4AZGA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
418
structure length
411
Chain Sequence
RGSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKISKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 161
structure length 411
sequence length 418
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azgA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azgA01
2JALA 1WDSA 1E40A 3SCOA 3T2QA 4PBGA 4AXNA 4CGTA 2A3AA 1SR0A 5D8ZA 1JZ5A 1QI2A 3RMEA 3A4WA 3GBEA 3BLKA 2VMFA 2ZX9A 1WZLA 3RDKA 3GXFA 3U5UA 4GI8A 2O92A 4ZXLA 1BFNA 2BVYA 4IUGA 1CIUA 1V3KA 2YDQA 1WP6A 1CXHA 4U3AA 2J8GA 4CD7A 5M03A 3VINA 4KGLA 4OOUA 2HISA 1BVNP 4DM1A 5FL0A 4CVWA 1WDRA 4JFSA 3BXWA 5DFAA 4W7UA 2VCCA 3AQUA 1WNOA 3HU7A 1HKJA 3ZT5A 1LL6A 3CHCA 3WNNA 3PZ9A 1VB9A 4M56A 3AI0A 3WFZA 1IZJA 4KWUA 4TVUA 2OWWA 4E2OA 2BVDA 2VOTA 1ISYA 1UZ1A 3WF2A 3NSNA 3WF0A 5C8BB 1BHGA 1V3IA 2MANA 2ZIDA 3CHFA 1KWGA 3AZRA 5HPOA 4QAWA 2XWDA 1XH1A 1YHTA 3B8SA 2GUYA 3F5LA 1UWRA 1CECA 1UA7A 2BY2A 3QOMA 5CLTA 1JF5A 1JZ2A 4HZ8A 2GSJA 1XHGA 4MAVA 4QLKA 1VFOA 3VGEA 4OBRA 1NP0A 1K9EA 1IZKA 1LWJA 2QHAA 4PMZA 1B31A 5FL1A 4W85A 2D0HA 4UFMA 3EDKA 2WAGA 1CLVA 2VX7A 1JXKA 3VD5A 3VX0A 2QPUA 3VKKA 1DEDA 2WBKA 3ARRA 3BH4A 4J28A 1V3MA 1EXPA 2WZHA 1ZB5A 1JZ3A 1B3WA 2EPOA 1B3XA 3T09A 2Z1KA 2Y5EA 2WVVA 4HPHA 4RE3A 1E6ZA 3WQ5A 5DEZA 2VZVA 2WVTA 1TE1A 1XSJA 4AD1A 1Q6EA 1E71M 3AFBA 1J0YA 4W89A 5BXTA 3OZPA 1H09A 1HNYA 4Z2GA 5BXRA 3UETA 3RJXA 2WMIA 1AVAA 4CN4A 1JIBA 2NT1A 1QI5A 4MPKA 1V6VA 3WNOA 2AMGA 4W8AA 1E6XM 2DSVA 1DWIM 4Z2HA 2J79A 1W9XA 4PYSA 2WBGA 3VDBA 3AOFA 3CUHA 3O6AA 3WEZA 2C7FA 3IJ8A 5D8WA 2W91A 4HZ6A 3ZJ7A 5HXMA 5DO8A 2PWDA 4QCFA 4Z2JA 4PTXA 2FGZA 3BAIA 5D9NA 1FHLA 1J0IA 2XSAA 3AICA 5A1AA 3WUFA 3N9KA 4UTFA 4TX6A 1GJWA 4FLQA 1J01A 4GI6A 3QOKA 3W37A 5D9MA 1JYWA 4MADA 2DGAA 4XB3A 1B1YA 4DUVA 1B3YA 3VTRA 3FW6A 3GH4A 1M03A 1HJUA 1HKKA 2CBVA 1F4AA 2JFEX 3SUUA 1HVQA 5I77A 4CD8A 3B9EA 4ATDA 3ZSSA 2QF8A 