4AZBA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
425
structure length
408
Chain Sequence
NEKLAKKKIVSIDAGRKYFSPEQLKEIIDKAKHYGYTDLHLLVGNDGLRFMLDDMSITANGKTYASDDVKRAIEKGTNDYYNDPNGNHLTESQMTDLINYAKDKGIGLIPTVNSPGHMDAILNAMKELGIQNPNFSYFGKKSARTVDLDNEQAVAFTKALIDKYAAYFAKKTEIFNIGLDEYANDATDAKGWSVLQADKYYPNEGYPVKGYEKFIAYANDLARIVKSHGLKPMAFNDGIYYNSDTSFGSFDKDIIVSMWTGGWGGYDVASSKLLAEKGHQILNTNDAWYYVLGRNADGQGGGNLDQGLNGIKNTPITSVPKTEGADIPIIGGMVAAWADTPSARYSPSRLFKLMRHFANANAEYFAADYESAEQALNEVPKDAIRSLDSNLSRAQQDTIDQAIAKLQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 154
structure length 408
sequence length 425
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azbA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azbA01
2D2OA 1JI1A 3AJ7A 2VX6A 3VIGA 5E9AA 1GCYA 1XH0A 2Y2WA 4QLJA 1XYZA 4M82A 1QI2A 2E8YA 3K46A 4D6JA 1W9DM 4TVCA 1UWTA 3ZT6A 3QGVA 3PZQA 3IJ7A 3VIPA 1ISXA 1JYXA 1E40A 3VNZA 5A1AA 3MUZ1 4D6EA 1UWQA 1UR4A 1M03A 4KGJA 1VJSA 4UQEA 4HTYA 1C7SA 4M56A 1QI5A 1B0IA 2VQUA 3WEZA 4MJ4A 3EYPA 4CD8A 3IJ9A 5I3DA 1B31A 4QAWA 2FHFA 1TG7A 4J3XA 4B3LA 4PCTA 3CMGA 3UG5A 1EH9A 1UH2A 2WM0A 1KXTA 1MFUA 2W92A 1DWFM 3SCTA 4BQ3A 2AAAA 3M07A 2EO7A 2CXGA 3GH7A 3GM8A 2X1IA 3UR7A 4CD4A 1OT2A 3M7SA 3TTOA 2VT0A 1MVYA 3LPPA 3MMWA 2NW0A 1E15A 5BCAA 1HVXA 4AZIA 4N42A 3OLDA 2J7CA 4HA4A 5E09A 1B30A 3AHXA 5JUVA 5BXSA 3WNMA 3AXHA 3CHCA 3I3EA 1XYFA 4B3KA 1ZBKA 1C3FA 3LPFA 4GIAA 1AQ0A 3QR3A 2DT0A 4XB3A 3MSDA 1P6WA 3KL5A 1J0HA 1K9FA 1QNPA 7TAAA 1KR0A 2D23A 3WF2A 1JZ5A 2GUYA 2ZOXA 1C8XA 3A4AA 4AZHA 2DDXA 1JL8A 3U5YA 4DM1A 3W26A 3AZTA 1HJVA 2ZWYA 3CHFA 5BROA 1E6ZA 2WMKA 1LQ0A 1UD5A 2CEQA 1JAKA 1US2A 2FH6A 4D6DA 2PF0A 1B3XA 1E4NA 4W8AA 2A3EA 2YL6A 1C91A 2O92A 1KFWA 4W89A 4PUDA 1EDTA 3F5LA 3B9DA 3OIHA 4HOZA 1C92A 2G3JA 4J3UA 2W63A 6TAAA 1GVYA 1R85A 1QNSA 1QW9A 1SYTA 4URIA 2YOCA 5A6BD 3CZ8A 4AC1X 2VUYA 3AS3A 3EDEA 3UEQA 4ZEPA 3WQ4A 5A6SA 4CU8A 5GNZA 1GHSA 1W1YA 4ZFMA 3BLPX 1I75A 1BYBA 3GNOA 1BAGA 5D9NA 2E9MA 1JGIA 1ZJBA 1V3JA 1MWOA 2WSKA 1DEDA 1TE1A 3UR8A 2WHLA 