4BS0 | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	299
structure length	299
Chain Sequence	QSIDQLIKARGKVYFGVATDQNRLTTGKNAAIIKADFGMVWPENSMQWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIGAGCLVWHNFLPSWVSSITDKNTLINVMKNHITTLMTRYKGKIRTWDVVGEAFNEDGSLRQNVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYIMDYNLDSASYPKTQAIVNRVKQWRAAGVPIDGIGSQMHLSAGQGAGVLQALPLLASAGTPEVSILMLDVAGASPTDYVNVVNACLNVQSCVGITVMGVADPDSAFASSTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQDLQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords	KEMP ELIMINASE HG3.17
publication title	Precision is Essential for Efficient Catalysis in an Evolved Kemp Eliminase pubmed doi rcsb
source organism	Thermoascus aurantiacus
total genus	122
structure length	299
sequence length	299
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2013-06-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4bs0A00

4WIWA 1UKQA 3CZLA 2YL5A 3ALFA 4KRTA 3EYPA 1UG6A 1VJSA 3AIQA 4PMDA 2J25A 5D9NA 1MW1A 1BQCA 1GCYA 5FD0A 1B0IA 1ITXA 3MMUA 5BXTA 2QV4A 3WF2A 5DFAA 2G41A 1B3VA 4U3CA 3EDJA 2OWXA 4MNJA 2XVPA 3L4UA 1YHTA 3KL0A 5A6MA 3OA5A 1J0IA 2J8GA 2BVTA 4P7NA 1W3JA 2PWDA 5ABFB 1BPLB 4LYRA 2J78A 3HMCA 4PMRA 2VT0A 4X9YA 1MQQA 5BXPA 1VFMA 1C8YA 3QHNA 4P8UA 1JDCA 2OSYA 3OBAA 2JF7A 1W1TA 4GIAA 2GDVA 1LWHA 3HN3A 1EH9A 4MB4A 4TTUA 1HJQA 5DT5A 2O92A 4WKAA 1TR1A 3VD9A 3WL1A 1W9BM 3J7HA 3ZIZA 4UZSA 3ARVA 1C8QA 3UG3A 1W2PA 1VEOA 4FLQA 3RO8A 5BRPA 1MW3A 1KGWA 4PMUA 2DT2A 3WNMA 2IXUA 2O9TA 3A6OA 3MANA 1M03A 5GNXA 3L4WA 5CPSA 2ESCA 1BGGA 2WW5A 2YIHA 4OKDA 3U5UA 1QVBA 3CLWA 2ZX9A 2WLYA 1BG9A 3WBEA 5AYIA 2J77A 2WHLA 4BCEA 4TXEA 4U5KA 1NH6A 4UQDA 3DYOA 2A3AA 3BC9A 4WLCA 4JHZA 3VIIA 1EGZA 3ARZA 1OB0A 3T2PA 4S3KA 2VCCA 4CD6A 2ZWZA 1HNYA 2D0FA 3WDPP 2VTFA 3ZT5A 1JNDA 1JZ6A 2CNCA 1JF6A 4RE2A 1D2KA 4UR9A 3PN8A 1CGWA 3WSUA 4Z2IA 1GHSA 1J11A 2J7EA 3BAIA 5JIWA 1CLXA 2J62A 1XD1A 1J0ZA 1W9VA 2WBKA 3VKKA 2WMFA 3AZTA 2XWEA 5IFPA 3UG4A 2HVMA 3WQVA 3VILA 3AS3A 3VIMA 1XSIA 1VFFA 2OYMA 1KR1A 2X2YA 4GXPA 1WO2A 2CETA 4J3SA 3EDEA 4JFVA 