3EBVA 2Z1SA 1UR9A 4JKLA 3F4VA 3BAWA 2ZUWA 1TG7A 2OYLA 2YDRA 1SMAA 2EEXA 2GK1A 3WF1A 2DT2A 2CHNA 3EDDA 2YBTA 3ZOAA 5IDIA 2XVKA 1UWIA 4M82A 2YA1A 1LLOA 3KL5A 3L4XA 3AIEA 2O9RA 3ARQA 4YN5A 1W1VA 2FH6A 1OD0A 1V08A 3IJ7A 4BCEA 2WC3A 2YA0A 4AD5A 3UR7A 4OUEA 1JG9A 2ZXDA 3PZNA 2CETA 4U5IA 1FHDA 2DH2A 4Y7EA 3AYRA 4V27A 5EFDA 4FF5A 5A2AA 1E6RA 2DSWA 5KZ6A 2XFFA 3WSUA 3CUIA 4AD2A 3PZQA 1CGTA 2JE8A 5LA2A 4MTVA 1ISWA 1FH8A 5I5RA 1JD9A 3AIVA 4PMYA 3AJ7A 4RE4A 1BGAA 4WJXA 1WAWA 5D9PA 5A8MA 4GINA 1GVYA 3TA9A 4P8XA 1QW9A 2A3CA 2ZUTA 4PCSA 3AHXA 1E0WA 2PB1A 3WH7A 5JUVA 1Q6CA 2VX6A 1QHOA 1NWSA 1E70M 4MNKA 5I3DA 4PSPA 1PX4A 4U3CA 1GOOA 1NWRA 5E70A 3VIOA 4OZOA 1CEOA 2W92A 4R27A 1TUXA 1H1NA 1V3HA 2Y8VA 1JYNA 1QVBA 2J7DA 3VGBA 4CD5A 2YL6A 2CKSA 3KL3A 1PX8A 4HTYA 5E6ZA 1MQPA 3LPGA 1QI0A 4A3HA 3OLGA 3MV11 2IXVA 3KE0A 1PZ3A 1PJ9A 1KGXA 1EGZA 3TTSA 1MW1A 4BZYA 2B31A 3EDEA 4AEFA 1PIFA 4YHGA 2ZUMA 4PEEA 5A6MA 3BAYA 1HP4A 1OM0A 3CHDA 3WNPA 4U31A 3LMYA 1GOKA 4M81A 3I3EA 1FFRA 3GBDA 4ZENA 1ITXA 3VX1A 1NQ6A 3AS3A 3UG5A 1V02A 3K8LA 2G41A 1VFMA 4WLCA 3VO0A 1KCKA 3RILA 3ARTA 5JIWA 2J7CA 3MKKA 2VJXA 3VIFA 4GXPA 3WMBA 4GZEA 5E0CA 2WHLA 1C8QA 2HVMA 1LG1A 4JHZA 1M7XA 2J25A 1J0ZA 1GORA 2XIBA 1VFFA 2WHJA 1C7TA 1ITCA 1C93A 3T2PA 1VJSA 4UQ9A 1W1YA 1E6PA 1RP8A 4N42A 3BSGA 1A47A 4C7FA 3APGA 1W3LA 3M6DA 5JBFA 2DPEA 5A6KA 2F8QA 4UOJA 3AROA 1J11A 3GNRA 1V6UA 1E0XA 2YA2A 3CO4A 1UA3A 3ECQA 1M04A 2W63A 5GNXA 4HOZA 3BGAA 1G5AA 1QNOA 1R85A 4NSBA 2GVYA 1JDDA 2YDSA 2BY3A 3VD7A 2WMHA 1E3ZA 1XYZA 2CBIA 3VIJA 1E1EA 1E43A 1UWQA 4NRSA 4PMVA 3GXMA 4PMRA 3RIKA 2BHYA 1TMQA 2DIEA 1BPLB 1BAGA 1PBGA 2WK2A 3WH6A 4P7OA 3FXYA 1E5JA 1DWFM 2XVPA 2DSZA 4QCEA 4CU8A 1MQRA 1KWKA 3CHEA 2WWDA 5CG0A 4W88A 2XG9A 1C91A 4J3SA 2X09A 1E5NA 2UY5A 4EANA 2CCRA 1W3HA 1E15A 4H8VA 4PMOA 4U5KA 1ZL1A 1S46A 1UKTA 4JFVA 4KMQA 3K46A 2VX5A 3WIJA 1IT0A 3W24A 1I1XA 3ZT6A 4M29A 3ZO9A 4KH2A 2NSXA 5A6JA 5HDRA 5ABEA 2WWCA 2X05A 