1O7AA 3L4UA 2OYKA 4B9YA 3L4ZA 3VGGA 3OGSA 2WMFA 2VCBA 5A3HA 2XFFA 2PC8A 4YHGA 3FXYA 2X05A 1KBBA 5CLWA 3LMYA 1V6XA 3WF3A 1F4AA 1EGZA 1V0LA 5BWFA 1RD6A 3W6MA 3NUKA 3AHYA 3HN3A 3WQVA 1GW1A 1UYQA 1HJUA 1E0XA 1US3A 2E0PA 4MB5A 1UR8A 3F5KA 2CBIA 3II1A 1E4LA 1JF5A 2E40A 2GJXB 3TTYA 1JDAA 3A4WA 3MV01 3K4AA 3GNPA 3FY1A 2W61A 1NM9A 1RP9A 1WZLA 3DHUA 3PTQA 1CGWA 5AYIA 3WENA 2ZWZA 4XZBA 3AIBA 3W0KA 4P8VA 4PMOA 1EXPA 1ZU8A 5I77A 2BY2A 1Q6CA 5GNXA 1B1YA 2C7FA 1OCQA 1PPIA 3FHQA 1E3ZA 4CU6A 1UD2A 4DUXA 1NOWA 5HDRA 2WC7A 1V3LA 2E9LA 1SMDA 2G8ZA 4PMZA 1R86A 3AOFA 3T0DA 1FHDA 1BG9A 4U5KA 3MMDA 4PMXA 2YDQA 1ZL1A 2F61A 2ZE0A 4P7OA 4DUWA 4H8VA 3CZGA 4OBRA 3BSHA 4GZJA 4W5ZA 1R7AA 3GNRA 3QHNA 4B16A 1WP6A 2EPMX 1KGXA 5IDIA 2Y8KA 2ZUVA 4CCDA 1HJQA 1V3HA 3DYPA 5M5DA 5HOSA 3PZ9A 1L8NA 2VCCA 2CPUA 2EXOA 4W88A 2G3IA 1MXDA 3N9KA 1UWRA 3KEHA 3WN6A 5AYBA 2VX4A 3AISA 2DIJA 4JFTA 1E43A 3WNOA 8A3HA 1KBKA 2TAAA 1E4MM 2ZXBA 5FL1A 5CGTA 2BV9A 1HJXA 1FH8A 1QI0A 2O9PA 5FKYA 3SCNA 2VQTA 2V38A 3SUUA 1HKKA 5HBFA 5CGMA 5LA0A 2Y8VA 5E70A 5ABHA 1XHGA 2VZUA 4D1IA 3VDBA 2WNWA 1BF2A 3ZSTA 2W67A 5IXEA 1YQ2A 4X9YA 3PZMA 3ZR5A 1MW3A 1M7XA 3W25A 3G6MA 1GJWA 5D8WA 2ZX9A 2RGLA 3T2PA 1JYNA 3LPGA 3D3AA 3I3DA 4DWSC 1WZKA 3ZO9A 3IANA 1E0VA 1CXEA 4AISA 3N04A 3VOCA 3VGDA 4NRRA 4AZ6A 5CG0A 2XIBA 3AI0A 2JALA 2X09A 3IAQA 1VB9A 2W5FA 4U5IA 5A2AA 4GQRA 2D0GA 1GOKA 2VZOA 4OUEA 4J3SA 1JFHA 1UKSA 3JUGA 3ARXA 2VZTA 4PUEA 4M80A 2ZX5A 3OLGA 1BVZA 1J10A 2CHNA 4JFSA 1LJYA 2CKSA 1EDGA 3CUHA 4J3WA 2GVYA 4CGTA 1W3KA 2J7GA 5GQBA 4FK9A 2Y4SA 2WK2A 2JIWA 1UOKA 1FP9A 2VNCA 4NF7A 4GXPA 1W9PA 1UZ4A 3ZOAA 1LG2A 1LL7A 1W2PA 1H4PA 2CBJA 3AIRA 4IUGA 3CMJA 2W91A 2VRQA 3VIOA 3VD3A 3L4XA 1GOWA 5IFPA 4A3HA 3CZKA 1B90A 2V3FA 3A3HA 2A3CA 3ARZA 2XVPA 3TA9A 4KMQA 2XM1A 3N18A 4MAVA 4JKMA 4PMNA 2C8NA 2JFEX 2ZIDA 1NARA 4PMVA 4J28A 4AZGA 1ECEA 1OSEA 4CD7A 5DEZA 3K8MA 4E8DA 4CN1A 2CYGA 3CZLA 5EFDA 4WIWA 4ZE5A 5AC5A 3ECQA 5EFFA 2Z1SA 3TOPA 3TTSA 1G01A 3T2QA 1LWHA 1UD4A 2WC4A 2XSBA 4HU0A 3ZT5A 2CNCA 2WWDA 4DM2A 4GO9A 