4AZHA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGGGFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPTNLEGYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAALQGLKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 163
structure length 421
sequence length 421
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4azhA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4azhA01
3NIYA 3BMWA 1P6WA 4W7VA 1GQLA 1KBBA 1XV8A 2WSKA 5JIWA 2X1IA 2CIPA 2WW5A 4DWSA 3TP4A 1B9ZA 1GOKA 1HL8A 1VIWA 1L0PA 1WAWA 4J27A 1L8NA 2ZUNA 4AMCA 3PZOA 1IZKA 3ZR5A 3BLKA 3L4VA 4OUEA 3WH9A 2VRKA 3T09A 4FF5A 1V6WA 3N12A 4N0RA 1H4PA 4HA3A 1VF8A 3VD4A 5JBFA 2WHJA 2WWCA 1W9PA 3U5YA 1DWJM 1JAEA 5HNNA 1ZJBA 4JKLA 3L4YA 3WL1A 1GVIA 5EBAA 4UQCA 3RCNA 3DHUA 1JD7A 1GJWA 4CU7A 3A47A 4CD6A 5BXTA 4HU0A 5A6LA 4UOQA 5A8QA 1HXJA 4HOXA 1JDAA 1J01A 2PF0A 2DT1A 2WPGA 5E0CA 4ZFMA 1E6XM 2QPUA 4W8AA 5A69A 4YN5A 4JIEA 1SYTA 2DIEA 4KGJA 1AQ0A 1JYWA 4UQBA 3SCNA 2J77A 3ZJ6A 1EXPA 1E40A 1E6QM 4PCTA 3IJ7A 4QLLA 4A3YA 4U3CA 4D6EA 1UHVA 1E3XA 2DIJA 4D6CA 3QGVA 1JYNA 3AIVA 4M24A 2PWGA 1V08A 2FDMA 4W5ZA 5A95A 4QDMA 3ZT6A 5C8BB 3WD0A 3CZEA 4DWSD 3WL0A 3AISA 1TVPA 3W4RA 4HZ8A 2BHUA 3CUFA 2BY1A 1K9TA 4JAWA 1LG1A 1BVZA 3SUUA 3SUWA 4AC1X 1TMQA 1OWQA 4J3VA 3MV01 4HP5A 3A3HA 1CGWA 2D3LA 3FHAA 2OYKA 1LJYA 2G4FA 3WBEA 1KWKA 4D6JA 1FH8A 1B1YA 2VCBA 3ARUA 3GDBA 2EPMX 2C7FA 1QNOA 4CGTA 3ARTA 4CN6A 1H09A 2TAAA 2FHBA 2W62A 1CLXA 1JG9A 4OOZA 2D20A 4W7UA 3NDZA 3KEHA 2Y8VA 1E71M 1ODUA 4M29A 1GQIA 2VZUA 4PTMA 2J25A 2WMJA 3CHCA 1S46A 1E1EA 2CCRA 2E9LA 4PEEA 2VTFA 3WD3A 1JZ7A 2WMFA 3AMCA 2WMIA 1JL8A 2WLZA 1XGZA 4UTFA 1VENA 3PZIA 3MSGA 4D1JA 5GNZA 3KL5A 4W86A 3SUVA 2A3AA 4P7LA 1Q6FA 2ZXBA 4GZJA 3ALGA 2OZNB 1DWHM 2WC4A 4CUCA 5CPSA 4PRWA 2BY3A 3CZJA 3K8LA 3VU2A 1UD5A 1V6YA 1CGTA 1BG4A 3BAIA 3BAWA 2ZX5A 2EEXA 1V6VA 4XB3A 1ISVA 3EMZA 4PMDA 4P8VA 1OT1A 2VX4A 4M81A 5A94A 2D24A 4DWSC 3VIGA 1CZ1A 5DT7A 2BVDA 