4AZIA

Differential inhibition of the tandem gh20 catalytic modules in the pneumococcal exo-beta-d-n-acetylglucosaminidase, strh
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
415
structure length
410
Chain Sequence
GSHMEKLAKNKVISIDAGRKYFTLNQLKRIVDKASELGYSDVHLLLGNDGLRFLLDDMTITANGKTYASDDVKKAIIEGTKAYYDDPNGTALTQAEVTELIEYAKSKDIGLIPAINSPGHMDAMLVAMEKLGIKNPQAHFDKVSKTTMDLKNEEAMNFVKALIGKYMDFFAGKTKIFNFGTDEYANDATSAQGWYYLKWYQLYGKFAEYANTLAAMAKERGLQPMAFNDGFYYEDKDDVQFDKDVLISYWSKGWWGYNLASPQYLASKGYKFLNTNGDWYYILGQKPEDGWYFLKKAIENTGKTPFNQLASTKYPEVDLPTVGSMLSIWADRPSAEYKEEEIFELMTAFADHNKDYFRANYNALREELAKIPYSKESLEALDAAKTALNYNLNRNKQAELDTLVANLKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE
publication title Inhibition of the Family 20 Glycoside Hydrolase Catalytic Modules in the Streptococcus Pneumoniae Exo-Beta-D-N-Acetylglucosaminidase, Strh.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 164
structure length 410
sequence length 415
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2012-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.90 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 AF1782-like 4aziA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4aziA01
4GQQA 1VRXA 3WMBA 4KMQA 2DDXA 4LPCA 4AZCA 4P7NA 4MNKA 1TVPA 1XHGA 5ABGA 5BXTA 4QLLA 5CQ1A 2Y24A 4V28A 1GNXA 1QHZA 2YDSA 5CZKA 5KZ6A 7TAAA 1BGAA 4HZ7A 3ZT6A 4H7VA 1BFNA 1HKIA 2YDRA 1UR0A 3L4WA 1FH8A 4Q22A 3IAQA 3D5HA 1CGWA 1LL4A 4QP0A 5CXPA 4BCEA 1E1EA 3QR3A 4JFVA 3RMEA 5CGTA 1XH2A 5HPOA 2HVMA 2WMGA 5A8OA 4MB3A 2WXDM 2ZIDA 3IJ8A 3WDHA 3CLWA 1LG2A 3MV01 3GYCA 4AMCA 5EBAA 3OLGA 4U3CA 5DO8A 1BYCA 4DM1A 3UCQA 3L4VA 2VOTA 4P8UA 5A94A 4PMXA 1UZ1A 3OZPA 1UKQA 3FN9A 4CN4A 4RL3A 2OYMA 1Y7VA 2NSXA 3CZKA 2ZWZA 3A6OA 3VGEA 1CGXA 4ZXLA 1JYWA 2BVTA 1V0MA 4CGTA 4PTVA 3TOPA 1W9DM 1WZAA 2WCSA 3HN3A 2AAAA 3ZJ6A 2FH6A 4MJ2A 1E1FA 2CKRA 3GTNA 1W2PA 1BVZA 4J3TA 3E1F1 1KCLA 2ZXQA 1CECA 