The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
202
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structure length |
202
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Chain Sequence |
MRVKFNPLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNLLGLYPRIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Structural Basis for Aspp2 Recognition by the Tumor Suppressor P73.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Cell cycle
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source organism |
Homo sapiens
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molecule keywords |
TUMOUR PROTEIN 73
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total genus |
59
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structure length |
202
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sequence length |
202
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chains with identical sequence |
D, F, H, J, L
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 2011-10-31 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
B | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
B | PF00023 | Ank | Ankyrin repeat |
B | PF13606 | Ank_3 | Ankyrin repeat |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Alpha | Alpha Horseshoe | Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat | Ankyrin repeat-containing domain | ||
Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2J6O A; 2RFA A; 2CH4 W; 2RN8 A; 1QYM A; 5AQB A; 4LNU D; 5HS0 A; 2ZGG A; 1I1J A; 2O9V A; 2EGE A; 3EU9 A; 5ENO D; 2PTK A; 5L23 A; 4YDW A; 3J5P A; 3T8K A; 2D1X A; 2RPN A; 2GQI A; 2ROL A; 2RQU A; 5EYL A; 2K7A A; 2C0O A; 4RTT A; 1CSK A; 2QC9 A; 1OY3 D; 2FO1 E; 1MUZ A; 1PRL C; 2J6F A; 3JV3 A; 1K4U S; 3H0H A; 4GMR A; 5EIL A; 4OAV B; 1ZLM A; 2ED1 A; 1DCQ A; 1K3Z D; 4QQI A; 1WLP B; 2LP5 A; 2XMF A; 4RUG A; 2RQW A; 2A36 A; 3EG3 A; 2JS2 A; 2L3S A; 4AFQ C; 1G3N B; 2XEH A; 5AAR A; 1H3H A; 1KFZ A; 2NYJ A; 1KJW A; 1ZUK A; 3TWV A; 1NLP C; 4GPM A; 2D0N A; 1MV3 A; 2JTE A; 2CUB A; 1ZUU A; 4D8D A; 3TVT A; 2Y1L E; 2EYY A; 2PZ1 A; 1AZG B; 3TWR A; 2M0Y A; 2C0T A; 2AZS A; 2BZY A; 2JT4 A; 2JAB A; 2DX1 A; 4J9C A; 2LMJ A; 3F6Q A; 1I0C A; 1PKS A; 1PNJ A; 2QDL A; 1SVX A; 1AWC B; 2L0A A; 2XEN A; 1M3A A; 1JEG A; 2A08 A; 3ZUV B; 2KXD A; 5FIO A; 4N5Q A; 1YN8 A; 4OMM A; 1NYG A; 4Z68 A; 1M3B A; 3M0U A; 2DNU A; 2ENM A; 2EQI A; 2OJ2 A; 4CC7 A; 5HKP A; 3VS5 A; 