2WSPA 3ARQA 3A4XA 3WENA 3VIIA 2WZHA 3PTKA 3SURA 1OT2A 2WKGA 1EDQA 3PHAA 4YHEA 3MUY1 1W1PA 3VDAA 1PZ2A 5ABFB 5EB8A 1BLIA 2OYMA 1HT6A 1UR0A 3ZO9A 1UD8A 3VUPA 1EO7A 5I3DA 1PIGA 2EBNA 2VT0A 4HA4A 1ZB5A 3OGSA 5A8NA 2DSVA 3FXYA 4JKMA 1DP0A 2JE8A 1JI2A 8CGTA 4MNLA 3U7VA 3GM8A 3AS2A 4ZXLA 3QOMA 2WKLA 2X8RA 3VILA 2DSZA 2O9PA 2W91A 1LWHA 3PTQA 2VVNA 1DWAM 2WZEA 4AZCB 1QBAA 4W85A 4TX8A 3L4WA 1VB9A 4W89A 1RPKA 4CCCA 1C8XA 3JUGA 1BGAA 2XG9A 3GTNA 3WNPA 5I6SA 2CBUA 5BWFA 3CLWA 3VDBA 1K9DA 2YKKA 2JEQA 1EDTA 1W9UA 1H3GA 4P8WA 5A8OA 3W0KA 4CD5A 3BCDA 1IT0A 2O9OA 4V28A 4GZIA 2CXGA 3WEOA 4PMXA 5IDIA 3GNPA 3EDDA 2GSJA 1KR1A 2YOCA 2DT2A 1E4IA 5CQ1A 1E6ZA 5HDRA 1FOBA 3VIOA 2XGBA 3FHQA 3AIBA 1JNEA 3LPPA 4TX6A 1E6PA 1SFSA 1GHSA 1WDQA 3WNLA 4MPKA 1XC6A 3N1AA 4ZE5A 3AIQA 4JFVA 3AI0A 4QAWA 1BVNP 1VFFA 2FH6A 5C70A 2WANA 1B30A 4CCDA 1CGUA 3CTTA 3KL0A 1MFVA 2QHAA 3GNRA 5CZKA 3W6LA 1B3WA 5BRQA 1MQQA 1UA3A 1V3LA 1B0IA 1V6XA 3NJ3A 4H8UA 3ARSA 7TAAA 5A2AA 1OSEA 1E5JA 3ZSSA 3VGEA 1I75A 1GCYA 2WCSA 2VC9A 1OD8A 4RL3A 3EDFA 2UWFA 3VNZA 3ARZA 4WJXA 4XX6A 3F5LA 2XSAA 4H41A 3O2LA 2VVSA 4WSKA 5CG0A 4K68A 4FLOA 2WC7A 3GZAA 4WIWA 1WPCA 3EBVA 3I3EA 4UR9A 2XIBA 3NSXA 4WKFA 3MANA 3AOFA 3FY1A 4AYSA 4WF7A 3FAWA 3GYCA 4MNKA 3SUSA 1GHRA 3A4AA 1HJSA 1H11A 1JFHA 1HKIA 1E0XA 3WNNA 2XYLA 3UEQA 5KEZA 4W88A 3EDJA 4HMCA 5BYWA 2GJXB 3IANA 4GO8A 1BTCA 1QPKA 5D9OA 1TA3B 2EXOA 4QLJA 3AJ7A 3WSUA 1UQYA 3N04A 1N82A 1Q6DA 3ARYA 3WDHA 6TAAA 1JXJA 3M07A 4HOZA 5C71A 1X6NA 2VZTA 4MJ2A 2IUZA 4B9ZA 4NRRA 4CN1A 4Q22A 3WF4A 4QLKA 4U2ZA 3VTRA 1VFMA 4BS0A 5HPOA 1EHAA 3RM8A 2ZXDA 3F4VA 4GXPA 3SCUA 1GW1A 2IXVA 1TVNA 3WQ4A 4BQ5A 3WBAA 1C3FA 3M46A 3AICA 4JHOA 4PYSA 2QMKA 1R85A 3N15A 2CITA 2DPEA 3UERA 2QV4A 4DM1A 2DH3A 1JDDA 5CXPA 1V0MA 4URIA 2GFTA 1E5NA 1VJZA 1UZ4A 1OB0A 4AZHA 3CPUA 1SMAA 1M7XA 3N9KA 4WLCA 3VMOA 4RE4A 1JD9A 4E2OA 2E3ZA 3CZKA 4EK7A 1QHPA 3VM5A 2EPLX 5DT5A 3B8SA 5FL1A 3D3AA 2ZE0A 1W3KA 3DECA 4GZEA 