5I23A 4WJXA 1LWHA 4V2XA 3ECQA 2VR5A 3GXIA 3EMZA 1KGXA 1UWIA 3II1A 4NRRA 3WDRA 4IPNB 2CBVA 5HNNA 4AZIA 3AHZA 4AW7A 2E9LA 4UOQA 2G4FA 2A3BA 4W8BA 1G5AA 3T2PA 1NH6A 4E8DA 3WNMA 5IDIA 2V3FA 3WDJA 1E5JA 2C8NA 2IUZA 1E6RA 1UQYA 2XM2A 3T2OA 4FZPA 1UR1A 4FK9A 1JYVA 1TFVA 1ZJAA 1QHOA 4P7OA 5A1AA 5M3WA 1JL8A 2VMFA 3B9EA 5A69A 1QI5A 1HXJA 3BCFA 1E72M 1CLVA 3SEPA 1V3MA 3UERA 1E43A 1B3XA 5D9NA 1YHTA 1WCGA 4E4PA 3WD2A 4U2ZA 3CO4A 2O9RA 3DECA 3TTSA 2NT1A 2DT3A 2BXYA 2WHLA 2ZWYA 5CSYA 4HU8A 2VRQA 2PMRA 2D3NA 2XJ7A 4F9DA 1HKKA 1EDQA 2QPSA 3WEOA 1UR8A 3L4ZA 3VIGA 5BYWA 2JIWA 3AHVA 1EQCA 1UWUA 1C93A 4KRTA 1JZ4A 5F7UA 1KWGA 1I1XA 3AOFA 5FL0A 3NUKA 2BY3A 2WBGA 2W5FA 1OD8A 5BXPA 1FH7A 1B3VA 1CEOA 2ZUNA 1TVNA 3AIWA 2CESA 4DUWA 1GQJA 2J74A 1NWSA 3VIPA 4M56A 4HOWA 3KEHA 3SCQA 2XPKA 2CHNA 2ZUWA 4YN5A 5GNZA 2E4TA 5HOSA 3VD7A 4MDPA 1H11A 4PTWA 4PSRA 2CITA 3B9DA 4KGJA 3AYRA 1ZBVA 2UY3A 3MO4A 4Z2GA 3W6MA 1EA9C 4P7QA 1X1NA 2QHAA 4MNJA 1BTCA 2G3IA 1CXEA 3CZ8A 1UYQA 4NSBA 1V3JA 4J3WA 1CGVA 2ZUTA 4DM2A 2J8FA 2O9TA 1R7AA 1UUQA 5LA2A 2J47A 2QLYA 4PMOA 5I5RA 4OOUA 1M03A 1JXKA 3GXFA 1CYGA 1ECEA 1WZLA 3UETA 2VCCA 5M5DA 3VILA 3PTMA 4AZBA 1EDGA 3AZTA 3QOMA 3W37A 4UQCA 1GCYA 3AXHA 1ISVA 1UWQA 3LPOA 4WKHA 1J0JA 3MANA 2DSVA 1H0IA 2MANA 1B3WA 4UFKA 3SUVA 1JAEA 3WN6A 3ARTA 3K8MA 3UG4A 2EPKX 4J27A 1ZB5A 4QLJA 5E0CA 2UY4A 2Z1SA 1HVXA 4KGLA 1UKPA 1UR9A 3ARQA 4AY1A 1M7XA 1ITCA 1EXPA 3PZTA 4LXFA 1IZKA 1E70M 4W5UA 1XSKA 3ARYA 4MTVA 1KR0A 1Q4NX 1JDDA 4PMNA 1XH0A 2JNKA 4Z2IA 1CNVA 4AISA 1E0WA 2CXGA 2D23A 2E0PA 1E4LA 4GKLA 1LG1A 4MAZA 1UZ4A 4M82A 4TTUA 5HXMA 3GM8A 2VQTA 3ARXA 2JFEX 5DT7A 4FLSA 4ACYA 1DWFM 4GI8A 4IPLA 5DF0A 3VM5A 1V0KA 3MUY1 3B9AA 3ZR5A 2WCAA 1PAMA 1UD4A 1AQMA 1MQPA 5FL1A 1UD6A 1Q6EA 3W28A 2VL4A 1GOQA 9CGTA 1C8YA 1V3HA 3N11A 1WPCA 1HJVA 1XC6A 1DEDA 5BWFA 4UQEA 3PZOA 2JF7A 4XX6A 4U2YA 1DWGM 4UZSA 2QMKA 4PYSA 1DP0A 1MW0A 3VMPA 3D3AA 2D22A 3AHXA 3EDEA 4QAWA 2VZVA 5ABFB 1V0NA 