4B1XB

Structure of the phactr1 rpel-2 bound to g-actin
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
357
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Structures of the Phactr1 RPEL domain and RPEL motif complexes with G-actin reveal the molecular basis for actin binding cooperativity.
pubmed doi rcsb
total genus 123
structure length 357
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1xB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4b1xB02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4b1xB03
2Q36A 4MLEA 4WQ5C 4FWLA 5AQVA 2IVNA 1QZ6A 3MCPA 3FLCO 4JNEA 2AA4A 3ATVA 5BPLA 4CD1A 4CI6A 3FZHA 3MDQA 2YHWA 2ZGYA 5AQYA 3D2FB 3HM8A 3VF6A 3QMLA 2FSNA 2E8AA 2V7ZA 1GLLO 1ZXOA 2HF4A 2YI1A 1QQMA 4BVPA 1BG3A 3ZETB 4CZEA 3BF1A 4JN4A 4ISEA 4LC9B 4IO8A 5BPNA 1TUUA 2FXUA 3ZEUA 3W3DA 1HPMA 2E1ZA 5TKYA 2ZF5O 2E2OA 3ZX3A 2Q31A 3DAWA 3H1VX 1U2VA 1KAYA 1ZBSA 4FPBA 4FOEA 1K8KA 4BRAA 4HWIA 2IVPA 3DXMB 5AQKA 4WYBA 3ULEB 3W0LA 4WQ4C 3I33A 1GLFO 2E2NA 2E2PA 1XQSC 1D4XA 1MWMA 3HSCA 1SZ2A 1CZAN 4BRKA 4CBXA 4FOIA 5B8HA 4DCHA 4FWOA 2FF3B 2YCHA 3KZBA 2VWBA 3RSEB 4BQLA 2I7NA 4BRFA 4GNIA 4CD3A 4IJNA 4BC4A 4EAHD 3LDQA 2NLXA 3QICA 1TYQA 4FWSA 5EXWA 3CJBA 3VETA 4MLHA 4BR5A 3L4IA 5AQOA 3VESA 4H5TA 3CIPA 5AQXA 4A2BA 4JHDB 3O1WA 2DPNA 4RCHA 3DXKB 4IZ9A 3A5NC 3QFUA 4BGBA 2CH5A 4BGAA 3VEXA 3J8AA 3D2EB 2A3ZA 1IG8A 2NRHA 2NZTA 2V51B 3R6MA 4O5FA 3A5OC 1NM1A 5AFUA 3FR0A 3WXIA 5JICA 4BC3A 2P9IB 3C7NA 3U9ZA 5BRHA 3S41A 1E4GT 5BN8A 3H46O 3D7EO 3FFKB 3HTVA 2WUSA 3R8EA 4L3QA 3MN5A 1HKCA 1MA9B 4H0PA 4JD2A 3WQUA 3CQYA 4FO0A 3VF4A 3CJ9A 2P9LB 4QS9A 1YVNA 3MMVA 4ISFA 4BRMA 1HKGA 3LDLA 2QWMA 5AZIA 5JLHA 5EX5A 1C0FA 1GLEG 2GWJA 5JMVA 3WT0A 1NGJA 3QB0A 1X3MA 4H5RA 1NGIA 3MN9A 5BN9A 4ISGA 3IDHA 4H03B 5AZJB 5FPEA 1BDGA 3FZLA 2D0PA 3FE1A 1XUPO 3UKRB 4QS7A 1NBWA 4K42A 1NGBA 1JCEA 2GWKA 1WUAA 3LDNA 3DWLA 1T6CA 2PAVA 1KAZA 1WOQA 4FWKA 4H0XB 2CH6A 4CJ7A 2E20A 3QBXA 3MN7A 1ESVA 3CJCA 4MO5A 3LDPA 4GY2B 4CZFA 3HBTA 3H3NO 1QHAA 4A62A 1IJJA 3M6GA 