4AZ7A

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
433
structure length
433
Chain Sequence
NEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGWYNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDLNRYTAESVTAVKEAEKAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQETVNNLTLT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 171
structure length 433
sequence length 433
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4az7A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4az7A01
1VEPA 1TR1A 4PSRA 1W91A 3IAPA 5I2UA 3SCUA 1TVPA 3MSDA 4W93A 2UY4A 1GHSA 3G6MA 4MAVA 1E6XM 2C8NA 1W9VA 3RCNA 4D1JA 3TTYA 4ZEPA 2VNCA 2G8ZA 1CGUA 1L0PA 3AQUA 3PHAA 5D9NA 3OLEA 2J78A 2D0GA 3ARUA 2CHNA 4WSJA 2EBNA 7TAAA 1E6SM 2WK2A 2JE8A 1TUXA 4J3SA 4P7LA 3N9KA 4TX6A 2VX5A 5ABGA 1CYGA 2PB1A 2DEPA 1V3IA 1MWOA 4AY1A 1GQLA 2ZWYA 1MYRA 3DECA 1E56A 4D1IA 1JYNA 3ZT5A 1QNPA 1XYZA 4P7NA 3LPFA 3RJYA 5FD0A 3SCSA 1JNDA 3QHNA 2YDQA 1X6NA 2DSKA 3CO4A 2WM0A 1X1NA 1B3XA 4U33A 2D0FA 1WE5A 3CPUA 1CXEA 4UOQA 3OLGA 1E40A 4UFHA 2YLAA 3GXIA 1UZ1A 2XJ7A 1GQIA 1WDQA 3MKKA 4YN5A 5HPOA 1DWGM 1OD8A 3AIQA 1OCQA 2EQDA 2QPUA 2YBUA 3PZOA 1QW9A 1DP0A 5C71A 1ZL1A 1V6XA 3QOKA 1OD0A 2YL9A 2BXYA 2WZIA 5IHRA 2DSWA 3KL5A 4H7VA 3WH8A 4LYRA 5GNYA 3WNKA 2Y2WA 1NP2A 3EDDA 4OUEA 1DWAM 3BMWA 1I75A 1Q6CA 5GQBA 1W3LA 3CZJA 2JF7A 1JIBA 2J75A 1K9DA 4PTWA 4UFLA 1CDGA 3PZTA 2E8YA 4AD2A 3BH4A 1CNVA 1C91A 1NARA 2GUYA 2XFYA 1UD4A 4R5EA 1JD7A 3KZSA 1KWGA 3MANA 4D6GA 2EJ1A 1S46A 2PF0A 1OGGA 3BAJA 1H49A 3L4ZA 5D9MA 1W32A 5HDRA 1C8QA 5A95A 4UQDA 1XD1A 4P8XA 1HJUA 3WDHA 4TVCA 2D20A 2ZXBA 1E4NA 5A6KA 1V0LA 3PTMA 2DT3A 2Y8VA 3MS8A 4W84A 3PZUA 3CGTA 4D6DA 3RM4A 1XD0A 1ZU8A 1JYWA 5A2CA 1NH6A 2YDRA 3NSNA 2ZICA 2AMGA 1UHVA 1JI2A 4H8VA 1UR1A 4AZCB 1CGXA 5AC4A 3U5UA 