4F8XA 1GPFA 3MUY1 2DEPA 4AZ5A 3AIWA 4JCMA 1RH9A 5DO8A 3AHTA 5EB8A 4PMUA 2VVNA 2XGBA 3WMSA 4BZYA 1AMYA 2UY5A 3GXDA 2J7BA 4W7UA 5FL0A 4M29A 2WHMA 1CGYA 1D3CA 3VGFA 2A3HA 4XV0A 1HNYA 1ITCA 4KWUA 1UZ1A 1GOQA 3EBVA 4WF7A 4AD4A 3MUAA 3WQWA 4XZWA 1B3VA 1ITXA 3N12A 4UFLA 3MU7A 1UR0A 1BYAA 3AMCA 3CZEA 3SCQA 1JNDA 1E56A 2WAGA 4JFVA 2XFRA 1MXGA 1HXJA 3AICA 3W28A 3KZSA 1OBAA 1OB0A 3WNKA 5A6BA 3SIMA 4ACYA 2XJ7A 2ZXQA 1R87A 3RJXA 5CPSA 1E6XM 4OOZA 4R27A 3CHEA 1QPKA 1NQ6A 2YL8A 1CLXA 3PZNA 1U2YA 3WFZA 3PZTA 2WVVA 2J8GA 1GQLA 4HZ7A 3WDHA 1V6WA 4WLCA 2FDMA 3MS8A 1V02E 3WF1A 2VTFA 4M8UA 4PRWA 3BH4A 3HJEA 3LPOA 1PX8A 4MAZA 3AHVA 4IPNB 2BY1A 1CIUA 1W1TA 3VMPA 2ZUNA 5HNNA 3VDHA 4KRTA 2V3EA 4MNKA 3OGRA 3WQ5A 4AY1A 3W27A 1BHGA 3AXXA 1EOKA 4UR9A 4PSRA 4TTGA 1SFSA 1J9YA 2WXDM 4BQ4A 1PAMA 1ODUA 1B3YA 4LQ1A 5JBDA 3VMOA 3RM9A 4WSJA 3FAXA 1WAWA 1XD1A 3VD9A 3PZGA 1LL4A 2EPOA 3MUIA 2DSKA 1GJUA 3WL1A 5A94A 1HIZA 1W9UA 2HISA 3POCA 4D6CA 1QI4A 3AQUA 5CLTA 3NSMA 2B31A 2DPEA 2NT0A 3RO8A 4W87A 4UFJA 1JNEA 1E1FA 2WBKA 3ZJKA 3VIIA 2D0HA 4OZOA 1MW1A 1W9VA 4S3JA 1PEZA 2D3NA 2WB5A 4KH2A 5E6YA 3D5HA 2GFTA 3F4VA 2IUZA 1V03A 5DT5A 2WCSA 4TXEA 3N11A 3WUGA 2JNKA 3EMCA 3O9NA 1I1WA 1VBUA 2ZUTA 3BCFA 2Q8XA 1E3XA 3MMUA 3AYSA 4H04A 4BF7A 3MSGA 4ATLA 1QNRA 4CU7A 3NDZA 1QHOA 4LPCA 2CBVA 3VIFA 4BQ2A 1UQZA 1UWSA 1LG1A 2ZX8A 4UOQA 1FA2A 1QW8A 4RE3A 2WKLA 3QHMA 2WLYA 5A8MA 2J7HA 4U3AA 3AZRA 3W81A 1J11A 1OT1A 3WBAA 2EBNA 5M3WA 3K8LA 5AC4A 2WZIA 1XC6A 2YLAA 4GKLA 4Z2LA 1HX0A 1NOUA 1NOFA 3BXWA 2AOSA 2G3MA 2O9RA 1OINA 2VMFA 1B2YA 1J0ZA 4IISA 1JG9A 5D8ZA 3CPUA 1LLOA 3PZVA 3VGEA 4D1JA 2J77A 3THDA 4K68A 1HN1A 1TVPA 2X0HA 4AZ7A 4AIOA 3K8KA 1Z32X 3KE0A 2V3DA 2G41A 3WNLA 5A2BA 2D20A 3WH6A 4PSPA 3WNNA 5IFTA 2DSZA 5IHSA 4W85A 5JBFA 1X6NA 1E73M 4JAWA 3AZSA 4AMCA 3PZUA 1QBBA 1ISYA 1CGVA 2JEPA 4JHOA 1OGGA 1UWUA 4UFMA 3VPLA 1GOMA 3BAKA 4P8XA 1KWGA 1CECA 4UCFA 2UY3A 4R5EA 1TFVA 3VX1A 2YBUA 5DFAA 4TUFA 2QLYA 3T2OA 4JZ5A 2YLLA 2DGAA 3DYOA 1CPUA 1YHTA 3AS0A 4P8UA 4CN6A 5ECUA 3VDCA 3OG2A 4UQBA 