1E6QM 2NT0A 3W0KA 2WCAA 3SUVA 5GPRA 3ARWA 3EMQA 3THDA 2A3EA 2WVUA 1NH6A 1CYGA 1NOFA 4D6HA 3VGFA 2WKGA 4MNJA 5EBAA 1A3HA 2YJQA 4LX4A 1I1WA 3BAJA 1E0VA 5BROA 3VD3A 2D22A 4ATLA 4ML4A 1CGVA 1W9PA 1J9YA 1ODZA 3WH5A 1GUVA 2J47A 2OYMA 4D6DA 5I0DA 3SURA 1BYCA 3AIBA 4E8DA 1CLXA 5C70A 1I75A 3SCNA 4UQBA 2JEQA 8A3HA 1US3A 3EMCA 3VGHA 4Z2LA 1KR0A 4YPJA 2PBGA 3AMGA 1E4IA 1NWTA 2WHMA 1C7SA 4L4PA 4QDMA 3G6MA 2OO2A 4UOQA 2VRJA 1TZ7A 2ZX5A 5A3HA 2DT3A 2XJ7A 4W87A 4F8XA 2WMKA 1C90A 4CCCA 3MSGA 1HN1A 1QW8A 2DIJA 1B2YA 3THCA 1J18A 2CESA 3NIYA 3NYDA 3MSDA 5A8OA 1R7AA 3UG3A 1PEZA 1J0JA 1HJXA 2WB5A 2TAAA 3LPOA 3CPUA 1GOMA 1HP5A 2EQDA 3VU2A 5I79A 4TX8A 3MUY1 4XV0A 2V3EA 1RP9A 2GJXB 3WQ8A 1SMDA 4CCEA 3WBAA 1M53A 3T0AA 1CBGA 1WDPA 1V0NA 1LQ0A 2AAAA 1GQLA 1MYRA 1DWJM 4AIUA 7CGTA 3AXIA 1QNQA 4WKHA 1GOQA 2ESCA 4OOZA 1GPFA 2VR4A 4MB1A 3ARPA 3WH8A 9CGTA 4D72A 3K1DA 4U2YA 1D3CA 3G6LA 4MB4A 4P8VA 1JNDA 2WSPA 3U5YA 1W3KA 4PCTA 3PN8A 1UR0A 4OJYA 5A6BA 1W9UA 2ZX7A 3ARZA 4AZCB 1C8XA 1Q4NX 1US2A 3BAXA 2D0FA 3KEHA 1XRVA 5A2BA 2CBUA 3BSHA 1W1PA 3BAKA 3GNOA 4CU6A 5JIPA 3S2CA 3IK2A 5DMYA 5LA0A 3KZSA 4M1RA 4QLJA 2E40A 2WC4A 3CZEA 4U2ZA 1EDGA 5E6YA 4YHEA 1UG6A 5IHRA 4FMVA 4JIEA 1E4LA 5AC5A 2VURA 3FN9A 4UCFA 2G3JA 1DWAM 1MW0A 4TVDA 4JFUA 3D3AA 3W26A 4HU0A 4RE2A 2OSWA 3VIGA 3A47A 2ZXQA 1H49A 4AZ6A 3DYOA 1K9TA 3PHAA 2EPKX 4DUWA 3NCOA 4JKKA 2XUCA 4J3UA 1D2KA 1E73M 1TA3B 1JD7A 1VBUA 3O9NA 4BQ3A 2V38A 3AISA 1JDAA 2DH3A 1GOWA 3ZJKA 5JBDA 2JF7A 4F9JA 1AQ0A 5FOOA 1KXQA 3HN3A 2FHBA 3WNKA 1VAHA 1WE5A 2E0PA 3BLPX 3WNMA 4HZ7A 1FH9A 3VDAA 1OT2A 2GDVA 2WMJA 5A95A 4NF7A 5LA1A 1JAKA 1L0PA 1XSIA 3T0DA 2D3NA 1U33A 4LGXA 2CPUA 1FP8A 4TXEA 3CZ8A 5CLWA 4J3WA 1KQYA 1QBBA 1E6SM 3IAPA 4FK9A 3RM4A 1UH4A 3CZKA 2VRKA 3TOPA 2PMRA 5A69A 4J27A 2WNWA 1G0CA 3AIRA 2XVLA 1UWUA 3GXIA 1G01A 3NSXA 4L4OA 1OIMA 3TONA 2XHYA 4UNIA 5D4YA 2JIEA 4RL3A 1GQJA 2A3HA 3AHVA 3ZR6A 3GTNA 3M07A 1UR4A 3WUEA 1RPKA 2G3NA 4CN1A 1CXEA 