4HA4A 2WHKA 4D72A 2G3IA 2EEXA 1WDPA 2YA0A 1XC6A 2VTFA 1W3HA 3I3DA 3WEMA 2ZX8A 1XYFA 2D1ZA 3WUFA 1NOFA 1Q6DA 4JFUA 1JL8A 1X6LA 5JBFA 2O9RA 3EMQA 3SCPA 3CUHA 3GDBA 4B9YA 3SUUA 2PC8A 4GKLA 1AQ0A 1Q6EA 1TFVA 2Y4SA 1R87A 2GDUA 3VINA 4DWSB 2VZUA 4KMQA 5TD4A 1H0IA 1NP0A 4AZIA 1UH4A 1HXJA 5A8OA 2WVSA 1TA3A 4UFIA 1CGYA 1XCXA 2PWEA 1WZAA 3L4YA 4HPGA 1QI5A 1BGAA 4AD1A 5BXRA 2OWCA 1V0NA 3IJ7A 1EIBA 1K9EA 1W1VA 2Z1SA 3CZLA 1CXHA 2EPMX 4UOZA 2XSBA 5DMYA 4CN6A 3AS2A 1KGWA 1HJWA 2ZXQA 4J3VA 4AD3A 1M7XA 5AYIA 2A3BA 3VGFA 5FL0A 1B0IA 4C7GA 3G6LA 1CLXA 1UD5A 1ZBKA 3BMVA 4WK9A 3AIUA 1V6WA 3VUPA 3SUSA 1V3LA 1I1WA 2IXUA 4DM1A 1LJYA 1MW3A 2BY0A 3I3BA 4UNIA 4J7RA 4AD4A 1UR9A 4CD8A 2W92A 5M17A 2VURA 1J11A 5A2BA 4Q22A 3OBAA 2CBVA 4GXPA 3SEPA 3OA5A 1VBUA 2PBOA 3J7HA 3CHDA 3M46A 5M5DA 2W63A 4OIFA 4W7WA 4ACYA 2XHYA 2OZNB 1HJVA 3NIYA 2VCBA 1JI1A 3O2LA 2J8FA 2OWXA 4OZOA 2PWHA 5KZ6A 4LYQA 4AEEA 1BYDA 4QAWA 2J7FA 3AHTA 1ZJBA 4NRRA 1OINA 1UR2A 1M03A 3FAXA 2DT1A 3AYSA 4OBRA 3LMYA 3WF4A 4RE2A 1QPKA 2RGMA 4GO9A 3W27A 3FN9A 1FH8A 3BAIA 2MANA 1EDQA 3AIRA 3K8MA 4M8UA 1B3YA 3CH9A 4L4OA 4JCMA 4NI3A 1Q4NX 1E71M 5AYBA 3VIOA 1B9ZA 2BVTA 1GPFA 4AYSA 3ARXA 3T2QA 4PCSA 2EPNA 3RO8A 2J7EA 1LG2A 5CLWA 1AVAA 1UA3A 3SCTA 3VDBA 1FFRA 1WZKA 1WAWA 4H04A 2BVDA 3DYOA 3VIKA 3KWXA 1KQYA 4J3XA 2WMJA 2XFRA 1VBRA 2J4GA 2V3FA 4M29A 3WKZA 4AZ5A 4X9YA 2OWWA 1HJSA 1PPIA 3HN3A 1KR1A 1V3HA 4N42A 2XM2A 3PZQA 4D6IA 4MNKA 1E6RA 4QLLA 3JUGA 2VX6A 4GZIA 1QI0A 1E6NA 7CGTA 3MV01 4PCTA 4TVUA 3WNMA 3OGVA 4OOUA 1DWFM 3MU7A 3VMNA 1E6ZA 4FZPA 1B90A 1JGIA 4JFSA 2YL6A 4ZE5A 4ATWA 1NOUA 2VL4A 3AXXA 2WKLA 3RIKA 1BVNP 1EDGA 3TONA 3VIHA 2DPEA 1C90A 4GI9A 3PZ9A 4DUVA 5A69A 4PEEA 1C7SA 4Z2GA 1H0GA 4W85A 5E0CA 1EGZA 1B1YA 4WKHA 1JZ7A 5CSUA 1BAGA 1JZ6A 5EBAA 4GINA 4W8BA 4TUFA 4TOQA 1ISVA 