1C92A 3WDPP 1HP4A 3T2QA 1W3HA 4MB1A 3ZT7A 2VRQA 2G3NA 1OM0A 3HMCA 5CSUA 4IPLA 1ISWA 2QLYA 1XD1A 1UR2A 4W7WA 1J0HA 4PTVA 1DWIM 1E15A 4EE9A 3AHXA 1QI5A 5FCZA 1WZLA 2Y24A 4UFIA 4D6IA 4Z2KA 4R5EA 3EDEA 4Z2IA 2J7EA 4NF7A 4CN4A 1W9DM 4J7RA 2VQUA 4MB5A 3CZLA 4CCEA 2CEQA 4HTYA 2VJXA 5D9MA 4UFHA 3GNOA 3AHZA 4HA1A 1GOOA 1JIBA 4F8XA 5IHSA 1BYDA 4D72A 1W3LA 5CGMA 2XFFA 4FLRA 4H8HA 1GUVA 1NWTA 2FGZA 2J75A 4W87A 1OBAA 1KFWA 1V3MA 2WLYA 1XSKA 2J7BA 2BHZA 1OD0A 1QW9A 2CNCA 1NOWA 1WZAA 1QNRA 1NP2A 3ARVA 3THCA 3NUKA 3ZSTA 1EGZA 4GQRA 1UWRA 4JL1A 2CBVA 1QHZA 1GORA 4XUYA 3L4ZA 4YHGA 1H0GA 2YLAA 4C7GA 1IV8A 3WF0A 1NWRA 1V02A 1E9LA 2CPUA 4HPHA 1JI1A 1HKJA 3AMLA 5FD0A 4P8UA 1MQRA 1D3CA 2J8FA 1J0ZA 4OJYA 2D2OA 1GJUA 1NARA 2ZWYA 3AS1A 5I5RA 3WKZA 2E40A 3OG2A 2JNKA 3VGHA 2B31A 2BS9A 2GDUA 3IAQA 4B15A 2DGAA 2YDSA 2WHMA 3WH7A 4QCFA 2UY5A 2XTKA 4P7QA 1G1YA 1GPFA 3QOKA 3KWXA 4P7NA 3AHVA 2J79A 1V3HA 4AW7A 1MQPA 1Q6GA 4P7OA 3ZMRA 4PSRA 5GPRA 3PZVA 3WNOA 3WEZA 3N17A 1JYVA 1I1XA 1G94A 4FMVA 1XRVA 1V3KA 3AQUA 2OSYA 3EMCA 5ABGA 4MNJA 4WKAA 4AD3A 4U2YA 1GZJA 1UWUA 3SCSA 2A3HA 3L4TA 3BH4A 2JIEA 4B3KA 4MJ4A 1C8YA 4H7VA 3IJ9A 1DWFM 1PX4A 4NRSA 1ZBVA 2D0FA 1UUQA 4DM2A 3G6MA 3NCOA 2V3GA 2D22A 2XVPA 5D9NA 5FIPA 3TA9A 5M17A 3OGRA 6CGTA 1JZ8A 3VO0A 3AMKA 1R86A 2X05A 3WUFA 1WZKA 5GQBA 4UOJA 4AISA 4TVUA 3W38A 1JGIA 1MFUA 3QHOA 5HPCA 1JXKA 2WVUA 1KBKA 1PAMA 4AD4A 4KH2A 5A6KA 2ZXQA 5ABFA 4UQAA 1GOQA 3WFZA 5A2CA 3PZUA 1UWSA 2YL5A 1E4MM 4RE3A 1G5AA 4JL2A 1LWJA 3G6LA 2CKSA 1HIZA 1TE1A 3M7SA 4AY1A 4Z2GA 1KB3A 4S3KA 1UA7A 2PWFA 1HJVA 1WNOA 1M53A 3DYOA 1ISYA 1BF2A 2OWXA 4WK9A 3KL3A 3I3DA 2PC8A 3AYRA 1TFVA 2RGMA 2J7CA 1AQHA 5CGTA 3II1A 4AZCA 4KRUA 4ZXOA 1WO2A 3W26A 1BFNA 3WD4A 1MW3A 4OZOA 3BAJA 3UR7A 4A4AA 4JFWA 3MMWA 3CUHA 2CHOA 2XFRA 5I77A 3VDHA 1WZMA 1E73M 5JIPA 3F5KA 2V5DA 4BQ3A 1E1FA 1BSIA 3T0AA 1H49A 4PTXA 2YL9A 3ARXA 1BPLB 2YA1A 1KXVA 2QMJA 4GI8A 2Z1SA 1UWTA 1KXHA 3WQWA 3WIJA 4UQDA 3OIHA 