4FPAA 2HOEA 3QBWA 4E1JA 4I6MB 1C0GA 1HLUA 3CJ1A 3D2FA 3LDOA 1NMDA 2P9UA 2QWOA 1BA1A 1XC3A 3SK3A 3MK6A 1J6ZA 2KHOA 4XH1A 3O08A 3R9PA 2P9PB 2P9NA 4CZIA 4K43A 5F0XA 3EN9A 1ZC6A 5AQMA 2QWRA 3M3ZA 1G99A 2YJEA 3H45C 1T44A 4XEIA 2ASPA 4H5WA 4B1WB 3WEEB 1YUWA 1MWKA 3TPQA 2P9SA 4PKHA 4B1UB 1SAZA 3WQTA 4CZJA 2FLOA 3A8YA 5AQIA 3DXMA 5LJWA 1HKBA 1OKJA 1NGAA 3GE1A 3H1QA 3LM9A 5LJVA 3QDKA 4K41A 4H0VB 2ZWHA 1V4SA 3OHRA 3VGMA 4H0OA 1BU6O 4F9OA 4FWQA 3F9MA 4CZHA 5F2RA 5FPDA 2Q2RA 1BO5O 1NGEA 3GBTA 1BA0A 2A6AA 3B8AX 5AQUA 1KXPA 4BG9A 4BRPA 5AQPA 4EHUA 4NB4A 2E88A 4JHDA 3WXKA 3FZKA 3BF3A 1YXQA 2Q0UA 3ZEUB 1JCGA 4PKGA 4BRNA 4FWRA 3UB5A 2D0OA 1U2VB 1Z05A 2D4WA 1K8KB 2BTFA 4BRIA 3VF2A 3P4IA 2P9IA 3MN6A 3BUZB 4CZMA 4BR2A 5FPMA 4NO7A 4O8KA 3SLCA 2P9KB 2E2QA 3SMPA 1KAXA 4C23A 3GOIA 4B1XB 4BRLA 4FSVA 1RDWX 3KHYA 3VGKA 5ELZA 1R59O 4A2AA 2W40A 3SMSA 4CZKA 3ENOA 4AM6A 1NGFA 2P9LA 3VEWA 5ADXA 1RGIA 5BRFA 4DHYA 2I7PA 4XH4A 4IJAA 2CGLA 2QW9A 4H5VA 4M7XA 3BP8A 3FGUA 4M63C 3A5MC 1DKGD 5AZJA 1Y64A 3M1FA 2F9TA 2QWQA 2CGJA 4PL7A 3H3OB 3CI5A 3AAPA 3VOVA 3JXUA 5AQLA 3EKSA 5EVZA 3C7NB 3A5LC 2W41A 3O8MA 4H0TB 4IWVA 2J4RA 2AP1A 4YDUA 1Z6RA 5CE3A 3U4LA 1U6ZA 1BUPA 3WUHA 3CERA 3HI0A 4JD2B 3AARA 1T6DA 2FF6A 2GEMA 3VPZA 3VEYA 3AY9A 4FWMA 5E84A 4I6MA 5EOYA 2HF3A 1HJOA 3QFPA 5AZIB 4HTLA 4H5NA 4BR7A 2CGKA 5JLFA 2A5XA 2VCPA 3CJAA 3FZMA 1HX1A 4BRHA 1ATSA 5KQDA 1TUYA 1H1VA 2D1KA 4JAXA 5AFUH 3ENHA 3WXLA 2Q97A 4H0YB 4K25A 5AQGA 3VGLA 1S3XA 1NGGA 3ZETA 1LOTB 3WEEA 2IVOA 4B9QA 1NLVA 4A61A 3CJ7A 2EWSA 1ATNA 3JS6A 4BQZA 5ADXH 3O6WA 3EKUA 2QWLA 3CHWA 3UKUB 5AQJA 4B1YB 3KVGA 4BRDA 5F1XA 3U8XA 4BR9A 3UE5A 2PBDA 4Z94A 3ULEA 1GLAG 2V7YA 1X9JA 5AQRA 2P9UB 5FPNA 3L0QA 2P9NB 1MDUB 4Y0WA 3RSEA 4QS8A 1NGHA 2YJFA 5I9EB 1QZ5A 2QWPA 5AQNA 3IUCA 3CQXA 3EZWA 3VEZA 5KPTA 5AQFA 3VERA 3LL3A 1QQOA 2P9SB 5AQSA 4RWTA 4XH5A 4BVOA 3WXJA 3LM2A 4IXCA 3DXKA 2A42A 4B1ZA 1NGDA 2E1YA 5KPRA 1QQNA 2QWNA 1LCUA 3D2EA 2P9KA 4WQ5A 3O1BA 2UYTA 3HZ6A 3ZX2A 4EIAA 1V4TA 4YDUC 3I8BA 4FL9A 2GUPA 2Q1NA 