3L2LA 2ZX6A 3VVGA 5CLWA 3BAYA 1U30A 3AFBA 1TVNA 3UERA 3WNOA 3FAWA 4XZWA 1NWTA 3RIKA 1MVYA 3K8LA 4V2XA 5GNZA 3D3AA 1DWJM 4U31A 4UNIA 3WQ4A 3AICA 3CO4A 2FDMA 4PN2A 2PWFA 2VNCA 4CUCA 4M82A 4D1JA 3WEMA 3VNYA 5C8BB 1UD6A 1WAWA 3N04A 4IPNB 3SCPA 1OD0A 3EDDA 1CXHA 1L0PA 2ZOXA 2VX6A 4GZIA 4D6EA 3G6MA 3VIKA 3FHQA 4WK9A 1OGGA 2BS9A 1OINA 1UWSA 3L4ZA 1OD8A 3L2MA 1WZMA 5AC4A 1I1WA 1NQ6A 4E8CA 3MMDA 3B9DA 2IXVA 2DGAA 4H04A 1UKSA 3K8KA 4CCCA 1UR0A 3AXHA 3N13A 3CUGA 4AZ7A 4M80A 4BQ2A 3BAXA 3O6AA 3WEOA 1QNPA 2WYSA 5E70A 1QI5A 4MNLA 4B15A 1ESWA 2WVSA 3A4AA 2DSKA 3CMJA 2DH2A 2GVYA 3BMVA 1YQ2A 1ISWA 2E8YA 5I77A 1HJWA 2W4XA 3AZSA 3WQ8A 1VIWA 2QLYA 1GHRA 4A3YA 1EO7A 2VX4A 5KZ6A 3ZSSA 1QBBA 2EPMX 2VUYA 2GDUA 5CGMA 3B8SA 1G1YA 1SMAA 2VR5A 3OZOA 1EQPA 4PTWA 2WCSA 4BQ3A 1OT1A 4OBRA 1FHDA 1EQCA 3W25A 4UQAA 4E2OA 4FK9A 2CHOA 4J3TA 1JF5A 1ISXA 4GQQA 4U2ZA 5I79A 5TD4A 1WCGA 2XM2A 4OOZA 4TVCA 1NARA 3OLIA 2E3ZA 1NM9A 3VD7A 2OWWA 2XYLA 3KZSA 4U3AA 2BNJA 1W32A 3NSNA 2CXGA 1D3CA 3N18A 2F8QA 1JI1A 3RILA 4R27A 1TFVA 3RJYA 4CU8A 1HXJA 1VEPA 1BG4A 1SR0A 2BXYA 1UZ4A 2W63A 4DM2A 1H09A 3ARPA 3GXIA 2F61A 3BXWA 1E1EA 3UR8A 1H0GA 1W9DM 4W7VA 4XZBA 3NUKA 4Q22A 5A1AA 5A6BA 3EMQA 1FH9A 1ZS2A 1NWUA 1US2A 4AD4A 4XUYA 2VZTA 3POCA 3F5KA 5D4YA 1XH2A 5M3WA 5GPRA 5AC5A 3LMYA 2CPUA 1EDQA 7TAAA 1C93A 3VNZA 5LA0A 1E72M 1K9DA 1G01A 2C0HA 2XHYA 4HMEA 1F4HA 3CH9A 1PX8A 4H41A 2J8FA 4GO9A 5HPOA 3W53A 6A3HA 1FHLA 3AHYA 2QF8A 3MU7A 4Z2LA 2YOCA 1AQHA 2V3EA 4Y7EA 4JKKA 4B3LA 1E6QM 4PMVA 3WD2A 2A3BA 4EAMA 3I3EA 2CKRA 1V0MA 3GH7A 3VD5A 2J74A 2EJ1A 4W93A 5EB8A 3W81A 4URIA 2DSUA 9CGTA 2VQUA 3ECQA 2FHCA 2YA2A 8A3HA 3AI0A 3A4XA 3SCTA 1V0LA 4AYSA 4LQ1A 3RCNA 1E5JA 1VFUA 3W38A 4GO8A 3AHVA 2PBOA 2XWDA 1E9LA 1KGXA 4MPKA 2O9OA 1E4LA 4HA1A 1J0HA 2XVNA 1HKKA 5E6ZA 2VZVA 2QMJA 2YDSA 2YKKA 4MTVA 4W85A 4IUGA 5A8NA 4F79A 3WDJA 4MAVA 3K1DA 3CIVA 2WSKA 1FA2A 3SUSA 5CJ5A 3JUGA 3SCSA 3PHAA 3M7SA 2VO5A 3VDAA 1J12A 2Y4SA 4HPGA 1Q6GA 1XH0A 1W9XA 1H49A 4YN5A 3MV01 4ZENA 1LL7A 4D6CA 1MW0A 1H3GA 1QPKA 1B2YA 4M81A 1BYCA 2BHUA 2ZXQA 1Q6CA 1O7AA 4E4PA 2XVLA 