2A28 A; 5GJV B; 3TWW A; 2P2C P; 2VGE A; 4CZ2 D; 5CEC B; 4DEX A; 3VS4 A; 1AD5 A; 3GBQ A; 1K0X A; 2RNA A; 3M0S A; 2O9S A; 3QWY A; 1T3S A; 1N0Q A; 4HBD A; 1UDL A; 1Y0M A; 1AWX A; 4BES A; 2DBK A; 4DX1 A; 2EPD A; 3VRY A; 1IXV A; 4K5B A; 2B86 A; 2EYW A; 3UI2 A; 3M0T A; 1YWO A; 4C48 B; 2Y0B G; 3JXI A; 1TG0 A; 1GL5 A; 3VS3 A; 1VYV A; 4NIK A; 5AN8 A; 2LJ3 A; 3NOG D; 2BTT A; 1ABO A; 3UTM A; 4HQD A; 5KBA A; 2O88 A; 2GNC A; 2KNB B; 3VS1 A; 3EHR A; 1GCQ C; 4E6R A; 2BZX A; 2DLP A; 4UUC A; 2J6K A; 2EYZ A; 4EIK A; 1K76 A; 4LE9 A; 2BZ8 A; 5AQ7 A; 4F6R D; 1MV0 B; 4CC2 A; 3UA7 A; 1YP5 A; 1X6G A; 3V2O A; 3IQL A; 2KXP C; 5HRY A; 1IKN D; 2L3Q A; 2HEQ A; 5AAO A; 1KSW A; 1U06 A; 3C0C A; 3VS6 A; 2LQW A; 1SSH A; 2J05 A; 1T0H A; 2EKH A; 2MYO A; 2J8S D; 3PVQ A; 2M51 A; 1QKX A; 1WFW A; 4FSS A; 2DL8 A; 3IXE A; 2EVR A; 2SEM A; 4GLM A; 2DL7 A; 3O5Z A; 4F14 A; 2D8J A; 1Z9Z A; 4X1V A; 4JZ4 A; 1AP7 A; 5ENT D; 2EGC A; 4AFZ C; 4HI8 A; 2BKG A; 2KT8 A; 2DWZ A; 2AK5 A; 4J9D A; 5IXF A; 2VKN A; 2A5E A; 2F37 A; 1K0S A; 2LNH B; 5CEA A; 2HBW A; 2LZ6 B; 4CYM D; 3REB B; 5CED B; 2KXC A; 4HXJ A; 4D8K A; 2LJ0 A; 1UG1 A; 2NWM A; 1Y57 A; 4Z8A A; 1AVZ C; 2YT6 A; 1MYO A; 4J9G A; 2KBX A; 2KE9 A; 3NOC D; 3AAA C; 2K3B A; 1SW6 A; 4RTY A; 2AKK A; 3TWT A; 1X2Q A; 4JJC A; 4JJB A; 1QLY A; 3M0R A; 3TSW A; 3H0I A; 4IIO A; 3H0F A; 2FPD A; 1A0N B; 2AZV A; 3RBB B; 3EG2 A; 2CT3 A; 2KGT A; 1OV3 A; 4CC3 A; 2X3X D; 4QFV A; 4OMO A; 4DEY A; 4HVU A; 1CKB A; 3SHW A; 1E7O A; 4U8Y D; 4U96 D; 2W0Z A; 1BI7 B; 2HCK A; 4J9E A; 1B07 A; 5ENP D; 2CSI A; 3PE0 A; 1MX4 A; 1GCP A; 1W6X A; 4JZ3 A; 1WXU A; 2FRW A; 4KRT A; 4OMN A; 4ESR A; 2DYB A; 4RTX A; 1V1C A; 3ZNG A; 4LSZ E; 5ITZ F; 1T0J A; 5BXU A; 5ENQ D; 1WYX A; 2DL5 A; 3LJN A; 3RNJ A; 2B0O E; 1BD8 A; 2LJ1 A; 1M3C A; 5GJW B; 5EN5 D; 4DX2 A; 4J9F A; 1UGV A; 2YSQ A; 4BER A; 1X2K A; 2ZGD A; 1RLP C; 2DZN A; 2F8Y A; 2CDT A; 4K5C A; 1OOT A; 3M0P A; 4HVW A; 2DMO A; 1AWO A; 4OMQ A; 1IHB A; 2MOX A; 2DRK A; 4AFU C; 2YUO A; 4G8K A; 3C5R A; 3JXJ A; 1UHC A; 4RLY A; 1VA7 A; 2K2M A; 5IXB A; 2EW3 A; 2DE0 X; 4DX6 D; 3Q9N C; 4O60 A; 4QT7 A; 2FPE A; 2I0N A; 4HCK A; 3V31 A; 1JXM A; 2F2V A; 1WDX A; 2F2X A; 2O2O A; 2FRY A; 3UF4 A; 2ROT A; 4HNA D; 4DX7 D; 1X6B A; 2P4R A; 1G2B A; 2HSP A; 4IIM A; 4OAU C; 2MCN A; 1SRL A; 1QWF A; 2EGA A; 2L3P A; 4U8V D; 2DZO A; 4DUI A; 2LQN A; 3UAT A; 1SHF A; 1UTI A; 2H8H A; 2VVK A; 4RTW A; 1YWP A; 4HRN A; 2JXB A; 1Z9Q A; 3FJ5 A; 1SPK A; 3I5S A; 1UOH A; 1RI9 