2J7CA 2BHUA 1FOBA 1KGUA 3EBVA 1OIMA 2WCAA 2ZUUA 4BZYA 4MTVA 5E6YA 3TA9A 2PWDA 1B31A 1E1EA 1HKJA 1BVZA 3AHVA 5BXPA 3WEZA 3ZJKA 2J8GA 3GH7A 1GW1A 1UUQA 3CZKA 2RGLA 2EPLX 2WNWA 1W9UA 2CBIA 5KEZA 1ZBVA 4ZXOA 1J0HA 1PX8A 4AZBA 5BWFA 2YL5A 2FHCA 1PZ3A 1HL8A 3GM8A 1BYCA 3RM9A 3S2CA 1XSIA 5M03A 3AHXA 4PMOA 3GXDA 1EOKA 2ZUWA 3VU2A 4KWUA 3ZJ7A 4J3WA 2C0HA 4PTVA 4BF7A 1VB9A 4FK9A 1WCGA 5E0FA 4AISA 4QP0A 3GTNA 1MW1A 1KXQA 3MMUA 1DHKA 1J12A 1FH9A 3AIBA 1E15A 2GVYA 3ZR6A 4PTXA 2WVUA 2YKKA 4PMRA 5BRQA 2ZXDA 2AOSA 3UESA 4BS0A 2CYGA 4U3AA 1GOIA 4W89A 3AHZA 4U5IA 3WDPP 1US3A 4HOZA 4NSBA 1RD6A 1ISXA 2BXZA 4C7DA 1B30A 1WKYA 2W91A 4Z2IA 2ZX7A 1BPLB 5IXEA 3MMDA 2WKGA 1WZLA 4PRWA 3WQ5A 4IPLA 5FIPA 5DO8A 1CGVA 1GJWA 1UOKA 2E0PA 5A6SA 1W1YA 4CCDA 4UTFA 1KCLA 2UWFA 2DGAA 4IPNB 1VRXA 2BHYA 3AXHA 3WMSA 1MW0A 1QHZA 2E4TA 1FHDA 1R8LA 3BGAA 4EANA 1EHAA 4UFMA 3TTQA 1G01A 2WMGA 4MNMA 4V27A 3ARYA 3K4DA 3MSGA 4CU6A 4J3UA 1RP8A 5BROA 1W3KA 1PZ2A 3KL0A 3BAKA 2Q8XA 2WZEA 3SCOA 1E5JA 2CEQA 2DSZA 4H41A 1QNQA 1W9PA 2X8RA 5LA2A 3N04A 1UWIA 1M01A 2XUCA 4AIEA 5CSYA 4UZSA 1NWTA 3M6DA 1J0YA 1SMDA 2F61A 1CZ1A 3WF0A 3PN8A 1XH1A 1GVYA 3OIHA 3L4TA 3U7BA 1ZBWA 2QLYA 3IAQA 4KRUA 1HVXA 3BAWA 3BXWA 3WMCA 2XGIA 3FNDA 2DSVA 1XSJA 3VDCA 5ABFA 1ISYA 1OBAA 3CUJA 2NW0A 4UZUA 2HISA 1VAHA 2J77A 2WSPA 3TP4A 4IISA 3BCDA 2J79A 3BSGA 1C7TA 1H09A 4EAMA 5EMYA 1DWHM 1G94A 2J7HA 5JBEA 4AXNA 1BTCA 2UY5A 5GPRA 1NWRA 4HMDA 2GSJA 4X0NA 1FP9A 3I3EA 5JUVA 3WMBA 3U7VA 1IZKA 1Q6FA 2FDMA 1CLVA 4DUWA 3ECQA 4MPKA 3GBDA 2QMJA 2WVVA 1OB0A 4QLKA 3IK2A 4OJYA 5HNNA 3AZTA 4GO8A 5D8WA 5A6AA 3L2MA 3WEOA 2WAGA 3BCFA 1BF2A 2G41A 4GQQA 1E0WA 2WCSA 2BY3A 4PBGA 4EK7A 3WNNA 1F4HA 1QW8A 1PJ9A 4PMYA 3WF1A 5I77A 5ABHA 1EQPA 2XYLA 1V02A 1U30A 3UG4A 1XH2A 5E09A 2D22A 5A2AA 1IZJA 2WYSA 2DT2A 4ML4A 