3CUJA 4TTGA 2V5DA 1WP6A 4PMZA 1DTUA 4C7GA 2VQUA 2UY2A 2XIIA 1ZBKA 2WANA 3WNPA 2A3HA 2WHMA 1GOIA 3AS1A 4J28A 3AMGA 4HU0A 3MKKA 4HZ6A 8CGTA 2CETA 3WEZA 4AZHA 5AY7A 4WF7A 2J8GA 2GVYA 3CH9A 5IFTA 5AC4A 2AMGA 4R27A 2GJPA 1CXFA 1UD5A 3SCPA 1XSJA 3VIJA 2WPGA 2VI0A 4JL2A 1VBRA 1VB9A 2VX6A 5DEZA 2BHZA 1H1NA 5I2UA 3DHPA 4XV0A 1JDAA 1BVNP 1J18A 3N13A 4AD0A 4F9JA 1OBAA 2ZX8A 2CHOA 3BAWA 1UWRA 1HP4A 1W2VA 1UKSA 1JZ6A 3WELA 4UFLA 1W91A 5GQBA 1U30A 3FHQA 1EHAA 1OSEA 1E3XA 1D7FA 4HA3A 1UH3A 5EFDA 2W92A 4UFJA 4A3YA 4F79A 1KWKA 4DWSC 3W0KA 2CIPA 1E6SM 3UR7A 4ACZB 3RPMA 2OLHA 3PZQA 1ISXA 4B9ZA 3NDYA 3PZUA 1VFUA 4AZ7A 3O6AA 1NOUA 5DMYA 4TX8A 1CXIA 7CGTA 1ODZA 3SCOA 1E6ZA 3OBAA 1GOKA 1R85A 4AEEA 4AYSA 4NF7A 1PIFA 1EGZA 3WNKA 2DQXA 1QI3A 3K4DA 2XGIA 2JALA 4Z2HA 2CNCA 1UG6A 1UR4A 2XG9A 1B3ZA 4QDMA 3B8SA 5DFAA 2G8ZA 4NI3A 3VGDA 3L4XA 1ZJBA 4ZEPA 4ZENA 2PB1A 1HF6A 2VVNA 1GORA 2XVPA 1E71M 1HT6A 4EANA 1OT2A 3U7VA 5BXRA 3AYSA 3VU2A 3VIMA 3WUBA 1AMYA 2GJRA 2WW5A 4CU6A 2W4XA 4IM4A 1W3LA 2GFTA 3WBEA 2Y5EA 5E6ZA 4YHGA 4CCCA 4D6JA 3MV11 4ATDA 2VX7A 2WCGA 3A4AA 1IT0A 3GNOA 3F5KA 2DIEA 4EK7A 3ZT5A 5I78A 1VEMA 2BVYA 1W1PA 4X9YA 2DH3A 1EH9A 2VTFA 4M1RA 3ARWA 3QOKA 5ABHA 1J9YA 1NQ6A 5A6SA 3A47A 3OG2A 1KCKA 3KL5A 3AICA 4WSKA 2WWCA 2EJ1A 3NSXA 4KWUA 2J7FA 2WMHA 3POHA 1OM0A 3LPFA 3AQUA 2CEQA 4AD4A 3W38A 1SYTA 1GW1A 2W63A 2G41A 4D72A 3M6DA 4C7DA 4OJYA 3AMKA 3BAIA 1LL6A 3VIIA 3F5JA 3VNYA 4PMDA 2PWDA 1MQQA 3PN8A 2J62A 2JIEA 1WDPA 2D2OA 2ZUUA 3DYOA 3GBEA 3VX1A 3WMCA 1JI1A 2ZXBA 1J0ZA 1NWUA 3ZQ9A 2VNCA 4LYPA 1E73M 4HPHA 1H3GA 2BHUA 1CLXA 1E6QM 5D8WA 3KZSA 1E0XA 3QHNA 1QNPA 2DSWA 1J0YA 1HP5A 4ML4A 1NOFA 1MW2A 1WB0A 3G6MA 4OKDA 3S6TA 2CCRA 3M7SA 3WL1A 1LF1A 1KFWA 3EDKA 1BYDA 1PX3A 1G94A 5M17A 4HZ8A 1E5NA 5EMYA 2CERA 1GQKA 2EPMX 1DWAM 4DWSD 1MXGA 3AS2A 2D0HA 2CBIA 3VIFA 3RM4A 3OB8A 2WYSA 3OLIA 3WD4A 2EEXA 3CUHA 3T09A 1OGBA 5JUVA 4OBRA 4WKAA 4D6IA 2WBKA 1WNOA 3EDFA 3ZO9A 4W7VA 3W27A 