A; 3TWX A; 3NPF A; 2HDA A; 1UJ0 A; 1UE9 A; 3J5Q B; 5EYP F; 3PVL A; 3REA B; 4YDY A; 1YYH A; 2KRM A; 2X3W D; 3B95 A; 4HRM B; 4DRX E; 3EG1 A; 1NM7 A; 3VS0 A; 1YCS B; 1BBZ A; 1ARK A; 3VS7 A; 2CH4 A; 1G83 A; 3I9Q A; 2JMA A; 4HRL A; 1QKW A; 3DEO A; 5I11 A; 1B3Q A; 1ABQ A; 1GBQ A; 1J3T A; 3TWU A; 3JUE A; 3A98 A; 4J7W A; 2DVW A; 4J9H A; 2RQV A; 4JJD A; 2FO0 A; 2IIM A; 3W9F A; 1ZUY A; 1KIK A; 1H8K A; 4ORZ A; 4ZFH A; 4Y92 A; 2KT1 A; 1WDY A; 1W70 A; 2DVJ A; 4ZNX A; 3KEA A; 1NG2 A; 1ZSG A; 2KYM A; 1JQQ A; 2CRE A; 5CBO A; 2O31 A; 3B7B A; 5JA4 D; 2KYB A; 5JMN D; 5IHI A; 4TUM A; 1U3O A; 1WA7 A; 4GBQ A; 3ZKJ A; 2C0I A; 3NMZ C; 2YUQ A; 1BK2 A; 2KEA A; 3LH5 A; 5ENR D; 2ABL A; 2ECZ A; 1JU5 C; 3TWS A; 4B93 B; 4HLL A; 1OEB A; 3NGP A; 4AG1 C; 4J9I A; 4BET A; 1NLO C; 1ZBJ A; 1WX6 A; 4WCI A; 5IHK A; 3EG0 A; 1N0R A; 1E6G A; 3V2X A; 1A5E A; 1BB9 A; 2NUZ A; 1UHF A; 1NYF A; 1AZE A; 2YDL A; 5AQA A; 2HE0 A; 1QCF A; 1TUD A; 4BSZ B; 4J8Y A; 1PWT A; 4K5A B; 1N5Z A; 1WI7 A; 5EC7 A; 1HSQ A; 5FWB A; 3DEP A; 1M27 C; 2PNI A; 2XZD G; 1X43 A; 1SRM A; 4ATZ D; 2FEI A; 2J7I A; 4JPB W; 2KR3 A; 3V79 K; 2V1Q A; 4OML A; 2K79 A; 1JO8 A; 3THK A; 4F17 A; 2DM1 A; 1UFF A; 3ZL7 C; 1AWW A; 4AFS C; 4HVV A; 1X69 A; 1RLQ C; 4JB8 P; 2DL4 A; 3HRA A; 1WXB A; 4RTV A; 1MX6 A; 5I22 A; 1SEM A; 1BU9 A; 4HB5 A; 2SRC A; 3D9H A; 3V30 A; 2E5K A; 4Z88 A; 2XZT G; 2OAW A; 1HJD A; 1GFC A; 2G6F X; 3I5R A; 5FWC A; 5BXO A; 5CBN A; 2DIL A; 1VYT A; 1TR4 A; 1NEG A; 2PNN A; 2OI3 A; 1T3L A; 4HI9 A; 3NHN A; 1S1N A; 2W10 A; 4K11 A; 1GBR A; 3ULR B; 2YUN A; 1VYU A; 1EFN A; 3QWX X; 1NFI E; 1UJY A; 1PRM C; 1K1Z A; 2MIO A; 3U23 A; 2RQR A; 1PKT A; 1WXT A; 1H92 A; 4LUE A; 1AWJ A; 5FW9 A; 2RMO A; 1K9A A; 2DJQ A; 1UEC A; 2V5Q C; 3SO8 A; 2GBQ A; 1MJ0 A; 4LG6 A; 2K6D A; 1WG0 A; 3H41 A; 5KNG A; 2LCS A; 2FPF A; 2J06 A; 3W9G A; 2CT4 A; 2JW4 A; 4RTZ A; 3UXG A; 1HD3 A; 1RUW A; 2YUP A; 4R0K A; 1YNZ A; 2CUD A; 3T9K A; 4DX5 D; 2DF6 A; 4M4Z A; 2V4H C; 1OT8 A; 2RQT A; 1MX2 A; 4A63 B; 2DL3 A; 4LNP A; 2RFM A; 1K1B A; 2KRO A; 1M8M A; 1OPK A; 2EBP A; 4BEP A; 3Q9U C; 2D8H A; 4F1P A; 2RF0 A; 2KRS A; 4O1O A; 2GGR A; 2BKK B; 3ZU7 B; 1UUE A; 4G8L A; 1BLX B; 2GTO A; 4O1P A; 4F16 A; 1JXO A; 1PHT A; 2ED0 A; 2JMC A; 3CQT A; 4OMP A; 3R6N A; 1N11 A; 2L2P A; 5KWD A; 1QWE A; 1OPL A; 1D9S A; 2K9G A; 1GRI A; 4LN2 A; 2V1R A; 1WIE A; 1CKA A; 2ESW A; 5ECA A; 3I35 A; 3VS2 A; 1BI8 B; 2ETA A; 2KBT A; 5KNH D; 1SHG A; 5ENS D; 5EID A; 2F8X K; 1E6H A; 1TUC A; 