4CBUA

Crystal structure of plasmodium falciparum actin i
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
365
structure length
357
Chain Sequence
EDVQALVVDNGSGNVKAGVAGDDAPRSVFPSIVGRPKNPKDAFVGDEAQTKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRAAPEEHPVLLTEAPLNPKGNRERMTQIMFESFNVPAMYVAIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTEYLMKILHERGYGFSTSAEKEIVRDIKEKLCYIALNFDEEMKTSEQSSDIEKSYELPDGNIITVGNERFRCPEALFQPSFLGKEAAGIHTTTFNSIKKCDVDIRKDLYGNIVLSGGTTMYEGIGERLTRDITTLAPSTMKIKVVAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQQMWITKEEYDESGP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Motor protein
molecule keywords ACTIN-1
publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 119
structure length 357
sequence length 365
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbuA03
3FZHA 3OHRA 2A5XA 1NGGA 2GEMA 4JD2B 3M1FA 4HTLA 2E1YA 2P9NA 3SMSA 4BVPA 2V7YA 3CJCA 4FOIA 4EAHD 3RSEB 2QWMA 5AQTA 2F9TA 3DXKB 1X3MA 2FSJA 1NGFA 2EWSA 2CGLA 3LL3A 4DB3A 4BR5A 4IJNA 5JLHA 1HX1A 3VETA 4WQ4C 2QM1A 4BRLA 1H1VA 1JCFA 3HTVA 5AR0A 3TU5A 1ATRA 3TPQA 2E2NA 4BRDA 2A42A 1HLUA 2AA4A 2D0OA 4CZJA 2WUSA 3WEEA 4CBXA 2YJFA 2CGJA 4K43A 2HMPA 4MLHA 1T44A 4FWNA 2J4RA 3F9MA 4B1ZA 4M7XA 3KVGA 4YDUC 2E2QA 5AQGA 1V4SA 3A5LC 3P4IA 4BC4A 1NM1A 2QWNA 2OANA 3GL1A 2CH5A 3SMPA 1BUPA 3FZFA 1XUPO 2QWLA 1BWFO 1GLEG 1QHAA 1HKGA 4FSVA 4JNEA 2KHOA 4PKHA 1U2VA 4BRQA 4PKGA 3VESA 3ZX3A 4BRKA 4H0VB 4JAXA 1HJOA 2QXLA 4BR4A 1YVNA 4CD3A 1QQMA 3KHYA 4A2AA 4B9QA 3SJHA 2GELA 3CI5A 1IJJA 4GNIA 1WOQA 2IVPA 1X3NA 1TUYA 1U6ZA 1JCEA 3ULEA 2GWKA 4FWLA 4CZIA 3QFPA 3CQYA 2ASOA 3G25A 1NGBA 2QWOA 2V7ZA 5KPTA 4F9OA 3MN9A 1IG8A 3C7NA 4K25A 5AQYA 4ISFA 5ADXA 4BRHA 3W3DA 3BF1A 4BGBA 3VEOA 3BP8A 3ZX0A 5ADXH 5BN8A 4DQ8A 2VYPA 4GY2B 3AAQA 4MLEA 2P9LA 5F0XA 1Q18A 4ISEA 2E8AA 2ITMA 3CJ1A 2E2PA 2F9WA 3R9PA 3WXJA 4CZGA 4BRMA 4H0PA 3J8AA 3B8AX 3LDOA 5F2RA 2P9PB 2QWRA 5KQDA 3CIPA 3H6EA 3S41A 3R8EA 3H3OB 1C0GA 3VF4A 5I9EB 3ZX2A 1KAZA 2Q97A 5FPMA 1GLCG 1QZ5A 3D2FB 5FPDA 4BRNA 4CZEA 2AP1A 2H3GX 3M6GA 4AM6A 3DWLA 5JLFA 1RGIA 3QB0A 