2FH8A 1KXVA 3WDQA 2E8ZA 2VRKA 1JDAA 1W1PA 3A4WA 4PMDA 3T08A 3VD7A 4H2CA 1C8XA 3ZSTA 3MMWA 2YLLA 4GPNA 4V28A 1QHOA 3SCWA 3WH7A 5JIPA 3WNOA 4WSKA 3SCNA 3FHAA 4KGLA 4FMVA 1E43A 2XWDA 4M1RA 2XWEA 1HKMA 3RDKA 3U57A 1E4LA 4PMNA 2WMIB 1QBAA 1H1NA 2G3MA 4DUXA 1PIGA 3PZGA 1A3HA 3WSUA 1H11A 2OSWA 3WDIA 5DF0A 5A6LA 4BCEA 1MFVA 4WLCA 3HJEA 1O7AA 3GNPA 2XIBA 5GNZA 3EDFA 3B8SA 2UY3A 2WPGA 3OGSA 3WQVA 2WVTA 3WQ4A 4GI6A 3K8LA 4D6FA 3KE0A 1W2PA 9CGTA 4IUGA 1JFHA 1GQKA 3A3HA 1JZ2A 2DH3A 3MO4A 1K6AA 2ZWZA 2VZSA 1XCWA 4A3YA 4PUEA 1W2VA 1BG9A 1ESWA 4ZXLA 3ZT6A 1D3CA 1KBBA 3ARWA 3AISA 2XGBA 3N17A 5IFTA 3VMOA 4XX6A 3WUBA 4HU0A 2FH6A 1OGBA 1UWSA 4D6HA 1IV8A 1OT1A 2CETA 4B16A 3ZO9A 4DWSD 3NCOA 2YDSA 4W5UA 2QV4A 2EO7A 4FF5A 1H2JA 1XRVA 2QMKA 4D6CA 4E4PA 2XG9A 2D23A 1AMYA 3PZVA 5A3HA 1TA3B 1SFSA 3WF3A 2GJRA 2XIIA 3FW6A 6TAAA 3VILA 3M7SA 4JL1A 2WCGA 1FHLA 2VZOA 2GK1A 1CGTA 1J9YA 1QBBA 4CCEA 2X0YA 4QLJA 2XSAA 3WN6A 2IXVA 3ARVA 3GBEA 2GJXA 1VEMA 5A6MA 1C3FA 2F2HA 2VCCA 2XVGA 1AQMA 3ZOAA 3S6TA 1E0VA 1RPKA 1UQZA 2G4FA 3GNRA 2J47A 5D4YA 5A8NA 2XM1A 4CGTA 1BYBA 3WDJA 3AMLA 2CIPA 1V3KA 3W24A 3W6LA 1TCMA 4P7OA 1LF1A 4EE9A 3ARPA 5A8PA 1HT6A 4W7VA 3VGHA 1PIFA 4UQEA 5CQ1A 3WQ8A 4AIUA 2PWFA 3VIJA 3N1AA 4CD5A 4LGXA 1GNXA 3GH4A 3N11A 1V6VA 4FLOA 3N12A 1WZMA 1C8YA 2PBGA 3MUIA 4UR9A 2Y8KA 2ZUTA 1GOOA 1HNYA 4U5KA 1W1TA 3VIGA 3VNYA 3WDRA 4DWSA 6A3HA 1EO5A 3NSMA 2E40A 1PEZA 3VGGA 7A3HA 4YHGA 5LYRA 3WQ6A 3CUIA 2A3CA 3L4XA 3WD2A 3UEQA 5CG0A 3BLPX 1CXFA 3W28A 3AZSA 4MJ4A 4JZ5A 4H8UA 4HMEA 4Z2KA 4OKDA 5HOSA 3WY1A 1SMAA 2JIWA 4TVDA 2VZVA 4X0VA 1G9HA 3HU7A 3AMKA 2CHOA 3MUY1 2G3NA 3CLWA 1UH3A 4B15A 1V0MA 2A3EA 2NT0A 2O9TA 4JCLA 4ACZA 3VD9A 1CWYA 3POCA 1IT0A 5I0DA 1JF6A 2WMFA 1JD9A 4MAZA 1GORA 2FGLA 3GXMA 1H5VA 2WANA 4P8VA 3AMDA 5DT5A 2YOCA 3M07A 4MJ2A 