2XVKA 4MPKA 1TA3A 1AQ0A 3U7BA 1IV8A 1VFFA 3SCVA 3IK2A 1JF5A 3SIMA 2A3CA 4E8CA 2V38A 5EB8A 2BV9A 2F61A 3VGBA 4U31A 3W81A 3W29A 4CN6A 4HMCA 2X05A 1PPIA 4FZOA 1DWJM 1OD0A 2FHCA 3GNPA 3SCTA 1V03A 5A3HA 1JFHA 7A3HA 2OSWA 5JIWA 2CBUA 2OYLA 3RIKA 1CENA 4M29A 4H41A 2WVUA 3WF1A 4S3KA 1W9VA 2WSPA 2GJXA 4D6HA 5E9AA 1GONA 1XCXA 2XFRA 2VCBA 1QNQA 3AIEA 2BS9A 1UR2A 3VD4A 1F4HA 4ZFMA 4D6EA 5GPRA 4CD5A 3ZMRA 4U33A 1VFOA 5BRPA 5ECUA 1J12A 3AMCA 4WIWA 3ARSA 3EDJA 2ZX5A 1WDQA 1BLIA 1VEPA 3QHMA 1QI0A 4MNMA 1W9BM 3BLPX 4P8WA 1IZJA 1G01A 1OGGA 4W89A 3LMYA 1SMDA 1JAKA 4GINA 4PMUA 5A6LA 1B30A 3K4AA 4W8AA 1OWQA 3TP4A 1JI2A 3WSUA 3MSDA 3MMWA 4WLCA 3WNOA 3GXDA 2ZX6A 4XUYA 5C71A 1XH1A 1ZU8A 3AMLA 4QFUA 2GDUA 4CCDA 3WIJA 1VIWA 5JIPA 4B15A 4PN2A 3L2LA 4ATLA 1MQRA 4FLRA 3RM9A 1HJWA 3HU7A 4AZCB 5A8MA 3VGHA 4L4OA 4CD8A 4Z2JA 5I0DA 2VRJA 2QF8A 3TA9A 2X09A 1B2YA 4JFUA 3MUIA 4UFMA 1FHDA 2JF6A 1E6NA 3OGVA 4LYRA 2OSXA 3U5UA 2PWGA 2Y8VA 3MU7A 4GIAA 2UWFA 3T0DA 4U3AA 2DPEA 1MFUA 1B9ZA 1AVAA 3AFBA 5HBFA 2XHYA 3PZGA 3RILA 4DWSA 2D24A 2BHYA 4IISA 5CLWA 3ZOAA 3WFLA 1D2KA 1BSIA 3VD3A 2X8RA 4W85A 1R7OA 3ZIZA 4R5EA 3WBAA 2ESCA 3TTQA 2GDVA 1BPLB 3IJ9A 2EPNA 1PZ2A 3OZOA 3WF2A 4H04A 3WQVA 2G3NA 3SURA 5CPSA 1M01A 3AJ7A 1VEOA 1UWSA 1QI2A 3VINA 2VX4A 5FOOA 1LL7A 1WZMA 3RJYA 3VIHA 5E70A 3EMCA 5JBFA 4LYQA 1HVQA 4CD6A 2YLAA 3CBWA 4XZWA 3J7HA 4WSJA 1UKTA 3VD5A 3ARPA 3PZIA 1HIZA 2C0HA 2G3JA 1C7TA 1KR1A 1RD6A 1XD0A 8A3HA 3WF0A 1L8NA 2WHJA 4KH2A 3IANA 1GVYA 4GZJA 1KXVA 5I79A 2WNWA 4PMVA 1DWIM 3VVGA 2YBTA 3IJ7A 2WHKA 3CHDA 5BRQA 1MW3A 4HPGA 2E40A 3EMQA 3SUWA 1GQLA 1EIBA 3BGAA 1MW1A 3AIBA 4K68A 3L2MA 2VO5A 4J7RA 1P6WA 4EE9A 2Y4SA 1WKYA 2W91A 3BMVA 3KWXA 3SCSA 5BXSA 1BG9A 1E4MM 3GH4A 5BROA 1GJWA 3WL0A 5A6BD 1J0KA 5DT5A 3FXYA 2JEQA 1CBGA 1LLOA 2DH2A 4CN1A 2W67A 1JYXA 2QPUA 1DWHM 2XFFA 1PJ9A 1UWTA 2GK1A 2V3EA 4PBGA 1B3YA 4AIEA 4HMEA 1UQZA 3M46A 3ZM8A 1PBGA 1NARA 1BYAA 2OWXA 2J79A 3W26A 2J75A 