1X27 A; 2L6B A; 2DBM A; 3KFV A; 5IH2 A; 1K1A A; 4ZHB A; 1XOV A; 2EYX A; 5EIB E; 1S70 B; 4LUD A; 1LCK A; 1AOJ A; 2LX7 A; 4J9B A; 1M30 A; 1IO6 A; 1ZX6 A; 3NBN B; 4Z89 A; 1W1F A; 3AJI A; 2QYJ A; 2DA9 A; 2ETC A; 3SEM A; 3EHQ A; 1YMP A; 1GCQ A; 1GFD A; 1FYN A; 3EGU A; 2GTJ A; 5IHN A; 5CER B; 2ETB A; 3M0Q A; 3TSZ A; 1I07 A; 2JM9 A; 1U5S A; 4AG2 C; 1NEB A; 3HG0 D; 1BU1 A; 2AJA A; 4CC4 B; 2AKL A; 4U95 D; 2DRM A; 4RTU A; 2VWF A; 2A37 A; 3VRZ A; 5AQ9 A; 5D66 A; 1AEY A; 2CSQ A; 2FG0 A; 3UA6 A; 2F2W A; 2JM8 A; 1DC2 A; 5HCK A; 3TWQ A; 2KRN A; 1FMK A; 2JS0 A; 2XEE A; 5FIN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4YDO A; 2RFA A; 1QYM A; 3ASG A; 4B0Z A; 1N54 A; 2E6N A; 4K0R A; 1TN7 A; 4F53 A; 4U0S A; 2RI5 A; 2ZGG A; 2GRL A; 3FTS A; 1MMN A; 3L2U A; 3KUF A; 4JRP A; 3OSS C; 3EU9 A; 2P4T A; 2D1X A; 2JTM A; 2GQI A; 2DBA A; 4DBQ A; 4BE0 A; 4AT1 B; 2CG3 A; 2GRM A; 2C0O A; 2NUP B; 3GNF B; 3M58 A; 3G4S T; 5JJT A; 1PRL C; 1Q82 U; 2J6F A; 1K4U S; 1BI1 A; 2OAU A; 1NJI U; 5GMK i; 1OU9 A; 1V29 B; 1DCQ A; 4RUG A; 1WLP B; 3ASF A; 1UW4 B; 3CXC S; 1VQN Q; 5CO7 A; 4I1M A; 2X4W A; 1OI1 A; 3EGD B; 4C92 D; 1VQ5 Q; 3TQ7 P; 1KJW A; 3FEY A; 4HOS A; 4RMO A; 5J3B A; 1NLP C; 3PZ1 A; 4GPM A; 4J8D A; 3CVY A; 2JTE A; 4D8D A; 5JHA A; 2Y1L E; 2QZA A; 3VV0 A; 4C8Q A; 3UMV A; 1AZG B; 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1KSW A; 2BUG A; 3CBP A; 4L59 A; 3VS6 A; 1T0H A; 3LKU A; 2EKH A; 3NF1 A; 3X24 B; 4FL6 A; 5LL6 S; 2DIW A; 2J8S D; 3JCM W; 5CK9 A; 4W9R A; 3QKJ A; 5FQ8 A; 2FZG B; 2EVR A; 2SEM A; 4GLM A; 2B8A A; 4EPZ A; 4KMO A; 3RAU A; 1OXJ A; 1AP7 A; 2LXL A; 5ENT D; 2V4L A; 1KC8 U; 3MYV A; 4HI8 A; 1QQJ A; 4XI0 A; 2WSE E; 2HKQ B; 2VC8 A; 4M78 E; 2NUP A; 3SFY A; 3C72 A; 1NPP A; 2PUK B; 3FTY A; 1K0S A; 2LNH B; 2E41 A; 4I6E A; 2IU1 A; 4D8K A; 3M54 A; 4L5G A; 2LSV A; 5LOZ A; 2NWM A; 1Y57 A; 2XPY A; 3AS8 A; 2WXJ A; 5AIJ A; 3V7S A; 2CKK A; 2QA4 Q; 3I4R B; 4ATG A; 2CHZ A; 2VJ8 A; 3A8H B; 4LRZ A; 5AEN A; 1X2Q A; 3TSW A; 1QLY A; 1YCY A; 5AYF A; 3H0I A; 3FH8 A; 3EGD A; 2D0Q B; 4PS7 A; 2KGT A; 1OV3 A; 4FYX B; 4RQI A; 2X3X D; 4QFV A; 1D1C A; 5GAN 8; 2VTB B; 4HVU A; 4EPC A; 2XI9 A; 4WUY A; 5GAM h; 1Q86 C; 2WQH A; 3G2V A; 1E7O A; 1KQ1 A; 4C8Q C; 1KLX A; 2RI3 A; 3CC4 A; 1YJW T; 1B07 A; 4I6G A; 2CSI A; 3PE0 A; 4RKU E; 1GCP A; 3I56 T; 2X6J A; 2FRW A; 4P5N A; 4JHR A; 4LSZ E; 5ARF A; 3JB9 F; 4MDX A; 4I2Z A; 5BXU A; 1WYX A; 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