2CBJA 2QPSA 2V3DA 3WF2A 1JDCA 3WQWA 4BQ5A 5EFFA 5JBDA 4HA1A 8A3HA 2VMFA 3F4VA 1WDSA 1JNEA 1TMQA 4IM4A 4EKJA 1E0XA 4JIEA 2W67A 2J7BA 1B3ZA 1CEOA 3FXYA 2VOTA 2ZE0A 2JF6A 2E9BA 4MB1A 1LG1A 1MQQA 4BA0A 2FHBA 2WLZA 3EDJA 1UZ4A 3O9NA 2OYKA 2WXDM 4P8WA 3RMEA 4HOXA 1HP4A 2CKSA 3A4AA 1GOKA 3CTTA 4CD6A 2X09A 1MXGA 1R7OA 1J18A 1J0ZA 1E5NA 3GH5A 4HU8A 2BFGA 2EPKX 3A47A 5I79A 2Y24A 1GZJA 2WMHA 4AEFA 3PZMA 3CBWA 2JEPA 3ZQ9A 4M24A 1EO7A 3VD5A 4UOJA 1KGXA 1EOMA 2CCRA 1W9BM 1GCYA 4TTUA 3DHUA 1G1YA 3VIFA 3LPGA 3ZJ6A 3CZGA 4UQCA 3W25A 2ZUMA 1VENA 3DC0A 1CXKA 2PI6A 3KEHA 5DFAA 2VX4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VEP A;  4J9J A;  1TR1 A;  4L9Z A;  1TVP A;  3CKD A;  4DN1 A;  3OIX A;  4JTK A;  2IS7 A;  3H4W A;  3SY1 A;  5DXY A;  1W9V A;  1ZGD A;  2VD9 A;  4D1J A;  4ZEP A;  3T49 A;  2VNC A;  1L0P A;  1N8W A;  3PHA A;  5D9N A;  2J78 A;  2D0G A;  3ARU A;  2EBN A;  7TAA A;  2NXH A;  2WK2 A;  1TPW A;  2JE8 A;  3HGS A;  1TUX A;  2C0A A;  4J3S A;  3QY7 A;  4F0M A;  9XIA A;  2YZ5 A;  1AA1 B;  4TX6 A;  4JTJ A;  3VOG A;  4Z1A A;  6ALD A;  5F2I A;  1MWO A;  4JTF A;  1GQL A;  3T44 A;  3BO9 A;  1IR2 A;  1QNP A;  1XYZ A;  3MKV A;  2A7N A;  3RJY A;  3EKL A;  3IS4 A;  1HW6 A;  2DSK A;  3DG7 A;  3CO4 A;  1X1N A;  3RLH A;  3MVI A;  2D0F A;  4HIB A;  3G22 A;  4DJF C;  3OLG A;  3JR2 A;  4UFH A;  4NL1 A;  1UZ1 A;  2XJ7 A;  2BGS A;  1GQI A;  3S3G A;  2DW6 A;  3MKK A;  3A3W A;  5HPO A;  4PUL A;  4UTT C;  5D2W A;  1OD8 A;  3N6J A;  3GNX A;  4POC A;  2EQD A;  2QPU A;  1DP0 A;  3I68 A;  3TDF A;  2VYO A;  1DHP A;  1M1B A;  3BV7 A;  3COT A;  3R89 A;  1V6X A;  1JPD X;  2BXY A;  3BOF A;  4IID A;  2DSW A;  2ASH A;  1NDW A;  2Y70 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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