1DGKN 1RFQA 4EHTA 3EO3A 1GLDG 3H6EA 5AQZA 1S22A 2GELA 4KBOA 4BREA 4BROA 3VEOA 1GLBG 4AM7A 5E26A 3IMXA 3O5BA 2GTDA 3L6QA 4CZGA 4CBWA 1ATRA 4BR0A 4DQ8A 3TU5A 2ZGZA 2HMPA 3U9DA 2BUPA 2VYPA 1TYQB 3DJCA 3O80A 3IFRA 1P8ZA 3C0BA 1X3NA 4FWPA 2IIRA 1BWFO 4BR4A 4MO4A 5BPMA 3BEXA 1NGCA 3UKRA 1SQKA 3ID8A 2QXLA 3AAQA 4WQ4A 3GDQA 1YAGA 3VENA 2H3GX 3ZX0A 4EFHA 1BOTO 4PL8A 4RTFD 2ASMA 4CBUA 5AQWA 4CZLA 1E4FT 2Q0RA 5LY3A 5KPZA 5KQ8A 4B1VA 2A40A 3SJHA 4M7YA 5BREA 2ASOA 5AR0A 2QM1A 2FSJA 2F9WA 1JCFA 3EL2A 2ITMA 4BRCA 4BG8A 2A41A 5AQQA 5BR9A 1GLJO 1GLCG 4BC2A 4PKIA 5AQHA 3FZFA 4FWNA 1DEJA 2YHXA 3ATUA 2YHYA 2P9PA 3O4WA 3A0IX 5AQTA 3CETA 4BRGA 3GG4A 3G25A 2FSKA 2V52B 1EQYA 2OANA 4J8FA 5BRDA 4BC5A 5EY4A 3UKUA 3VEVA 1Q18A 3GL1A 1HUXA 4DB3A 1NWKA 4BRQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H8KA 2IVNA 3DLEA 1QZ6A 1RBUA 3UIQA 4OPAA 3NH0A 5BPLA 1QVFM 3IRXA 3MEDA 3BZKA 4CF2A 4DV2K 2X6SA 4F8RA 3MDQA 3EYZA 2ZGYA 3M5RA 3D2FB 4O0JA 1U04A 5E41A 4CIGA 3E9PA 4JKCA 1QQMA 5AJ3K 2IAJA 3ZT2A 3KTQA 4JI2K 1YJ9N 3O4NA 4DV1K 3BF1A 4LF5K 1HYZA 3ZSOA 4LC9B 2WBNA 4KB0A 2Z1GA 3RMAA 5BPNA 1UA1A 1S5JA 3ZEUA 1HPMA 2E2OA 4HUFA 4JEPA 4FZYA 2F4VK 4FOEA 3QEIA 1HMVA 1EP4A 3ULEB 4WQ4C 1VQON 4DSJA 2VGMA 1GLFO 5FLXO 1NOYA 2XO7A 3SQ0A 1NJIO 2ZE2A 4CGHA 4FWOA 4IJNA 4EAHD 4DV4K 3LDQA 4JI0K 1TYQA 3VETA 4IEEA 4MLHA 4CJVA 3L4IA 3VESA 3CCEN 2GBZA 5AQXA 2DPNA 5DMRA 3AVIA 3QFUA 4FJ5A 3LANA 4CJWA 4BGAA 3D2EB 4AH9A 1ZBIA 2NRHA 2NZTA 3A5OC 5JICA 4F2SA 4B9SA 2G8WA 3OYMA 4BWMA 4J2DA 3LZJA 3H46O 3D7EO 4CEDA 2WUSA 3THYB 3MN5A 3K5LA 3OYGA 4H0PA 5C2FA 4YNQA 3CQYA 1KSPA 3CJ9A 3Q7BA 4DWIA 1TL3A 4JRPA 3LDLA 5JLHA 5EX5A 3ZT0A 1S9GA 2XY5A 1BGXT 5JMVA 3KKRA 1ILYA 1BCMA 3CCQN 3MN9A 5BN9A 5CHIA 3AO2A 4PA1A 4DQIA 4K0KK 4H03B 5FPEA 2D0PA 4Q0BA 3V1OA 4QS7A 4FZXC 3CM5A 3OYHA 1EX4A 1X1PA 3DLKA 3SJJA 4CK2A 5IT9O 1JCEA 2GV9A 2D0BA 4QCLA 2PAVA 1WOQA 4H0XB 1RBRA 3THXB 5CZ2A 3QBXA 1KTQA 1ESVA 3OS0A 1CZ9A 3IS9A 4CZFA 1QHAA 2HOEA 2G8FA 5C24A 3THWA 4RG8A 1C0GA 3ZT3A 4B9TA 3CFPA 1XC3A 3SK3A 