2CH6A 2A41A 4CZLA 1RFQA 3KZBA 5LY3A 3BUZB 1TUUA 1SQKA 3D2EB 1Z6RA 5AQSA 3WQTA 4JN4A 4PL8A 5B8HA 3FZMA 3CJ9A 4CZFA 3VF2A 3GOIA 1K8KB 2FSNA 3W0LA 3CETA 1YUWA 3H3NO 5AQPA 3L0QA 3DXMA 2GWJA 4BC3A 3O8MA 3CQXA 3DJCA 1BU6O 3LM2A 5AQMA 1BA0A 4Z94A 2DPNA 2YHWA 2YHYA 3U9ZA 3WXLA 3ENOA 4JD2A 4H5VA 1S22A 1DGKN 4H0XB 3ENHA 3GG4A 3EKUA 4BR0A 1GLBG 5AQHA 2E20A 4EFHA 1ATNA 3FR0A 4XH5A 4RCHA 3RSEA 3ATUA 1P8ZA 1S3XA 3DXKA 3L6QA 5AQJA 4XEIA 1D4XA 2PAVA 1KAXA 2ZGYA 1MWMA 5FPEA 1HKBA 2P9SB 1NLVA 1NGHA 4BVOA 2FXUA 1NMDA 2BUPA 1GLFO 5AQVA 4MO5A 1TYQB 5AQWA 5LJWA 5CE3A 4WQ5A 4AM7A 2CGKA 2P9SA 3FLCO 3I8BA 5AQFA 3MN6A 4FWSA 3CHWA 3ZETB 2FF3B 5EY4A 4B1YB 3EZWA 3H1VX 3O5BA 2P9IB 4M7YA 1KAYA 1G99A 3ZEUB 1ZXOA 4H5TA 2NLXA 3VEZA 5BPLA 1KXPA 1GLAG 3A5OC 5BRDA 1Y64A 1MA9B 3AAPA 3QFUA 4A61A 4E1JA 3VGLA 3IUCA 3JS6A 2IVNA 2FSKA 5AQXA 4BRPA 3WT0A 1QZ6A 4H0TB 4O8KA 3UKRB 4BREA 4LC9B 4QS9A 2ZF5O 3MN5A 3IFRA 2QWQA 4BC5A 4FPBA 4XH4A 1T6CA 4BR2A 1HPMA 4CZKA 3U8XA 1ZC6A 3VERA 3WQUA 2ZWHA 4K42A 3EO3A 5BN9A 1SZ2A 2Q36A 2QW9A 1NGCA 3QDKA 1BG3A 3VEWA 3ID8A 3JXUA 4H5NA 3QBXA 4BRFA 2A6AA 1NGJA 3ATVA 2PBDA 3CJAA 5LJVA 1ESVA 4H03B 1BOTO 3WXIA 2I7PA 4BRGA 2Q1NA 4H0YB 2E2OA 4BQLA 3QICA 3DAWA 4EIAA 1ZBSA 2NZTA 4DHYA 3AY9A 3QMLA 3MMVA 2GTDA 2Q0RA 2E88A 3GBTA 3H46O 1NGAA 4BRIA 1CZAN 1BA1A 2E1ZA 2P9UB 3O4WA 2NRHA 2P9PA 2IIRA 2ASPA 4BRCA 3MCPA 2UYTA 4WYBA 2P9KB 4XH1A 2V52B 3MK6A 1EQYA 3CJ7A 4H5RA 3VGKA 5E26A 4IO8A 2Q0UA 4I6MB 1HKCA 4FWQA 1OKJA 3HSCA 3IDHA 3D2FA 2YHXA 3L4IA 5F1XA 3GDQA 2D1KA 2D0PA 3UKUB 3MDQA 3GE1A 3A5MC 1SAZA 5AZJB 1NGIA 2VCPA 1BO5O 1NWKA 3D2EA 4BG8A 4CJ7A 4JHDB 3BEXA 1K8KA 1R59O 3HBTA 3LDLA 5AQKA 5AQLA 1DEJA 1RDWX 2D4WA 1GLDG 3IMXA 3FZKA 2W40A 3FGUA 5TKYA 5BPMA 3O80A 4KBOA 3LDPA 1ATSA 4PKIA 2P9NB 3U9DA 2YCHA 4BROA 3VEYA 4BR7A 3LDQA 2V51B 3BF3A 4DCHA 4WQ4A 4FL9A 5AQZA 2FF6A 1MDUB 4H0OA 5ELZA 4CBUA 1X9JA 3VEXA 3VGMA 4CD1A 3FZLA 5JICA 3EN9A 3CJBA 4EHTA 3LDNA 3R6MA 3WEEB 4IJAA 3SLCA 2HOEA 4YDUA 4A62A 5E84A 1TYQA 5AQNA 1QQOA 3MN7A 4QS7A 4RTFD 4HWIA 4FWMA 4IWVA 4B1UB 4FPAA 5EVZA 5BREA 4PL7A 4BQZA 1BDGA 1XC3A 4FOEA 3H1QA 