4AW7A 3VGDA 1EA9C 3CUHA 3SIMA 1V02E 2PI6A 1K6AA 1SFSA 4J7RA 4FF5A 5D8ZA 1W9PA 2X8RA 5DF0A 3WQWA 4HA4A 1MXDA 4X0NA 2PB1A 5D9PA 3VD4A 3F5JA 3U57A 3W4RA 4AD3A 2OWCA 4KMQA 2J75A 1FH8A 4S3JA 4D6DA 1PAMA 1UHVA 3OIHA 1GOWA 5ABEA 1V02A 3PZ9A 4W7WA 1V3JA 3UETA 2X1IA 4AZ5A 1UWTA 1UR8A 2OYLA 4GZEA 4AZCA 1QOXA 4E8DA 3G6LA 3IK2A 3VPLA 1CECA 4PSRA 4MNKA 1ISYA 2QPSA 4M56A 4UFJA 3BCFA 3VGGA 2C8NA 2VQTA 4ATDA 4XV0A 5F7UA 3GM8A 3VMPA 1GJUA 2V5CA 2AOSA 1KXQA 4PMYA 4MADA 2NT1A 1QHOA 2Y24A 3BAKA 1CENA 3GNPA 3W0KA 5I23A 3GNOA 4PTMA 1HIZA 3DYMA 1HJUA 4CCEA 1UWRA 4PMZA 1DWHM 1DWAM 2VVNA 3RDKA 3WUFA 3VDCA 1TG7A 1B31A 4AIEA 1LWJA 1QW8A 2D1ZA 4PTXA 1NP2A 2YBUA 5HNNA 4DUVA 2DT1A 2YA1A 3VIOA 4JCMA 1WZAA 3DECA 3VMNA 4UQEA 3L4VA 4B3KA 4Z2KA 4HOZA 2DSZA 1QHPA 1Q6DA 2XFYA 1JD9A 3AZRA 1E6XM 1KXTA 1OIFA 2YDRA 3NCOA 2E8ZA 1J0KA 1BTCA 1E3ZA 5HBFA 1R87A 4QFUA 2J47A 1XD0A 3AHTA 4P8VA 1JZ7A 4JFTA 1KQZA 1OCQA 4H2CA 3WUEA 3AXIA 4Z2JA 2ZX5A 2D3LA 5I5RA 1Q4NX 3WD3A 1CYGA 1N82A 2J7HA 3M46A 2FH6A 4Z2HA 1BYDA 4HA3A 1V3IA 2YL9A 4F8XA 3MMWA 1HF6A 1CIUA 3MS8A 1LF1A 1V6VA 5A6KA 1AVAA 4D72A 1E71M 4W84A 2PBGA 2WMHA 3POHA 2AMGA 2OYKA 2DH3A 3E1F1 2WKLA 1IT0A 3HU7A 3O2LA 4OOUA 2ZUUA 4QCFA 4CVWA 2Z1SA 4QDMA 3T2OA 4UFMA 2WMGA 1UWIA 1WZKA 3VO0A 2BV9A 3A4WA 5M03A 3WEZA 2VZOA 2X0YA 1BYBA 4GI9A 1E5NA 5DEZA 4EKJA 1LJYA 2GJXB 1H41A 1ZBKA 4DM1A 1HX0A 1B3ZA 3AMDA 1E6PA 4GI6A 1E73M 3F4VA 4H8UA 5IHSA 1CXEA 4TTGA 3MUY1 3VIJA 1B30A 2BY0A 1QBAA 1UZ1A 4UQCA 1UWUA 2GJRA 1OGSA 3VM7A 3WQ5A 1U2YA 5IFTA 3W24A 4WJXA 2DIJA 2YA0A 5LYRA 1JZ8A 4P8WA 3ZR6A 3A3HA 1E40A 3W28A 1JFXA 2J7GA 4CN4A 3K8MA 4CVUA 1WPCA 3PTQA 3WH5A 1HP4A 2D22A 1J10A 2VL4A 4A3HA 1V3KA 1C92A 1GVIA 1WDRA 2WB5A 2VC9A 5I78A 1OIMA 1EDGA 1QHZA 5DO8A 1BVNP 2YBTA 4W8BA 5EFFA 2PWEA 4JIEA 3WH6A 1KCLA 3ZMRA 5A6BD 3WF1A 1X1NA 3HJEA 1CTNA 3VIHA 1H0IA 4ACZB 3K4DA 2FHFA 1WP6A 1V6XA 2WZHA 1HL9A 2XJ7A 4NI3A 2Y5EA 4HU8A 5AY7A 1JL8A 4DWSB 3IAPA 1JGIA 4H8VA 3D5HA 3K46A 5DMYA 4TX6A 2E9LA 7CGTA 1E4NA 3WD1A 2NT0A 2ZXDA 4HMCA 3WKZA 5FIPA 4L4PA 1A47A 3PZIA 3N9KA 1C3FA 3TTOA 3NSXA 1ITCA 1HT6A 2WPGA 