2E4TA 2WVVB 2YJQA 3OLDA 1TR1A 4PSPA 4N42A 3PZGA 3WMBA 1UH2A 4OKDA 3SIMA 1A47A 1C91A 1HP5A 2ZX8A 3EDKA 3WDJA 4AXNA 2J8GA 4BZYA 3VNYA 1VEMA 5BXSA 3APGA 4PUEA 4CD7A 1KQZA 3L2LA 3AROA 3W37A 4PMOA 4C7DA 5ABHA 1AQMA 3AZSA 3VDCA 3UR8A 3K4AA 1W2PA 1W1YA 2ZX7A 3WH8A 3CUJA 2J62A 2ESCA 1ISZA 1C93A 1XSIA 1QBBA 4J3XA 2JIWA 1MYRA 7A3HA 3L2MA 5I79A 1CXKA 1O6IA 3HU7A 1UD4A 2E9MA 3TTYA 1V0KA 2XFYA 3I3BA 1LF1A 4PMRA 3RPMA 1EQPA 3NSNA 4EANA 3W28A 3TTQA 2WHLA 3WH6A 3WNKA 1QI2A 1V02E 3VX1A 4DUXA 1EH9A 1XH0A 5D8WA 3WD2A 1J0IA 1YQ2A 2WZIA 3MV11 4DUVA 5IFPA 3U7BA 4AD1A 4F79A 5FL0A 1DWGM 4HOWA 1MXGA 4PMUA 4PMQA 3IJ8A 1XYZA 9CGTA 2WC3A 4F9JA 2XM2A 3LPGA 5HXMA 4U3AA 3BSHA 1O7AA 3QR3A 5FKYA 2YDRA 1JZ2A 3N11A 2UY3A 3ZJ8A 1K9EA 4MAVA 2VUYA 2FHFA 3W6MA 5I2UA 4AEFA 1M01A 2WB5A 1ZU8A 5IHRA 2GJXA 3S6TA 4FLSA 3FW6A 1TA3A 3U57A 1VBRA 3WDRA 2DH2A 1HVXA 3POHA 1BYAA 3ARWA 1MVYA 4W84A 1X1NA 4MB3A 1B2YA 1KWGA 3GH7A 2CHNA 3PZQA 3WDQA 2DDXA 1OIFA 5AY7A 5AYIA 2XIIA 4HU8A 3VIFA 1ZL1A 3DYPA 1HF6A 4J28A 3O9NA 3CHEA 4ATWA 2ZUWA 1EHNA 3SCWA 1HX0A 4KRTA 4FK9A 1J0YA 1UZ1A 2E8YA 5D4YA 2W63A 3AHTA 1WP6A 3RJXA 3BGAA 1UD3A 2GVYA 2V3DA 2J78A 3CHDA 2X0YA 1WE5A 3RM4A 1CGXA 4JFSA 4UZSA 2VOTA 4CD4A 4H2CA 5AC4A 1B31A 3CUGA 2YL8A 1R7OA 3FNDA 3AIRA 4UNIA 1HJUA 3W24A 2AOSA 2BHYA 3MUAA 1CEOA 4C7FA 4HZ7A 5AYBA 3VIJA 2QF8A 4LYQA 5BROA 4MB4A 2XWDA 1CWYA 3VD9A 4L4OA 4M82A 1OINA 4ZEPA 3BLPX 2OO2A 4AD0A 1LQ0A 3WUGA 1F4AA 2BY2A 2VX5A 3MUIA 2ZX6A 4ML4A 5E0FA 4D6GA 2EQDA 2C8NA 3T2OA 4U5KA 4WSJA 1VEOA 4UFLA 4NZCA 5E70A 5E6YA 3AS3A 4LYPA 4ZE4A 5CPTA 1E55A 2V5CA 3AXXA 3POCA 4QP0A 1BYBA 3RDKA 3WQ6A 5D8ZA 1H41A 2FGLA 1QNPA 5A6BA 4X0VA 5BRPA 4KWUA 3ZQ9A 2ZUTA 3VD5A 1JZ3A 5A8PA 3ARPA 1W1TA 1CIUA 2FH8A 3W25A 3VD3A 1E6SM 3B9AA 1B3XA 2CYGA 4BQ4A 4TUFA 1V3JA 4FZPA 1PZ3A 2W67A 5A6MA 3CH9A 4M80A 5LA0A 3PZTA 4H8VA 4XV0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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