4FWKA 4J8FA 5KPRA 5AQIA 4WQ5C 2HF3A 2Q2RA 1Z05A 3D7EO 4BGAA 3VF6A 3ZETA 4FO0A 5AQRA 4CI6A 1U2VB 5EX5A 2P9IA 3HI0A 4FWRA 3ZEUA 4IZ9A 3O1WA 5AZIB 4RWTA 5AFUA 2I7NA 4B1XB 3A8YA 5JMVA 2A40A 2IVOA 4CZMA 5EXWA 2FLOA 2ASMA 5AFUH 4MO4A 1NGEA 3UB5A 1E4GT 3H45C 3QBWA 2HF4A 3ULEB 5AZIA 4C23A 3SK3A 2ZGZA 3A5NC 3UKRA 4BRAA 5KQ8A 3VEVA 3CERA 4NO7A 1YXQA 3C7NB 1E4FT 4IXCA 1JCGA 1XQSC 3HZ6A 4B1WB 3AARA 4B1VA 2A3ZA 3VOVA 1NGDA 3EKSA 3UE5A 3FFKB 4H5WA 3O6WA 3O1BA 1LCUA 3WXKA 1HUXA 1GLLO 4BG9A 2P9LB 2VWBA 4A2BA 4NB4A 3VENA 1YAGA 3I33A 5BPNA 3LM9A 2QWPA 4BR9A 5AQUA 3FE1A 1DKGD 5BRHA 1QQNA 4ISGA 2W41A 1J6ZA 3M3ZA 5BR9A 5EOYA 2GUPA 4FWPA 4QS8A 2P9UA 4L3QA 4Y0WA 2P9KA 1MWKA 3A0IX 1T6DA 1V4TA 2YI1A 3C0BA 3EL2A 1WUAA 1GLJO 4I6MA 4FWOA 4K41A 5FPNA 5BRFA 2YJEA 3UKUA 1LOTB 3WUHA 1C0FA 3VPZA 5KPZA 2BTFA 5AQQA 5AQOA 5AZJA 4BC2A 3U4LA 2Q31A 4CBWA 4M63C 3HM8A 3DXMB 4JHDA 1NBWA 4O5FA 3O08A 4EHUA 4CZHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QESA 1EXQA 5C15A 3D45A 4DV4K 4DSLA 2P9NA 4M42A 3C6AA 2IAJA 3TTFA 2V7YA 3PIOL 4DQRA 1ASWA 3CJCA 3MEEA 2VG6A 1Q82O 5AQTA 4O55A 1X3MA 4CEDA 3G6EN 4CJRA 2EWSA 3K57A 3HVTA 1JXBA 3LL3A 3K0SA 4IJNA 3VETA 2QM1A 4FXDA 1JCFA 2HHVA 2IC3A 5KRTA 1HLUA 3NHGA 4CZJA 4BECA 1RBUA 4CBXA 3ZSZA 4MLHA 2PYJA 1T44A 4DWIA 4FWNA 2ATQA 2J4RA 1UWBA 1HR0K 3OTOK 4ILHA 3A5LC 2OPQA 3P4IA 3THYA 3THWB 1BUPA 2NRZA 1XUPO 3EE8A 1BWFO 4FK0A 1HKGA 4JNEA 1YT3A 4KTWA 3U3GA 1U2VA 4PKGA 3AVAA 4BRKA 3ZX3A 2F8SA 3EEQA 4OX9K 4BR4A 4A2AA 3OS1A 4BWMA 4Q0BA 5BR8K 2IVPA 1X3NA 4DU4A 3OVNA 1JCEA 3L2QA 4F4KA 1EWRA 1X9SA 3CQYA 3RTVA 1NGBA 2DY4A 2V7ZA 2HSTA 1IG8A 1WAFA 5AQYA 4BRHA 3W3DA 3CCJN 1LWEA 3J80O 4E0DA 2QK9A 3C95A 5ADXH 2W6KA 4K8XA 4DQ8A 1TL1A 4DF8A 3AAQA 2P9LA 5F0XA 4ISEA 2E8AA 4CK3A 2ITMA 4OGCA 3NF6A 3CJ1A 3DRRA 2OPPA 4BRMA 3AVGA 2BE2A 1NK8A 1O13A 3B8AX 5F2RA 2P9PB 1RTIA 4KI4A 3ITHA 4FCYA 3H6EA 3S41A 1DTTA 3Q7BA 3SV4A 3OYJA 1C0GA 4AH9A 4FLUA 5M1NA 1GLCG 4B9MA 3D2FB 4CZEA 4AM6A 4K0KK 4DR3K 3QB0A 3OYKA 3NVMA 5JVHL 1IKWA 3LPUA 1RFQA 4O0JA 3KZBA 1WSHA 1SQKA 5AQSA 3WQTA 1BCOA 3FZMA 3GOIA 3VQ5A 3HK2A 4GVEA 3L0QA 