2JEQA 4GQQA 1NWUA 4JFWA 5E0CA 3A47A 1V02A 3S2CA 1Q6GA 3OLEA 4HZ6A 2WANA 4W84A 2DIEA 5D4YA 2ZXDA 3BAIA 4AIEA 3GZAA 3W6LA 1MYRA 4OBSA 4PMRA 1BSIA 3W82A 3W53A 2XYLA 2OYLA 1N82A 3T0BA 3KL0A 3CH9A 3UERA 1H1NA 5E6ZA 3SURA 1CEOA 2JE8A 5CSYA 2WVVB 1J0YA 3GDBA 4E8CA 1BYDA 2WHJA 1EIBA 4MNLA 1NWTA 1VFUA 1C93A 1V08A 3WUBA 1BG4A 4F9JA 1CNVA 3OZPA 3CUGA 3WQ6A 1B9ZA 1KGWA 1PIFA 3WD1A 2XWEA 3RILA 3GXFA 3ARTA 1WKYA 2YDRA 3NSXA 1CGXA 4GI9A 4AIUA 3WMCA 5C70A 2J79A 4J3VA 3SCUA 4MNMA 2J7DA 4PMDA 1V3MA 2GJRA 1X1NA 1ISWA 3HMCA 4HA1A 4HP5A 2E4TA 1W91A 3ARVA 4E2OA 3NYDA 4LGXA 4BQ5A 4JFUA 1UKPA 3DC0A 3RIKA 1E6QM 1UH3A 2O9TA 2XIIA 1JZ4A 1Q4NX 1XCWA 4WJXA 5I5RA 2YDSA 2Z1KA 4H2CA 1TMQA 3VILA 1IV8A 1HKJA 3OA5A 4MTVA 2ZX7A 3OBAA 2Y24A 4HOXA 1S46A 4LYPA 1QNQA 4PMYA 2QV4A 4HPGA 3GBEA 2C0HA 1DWGM 1EO7A 3WQ8A 1E5NA 2WVTA 2OWXA 2BVYA 4UFKA 1UD3A 2CERA 2DT1A 1ZJAA 4UQ9A 5D9MA 1B3ZA 1EDQA 4NZCA 3WF4A 1XSJA 4U3CA 1NP0A 4Z2KA 2PI6A 2PB1A 4E4PA 1JZ2A 1D7FA 1W9BM 3N17A 2XUCA 4OJYA 4RE2A 1AQMA 2BXYA 3ARWA 4YHEA 1XD0A 1G1YA 3RCNA 2YA0A 3KL3A 1TUXA 4U31A 1JF6A 1V0MA 3SCRA 5A6AA 2WLZA 3MANA 1HJSA 1JDDA 1C8YA 1CDGA 5HXMA 3WH5A 1CGUA 2WCAA 4PMQA 4MDPA 3QHOA 3CGTA 4TX6A 1JFXA 4CVWA 5BYWA 1H0IA 1OD0A 4FLSA 4QCFA 2PWGA 3ZQ9A 4WKFA 1H09A 3PBGA 4WK9A 3BAWA 4GZIA 4TOQA 1CGTA 1JXKA 1QOXA 1UQYA 3EMQA 3CZJA 3VDAA 2QMJA 2BY0A 2VL4A 4CUCA 1TA3A 2VX7A 3FN9A 1V6YA 4FLRA 2WPGA 3AMKA 2W4XA 5ABGA 1GZJA 5I78A 3I3BA 1WDPA 1AVAA 1VRXA 3CO4A 5TD4A 4TVDA 2WSPA 2VRJA 1DHKA 1HL8A 1ZBCA 4WSKA 3M46A 4Z2JA 3GH5A 3VIJA 1TVNA 1QHZA 1WE5A 3GYCA 1E6SM 1Y7VA 2ZUUA 4HMCA 5BXPA 2UY4A 1V6VA 5A6LA 4EKJA 1XH1A 2PBOA 2ESCA 2YA2A 1KWKA 4TX8A 4P8WA 1OD8A 4GI6A 4HMDA 4MB1A 4NSBA 5A6JA 4A4AA 2VJXA 5LYRA 3O6AA 2WC3A 3O2LA 1JDCA 1XCXA 5CPTA 3WD0A 2V5CA 2WMHA 3VU2A 3B9EA 5A69A 3KWXA 3CUIA 1E9LA 4MB3A 3U5UA 3BC9A 4GI8A 1E72M 4UFHA 4ACZA 4J27A 3E1F1 3W4RA 2XVNA 1TCMA 4KGLA 1XRVA 3VGBA 4X0VA 1C8QA 1DWAM 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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