4F2RA 1NJYA 3JSMA 4OKKA 4CZIA 5C0YA 4K43A 1ZC6A 3M3ZA 4ID5A 4EP4A 4CHOA 4XEIA 1VK0A 3RR8A 4H5WA 4B1WB 1WSHA 2PYLA 3V9ZA 4PKHA 1B9FA 4FJ9A 3HOTA 1SAZA 1NK9A 5HRRA 1I39A 4CZJA 3LP1A 4CIEA 4CECA 4UQGA 1JLQA 4CK1A 3QDKA 5GIPA 3VGMA 4LH4A 1RNHA 4CZHA 4C8OA 3GBTA 2ZJRL 4DV3K 4DLGA 3DMJA 5AQUA 1HNWK 3VQ7A 2RPIA 4BG9A 1VRTA 1NJZA 3O3GA 4C8MA 3SPZA 3FZKA 1YXQA 4CJ3A 3WNEA 4Z4CA 2Q0UA 2Z1JA 2HHUA 4BDYA 4KV8A 1RTIA 4HHTA 1T03A 4DFJA 1JCGA 1C0TA 4BRNA 5M1PA 3AA3A 3CC4N 2O8FB 1NK8A 1U2VB 2BTFA 3P4IA 2P9IA 1EWQA 3BUZB 2P9KB 2E2QA 4FVMA 3WNHA 1S1XA 4C23A 3GOIA 4B1XB 4BRLA 4WFAL 1RDWX 4CF9A 3KHYA 4CVNE 3RMCA 1B92A 1RDAA 3VQQA 4N47A 2W40A 3SMSA 2P1JA 2HBKA 4HUEA 2NRRA 1OVQA 2R7YA 1VSJA 3SQ1A 3CC2N 3E9LA 4DSEA 3ZSZA 1HR0K 4CHZA 3AVKA 4TSXA 3VA3A 4MFBA 2I7PA 4IJAA 2KLAA 2QW9A 3S3OA 4E7JA 1G15A 3FGUA 4R79A 4WCEL 2QK9A 5AZJA 4LY7A 4AHRA 2F9TA 2CGJA 1U47A 2ETJA 3AAPA 5AQLA 2HHSA 1WB9A 5EVZA 4FJ8A 1R0AA 4LSLA 3C7NB 3O8MA 2J4RA 3AVHA 5FROA 4E1MA 3MEEA 4ILHA 4FXDA 1XC9A 4CJQA 1OH5A 4DR5K 3HI0A 3F73A 2G8KA 2GEMA 3MXJA 3VEYA 3CG7A 3AY9A 1TAUA 2HF3A 1HJOA 5C2DA 2YKNA 1Z26A 3DRRA 4CGDA 4NCGA 3VQ8A 3V9SA 3V1QA 5JLFA 2A5XA 3DLHA 2KFNA 1HX1A 1EETA 5AQGA 1SL1A 2UUBK 2A1SA 3PLAA 1X9SA 4OPKA 3NF9A 3TAFA 1I3AA 4B9QA 3TWHA 1ATNA 3DOKA 4JI1K 4JI4K 4BQZA 5ADXH 2O8BA 2JLEA 2YKMA 4CHYA 3CMEN 2HNZA 1BI4B 4BR9A 5GAGP 3HP9A 1ASVA 1D8YA 3OYKA 1X9JA 3DRSA 4DV7K 2KZMA 3MAQA 5HLFA 4I9QA 1YJNN 3V9UA 4KRFA 1TKXA 2P9NB 2HHQA 3K59A 1BIUA 2NRWA 1NGHA 1J54A 2QWPA 5AQNA 3IUCA 4ZTFA 3SV3A 3EZWA 4B9UA 3MXIA 5KGWA 1WAFA 5J1EA 1JL1A 2DFFA 4IXCA 3DXKA 1LWEA 3ZSRA 4IOAL 4DQRA 4YOVA 3OYNA 3ZX2A 2VGNA 2GUPA 4JKDA 2HHVA 4EHTA 2BE2A 3PIOL 3EO3A 1GLDG 5AQZA 1S22A 4BREA 1HYSA 4AM7A 4O5BA 4DV0K 3VA0A 3IMXA 3RMDA 1IBLK 1RT6A 4KHYA 5M1NA 3AVLA 1HNXK 3HVTA 4YOWA 3S9HA 3M8RA 3MEGA 3O80A 4CJSA 2HBJA 3C94A 5EU7A 3BEXA 1LV5A 1NGCA 4CW7B 1SQKA 3ID8A 3KLHA 4A5AA 4EFHA 1REVA 1BOTO 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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