1SL1A 3DXMA 4AILC 4DR7K 5JS1A 3SUNA 1BU6O 2DPNA 4JD2A 3ZCMA 3NH2A 1S22A 4G9ZA 3ENHA 2FBXA 2HBJA 3TWHA 1ATNA 4RW9A 1LV5A 3FR0A 1CXUA 3QEIA 3L6QA 4CFCA 5AQJA 1KAXA 1HNZK 5FPEA 4O8UA 1OH6A 3CC7N 3TI0A 3L8BA 4JI7K 3LDSA 3LZJA 3HL8A 1OVYA 3THXB 4AM7A 3K2PA 1EX4A 2P9SA 3CCEN 4CHZA 3I8BA 1WBDA 4J2BA 4F2SA 4U7BA 4N41A 4KO0A 4FWSA 3F5TA 3QO9A 1RTJA 3O5BA 3H1VX 4FJKA 1G99A 3CFRA 4YOWA 1KXPA 3A5OC 3DOKA 5BRDA 4DFJA 4JKDA 3QEVA 3QFUA 3VGLA 2GX9A 3IUCA 3JS6A 3ENBA 3OS0A 1L3TA 1QZ6A 4O8KA 3LPTA 1NK7A 1J54A 3AVHA 1XMQK 3IFRA 4Z4EA 1T3VA 4FPBA 4XH4A 3KLHA 4BR2A 3TARA 4IKFA 2IGIA 1ZC6A 4J2AA 3OS2A 4B3TK 2ZWHA 5J2PA 4Y1DA 4MDBA 5BN9A 1FKPA 3QDKA 1BG3A 2W6LA 4CIGA 4CEFA 2HVIA 3CMEN 4DSFA 5LJVA 2XRIA 3WXIA 5I3UA 4BQLA 2E2OA 3DAWA 2BDPA 2NZTA 2P5GA 3CF5L 4GV6A 3I0RA 2GTDA 4FLWA 4KTZA 3SQ0A 4CJEA 2RF2A 1CZAN 1BA1A 3K5NA 1M90O 2O8EB 3DRSA 4I2QA 4DR4K 2V52B 1E3MA 4YOTA 3V4IA 2QA4N 2O8DA 3CJ7A 4Z4IA 4I6MB 4DS4A 1HKCA 4FWQA 3L2UA 3ZSOA 1BQNA 4FJ5A 3MDQA 4W5TA 5GADP 4CJ5A 3KTQA 5KI6A 4F2RA 2VCPA 1BO5O 5M1KA 1SKSA 4FZZA 4WCEL 3F2KA 4DUYK 3CG7A 4CK1A 1K8KA 1R59O 3LDLA 4KAZA 4DR1K 3IMXA 3FZKA 5TKYA 1HNVA 5BPMA 3IKMA 4RW4A 4ILJA 4KBOA 3LDPA 4BROA 3VEYA 3OYBA 1Q9YA 2ZJPL 1YTUA 4BR7A 4Y1CA 2V51B 3SQ4A 1IG9A 4H0OA 1MDUB 4CBUA 3LAMA 3VEXA 3LP0A 3AO2A 3HOSA 5HBMA 4EHTA 4NXMK 1TKXA 3LDNA 4LF7K 3R6MA 4DTPA 4KI6A 1FK9A 4LH4A 1U4BA 3G0ZA 1C0TA 4FJIA 4CE9A 4C8NA 1TYQA 5AQNA 4QS7A 4HWIA 4IWVA 1NKCA 1W2BM 4JI6K 1B92A 5J2NA 3TAFA 2IS3A 1BDGA 4KHYA 5KPRA 3H1QA 4JK7A 3QEPA 1EKEA 1LAVA 2HF3A 4DTNA 1Q86O 3TAGA 3ZETA 1VRUA 4YOXA 4FO0A 5AQRA 2NRVA 5EX5A 3VMFB 5AZIB 1KC8O 3CCQN 3RMBA 5JMVA 3O9RA 2IVOA 1W9HA 3KK2A 4IFYA 4JI5K 1NGEA 1EWQA 3UB5A 2HHQA 3TANA 3SK3A 2ZQBA 2ZE2A 2O8BA 4E7KA 4OKKA 4E1MA 1L3UA 5KQ8A 2G8HA 3VEVA 1Q9XA 1XC9A 1RT1A 2WFBA 1YXQA 3C7NB 1E4FT 4B9LA 2AJQA 1JCGA 2D0AA 3AARA 3RMCA 5GAGP 4B9NA 3DLRA 2HHTA 1I39A 2ITGA 1BI4B 1TKTA 4JK8A 4BG9A 3V9ZA 4NYFA 3V9UA 3DLEA 1YAGA 3I33A 3IG1A 4DTOA 3E66A 1RT7A 1DKGD 4H8KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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