4AC1X 1UD2A 3WY1A 3WDIA 4QCFA 2A3EA 2WVVA 2VJXA 3WF3A 4BQ4A 4LQ1A 2CBJA 1WE5A 1KQZA 1MWOA 2RGLA 3NIYA 3AHYA 1W3KA 3GH7A 1S46A 4W5ZA 4OBSA 1E3ZA 2DEPA 4B3LA 4Z2LA 2EQDA 1R86A 2FHBA 4AEFA 3OGRA 1G0CA 3WQ8A 4QCEA 3MMUA 3QHOA 2Y8KA 3WMSA 4NRSA 1K6AA 1HJUA 3PTQA 3WNNA 2VR4A 3VDBA 2VZUA 4F8XA 2FGZA 2W62A 1E4NA 3FNDA 2WVTA 2XVLA 3RCNA 2WB5A 1D3CA 2G3MA 2ZXDA 1XYZA 4JIEA 3WUFA 2D20A 1B90A 2F2HA 4WK9A 3CZJA 4OIFA 5D9MA 2OSYA 1KBKA 3ZJKA 2BVDA 1HL9A 3VGFA 4BS0A 3N15A 3NSNA 5HDRA 1JXJA 1ZS2A 1W32A 4J3UA 3GXMA 3BCDA 2WLZA 2VT0A 2YA0A 3WNLA 1QHPA 3AROA 1JYNA 3GDBA 2NW0A 3KL3A 1N82A 3THDA 4XB3A 1H0GA 4TVUA 5FD0A 2OO2A 1DHKA 4UQAA 5A6KA 5A2BA 1ZBWA 3AIRA 4P7RA 3DC0A 1PZ3A 1C8QA 2YL6A 3VD9A 4GZEA 5GNXA 3VTRA 1HKJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ACO A;  1VRX A;  2JK2 A;  4FR6 A;  2Y7D A;  3HPA A;  4MNK A;  3GWQ A;  3B8V A;  5C9R A;  4V28 A;  3SY8 A;  3TR2 A;  4L56 A;  4IH3 A;  3CWO X;  4LCR A;  5KZ6 A;  7TAA A;  3IAR A;  3TYU A;  1TQS A;  1BGA A;  5TKY A;  1DOS A;  4P5U A;  3BJT A;  1CGW A;  1Y5X A;  1LL4 A;  4ZCW A;  3LS9 A;  1E1E A;  3QR3 A;  4IPI A;  4JFV A;  3TQ0 A;  1NAL 1;  1XH2 A;  1J5S A;  4RJE A;  2WMG A;  3LNP A;  4QSF A;  2ZZ3 A;  1EP2 A;  3WDH A;  4GCX A;  1E1C B;  4Q33 A;  5HUP A;  1WOA A;  4U3C A;  3UCQ A;  4OHQ A;  3SDO A;  3TYA A;  2NQZ A;  2HZG A;  3I2W A;  3OZP A;  4CN4 A;  3TDF A;  2GGE A;  3NOE A;  3CZK A;  3VNL A;  3A6O A;  1SFJ A;  4I90 A;  4LAN A;  4JR5 A;  1XRF A;  4CGT A;  3UT0 A;  3TOP A;  1A5N C;  2FH6 A;  1DE5 A;  3TNB A;  1DE6 A;  3GTN A;  3MYO A;  3NQF A;  1CEC A;  5I23 A;  1LP6 A;  4V2X A;  1XBZ A;  2VR5 A;  3C0Q A;  1IEW A;  2V6A A;  2D2J A;  2CBV A;  5HNN A;  4JQ4 A;  4LVB A;  4MHB A;  4HPX A;  2ZZ6 A;  4E8D A;  3WQE A;  5IDI A;  3TSB A;  3W1X A;  5K4Z A;  3C2Y A;  2INZ A;  4NZ5 A;  2IUZ A;  3FVM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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