1W91A 2CITA 2ZXBA 3UESA 2OYKA 2VC9A 4NI3A 4GI9A 1OT1A 4PMQA 1E3XA 7TAAA 1V0MA 3UCQA 4AZGA 5E09A 3SEPA 2J7FA 4P7NA 3HMCA 1OB0A 3ALGA 3CZGA 1XH2A 5M17A 1VJZA 5A6BD 1GOIA 3WN6A 4H04A 1O6IA 3FHQA 3RM8A 3VGGA 2RGLA 4DWSB 4H2CA 4CN6A 4U33A 2J8FA 3POHA 3M7SA 4MAZA 3A6OA 2J7EA 5A8PA 1J10A 3PBGA 2XIIA 4Z2KA 3WL0A 2W62A 4CD6A 2D0GA 2E8YA 4QLLA 2ZWYA 3WDPP 3WELA 4XZWA 2YLLA 4GKLA 4N0RA 3N15A 1GQIA 1XD0A 3CLWA 3BC9A 5IHSA 4BS0A 1EOMA 3BMVA 3T2OA 1LL4A 4XUYA 3AHTA 3F5KA 3WD2A 2NW0A 1W9BM 2ZUSA 1JDCA 5BRQA 3LPPA 4S3JA 1QNSA 1EDTA 3AHYA 3DECA 1OGBA 5FKYA 2E9LA 2JNKA 1WO2A 2RGMA 3AZSA 5CXPA 5ABFB 1MWOA 4GZIA 1OSEA 1K6AA 2WCGA 4WK9A 3CBWA 1JF6A 4LYRA 3VNZA 3MUIA 5ABGA 1XCXA 3N17A 1EQCA 3L4ZA 5BXSA 3QR3A 3L4VA 3K4AA 1F4HA 2CERA 2VZUA 1B30A 2V5CA 1SFSA 2XGIA 1BG9A 2Y24A 2VZOA 4FLSA 1W1TA 3QHNA 3K8MA 3W25A 2WZEA 1DP0A 3WF4A 2J77A 2VVSA 4H8HA 1VEOA 3TTYA 2J4GA 5IXEA 4CCDA 4D6FA 5I2UA 1W3JA 3PTMA 3TTQA 1EDQA 1UUQA 4UFJA 6A3HA 2V3DA 1BSIA 3N13A 3VD9A 5CZKA 1PIGA 2WPGA 4B9YA 1FA2A 2G8ZA 3AMDA 1CXLA 3K8KA 1ODUA 2QMKA 4J7RA 3I3BA 1TVPA 4F79A 4MNLA 1VBRA 2G4FA 3ARYA 4HA4A 4P8UA 3FHAA 3OIHA 2GJXA 3VIMA 3CZJA 2V3GA 1ZBCA 1NOWA 1UD8A 4J3XA 2Y4SA 4UZUA 3PZUA 1OBAA 1WB0A 1VEPA 2PWGA 2E8ZA 4V28A 3BCDA 4D1JA 1MFVA 2ZUVA 1CTNA 3U7BA 3IANA 2GJPA 4XZBA 2VZSA 5BWFA 3VDHA 3MO4A 4AZ7A 2VRQA 5AY7A 3EYPA 4DM2A 4IISA 4UFLA 2JIWA 2EO7A 4AD3A 1C8YA 4HMCA 5A8NA 1BLIA 3OZOA 3AHZA 4HU8A 4PUEA 4QFUA 1AQMA 2DSKA 2DT1A 2YIHA 2YBUA 2J74A 1UYQA 3PZIA 4AZCA 3CIVA 3ZQ9A 5EB8A 1V6XA 2WCSA 1BYAA 2UY3A 4WIWA 5DF0A 3WDRA 2W4XA 3W6LA 2EPMX 1KQZA 5AYIA 2DDXA 1MW3A 4W5ZA 3AXHA 3AXXA 2VNCA 4W8LA 4W7WA 2EPLX 2J7BA 1JZ4A 2VCAA 1VF8A 4AEEA 1YQ2A 2OSXA 1HJQA 3CMJA 4JL2A 4X9YA 1UD4A 3WQWA 5EMYA 1H4PA 3BCFA 1Y7VA 3OGSA 1HL8A 4D6GA 1JI1A 4AC1X 3FAWA 2CNCA 1B0IA 3OG2A 5JBEA 1LWHA 3ZSTA 1TA3A 4A3YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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