3M07A 1UR9A 4X0VA 1C90A 2D0GA 1E43A 5JBEA 4NZCA 2CBJA 5LA1A 3LPOA 4W86A 2GK1B 1K9EA 4CD5A 3FHAA 4CKQA 4UQBA 5C70A 5LA2A 2VMFA 3ALGA 4J3XA 2UY2A 3BAJA 1UKPA 4B16A 1IZJA 1JAEA 1VB9A 4UFHA 3CHCA 3TTYA 1BAGA 1E0VA 2NSXA 5ABFA 1UD5A 2PWHA 4CD7A 5A69A 5BWFA 2A3CA 1BFNA 3QOMA 3II1A 4F66A 5CZKA 4JHOA 2V3FA 2PC8A 1CLVA 2XPKA 3MSDA 3AIBA 2RGMA 1KGUA 1J0YA 5IHRA 1R7OA 4MB5A 1JZ4A 5A6AA 1SYTA 1ECEA 3BSGA 4J3VA 3VMOA 2X0HA 2GJXA 3W27A 5A95A 5C71A 5JUVA 1Z32X 3RPMA 3GXDA 1RH9A 1GORA 1ZJAA 1B9ZA 2VCBA 2DEPA 1XHGA 5E6YA 4EE9A 1W9UA 3GTNA 4W8AA 4OZOA 2X09A 3WELA 5A8OA 1UA3A 2DPEA 3CTTA 1JDAA 3N11A 3WNLA 1W1VA 4P7LA 2VZSA 3MKKA 2Y8VA 3CGTA 3L4YA 3RM4A 1W91A 5I6SA 2VZUA 3T08A 1PBGA 2VVSA 4LPCA 2G3NA 1UUQA 5JBFA 2JIWA 2WXDM 3ARWA 1EHNA 3F5LA 1GOKA 1E3XA 1X6NA 3SUTA 4QAWA 4TVDA 1KWGA 5ABGA 2WWCA 5CGTA 1KB3A 5JBDA 2E9MA 4AY1A 4DWSA 2O9PA 2ZUVA 1MFVA 2J7BA 3AIUA 3VDHA 2WC7A 3W26A 1TUXA 1FH7A 4D6IA 3S2CA 4BF7A 4IISA 1E4MM 1A3HA 2UY4A 3ZJ8A 4AZIA 1VFOA 1CXKA 2VX7A 4PCSA 1OGBA 1UOKA 2ZUTA 1PJ9A 2YLLA 2XVKA 3GBEA 2GK1A 1B3WA 1HVXA 1MXGA 3AS0A 8CGTA 4J3WA 2BVDA 1G94A 2EPLX 4U33A 4BZYA 4DUXA 4WKHA 3SUUA 1NWRA 1F4AA 4GKLA 1VAHA 3LPPA 4QCEA 2VOTA 4CU6A 3KWXA 2VJXA 1MW2A 2VRQA 5E9AA 4FLRA 1GW1A 4CN1A 4R5EA 3VM5A 4AEFA 5A94A 4W5UA 3UR7A 1TA3B 3VINA 3VGEA 3TP4A 3CHEA 4PYSA 2JEQA 3AROA 1JDDA 3WNKA 3VIFA 1DWIM 3SCVA 1QI0A 3TTSA 3GNRA 3MUAA 5I0DA 1J18A 1ODUA 5CG0A 2XSAA 3ARTA 3IJ7A 3PZVA 3AIVA 3EBVA 1LG1A 4RE4A 1V08A 2DQXA 2XGBA 3MUZ1 1E4IA 3PZUA 1VF8A 2ZUMA 3WF4A 2D2OA 4HU0A 1H1NA 1WZLA 1V0NA 3FW6A 5HOSA 4A4AA 2WNWA 1UR1A 1HKMA 1E6RA 4LX4A 2X05A 1BSIA 1JYNA 3RJXA 1CWYA 4OIFA 2WKGA 2ZX8A 1V0KA 3VD3A 1UR2A 1KFWA 3IANA 3OLDA 4U5IA 3SCWA 3CHDA 2BHYA 5A6JA 3OZPA 1G5AA 2JFEX 2GFTA 4UFIA 1E55A 4WSKA 3WH7A 3BGAA 1Y7VA 1UD8A 4W87A 1JAKA 1XRVA 2WMIB 4W88A 1XCWA 3OGRA 1LLOA 4HTYA 1V03A 4N42A 4U2YA 2WM0A 3AXXA 3AMLA 3QR3A 4GI8A 4JKLA 3BLKA 1PIGA 5FOOA 2GJPA 5BCAA 1B3YA 1CBGA 3VTRA 4AEEA 1DP0A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4BS0A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations