA 2DT2A 4XV0A 1WZMA 1EQCA 3N9KA 2BXYA 3TP4A 3CZKA 2WYSA 3K1DA 3WQ5A 2CKRA 2X05A 3OB8A 1MQRA 1KXTA 2YJQA 3L4ZA 4X0NA 2BVDA 2V3FA 2WSKA 2VRKA 4D6JA 1WKYA 4ATLA 3NYDA 1TE1A 1VENA 1AVAA 5I6SA 4JHZA 1AMYA 3N11A 2GUYA 1PJ9A 1QW8A 1TZ7A 4YN5A 4QCEA 3IJ7A 1E6RA 4GI6A 1W2VA 3ZR6A 3VMOA 1VEMA 1E6PA 1R87A 1OT2A 2ZUNA 5BCAA 1CEOA 2BVTA 1JFHA 1VIWA 3RPMA 1PIFA 4AEFA 4HPHA 3VKKA 1MFVA 1JZ6A 3ZIZA 2YKKA 5M5DA 2J7HA 3FN9A 4DWSB 1TMQA 4AZCA 3SCSA 3K4AA 1GVIA 4GXPA 4EE9A 1GQLA 2W66A 3CBWA 4AZHA 1JDCA 3MV11 1HIZA 5IXEA 4JKMA 1H2JA 1JZ3A 1JAKA 1HKKA 2O92A 2ZXAA 3G6LA 4FLRA 4QLLA 3CMGA 3W6LA 4QFUA 5A6MA 5GNYA 1WAWA 4KGJA 3WD4A 4UNIA 3WSUA 1KCKA 3UR8A 1UA7A 1TFVA 4UQBA 4ATDA 3BLPX 3UG3A 4BZYA 1H3GA 3TOPA 4PTXA 3MO4A 1ISYA 1C8YA 2QV4A 1CXIA 3CO4A 3A47A 2WHJA 3VX0A 4WIWA 4NSBA 4AZ6A 2EPNA 1J0ZA 3TONA 1JXJA 1C8QA 2OSWA 3SEPA 3AXIA 3N15A 4UOJA 2WC3A 2V38A 5A3HA 1GONA 3VDAA 1L8NA 1TVPA 1K9DA 3RDKA 1CYGA 4AZCB 1GZJA 1UZ4A 3AHVA 3MV01 1QNPA 1BYAA 5FD0A 4CN6A 3I3BA 2GDVA 3WENA 2J75A 3SCWA 2F8QA 1GHSA 1SMDA 2JEQA 1H0IA 1XSJA 4GIAA 3VIJA 1V6XA 3NUKA 3VNYA 2G3IA 5DF0A 2XJ7A 3L4TA 2VVNA 2X0YA 4J7RA 3W82A 4J27A 1YHTA 1HNYA 3B8SA 2D0HA 1XH0A 4M80A 1W9XA 3FAWA 1ODZA 3LPGA 3WF4A 1W9VA 2WMJA 4S3KA 1W32A 1E5NA 5A8QA 3CHCA 4B3KA 1W1YA 2GSJA 4IPLA 3SCUA 2VMFA 3W25A 2JF6A 1UR2A 4HPGA 2WHKA 2BS9A 5DO8A 2OSXA 3A4XA 4LYRA 4OZOA 4PYSA 5A6LA 1NQ6A 4M24A 3IJ8A 4CU7A 1GOIA 3N17A 2CITA 4D6GA 3SCRA 1OGGA 1UOKA 1EOKA 1KR1A 3ZT5A 2E8ZA 1AQ0A 2WMHA 3VGEA 2VTFA 2GFTA 1W9BM 4WKAA 1WE5A 1KWKA 1LWJA 3OLIA 5CQ1A 1OD0A 4JCLA 3PN8A 1UD2A 4GPNA 5A2BA 1R8LA 5D8WA 2FGZA 1GUVA 2J47A 1HKIA 4E4PA 2HVMA 1JDAA 3L2MA 1NP2A 2AOSA 2VZOA 4M82A 1U30A 5JIWA 1MYRA 1MFUA 4J3SA 4M1RA 4ZXLA 4AZGA 3OGVA 2WZIA 1WO2A 3WH5A 3WQWA 1UWTA 3T2QA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3ARR A;  1CLV A;  2QLY A;  3IK2 A;  5A8N A;  1E4M M;  2J4G A;  3N12 A;  1XHG A;  1UHV A;  4S3J A;  1YQ2 A;  1V6U A;  3VM5 A;  1TA3 A;  6TAA A;  3ZT6 A;  1PAM A;  2WKL A;  2X8R A;  6CGT A;  1BSI A;  1FH7 A;  4UQD A;  2YIH A;  4MB1 A;  1E3Z A;  4HME A;  4CCD A;  3DEC A;  3IJ9 A;  4R27 A;  3AS1 A;  4PN2 A;  2EBN A;  5CGM A;  2WK2 A;  3E1F 1;  3KL3 A;  4J28 A;  1QHO A;  4U5I A;  3WBE A;  1CEC A;  3AHT A;  2CBI A;  3VIO A;  3GXI A;  2E40 A;  4B9Y A;  1HJV A;  4K68 A;  1CZ1 A;  2E9L A;  3OLE A;  4NRR A;  1J9Y A;  3O6A A;  1TVN A;  1KCL A;  4Z2H A;  1RH9 A;  1BPL B;  2WNW A;  1SR0 A;  1G94 A;  4HZ8 A;  1OGS A;  3WNN A;  1UWU A;  2E3Z A;  3WF2 A;  1CGT A;  2WC4 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4A3HA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations